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Quantification of mRNA Levels by Fluorescently Labelled Reverse Transcription Competitive PCR
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作者 Wen-ximHuang PingHuang 等 《激光生物学报》 CAS CSCD 2001年第2期140-146,共7页
A reproducible,quantitative,non-radioactive method for the analysis of mRNA expression is described.After RNA preparation and cDNA synthesis,the cDNA was co-amplified with an internal standard in the same PCR system.T... A reproducible,quantitative,non-radioactive method for the analysis of mRNA expression is described.After RNA preparation and cDNA synthesis,the cDNA was co-amplified with an internal standard in the same PCR system.The PCR products containing both targen and internal standard amplificates were electrophoresed and detected on an ABI 377 DNA Sequencer.For each sample,β-actin was also quantified by an identical procedure to compensate for relative differences between samples in the integrity of the individual RNA samples and for variations in reverse transcription.Due to the linear relationship between cDNA content and PCR product ratio of target cDNA template and competitive standard,a single PCR reaction was sufficient for quantification of a sample.The experimental results showed that the method is a mRNA quantitative RT-PCR method with high sensitivity and good reproducibility.It can be used in large-scale accurate quantitative analyses of mRNA expression of any gene. 展开更多
关键词 MRNA 定量测定 荧光标记 rt-pcr
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葡萄浆果内坏死病毒RT-q PCR检测技术建立及其在葡萄砧木中的时空分布规律
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作者 张英 原青云 +3 位作者 任芳 胡国君 范旭东 董雅凤 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第14期2771-2780,共10页
