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Identification of a toxin coding fragment in pBSSB1, a linear plasmid from Salmonella enterica serovar Typhi that can stabilize a multicopy plasmid
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作者 Sunjukta Ahsan David Summers 《Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine》 SCIE CAS 2018年第7期365-370,共6页
Objective: To identify the region conferring stability to pBSSB2(a linear plasmid, pBSSB1, containing a kanamycin cassette), which is unique to Indonesian isolates of Salmonella enterica serovar Typhi. Methods: The op... Objective: To identify the region conferring stability to pBSSB2(a linear plasmid, pBSSB1, containing a kanamycin cassette), which is unique to Indonesian isolates of Salmonella enterica serovar Typhi. Methods: The open reading frame(ORF) 009 was identified as a toxin coding gene in the plasmid through introduction of translational termination codons in the ORF. Results: The stability function was located in a fragment that spanned nucleotides 5 766 to 6 828 in the linear plasmid genetic map. Ectopic expression of ORF009 in pBAD18 vector indicated ORF009 codes for a toxin. This fragment could stabilize plasmid pUC18 previously destabilized through mutation of the pcnB(plasmid copy number control) gene that codes for polyA polymerase. Majority of the cells expressing ORF009 were non-viable according to phase contrast microscopy. Conclusions: This study demonstrated that a linear plasmid fragment that carries a gene encoding a toxin possibly conferred stability to the parent plasmid. It was able to stabilize a multicopy plasmid of Escherichia coli. 展开更多
关键词 Linear plasmid pBSSB2 salmonella enterica serovar typhi
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Induction of deletion mutation on ompR gene of Salmonella enterica serovar Typhi isolates from asymptomatic typhoid carriers to evolve attenuated strains for vaccine development 被引量:2
2
作者 Senthilkumar B Anbarasu K +1 位作者 Senbagam D Rajasekarapandian M 《Asian Pacific Journal of Tropical Medicine》 SCIE CAS 2014年第12期933-939,共7页
Objective:To develop allenualed slrains of Salmonella enterica serorar Typhi(S.typhi) for the candidate vaccine by osmolar stress.Mothods:S.typhi SS3 and SS5 strains were isolated from asymptomatic typhoid carriers in... Objective:To develop allenualed slrains of Salmonella enterica serorar Typhi(S.typhi) for the candidate vaccine by osmolar stress.Mothods:S.typhi SS3 and SS5 strains were isolated from asymptomatic typhoid carriers in Mamakkal,Tamil Nadu.India.Both strains were grown in LB(Luria Bertani) medium supplemented with various concentration of NaCl(0.1- 