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盐胁迫下水稻种质资源Na^(+)、K^(+)平衡和SKC1单倍型分析 被引量:1
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作者 杨辉 白天亮 +6 位作者 朱春艳 冯培媛 宋佳伟 刘晓刚 李培富 罗成科 田蕾 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1085-1096,共12页
为探究盐胁迫下水稻地上部和根部Na^(+)、K^(+)含量和分布对其生物量累积和苗期耐盐性的影响,利用125 mmol/L Na Cl对51份不同类型水稻种质资源进行胁迫处理,测定5个形态学指标:耐盐级别、相对根长、相对地上部干重、相对根干重和地上... 为探究盐胁迫下水稻地上部和根部Na^(+)、K^(+)含量和分布对其生物量累积和苗期耐盐性的影响,利用125 mmol/L Na Cl对51份不同类型水稻种质资源进行胁迫处理,测定5个形态学指标:耐盐级别、相对根长、相对地上部干重、相对根干重和地上部含水量;6个离子指标:地上部Na^(+)含量、根系Na^(+)含量、地上部K^(+)含量、根系K^(+)含量、地上部Na^(+)/K^(+)和根系Na^(+)/K^(+),共11个耐盐相关指标。在主成分分析基础上,利用隶属函数和标准差系数赋予权重法获得水稻苗期耐盐性综合评价值(D值)。利用特异引物扩增SKC1基因编码区进行测序、比对和单倍型分析。结果表明:除相对根长外,地上部Na^(+)含量与其余4个形态学指标呈极显著负相关,耐盐级别与地上部Na^(+)含量、根系Na^(+)含量和地上部Na^(+)/K^(+)均呈极显著负相关,耐盐级别、相对地上部干重、相对根干重、地上部含水量4个指标两两之间均呈极显著正相关。利用SPSS主成分分析将11个单项指标转换为4个主成分,累计贡献率达82.093%。依据PC1中各指标的载荷系数,筛选出相对地上部干重、耐盐级别、相对根干重、地上部Na^(+)含量、地上部Na^(+)/K^(+)和根系Na^(+)含量6个重要指标;结合综合评价D值与这6个指标的线性回归分析,发现耐盐级别和地上部Na^(+)/K^(+)的系数较大,分别是影响水稻苗期耐盐性的形态学和离子平衡关键因子。通过对51份水稻种质资源SKC1编码区序列比对,共检测到9种不同的单倍型。其中源于越光的单倍型(Hap1)为粳稻种质资源的优势等位基因;源于Nona Bokra的单倍型(Hap7)为籼稻和Aus的优势等位基因。本研究结果可从离子平衡层面为耐盐水稻资源筛选与鉴定提供理论依据。 展开更多
关键词 水稻 耐盐性 离子平衡 skc1 单倍型分析
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小麦SKC1-like基因的克隆及多样性研究 被引量:3
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作者 李孟军 高欣娜 +1 位作者 史占良 郭进考 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期597-602,共6页
为了给小麦耐盐分子机制的研究提供参考,以水稻(Oryza sativa L.)耐盐相关数量性状基因SKC1(Shoot K+Content)的cDNA序列(GenBank登录号:DQ148410)为基础,通过搜索GenBank数据库找到2条与OsSKC1同源的普通小麦(Triticum aestivum L.)EST... 为了给小麦耐盐分子机制的研究提供参考,以水稻(Oryza sativa L.)耐盐相关数量性状基因SKC1(Shoot K+Content)的cDNA序列(GenBank登录号:DQ148410)为基础,通过搜索GenBank数据库找到2条与OsSKC1同源的普通小麦(Triticum aestivum L.)EST(GenBank登录号:DR734861,CK193616)。根据EST-DR734861设计引物筛选粗山羊草AL8/78(Aegilops squarrosa)BAC文库,通过BAC延伸测序克隆了粗山羊草AL8/78的SKC1-like基因(AeSKC1),进一步根据AeSKC1序列设计特异引物克隆了普通小麦SKC1-like基因(TaSKC1)。对人工合成双二倍体、地方品种和育成品种中TaSKC1的基因多样性分析表明,在驯化过程中TaSKC1瓶颈效应明显,属于驯化基因。 展开更多
关键词 小麦 skc1 驯化基因
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水稻耐盐基因SKC1等位变异突变体耐盐性评价
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作者 王彩芬 安永平 马静 《种子》 北大核心 2019年第6期51-55,共5页
SKC1基因是已经克隆的水稻耐盐主效基因,位于水稻1号染色体。为了在水稻育种中高效利用SKC1耐盐基因,前期研究利用TILLING技术检测宁夏水稻主栽品种宁粳28号EMS诱变群体,得到了SKC1基因的SNP突变体。本研究通过芽期、苗期、孕穗期、全... SKC1基因是已经克隆的水稻耐盐主效基因,位于水稻1号染色体。为了在水稻育种中高效利用SKC1耐盐基因,前期研究利用TILLING技术检测宁夏水稻主栽品种宁粳28号EMS诱变群体,得到了SKC1基因的SNP突变体。本研究通过芽期、苗期、孕穗期、全生育期耐盐性鉴定,对16份农艺性状优良的水稻耐盐基因SKC1等位变异突变体的耐盐性进行了全面评价,结果表明:耐盐性强的突变材料有:18NY-10、18NY-12、18NY-14,耐盐性较强的突变材料有:18NY-2、18NY-4、18NY-5、18NY-6、18NY-7、18NY-8、18NY-13、18NY-16。结果可为宁夏水稻耐盐育种提供种质资源。 展开更多
关键词 水稻 耐盐基因skc1 突变体 耐盐性评价
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水稻耐盐性基因SKC1的KASP标记的开发与利用
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作者 李瑶 程灿 +7 位作者 周继华 牛付安 姚瑶 黄祎雯 张安鹏 孙滨 曹黎明 储黄伟 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第9期2923-2929,共7页
