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红花农艺性状与SCoT标记的关联分析
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作者 许兰杰 梁慧珍 +7 位作者 余永亮 安素妨 杨青 李春明 董薇 李磊 王红雨 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第4期157-162,共6页
红花种子富含亚油酸,具有降血脂、美容等功效。获得与红花农艺性状关联的分子标记,将为红花品种分子育种提供技术支撑。基于包含64条多态性条带的19条SCoT标记,利用STRUCTURE 2.3软件和一般线性模型进行群体结构分析和关联分析。结果表... 红花种子富含亚油酸,具有降血脂、美容等功效。获得与红花农艺性状关联的分子标记,将为红花品种分子育种提供技术支撑。基于包含64条多态性条带的19条SCoT标记,利用STRUCTURE 2.3软件和一般线性模型进行群体结构分析和关联分析。结果表明,84份红花种质的12个农艺性状变异系数为9.23%~51.21%,数据呈正态分布。单株种子质量与茎粗、有效分枝总数、单株果球总数、顶果球直径、顶果球着粒数、顶果球着粒质量、顶果球质量和单株果球总质量呈显著正相关,而与第1分枝高度呈显著负相关。群体遗传结构分析可将84份红花种质划分为5个类群,分别包含11、9、20、9、35份试验材料。84份红花种质中有60份材料Q>0.6,占所有供试材料的71.43%,说明各群体中大部分红花种质亲缘关系比较单一。3个SCoT标记位点与单株总果球数、单株2级分枝果球数、单株果球总质量和单株种子质量呈极显著相关联(P<0.01),各位点对表型变异的解释率在8.25%~10.93%。 展开更多
关键词 红花 农艺性状 scot标记 关联分析
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海南雷公笋的SCoT-PCR体系优化及有效引物筛选
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作者 孙秀秀 王春梅 +3 位作者 陈加利 夏腾飞 冯依欣 郑道君 《安徽农业科学》 CAS 2024年第8期95-99,共5页
[目的]分析DNA、引物,dNTPs、Taq DNA聚合酶4种因素对雷公笋SCoT-PCR扩增结果的影响,通过最优的SCoT-PCR反应体系筛选多态性引物,为雷公笋种质资源分子标记研究提供条件。[方法]以海南雷公笋为材料,采用单因素试验和正交试验方法。[结果... [目的]分析DNA、引物,dNTPs、Taq DNA聚合酶4种因素对雷公笋SCoT-PCR扩增结果的影响,通过最优的SCoT-PCR反应体系筛选多态性引物,为雷公笋种质资源分子标记研究提供条件。[方法]以海南雷公笋为材料,采用单因素试验和正交试验方法。[结果]Taq酶对雷公笋SCoT-PCR扩增的影响最大,其次是模板DNA和dNTPs,最后是引物;最优反应体系为20μL体系中40 ng DNA,0.30μmol/L引物,0.25 mmol/L dNTPs,3.00 U Taq酶。经验证,该体系获得的扩增产物清晰稳定;应用该体系从40条SCoT引物筛选出8条多态性好,且适合雷公笋扩增的引物,多态性条带占62.64%。[结论]该研究为使用SCoT分子标记技术对雷公笋开展深入研究提供了重要的理论基础和技术支持。 展开更多
关键词 雷公笋 scot 反应体系优化 有效性引物
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基于SCoT分子标记的61份加工型黄瓜种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
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作者 王宏利 赵久成 +5 位作者 赖淼 卢家仕 凌启昌 肖锦华 张华 付鑫锋 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2024年第4期36-45,共10页
为探明加工型黄瓜种质资源的亲缘关系及遗传多样性,为新品种选育提供理论依据,采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)技术,以61份加工型黄瓜种质资源为试验材料,进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。结果表明,从100条SCoT引物中筛选出8... 为探明加工型黄瓜种质资源的亲缘关系及遗传多样性,为新品种选育提供理论依据,采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)技术,以61份加工型黄瓜种质资源为试验材料,进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。