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Heme status affects human hepatic messenger RNA and microRNA expression
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作者 Herbert L Bonkovsky Weihong Hou +6 位作者 Nury Steuerwald Qing Tian Ting Li Judy Parsons Alicia Hamilton Sunil Hwang Laura Schrum 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2013年第10期1593-1601,共9页
AIM:To assess effects of heme on messenger RNA(mRNA) and microRNA(miRNA) profiles of liver cells derived from humans.METHODS:We exposed human hepatoma cell line Huh-7 cells to excess iron protoporphyrin(heme)(10 μmol... AIM:To assess effects of heme on messenger RNA(mRNA) and microRNA(miRNA) profiles of liver cells derived from humans.METHODS:We exposed human hepatoma cell line Huh-7 cells to excess iron protoporphyrin(heme)(10 μmol/L) or induced heme deficiency by addition of 4,6-dioxoheptanoic acid(500 μmol/L),a potent inhibitor of aminolevulinic acid dehydratase,for 6 h or 24 h.We harvested total RNA from the cells and performed both mRNA and miRNA array analyses,with use of Affymetrix chips,reagents,and instruments(human genome U133 plus 2.0 and miRNA 2.0 arrays).We assessed changes and their significance and interrelationships with Target Scan,Pathway Studios,and Ingenuity software.RESULTS:Changes in mRNA levels were most numerous and striking at 6 h after heme treatment but were similar and still numerous at 24 h.After 6 h of heme exposure,the increase in heme oxygenase 1 gene expression was 60-fold by mRNA and 88-fold by quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction.We found striking changes,especially up-regulation by heme of nuclear erythroid-2 related factor-mediated oxidative stress responses,protein ubiquitination,glucocorticoid signaling,P53 signaling,and changes in RNAs that regulate intermediary metabolism.Fewer mRNAs were down-regulated by heme,and the fold decreases were less exuberant than were the increases.Notable decreases after 24 h of heme exposure were patatin-like phospholipase domain-containing protein 3(-6.5-fold),neuronal PAS domain protein 2(-1.93-fold),and protoporphyrinogen oxidase(-1.7-fold).CONCLUSION:Heme excess exhibits several toxic effects on liver and kidney,which deserve study in humans and in animal models of the human porphyrias or other disorders. 展开更多
关键词 Delta-aminolevulinic acid SYNTHASE HEME Heat shock proteins HEPATOTOXICITY messenger rna Microrna
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精神分裂症患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA筛选及核心竞争性内源RNA网络构建
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作者 王艺梦 邰旭光 +3 位作者 李小龙 刘鹏 王越 祁冬冬 《山东医药》 CAS 2024年第33期30-34,共5页