籼稻品种‘Nona Bokra’中携带的SKC1^(NB)等位基因水稻耐盐性的主效QTL(Quantitative trait locus)位点。为了提高对水稻SKC1基因型鉴定效率,根据SKC1^(NB)基因中的功能性SNP位点开发了一个KASP分子标记SKC1^(NB)-KASP,利用该标记对‘N... 籼稻品种‘Nona Bokra’中携带的SKC1^(NB)等位基因水稻耐盐性的主效QTL(Quantitative trait locus)位点。为了提高对水稻SKC1基因型鉴定效率,根据SKC1^(NB)基因中的功能性SNP位点开发了一个KASP分子标记SKC1^(NB)-KASP,利用该标记对‘Nona Bokra’与粳稻品种‘繁14’、‘花B’和‘武1B’的回交BC3F2群体进行SKC1等位基因的分型,发现在BC3F2群体受测的65个单株的DNA样品中,有16份样品的基因型与供体亲本‘Nona Bokra’相同,31份样品显示杂合基因型,18份样品与轮回亲本基因型相同。对这65份DNA样品的,SKC1基因进行测序以检验KASP标记基因分型结果的准确性,发现测序结果与KASP标记分型的结果完全一致。以上结果说明SKC1^(NB)-KASP标记可以高效、准确地鉴定,SKC1位点的基因型,大大提高了耐盐性水稻分子标记辅助选择育种的效率。 展开更多
关键词 水稻(Oryza sativa) 耐盐碱 skc1 KASP
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水稻耐盐基因SKC1特异性CAPS标记的开发与验证 被引量:13
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作者 王彩芬 刘冬成 +3 位作者 马晓玲 安永平 张文银 马静 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期2437-2440,共4页
SKC1基因是已经成功克隆的水稻耐盐主效基因,位于水稻1号染色体。为在水稻育种中快速与高效利用SKC1耐盐基因,本研究利用经过TILLING技术检测得到的SKC1基因的SNP突变体为材料,分析突变位点的限制性酶切位点,筛选到特异性的内切酶Msc I... SKC1基因是已经成功克隆的水稻耐盐主效基因,位于水稻1号染色体。为在水稻育种中快速与高效利用SKC1耐盐基因,本研究利用经过TILLING技术检测得到的SKC1基因的SNP突变体为材料,分析突变位点的限制性酶切位点,筛选到特异性的内切酶Msc I,通过酶切PCR产物、琼脂糖电泳、酶切片段分析,开发建立了SKC1突变位点的CAPS标记,命名为CAPS/Msc I。并利用该标记对40份突变群体进行了纯合、杂合和野生型酶切分型,筛选出纯合突变体5份,并对选择结果进行了测序验证。结果表明该CAPS标记准确可靠,可用于耐盐分子标记辅助选择育种。 展开更多
关键词 水稻 耐盐基因 skc1 CAPS标记
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TILLING技术在水稻耐盐基因SKC1突变体筛选中的应用 被引量:4
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作者 王彩芬 马晓玲 +3 位作者 安永平 张文银 马静 刘冬成 《作物杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期66-70,共5页
TILLING技术是一种高效检测SNP的反向遗传学方法.根据已克隆的水稻耐盐主效基因SKC1设计特异引物,以化学诱变剂EMS(甲基磺酸乙酯)处理获得的1 310份M2代水稻为材料,利用TILLING技术检测突变位点.经过2011 ~ 2012年2年M2、M3代的连续... TILLING技术是一种高效检测SNP的反向遗传学方法.根据已克隆的水稻耐盐主效基因SKC1设计特异引物,以化学诱变剂EMS(甲基磺酸乙酯)处理获得的1 310份M2代水稻为材料,利用TILLING技术检测突变位点.经过2011 ~ 2012年2年M2、M3代的连续检测及测序分析,获得SKC1基因纯合突变体5份,杂合突变体14份,研究结果表明利用TILLING技术进行水稻耐盐突变体筛选是非常有效的. 展开更多
关键词 水稻 TILLING技术 skc1基因 突变体
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Na^+转运蛋白SKC1基因转化大豆的研究 被引量:1
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作者 于志晶 蔡勤安 +3 位作者 刘艳芝 齐广勋 马瑞 董英山 《吉林农业科学》 CSCD 北大核心 2014年第1期1-5,共5页
本研究构建了水稻Na+转运蛋白SKC1基因植物表达载体pTF-SKC1,标记基因为Bar基因。以子叶节为外植体,利用农杆菌介导法将SKC1导入大豆中。经过除草剂抗性筛选后获得的再生植株经PCR方法鉴定,转基因植株阳性率为50%,初步证明SKC1基因已整... 本研究构建了水稻Na+转运蛋白SKC1基因植物表达载体pTF-SKC1,标记基因为Bar基因。以子叶节为外植体,利用农杆菌介导法将SKC1导入大豆中。经过除草剂抗性筛选后获得的再生植株经PCR方法鉴定,转基因植株阳性率为50%,初步证明SKC1基因已整合到大豆基因组中。耐盐性试验结果表明,转基因植株的耐盐性高于对照。 展开更多
关键词 skc1基因 遗传转化 大豆
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水稻耐盐基因SKC1特异性分子标记开发及应用 被引量:1
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作者 蒋医蔚 韩晓丽 +5 位作者 闸雯俊 刘凯 李培德 徐华山 游艾青 周雷 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期3609-3614,共6页
SKC1是世界上第一个被克隆的水稻耐盐性QTL,为了使SKC1在水稻分子标记辅助选择(MAS)育种中得到高效和快速利用,本研究通过将SKC1不同等位基因测序及序列比对鉴定到一个SKC1基因内特异SNP位点,使用AS-PCR(allele-specific PCR)的方法加... SKC1是世界上第一个被克隆的水稻耐盐性QTL,为了使SKC1在水稻分子标记辅助选择(MAS)育种中得到高效和快速利用,本研究通过将SKC1不同等位基因测序及序列比对鉴定到一个SKC1基因内特异SNP位点,使用AS-PCR(allele-specific PCR)的方法加以改进开发了一套鉴定该SNP的功能性分子标记,利用该标记及待检测水稻品种基因组DNA进行PCR扩增,通过不同PCR产物条带大小将SKC1与其它等位基因区分开,可快速判断待测水稻SKC1的等位基因类型。本方法成本费用低廉、简单高效,可应用于大规模水稻种质资源SKC1等位基因筛选和MAS育种。本研究对创制耐盐水稻新种质、培育耐盐水稻新品种、推动盐碱地水稻种植推广具有一定的意义。 展开更多
