小麦SUS基因家族鉴定与生物信息学分析

【目的】对小麦蔗糖合成酶(sucrose synthase,SUS)基因家族进行鉴定和生物信息学分析,为探究小麦SUS(TaSUS)基因家族的作用机制提供理论参考。【方法】采用生物信息学方法在小麦全基因组上鉴定TaSUS基因家族成员,并对其系统进化关系、染色体位置、基因结构、保守结构域、启动子顺式作用元件和基因表达模式进行分析。【结果】在小麦基因组中共鉴定到分布于14条染色体上的24个TaSUS基因,可分为3个亚组。TaSUS基因含有多个外显子,但部分基因缺失非翻译区结构。TaSUS基因家族成员启动子区域包含45种顺式作用元件,涉及植物生长发育和逆境胁迫响应。大多数TaSUS基因在小麦穗中显著表达,在叶、茎和根中的相对表达量较低。【结论】研究结果有助于了解小麦SUS基因家族的进化,为后期小麦SUS基因家族的生物功能研究奠定理论基础。

玉竹蔗糖合成酶(SUS)基因家族的鉴定、表达分析及PoSUS1基因的克隆

多糖是玉竹的质量标志物,在免疫调节、抗肿瘤等方面具有显著的药理作用。作为多糖合成的关键酶之一,蔗糖合成酶(sucrose synthase,SUS)一直是揭示植物多糖合成的重要研究内容。基于转录组序列信息,本研究利用生物信息学手段对玉竹SUS基因家族及其成员进行鉴定,并利用荧光定量PCR(qPCR)对其成员表达模式进行分析。结果表明:玉竹转录组共获得8个具有ORF序列的PoSUS基因家族成员,其编码蛋白质含有111~310个氨基酸,分子量为12.81~35.43 kDa,其理论等电点为5.83~9.18。系统进化树分析表明,8个PoSUS基因家族成员可分为3个亚家族,其中第Ⅲ亚家族基因成员数目最多。亚细胞定位预测显示大多数PoSUS蛋白定位在叶绿体。基因表达模式分析表明,PoSUS1和PoSUS6基因在多糖积累的根茎组织中表达量最高,且高多糖种质HN1中PoSUS1和PoSUS2表达量显著高于低多糖种质AH2。此外,本研究还从种质HN1和AH2克隆得到PoSUS1基因CDS序列,其编码蛋白在2份种质间存在3处氨基酸差异,且这些差异位于PoSUS1蔗糖合成酶结构域。本研究结果为深入研究玉竹SUS基因功能奠定基础,也为玉竹药用品质形成分子机制研究提供理论依据。

心理弹性干预联合对症支持对乳腺癌易感基因突变晚期卵巢癌患者心理弹性及生活质量的影响

目的 探讨心理弹性干预联合对症支持对乳腺癌易感基因(BRCA)突变晚期卵巢癌患者心理弹性和生活质量的影响。方法 将80例BRCA突变晚期卵巢癌患者按干预方法的不同分为联合心理干预组(n=43)和常规干预组(n=37),常规干预组患者采用常规疗护方法,联合心理干预组患者在常规干预组的基础上采用心理弹性干预联合对症支持。比较两组患者心理弹性[心理弹性量表(CD-RISC)]、疼痛[数字分级评分法(NRS)]、自我效能[一般自我效能感量表(GSES)]、心理状况[症状自评量表(SCL-90)]、生活质量[欧洲癌症研究与治疗组织生命质量测定量表(EORTC QLQ-C30)]和满意度。结果 干预后,两组患者CD-RISC、EORTC QLQ-C30各维度评分均较干预前升高,SCL-90各维度评分均较干预前降低,且联合心理干预组患者CD-RISC、EORTC QLQ-C30各维度评分均高于常规干预组,SCL-90各维度评分均低于常规干预组,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。干预后,两组患者NRS评分均较干预前降低,GSES评分均较干预前升高,且联合心理干预组患者NRS评分低于常规干预组,GSES评分高于常规干预组,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。联合心理干预组患者满意度和满意度评分均高于常规干预组,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。结论 心理弹性干预联合对症支持可有效提升BRCA突变晚期卵巢癌患者心理弹性、自我效能、生活质量,减轻疼痛,缓解负性情绪,提高患者满意度。

