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RPL1, a Gene Involved in Epigenetic Processes Regulates Phenotypic Plasticity in Rice 被引量:2
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作者 Cui-Cui Zhang Wen-Ya Yuan Qi-Fa Zhang 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2012年第2期482-493,共12页
Organisms can adjust their phenotype in response to changing environmental conditions. This phenomenon is termed phenotypic plasticity. Despite its ubiquitous occurrence, there has been very little study on the molecu... Organisms can adjust their phenotype in response to changing environmental conditions. This phenomenon is termed phenotypic plasticity. Despite its ubiquitous occurrence, there has been very little study on the molecular mechanism of phenotypic plasticity. In this study, we isolated a rice (Oryza sativa L.) mutant, rice plasticity 1 (rpl1), that displayed increased environment-dependent phenotypic variations. RPL1 was expressed in all tissues examined. The protein was localized in the nucleus and its distribution in the nucleus overlapped with heterochromatin. The rpll mutation led to an increase in DNA methylation on repetitive sequences and a decrease in overall histone acetylation. In addition, the mutation affected responses of the rice plant to phytohormones such as brassinosteroid, gibberellin, and cytokinin. Analysis of the putative rice brassinosteroid receptor OsBRI1, a key hormone signaling gene, indicated that RPL1 may be involved in the regulation of epigenomic modification of the gene. These data suggest that RPL1 regulated phenotypic plasticity likely through its involvement in epigenetic processes affecting responses of the plant to phytohormones. 展开更多
关键词 Phenotypic plasticity rpl1 EPIGENETICS PHYTOHORMONE evolution.
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糖酵解参与的黑色素瘤细胞放射敏感性lncRNAs的初步筛选及相关性分析
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作者 王琦 黄程辉 +2 位作者 胡一 严文广 龚恋 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期565-574,共10页
