基于SRK和SCR序列的甘蓝自交不亲和系单倍型分析

采用RT-PCR和其他分子生物学方法,以甘蓝自交不亲和系E1和F1柱头cDNA为模板扩增SRKE1和SRKF1基因,以花药cDNA为模板扩增SCRE1和SCRF1基因.经序列比对首次证明E1和F1材料分别为S28和S7单倍型.经三维结构分析,预测SCRE1上C5-C6和C7-C8之间氨基酸序列决定SCRE1的单倍型特异性,SRKE1上TNNSFYSRLKVS序列决定了SRKE1的单倍型特异性,并对两者相对作用的关键氨基酸位点进行了分析.

灯盏花自交不亲和SRK基因编码区甲基化分析

为研究灯盏花自交不亲和基因SRK(Eb SRK)的DNA甲基化变异,本文利用甲基化敏感限制性内切酶-PCR法,对Eb SRK基因中包含CCGG位点的部分编码区进行甲基化分析,同时,利用RT-PCR检测Eb SRK基因在灯盏花不同组织中的表达情况。实验结果显示,Eb SRK基因中的两个CCGG位点不存在甲基化,而Eb SRK基因在不同组织该基因的表达量有显著的差异性。这说明对Eb SRK等位基因的抑制不是由于Eb SRK基因中CCGG位点甲基化引起,而存在其他的调控机理。