EGFR、Ki-67表达与原发性肝癌根治性手术预后的相关性

【目的】探讨癌组织中表皮生长因子受体(EGFR)、Ki-67表达与原发性肝癌(HCC)根治性手术后预后的关系。【方法】选取2015年6月至2018年6月本院收治的103例HCC患者,患者均行HCC根治性手术及术后预防性导管动脉化疗栓塞,术后随访3年。检测并比较癌组织、癌旁组织中EGFR、Ki-67表达情况,分析癌组织中EGFR、Ki-67表达与病理因素关系,分析影响HCC根治术患者预后的因素及癌组织中EGFR、Ki-67表达与HCC术后预后的关系。【结果】癌组织中EGFR、Ki-67阳性表达率均高于癌旁组织(P<0.05)。有微血管癌栓、肿瘤包膜不完整、临床Ⅲ期及低分化患者癌组织EGFR、Ki-67阳性表达率分别高于无微血管癌栓、肿瘤包膜完整、临床Ⅰ~Ⅱ期、中高分化患者(P<0.05)。Cox回归分析显示,微血管癌栓、肿瘤包膜、临床分期、分化程度情况及EGFR表达、Ki-67表达是影响HCC患者无病生存率的相关因素(P<0.05);肿瘤包膜、临床分期、分化程度情况及EGFR表达、Ki-67表达是影响总生存率的相关因素(P<0.05)。EGFR、Ki-67阴性表达患者的无病生存率、总生存率均优于阳性表达患者,差异有统计学意义(P<0.05)。【结论】HCC患者癌组织中EGFR、Ki-67异常高表达,EGFR、Ki-67表达与HCC术后患者病理、预后有关,阳性表达者预后不良风险高。

表观遗传学药物对弥漫大B细胞淋巴瘤SU-DHL-4细胞株增殖及SHP-1基因表达的影响

目的探讨去甲基化药物5-氮杂-2’-脱氧胞苷(5-aza-2'-deoxycytidine,5-Aza-CdR)及组蛋白去乙酰化酶抑制剂辛二酰苯胺异羟肟酸(N-Hydroxy-N-phenyloctanediamide,SAHA)对弥漫大B细胞淋巴瘤SU-DHL-4细胞株增殖及抑癌基因蛋白酪氨酸磷酸酶-1基因(Src-homologydomain2-containingprotein tyrosine phosphatase-1,SHP-1)表达的影响。方法四甲基偶氮唑蓝(MTT)法检测5-Aza-CdR及SAHA对SU-DHL-4细胞株增殖的影响,SYBR Green相对定量反转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测SHP-1基因表达水平。结果5-Aza-CdR及SAHA均可抑制SU-DHL-4细胞的增殖,且表现为浓度依赖性;1μmol/L5-Aza-CdR及2μmol/SAHA联合应用后,SU-DHL-4细胞的增殖抑制率增高为52.23%,且不同药物浓度间吸光度比较(P<0.01);5-Aza-CdR及SAHA均能使SU-DHL-4细胞中SHP-1重新表达,且联合应用后表达量更高。结论表观遗传学药物能显著抑制弥漫大B细胞淋巴瘤SU-DHL-4细胞株增殖,可能与其诱导的SHP-1基因的表观遗传改变和SHP-1的再表达有关。

