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Hepatitis C virus in human B lymphocytes transformed by Epstein-Barr virus in vitro by in situ reverse transcriptase-polymerase chain reaction 被引量:11
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作者 Ji Lin Cheng Bao Ling Liu Yi Zhang Wen Bin Tong Zheng Yan Bai Fang Feng Institute of Hepatology,Peoples Hospital,Medical Center of Beijing University,Beijing 10(X)44,China 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2001年第3期370-375,共6页
AIM: To study persistence and replication of hepatitis C virus (HCV) in patients' peripheral blood mononuclear cells (PBMC) cultured in vitro. METHODS: Epstein Barr virus (EBV) was used to transform the hepatitis ... AIM: To study persistence and replication of hepatitis C virus (HCV) in patients' peripheral blood mononuclear cells (PBMC) cultured in vitro. METHODS: Epstein Barr virus (EBV) was used to transform the hepatitis C virus from a HCV positive patient to permanent lymphoblastoid cell lines (LCL). Positive and negative HCV RNA strands of the cultured cells and growth media were detected by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) each month. Core and NS5 proteins of HCV were further tested using immunohistochemical SP method and in situ RT-PCR. RESULTS: HCV RNA positive strands were consistently detected the cultured cells for one year. The negative-strand RNA in LCL cells and the positive-strand RNA in supernatants were observed intermittently. Immunohistochemical results medicated expression of HCV NS3 and C proteins in LCL cytoplasm mostly. The positive signal of PCR product was dark blue and mainly localized to the LCL cytoplasm. The RT-PCR signal was eliminated by overnight RNase digestion but not DNase digestion. CONCLUSION: HCV may exist and remain functional in a cultured cell line for a long period. 展开更多
关键词 B-LYMPHOCYTES Cells Cultured Female HEPACIVIRUS development purification Herpesvirus 4 Human Humans Immunohistochemistry In Vitro polymerase chain Reaction RNA Viral Research Support Non-U.S. Gov't reverse transcriptase polymerase chain Reaction Transformation Genetic Viral Core Proteins Viral Nonstructural Proteins Virus Replication
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SEQUENCE ANALYSIS OF THE NS5 REGION OF GBVC/HGV AND DETECTION OF THE VIRUS BY REVERSE TRANSCRIPTASE PCR
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作者 陶其敏 常锦红 +3 位作者 魏来 杜绍财 王豪 孙焱 《Chinese Medical Sciences Journal》 CAS CSCD 1998年第4期221-224,共4页