【背景】葡萄浆果内坏死病毒(grapevine berry inner necrosis virus,GINV)是近年来在中国报道的一种正单链RNA病毒,该病毒发生普遍且危害严重。高灵敏的检测技术是病毒田间监测和无病毒苗木培育的关键。【目的】建立灵敏度较高的GINV... 【背景】葡萄浆果内坏死病毒(grapevine berry inner necrosis virus,GINV)是近年来在中国报道的一种正单链RNA病毒,该病毒发生普遍且危害严重。高灵敏的检测技术是病毒田间监测和无病毒苗木培育的关键。【目的】建立灵敏度较高的GINV逆转录实时荧光定量PCR(reverse transcription real-time quantitative PCR,RT-qPCR)检测体系;明确不同葡萄砧木对GINV的敏感性;明确GINV在寄主植株中的时空分布规律,为该病毒的监测预警提供技术支撑。【方法】根据GenBank已登录GINV的复制酶(replicase,RP)、移动蛋白(movement protein,MP)和外壳蛋白(coat protein,CP)基因保守序列设计6套引物,通过常规RT-PCR和RT-qPCR筛选特异性强、扩增效果好的引物。再通过对退火温度和引物浓度等反应条件的优化建立GINV的SYBR Green I染料法RT-qPCR检测体系,并进一步对该技术的灵敏度、特异性和田间适用性进行评价。将GINV接种到贝达、SO4、101-14、140R和1103P 5种葡萄砧木上进行症状观察和病毒检测,以筛选GINV敏感性较高的指示植物。基于所建立的RT-qPCR技术对接种GINV葡萄砧木的不同生长时期、不同部位样品进行GINV检测,从而明确GINV在不同葡萄砧木的时空分布规律。【结果】建立了GINV SYBR Green I染料法RT-qPCR检测技术体系,其最佳引物为GINVRPYGF2/R2,最佳引物浓度为300 nmol·L^(-1),最佳退火温度为58.4℃。该技术对GINV的检测特异性强,其检测灵敏度达常规RT-PCR的1 000倍。症状观察结果表明贝达感染GINV的症状最为严重,表现为叶片系统性坏死,而其他砧木叶片仅表现褪绿斑驳和环斑症状。RT-qPCR检测结果表明GINV在EL27时期(坐果期)的相对含量最高,5个品种间的病毒相对含量在EL12(花序分明期)和EL27时期间无显著差异,EL31时期(果实增大期)的贝达与SO4、101-14、140R和1103P的病毒相对含量存在显著差异;GINV的相对含量在不同组织部位存在较大差异,由高到低依次为下部叶片、上部叶片、上部茎秆、下部茎秆、根部。【结论】建立了灵敏度高、特异性强的GINV RT-qPCR检测方法,利用该方法明确了GINV在不同葡萄砧木的时空分布规律。 展开更多
关键词 葡萄浆果内坏死病毒 逆转录实时荧光定量pcr 葡萄砧木 时空分布
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RT-PCR检测猪瘟病毒初探 被引量:24
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作者 罗廷荣 波丹 +7 位作者 黄宪高 梁家权 刘芳 黄伟坚 秦爱珍 温荣辉 陆芹章 余克伦 《广西农业生物科学》 CAS CSCD 2001年第1期17-20,共4页
本研究建立了反转录聚合酶链反应 ( RT PCR)技术检测猪瘟病毒 ( Hog Cholera Virus,HCV)方法。合成的二对引物 HCV 1 / HCV 2和 HCV A1 / HCV A2成功地扩增兔化弱毒株、法国株和石门株的核酸 ,并对采自博白县 3个、贵港市 1个和武宣县 ... 本研究建立了反转录聚合酶链反应 ( RT PCR)技术检测猪瘟病毒 ( Hog Cholera Virus,HCV)方法。合成的二对引物 HCV 1 / HCV 2和 HCV A1 / HCV A2成功地扩增兔化弱毒株、法国株和石门株的核酸 ,并对采自博白县 3个、贵港市 1个和武宣县 1个猪场共 1 3份病料进行检测。结果从博白县和贵港市的 1 1份材料中检测到 HCV的核酸。 展开更多
关键词 反转录-聚合酶链反应 猪瘟病毒 检测
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竞争性RT-PCR测定法及BMP-2mRNA的定量检测 被引量:11
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作者 郭若霖 郭善一 +1 位作者 鲍秋野 张镜宇 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 2000年第5期680-683,共4页