0.7M) respectively.The effecl of osmolar stress was determined at molecular level by PCR using MCR 06 and MCR07 primers corresponding to ompR with chromosomal DNA of S.typhi SS3 and SS5 strains.Attenuation by osmolar stress results in deletion mutation of the.S.typhi slrains was determined by agglutination assays,precipitation method.SDS PAGE analysis and by animal models.Results:The 799 bp amplified ompR gene product from wild type S.typhi SS3 and SS5 illustrate the presence of virulent gene.Interestingly,there was only a 282 bp amplified product from S.typhi SS3 and SS5 grown in the presence of 0.5.0.6 and 0.7 M NaCl.This illustrates the occurrence of deletion mutation in ompR gene al high concentration of NaCl.Furthermore,both the wildtype and mutant S.typhi outer membrane SDS-PAGF.profile reveals the differences in the expression of ompF.ompC and ompA proteins.In mice,wild type and mutant strains lethal dose(LD_(50)) were determined.The mice died within 72 h when both the wild type strains were injected intraperitoneally with 3 log CFU-mL^(-1).When the mice were injected with the mutants in same dosage,no clinical symptoms were observed;whereas the serum antibodv litre was elicited within two weeks indicated that the mutants have the ability to induce protective humoral immune response.These results suggest that S.typhi SS3 and SS5 may bo used as good candidate strains for the development of live attenuated vaccine against salmonellosis.Conclusions:This study demonstrates that the S.typhi strains were allenualed and could be good vaccine candidates in future. 展开更多
关键词 ATTENUATED live vaccine salmonella enterica serovar typhi Mutants
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Enhancing chloramphenicol and trimethoprim in vitro activity by Ocimum sanctum Linn.(Lamiaceae) leaf extract against Salmonella enterica serovar Typhi
3
作者 Shyamapada Mandal Manisha Deb Mandal Nishith Kumar Pal 《Asian Pacific Journal of Tropical Medicine》 SCIE CAS 2012年第3期220-224,共5页
Objective:To evaluate the antibacterial activity of Ocimum sanctum(O.sanctum) leaf extract, alone,and in combination with chloramphenicol(C) and trimethoprim(Tm) against Salmonella enterica serovar Typhi(S.typhi).Meth... Objective:To evaluate the antibacterial activity of Ocimum sanctum(O.sanctum) leaf extract, alone,and in combination with chloramphenicol(C) and trimethoprim(Tm) against Salmonella enterica serovar Typhi(S.typhi).Methods:The antibacterial activity of ethanolic extract of tulsi, 0.sanctum,leaf(TLE:500μg) for 23 S.typhi isolates was determined following agar diffusion. The C(30μg) and Tm(5μg) activity alone and in combination with TLE(250μg) was determined