结果表明,从100条SCoT引物中筛选出8条扩增条带清晰、多态性高且重复性好的引物;利用筛选出的引物对61份黄瓜种质基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出238个位点信息,其中多态性位点227个,平均多态性位点百分比为95.38%;采用NTSYS-pc 2.1软件计算得出供试的61份材料间的遗传相似系数分布在0.588~0.920之间,遗传相似系数最小的材料分别是34号与55号,二者在瓜色、叶片形状及果实形状方面存在较大差异,说明两者亲缘关系最远。基于遗传相似系数对其进行UPGMA聚类分析和树状图绘制,在相似系数0.735处,可将其划分为7个类群,说明61份黄瓜种质材料背景存在差异,但多数地域来源相近、生境相似地区的种质被聚在同一类群。利用2对特异性较大的引物SCoT12和SCoT83构建的DNA指纹图谱可单独鉴别出61份黄瓜种质资源,该图谱可为黄瓜分类与鉴定提供科学依据。 展开更多
关键词 黄瓜 scot分子标记 亲缘关系 遗传多样性 DNA指纹图谱
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基于CiteSpace的SCoT分子标记技术研究热点和前沿分析
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作者 庞敏霞 姚国祥 +1 位作者 戚勇 谢雄杰 《安徽农业科学》 CAS 2024年第9期212-219,共8页
采用文献计量学可视化分析的方法分析SCoT分子标记技术研究进程与现状,揭示研究热点及演化过程。检索中国知网(CNKI)和Web of Science(WOS)核心合集数据库中2000—2022年相关文献,通过Citespace 6.2.R2软件分析文献作者、机构、关键词... 采用文献计量学可视化分析的方法分析SCoT分子标记技术研究进程与现状,揭示研究热点及演化过程。检索中国知网(CNKI)和Web of Science(WOS)核心合集数据库中2000—2022年相关文献,通过Citespace 6.2.R2软件分析文献作者、机构、关键词、引文情况。结果表明,CNKI检索出297篇文献,WOS检索出319篇文献,SCoT分子标记技术研究发文量呈逐年增加趋势。中文文献大都呈散点状,没有形成复杂的网络合作关系,发文量以广西大学何新华教授居多,其次是陕西理工大学的张羽教授。英文文献发文量以Islamic Azad University的Etminan Alireza教授居多,但没有形成复杂的网络合作关系;而来自四川农业大学的张宇(Zhang Yu)教授与其他团队交流紧密,形成较大的研究团队和合作网络。高频关键词有种质资源、亲缘关系、体系优化、genetic diversity(遗传多样性)、scot(start codon targeted)(靶向起始密码子)、polymorphism(多态性)等,近年频率突现关键词为指纹图谱、猕猴桃、葛根、variability(可变性)、gene flow(基因流)、genotype(基因型)、traits(特性)等。英文分析高被引文章大都为遗传多样性分析文献,引文关键词为callus(愈伤组织)、spectral fingerprinting(光谱指纹)。综上所述,中文和英文文献对SCoT分子标记技术研究的关键词相似,前沿热点稍有不同,作者机构间应继续加强合作,促进同专业的学术交流,共同推动SCoT分子标记技术的应用发展。 展开更多
关键词 scot分子标记技术 CITESPACE 研究热点 前沿分析 可视化分析
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蛋黄果SCoT-PCR反应体系的建立与优化
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作者 周彩霞 李文砚 +6 位作者 卢美瑛 周之珞 颜桢灵 韦雪英 卓福昌 韦优 周婧 《中国南方果树》 北大核心 2024年第2期112-116,共5页
为建立和优化蛋黄果SCoT-PCR反应体系,以“仙桃1号”蛋黄果为试材,SCoT1为引物,采用L_(16)(4^(5))正交试验,对影响SCoT-PCR反应的DNA、Mg^(2+)、dNTPs、引物及Taq聚合酶等因素进行优化;并选用3份地理位置相距较远的蛋黄果种质为模板,对... 为建立和优化蛋黄果SCoT-PCR反应体系,以“仙桃1号”蛋黄果为试材,SCoT1为引物,采用L_(16)(4^(5))正交试验,对影响SCoT-PCR反应的DNA、Mg^(2+)、dNTPs、引物及Taq聚合酶等因素进行优化;并选用3份地理位置相距较远的蛋黄果种质为模板,对优化反应体系进行验证。结果表明,不同因素对蛋黄果SCoT-PCR反应体系的影响存在差异,但不显著,其中最大的影响因素是Taq聚合酶含量,其次是dNTPs浓度、模板DNA含量、引物浓度和Mg^(2+)浓度。蛋黄果SCoT-PCR最佳反应体系(20μL)为模板DNA 80 ng、3 mmol/L Mg^(2+)、0.25 mmol/L dNTPs、0.4μmol/L引物、Taq 2 U。在该体系下,3份蛋黄果种质均能稳定扩增出清晰明亮、数目丰富且稳定性高的条带,说明优化的SCoT-PCR反应体系适用于蛋黄果SCoT分子标记。 展开更多
关键词 蛋黄果 scot-PCR 正交试验 Taq聚合酶 dNTPs浓度