建立竞争性 PCR方法 ,以期用于转录水平基因表达的定量研究 .以检测大鼠颅骨骨细胞总RNA中骨形态发生蛋白 - 2 ( BMP- 2 ,bone morphogenetic protein- 2 ) m RNA含量为例 ,构建大鼠BMP- 2基因的竞争模板 ,以之为内对照进行竞争性 PCR.... 建立竞争性 PCR方法 ,以期用于转录水平基因表达的定量研究 .以检测大鼠颅骨骨细胞总RNA中骨形态发生蛋白 - 2 ( BMP- 2 ,bone morphogenetic protein- 2 ) m RNA含量为例 ,构建大鼠BMP- 2基因的竞争模板 ,以之为内对照进行竞争性 PCR.PCR反应结束后 ,电泳、拍照 ,扫描所扩增条带密度 ,作回归方程 .根据回归方程 ,计算出正常 7d Wistar大鼠颅骨总 RNA中 BMP- 2 m RNA含量为 1 .1 2 5amol/μg RNA.结果显示 ,成功构建了大鼠 BMP- 2基因的竞争模板 ,建立了可以测定大鼠颅骨骨细胞总 RNA中 BMP- 2 m RNA含量的竞争性 PCR方法 . 展开更多
关键词 竞争性pcr 基因表达调控 MRNA 定量检测 BMP-2
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RT-PCR快速诊断禽流感 被引量:21
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作者 刘明 于康震 +3 位作者 崔尚金 孔宪刚 唐秀英 徐宜为 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 2000年第S1期176-177,共2页
根据禽流感病毒NP基因的序列分析结果,设计了一对NP基因特异的引物。采用该对引物,不经病毒分离,直接从禽流感病毒感染鸡的气管、泄殖腔棉拭子和组织样品中提取核酸, RT~PCR可以扩增出 326bp的 NP基因片段。采用... 根据禽流感病毒NP基因的序列分析结果,设计了一对NP基因特异的引物。采用该对引物,不经病毒分离,直接从禽流感病毒感染鸡的气管、泄殖腔棉拭子和组织样品中提取核酸, RT~PCR可以扩增出 326bp的 NP基因片段。采用该技术对14个亚型禽流感病毒标准参考株,4个亚型12株国内分离野毒株,RT-PCR检测的结果都呈阳性;对新城疫病毒、传染性法氏囊病毒、传染性支气管炎病毒、传染性喉气管炎病毒以及减蛋综合症病毒,RT-PCR扩增结果都呈阴性。禽流感病毒 A/Goose/Guangdong(H5N1)和 A/African Starling/England(H7N1)实验感染鸡样品 RT-PCR检测与鸡胚病毒分离阳性率分别为34/42、32/42; 24/55、24/55, 二者符合率大于95%。 RT-PCR最少可检测到10pg的病毒核酸。对山东某地发病鸡场样品进行RT-PCR检测,只用6个小时就可得出准确的诊断结果,证明RT-PCR检测方法敏感特异,可用于禽流感的快速诊断。 展开更多
关键词 禽流感病毒 诊断 反转录-聚合酶链式反应
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逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术同时检测水中多种肠道病毒 被引量:17
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作者 张崇淼 刘永军 +1 位作者 王晓昌 薛小平 《环境科学研究》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第3期137-141,共5页
建立了一种利用通用引物RT-PCR技术检测水中肠道病毒的方法.利用脊髓灰质炎病毒1~3型,柯萨奇病毒B3型作为参考病毒株,根据肠道病毒RNA5′非编码区中具有高度同源性的序列来设计通用引物.比较了M-MLV酶和AMV酶的逆转录效果,AMV酶能够成... 建立了一种利用通用引物RT-PCR技术检测水中肠道病毒的方法.利用脊髓灰质炎病毒1~3型,柯萨奇病毒B3型作为参考病毒株,根据肠道病毒RNA5′非编码区中具有高度同源性的序列来设计通用引物.比较了M-MLV酶和AMV酶的逆转录效果,AMV酶能够成功地从地表水和生活污水中逆转录病毒RNA,更适于实际应用.对比研究了PCR过程中的退火温度,c(Mg2+)等因素对RT-PCR检测结果的影响,选择退火温度55℃,c(Mg2+)为2 mmol/L的反应条件,优化了RT-PCR检测方法.通过检测水样中接种的连续稀释的病毒,确定了该检测方法的灵敏度为38 CCID50.考察人工污染的地表水、污水、二级处理出水样品发现,检测灵敏度基本一致.该方法可应用在实际环境的肠道病毒检测中. 展开更多
关键词 肠道病毒 逆转录-聚合酶链反应(rt-pcr) 通用引物 同时检测
