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毛白杨S-腺苷高半胱氨酸水解酶基因PtSAHHA的克隆、表达及SNP关联分析 被引量:3
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作者 巩琛锐 王璐 +1 位作者 杜庆章 张德强 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第11期67-76,共10页
组合运用分子生物学及生物信息学方法,首次从毛白杨成熟木质部中分离出编码S-腺苷高半胱氨酸水解酶基因PtSAHHA的cDNA克隆。序列分析表明,毛白杨PtSAHHA cDNA片段全长为1 935 bp,其内部含有大小为1 458 bp的完整开放阅读框架,可编码含有... 组合运用分子生物学及生物信息学方法,首次从毛白杨成熟木质部中分离出编码S-腺苷高半胱氨酸水解酶基因PtSAHHA的cDNA克隆。序列分析表明,毛白杨PtSAHHA cDNA片段全长为1 935 bp,其内部含有大小为1 458 bp的完整开放阅读框架,可编码含有485个氨基酸残基的蛋白质。组织特异性Realtime-PCR结果显示,PtSAHHA在木质部中表达丰度最高,在形成层和老叶中表达丰度中等,在嫩叶中表达丰度最低。在此基础上,组合利用MAGE5.0和DnaSP5软件对毛白杨自然群体中45株基因型个体的PtSAHHA序列进行对比和分析,共检测到166个单核苷酸多态性(SNP)位点,SNP频率为1/15 bp,多样性指数πT为0.010 58。在外显子区域共检测到88个SNP位点,其中同义突变位点34个,错义突变位点53个及1个无义突变位点;同义突变的核苷酸多样性πSynonymous=0.024 91,是非同义突变核苷酸多样性πNonsynonymous=0.002 33的10倍,推测毛白杨PtSAHHA基因编码区在毛白杨物种演化过程中受到较强的纯化选择压力。对PtSAHHA基因内的SNPs连锁不平衡分析结果表明,随着核苷酸序列长度增加至800 bp,即r2<0.1,SNPs的连锁不平衡水平已衰退至不明显。在此基础上,在由426株毛白杨基因型个体组成的关联作图群体内,对频率大于10%的42个常见SNP标记位点与6个木材品质性状进行关联分析,检测到3个SNP标记与3个表型性状显著关联。研究结果为基于分子标记的毛白杨优良木材品质性状定向辅助育种提供理论依据。 展开更多
关键词 毛白杨 S-腺苷高半胱氨酸水解酶 单核苷酸多态性 连锁不平衡 木材品质性状
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氧化型辅酶NAD^+及布氏杆菌SahH活性位点对SahH催化活性的影响
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作者 荆雅玮 左佳坤 +7 位作者 王志豪 胡剑刚 黄燕 米荣升 苗晋锋 PHOUTHAPANE Vanhnaseng 陈兆国 韩先干 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期903-909,共7页
[目的]本文旨在鉴定影响布氏杆菌S-腺苷同型半胱氨酸水解酶(S-adenosylhomocysteine hydrolase,SahH)催化S-腺苷同型半胱氨酸(S-adenosylhomocysteine,SAH)产生同型半胱氨酸(homocysteine,HCY)的催化活性位点。[方法]将表达载体pET28a-B... [目的]本文旨在鉴定影响布氏杆菌S-腺苷同型半胱氨酸水解酶(S-adenosylhomocysteine hydrolase,SahH)催化S-腺苷同型半胱氨酸(S-adenosylhomocysteine,SAH)产生同型半胱氨酸(homocysteine,HCY)的催化活性位点。[方法]将表达载体pET28a-Bru-sahH转化大肠杆菌BL21中,表达、纯化布氏杆菌SahH(Bru-SahH)蛋白,分析辅酶NAD+、磷酸化修饰及活性位点对Bru-SahH催化活性的影响。[结果]添加NAD+后,Bru-SahH的催化活性降低85.6%;对Bru-SahH质谱分析表明,其444位丝氨酸为可能的磷酸化位点,对该位点突变后Bru-SahH催化SAH形成HCY的活性降低85.5%;生物信息学分析表明,Bru-SahH的337位和338位氨基酸为其活性位点,分别对上述2个位点进行单突变和双突变,突变后的Bru-SahH催化活性降低90.8%以上。[结论]Bru-SahH的337、338和444位氨基酸是其催化活性位点,添加外源性NAD+可抑制其催化活性。 展开更多
关键词 布氏杆菌 S-腺苷同型半胱氨酸水解酶 酶活性 活性位点
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布鲁菌半胱氨酸水解酶在甲硫氨酸循环中的催化活性研究 被引量:1
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作者 徐达 吴小卡 +6 位作者 荆雅玮 左佳坤 米荣升 黄燕 陈兆国 王成明 韩先干 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期697-702,共6页
[目的]细菌的sah H基因编码S-腺苷同型半胱氨酸水解酶(Sah H),该酶参与细菌的甲硫氨酸循环(AMC),调控细菌的多种生理功能。[方法]通过构建重组表达质粒p ET28a-Bru-sah H和p ET28a-Pse-sah H,分别表达布鲁菌(Brucella abortus)S2308株... [目的]细菌的sah H基因编码S-腺苷同型半胱氨酸水解酶(Sah H),该酶参与细菌的甲硫氨酸循环(AMC),调控细菌的多种生理功能。[方法]通过构建重组表达质粒p ET28a-Bru-sah H和p ET28a-Pse-sah H,分别表达布鲁菌(Brucella abortus)S2308株和铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)PAO1株的Sah H重组蛋白Bru-Sah H和Pse-Sah H。将纯化后的Bru-Sah H、Pse-Sah H以及我们前期表达纯化的禽致病性大肠杆菌(avian pathogenic Escherichia coli,APEC)的Pfs和Lux S蛋白,分别在体外催化S-腺苷同型半胱氨酸(SAH),通过对产物同型半胱氨酸(HCY)的浓度测定,评价不同重组蛋白的催化活性,并对催化底物时产生的自诱导分子2(AI-2)活性进行检测。[结果]Bru-Sah H和Pse-Sah H分别催化1 mmol·L-1SAH生成38和47μmol·L-1HCY,而APEC的Pfs和Lux S蛋白能催化相同浓度的SAH产生401μmol·L-1HCY。运用哈维弧菌BB170检测上述底物的AI-2活性,结果表明只有同时采用AEPC的Pfs和Lux S蛋白催化SAH,才能形成有活性的AI-2分子,而Bru-Sah H和Pce-Sah H均不能催化SAH形成活性AI-2分子。[结论]Bru-Sah H能催化SAH生成HCY,为进一步研究sah H在布鲁菌感染过程中的作用提供依据。 展开更多
关键词 布鲁菌 甲硫氨酸循环 S-腺苷同型半胱氨酸水解酶 催化活性 信号分子AI-2
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落地生根S-腺苷高半胱氨酸水解酶基因的克隆及生物信息学分析 被引量:4
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作者 苏振声 苏文锋 +6 位作者 杨秉建 张利娟 李亚超 白宇清 闫纯 曾会明 钟天秀 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期227-235,共9页