GBV C/HGV is a newly identified virus associated with human hepatitis In this study, the nucleotide sequences of the partial NS5 gene of GBV C/HGV derived from sera of 8 Chinese patien... GBV C/HGV is a newly identified virus associated with human hepatitis In this study, the nucleotide sequences of the partial NS5 gene of GBV C/HGV derived from sera of 8 Chinese patients were determined The nucleotide homology among the 8 isolates were 92% on average On the basis of sequence analysis, two sets of oligonucleotide primers derived from highly conserved region of GBV C/HGV NS5 gene were designed to establish both sensitive and specific nested PCR for detection of GBV C/HGV RNA 253 Chinese patients were examined for the virus RNA GBV C/HGV RNA positive rates in patients infected with HBV, HCV and patients with chronic non B,non C hepatitis were 18 4%, 19 8% and 8 9% respectively This result suggested that HBV,HCV and GBV C/HGV shared the same transmission risk factors 8 patients with GBV C/HGV and HCV coinfection were retrospectively observed for the response to interferon Coinfection with GBV/HGV did not negatively influence the responsiveness of HCV, and GBV C/HGV was sensitive to interferon to a certain degree 展开更多
关键词 GB virus C/hepatitis G virus NS5 gene reverse transcriptase polymerase chain reaction
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Detection of SYT-SSX fusion transcripts in paraffin-embedded tissues of synovial sarcoma by reverse transcription-polymerase chain reaction 被引量:2
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作者 魏永昆 王坚 +3 位作者 朱雄增 施达仁 久冈正典 桥本洋 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2002年第7期1043-1047,151,共5页
OBJECTIVE: To assess the feasibility of detecting SYT-SSX fusion transcripts in paraffin-embedded tissues of synovial sarcoma by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). METHODS: RT-PCR was used to am... OBJECTIVE: To assess the feasibility of detecting SYT-SSX fusion transcripts in paraffin-embedded tissues of synovial sarcoma by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). METHODS: RT-PCR was used to amplify the SYT-SSX fusion transcripts using archival formalin-fixed paraffin-embedded tumor specimens from a series of 37 synovial sarcoma cases. To investigate the specificity of the SYT-SSX fusion transcripts, a variety of non-synovial sarcoma tumors were included in the study as negative controls. The detected messages derived