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马铃薯Y病毒的RT-PCR检测 被引量:30
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作者 李浩戈 吴元华 赵秀香 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 1999年第3期244-246,共3页
通过两种方法提取了烟草病叶中PVY病毒的RNA,然后针对PVY^N的CP基因序列,设计合成了一对特异性引物,运用反转录PCR技术对提取的PVY-RNA进行了体外扩增,结果得到与预期大小相一致的780bp片段,而对照未得到任何产物,从而建立了运... 通过两种方法提取了烟草病叶中PVY病毒的RNA,然后针对PVY^N的CP基因序列,设计合成了一对特异性引物,运用反转录PCR技术对提取的PVY-RNA进行了体外扩增,结果得到与预期大小相一致的780bp片段,而对照未得到任何产物,从而建立了运用RT-PCR手段检测植物中PVY的又一有效途径,并运用此方法对东北三省部分地区马铃薯种薯中PVY的带毒情况进行了检测。 展开更多
关键词 反转录pcr 马铃薯 Y病毒 检测
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用RT-PCR对mRNA进行定量分析 被引量:9
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作者 戴建国 肖华胜 +2 位作者 张萍 陈镔复 赵文明 《第四军医大学学报》 CAS 1999年第3期242-243,共2页
编码蛋白质的mRNA通过反转录酶的作用,将mR-NA反转录成cDNA,再通过PCR扩增,DNA产物得到指数形式的增加.在一定循环数内,PCR产物的量与其模板cD-NA,也就是相应mRNA的浓度有关.PCR产物电泳后掺入溴化乙锭,可通过扫描荧光强度来... 编码蛋白质的mRNA通过反转录酶的作用,将mR-NA反转录成cDNA,再通过PCR扩增,DNA产物得到指数形式的增加.在一定循环数内,PCR产物的量与其模板cD-NA,也就是相应mRNA的浓度有关.PCR产物电泳后掺入溴化乙锭,可通过扫描荧光强度来确定PCR产物的量.通过优化实验条件,可计算出所检测的mRNA的相对含量. 展开更多
关键词 rt-pcr 溴化乙锭 MRNA 聚合酶链反应
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用RT-PCR对湖北省部分猪场猪繁殖与呼吸综合症的检测 被引量:12
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作者 李勇 梅书棋 +3 位作者 郑新民 樊俊华 孟庆友 杨宜生 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期363-365,共3页
关键词 猪繁殖与呼吸综合症 逆转录聚合酶链式反应 cDNA-Dig探针 Southern转印杂交
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RT-PCR分析肉芽组织生长过程中VEGF及β3整合素mRNA的表达 被引量:6
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作者 张聚良 王岭 +2 位作者 晋援朝 黄庆生 金卫林 《第四军医大学学报》 北大核心 2001年第2期145-147,共3页
目的 观察血管内皮生长因子 (vascular endothelialgrowth factor,VEGF)及 β3整合素 m RNA在肉芽组织血管生成中表达的动态变化 .方法 采用 RT- PCR法定量分析人正常皮下组织、增殖期肉芽组织 (伤后 7~ 12 d)及成熟期肉芽组织 (伤后... 目的 观察血管内皮生长因子 (vascular endothelialgrowth factor,VEGF)及 β3整合素 m RNA在肉芽组织血管生成中表达的动态变化 .方法 采用 RT- PCR法定量分析人正常皮下组织、增殖期肉芽组织 (伤后 7~ 12 d)及成熟期肉芽组织 (伤后 30~ 35 d) VEGF及β3整合素 m RNA的水平 .结果 在正常皮下组织中 ,VEGF及β3整合素 m RNA呈低表达 ,而在增殖期肉芽组织中表达升高 ,待肉芽组织完全成熟后二者的表达又有所降低 .结论  VEGF及β3整合素 m RNA的水平与肉芽组织的血管生长过程呈动态相关 。 展开更多