by disk diffusion.The zone diameter of inhibition(ZDI) for the agents was recorded, and growth inhibitory indices(Glls) were calculated.Results:The S.typhi isolates(n=23),which were resistant to both C(ZDI 6 mm) and Tm(ZDI 6 mm),had TLE(500μg) ZDIs 16-24 mm.The ZDIs of C and Tm were increased up to 15-21 mm and 17-23 mm,respectively,when TLE(250μg) was added to the C and Tm discs.The Glls ranged 0.789-1.235 and 0.894-1.352,due to combined activity against S.typhi isolates,of C and TLE and Tm and TLE.respeclivelv.Conclusions:The data suggest that TLE,in combination with C and Tm,had synergistic activity for S.typhi isolates, and hence O.sanclum is potential in combating S.typhi drug resistance,as well promising in the development of non-antibiotic drug for S.typhi infection. 展开更多
关键词 Antibacterial activity OCIMUM sanctum CHLORAMPHENICOL TRIMETHOPRIM Growth inhibitory index Synergy salmonella enterica serovar typhi
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Identification of in vivo induced protein antigens of Salmonella enterica serovar Typhi during human infection 被引量:9
4
作者 HU Yong1,2, CONG YanGuang1, LI Shu1, RAO XianCai1, WANG Gang3 & HU FuQuan1 1 Department of Microbiology, Third Military Medical University, Chongqing 400038, China 2 Department of Biotechnology, Chongqing University of Technology, Chongqing 400050, China 3 Department of Clinical Laboratory, The 3rd Hospital of People’s Liberation Army, Baoji 721004, China 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2009年第10期942-948,共7页
During infectious disease episodes, pathogens express distinct subsets of virulence factors which allow them to adapt to different environments. Hence, genes that are expressed or upregulated in vivo are implicated in... During infectious disease episodes, pathogens express distinct subsets of virulence factors which allow them to adapt to different environments. Hence, genes that are expressed or upregulated in vivo are implicated in pathogenesis. We used in vivo induced antigen technology (IVIAT) to identify antigens which are expressed during infection with Salmonella enterica serovar Typhi. We identified 7 in vivo induced (IVI) antigens, which included BcfD (a fimbrial structural subunit), GrxC (a glutaredoxin 3), SapB (an ABC-type transport system), T3663 (an ABC-type uncharacterized transport system), T3816 (a putative rhodanese-related sulfurtransferase), T1497 (a probable TonB-dependent receptor) and T3689 (unknown function). Of the 7 identified antigens, 5 antigens had no cross-immunoreactivity in adsorbed control sera from healthy subjects. These 5 included BcfD, GrxC, SapB, T3663 and T3689. Antigens identified in this study are potential targets for drug and vaccine development and may be utilized as diagnostic agents. 展开更多