from fusion genes were confirmed by subsequent sequence analysis. RESULTS: SYT-SSX fusion transcripts were detected in 33 of 37 (89.2%) synovial sarcomas. None of the 34 cases of non-synovial sarcoma tumors showed amplified products of SYT-SSX fusion transcripts, although PBGD mRNA was detected in all specimens. Among 33 SYT-SSX-positive synovial sarcomas, 22 tumors had an SYT-SSX 1 fusion transcript, whereas 6 tumors had an SYT-SSX2 fusion transcript. Fusion types can not be distinguished in the remaining 5 cases. There was a significant relationship between SYT-SSX fusion type and histologic subtype. All 10 biphasic synovial sarcomas had the SYT-SSX1 fusion, whereas all tumors with SYT-SSX2 were of monophasic morphology (P 展开更多
关键词 reverse transcriptase polymerase chain Reaction ADOLESCENT ADULT Aged Aged 80 and over Female Humans Male Middle Aged Oncogene Proteins Fusion Paraffin Embedding RNA Messenger Sarcoma Synovial
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RT-PCR技术检测猪瘟病毒的应用研究 被引量:34
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作者 罗廷荣 莫扬 +7 位作者 吴文德 黄玉华 黄伟坚 秦爱珍 刘芳 温荣辉 陆芹章 余克伦 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期307-309,312,共4页
本试验应用反转录_聚合酶链式反应 (RT_PCR)对猪瘟进行诊断应用研究。应用RT_PCR对来自广西不同地区的 135份疑似猪瘟病料进行检测 ,84份诊断为阳性 ,阳性率 6 2 2 %。从百色、柳州地区等采集的健康猪扁桃体和淋巴结共 2 76份 ,经RT_PC... 本试验应用反转录_聚合酶链式反应 (RT_PCR)对猪瘟进行诊断应用研究。应用RT_PCR对来自广西不同地区的 135份疑似猪瘟病料进行检测 ,84份诊断为阳性 ,阳性率 6 2 2 %。从百色、柳州地区等采集的健康猪扁桃体和淋巴结共 2 76份 ,经RT_PCR检测 ,37份为阳性 ,阳性率为 13 4 %。其中健康猪扁桃体带毒较高 ,2 4 6份扁桃体中有 35份阳性 ,占 14 2 %。采自柳州健康猪的 2 6份淋巴结材料全为阴性 ,只有邕宁县的 1份健猪淋巴结阳性。结果表明 ,RT_PCR技术可应用于猪瘟的临床诊断。 展开更多
关键词 猪瘟 反转录-聚合酶链式反应 诊断
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RT-PCR技术诊断猪瘟的应用研究 被引量:26
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作者 罗廷荣 莫扬 +7 位作者 吴文德 黄玉华 黄伟坚 秦爱珍 刘芳 温荣辉 陆芹章 余克伦 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期219-222,共4页
应用反转录_聚合酶链反应 (RT_PCR)对猪瘟进行诊断应用研究。应用RT_PCR对来自广西不同地区的 135份疑似猪瘟病料进行检测 ,84份诊断为阳性 ,阳性率 6 2 .2 %。从百色、柳州地区等采集的健康猪扁桃体和淋巴结共 2 76份 ,经RT_PCR检测 ,3... 应用反转录_聚合酶链反应 (RT_PCR)对猪瘟进行诊断应用研究。应用RT_PCR对来自广西不同地区的 135份疑似猪瘟病料进行检测 ,84份诊断为阳性 ,阳性率 6 2 .2 %。从百色、柳州地区等采集的健康猪扁桃体和淋巴结共 2 76份 ,经RT_PCR检测 ,37份为阳性 ,阳性率为 13.4 %。其中健康猪扁桃体带毒较高 ,2 4 6份扁桃体中有 35份阳性 ,占 14 .2%。采自柳州健康猪的 2 6份淋巴结材料全为阴性 ,只有邕宁县的 1份健猪淋巴结阳性。结果表明 。 展开更多
关键词 猪瘟 反转录-聚合酶链式反应 诊断
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RNA加尾和引物延伸RT-PCR法实时定量检测microRNA 被引量:23
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作者 张旗 何湘君 潘秀英 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期87-91,共5页