基于线粒体Cytb基因的贵州野猪(Sus scrofa)群体遗传多样性分析

【目的】评估贵州地区野猪(Sus scrofa)的遗传多样性和遗传结构,为进一步开展保护遗传学研究和种群生态管理提供理论依据,进而为研究野猪的保护生物学及其对环境的适应奠定基础。【方法】对野猪线粒体Cytb基因进行PCR扩增及测序,结合从GenBank中下载的国内其他9个地区的55条野猪线粒体Cytb基因序列,利用Mega 7.0软件进行碱基组成和遗传距离分析,并使用DnaSP 6.0软件进行遗传多样性分析。【结果】贵州野猪Cytb基因(1140 bp)碱基组成与其他地区野猪种群相似,AT含量高于GC含量;贵州采集的11头野猪的Cytb基因共有6个变异位点,4种单倍型,单倍型多样性为0.600,核苷酸多样性为0.00118;单倍型多样性与核苷酸多样性仅高于江西和东北地区的野猪种群;种内遗传距离较小,亲缘关系较近;中性检验Tajima’s D值和Fu’s Fs值均为负值且差异不显著,错配分布分析呈单峰分布,表明贵州野猪种群在历史上较为稳定。使用Network构建单倍型网络图,结合Mega 7.0软件构建的单倍型系统发育树分析结果表明,贵州野猪单倍型与其他地区种群存在共享单倍型(Hap_1和Hap_10)。【结论】贵州野猪种群正历经种群扩张阶段,但种群遗传多样性低于全国多个地区的野猪种群,种群内遗传距离较小,与国内其他地区种群间遗传距离适中,因此,应加强对其种群遗传多样性的保护管理。

Polycomb家族基因BmSu(z)12在家蚕幼虫中的表达研究

[目的]研究家蚕Polycomb蛋白家族基因BmSu（z）12在家蚕幼虫中的表达情况.[方法]根据家蚕基因组预测的BmSu（z）12基因序列,设计特异引物,利用qRT-PCR对该基因在家蚕不同龄期幼虫中的表达进行研究.[结果]BmSu（z）12基因在5龄幼虫蜕皮后2d和变态前2d有较高表达,而在1～5龄取食中期表达量较低,表达特征具有一定的规律性.[结论]BmSu（z）12基因在家蚕幼虫生长发育中具有重要作用,该研究为进一步研究家蚕SU（Z）12蛋白的功能奠定基础.

Gene therapy in pancreatic cancer

Pancreatic cancer(PC) is a highly lethal disease and notoriously difficult to treat. Only a small proportion of PC patients are eligible for surgical resection, whilst conventional chemoradiotherapy only has a modest effect with substantial toxicity. Gene therapy has become a new widely investigated therapeutic approach for PC.This article reviews the basic rationale, gene delivery methods, therapeutic targets and developments of laboratory research and clinical trials in gene therapy of PC by searching the literature published in English using the PubMed database and analyzing clinical trials registered on the Gene Therapy Clinical Trials Worldwide website(http://www. wiley.co.uk/genmed/ clinical). Viral vectors are main gene delivery tools in gene therapy of cancer, and especially, oncolytic virus shows brighter prospect due to its tumor-targeting property.Efficient therapeutic targets for gene therapy include tumor suppressor gene p53, mutant oncogene K-ras,anti-angiogenesis gene VEGFR, suicide gene HSK-TK,cytosine deaminase and cytochrome p450, multiple cytokine genes and so on. Combining different targets or combination strategies with traditional chemoradiother-apy may be a more effective approach to improve the efficacy of cancer gene therapy. Cancer gene therapy is not yet applied in clinical practice, but basic and clinical studies have demonstrated its safety and clinical benefits. Gene therapy will be a new and promising field for the treatment of PC.