目的:通过微阵列芯片技术筛选糖酵解参与的黑色素瘤细胞放射治疗(以下简称放疗)敏感性相关的lncRNA和mRNA表达谱,初步探索lncRNA调控糖酵解途径影响黑色素瘤细胞放疗敏感性的分子机制。方法:以不同浓度(1.25、2.50、5.00、10.00 mmol/L)... 目的:通过微阵列芯片技术筛选糖酵解参与的黑色素瘤细胞放射治疗(以下简称放疗)敏感性相关的lncRNA和mRNA表达谱,初步探索lncRNA调控糖酵解途径影响黑色素瘤细胞放疗敏感性的分子机制。方法:以不同浓度(1.25、2.50、5.00、10.00 mmol/L)的2-脱氧-D-葡萄糖(2-deoxy-D-glucose,2-DG)处理、不同剂量(0、2、4、6、8 Gy)的X射线照射黑色素瘤细胞WM35。采用MTT法检测NC-0 Gy组(阴性对照组)、NC-4 Gy组(仅4 Gy X射线照射)、2-DG组(仅2.50 mmol/L 2-DG处理)、2-DG-4 Gy组(2.50 mmol/L 2-DG处理,4 Gy X射线照射)增殖能力;lncRNA和mRNA表达谱微阵列芯片检测NC-4 Gy组和2-DG-4 Gy组的lncRNA和mRNA表达谱的改变。采用CNC(coding-noncoding)分析预测表达最显著的10个lncRNA潜在靶基因,构建差异lncRNA和mRNA共表达网络。运用基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和KEGG(Kyoto EncyclopediaofGenesandGenomes)通路富集分析预测差异表达的lncRNA的功能分布;real-time RT-PCR定量检测差异表达上调最显著的5个和下调最显著的5个lncRNA的表达。结果:2-DG处理WM35细胞48和96 h,细胞增殖均受到明显抑制(均P<0.05),呈剂量依赖关系;大剂量X射线照射抑制WM35细胞的增殖,造成细胞大量死亡,4 Gy X射线照射后细胞增殖活性较阴性对照组下降61%;对NC-4 Gy组和2-DG-4 Gy组行lncRNA芯片分析,发现有1206个lncRNA和543个mRNA差异表达,real-time RT-PCR示lncRNA的变化与mRNA芯片基本一致;进一步CNC分析示这10个表达最显著的lncRNA与333个靶基因之间存在正/负相关,GO功能富集分析结果显示lncRNA主要富集于DNA结合、DNA损伤和修复、细胞周期阻滞、氧化应激等功能,KEGG通路富集分析结果显示这10个lnRNA主要与放疗敏感性相关。结论:采用微阵列芯片技术筛选出糖酵解参与的黑色素瘤细胞放疗敏感性相关的差异表达lncRNA,lncRNA RPL34-AS1可能是黑色素瘤放疗潜在的生物靶点。 展开更多
关键词 黑色素瘤 放疗敏感性 2-脱氧-D-葡萄糖 糖酵解 lncRNA RPL34-AS1
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假基因RPL34-PS1促进B细胞淋巴瘤生长的研究
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作者 刘金晶 周芳超 +1 位作者 张毅 郁多男 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS 北大核心 2021年第2期52-56,67,共6页
通过将假基因RPL34-PS1的序列克隆至MSCV-PIG载体上后,包装反转录病毒并感染小鼠B淋巴瘤细胞38B9,构建稳定过表达RPL34-PS1的38B9细胞系。对体外培养的细胞进行计数观察细胞增殖;利用流式检测技术观察细胞的凋亡和周期;进行小鼠皮下荷... 通过将假基因RPL34-PS1的序列克隆至MSCV-PIG载体上后,包装反转录病毒并感染小鼠B淋巴瘤细胞38B9,构建稳定过表达RPL34-PS1的38B9细胞系。对体外培养的细胞进行计数观察细胞增殖;利用流式检测技术观察细胞的凋亡和周期;进行小鼠皮下荷瘤试验观察体内成瘤并进行相关机制研究。结果表明:假基因RPL34-PS1对体外培养的38B9的生长速率、周期及凋亡无显著影响,但在体内能显著增加B细胞淋巴瘤的生长,其促进体内肿瘤生长的机制可能是肿瘤微环境中T淋巴细胞数量的减少之故,说明RPL34-PS1在微环境中靶向免疫细胞以促进肿瘤生长,RPL34-PS1可能可作为B细胞淋巴瘤的临床治疗的一个潜在靶点。 展开更多
关键词 假基因 RPL34-PS1 B细胞淋巴瘤 T细胞
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lncRNA RPL34-AS1调控miR-670-5p/SMAD4对胃癌细胞生物学行为的影响
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作者 朱朝玉 范长儒 刘贵峰 《临床和实验医学杂志》 2022年第2期141-145,共5页
目的探讨lncRNA RPL34-AS1对胃癌细胞生物学行为的影响及其对miR-670-5p/SMAD4分子轴的调控作用。方法回顾性收集2018年5月至2019年6月期间临沂市肿瘤医院收治的33例胃癌患者的癌组织及其癌旁组织标本。QRT-PCR检测RPL34-AS1、miR-670-5... 目的探讨lncRNA RPL34-AS1对胃癌细胞生物学行为的影响及其对miR-670-5p/SMAD4分子轴的调控作用。方法回顾性收集2018年5月至2019年6月期间临沂市肿瘤医院收治的33例胃癌患者的癌组织及其癌旁组织标本。QRT-PCR检测RPL34-AS1、miR-670-5p的表达量,蛋白质印迹法检测SMAD4表达。体外培养人胃癌细胞HGC-27,实验分组:pcDNA组(转染RPL34-AS1过表达载体的阴性对照)、pcDNA-RPL34-AS1组(转染RPL34-AS1过表达载体)、anti-miR-NC组(转染miR-670-5p特异性寡核苷酸抑制剂的阴性对照)、anti-miR-670-5p组(转染miR-670-5p特异性寡核苷酸抑制剂)、pcDNA-RPL34-AS1+miR-NC组(共转染pcDNA-RPL34-AS1与阴性对照mimic NC序列)、pcDNA-RPL34-AS1+miR-670-5p组(共转染pcDNA-RPL34-AS1与miR-670-5p寡核苷酸模拟物)。