目的筛选精神分裂症患者外周血中差异表达的circRNA、miRNA、mRNA,并构建核心竞争性内源RNA(ceRNA)网络,解析精神分裂症发生发展的分子机制。方法精神分裂症患者6例记为精神分裂症组,同期体检健康的人群4例记为健康对照组。采集两组研... 目的筛选精神分裂症患者外周血中差异表达的circRNA、miRNA、mRNA,并构建核心竞争性内源RNA(ceRNA)网络,解析精神分裂症发生发展的分子机制。方法精神分裂症患者6例记为精神分裂症组,同期体检健康的人群4例记为健康对照组。采集两组研究对象的外周血,提取总RNA后构建cDNA文库并进行高通量测序,采用R软件筛选精神分裂症患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA。采用miRanda和qTar数据库共同预测与差异表达miRNA相互作用的circRNA和mRNA,与差异表达的circRNA、mRNA取交集后,采用R软件构建差异表达的ceRNA网络。基于DAVID数据库对精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中差异mRNA进行GO和KEGG富集分析。采用string数据库构建精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中差异mRNA之间的PPI网络,选用cytoscape软件中cytoHubba插件筛选影响精神分裂症发生发展的核心mRNA,选择与核心mRNA存在相互作用关系的miRNA和circRNA构建精神分裂症患者外周血中差异表达的核心ceRNA网络。结果相比健康对照组,精神分裂症组患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA分别为31、213、2624个。构建了由差异表达的5个circRNA、4个miRNA和57个mRNA组成的ceRNA网络。精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中mRNA主要参与化学刺激的感官知觉、多细胞生物生长的负调控等生物过程,涉及泛素-泛素连接酶活性、鸟苷酸结合、酶结合等分子功能,以及细胞质、肌动蛋白细胞骨架、轴突末端等细胞成分,ceRNA网络中mRNA显著富集于NF-κB信号通路、PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路、泛素介导的蛋白水解等代谢通路。构建的精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中mRNA PPI网络共包含23个节点和22条边,筛选获得影响精神分裂症发生发展的2个核心mRNA为BRCA1、GNAS。构建的精神分裂症患者外周血中差异表达的核心ceRNA网络包含5个节点和4条边。5个节点中包含2个核心mRNA:BRCA1、GNAS,1个miRNA:hsa-miR-502-5p,2个circRNA:hsa_circ_0001423、hsa_circ_0008494。4条边分别为hsa_circ_0001423/hsa-miR-502-5p/BRCA1、hsa_circ_0001423/hsa-miR-502-5p/GNAS、hsa_circ_0008494/hsa-miR-502-5p/BRCA1和hsa_circ_0008494/hsa-miR-502-5p/GNAS。结论与健康对照人群相比,精神分裂症患者外周血中有差异表达的circRNA 31个、miRNA 213个、mRNA 2624个,最终构建了包含5个节点和4条边的核心ceRNA网络。 展开更多
关键词 精神分裂症 circrna-mirna-mrna网络 竞争性内源rna网络 环状rna 微小rna 信使rna
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Comparison of gene expression between normalcolon mucosa and colon carcinoma by means of messenger RNA differential display 被引量:4
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作者 Wang L Lu W +2 位作者 Chen YG Zhou XM Gu JR 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1999年第6期533-534,共2页
关键词 COLONIC MUCOSA COLONIC NEOPLASMS rna messenger gene expression
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Significance of vascular endothelial growth factor messenger RNA expression in gastric cancer 被引量:16
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作者 TAO Hou-Quan LIN Yan-Zhen WANG Rui-Nian 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1998年第1期15-18,共4页
IM To study VEGF mRNA expression in gastric carcinoma and to clarify the association of its expression with the clinicopathologic features of the disease.METHODS In situ hybridization (ISH) and histochemistry were u... IM To study VEGF mRNA expression in gastric carcinoma and to clarify the association of its expression with the clinicopathologic features of the disease.METHODS In situ hybridization (ISH) and histochemistry were used to examine and analyze the expression of VEGF mRNA and antigen, and microvessel count (MVC) in 28 cases of gastric carcinomatous tissue in combination with clinical materials.RESULTS Ninteen of 28 gastric carcinomas were positive for VEGF mRNA. VEGF mRNA was mainly expressed in malignant cells and not in normal epithelium of gastric mucosa. Its expression was further increased in tumor cells adjacent to tumor necrosis zones, where stromal cells expressed VEGF mRNA occasionally. There was a close correlation between MVC and VEGF mRNA positivity (P<0005). High VEGF mRNA levels were significantly associated with serosal invasion, lymph node metastasis and TNM staging (P<005, respectively).CONCLUSION VEGF mRNA expression is associated with tumor invasion and metastasis by stimulating angiogenesis in gastric carcinoma.expression; endothelial growth factor. 展开更多