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环境温度对标准SCOT尾气SO_(2)排放的影响与对策分析
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作者 罗永辉 林万洲 +5 位作者 潘向东 王毅 黄娅 李宏 许万川 胡明 《石油和化工设备》 CAS 2024年第5期197-199,193,共4页
季节性的环境温度变化,对天然气净化厂SCOT装置尾气SO_(2)排放有较大影响。统计表明,在环境超过一定温度(约11℃)后,温度升高,SO_(2)排放明显升高。面对日益增长的环保要求,通过对现有的工艺进行分析和讨论,提出合理的解决思路,有效的... 季节性的环境温度变化,对天然气净化厂SCOT装置尾气SO_(2)排放有较大影响。统计表明,在环境超过一定温度(约11℃)后,温度升高,SO_(2)排放明显升高。面对日益增长的环保要求,通过对现有的工艺进行分析和讨论,提出合理的解决思路,有效的转化和吸收CLAUS尾气中的硫及H_2S,从而实现生产装置尾气排放达标,保护周边的生态环境。 展开更多
关键词 标准scot工艺 环境温度 SO_(2) 吸收条件
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广西壮瑶药瘤果紫玉盘SCoT-PCR反应体系建立及引物筛选
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作者 张尚文 杨天为 +4 位作者 黄诗宇 李婷 高曼熔 何龙飞 张向军 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1646-1655,共10页
【目的】建立瘤果紫玉盘SCoT-PCR最佳反应体系,并筛选出适宜的SCoT引物,为瘤果紫玉盘种质鉴定分类、亲缘关系分析和遗传多样性分析提供理论参考。【方法】以广西河池、百色、柳州、南宁4份瘤果紫玉盘野生种质为试材,通过单因素试验和正... 【目的】建立瘤果紫玉盘SCoT-PCR最佳反应体系,并筛选出适宜的SCoT引物,为瘤果紫玉盘种质鉴定分类、亲缘关系分析和遗传多样性分析提供理论参考。【方法】以广西河池、百色、柳州、南宁4份瘤果紫玉盘野生种质为试材,通过单因素试验和正交试验对瘤果紫玉盘SCoT-PCR反应体系的DNA模板用量、引物用量和Mix预混液用量3个因素进行优化,并使用优化后最佳反应体系进行SCoT引物筛选。最后将SCoT-PCR最佳反应体系和筛选出的引物用于瘤果紫玉盘种质的遗传多样性分析。【结果】单因素试验结果显示,DNA模板用量为40~70 ng,引物(10μmoL/L)用量为1.0~1.4μL,Mix预混液用量为9.0~12.0μL范围内扩增效果较好,通过L16(43)正交试验确定瘤果紫玉盘的SCoT-PCR最佳反应体系20.0μL:DNA模板(40 ng/μL)1.0μL,引物(10μmoL/L)1.2μL,Mix预混液10.0μL,7.8μL ddH2O。利用最佳反应体系筛选出26条适用于瘤果紫玉盘的SCoT引物,并确定了各引物最适的退火温度。26条SCoT引物在4份瘤果紫玉盘材料中共扩增出305个基因位点,其中多态性位点204个,多态性比率为66.89%,平均每条引物扩增出11.7个基因位点,有8.7个多态性位点。4份瘤果紫玉盘种质的平均等位基因数(Na)为1.7377,平均有效等位基因数(Ne)为1.5344,Nei’s基因多样性指数(H′)为0.3053,Shannon指数(I)为0.4449。4份瘤果紫玉盘间的遗传相似系数为0.5443~0.6492,遗传距离为0.4320~0.6083,说明4份瘤果紫玉盘种质间存在较大的遗传变异,遗传多样性水平较高。【结论】建立的SCoT-PCR最佳反应体系和筛选出的26条SCoT标记引物扩增效果较好,可用于瘤果紫玉盘种质资源的鉴定分类、亲缘关系分析和遗传多样性分析。 展开更多
关键词 瘤果紫玉盘 scot-PCR 反应体系优化 引物筛选 遗传多样性
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酸枣选育新品种遗传多样性的SCoT标记分析
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作者 王琳 赵红艳 +3 位作者 王云达 杜宪臣 曹岩 郭庆梅 《中药材》 CAS 北大核心 2023年第10期2425-2429,共5页
目的:利用SCoT分子标记技术分析酸枣选育新品种及酸枣栽培品种的遗传多样性和亲缘关系,为酸枣种质资源的保护、品种改良和优化夯实研究基础。方法:从100个SCoT引物中筛选出条带重复性好、多态性高的引物对供试材料进行PCR扩增,计算不同... 目的:利用SCoT分子标记技术分析酸枣选育新品种及酸枣栽培品种的遗传多样性和亲缘关系,为酸枣种质资源的保护、品种改良和优化夯实研究基础。方法:从100个SCoT引物中筛选出条带重复性好、多态性高的引物对供试材料进行PCR扩增,计算不同酸枣品种间的遗传相似系数,用非加权组平均距离法(UPGMA)进行聚类分析。结果:从100个SCoT引物中筛选出17个引物,共扩增出210条片段,每个引物平均产生12.35条片段。多态性条带187条,多态性比率为89.05%。22个酸枣品种间的遗传相似系数为0.561~0.941。聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.72处22个酸枣品种聚为三组。结论:该研究对酸枣种质资源的鉴定保护,分子辅助育种和开发利用提供了理论依据。 展开更多