目的:用改进的RNA加尾和引物延伸RT-PCR法实时定量检测组织中的microRNAs(miRNAs),并评价其敏感性和特异性。方法:提取组织中的小于200bp的RNA,用poly(A)聚合酶在其3′末端加尾,再用5′带40nt延伸序列的单碱基锚定Olig-dT引物进行反转录... 目的:用改进的RNA加尾和引物延伸RT-PCR法实时定量检测组织中的microRNAs(miRNAs),并评价其敏感性和特异性。方法:提取组织中的小于200bp的RNA,用poly(A)聚合酶在其3′末端加尾,再用5′带40nt延伸序列的单碱基锚定Olig-dT引物进行反转录,得到约80nt的cDNA,然后用特异引物进行SYBRGreen实时定量PCR扩增。结果:该法线性范围宽,可检测低丰度的miRNAs,能特异区分3′末端碱基不同的亚型,但对序列中间个别碱基不同的亚型不能鉴别。对15种miRNA在大鼠心、肝和大脑皮层的相对表达的检测验证了该法的可靠性。另外,海马组织中的miRNAs表达与大脑皮层组织有一定差异。熔解曲线的单一峰型和电泳检测到的单一条带都证明了扩增的特异性。结论:该法可快速、敏感地检测不同组织中大多数miRNAs的表达差异,可用于寻找组织特异及疾病相关的miRNAs。 展开更多
关键词 微RNAS 逆转录聚合酶链反应 实验室技术和方法
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实时荧光定量RT-PCR分析非小细胞肺癌SATB1的表达和临床病理意义 被引量:32
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作者 周来勇 刘芳 +3 位作者 童健 陈群请 张福伟 郭琳琅 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期534-537,共4页
目的检测非小细胞肺癌组织中SATB1 mRNA的表达,探讨SATB1表达与非小细胞肺癌发生、发展的关系及其临床病理意义。方法用TRIZOL提取非小细胞肺癌组织和正常肺组织总RNA后,将其反转录为cDNA,以实时荧光定量RT-PCR方法检测非小细胞肺癌组... 目的检测非小细胞肺癌组织中SATB1 mRNA的表达,探讨SATB1表达与非小细胞肺癌发生、发展的关系及其临床病理意义。方法用TRIZOL提取非小细胞肺癌组织和正常肺组织总RNA后,将其反转录为cDNA,以实时荧光定量RT-PCR方法检测非小细胞肺癌组织及正常肺组织中SATB1 mRNA的表达,分析SATB1基因表达与临床病理参数的相关性。结果癌组织中SATB1 mRNA表达量为正常组织13倍,两者差异显著(P<0.001),其中有、无转移组分别为正常组织23.63倍和5.57倍。结论SATB1 mRNA的表达水平可能与非小细胞肺癌发生发展及淋巴转移有关,有望成为判断非小细胞肺癌预后的一个指标。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 SATB1 mRNA 实时荧光定量rt-pcr
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RT-PCR及RFLP分析技术对鸡传染性支气管炎病毒的诊断和S1基因分型的研究 被引量:27
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作者 磨美兰 李康然 韦平 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期277-282,共6页
本研究使用分别扩增整个S1糖蛋白基因 (引物A)和S1糖蛋白基因N_端高变区Ⅰ (引物B)的 2对引物对 3个IBV标准株M41、Connecticut、Arkansas及 5个地方分离株 (C60 ,D41A ,D41B ,A112 1,A1171)进行RT_PCR扩增。用引物A时 ,有 5个IBV毒株... 本研究使用分别扩增整个S1糖蛋白基因 (引物A)和S1糖蛋白基因N_端高变区Ⅰ (引物B)的 2对引物对 3个IBV标准株M41、Connecticut、Arkansas及 5个地方分离株 (C60 ,D41A ,D41B ,A112 1,A1171)进行RT_PCR扩增。用引物A时 ,有 5个IBV毒株扩增到目的片段 (172 0bp) ;用引物B时 ,所有 8个IBV毒株均得到与预计大小相符的目的产物 (2 2 8bp)。对 172 0bp的PCR产物用限制性内切酶HaeⅢ进行酶切 ,结果得出 3个不同的RFLP图谱 ,其中M41、Connecticut、D41B具有相同的HaeⅢ酶切图谱。Arkansas和D41A则分别具有互不相同的图谱 ;对 2 2 8bp的PCR产物进行DdeⅠ、RsaⅠ限制性内切酶消化 ,根据它们的RFLP图谱 ,8个IBV毒株可分为 5个基因型。综合 2对引物的PCR产物的RFLP分析结果 ,8个IBV毒株可分为 7个基因型 ,分型的结果与传统的血清学方法吻合。本研究建立的方法和技术具有快速、简单、特异、灵敏等优点 ,为现场流行毒株的定型(基因型 /血清型 )及其S1基因变异的跟踪研究以及更有效防制传染性支气管炎奠定了基础。 展开更多
关键词 鸡传染性支气管炎病毒 S1基因 反转录酶多聚酶链反应 限制性片段多态性分析 分型
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实时RT-PCR常用内对照在死亡早期人心肌内的稳定性 被引量:6
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作者 张萍 马开军 +3 位作者 张恒 王慧君 沈忆文 陈龙 《法医学杂志》 CAS CSCD 2012年第2期81-84,共4页