MTT与平板克隆形成实验检测细胞增殖与克隆形成数,流式细胞术检测细胞凋亡率,划痕实验与Transwell小室法检测细胞迁移及侵袭能力;双荧光素酶报告基因实验检测RPL34-AS1与miR-670-5p的靶向关系,以及miR-670-5p与SMAD4的靶向关系。结果与癌旁组织比较,胃癌组织中RPL34-AS1和SMAD4的表达量降低,miR-670-5p的表达量升高,差异均有统计学意义(P<0.05)。过表达RPL34-AS1或抑制miR-670-5p表达后,SMAD4表达量升高,细胞活力降低,集落形成数和侵袭细胞数减少,迁移距离减小,细胞凋亡率升高,差异均有统计学意义(P<0.05)。RPL34-AS1可靶向调控miR-670-5p,miR-670-5p可靶向调控SMAD4;而miR-670-5p过表达可逆转RPL34-AS1过表达对细胞生物学行为的作用。结论LncRNA RPL34-AS1过表达可通过调控miR-670-5p/SMAD4而抑制胃癌细胞增殖、克隆形成、迁移、侵袭及诱导细胞凋亡。 展开更多
关键词 胃癌 lncRNA RPL34-AS1 miR-670-5p SMAD4 增殖 迁移 侵袭
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lncRNA RPL22P1-201通过调控miR-216b-5p表达影响前列腺癌细胞增殖、细胞周期和多西紫杉醇的敏感性
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作者 杨超 薛建国 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期881-887,共7页
目的:探究长链非编码RNA(lncRNA)RPL22P1-201通过介导miR-216b-5p表达对前列腺癌细胞增殖、细胞周期以及多西紫杉醇敏感性的作用机制。方法:基于Cancer LncRNA Census数据库分析前列腺癌组织和正常组织中RPL22P1-201的表达差异。实时定... 目的:探究长链非编码RNA(lncRNA)RPL22P1-201通过介导miR-216b-5p表达对前列腺癌细胞增殖、细胞周期以及多西紫杉醇敏感性的作用机制。方法:基于Cancer LncRNA Census数据库分析前列腺癌组织和正常组织中RPL22P1-201的表达差异。实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测前列腺癌细胞株(DU-145、C4-2B、PC3、22Rv1、LNCaP)和正常前列腺上皮细胞(RWPE-1)中RPL22P1-201表达水平。将PC3细胞分为si-RPL22P1-201组(转染RPL22P1-201干扰序列)和si-NC组(转染si-NC序列),集落形成实验检测PC3细胞增殖能力,流式细胞术检测PC3细胞周期,CCK-8法检测多西紫杉醇处理后各组PC3细胞的增殖情况,双荧光素酶报告基因实验验证RPL22P1-201与靶基因的结合,qRT-PCR检测miR-216b-5p表达水平,Western印迹检测TrkB、CDK4、cyclin D2、cyclin D3、CDK6蛋白表达水平。结果:前列腺癌组织中RPL22P1-201表达水平高于正常组织(P<0.01),前列腺癌细胞株中RPL22P1-201表达水平高于正常前列腺上皮细胞(P<0.01),si-NC组和si-RPL22P1-201组集落数量分别为(256.1±28.79)个和(78.77±14.52)个,差异有统计学意义(P<0.01)。si-NC组和si-RPL22P1-201组G0/G1细胞率分别为(43.18±4.56)%和(68.85±3.40)%,S细胞率分别为(36.84±2.28)%和(24.27±2.74)%,G2/M细胞率分别为(19.98±2.69)%和(6.88±1.57)%,差异均有统计学意义(均P<0.05)。si-RPL22P1-201组在多西紫杉醇作用下的细胞存活率均低于si-NC组(均P<0.05),RPL22P1-201能够与miR-216b-5p配对结合(P<0.01)。相比si-NC组,si-RPL22P1-201组PC3细胞中miR-216b-5p表达降低(P<0.01),TrkB、CDK4、cyclin D2、cyclin D3、CDK6蛋白表达均降低。结论:RPL22P1-201在前列腺癌中高表达,沉默RPL22P1-201通过升高miR-216b-5p表达抑制前列腺癌PC3细胞增殖和细胞周期,并增强PC3细胞对多西紫杉醇的敏感性。 展开更多
关键词 前列腺癌 RPL22P1-201 miR-216b-5p 细胞增殖 细胞周期 多西紫杉醇
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花生核糖体蛋白L29-1(RPL29-1)基因克隆表达分析及载体构建 被引量:5
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作者 曹广英 吴琪 +4 位作者 唐月异 王秀贞 孙全喜 关淑艳 王传堂 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期1730-1736,共7页