关键词 酸枣 新品种 亲缘关系 遗传多样性 scot分子标记
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基于SCoT分子标记的苇状羊茅品种遗传关系及指纹图谱分析
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作者 赵旭 陈仕勇 +3 位作者 余静菠 张慧丽 关皓 周青平 《中国草地学报》 CSCD 北大核心 2023年第5期1-8,共8页
采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)对13个苇状羊茅品种进行遗传多样性、遗传结构及指纹图谱分析,以期为苇状羊茅种质资源鉴定、野生种质资源驯化及新品种培育提供理论依据。从80个SCoT引物中筛选出多态性较好、条带清晰且重复性高的引... 采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)对13个苇状羊茅品种进行遗传多样性、遗传结构及指纹图谱分析,以期为苇状羊茅种质资源鉴定、野生种质资源驯化及新品种培育提供理论依据。从80个SCoT引物中筛选出多态性较好、条带清晰且重复性高的引物15个进行扩增,13个苇状羊茅品种共扩增出181条条带,平均每个引物扩增12.07条。其中,多态性条带共176条,不同引物扩增的多态性条带数在7~16条之间,平均每个引物扩增多态性条带为11.73条,多态性条带比率(PPB)为97.24%;有效等位基因数范围在1.311~1.642之间,平均为1.511;基因多样性指数范围在0.184~0.357之间,平均为0.294;Shannon指数范围在0.276~0.518之间,平均为0.435。供试的13个品种间的遗传距离在0.0444~0.1401之间,平均值为0.1003;基于遗传距离的UPGMA聚类分析可将13个品种分为两类,与遗传结构分析结果一致。分子方差分析结果表明,总的遗传变异中有14%发生在品种间,有86%发生在品种内。引物SCoT10、SCoT56、SCoT80可以完全区分供试苇状羊茅品种,采用SCoT10引物扩增出的7个多态性位点成功构建了13个苇状羊茅品种的指纹图谱。 展开更多
关键词 苇状羊茅 scot 指纹图谱 亲缘关系
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基于SCoT分子标记的37份葡萄种质遗传多样性分析 被引量:1
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作者 马玉姣 何西堂 +3 位作者 吴玉森 刘利 李勃 李秀杰 《中外葡萄与葡萄酒》 北大核心 2023年第4期18-23,共6页
为进一步解析鲜食葡萄种质的遗传关系及遗传多样性,为新品种选育提供理论依据。基于SCoT分子标记对泰安金牛山基地和郑州果树研究所国家葡萄种质资源圃收集的37份葡萄种质(优系)进行遗传关系及多样性调查,并利用NTSYS 2.10软件进行聚类... 为进一步解析鲜食葡萄种质的遗传关系及遗传多样性,为新品种选育提供理论依据。基于SCoT分子标记对泰安金牛山基地和郑州果树研究所国家葡萄种质资源圃收集的37份葡萄种质(优系)进行遗传关系及多样性调查,并利用NTSYS 2.10软件进行聚类和主坐标分析。结果表明,11对SCoT引物共扩增出115条清晰的谱带,平均每条引物扩增条带数为10.45条;115条谱带中多态性条带102条,平均多态性比例为87.90%;遗传相似系数分析显示其遗传范围在0.612~0.929;当遗传相似系数为0.67时,可将37份葡萄种质分为两大类,说明37份葡萄种质遗传背景存在差异,但多数葡萄种质与亲本或潜在亲本分布在同一类内。以上结果表明,SCoT分子标记可以分析葡萄种质的潜在亲本关系,该结果可用于葡萄育种的早期鉴定,为后期优良种质的选育提供理论依据。 展开更多
关键词 葡萄种质 scot分子标记 遗传关系 遗传多样性
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变革、转向与伦理:基于SCOT理论的AIGC与出版知识服务
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作者 杨阿圆 王勇安 《出版广角》 北大核心 2023年第23期29-37,共9页
基于SCOT理论视角,分析出版业知识服务在技术与社会相关联情境下的知识生产方式变革及存在的问题,发现出版知识生产方式经历了三个阶段。在以AIGC为代表的为服务而知识的第三阶段,除了技术的创新让出版知识方式发生重大变革,仍然存在版... 基于SCOT理论视角,分析出版业知识服务在技术与社会相关联情境下的知识生产方式变革及存在的问题,发现出版知识生产方式经历了三个阶段。在以AIGC为代表的为服务而知识的第三阶段,除了技术的创新让出版知识方式发生重大变革,仍然存在版权争议、数据鸿沟、知识规范性缺失等问题。构建双驱动知识生产模式,重建知识权力,让冰冷的技术注入人的温度,可破解出版知识服务的困局,实现出版知识服务在社会、技术环境中的科学发展。 展开更多