关键词 stomach neoplasms rna messenger neoplasm metastasis GENE
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Expression of alpha-fetoprotein messenger RNA in BEL-7404 human hepatoma cells and effect of L-4-oxalysine on the expression 被引量:3
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作者 WANG XingWang and XU BinKeywords oxalysine liver neoplasms +5 位作者 fetoprotein tumor cell, cultured RNA, messenger gene expression in situ hybridization immunohistochemistry 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1998年第4期22-25,共4页
AIM To investigate alpha-fetoprotein (AFP) mRNA expression in BEL-7404 human hepatoma cells and the effect of L-4-oxalysine (OXL) on the expression.METHODS BEl-7404 human hepatoma cells were maintained in RPMI 1640 me... AIM To investigate alpha-fetoprotein (AFP) mRNA expression in BEL-7404 human hepatoma cells and the effect of L-4-oxalysine (OXL) on the expression.METHODS BEl-7404 human hepatoma cells were maintained in RPMI 1640 media. Human AFP cDNA probe was labelled with digoxigenin-11-dUTP by the random primer labelling method. The expression of AFP mRNA in Bel-7404 cells was determined by an in situ hybridization technique with digoxigenin-labelled human AFP cDNA probe. The positive intensities of AFP mRNA in cells were analyzed by microspectrophotometer and expressed as absorbance at 470nm. For the experiment with OXL, cells were incubated with various concentrations of the agent for 72h.RESULTS Essentially all the hepatoma cells contained AFP mRNA in the cytoplasm, although in various amounts. The specificity of the hybridization reaction was confirmed by control experiments in which the use of RNase-treated BEL-7404 cells, non-AFP-producing cells (HL-60 human leukemia cells) or a nonspecific cDNA probe resulted in negative hybridization. When the cells were treated with OXL (25, 50mg/L), the content of AFP mRNA in the cytoplasm was decreased with the inhibition percentages of 34.3% and 70.1%, respectively (P<0.05).CONCLUSION AFP mRNA was expressed in BEL-7404 human hepatoma cells and OXL suppressed AFP mRNA expression in the cells. 展开更多
关键词 fetoprotein HEPATOMA rna messenger
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宫颈癌RNA分子的研究进展 被引量:8
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作者 陈昌贤 谢雨萱 +2 位作者 莫凌昭 宋红林 李力 《国际妇产科学杂志》 CAS 2018年第6期634-637,共4页
信使RNA(mRNA)、微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)等在内的RNA分子之间彼此联系、互相协调,共同构成动态的分子网络,即竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络。近年来研究揭示,ceRNA调控网络在促进宫颈癌的发生、发展... 信使RNA(mRNA)、微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)等在内的RNA分子之间彼此联系、互相协调,共同构成动态的分子网络,即竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络。近年来研究揭示,ceRNA调控网络在促进宫颈癌的发生、发展和转归等过程中发挥着重要的调控作用。ceRNA调控网络中的任何一种RNA分子出现异常,均有可能通过多条信号通路导致宫颈癌细胞增殖、浸润、迁移或凋亡。现就近年来取得的研究进展,重点对mRNA、miRNA、lncRNA和circRNA等RNA分子与宫颈癌的关系进行综述,旨在深入阐明宫颈癌发病相关RNA分子机制,从而为宫颈癌的诊断和治疗提供新思路。 展开更多