核糖体蛋白是核糖体的主要组成成分,在细胞内蛋白质生物合成过程中具有重要作用。RPL29-1是核糖体大亚基60S的一个组件。本研究以花生品种日花1号为材料,利用RACE方法成功得到RPL29-1基因的c DNA序列,并获得DNA序列。RPL29-1基因c DNA... 核糖体蛋白是核糖体的主要组成成分,在细胞内蛋白质生物合成过程中具有重要作用。RPL29-1是核糖体大亚基60S的一个组件。本研究以花生品种日花1号为材料,利用RACE方法成功得到RPL29-1基因的c DNA序列,并获得DNA序列。RPL29-1基因c DNA序列包括186 bp的开放阅读框,编码61个氨基酸。RPL29-1基因DNA序列含有两个外显子和一个内含子。一级结构分析表明,RPL29-1蛋白质分子量为7 127.02 Da,等电点为10.29。本研究采用荧光定量技术(q RT-PCR)分析了RPL29-1基因在花生品种日花1号植株中的组织表达和青枯菌胁迫条件下的表达变化规律,并构建了RPL29-1的过表达载体和反义表达载体,为进一步通过功能分析研究花生RPL29-1基因在抗青枯病中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 花生 日花1号 核糖体蛋白 RPL29-1 植物表达载体构建
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lncRNA RPL34-AS1通过靶向调控miR-575表达对卵巢癌SKOV3细胞增殖和凋亡的影响 被引量:3
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作者 张敬 董杰 +2 位作者 王秋桔 崔允巍 张辉 《中华细胞与干细胞杂志(电子版)》 2020年第3期146-154,共9页
目的探究RPL34-AS1对卵巢癌细胞增殖、迁移的影响及其作用机制。方法取对数生长期SKOV3细胞用无血清培养基同步化12 h,将pcDNA、pcDNA-RPL34-AS1、si-NC、si-RPL34-AS1、anti-miR-NC、anti-miR-575转染至SKOV3细胞中,分别记为pcDNA组、p... 目的探究RPL34-AS1对卵巢癌细胞增殖、迁移的影响及其作用机制。方法取对数生长期SKOV3细胞用无血清培养基同步化12 h,将pcDNA、pcDNA-RPL34-AS1、si-NC、si-RPL34-AS1、anti-miR-NC、anti-miR-575转染至SKOV3细胞中,分别记为pcDNA组、pcDNA-RPL34-AS1组、si-NC组、si-RPL34-AS1组、anti-miR-NC组、anti-miR-575组;将pcDNA-RPL34-AS1与miR-NC、miR-575分别共转染至SKOV3细胞中,记为pcDNA-RPL34-AS1+miR-NC组、pcDNA-RPL34-AS1+miR-575组。实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测临床组织标本及转染后各组细胞中RPL34-AS1和miR-575的表达水平;双荧光素酶报告实验检测RPL34-AS1和miR-575的靶向关系;四甲基偶氮唑盐比色法(MTT)检测细胞存活率;流式细胞术检测细胞凋亡;蛋白质印迹(Western blot)法检测细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1A(p21)、B细胞淋巴瘤/白血病-2(Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)蛋白表达水平。两组间比较采用独立样本t检验,多组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用LSD-t检验。结果与癌旁组织相比,卵巢癌组织中RPL34-AS1表达水平降低(1.00±0.08比0.47±0.05),miR-575表达水平升高(1.01±0.07比3.12±0.28)(P<0.05)。转染si-RPL34-AS1后,细胞活性升高(48 h:0.68±0.06比0.55±0.05;72 h:0.99±0.08比0.71±0.06),G1期细胞所占比例降低(13.42±1.38比32.15±2.11),S期细胞所占比例升高(53.75±5.22比34.69±3.41),细胞凋亡率降低(4.31±0.42比9.25±0.91),CyclinD1、Bcl-2表达水平升高(0.92±0.08比0.71±0.07;0.86±0.07比0.61±0.06),p21、Bax表达水平降低(0.13±0.02比0.29±0.03;0.19±0.02比0.31±0.03)(P均<0.05)。RPL34-AS1靶向调控miR-575,过表达RPL34-AS1或抑制miR-575后可抑制细胞活性,阻滞细胞周期和促进细胞凋亡。miR-575过表达逆转了RPL34-AS1过表达对卵巢癌SKOV3细胞增殖抑制和凋亡促进的作用。结论过表达RPL34-AS1可抑制卵巢癌SKOV3细胞增殖,促进细胞凋亡,其机制可能与下调miR-575有关。 展开更多
关键词 RPL34-AS1 MiR-575 卵巢癌 增殖 凋亡
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