关键词 scot理论 出版知识服务 AIGC 知识生产 伦理规范
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药食同源蔬菜赤苍藤SCoT分子标记体系的优化及引物筛选 被引量:1
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作者 杨天为 黄诗宇 +6 位作者 张尚文 高曼熔 张向军 李婷 庾韦花 蒙平 石前 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2023年第1期48-52,共5页
笔者以24份不同来源地的野生赤苍藤种质为试验材料,采用L9(33)正交试验对赤苍藤SCoT-PCR反应体系进行优化,并通过优化后的体系进行引物筛选,结果表明,PCR体系中各因素对多态性结果的影响程度排序为DNA模板量>引物用量>2×Taq ... 笔者以24份不同来源地的野生赤苍藤种质为试验材料,采用L9(33)正交试验对赤苍藤SCoT-PCR反应体系进行优化,并通过优化后的体系进行引物筛选,结果表明,PCR体系中各因素对多态性结果的影响程度排序为DNA模板量>引物用量>2×Taq Master Mix用量。最佳反应体系(20μL)为1 μL DNA模板(50 ng·μL^(-1))、1.2 μL引物(10 μmoL·μL^(-1))、10 μL 2×Taq Master Mix和7.8 μL ddH2O。通过该体系从36条SCoT引物中筛选出14条稳定性好、多态性高的引物,并确定了最佳退火温度。该体系的建立和引物的筛选将为后续开展赤苍藤种质资源收集与保护、遗传多样性研究和分子育种提供参考依据。 展开更多
关键词 赤苍藤 scot-PCR 体系优化 引物筛选
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Changes in the growth of Scots pine(Pinus sylvestris L.)stands in an urban environment in European Russia since 1862
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作者 Aleksandr V.Lebedev 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2023年第5期1279-1287,共9页
A century and a half ago,in the European part of Russia(Moscow),forest scientists established the first long-term observations of forests,many of which are under observation to the present day.In the twentieth century... A century and a half ago,in the European part of Russia(Moscow),forest scientists established the first long-term observations of forests,many of which are under observation to the present day.In the twentieth century,climate changes and,due to industrial development,forest areas were under air pollution.Based on observations from 157 sites,this study shows that the growth and density of Scots pine(Pinus sylvestris L.)have decreased by the end of the twentieth century.The environment has changed,and the growth and development of plantations has slowed.Pine yields(-34%stand volume)and their life expectancy(on average 50 years)have decreased.These changes are critical for forestry and for the management of forests in urban centers.Due to the decline in growth,ecosystem functions by urban forests has decreased.In order to increase the sustainability of urban forests and the provision of ecosystem services,it is preferable to create multi-species stands with a complex structure. 展开更多