目的探讨实时RT-PCR方法常用内对照表达水平在死亡早期人体心肌组织中的稳定性。方法选取10例具有一致的外界环境(平均存放温度25℃)、不同死亡时间(4.3~22.3 h)的个体,提取心肌组织的总RNA。选择6个常用内对照:β-actin、GAPDH、B2M... 目的探讨实时RT-PCR方法常用内对照表达水平在死亡早期人体心肌组织中的稳定性。方法选取10例具有一致的外界环境(平均存放温度25℃)、不同死亡时间(4.3~22.3 h)的个体,提取心肌组织的总RNA。选择6个常用内对照:β-actin、GAPDH、B2M、U6、18S rRNA、HSA-miR-1,通过实时RT-PCR检测其在心肌组织的表达水平。利用genormPLUS软件评估内对照在死亡早期表达水平的稳定性,挑选出最稳定的内对照并且分析其表达水平与相关因素(年龄、性别、死因)的关系。结果死亡早期心肌组织中U6表达水平最稳定,其表达量与年龄、性别及死因无关(P>0.05)。结论 U6可以作为实时RT-PCR方法研究死亡时间与心肌组织中核酸降解之间规律的理想内对照。 展开更多
关键词 法医病理学 逆转录聚合酶链反应 心肌 内对照 死亡时间
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荧光RT-PCR法检测丙型肝炎病毒基因型 被引量:5
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作者 郭新会 严艳 +1 位作者 李卓 殷继明 《临床肝胆病杂志》 CAS 2011年第1期65-67,共3页
目的应用荧光RT-PCR方法对慢性丙型肝炎(CHC)患者血清进行HCV基因型分析。方法采用荧光RT-PCR方法与测序方法比较,对118例CHC阳性患者血清进行HCV RNA分型,比较两种方法分型结果的一致性;为了考察该方法的特异性,对98例慢性乙型肝炎(CHB... 目的应用荧光RT-PCR方法对慢性丙型肝炎(CHC)患者血清进行HCV基因型分析。方法采用荧光RT-PCR方法与测序方法比较,对118例CHC阳性患者血清进行HCV RNA分型,比较两种方法分型结果的一致性;为了考察该方法的特异性,对98例慢性乙型肝炎(CHB)患者血清进行HCV RNA分型检测。结果在118例HCV RNA阳性血清标本中,用荧光RT-PCR方法检测有HCV基因1型79例(66.9%),2型29例(24.6%),1/2混合型8例(6.8%);另有2例(1.7%)HCV RNA定量为1×103IU/ml弱阳性标本未分出型。测序法分出1型81例(68.4%),2型29例(24.6%),1/2混合型6例(5.1%),与荧光RT-PCR方法一致2例(1.7%)HCV RNA定量结果为1×103IU/ml的阳性标本测序法未分出型。未发现其他基因型的病例。98例CHB患者血清检测结果均为阴性。结论荧光HCV基因分型的方法具有良好的敏感性、特异性、可重复性且省时省力,可选择该方法为临床诊断服务。 展开更多
关键词 肝炎 丙型 基因型 逆转录聚合酶链反应
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RT-PCR检测神经母细胞瘤患儿化疗后骨髓PGP9.5mRNA表达在预后判断中的意义 被引量:4
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作者 唐锁勤 冯晨 +2 位作者 黄东生 王建文 张小飞 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 2005年第3期215-217,共3页
目的该研究试图阐明诱导化疗后在转录水平清除骨髓肿瘤细胞能否取得好的疗效。方法应用以PGP9.5为靶基因的逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,其敏感性为106个细胞,测定32例发病时组织学存在骨髓转移的神经母细胞瘤患者,测定初诊及诱导... 目的该研究试图阐明诱导化疗后在转录水平清除骨髓肿瘤细胞能否取得好的疗效。方法应用以PGP9.5为靶基因的逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,其敏感性为106个细胞,测定32例发病时组织学存在骨髓转移的神经母细胞瘤患者,测定初诊及诱导治疗结束后骨髓肿瘤细胞水平。入选病例须在诱导治疗后用免疫组织化学法测定骨髓瘤细胞阴性。结果32例患者诊断时骨髓PGP9.5mRNA均阳性,诱导结束后16例仍阳性,自体骨髓移植后随访3.4±0.9年11例复发,无病生存率31%;16例阴转,骨髓移植后随诊3.2±0.7年仅有5例复发,无病生存率69%,两组无病生存率有显著性差异(P=0.018)。结论诱导治疗在转录水平清除骨髓神经母细胞瘤后行自体骨髓移植可以取得较好疗效。 展开更多
关键词 神经母细胞瘤 逆转录聚合酶链式反应 PGP9.5 儿童
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荧光标记RT-PCR技术在实验动物死亡时间推断中的应用 被引量:5
12
作者 朱方成 任亮 +3 位作者 刘良 王树法 朱传红 朱少华 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第18期1857-1859,共3页