关键词 逆转录-pcr 新生血管化 内皮生长因子 MRNA 内素组织生长
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RT-PCR检测健康猪扁桃体和流产死胎猪瘟病毒的应用及RFLP分析 被引量:14
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作者 罗廷荣 孙敬锋 +6 位作者 莫扬 刘芳 黄伟坚 陆芹章 温荣辉 秦爱珍 余克伦 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期192-195,共4页
本研究用反转录_聚合酶链反应(RT_PCR)技术对广西部分猪场的健康猪扁桃体材料以及流产胎儿和死胎中的猪瘟病毒(HCV)进行检测。70份健康猪扁桃体材料中阳性11份,阳性率达15 7%;52份流产胎儿及死胎材料中检出阳性9份,阳性率达17 3%。表... 本研究用反转录_聚合酶链反应(RT_PCR)技术对广西部分猪场的健康猪扁桃体材料以及流产胎儿和死胎中的猪瘟病毒(HCV)进行检测。70份健康猪扁桃体材料中阳性11份,阳性率达15 7%;52份流产胎儿及死胎材料中检出阳性9份,阳性率达17 3%。表明广西猪场中有比较严重的健康带毒情况。用限制性片段长度多态性分析法(RFLP)对25份阳性材料、HCLV和石门毒的引物A1/A2的PCR产物进行分析,发现HCLV、石门强毒和广西流行野毒的RT_PCR扩增产物中均有RsaⅠ的一个识别序列,但HCLV上的识别序列所在位置不同。本研究表明,用引物A1/A2作RT_PCR检测,并结合RFLP分析技术可把兔化弱毒和流行野毒区分开来,这将对预防猪瘟起到十分重要的作用。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 反转录-聚合酶链式反应 限制性片段长度多态性分析法
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乙脑病毒嵌套式RT-PCR检测方法的建立及初步应用 被引量:12
12
作者 高正琴 贺争鸣 +2 位作者 邢瑞昌 卫礼 王吉 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第4期279-282,共4页
目的 建立适用于检测人用猪源性生物制品中外源性乙脑病毒(JEV)的嵌套式RT- PCR方法。方法 根据已公布的JEV序列(GenBank登录号为M5 5 5 0 6 ) ,设计合成两对引物,对JEV感染的乳鼠脑组织和培养JEV的BHK 2 1细胞抽提RNA进行RT PCR和RT ... 目的 建立适用于检测人用猪源性生物制品中外源性乙脑病毒(JEV)的嵌套式RT- PCR方法。方法 根据已公布的JEV序列(GenBank登录号为M5 5 5 0 6 ) ,设计合成两对引物,对JEV感染的乳鼠脑组织和培养JEV的BHK 2 1细胞抽提RNA进行RT PCR和RT nestedPCR ,将PCR产物进行了克隆测序;同时对猪细小病毒(PPV)、猴空泡病毒4 0 (SV4 0 )及正常乳鼠脑组织、正常BHK 2 1细胞、PK15细胞、BSC 1细胞提取核酸进行PCR ,并对2 10份临床样品进行了检测。结果 PCR产物经琼脂糖凝胶电泳检测,JEV感染的乳鼠脑组织和培养JEV的BHK 2 1细胞均扩增出10 15bp和6 2 2bp目的基因片段,而PPV、SV4 0及未感染JEV的乳鼠脑组织、正常BHK 2 1细胞、PK15细胞、BSC 1细胞均未见特异性扩增条带,2 10份猪组织样品中未检出阳性样品。RT nestedPCR检测的最低限度为10PFU病毒。从样品核酸的提取到PCR扩增及检测结果的报告可在8小时内完成。结论 本研究建立的RT NestedPCR方法具有快速、特异、敏感、可靠的特点,可用于人用猪源性生物制品中外源性JEV的污染检测。 展开更多
关键词 乙脑病毒 反转录-嵌套式聚合酶链反应 检测
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猪流感病毒RT-PCR快速检测方法的建立 被引量:8
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作者 杨焕良 乔传玲 +2 位作者 陈艳 辛晓光 陈化兰 《动物医学进展》 CSCD 2007年第1期42-45,共4页