关键词 Forest stand scots pine Stand growth Urbanized environment Human footprint
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Microwave Drying of Scots Pine Lumber:Structure Changes,Its Effect on Liquid Permeability
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作者 Sheng He Weiqi Leng +4 位作者 Yuhe Chen Hongchen Li Jingpeng Li Zaixing Wu Zizhang Xiao 《Journal of Renewable Materials》 SCIE EI 2023年第1期321-331,共11页
Microwave(MW)drying method was adopted to enhance the liquid permeability of Scots pine lumber.Structure changes were characterized by stereoscope microscope,scanned electron microscope(SEM)and transmission electron m... Microwave(MW)drying method was adopted to enhance the liquid permeability of Scots pine lumber.Structure changes were characterized by stereoscope microscope,scanned electron microscope(SEM)and transmission electron microscope(TEM)examination.Pore parameters before and after MW treatment were detected by mercury intrusion porosimetry(MIP)method,and the effect of structure changes on liquid permeability were analyzed.As stereoscope microscope,SEM and TEM examination results showed,macro and micro checks mainly developed at intercellcular of tracheids,intercellular of ray parenchyma and tracheid,while these checks extend main along the radial-longitudinal plane.Pit border destruction,aspirated pits’orus translocation and micro-checks in tracheid cell wall were also observed.MIP test shown that pore volume and pore area increased as macro and micro checks generated to form new cavities.Microstructure changes would increase the quantity of pores or enlarge the pore diameter.Liquid flow pathways increased as macro and micro checks generated,aspirated pits reopened to form new pathways;liquid flow efficiency improved as porosity,pore volume and pore diameter increased which facilitated the liquid flow. 展开更多
关键词 Microwave drying structure change pore structure liquid permeability scots pine lumber
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基于SCoT标记的胡椒属药用植物多样性分析
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作者 零唯 杨丹 +3 位作者 谭勇 黄鼎 林敬祯 明如宏 《安徽农业科学》 CAS 2023年第8期182-186,202,共6页