萝卜全基因组SUS基因家族成员的鉴定与分析

利用生物信息学方法,对萝卜全基因组SUS基因家族成员进行鉴定与表达分析,结果表明:1)从萝卜基因组中鉴定出7个SUS基因家族成员,且每个家族成员均包含3个保守基序,外显子数量为11~14个。2)根据进化树聚类结果,7个SUS基因家族成员可分为3大类,即SUSⅠ、SUSⅡ和SUSⅢ,它们分别包含2个、2个和3个SUS基因家族成员。3)这7个SUS基因家族成员分布在4条染色体上,7号染色体上分布有3个SUS基因家族成员,9号染色体上分布有2个SUS基因家族成员,3号和4号染色体分别有1个SUS基因家族成员。4)萝卜SUS基因家族成员启动子包括参与激素响应、参与环境响应和抗性、参与厌氧诱导及分生组织表达的顺式作用元件。5)RsSUS1基因的2个拷贝(即Rsa10035816和Rsa10021071)在萝卜不同组织和不同发育时期的表达量均较高。以上研究为萝卜SUS基因家族成员的生物学功能分析提供了基础。

猕猴桃蔗糖合成相关酶SUS与SPS基因的鉴定与表达分析

蔗糖合酶(SUS)和蔗糖磷酸合成酶(SPS)基因是高等植物蔗糖代谢的关键酶。为了探究猕猴桃SUS和SPS基因在蔗糖代谢中的作用,本研究以‘红阳’和‘华特’为试材,进行了全基因组鉴定与基因结构、系统发育关系、保守域分析、染色体定位和基因进化模式分析,并结合转录组数据分析了SUS和SPS基因的表达特征。结果表明,猕猴桃中包含8个SUS基因(AchSUS1~AchSUS8)和5个SPS基因(AchSPS1~AchSPS5),其中,SUS家族基因分为3个亚家族,分别为SUSⅠ、SUSⅡ和SUSⅢ;SPS基因家族分为4个组,分别为SPSA、SPSB、SPSC和SPSD。猕猴桃SUS和SPS基因家族成员不均匀地分布在11条染色体上,存在7对旁系同源基因,分别经历了片段重复和猕猴桃种内全基因组复制事件,SUS基因在SUSⅢ中的扩张得以保留,且这些基因在进化过程中受纯化选择作用。表达分析发现,所有SPS基因和4个SUS基因在‘红阳’和‘华特’中的表达呈现极显著差异,其中AchSUS7在‘红阳’中特异表达。这些基因可能在猕猴桃糖分积累和品质形成中起着重要作用。

柠檬蔗糖代谢关键酶基因家族鉴定及表达分析

【目的】对柠檬蔗糖代谢关键酶基因家族成员进行鉴定,并分析其在蔗糖积累有明显差异的2个柠檬品种果实发育过程中的表达情况,为揭示柠檬蔗糖代谢关键酶在果实发育中的作用机制及柠檬与其他柑橘类果实蔗糖代谢分子机制提供理论依据。【方法】运用生物信息学方法鉴定柠檬蔗糖代谢关键酶[蔗糖合成酶(SUS)、蔗糖磷酸合成酶(SPS)、蔗糖转化酶(INV)]基因家族成员,对其基本理化性质、保守基序、基因结构、系统进化、蛋白质保守功能域、顺式作用元件和进化模式等进行全面分析。基于转录组数据分析柠檬蔗糖代谢关键酶基因家族成员在不同组织中的表达模式,并利用实时荧光定量PCR检测其在果皮和果肉发育过程的表达情况。【结果】从柠檬基因组共鉴定获得6个ClSUS基因家族成员(ClSUS1~ClSUS6)、4个ClSPS基因家族成员(ClSPS1~ClSPS4)和15个ClINV基因家族成员(ClINV1~ClINV15),其中ClSPSs基因编码的氨基酸数量最多,ClSUSs、ClSPSs和ClINVs基因编码的保守基序数量和种类大致相同,ClSUSs基因内含子数目为12~14个,ClSPSs基因的内含子数目为12~13个,ClINVs基因的内含子数量为1~11个。ClSUS基因家族成员和ClINV基因家族成员各分为3个亚家族,ClSPS基因家族分为2个亚家族。ClSUS6、ClINV1和ClINV8蛋白均扩张出新的结构域,依据结构域不同,ClINV蛋白家族成员分为2种不同水解酶类型。ClSUSs、ClSPSs和ClINVs基因启动子区域均含有激素响应、光响应、胁迫响应和生长发育调控元件。共25个基因不均匀地分布在染色体上,出现基因串联和片段复制现象。基于转录组数据分析,发现仅有21个基因表达,其中7个基因在柠檬不同组织中特异性表达。21个基因的相对表达量与葡萄糖、果糖和蔗糖含量呈不同程度相关性,其中有9个基因与柠檬葡萄糖、果糖和蔗糖含量呈明显正相关或负相关。实时荧光定量PCR检测结果显示,ClSUSs、ClSPSs和ClINVs基因整体上在果皮中的表达量均比果肉中的表达量高,在果皮中高表达的基因有ClSUS4、ClSPS2、ClINV14和ClINV1,推测这些基因在柠檬果实可溶性糖积累过程中起重要调控作用。【结论】鉴定出的25个柠檬蔗糖代谢关键酶基因家族成员在理化性质与基因结构方面均存在明显差异,具有明显的组织表达特异性,部分成员如ClSUS4、ClSPS2、ClINV1和ClINV14等是调控柠檬果皮和果肉可溶性糖含量差异的关键基因。