关键词 耐盐性 skc1 等位基因特异性PCR MAS 水稻
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Morphophysiological Diversity and Haplotype Analysis of Saltol QTL Region in Diverse Rice Landraces for Salinity Tolerance
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作者 B.M.LOKESHKUMAR S.L.KRISHNAMURTHY +4 位作者 Suman RATHOR Arvinder Singh WARRIACH N.M.VINAYKUMAR B.M.DUSHYANTHAKUMAR Parbodh Chander SHARMA 《Rice science》 SCIE CSCD 2023年第4期306-320,I0010-I0012,共18页
Rice is sensitive to salinity stress at both the seedling and reproductive stages.The present study used 145 rice genotypes comprising of 100 landraces and 45 advanced breeding lines collected from different regions o... Rice is sensitive to salinity stress at both the seedling and reproductive stages.The present study used 145 rice genotypes comprising of 100 landraces and 45 advanced breeding lines collected from different regions of India.These genotypes were evaluated in hydroponics under control[electrical conductivity(ECe)~1.2 dS/m]and saline(ECe~10.0 dS/m)environments along with susceptible(IR29)and tolerant(FL478)checks.The stress susceptibility index for eight morphophysiological traits was estimated.Analysis of variance showed significant differences among the genotypes for all the parameters studied in control,stress and relative stress conditions.We identified 3 landraces(Kuttimanja,Tulasimog and IET-13713I)as tolerant and 14 lines as moderately tolerant to salt stress.Strong correlations in the morphological(root and shoot lengths)and physiological traits(shoot Na^(+),Ca^(2+)and Mg^(2+)contents,and Na^(+)/K^(+)ratio)were observed under all the conditions.The hierarchical cluster analysis grouped the genotypes into five clusters,among which cluster Ⅱ comprised salt-tolerant lines.Haplotyping of Saltol region using 11 simple sequence repeat markers on 17 saline tolerant and moderately tolerant lines was conducted.Markers AP3206F,RM10793 and RM3412b,located close to SKC1 gene(11.23‒12.55 Mb),displayed diverse allelic variations and they were not related to the FL478 type.In this region,tolerant lines like Kuttimanja,IET-13713I and Tulasimog have new alleles.As a result,these lines may be suitable candidates for novel genomic regions governing rice salinity tolerance.Salt-tolerance ability of Kuttimanja,Tulasimog and IET-13713I was validated in two years in three salinity stress environments.These promising lines can be used in breeding programs to broaden the genetic base of salinity tolerance in rice,and it may help to dissect key genomic regions responsible for salinity tolerance. 展开更多
关键词 HAPLOTYPE salinity tolerance RICE Saltol DIVERSITY skc1 gene
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