关键词 宫颈肿瘤 rna 信使 rnaS 长链非编码rna 环状rna 竞争性内源rna调控网络
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参芪复方对糖尿病GK大鼠肝脏组织mRNA、lncRNA表达谱的影响
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作者 刘桠 张翕宇 +2 位作者 谢春光 徐刚 彭思涵 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2024年第1期46-51,I0008-I0012,共11页
目的应用全转录组测序与实时聚合酶链锁反应(Real-time polymerase chain reaction,RT-qPCR)技术,探索参芪复方调控糖尿病GK大鼠肝脏信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱的机制研究。方法采... 目的应用全转录组测序与实时聚合酶链锁反应(Real-time polymerase chain reaction,RT-qPCR)技术,探索参芪复方调控糖尿病GK大鼠肝脏信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱的机制研究。方法采用高脂高糖饲料建立2型糖尿病模型,将GK大鼠随机分为模型组、参芪复方组和西药组。另将10只Wistar大鼠设为空白组,予普通饲料喂养。参芪复方组大鼠予参芪复方浸膏灌胃,西药组予西格列汀混悬液灌胃,模型组及空白组灌服生理盐水。干预12周,每周检测空腹血糖(fasting blood glucose,FBG)。运用HE染色法观察大鼠肝脏组织病理形态,在空白组、模型组和参芪复方组中每组随机选取4只大鼠进行全转录组测序,构建mRNA、lncRNA差异表达谱,分析差异基因生物学功能,并进行RT-qPCR验证。结果与空白组相比,糖尿病GK大鼠FBG显著升高(P<0.05),模型组大鼠肝脏可见肝细胞排列紊乱,边界模糊,出现弥漫空泡状改变,呈中度脂肪变性,伴见炎性浸润、弥漫水肿;与模型组相比,参芪复方组大鼠FBG在12周时明显降低(P<0.05),肝脏组织排列较整齐,脂质沉积、细胞水肿及炎细胞浸润明显减轻。全转录组结果显示,与空白组相比,模型组大鼠mRNA、lncRNA表达谱存在显著差异,决定了糖尿病大鼠生理病理上的差异表现。参芪复方可广泛调控mRNA、lncRNA的差异表达,富集分析显示参芪复方通过调控多条内分泌系统及代谢过程相关信号通路改善糖尿病,包括胰岛素分泌、非酒精性脂肪性肝病、胆固醇代谢、鞘脂代谢、胰岛素抵抗等信号通路。RT-qPCR结果显示,基因Irf1、Trim30、Tmcc3、Insig1与转录组结果一致,转录组准确性较高。结论参芪复方发挥调节血糖及改善肝脏脂质沉积、水肿的作用,可能与广泛调控mRNA、lncRNA的差异表达有关。 展开更多
关键词 参芪复方 2型糖尿病 长链非编码rna(lncrna) 信使rna(mrna)
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mRNA疫苗制备技术在甲型流感病毒疫苗研究中的应用
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作者 张民秀 谢芝勋 +6 位作者 李孟 罗思思 谢丽基 谢志勤 李丹 阮志华 王粲 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第12期16-22,28,共8页
禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)、H1N1和H3N2亚型人流感病毒(Influenza virus,IV)均属于甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)。IAV含有多种亚型,毒株变异快,因此IAV疫苗株需要根据当年的优势毒株进行相应的调整,这给疫苗的研... 禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)、H1N1和H3N2亚型人流感病毒(Influenza virus,IV)均属于甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)。IAV含有多种亚型,毒株变异快,因此IAV疫苗株需要根据当年的优势毒株进行相应的调整,这给疫苗的研制和生产带来巨大挑战。信使核糖核酸(messenger RNA,mRNA)疫苗制备工艺简单、生产时间短且容易规模化生产,在疾病预防方面具有广阔的应用前景。笔者对mRNA疫苗的种类、优化策略和IAV mRNA疫苗的研究现状进行了综述,旨在为IAV mRNA疫苗的研发提供理论参考。 展开更多
关键词 甲型流感病毒(IAV) 禽流感病毒(AIV) 信使核糖核酸(mrna) 非复制型mrna(Nr mrna) 自我扩增型mrna(Sa mrna) 疫苗
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弱精子症患者精子lncRNA与mRNA基因表达特征分析
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作者 石水波 罗龙华 +4 位作者 刘莲 黄学明 熊素萍 宋丹丹 李冬水 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2024年第9期782-788,共7页
目的:通过DNBSEQ平台测序技术构建文库,并以此来确定人类正常与弱精子症精子中lncRNA和mRNA的表达差异,并通过生物信息学方法分析其在弱精子症中的生物学意义。方法:将9份正常精液样本及9份弱精子症精液样本分组后,分离精子,提取总RNA,... 目的:通过DNBSEQ平台测序技术构建文库,并以此来确定人类正常与弱精子症精子中lncRNA和mRNA的表达差异,并通过生物信息学方法分析其在弱精子症中的生物学意义。方法:将9份正常精液样本及9份弱精子症精液样本分组后,分离精子,提取总RNA,通过DNBSEQ测序平台检测得到RNA-seq在精子中的表达情况,通过GO富集分析和KEGG通路分析,进一步分析其相关功能情况。结果:使用DNBSEQ平台检测,每组平均产出10.64G数据,共检测到282185个RNA,包含有107009个lncRNA,其中15157个lncRNA具有表达差异,2190个lncRNA表达上调,12967个表达下调;共检测到19514个mRNA,其中13736个mRNA具有表达差异,4995个mRNA表达上调,8741个mRNA表达下调。差异基因主要富集在精子细胞膜、离子通道的功能以及精子发育、受精相关的通路上。结论:通过对弱精子症与正常精子的测序分析,鉴别出差异表达的lncRNA和mRNA,可通过胞膜离子通道对精子功能进行调控,进而导致弱精子症的发生,可为弱精子症的进一步研究提供分子基础。 展开更多