根据猪流感病毒M基因序列设计了一对扩增M基因684 bp片段的特异性引物,建立了RT- PCR快速诊断猪流感的方法,采用该方法检测出H1、H3、H5和H9 4个亚型猪流感病毒标准参考株为阳性,猪副黏病毒、圆环病毒2型和猪繁殖与呼吸综合征病毒检测... 根据猪流感病毒M基因序列设计了一对扩增M基因684 bp片段的特异性引物,建立了RT- PCR快速诊断猪流感的方法,采用该方法检测出H1、H3、H5和H9 4个亚型猪流感病毒标准参考株为阳性,猪副黏病毒、圆环病毒2型和猪繁殖与呼吸综合征病毒检测结果呈阴性。RT-PCR最少可检测到1 000 EID_(50)的病毒量核酸,可直接从猪流感病毒感染小鼠的组织样品中检测到病毒。 展开更多
关键词 猪流感病毒 诊断 反转录-聚合酶链式反应
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猪瘟病毒强毒株和兔化弱毒疫苗株RT-PCR快速鉴别检测方法的建立 被引量:9
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作者 郭抗抗 邓力 +3 位作者 井勇 张彦明 王晶钰 宁蓬勃 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2010年第6期13-18,共6页
【目的】建立猪瘟病毒强毒株和兔化弱毒疫苗株的RT-PCR快速鉴别检测方法。【方法】根据Gen-Bank中36株猪瘟病毒(CSFV)强毒株和兔化弱毒疫苗株的基因序列,分别设计了针对CSFV强毒和兔化弱毒疫苗株的特异性引物,建立了一种能区分CSFV强毒... 【目的】建立猪瘟病毒强毒株和兔化弱毒疫苗株的RT-PCR快速鉴别检测方法。【方法】根据Gen-Bank中36株猪瘟病毒(CSFV)强毒株和兔化弱毒疫苗株的基因序列,分别设计了针对CSFV强毒和兔化弱毒疫苗株的特异性引物,建立了一种能区分CSFV强毒和兔化弱毒疫苗株的RT-PCR检测方法。【结果】建立的RT-PCR检测方法可以从CSFV强毒株和兔化弱毒疫苗株中分别扩增出大小为187和492 bp的特异性片段,对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪圆环病毒2型(PCV2)和猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)等猪源性病毒的检测结果均为阴性,说明该方法具有较好的特异性。对10份疑似猪瘟临床样品进行检测后发现,利用该方法可以从中分别检测出CSFV强毒和疫苗毒。【结论】建立了可鉴别检测CSFV强毒株和弱毒疫苗株的RT-PCR方法,为猪瘟的早期诊断及疫苗免疫猪和野毒感染猪的鉴别提供了技术参考。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 猪瘟兔化弱毒疫苗 反转录-聚合酶链式反应 鉴别检测
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应用RT-PCR制备登革病毒诊断基因芯片探针 被引量:2
15
作者 肖维威 马文丽 +2 位作者 黄吉城 郑夔 郑文岭 《生命科学研究》 CAS CSCD 2004年第1期67-70,共4页
根据GenBank数据库中的生物信息,利用BLAST免费分析软件找出4种型别登革病毒的保守序列及各型特异性序列,针对上述序列设计引物经RT-PCR扩增登革病毒的特异片段。利用此RT-PCR法收集探针是一种快速、简便制备基因芯片探针的实用方法。
关键词 rt-pcr 登革病毒 诊断 基因芯片探针 聚合酶链反应 逆转录 GENBANK数据库
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GeXP多重RT-PCR技术在呼吸道病毒检测中的应用 被引量:3
16
作者 张允奇 王琼 +2 位作者 张银辉 何涛君 陆学东 《现代检验医学杂志》 CAS 2016年第2期94-98,102,共6页
