鮰鱼SCYA107基因序列的比较分析

筛选BAC基因组文库得到阳性克隆后,利用引物步移法测定斑点叉尾SCYA 107基因组序列。该基因由四个外显子和三个内含子组成;外显子拼接的序列与cDNA序列完全一致,编码96个氨基酸,在N端含有两个相邻的半胱氨酸(CC)和两个不相邻的半胱氨酸,为典型的CC趋化因子亚家族成员;其上游调控序列有一些与免疫相关的转录因子结合位点;斑点叉尾SCYA 107氨基酸的结构和功能与小鼠趋化因子CCL 20比较接近,而蓝叉尾则更接近人CCL 8,它们氨基酸序列的差别是由于斑点叉尾SCYA 107基因序列中多了ACAAA这5个核苷酸,导致读码框移位提前出现终止子TGA所造成的。