关键词 长链非编码rna 弱精子症 rna测序 差异表达分析
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POCD小鼠海马组织中差异表达miRNA的筛选、靶基因预测和生物信息学分析及其调控机制探讨 被引量:4
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作者 张英立 刘乘麟 +4 位作者 于明懂 王莹 胡南 卢悦淳 吕国义 《山东医药》 CAS 2021年第9期14-18,共5页
目的采用生物信息学方法分析术后认知功能障碍(POCD)小鼠海马组织中差异表达miRNA(DEMs)及其靶基因(DEGs),并构建POCD小鼠海马组织中差异表达miRNA-mRNA的调控网络图,探讨其机制。方法在GEO数据库中搜索下载POCD小鼠海马组织与正常小鼠... 目的采用生物信息学方法分析术后认知功能障碍(POCD)小鼠海马组织中差异表达miRNA(DEMs)及其靶基因(DEGs),并构建POCD小鼠海马组织中差异表达miRNA-mRNA的调控网络图,探讨其机制。方法在GEO数据库中搜索下载POCD小鼠海马组织与正常小鼠海马组织基因表达谱芯片数据GSE95070,采用R软件lim⁃ma函数包筛选出差异表达的miRNA,即DEMs。将DEMs分别输入到miRTarBase、TargetScan、miRDB数据库中,三个数据库中皆存在的靶基因为差异表达的DEMs靶基因,即DEGs。使用R软件中的ggplot2、enrichplot函数包对DEGs进行了基因本体(GO)功能富集分析和KEGG信号通路分析。通过STRING在线工具构建DEGs蛋白互作网络(PPI),将蛋白间相互作用得分>0.4的节点输入到可视化工具Cytoscape软件中,利用cytoHubba插件筛选出节点度值排名前10的节点,即为可能参与小鼠POCD发生发展的枢纽基因。选取枢纽基因及其相应的DEMs,利用Cyto⁃scape软件构建POCD小鼠海马组织中差异表达miRNA-mRNA调控网络图。结果共筛选出19个显著差异表达的DEMs,得到448个DEGs。GO功能富集分析结果显示,DEGs在DNA结合的转录因子激活活性、特异性RNA聚合酶Ⅱ、微小GTP酶结合等分子功能中显著富集,在树突的形成以及调节、促进神经胶质细胞的增殖等生物学过程中显著富集,在突触膜的有机组成成分、细胞边缘以及囊泡运输等细胞组分中显著富集。KEGG信号通路分析结果显示,DEGs在Cushing综合征相关通路、cGMP-PKG信号通路、Hepatitis C信号通路、Apelin信号通路等通路中显著富集。小鼠POCD发生发展的10个枢纽基因分别为Gsk3β、Igf1、Cd34、Ubxn7、Smad2、Smarca4、Stat1、Grb2、Sin3a、Ncam1,相应的6个DEMs分别为mmu-miR-362-3p、mmu-miR-3065-5p、mmu-miR-592-3p、mmu-miR-28a-3p、mmu-miR-181c-5p、mmu-miR-351-5p,成功构建了POCD小鼠海马组织中差异表达miRNA-mRNA调控网络图,其中mmu-miR-362-3p调控Gsk3β的关系对、mmu-miR-3065-5p调控Igf1的关系对在调控网络中节点度最高。结论与正常小鼠海马组织相比,POCD小鼠海马组织中有19个差异表达的DEMs和448个DEGs;DEGs与树突的形成以及调节等有关,参与介导Cushing综合征相关通路、cGMP-PKG信号通路等。mmu-miR-362-3p、mmu-miR-3065-5p等差异表达的miRNA可能是通过调节Gsk3β、Igf1等靶基因的表达,影响POCD的发生发展。 展开更多
关键词 认知功能障碍 围手术期神经认知障碍 术后认知功能障碍 微小rna 差异表达微小rna 信使rna 靶基因 mirna-mrna调控网络图
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基于RNA-seq不明原因复发性流产绒毛组织mRNA基因差异性表达研究
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作者 杨丽 杨静 +2 位作者 叶尔登切切克 韩锐 腊晓琳 《国际妇产科学杂志》 CAS 2024年第3期322-328,341,共8页
目的:构建不明原因复发性流产(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)孕妇绒毛组织的mRNA差异性表达谱并进行功能分析,为阐明URSA的发生发展机制提供依据。方法:收集2022年3月于新疆医科大学第一附属医院妇科门诊收治的4例U... 目的:构建不明原因复发性流产(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)孕妇绒毛组织的mRNA差异性表达谱并进行功能分析,为阐明URSA的发生发展机制提供依据。方法:收集2022年3月于新疆医科大学第一附属医院妇科门诊收治的4例URSA(试验组)和4例选择性终止妊娠孕妇(对照组)的绒毛组织样本。应用转录组测序技术(RNA-seq)筛选2组差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对其进行GO功能注释、KEGG通路分析及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,进一步研究差异表达mRNA的功能,并筛选出URSA的关键基因。结果:RNA-seq分析共筛选出3350个DEGs,其中上调基因2259个,下调基因1091个。通过PPI网络分析,筛选出与URSA有关的前10个关键基因:TYROBP、CD74、GH1、GH2、STAT5A、HLA-DRA、STAT5B、HLA-DRB1、CISH和HLA-A。通过GO和KEGG生物学功能分析,发现差异性表达的mRNA参与到多种白细胞分化相关免疫反应通路和同种异体免疫应答等生物学过程。结论:利用RNA-seq获得的URSA的mRNA差异性表达谱,筛选出可能与URSA有关的关键基因及生物学通路,为进一步研究URSA的发病机制和诊疗靶点提供了理论依据。 展开更多
关键词 流产 习惯性 绒毛组织 rna 信使 转录组测序 免疫调节
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妊娠期高血压病患者血清DNMT1 mRNA和LncRNA UCA1水平表达与妊娠结局的关系