采用正交设计优化胡椒属药用植物SCoT-PCR反应体系,并运用SCoT分子标记对7种胡椒属药用植物31份样品进行遗传多样性研究。结果表明,胡椒属药用植物SCoT-PCR最佳反应体系:总体积20μL,其中10×Buffer 2.0μL,dNTPs 0.20 mmol/L,Mg^(2... 采用正交设计优化胡椒属药用植物SCoT-PCR反应体系,并运用SCoT分子标记对7种胡椒属药用植物31份样品进行遗传多样性研究。结果表明,胡椒属药用植物SCoT-PCR最佳反应体系:总体积20μL,其中10×Buffer 2.0μL,dNTPs 0.20 mmol/L,Mg^(2+) 1.5 mmol/L,引物0.4μmol/L,模板DNA 100 ng,Taq聚合酶2.5 U。扩增总条带数为68条,其中多态性条带为64条,多态性比率为94.12%。31份胡椒属药用植物个体间聚类分析结果显示,31份胡椒属样品划分为2个类群,6个亚群。SCoT可适用于胡椒属药用植物遗传多样性研究。 展开更多
关键词 胡椒属 scot 正交优化 遗传多样性
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苦荞EMS突变体库的构建及SCoT标记筛选分析 被引量:3
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作者 方小梅 杨文娟 +8 位作者 王于栋 唐恬 吴银环 陶建波 王艺钢 王俊珍 朱剑锋 张建 易泽林 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期54-65,共12页
苦荞属于蓼科荞麦属1年生草本植物,药食两用,营养价值丰富.该研究以苦荞测序品种“品苦1号”为试验材料,利用甲基磺酸乙酯(EMS)诱变技术构建苦荞突变体库,并利用形态观察及目标起始密码子多态性(SCoT)分子标记对突变体进行了筛选分析,... 苦荞属于蓼科荞麦属1年生草本植物,药食两用,营养价值丰富.该研究以苦荞测序品种“品苦1号”为试验材料,利用甲基磺酸乙酯(EMS)诱变技术构建苦荞突变体库,并利用形态观察及目标起始密码子多态性(SCoT)分子标记对突变体进行了筛选分析,主要研究结果为:(1) 0.6%EMS处理12 h为“品苦1号”最佳诱变处理;(2)构建了包含966个株系的苦荞突变体库,M2代11个主要农艺性状主成分分析得到包括籽粒大小因子、籽粒形状因子、植株产量因子、植株表型因子的4大主成分因子;聚类分析将M2代群体按农艺性状的差异分为4大类;(3)利用26条SCoT引物对“品苦1号”诱变M2代群体进行PCR扩增,共得到263条清晰稳定的条带;诱变M2代与野生型之间的遗传距离在0.003 8~0.324 5之间,其中PKM2-803和对照“品苦1号”(CK)间的遗传距离最大,PKM2-097和CK间的遗传距离最小;聚类分析将966份材料分为4大类,与表型分类相似,表明EMS诱变导致苦荞在表型性状及DNA分子水平均发生了变异. 展开更多
关键词 苦荞 甲基磺酸乙酯诱变 突变体库 目标起始密码子多态性分子标记
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基于SRAP和SCoT标记分析不同甜樱桃品种遗传多样性
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作者 李沛华 王进 +3 位作者 梁东 吕秀兰 周桂虹 李元美 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期12-22,共11页
【目的】探究40个甜樱桃(Prunus avium L.)品种的遗传多样性及SRAP和SCoT标记在甜樱桃上的应用。【方法】利用SRAP和SCoT分子标记进行遗传多样性分析。【结果】筛选出6对条带清晰、多态性好的SRAP引物和7条SCoT引物,在40个甜樱桃品种中... 【目的】探究40个甜樱桃(Prunus avium L.)品种的遗传多样性及SRAP和SCoT标记在甜樱桃上的应用。【方法】利用SRAP和SCoT分子标记进行遗传多样性分析。【结果】筛选出6对条带清晰、多态性好的SRAP引物和7条SCoT引物,在40个甜樱桃品种中分别扩增出多态性条带67和69条,多态性百分率分别为90.54%和93.24%。SRAP标记和SCoT标记的UPGMA聚类分析表明,40个甜樱桃品种的遗传相似系数分别在0.67~0.95和0.72~0.93,说明甜樱桃的遗传背景相对较窄。SRAP标记在相似系数0.79左右可以将40份甜樱桃分为6组,SCoT标记在相似系数在0.77左右可以将40份甜樱桃分为6组。两种分子标记中,来自不同地区的甜樱桃品种没有明显聚类,说明各个地区甜樱桃品种基因交流频繁,另外大部分黄色系甜樱桃品种聚为一类。【结论】2种分子标记均可应用于分析甜樱桃遗传多样性且能够区分不同果皮颜色甜樱桃,可以作为后期种质资源利用和新品种选育的技术手段。 展开更多
关键词 甜樱桃 相关序列扩增多态性 目标起始密码子多态性 遗传多样性
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草莓属植物SCoT分析体系的建立及优化 被引量:36