目的应用GeXP多重基因表达遗传分析系统多重RT-PCR技术检测急性呼吸道感染儿童呼吸道样本中的呼吸道病毒并探讨其在儿童呼吸道感染病毒检测中的价值。方法回顾性检测2010年7月~2012年6月期间因疑似急性呼吸道感染就诊的1800名儿科患者... 目的应用GeXP多重基因表达遗传分析系统多重RT-PCR技术检测急性呼吸道感染儿童呼吸道样本中的呼吸道病毒并探讨其在儿童呼吸道感染病毒检测中的价值。方法回顾性检测2010年7月~2012年6月期间因疑似急性呼吸道感染就诊的1800名儿科患者的呼吸道样本,应用GeXP多重基因表达遗传分析系统多重RT-PCR技术对呼吸道合胞病毒、鼻病毒等多种呼吸道病毒进行检测。采用SPSS13.0统计软件进行统计学分析。结果GeXP多重RT—PCR方法检测到样本中的10种呼吸道病毒。样本中共有67.33%(1212/1800)的样本至少有一种病毒检测结果为阳性。这1212份病毒阳性标本中,人类鼻病毒(HRV)阳性最多,为375份,阳性率20.83%;其次为呼吸道合胞病毒(RSV)249份,阳性率13.83%;其他依次为人类腺病毒(HADV)、人类副流感病毒3(HPIV-3)、人类博卡病毒(HBoV)、甲型流感(InfA)、人类副流感病毒4(HPIV-4)、流感C(InfC)、人类偏肺病毒(hMPV)和乙型流感病毒(InfB);阳性率分别为8.89%,6.5%,5.3%,5.3%,3.3%,1.5%,1.11%和0.67%。不同性别间患儿呼吸道病毒阳性率差异无统计学意义(P〉0.05)。研究中观察到13.5%(243/1800)的病例同时感染两种或两种以上的病毒,其中两种病毒的混合感染为210例(11.67%),3种病毒混合感染为33例(1.83%)。呼吸道病毒的感染率存在季节差异,RSV大多在春季和冬季流行,HBoV,hMPV,InfA,InfB和HPIV-3大多是在春季流行,而HADV和HPIV-4主要在夏季流行,InfC大多是在秋季流行。结论GeXP分析系统多重RT-PCR方法是一个快速、高通量、高灵敏度且特异度强的检测分析方法,可用于急性呼吸道感染临床分子诊断和流行病学研究。 展开更多
关键词 GeXP系统 多重rt-pcr 呼吸道病毒 流行病学
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RT-PCR检测乳腺癌淋巴结转移的临床意义 被引量:6
17
作者 郝新保 付京 邱福海 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第9期964-967,共4页
背景与目的:近年来有报道,应用逆转录-多聚酶链反应(reversetranscription-polymerasechainreaction,RT-PCR)技术检测有关肿瘤细胞标志物的mRNA表达来判断淋巴结转移情况,可以获得较高的检测灵敏度。本研究的目的在于探讨RT-PCR检测癌... 背景与目的:近年来有报道,应用逆转录-多聚酶链反应(reversetranscription-polymerasechainreaction,RT-PCR)技术检测有关肿瘤细胞标志物的mRNA表达来判断淋巴结转移情况,可以获得较高的检测灵敏度。本研究的目的在于探讨RT-PCR检测癌细胞淋巴结转移的临床意义。方法:应用RT-PCR技术检测患者腋窝淋巴结中MUC1和keratin19的mRNA表达,结合HE染色结果判断有无发生腋窝淋巴结转移。HE染色阴性患者随访3年。结果:86例肿瘤组织中可检测出MUC1和keratin19的表达,而正常淋巴结中未发现。在37例HE染色淋巴结阴性的病例中,有11例(29.7%)的keratin19检测结果阳性,这部分病例的3年复发率为45.5%,而keratin19表达阴性的病例其3年复发率仅为12.5%(P<0.01)。结论:RT-PCR检测出的MUC1和keratin19在淋巴结中的表达可作为乳腺癌转移的参考标志,有助于对乳腺癌预后的判断。 展开更多
关键词 rt-pcr 检测 乳腺癌 淋巴结转移
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RT-PCR快速检测婴幼儿奶粉中的克罗诺杆菌活菌研究 被引量:5
18
作者 孙晶莹 李宏铎 +2 位作者 孙丽君 杨晓东 胡军 《食品安全质量检测学报》 CAS 2018年第3期598-602,共5页
目的建立反转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)快速检测克罗诺杆菌的方法,解决常见方法中以DNA作为模板带来的假阳性问题。方法根据克罗诺杆菌的α-葡萄糖苷酶基因序列设计特异性引物和探针,检测克罗诺杆菌,做了特异性和灵敏度... 目的建立反转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)快速检测克罗诺杆菌的方法,解决常见方法中以DNA作为模板带来的假阳性问题。方法根据克罗诺杆菌的α-葡萄糖苷酶基因序列设计特异性引物和探针,检测克罗诺杆菌,做了特异性和灵敏度研究。结果建立的RT-PCR法能有效扩增克罗诺杆菌的特异性片段,在纯培养物中,灵敏度可达10 CFU/m L,在人工污染奶粉培养7 h后的检测限为1×10 CFU/m L。结论本方法能够快速检测奶粉中克罗诺杆菌活菌。 展开更多