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作者 侯书利 张金玲 +1 位作者 李燕 李晓晓 《现代检验医学杂志》 CAS 2024年第5期47-53,共7页
目的分析妊娠期高血压疾病(hypertensive disorder complicating pregnancy,HDCP)患者血清DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-codingRNA,LncRNA)尿路上皮癌胚抗原1(ur... 目的分析妊娠期高血压疾病(hypertensive disorder complicating pregnancy,HDCP)患者血清DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-codingRNA,LncRNA)尿路上皮癌胚抗原1(urothelial carcinoembryonic antigen 1,UCA1)水平与妊娠结局的关系。方法选取2021年3月~2023年8月在邯郸市妇幼保健院诊治的HDCP患者195例为病例组、健康妊娠孕妇195例为对照组。收集所有孕妇临床资料并检测分娩前1天生化指标;荧光定量PCR法检测血清DNMT1 mRNA,LncRNA UCA1水平;根据病情将病例组分为妊娠期高血压(pregnancy induced hypertension,PIH)组、轻度子痫前期(preeclampsia,PE)组、重度PE组;根据HDCP患者分娩时不良妊娠结局情况分为妊娠结局良好组和妊娠结局不良组;比较对照组和病例组临床资料和生化指标、血清DNMT1 mRNA,LncRNA UCA1水平;比较不同严重程度HDCP患者血清DNMT1mRNA和LncRNA UCA1水平;比较不同妊娠结局HDCP患者临床资料和生化指标、血清DNMT1 mRNA和LncRNAUCA1水平;分析HDCP患者血清DNMT1 mRNA与LncRNA UCA1的相关性,影响HDCP患者妊娠结局的因素,血清DNMT1 mRNA和LncRNA UCA1对HDCP患者发生不良妊娠结局的预测价值。结果与对照组比较,病例组收缩压、舒张压、白细胞计数水平明显升高,血清DNMT1 mRNA(0.72±0.18 vs 1.00±0.04),LncRNA UCA1(0.61±0.16vs 1.00±0.02)水平明显降低,差异具有统计学意义(t=40.651,32.595,7.837,21.205,33.775,均P<0.001);PIH组、轻度PE组、重度PE组血清DNMT1 mRNA(0.85±0.20,0.74±0.18,0.50±0.15),LncRNA UCA1(0.77±0.18,0.58±0.16,0.43±0.13)水平依次降低,差异具有统计学意义(F=52.687,64.030,均P<0.001);HDCP患者血清DNMT1 mRNA与LncRNA UCA1呈正相关(r=0.582,P<0.001);与妊娠结局良好组比较,妊娠结局不良组HDCP严重程度较高,收缩压、舒张压、白细胞计数水平明显升高,血清DNMT1 mRNA(0.80±0.20 vs 0.59±0.15),LncRNA UCA1(0.72±0.17 vs 0.43±0.14)水平明显降低,差异具有统计学意义(χ^(2)=18.386,t=2.615~12.290,均P<0.05);重度PE[OR(95%CI)=1.708(1.193~2.445)]、收缩压[OR(95%CI)=1.495(1.090~2.049)]、舒张压[OR(95%CI)=1.621(1.076~2.442)]是影响HDCP患者发生不良妊娠结局的危险因素,DNMT1 mRNA[OR(95%CI)=0.833(0.725~0.957)],LncRNA UCA1[OR(95%CI)=0.796(0.696~0.909)]是影响HDCP患者发生不良妊娠结局的保护因素(均P<0.05);DNMT1 mRNA和LncRNA UCA1二者联合预测HDCP患者发生不良妊娠结局的曲线下面积(area under curve,AUC)大于DNMT1 mRNA及LncRNA UCA1单独预测的AUC(0.926 vs 0.832,0.844),差异具有统计学意义(Z=2.932,2.345,均P<0.05)。结论HDCP患者血清DNMT1 mRNA和LncRNA UCA1水平均较低,与病情程度、妊娠结局相关,DNMT1 mRNA联合LncRNA UCA1检测对不良妊娠结局有较佳预测效能。 展开更多
关键词 妊娠期高血压疾病 DNA甲基转移酶1信使rna 长链非编码rna尿路上皮癌胚抗原1 妊娠结局
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治疗遗传病的RNA药物研究进展 被引量:2
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作者 罗婷 霍春晓 +1 位作者 周天华 谢珊珊 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期406-416,共11页
RNA药物能够通过识别互补序列靶向对应基因以抑制特定蛋白或RNA的表达,或通过翻译合成目的基因编码的蛋白来发挥遗传性疾病治疗作用。RNA药物主要分为寡核苷酸药物(包括反义寡核苷酸、小干扰RNA和RNA适配体)和信使RNA药物等。其中,反义... RNA药物能够通过识别互补序列靶向对应基因以抑制特定蛋白或RNA的表达,或通过翻译合成目的基因编码的蛋白来发挥遗传性疾病治疗作用。RNA药物主要分为寡核苷酸药物(包括反义寡核苷酸、小干扰RNA和RNA适配体)和信使RNA药物等。其中,反义寡核苷酸和小干扰RNA已用于临床治疗遗传病,而RNA适配体和信使RNA药物目前还处于临床试验阶段。当前主要通过对RNA药物进行化学修饰(如对信使RNA进行假尿嘧啶修饰)来降低免疫原性和提升药物疗效,以及开发纳米粒载体、细胞外囊泡和类病毒载体等递送载体来解决RNA药物的稳定性、特异靶向性和安全性等问题。本文概述了目前用于治疗遗传病的11种RNA药物的具体作用分子机制,并简单讨论了RNA药物的化学修饰及递送载体的研究现状。 展开更多
关键词 rna 药物 rna 医学 反义寡核苷酸 小干扰rna rna适配体 信使rna药物 遗传病 综述
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结核病mRNA疫苗的研制策略与展望
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作者 杨静 肖丽娟 方谭玮 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期590-595,共6页