关键词 salmonella enterica serovar typhi in vivo INDUCED ANTIGEN technology (IVIAT) VIRULENCE
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伤寒沙门菌外膜囊泡通过调控铁死亡抑制结直肠癌细胞的增殖及机制初探
5
作者 戈艺潼 吉滢 +3 位作者 曾敏敏 郑学明 黄新祥 张盈 《华中师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期214-223,共10页
近年来,细菌外膜囊泡(OMVs)在抗肿瘤治疗中展现出的巨大潜力引起了广泛的关注.为探究伤寒沙门菌外膜囊泡(S.Typhi-OMVs)对人结直肠癌细胞株HT-29增殖的影响及可能的作用机制,通过超速离心法提取不同细菌的OMVs,细胞增殖实验(CCK-8)检测... 近年来,细菌外膜囊泡(OMVs)在抗肿瘤治疗中展现出的巨大潜力引起了广泛的关注.为探究伤寒沙门菌外膜囊泡(S.Typhi-OMVs)对人结直肠癌细胞株HT-29增殖的影响及可能的作用机制,通过超速离心法提取不同细菌的OMVs,细胞增殖实验(CCK-8)检测各细菌OMVs对细胞活力的影响;转录组测序(RNA-seq)分析处理后细胞基因表达水平的变化;试剂盒检测铁死亡相关标志物的含量变化;实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和蛋白质免疫印迹法(western blot)分别检测相关基因mRNA和蛋白质的表达变化.结果显示,在提取的6种细菌OMVs中,S.Typhi-OMVs对HT-29细胞的增殖产生了最明显的抑制作用,并且呈现出浓度和时间梯度依赖性;RNA-seq显示HT-29细胞可能发生了铁死亡;S.Typhi-OMVs作用后,细胞内发生了铁沉积,氧化产物增多,抗氧化剂减少,符合铁死亡生化特征;SAT1是S.Typhi-OMVs处理后HT-29胞内mRNA表达量变化最大的基因;p53-SAT1-ALOX15是铁死亡的信号通路之一,S.Typhi-OMVs处理后胞内p53、SAT1、ALOX15的mRNA与蛋白表达均增高.以上结果表明,S.Typhi-OMVs能够抑制结直肠癌细胞HT-29的增殖,其机制可能与通过p53-SAT1-ALOX15信号通路诱导HT-29发生铁死亡有关. 展开更多
关键词 铁死亡 外膜囊泡 伤寒沙门菌 结直肠癌 细胞增殖
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伤寒沙门菌基因组DNA芯片的制备与基因表达谱分析应用 被引量:14
6
作者 生秀梅 黄新祥 +5 位作者 茅凌翔 朱超望 徐顺高 张海方 许化溪 刘秀梅 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第2期206-212,共7页
伤寒沙门菌是一种具有鞭毛的革兰阴性人类肠道致病菌,也是一种重要的原核生物研究用模式菌.基因组芯片能够系统、全面且高效地观察生物的基因表达及进行基因组结构比较.利用伤寒沙门菌现有的全基因组序列,以Ty2菌株的基因组为基准,选取C... 伤寒沙门菌是一种具有鞭毛的革兰阴性人类肠道致病菌,也是一种重要的原核生物研究用模式菌.基因组芯片能够系统、全面且高效地观察生物的基因表达及进行基因组结构比较.利用伤寒沙门菌现有的全基因组序列,以Ty2菌株的基因组为基准,选取CT18菌株和z66阳性菌株的特异性蛋白编码基因,设计特异性引物,经PCR有效扩增出4201个基因,产物纯化后点样于多聚赖氨酸玻片制备伤寒沙门菌基因组DNA芯片,并验证了芯片样点位次与效果.通过对基因表达谱分析的各种条件进行优化,建立相应的表达谱分析方法,并用于比较伤寒沙门菌野生株在高渗、低渗条件下的基因表达差异,结果与以前的报道基本一致.结果表明,成功建立了伤寒沙门菌基因组DNA芯片及表达谱分析方法,可为有关伤寒沙门菌基因表达调控及致病性机理、进化和基因多样性等方面的深入研究提供有效的技术支持. 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 基因组DNA芯片 基因表达谱
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伤寒沙门菌phoP基因缺陷变异株的制备 被引量:15
7
作者 茅凌翔 朱超望 +1 位作者 许化溪 黄新祥 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2007年第2期145-149,共5页
目的:为深入研究伤寒沙门菌调节因子phoP的功能,制备伤寒沙门菌phoP基因缺陷变异株。方法:根据伤寒沙门菌phoP基因序列,设计PCR特异性引物,并在5′末端加接酶BglII位点,PCR扩增phoP基因上、下游片段后,用BglII消化,再定向连接成phoP基... 目的:为深入研究伤寒沙门菌调节因子phoP的功能,制备伤寒沙门菌phoP基因缺陷变异株。方法:根据伤寒沙门菌phoP基因序列,设计PCR特异性引物,并在5′末端加接酶BglII位点,PCR扩增phoP基因上、下游片段后,用BglII消化,再定向连接成phoP基因的缺损性同源性核苷酸片段。将此片段胶回收后并导入自杀质粒pG-MB151的BamHI位点,将阳性质粒用电转化导入伤寒沙门菌野生株,进行同源重组。用PCR观察重组现象,将完全重组的菌株作为phoP基因的缺陷变异株,并通过相应的核苷酸序列分析加以确定。结果:PCR及序列分析证实,缺陷变异株的phoP基因缺失297个碱基。结论:成功构建伤寒沙门菌phoP基因缺陷变异株,为进一步研究其在伤寒沙门菌中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 PHOP 基因缺陷变异 同源重组
