利用RNA指纹技术分析大白菜胞质雄性不育相关基因的差异表达

采用改进的RNA指纹技术(RAP-PCR)对两套大白菜胞质雄性不育材料及其杂种F1花蕾的总RNA进行了分析,通过对186条随机引物的筛选,获得4个重复性较好的差异片段S47-412,S93-622,S176-343,S199-904,并对其克隆、测序。根据各差异条带的测序结果合成长引物进行验证,S47,S93所对应的差异消失,而S176,S199长引物验证的结果与RAP-PCR相似,序列分析表明:S176-343,S199-904两差异片段均和油菜Polima不育胞质线粒体基因组orf224/atp6位点有着极高的同源性,两差异片段序列部分重叠,这说明两差异片段可能和大白菜胞质雄性不育有很高的相关性。

应用全自动核糖体RNA基因指纹技术快速鉴定细菌菌种

应用RiboPrinter全自动核糖体RNA基因指纹技术对4株未知菌种进行快速鉴定,并与生理生化试验结合16SrDNA序列测定方法相比较。结果表明,两种方法均成功地完成了4株未知菌种的鉴定,其结果分别为大肠杆菌、嗜热链球菌、地衣芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌。相比之下,生理生化试验结合16SrDNA序列测定的方法经济实用,而RiboPrinter系统更为简便、快速,在8h内快速地完成了4株未知菌种的鉴定,并且为菌株的基因分型以及溯源分析奠定了基础。

DNA指纹、RNA指纹技术及应用

在 8 0年代中期兴起 DNA指纹技术和 RNA指纹技术 ,目前此技术已广泛应用于遗传育种、新子鉴定、连锁分析、罪犯鉴别、疾病早期诊断、基因调控等方面的研究 ,二者特点不同、应用不同 。

生物质谱技术及其在RNA检测中的应用

生命科学的需求促进质谱技术的发展,现代的质谱技术为生命科学研究提供丰富的检测手段,本文重点介绍生物质谱技术的特点、性能以及质谱技术的进展;及质谱技术在RNA研究领域的方法学,包括核酸的纯化方法、核酸的离子化技术、核酸的分子量检测技术和核酸质谱数据的解析方法及其软件;以及质谱在核酸领域的具体应用,包括质谱在测序、定量、转录后修饰、核酸的指纹识别、蛋白和核酸相互作用等方面的应用。

差异表达基因分离技术的研究进展

分离并克隆差异表达基因是生命科学的研究热点。近年来,以差示筛选、扣除杂交等基本方法为基础,先后出现了抑制差减杂交,微阵列技术等多种分析差异表达基因的技术,使差异表达基因分离方法不断完善。对这些方法的优缺点、发展趋势及应用前景进行了简要综述。

Changes in the Chemical Components of Light Crude Oil During Simulated Short Term Weathering

To unambiguously identify spilled oils and to link them to the known sources are extremely important in settling ques-tions of environmental impact and legal liability. The fate and behavior of spilled oils in the environment depend on a number of physicochemical and biological factors. This paper presents the results regarding changes in chemical composition of light crude oil during simulated short-term weathering based on natural environmental conditions. The results show that the saturated hydrocarbons of the light crude oil mainly distribute between n-C8 and n-C23 and the most abundant n-alkanes are found in the n-C10 to n-C16. The main chemical components of the light crude oil are n-alkanes and isoprenoids. The aromatic compounds are subordinate chemical components. Under the conditions of the weathering simulation experiment,n-alkanes less than n-C12,toluene and 1,3-dimethyl ben-zene are lost after 1 d weathering,the n-C13,n-C14,naphthalene and 2-methyl-naphthalene are lost on the fifth day of weathering,and n-C15 alkane components show certain weatherproof capability. The ratios n-C17/pristane and n-C18/phytane are unaltered and can be used to identify the source of the light crude oil during the first 8 d of weathering. After 21 d,the ratio pristine/phytane can not pro-vide much information on the source of the spilled light crude oil. Triterpanes(m/z 191) as biomarker compounds of light crude oil are more valuable.

基于质谱的核酸指纹识别技术

基因转录是继基因组计划完成后基因功能研究的基本内容。基因转录研究迫切需要有新方法的支持。人们从蛋白的指纹分析技术中得到启发,开发基于质谱分析的核酸指纹识别技术。通过对核酸进行酶解处理,使其核酸片段分子量位于质谱检测的范围内,通过高分辨质谱技术获得所检测酶解核酸片段的分子量列表;利用基因组研究所获得的大量数据,通过计算机技术,模拟产生核酸酶解产物数据库,通过独特的算法以及基于这些算法开发的工具软件,把酶解的核酸质谱数据和虚拟的核酸酶解产物数据库进行比对,以发现和鉴别核酸。随着这一技术的逐渐应用和发展,将来还可能直接建立基于质谱数据的核酸数据库。相信这一技术在转录组研究中将发挥重要作用。