应对危害全球人类健康的重大传染性疾病——结核病流行的严峻挑战,迫切需要研制出有效的新型结核病疫苗。虽然目前开展了多种类型的新型结核病疫苗的研制,且一些疫苗已进入临床试验研究,但至今仍未能获得可以替代传统卡介苗(BCG)的更为... 应对危害全球人类健康的重大传染性疾病——结核病流行的严峻挑战,迫切需要研制出有效的新型结核病疫苗。虽然目前开展了多种类型的新型结核病疫苗的研制,且一些疫苗已进入临床试验研究,但至今仍未能获得可以替代传统卡介苗(BCG)的更为有效的新型疫苗。随着mRNA疫苗研制技术的突破,其研发周期短、高效、安全和生产成本低等优点,使其成为一个非常有前景的疫苗研发新方向。笔者主要就mRNA疫苗的技术原理、优势、制备技术,以及结核病mRNA疫苗的研制策略和现状等方面的研究进展进行综述,以期为结核病mRNA疫苗的研制提供参考。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 rna 细菌 rna 信使 疫苗 灭活 策略 实验性 综述
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基于GEO数据库联合分析高原病患者外周血差异表达miRNA及其上游转录因子和下游mRNA
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作者 伊力亚斯·艾萨 阿米娜·苏建和 付瑾 《广西医学》 CAS 2024年第2期284-291,共8页
目的基于GEO数据库联合分析高原病患者外周血差异表达miRNA及其上游转录因子和下游mRNA,从而基于分子层面探讨高原病潜在的发病机制。方法(1)在GEO数据库获取与高原病相关的miRNA表达谱芯片(GSE90500数据集)和mRNA表达谱芯片(GSE29977... 目的基于GEO数据库联合分析高原病患者外周血差异表达miRNA及其上游转录因子和下游mRNA,从而基于分子层面探讨高原病潜在的发病机制。方法(1)在GEO数据库获取与高原病相关的miRNA表达谱芯片(GSE90500数据集)和mRNA表达谱芯片(GSE29977数据集),再采用R语言3.6软件limma程序包筛选差异表达miRNA和差异表达mRNA。(2)利用FunRich软件预测差异表达miRNA的下游靶基因(mRNA)和上游转录因子,并对上游转录因子进行功能富集分析。使用R语言3.6软件、DAVID数据库对下游靶基因分别进行功能和通路富集分析。(3)对GSE29977数据集的差异表达mRNA与差异表达miRNA下游靶基因取交集,并根据miRNA及其靶基因的表达关系,筛选miRNA-mRNA调控轴。结果(1)共筛选出14个差异表达miRNA及其385个下游靶基因、123个上游转录因子。差异表达miRNA主要富集的转录因子包括EGR1、RREB1、MYF5和MEF2A。(2)上游转录因子涉及的生物学过程主要包括信号转导、核酸代谢的调节、脂肪酸代谢、糖代谢、细胞因子和趋化因子介导的信号通路、细胞周期等。下游靶基因富集的生物学过程主要包括转录调控、心肌细胞增殖、血管生成和染色质重塑等,富集的信号通路主要包括PD-L1表达和PD-1免疫检查点通路、细胞衰老、MTOR信号通路、MAPK信号通路及PI3K/AKT信号通路等。(3)共筛选得到443个差异表达mRNA,与差异表达miRNA的下游靶基因取交集后获得与高原病相关的5个核心mRNA,并构建出hsa-miR-155-5p-MYO1D调控轴。结论高原病中存在多个差异表达的miRNA,其上游转录因子EGR1、RREB1、MYF5、MEF2A可能是参与调控下游靶基因转录的核心因子;差异表达miRNA的上游转录因子和下游靶基因可能通过调控基因转录、细胞增殖与凋亡、炎症过程等生物学过程,共同参与高原病的发生、发展。hsa-miR-155-5p与下游靶基因MYO1D之间的调控关系可能在高原病的发生、发展中发挥重要的作用。 展开更多
关键词 高原病 微小rna 信使rna 转录因子 调控轴 分子机制
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心房颤动相关的小RNA的研究进展 被引量:1
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作者 谷蕾 陈效安 +1 位作者 张卫泽 胡威 《心血管病学进展》 CAS 2020年第6期622-626,共5页
心房颤动(房颤)是一种常见的心律失常,与心血管疾病的发病率和死亡率增加有关,可诱发心力衰竭、卒中以及形成血栓等致死性心血管疾病。随着生物学技术和预测软件的不断发展,越来越多的研究发现与房颤相关的小RNA,包括微小RNA、长链非编... 心房颤动(房颤)是一种常见的心律失常,与心血管疾病的发病率和死亡率增加有关,可诱发心力衰竭、卒中以及形成血栓等致死性心血管疾病。随着生物学技术和预测软件的不断发展,越来越多的研究发现与房颤相关的小RNA,包括微小RNA、长链非编码RNA、环状RNA、小干扰RNA和信使RNA等参与了房颤相关的作用机制,促进了房颤的发生和发展。阐明RNA在房颤中的作用及其调控机制,对于评估患者预后以及发掘房颤患者药物治疗的新靶点具有重要的临床意义。 展开更多
关键词 心房颤动 微小rna 长链非编码rna 环状rna 小干扰rna 信使rna
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长链非编码RNA的竞争性内源RNA调控模式在动脉粥样硬化中的研究进展 被引量:6
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作者 韩爽 陈宇 张伟丽 《中国动脉硬化杂志》 CAS 2021年第3期185-192,共8页
动脉粥样硬化是一种缓慢进行性的血管炎症性病变。越来越多的研究表明长链非编码RNA(lncRNA)作为竞争性内源RNA(ceRNA)与微小RNA(miRNA)结合,通过ceRNA网络调控靶基因信使RNA(mRNA)分子的表达水平和功能,在动脉粥样硬化的病理生理过程... 动脉粥样硬化是一种缓慢进行性的血管炎症性病变。越来越多的研究表明长链非编码RNA(lncRNA)作为竞争性内源RNA(ceRNA)与微小RNA(miRNA)结合,通过ceRNA网络调控靶基因信使RNA(mRNA)分子的表达水平和功能,在动脉粥样硬化的病理生理过程中发挥重要作用。lncRNA、miRNA和mRNA之间的互作调控机制复杂。本文综述了lncRNA-miRNA-mRNA调控网络在动脉粥样硬化发病机制中的调控关系,阐述该调控网络在内皮细胞功能障碍、血管平滑肌细胞表型转化、巨噬细胞激活以及脂质代谢异常等病变中的重要作用,为动脉粥样硬化临床诊疗提供新思路。 展开更多
关键词 长链非编码rna 竞争性内源rna 微小rna 信使rna 动脉粥样硬化
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SLE患者PBMCs雌激素受体mRNA水平与IL-10mRNA水平的研究 被引量:4