目的探讨荧光标记逆转录-聚合酶联反应(RT-PCR)在死亡时间(PM I)推断中的应用。方法44只大鼠断颈处死后置于20℃温度控制系统内,利用荧光标记RT-PCR技术检测大鼠脑及肝组织GAPDH mRNA在死后即刻至8 d的相对表达量的变化。结果在大鼠死... 目的探讨荧光标记逆转录-聚合酶联反应(RT-PCR)在死亡时间(PM I)推断中的应用。方法44只大鼠断颈处死后置于20℃温度控制系统内,利用荧光标记RT-PCR技术检测大鼠脑及肝组织GAPDH mRNA在死后即刻至8 d的相对表达量的变化。结果在大鼠死后即刻至7 d脑组织、2 d肝组织内均可检测到GAPDH mRNA,其扩增产物的降解呈现出一定的规律性。结论荧光RT-PCR技术检测大鼠死后脑及肝GAPDH mRNA,可为PM I推断提供一种新的方法。 展开更多
关键词 法医病理学 逆转录-聚合酶联反应 荧光 3-磷酸甘油醛脱氢酶 死亡时间
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实时RT-PCR检测大鼠死后管家基因mRNA的时序性降解 被引量:11
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作者 任广睦 刘季 王英元 《法医学杂志》 CAS CSCD 2009年第1期33-36,共4页
目的研究实时荧光定量RT-PCR方法检测死亡大鼠管家基因mRNA时序性降解的可行性,为死亡时间(postmortem interval,PMI)推断寻找新的研究手段。方法应用SYBR GreenⅠ实时荧光定量RT-PCR技术,检测死后不同时间大鼠脑和脾中管家基因GAPDH m... 目的研究实时荧光定量RT-PCR方法检测死亡大鼠管家基因mRNA时序性降解的可行性,为死亡时间(postmortem interval,PMI)推断寻找新的研究手段。方法应用SYBR GreenⅠ实时荧光定量RT-PCR技术,检测死后不同时间大鼠脑和脾中管家基因GAPDH mRNA及β-actin mRNA的水平,结果用循环阈值(简称Ct值)表示,分析死后经过时间与Ct值的线性关系,并建立死亡时间推断回归方程。结果GAPDH mRNA和β-actin mRNA的Ct值均与PMI之间存在显著的相关性。结论SYBR GreenⅠ实时荧光定量RT-PCR在定量分析mRNA降解的研究中是一个较理想的技术手段。选用管家基因作为PMI推断的研究对象,可在法医检案中消除其他基因因为个体差异带来的误差,更具实用性。Ct值作为动态监测机体死后不同时间点的客观指标,与死后不同时间点的线性关系良好,推断死后经过时间尤其是晚期死亡时间较为理想。 展开更多
关键词 法医病理学 逆转录聚合酶链反应 死亡时间推断 管家基因 大鼠
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RT-PCR扩增K19检测胃癌区域淋巴结微转移 被引量:3
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作者 所剑 陶正贵 +2 位作者 李虹 金洪娟 赵航 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期577-579,共3页
目的 :探讨 RT- PCR检测胃癌区域淋巴结微转移的价值及其应用前景。方法 :以病理组织学和 RT- PCR扩增 K19对 30例胃癌患者的癌组织标本及 12 6个淋巴结进行检测。结果 :30例胃癌患者癌组织均有 K19m RNA表达 ;12 6个淋巴结中 ,组织学阳... 目的 :探讨 RT- PCR检测胃癌区域淋巴结微转移的价值及其应用前景。方法 :以病理组织学和 RT- PCR扩增 K19对 30例胃癌患者的癌组织标本及 12 6个淋巴结进行检测。结果 :30例胃癌患者癌组织均有 K19m RNA表达 ;12 6个淋巴结中 ,组织学阳性 2 6个 (2 0 .6 % ) ,而 RT- PCR阳性 4 2个 (33.3% ) ,RT- PCR扩增 K19及内参基因β- actin后 ,所有瘤组织、转移淋巴结显示 4 6 0和 5 4 0 bp的扩增片段 ,非肿瘤患者的淋巴结中仅显示 5 4 0 bp。结论 :RT- PCR扩增 K19m RNA检测胃癌区域淋巴结微转移是一种敏感、特异的检测方法 ,优于常规病理组织学。 展开更多
关键词 胃肿瘤 逆转录聚合酶链反应 角蛋白19 淋巴结 微转移
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RT-PCR检测膀胱移行细胞癌患者尿CK20 mRNA表达的研究 被引量:4
15
作者 罗春丽 韩永华 +4 位作者 吴小候 邹琳 刘彦慧 唐敏 蔡晓钟 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期105-107,共3页
目的 探讨膀胱移行细胞癌 (TCCB)患者尿细胞角蛋白 2 0 (CK2 0 )mRNA表达及其意义。方法 采用逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)检测 6 1例TCCB患者、19例非肿瘤患者及 11例健康志愿者尿脱落细胞CK2 0mRNA。结果  6 1例TCCB患者中 5 2例... 目的 探讨膀胱移行细胞癌 (TCCB)患者尿细胞角蛋白 2 0 (CK2 0 )mRNA表达及其意义。方法 采用逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)检测 6 1例TCCB患者、19例非肿瘤患者及 11例健康志愿者尿脱落细胞CK2 0mRNA。结果  6 1例TCCB患者中 5 2例尿脱落细胞CK2 0阳性表达 ,阳性率为 85 .3% ,对照组 30例中 2例表达 ,阳性率为 6 .7%。