为了解落地生根(Kalanchoe daigremontiana)的SAHH基因功能,采用RACE技术从其叶片克隆了SAHH的全长cDNA序列,命名为KdSAHH。结果表明,KdSAHH全长为1748 bp,含1458 bp完整的开放阅读框(ORF),推测编码485个氨基酸。预测落地生根S... 为了解落地生根(Kalanchoe daigremontiana)的SAHH基因功能,采用RACE技术从其叶片克隆了SAHH的全长cDNA序列,命名为KdSAHH。结果表明,KdSAHH全长为1748 bp,含1458 bp完整的开放阅读框(ORF),推测编码485个氨基酸。预测落地生根SAHH蛋白分子量约为53 kDa,理论等电点为5.59~5.682。Scanprostie和DNAstar预测表明,落地生根SAHH蛋白在进化上非常保守,与苜蓿的亲缘关系较近。以黄羽扇豆为模板,利用SWISS-MODLE和Phyre程序模拟的落地生根SAHH蛋白亚基三维结构有一定差异。这些为落地生根KdSAHH的表达和功能研究奠定了基础。 展开更多
关键词 落地生根 S-腺苷高半胱氨酸水解酶 sahh 克隆 生物信息学
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Synthesis and biological evaluation of substituted indazolyl amide derivatives as S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase inhibitors
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作者 Xiang-Duan Tan Li-Guang Mao +2 位作者 Wei Wu Si-Yun Nian Guo-Ping Wang 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2016年第6期984-988,共5页
A series of novel amide derivatives bearing an indazole moiety were synthesized and evaluated for their in vitro S-adenosylL-homocysteine hydrolase(SAHase) inhibitory activity. Among these compounds, 8b,8m, 8r and 8... A series of novel amide derivatives bearing an indazole moiety were synthesized and evaluated for their in vitro S-adenosylL-homocysteine hydrolase(SAHase) inhibitory activity. Among these compounds, 8b,8m, 8r and 8w showed better or similar inhibitory effects compared to the positive control aristeromycin. These results provide a novel lead for the discovery of more potent non-adenosine analogs as SAHase inhibitors. 展开更多
关键词 s-adenosylhomocysteine hydrolase SAHase inhibitors Amide derivatives INDAZOLE SYNTHESIS
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Nuclear Targeting of Methyl-Recycling Enzymes in Arabidopsis thaliana Is Mediated by Specific Protein Interactions
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作者 Sanghyun Lee Andrew C. Doxey +1 位作者 Brendan J. McConkey Barbara A. Moffatt 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2012年第1期231-248,共18页
Numerous transmethylation reactions are required for normal plant growth and development. S-adenosylhomocysteine hydrolase (SAHH) and adenosine kinase (ADK) act coordinately to recycle the by-product of these reac... Numerous transmethylation reactions are required for normal plant growth and development. S-adenosylhomocysteine hydrolase (SAHH) and adenosine kinase (ADK) act coordinately to recycle the by-product of these reactions, S-adenosylhomocysteine (SAH) that would otherwise competitively inhibit methyltransferase (MT) activities. Here, we report on investigations to understand how the SAH produced in the nucleus is metabolized by SAHH and ADK. Localization analyses using green fluorescent fusion proteins demonstrated that both enzymes are capable of localizing to the cytoplasm and the nucleus, although no obvious nuclear localization signal was found in their sequences. Deletion analysis revealed that a 41-amino-acid segment of SAHH (GlylS^-Lys19~) is required for nuclear targeting of this enzyme. This segment is surface exposed, shows unique sequence conservation patterns in plant SAHHs, and possesses additional features of protein-protein interaction motifs. ADK and SAHH interact in Arabidopsb via this segment and also interact with an mRNA cap MT. We propose that the targeting of this complex is directed by the nuclear localization signal of the MT; other MTs may similarly target SAHH/ADK to other subcellular compartments to ensure uninterrupted transmethylation. 展开更多
关键词 TRANSMETHYLATION subcellular localization s-adenosylhomocysteine hydrolase adenosine kinase nuclear targeting protein docking protein modeling protein motif analysis.
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