大豆蔗糖合成酶家族成员的全基因组鉴定及表达分析

该研究基于已公布的大豆基因组序列,旨在对大豆蔗糖合成酶(SUS)家族成员进行全基因组鉴定及表达分析,以探讨大豆SUS家族基因的生物学功能,为GmSUS基因的利用及大豆高产育种奠定理论基础。结果表明:(1)在大豆基因组中共鉴定到12个蔗糖合成酶基因(GmSUS1~GmSUS12)。(2)GmSUS蛋白之间序列一致性很高,均具有植物SUS家族蛋白特有的蔗糖合成结构域和糖基转移结构域;除GmSUS5外,其他GmSUS蛋白N端均具有一个保守的丝氨酸(Ser)磷酸化位点。(3)系统进化分析显示,GmSUS蛋白主要聚为3组(SUSⅠ~SUSⅢ),且位于同1组的GmSUS基因大部分具有相似的内含子/外显子分布模式。(4)12个GmSUS基因不均匀地分布在大豆的10条染色体上,片段复制可能导致了GmSUS基因在大豆基因组中的扩增。(5)表达特性分析表明,大豆SUS家族成员具有不同的组织表达模式,GmSUS8在大豆种子中表达量很高,GmSUS1、GmSUS7和GmSUS5在大豆根瘤中表达量很高,GmSUS3、GmSUS11和GmSUS12在所有被检测的组织均具有较高的表达。

玉米蔗糖合成酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析

【目的】蔗糖合成酶(SUS)是植物进行蔗糖代谢的关键酶之一,控制着植物体内糖分的合成和运输,在植物的生长发育和代谢活动中具有重要作用。【方法】本研究利用玉米基因组数据库平台,以生物信息学手段对玉米SUS基因家族进行成员鉴定和分析。【结果】①玉米SUS家族共有5个成员,它们分别分布在第1.4.9号染色体上。氨基酸大小为802~849 aa,除ZmSUS5为弱碱性以外,其余均表现为弱酸性。②基因二级结构分析显示,该家族蛋白主要结构为a-螺旋,大部分为不稳定蛋白,且具有弱疏水性。③亚细胞定位预测结果显示,ZmSUS蛋白均定位在叶绿体。④进化分析显示ZmSUS可分为3个亚家族(SUSⅠ~SUSⅢ),且位于同一组的成员其氨基酸序列一致性以及内含子/外显子分布模式相似度都很高。⑤基因启动子分析分析显示ZmSUS家族蛋白在玉米的生长发育以及逆境胁迫方面都起着重要的作用。⑥组织表达特异性分析发现,ZmSUS1和ZmSUS2在胚和胚乳中大量表达;ZmSUS5在所有被检测的组织中表达量很低;ZmSUS3及ZmSUS4在被检测的组织中均有较高的表达量。【结论】这些结果表明ZmSUS1和ZmSUS2可能参与了种子的发育过程,ZmSUS3、ZmSUS4可能参与玉米生长发育的多个阶段。本研究为后续对玉米SUS家族基因的功能研究以及对蔗糖代谢调控的应用提供了理论参考。