各分期尿CK2 0mRNA阳性率T1为 83.9% (2 6 / 31) ,T2 4期 86 .7% (2 6 / 30 ) ,两者差异无统计学意义 ;分级G1为 82 .8% (2 4 / 2 9) ,G2 85 .0 % (17/ 2 0 ) ,G3 91.7% (11/ 12 ) ,三者之间差异无统计学意义。行保留膀胱手术患者 5 1例 ,其中 4 2例术前尿CK2 0mRNA表达阳性 ,术后36例阴性 ,术后转阴率 85 .7%。 5 1例中有 2 9例 (术后尿脱落细胞CK2 0阳性表达 4例 )随访 6个月 ,4例CK2 0阳性表达者有2例 (5 0 % )复发 ,2 5例CK2 0阴性表达有 1例 (4 % )复发 ,两者复发率比较有统计学差异 (P <0 .0 0 5 )。结论 RT PCR检测尿脱落细胞CK2 0mRNA表达是诊断TCCB一种简便方法 ,其敏感性为 85 .3% ,特异性为 93.3% ,有助于膀胱TCCB的早期诊断和预后观察 。 展开更多
关键词 RT—PCR 检测 膀胱移行细胞癌 尿CK20mRNA 表达 尿细胞角蛋白20
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实时RT-PCR检测人端粒酶逆转录酶mRNA用于乳腺癌鉴别诊断及与c-Myc基因的相关性 被引量:3
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作者 唐峰 陈忠清 +5 位作者 包芸 朱腾芳 王虹 朱虹光 许祖德 胡锡琪 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期727-731,共5页
目的探讨定量检测人端粒酶逆转录酶(hTERT)mRNA在乳腺癌鉴别诊断中的价值,并观察原癌基因c-Myc与hTERT mRNA表达的关系。方法收集癌旁正常乳腺组织、乳腺普通型导管增生、不典型导管增生、导管原位癌、浸润性导管癌病例,采用实时荧光定... 目的探讨定量检测人端粒酶逆转录酶(hTERT)mRNA在乳腺癌鉴别诊断中的价值,并观察原癌基因c-Myc与hTERT mRNA表达的关系。方法收集癌旁正常乳腺组织、乳腺普通型导管增生、不典型导管增生、导管原位癌、浸润性导管癌病例,采用实时荧光定量RT-PCR技术(Real-ti me RT-PCR)定量检测hTERT和c-Myc基因的转录水平。结果以NhTERT=10为临界值,所有正常组织和良性病变NhTERT值均小于临界值,而hTERT基因转录升高的导管原位癌及浸润性导管癌其NhTERT值均大于此临界值。显示hTERT和c-Myc基因转录水平呈正相关(γ=0.7395,P<0.01)。结论实时荧光定量PCR技术检测hTERT基因表达具有高敏感性和特异性,能为常规病理学诊断提供客观的参考指标,从而提高乳腺不典型导管增生与导管原位癌鉴别诊断的准确性。原癌基因c-Myc转录水平上调可能与乳腺癌hTERT基因转录激活有关。 展开更多
关键词 乳腺癌 端粒酶 实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应 人端粒酶逆转录酶 C-MYC原癌基因
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荧光定量RT-PCR在轮状病毒检测中的应用 被引量:3
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作者 王志宇 王健伟 +3 位作者 何深一 孟红 韩金祥 洪涛 《山东大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2006年第3期217-221,共5页
目的:建立轮状病毒的荧光定量RT-PCR检测方法,用于检测临床腹泻样本。方法:使用Taqman探针技术,建立轮状病毒VP6特异的荧光定量RT-PCR体系。与WHO推荐的轮状病毒检测方法ELISA平行检测,对该体系的检测范围、灵敏度、特异性等参数进行评... 目的:建立轮状病毒的荧光定量RT-PCR检测方法,用于检测临床腹泻样本。方法:使用Taqman探针技术,建立轮状病毒VP6特异的荧光定量RT-PCR体系。与WHO推荐的轮状病毒检测方法ELISA平行检测,对该体系的检测范围、灵敏度、特异性等参数进行评价。并将该体系用于临床腹泻样本。结果:该荧光定量RT-PCR体系具有高度灵敏度和特异性,线性范围宽,最低可检出1TCID50/ml。对113份临床腹泻样本的平行检测结果显示,该荧光定量RT-PCR体系与ELISA的检出率差异无统计学意义(χ2=0.41,P>0.5),可同样用于临床样本检测。结论:成功建立了轮状病毒荧光定量RT-PCR体系,该体系灵敏、特异、重复性好,可用于临床检测。 展开更多
关键词 实时逆转录聚合酶链反应 轮状病毒属 聚合酶链反应
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实时荧光定量RT-PCR检测结直肠癌中外周血端粒酶逆转录酶mRNA的表达及其临床意义 被引量:4
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作者 司君利 亓玉琴 +1 位作者 周长宏 刘吉勇 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2008年第36期4066-4070,共5页