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作者 秦国新 何桥 +2 位作者 梁国鲁 雷家军 郭启高 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期393-397,共5页
为利用SCoT技术开展草莓属(Fragaria)植物种质资源遗传多样性及分子系统学研究,以草莓属植物11个野生种和1个栽培品种为试材,采用L25(56)正交试验设计,建立了草莓属植物的最优SCoT-PCR反应体系,即20μL反应体系中,含Mg2+2.0 mmol·... 为利用SCoT技术开展草莓属(Fragaria)植物种质资源遗传多样性及分子系统学研究,以草莓属植物11个野生种和1个栽培品种为试材,采用L25(56)正交试验设计,建立了草莓属植物的最优SCoT-PCR反应体系,即20μL反应体系中,含Mg2+2.0 mmol·L-1、dNTPs 0.3 mmol·L-1、Taq酶0.75 U、引物0.75μmol·L-1、模板DNA 40 ng,并对退火温度进行了优化,对电泳检测方法及草莓属植物DNA提取方法进行了改进。共筛选出22个适于进行草莓属植物SCoT分析的引物。经验证,该反应体系稳定性好、可重复性强、多态性高、扩增效果好,适于草莓属植物的SCoT分析。 展开更多
关键词 草莓属 scot 体系优化
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目标起始密码子多态性(SCoT):一种基于翻译起始位点的目的基因标记新技术 被引量:91
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作者 熊发前 唐荣华 +2 位作者 陈忠良 潘玲华 庄伟建 《分子植物育种》 CAS CSCD 2009年第3期635-638,共4页
随着功能基因组学的发展,分子标记领域已开始从传统的随机或匿名性分子标记转向目的基因标记和功能性标记。目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism,SCoT)标记是一种基于翻译起始位点的目的基因标记新技术,具有操作简... 随着功能基因组学的发展,分子标记领域已开始从传统的随机或匿名性分子标记转向目的基因标记和功能性标记。目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism,SCoT)标记是一种基于翻译起始位点的目的基因标记新技术,具有操作简单、重复性好等特点,根据ATG翻译起始位点侧翼保守序列来设计单引物,扩增产生偏向候选功能基因区显性多态性标记,适合不同层次实验室的不同领域的广泛应用,SCoT标记已开始在水稻和花生上得到运用。本文旨在介绍给研究者一种可以作为传统的RAPD、ISSR标记有效补充的目的基因标记新技术,希望其广泛的应用于生物多样性分析、遗传图谱构建、重要性状标记等方面。 展开更多
关键词 scot标记技术 基因目的标记 功能性标记 单引物扩增反应
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41份葡萄种质遗传多样性的ISSR和SCoT对比分析 被引量:18
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作者 王发明 李洁维 +4 位作者 叶开玉 龚弘娟 莫权辉 蒋桥生 刘平平 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期1-8,共8页
对收集于广西桂林的17份野生毛葡萄种质和24份栽培葡萄种质,分别使用12条ISSR和12条SCoT引物进行了遗传多样性和亲缘关系检测。结果表明:两种分子标记均能产生较丰富的多态性片段,可有效应用于葡萄的遗传多样性检测,但在聚类分析结果上... 对收集于广西桂林的17份野生毛葡萄种质和24份栽培葡萄种质,分别使用12条ISSR和12条SCoT引物进行了遗传多样性和亲缘关系检测。结果表明:两种分子标记均能产生较丰富的多态性片段,可有效应用于葡萄的遗传多样性检测,但在聚类分析结果上表现出一定的差异性,SCoT分子标记能更好地区分野生种质和栽培品种,说明SCoT分子标记在葡萄遗传多样性检测和系统进化研究上可能更有优势。从SCoT聚类结果上看,广西植物研究所收集的3个野生毛葡萄种质zws1、zws2和zws3相对其它野生种质而言,更偏向于与栽培种质聚为一类,说明这一类野生毛葡萄可能是这些栽培品种的原始亲本来源之一。不同的野生种质聚为多个类群,并表现出明显的地域特性,但遗传距离相对较远,说明桂林野生毛葡萄资源具有丰富的遗传变异。栽培品种没有明显的聚类特点,可能因为所选用的栽培品种的地域代表性并不是很强,也可能是因为栽培品种在不断的人工杂交选育过程中,遗传背景趋向一致,遗传多样性降低。该研究证明SCoT分子标记在葡萄遗传多样性研究上具有一定的优势。该研究结果为桂林毛葡萄资源的保护、利用和品种选育提供了理论依据,也为葡萄的系统进化研究提供了参考。 展开更多
关键词 葡萄 毛葡萄 遗传多样性 ISSR scot
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