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应用氨基酸稳定同位素标记-质谱技术构建肺癌细胞14—3—3sigma相互作用的分子网络 被引量:2
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作者 肖汀 米薇 +4 位作者 李敏 曹邦荣 冯林 程书钧 高燕宁 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期752-756,共5页
目的筛选14—3—3sigma在非小细胞肺癌细胞中的功能相关蛋白,构建相互作用的分子网络。方法构建稳定过表达14—3—3sigma蛋白的非小细胞肺癌细胞株(PG细胞,大细胞肺癌),采用四甲基偶氮唑蓝(MTT)方法检测PG细胞的生长速度。利用... 目的筛选14—3—3sigma在非小细胞肺癌细胞中的功能相关蛋白,构建相互作用的分子网络。方法构建稳定过表达14—3—3sigma蛋白的非小细胞肺癌细胞株(PG细胞,大细胞肺癌),采用四甲基偶氮唑蓝(MTT)方法检测PG细胞的生长速度。利用稳定同位素标记氨基酸(stableisotopelabelingbyaminoacidsincellculture,SILAC)技术,联合线性离子阱回旋共振质谱仪(LC-LTQ—n’)鉴定由14-3-3sigma过表达引起的差异表达蛋白,将质谱鉴定为表达〉2倍或〈0.5倍的蛋白作为差异蛋白。通过检索人类蛋白参考数据库(Humanproteinreferencedatabase,HPRD)和蛋白质交互作用网络数据库(Kyotoencyclopediaofgenesandgenomes,KEGG)构建分子网络。结果显示C4克隆中外源14—3—3sigma表达量最高(命名为PGSC4),后续实验用PGSCA细胞进行。转染14—3-3sigma后,PG细胞生长速度明显减慢。建立了包含147个蛋白差异蛋白的数据库。构建的分子网络中含有26个蛋白,其中参与了多个细胞活动(细胞周期调控、细胞分化、凋亡等)的重要激酶——酪蛋白激酶Ⅱ0t亚基(caseinkinaseIIsubunitalpha,CSNK2A1)是表达升高最明显的蛋白质,与DNA损伤调节机制相关的转录调节因子MENl(Menin)则是表达降低幅度最大的蛋白质。结论14.3—3sigma可以抑制非小细胞肺癌PG细胞的生长速度,与细胞周期、DNA损伤修复等机制相关的蛋白质发生了变化,并构成了相互作用的分子网络。 展开更多
关键词 14—3—3蛋白质类 肺肿瘤 细胞培养氨基酸稳定同位素标记-质谱技术 PG细胞 分子网络
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TNF-α诱导的信号转导中乙酰化蛋白质全谱及其功能的探索 被引量:1
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作者 张晓夕 左帅 +1 位作者 唐思伟 陈先 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期123-136,共14页
通过将体内稳定同位素标记细胞培养技术(AACT/SILAC)与LC-MS/MS联用,对哺乳动物细胞中TNF-α/NF-κB信号通路相关蛋白在TNF-α及TSA存在情况下乙酰化变化情况进行了研究.在TSA协同处理的、TNF-α刺激的细胞中鉴定到3个乙酰化蛋白,其中... 通过将体内稳定同位素标记细胞培养技术(AACT/SILAC)与LC-MS/MS联用,对哺乳动物细胞中TNF-α/NF-κB信号通路相关蛋白在TNF-α及TSA存在情况下乙酰化变化情况进行了研究.在TSA协同处理的、TNF-α刺激的细胞中鉴定到3个乙酰化蛋白,其中核糖体蛋白L4(60SRibosomal Protein L4,RPL4)已被报道存在乙酰化的后修饰,转铁蛋白受体1(Transferrin Receptor Protein 1,TfR1)和凋亡诱导因子3(ApoptosisInducing Factor,Mitochondrion-associated,3,AIFM3)尚未见报道. 展开更多
关键词 同位素氨基酸定量技术 定量蛋白质组学 TNF-Α LC-MS/MS RPL4 TFRC AIFM3
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