目的:建立外周血端粒酶逆转录酶(hTERT)mRNA表达量检测的实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)系统,检测结直肠癌患者hTERT mRNA的表达并探讨其对结直肠癌微转移的诊断价值.方法:用实时荧光定量RT-PCR技术检测53例结直肠癌患者和21... 目的:建立外周血端粒酶逆转录酶(hTERT)mRNA表达量检测的实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)系统,检测结直肠癌患者hTERT mRNA的表达并探讨其对结直肠癌微转移的诊断价值.方法:用实时荧光定量RT-PCR技术检测53例结直肠癌患者和21名健康人的外周血标本hTERT mRNA表达情况,分析其表达与肿瘤临床病理特征的关系并应用接受者操作特征曲线(ROC曲线)分析hTERT mRNA检测对结直肠癌的诊断价值.结果:结直肠癌组外周血hTERT mRNA表达水平显著高于正常对照组(t'=7.953,P<0.05),其表达与肿瘤淋巴结转移、血行转移和TNM分期相关(t'/t=2.334,2.149,2.460,均P<0.05).hTERT mRNA诊断结直肠癌的ROC曲线下面积0.91,诊断界值为Ct≤32.结论:应用实时荧光定量RT-PCR技术克服了传统PCR只能定性检测而不能定量检测的缺点;外周血hTERT mRNA可作为诊断结直肠癌微转移的标记物. 展开更多
关键词 结直肠癌 微转移 外周血端粒酶逆转录酶(hTERT)mRNA 实时荧光定量逆转录聚合酶链反应
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荧光定量RT-PCR法检测门头沟区手足口病病原体探讨 被引量:5
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作者 刘海涛 庄国良 +2 位作者 王志越 吕秋艳 宋景红 《河北医科大学学报》 CAS 2012年第1期62-64,共3页
目的 明确门头沟区手足口病流行期间手足口病患儿病毒感染类型,并探讨实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)法对手足口病患儿咽拭子标本中肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A 1... 目的 明确门头沟区手足口病流行期间手足口病患儿病毒感染类型,并探讨实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)法对手足口病患儿咽拭子标本中肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A 16型(Cox A16)病毒载量进行定量检测的可行性.方法 采用RT-PCR荧光探针体外扩增法对103例手足口病患儿咽拭子标本中抽提的RNA进行抽样检测.结果 58例手足口病患儿咽拭子标本中EV71的病毒载量>103copies/mL.实时荧光定量RT-PCR法其标准曲线显示,样本阈值环数(threshold cycle,Ct)值与病毒拷贝数的对数之间的相关系数为1.000,相关性较好.32例手足口病患儿咽拭子标本中Cox A16的病毒载量>103copies/mL.实时荧光定量RT-PCR法其标准曲线显示,Ct值与病毒拷贝数的对数之间的相关系数为0.977,相关性较好.结论 门头沟区56.3%手足口病患儿EV71病毒载量>103copies/mL,31.1%患儿Cox A16病毒载量>103copies/mL.实时荧光定量RT-PCR法对咽拭子标本中的EV71、Cox A16 RNA定量检测较方便快捷,为进一步研究病毒载量与临床表现之间的关系打下基础. 展开更多
关键词 手足口病 病毒载量 逆转录聚合酶链反应
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新型冠状病毒Omicron I1566V突变位点MS2噬菌体病毒样颗粒的构建
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作者 杨静远 李永鑫 +3 位作者 史茜 刘春燕 梁梦洁 张新 《检验医学与临床》 CAS 2024年第8期1030-1034,共5页
目的构建新型冠状病毒Omicron I1566V突变位点MS2噬菌体病毒样颗粒。方法选取并合成带有6×His标签的MS2噬菌体的衣壳蛋白(CP)、成熟蛋白(A蛋白)及Omicron I1566V突变基因序列,插入pACYCDuet-1质粒构建重组载体,通过原核系统诱导表... 目的构建新型冠状病毒Omicron I1566V突变位点MS2噬菌体病毒样颗粒。方法选取并合成带有6×His标签的MS2噬菌体的衣壳蛋白(CP)、成熟蛋白(A蛋白)及Omicron I1566V突变基因序列,插入pACYCDuet-1质粒构建重组载体,通过原核系统诱导表达目的蛋白,纯化重组蛋白后利用透射电镜对蛋白质进行物理表征,最后通过反转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测病毒样颗粒的热稳定性及耐核酸酶水解能力。结果成功构建包含有6×His标签的CP、A蛋白和Omicron I1566V突变基因序列的重组载体,经限制性内切酶BamHⅠ和KpnⅠ酶切鉴定和测序验证,结果均与预期相符。经诱导并纯化后,通过电镜观察到了大小均匀、直径为23~28 nm的病毒样颗粒,该病毒样颗粒经核酸酶消化后可在37℃条件下稳定储存20 d以上。结论该研究成功利用MS2噬菌体的CP和A蛋白构建了Omicron I1566V突变位点病毒样颗粒,为该突变位点的RT-PCR检测体系提供了可靠的质量保障。 展开更多
关键词 新型冠状病毒变异株 Omicron I1566V突变位点 反转录聚合酶链反应 MS2噬菌体 病毒样颗粒
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