CD基因联合5-Fc治疗人胃癌的实验研究

目的:通过转基因方法观察自杀基因CD对人胃癌细胞株7901的体内外杀伤作用,并观察组织病理变化。方法:应用逆转录病毒方法转导自杀基因CD,通过体外实验观察CD基因对人胃癌7901细胞的杀伤性和旁观者效应;体内实验中首先在BALB/cnu/nu裸鼠建立胃癌模型,然后将病毒上清注入瘤体内,并结合应用前药,观察肿瘤体积变化通过病理切片观察组织病理变化。结果:CD基因在体外即显出明显的杀伤作用(含旁观者效应),20%的转基因细胞可以杀伤70%～80%的肿瘤细胞。在实验动物体内,CD基因结合前药5Fc可显著杀伤肿瘤,而单纯转导CD基因和只应用5Fc并不能起到杀伤作用。结论:自杀基因CD联合前药5Fc对胃癌产生显著杀伤作用,不仅转基因细胞被杀死,而且通过旁观者效应杀伤大量周围细胞。CD/5Fc在体内试验对胃癌有显著杀伤作用。

十二指肠和小肠肿瘤P27mRNA,PTENmRNA表达及意义

研究十二指肠和小肠良恶性肿瘤组织中P2 7mRNA ,PTENmRNA表达及临床病理学意义。方法 :标本经 10 %福尔马林固定 ,常规石蜡包埋后连续切片 ,P2 7mRNA和PTENmRNA染色方法为原位杂交染色法。结果 :4 4例腺癌P2 7mRNA和PTENmRNA阳性率 (5 2 % ,5 7% )明显地低于 10例腺瘤 (90 % ,90 % ) ,P2 7mRNA和PTENmRNA阴性病例均为同 1例腺上皮呈重度不典型增生腺瘤。组织学分级Ⅰ级、癌细胞未侵袭肌层 +浅肌层、肿块最大径≤ 3cm和淋巴结未转移病例P2 7mRNA、PTENmRNA阳性率明显高于组织学分级Ⅲ级、癌细胞侵袭深肌层 +浆膜层、肿块最大径 >3cm和淋巴结转移病例。P2 7mRNA和PTENmRNA在腺癌中表达无明显相互关系。结论 :P2 7mRNA和PTENmRNA表达与十二指肠和小肠癌发生发展、生物学行为、转移发生及预后有密切关系 ,检测十二指肠和小肠良性病变P2 7mRNA或 /和PTENmRNA表达对预防和早期发现恶性肿瘤可能有重要临床应用意义。

绵羊肺腺瘤病毒囊膜基因表面蛋白的表达及其单克隆抗体的制备

在E.coli BL21中诱导表达含有绵羊肺瘤病毒囊膜表面蛋白(SU)重组质粒pGEX-4T-1-SU,表达的GST融合蛋白经纯化后用佐剂乳化,作为抗原免疫BALB/c小鼠,并进行细胞融合、克隆化、ELISA法初步筛选抗SU单抗。最终获得了3株抗SU的单抗,为深入探讨JSRV的分子生物学特性及研制诊断试剂盒打下了基础。