关键词 反转录pcr 克罗诺杆菌 活菌 奶粉
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竞争性RT-PCR法定量检测糖基化磷脂酰肌醇特异性磷脂酶D基因的表达 被引量:4
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作者 张晓杰 鲁纯平 +2 位作者 唐建华 顾善兰 禹虹 《湖南医科大学学报》 CSCD 北大核心 2003年第4期322-326,共5页
目的 :建立一种定量检测糖基化磷脂酰肌醇特异性磷脂酶D(GPI PLD)基因表达水平的竞争性RT PCR方法 ,以研究GPI PLD与白血病等疾病的关系。方法 :首先用PCR定点诱变法构建GPI PLD的竞争性cDNA模板 ,该模板与靶cDNA具有相同的引物结合区 ... 目的 :建立一种定量检测糖基化磷脂酰肌醇特异性磷脂酶D(GPI PLD)基因表达水平的竞争性RT PCR方法 ,以研究GPI PLD与白血病等疾病的关系。方法 :首先用PCR定点诱变法构建GPI PLD的竞争性cDNA模板 ,该模板与靶cDNA具有相同的引物结合区 ,但在长度上要比靶cDNA少 2 0个碱基。把该竞争性cD NA模板在体外转录出的竞争性RNA作为RT PCR的内标准 ,与白血病细胞株K5 6 2细胞的总RNA在同一体系内进行逆转录和PCR扩增 ,二者的PCR产物因长度不同可经电泳区分开 ,然后对电泳图像进行光密度扫描 ,根据已知的竞争性RNA模板的量计算出GPI PLDmRNA的量 ,从而得到GPI PLD基因的绝对表达量。结果 :构建和制备了长度为 198bp的GPI PLD竞争性RNA模板 ,该模板与靶模板呈明显的竞争性RT PCR反应 ;测得K5 6 2细胞GPI PLD基因的表达水平为每纳克 (44 0± 2 0 )拷贝。结论 :成功地建立了一种定量检测GPI PLD基因表达水平的竞争性RT PCR方法 ,该方法具有灵敏、准确等优点。 展开更多
关键词 竞争性rt-pcr 定量检测 糖基化磷脂酰肌醇特异性磷脂酶D基因 表达 白血病
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3种大蒜中洋葱黄矮病毒的RT-PCR分子鉴定 被引量:5
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作者 李金娟 李唯 +2 位作者 栗孟飞 马雯 许蕊 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期330-335,共6页
洋葱黄矮病毒(Onion yellow dwarf virus,OYDV)是危害大蒜产量和品质的主要病毒之一。快速有效的病毒检测方法可为大蒜病毒病的研究和有效防御提供理论与技术资料。本研究利用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术对甘肃"成县迟蒜&qu... 洋葱黄矮病毒(Onion yellow dwarf virus,OYDV)是危害大蒜产量和品质的主要病毒之一。快速有效的病毒检测方法可为大蒜病毒病的研究和有效防御提供理论与技术资料。本研究利用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术对甘肃"成县迟蒜"和山东"鲁蒜王2号"中OYDV外壳蛋白基因进行特异性扩增,并克隆到载体PMD18-TEasy Vector上进行核苷酸序列测定及分析。成功分离得到OYDV的两个DNA片段——GSCCS和SDLSW2,与GenBank中已报道的AB000837.1、AB000838.1和AJ409311.1等22个OYDV DNA片段的核苷酸相似性分别为81%~98%和81%~84%,氨基酸相似性分别为85%~99%和89%~94%,二者之间核苷酸相似性为84%,氨基酸相似性为89%。系统进化树显示不同DNA片段可聚为3个组群,GSCCS与中国山东金乡OYDV DNA片段同属一组,SDLSW2与其它16个OYDV DNA片段同属一组,表明OYDV在甘肃"成县迟蒜"和山东"鲁蒜王2号"中均存在,但具有一定差异。本实验确定了OYDV的基因变异程度,为进一步研究病毒进化和变异提供了有利条件。 展开更多
关键词 洋葱黄矮病毒(OYDV) 反转录-聚合酶链式反应 病毒检测 序列分析
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