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作者 周倩宜 齐文 +1 位作者 成韩锋 王玉亮 《天津医药》 CAS 北大核心 2005年第11期694-696,共3页
目的:探讨未经刺激外周血单个核细胞(PBMCs)雌激素受体(ER)mRNA水平和白细胞介素10(IL-10)mRNA水平在系统性红斑狼疮发病中的作用。方法:分离25例系统性红斑狼疮(SLE)患者(患者组)和15例正常人(对照组)新鲜外周血单个核细胞,提取总RNA,... 目的:探讨未经刺激外周血单个核细胞(PBMCs)雌激素受体(ER)mRNA水平和白细胞介素10(IL-10)mRNA水平在系统性红斑狼疮发病中的作用。方法:分离25例系统性红斑狼疮(SLE)患者(患者组)和15例正常人(对照组)新鲜外周血单个核细胞,提取总RNA,利用半定量RT-PCR方法逆转录并扩增雌激素受体和IL-10,通过凝胶图像扫描系统对PCR产物的电泳条带进行密度扫描。结果:患者组PBMCsERmRNA水平和IL-10mRNA水平均高于正常对照组(P<0.01)。患者组和对照组PBMCsERmRNA水平与IL-10mRNA水平均呈正相关(r分别为0.442和0.557,P<0.05)。结论:SLE患者外周血单个核细胞存在雌激素受体mRNA和IL-10mRNA表达异常,IL-10表达的上调可能与雌激素受体有关,过量的IL-10可能导致了SLE患者B细胞产生大量自身抗体。 展开更多
关键词 红斑狼疮 系统性 单个核细胞 受体 雌激素 白细胞介素10 rna 信使 雌激素受体Mrna Mrna水平 SLE患者 IL-10 PBMCS
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基于生物信息学构建膀胱尿路上皮癌的ceRNA网络以及关键mRNA与免疫功能分析
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作者 邵波 汪进 +5 位作者 万水 吴开秀 田申 杜沂宸 陈丹霞 马园园 《现代检验医学杂志》 CAS 2024年第1期29-35,66,共8页
目的构建膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BLCA)具有预后价值的内源竞争性核糖核酸(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,分析关键信使RNA(messenger RNA,mRNA)与免疫功能的关系。方法UCSC Xena数据库下载404例BLCA... 目的构建膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BLCA)具有预后价值的内源竞争性核糖核酸(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,分析关键信使RNA(messenger RNA,mRNA)与免疫功能的关系。方法UCSC Xena数据库下载404例BLCA患者和28例正常人的mRNA表达数据,通过差异分析筛选关键mRNA。ENCORI数据库中查找与关键mRNA结合的微小核糖核酸(micro RNA,miRNA)以及与miRNA结合的长链非编码核糖核酸(long non-coding RNA,LncRNA)。TCGA数据库下载miRNA和LncRNA的表达数据,对关键mRNA与所有miRNA以及mi RNA与所有LncRNA进行共表达分析,筛选出关键的miRNA和LncRNA。根据关键mRNA,miRNA和LncRNA在肿瘤患者和正常人之间表达量的差异进行生存分析,最后构建了ceRNA调控网络。借助TIMER 2.0数据库,分析关键mRNA与免疫细胞、免疫检查点(CD274,PDCD1,CTLA4)以及免疫细胞标记基因(immunomarker genes,IG)的相关性。结果筛选出关键mRNA*共22个,其中差异显著性最高的是脯氨酸3-羟化酶4(proline3-hydroxylase 4,P3H4)。在BLCA中,P3H4表达高,在高表达组患者的生存时间较短。以关键mRNA为中心环节,共筛选出33个miRNA和14个LncRNA。经过共表达分析和生存分析后,筛选出具有预后价值的关键miRNA和关键LncRNA分别为hsa-miR-151a-3p和MIR100HG。上述分析结果差异具有统计学意义(均Ρ<0.05)。综合以上结果,构建了包含1个mRNA,1个miRNA和1个LncRNA的ceRNA调控网络。免疫分析首次在BLCA肿瘤微环境中发现了与P3H4表达量呈显著正相关的双阳性T细胞。此外还有3种免疫细胞(肿瘤相关性中性粒细胞、肿瘤相关巨噬细胞、树突状细胞)、3个免疫检查点(CD274,PDCD1,CTLA4)以及15个IG与P3H4相关度显著,这些差异具有统计学意义(均Ρ<0.01)。结论该研究有助于揭示BLCA的进展机制,构建的ceRNA网络及免疫分析,可为BLCA患者的诊断、治疗、预测提供新的生物学靶点和方向。 展开更多
关键词 膀胱尿路上皮癌 信使核糖核酸 内源竞争性rna 免疫功能
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抑制表皮生长因子受体基因表达的pSIREN-Shuttle RNAi表达载体的构建
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作者 栾建刚 梁传余 +1 位作者 文艳君 李炯 《山东大学耳鼻喉眼学报》 CAS 2006年第1期4-8,共5页
目的:构建抑制表皮生长因子受体(EGFR)基因表达的RNA干扰(RNAi)质粒表达载体pSI-REN-Shuttle-EGFR。方法:化学合成3条编码短发夹RNA序列的、特异靶向EGFR基因的寡核苷酸链,各69个碱基,退火,克隆到RNAi-Ready pSIREN-Shuttle载体的人源U... 目的:构建抑制表皮生长因子受体(EGFR)基因表达的RNA干扰(RNAi)质粒表达载体pSI-REN-Shuttle-EGFR。方法:化学合成3条编码短发夹RNA序列的、特异靶向EGFR基因的寡核苷酸链,各69个碱基,退火,克隆到RNAi-Ready pSIREN-Shuttle载体的人源U6启动子的下游,重组构建RNAi质粒,3种载体转染人鼻咽癌细胞株(CNE),用RT-PCR分析pSIREN-Shuttle-EGFR载体对EGFR基因的mRNA表达抑制效果。结果:重组构建的pSIREN-Shuttle-EGFR载体经插入基因片段序列分析,表明69个碱基成功插入到预计位点,并且序列完全一致。CNE细胞EGFR基因的mRNA被明显抑制。结论:RNAi质粒表达载体介导对EGFR基因的RNA干扰可能是鼻咽癌干预治疗的一种有效手段。 展开更多
关键词 受体 表皮生长因子 rna 信使 rna 干扰 rna 小发夹
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