3个外种猪Nramp1基因多态性研究

采用PCR-RFLP方法,对3个外种猪群Nramp1基因第6内含子序列多态性进行了检测。结果表明,在3个外种猪群中均仅检测到AB和BB2种基因型,其中AB基因型为优势基因型,BB基因型为数极少,未检测到AA基因型。卡方检验结果表明,3个外种猪群该位点均处于遗传不平衡状态(P<0.01)。群体中该位点杂合度较高、纯合度较低,具有中度遗传多态性,可在后续的育种方案中实施分化选择和培育,为抗病育种提供遗传素材。

家猪Atrn基因与微卫星标记遗传连锁及对经济性状效应的分析

以杂种近交培育的丹麦资源家系 0～ 5世代中的 174头猪为实验材料 ,以杂交合成的湘黄猪第 9世代的12 9头猪为对照 ,采用PCR RFLP技术 ,检测家猪Atrn基因多态性并分析其对生长和体组成性状的影响。结果表明 :PCR产物经TaqⅠ限制酶消化 ,两猪种均能得到AA、AB、BB 3种基因型 ,基因型频率在猪种间存在极显著差异 (P <0 0 1)。资源家系资料经CRI MAPV2 4软件作连锁分析 ,发现Atrn基因座与 17号染色体SW10 31位点连锁 ,重组率和LOD值分别为 0 2 1和 3 19。应用多变量最小二乘分析模型 ,资源家系的日均屠宰重、背膘厚和湘黄猪的日增重、背膘厚、瘦肉率等性状基因型间均差异显著 (P <0 0 5或P <0 0 1) ,主要为BB基因型个体优于AA和AB基因型个体。由此可见 ,等位基因B对重要经济性状会产生良好效应或选择BB基因型会获得对重要经济性状的良好效应 。

猪CACNA2D1基因定位及与相关遗传图谱的整合分析

【目的】定位猪CACNA2D1基因并分析该基因是否可作为影响猪某些生产性状的候选基因。【方法】扩增并测定猪CACNA2D1基因的部分序列，运用辐射杂种细胞系对其进行定位并将定位结果与相关遗传图谱进行整合分析。【结果】将猪cAcNA2D1基因定位在猪9号染色体79．3～86．7cM的位置上，发现在cACNA2D1基因定位区域有3个分别影响母猪发情期排卵数、胴体肩胛重以及10周龄体重的QTL，在定位区域附近有影响猪屠宰24h后肌肉pH值的QTL。【结论】猪CACNA2D1基因可作为猪繁殖性状、胴体性状、生长性状甚至肉质性状的候选基因进行进一步的研究。

猪细环病毒1b型ORF3基因克隆及序列分析

为明确福建省猪细环病毒(porcine torque teno sus virus,PTTSuV)1b型(PTTSuV-1b)ORF3基因的遗传进化特征,本研究根据GenBank中登录的PTTSuV-1b基因组特征设计特异性引物,对福建省某猪场患有仔猪断奶后多系统衰竭综合征(PMWS)的猪血清进行PTTSuV-1b分段扩增,并分别对PCR扩增产物进行胶回收后克隆测序,将测序结果经BLAST分析后进行序列拼接。试验结果表明,所扩增的目的片段编码有完整的PTTSuV-1bORF3蛋白,全长为600bp,编码有199个氨基酸。将获得的PTTSuV-1b型福建株与GenBank中PTTSuV-1b型的ORF3基因进行比对分析,其与FJ/China/2010/TTV2/2株核苷酸同源性最高,为99.7%,与西班牙PTTSuV-1b分离株TTV2_G43核苷酸同源性为97.3%,与SC株核苷酸同源性稍低,但也达94.0%;而与猪细环病毒K2型德国家猪分离株472142株核苷酸同源性仅为60.7%,与猪细环病毒1a型西班牙分离株PTTV1_1914株核苷酸同源性仅为46.8%。从遗传进化关系上看,PTTSuV-1bORF3基因在遗传进化上呈2个大的遗传进化分支(分支Ⅰ和分支Ⅱ),本研究分离株处于分支Ⅰ。