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LuxS/AI-2对伤寒沙门菌基因表达的调节 被引量:3
8
作者 罗哲 王敏 +5 位作者 杜鸿 王菲 孟彦辰 倪斌 徐顺高 黄新祥 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2011年第1期34-41,共8页
目的:探讨伤寒沙门菌luxS基因在葡萄糖存在下对细菌对数生长中期基因表达调控的影响。方法:应用自杀质粒介导的同源重组方法制备伤寒沙门菌luxS基因缺陷变异株;比较野生株与缺陷株的生长情况及动力差异;用哈氏弧菌BB170作为报告菌株检... 目的:探讨伤寒沙门菌luxS基因在葡萄糖存在下对细菌对数生长中期基因表达调控的影响。方法:应用自杀质粒介导的同源重组方法制备伤寒沙门菌luxS基因缺陷变异株;比较野生株与缺陷株的生长情况及动力差异;用哈氏弧菌BB170作为报告菌株检测不同时期野生株与缺陷株的生物发光;利用伤寒沙门菌全基因组芯片技术,比较在葡萄糖存在下伤寒沙门菌野生株和luxS基因缺陷变异株的对数生长中期基因表达谱差异,并选择部分差异表达基因进行实时定量PCR验证。结果:经PCR及序列分析证实,伤寒沙门菌luxS基因缺陷变异株制备成功;在葡萄糖存在下野生株发光均比无葡萄糖时强,在对数生长中期时AI-2产生的荧光最强,而luxS缺陷株不发光;luxS不影响细菌生长但影响细菌的动力;基因表达谱比较分析结果表明,与野生株相比,luxS缺陷株有47个基因表达上调,27个基因表达下调;实时定量PCR结果与芯片分析一致。结论:伤寒沙门菌中luxS基因能参与信号分子AI-2的合成,且LuxS/AI-2在细菌对数生长中期的基因表达调控中发挥重要作用。 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 LUXS 群体感应 生物发光 基因芯片
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OsmY缺失对伤寒沙门菌在高渗应激早期基因表达的影响 被引量:3
9
作者 孟彦辰 王菲 +5 位作者 杜鸿 翁晓琴 张海方 生秀梅 徐顺高 黄新祥 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2012年第4期286-290,294,共6页
目的:研究伤寒沙门菌OsmY在高渗应激早期对其他基因表达的调节。方法:通过同源重组的方法利用自杀质粒制备伤寒沙门菌osmY基因缺陷变异株;采用伤寒沙门菌全基因组芯片比较野生株和osmY基因缺陷变异株在高渗应激早期的基因表达差异,并对... 目的:研究伤寒沙门菌OsmY在高渗应激早期对其他基因表达的调节。方法:通过同源重组的方法利用自杀质粒制备伤寒沙门菌osmY基因缺陷变异株;采用伤寒沙门菌全基因组芯片比较野生株和osmY基因缺陷变异株在高渗应激早期的基因表达差异,并对其中部分表达差异基因进行实时定量PCR验证。结果:成功制备伤寒沙门菌osmY基因缺陷变异株;基因芯片结果显示,在高渗应激早期,与野生株相比,伤寒沙门菌osmY基因缺陷变异株有128个基因表达下调,有27个基因表达上调。实时定量PCR与芯片结果一致。结论:OsmY可作为一调节因子在伤寒沙门菌高渗应激早期对基因表达起重要调节作用。 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 OsmY 高渗应激 基因芯片
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伤寒沙门菌fljA样基因缺陷变异株的制备 被引量:2
10
作者 徐顺高 马洁 +2 位作者 周丽萍 张驰宇 黄新祥 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2005年第3期205-208,共4页
目的:为探讨z66鞭毛抗原阳性伤寒沙门菌的fljA样基因的功能,制备沙门菌fljA样基因缺陷变异株。方法:根据伤寒沙门菌fljA样基因序列,设计PCR特异性引物并在5'末端加接酶BglII位点,扩增fljA样基因上、下游片段,用BglII消化后,定向连接... 目的:为探讨z66鞭毛抗原阳性伤寒沙门菌的fljA样基因的功能,制备沙门菌fljA样基因缺陷变异株。方法:根据伤寒沙门菌fljA样基因序列,设计PCR特异性引物并在5'末端加接酶BglII位点,扩增fljA样基因上、下游片段,用BglII消化后,定向连接成fljA样基因的缺损性同源性核苷酸片段,先克隆至pGEM T质粒,再经BamHI酶切后导入自杀质粒pGMB151,电转化入伤寒沙门菌(GIFU10007),进行同源重组。用PCR观察重组现象,将完全重组的菌株作为fljA样基因的缺陷变异株,并通过相应的核苷酸序列分析加以确定。结果:PCR及序列分析证实,缺陷变异株的fljA样基因缺失231个碱基。结论:成功构建伤寒沙门菌fljA样基因缺陷变异株,为进一步研究其在伤寒沙门菌鞭毛抗原表达的调控作用奠定了基础。 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 基因缺陷变异 fljA 同源重组
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鼠伤寒沙门菌spvC基因缺陷变异株的制备 被引量:2
11
作者 陈强 吴春雪 +3 位作者 余晓君 李红 朱春晖 刘晓艳 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2014年第3期235-239,共5页
目的:为进一步研究鼠伤寒沙门菌毒力基因spvC的功能,制备鼠伤寒沙门菌spvC基因缺陷变异株。方法:根据鼠伤寒沙门菌spvC基因序列,设计PCR特异性引物,制备spvC基因缺陷性同源性核苷酸片段,导入自杀质粒pCVD442后再导入鼠伤寒沙门菌野生株... 目的:为进一步研究鼠伤寒沙门菌毒力基因spvC的功能,制备鼠伤寒沙门菌spvC基因缺陷变异株。方法:根据鼠伤寒沙门菌spvC基因序列,设计PCR特异性引物,制备spvC基因缺陷性同源性核苷酸片段,导入自杀质粒pCVD442后再导入鼠伤寒沙门菌野生株,进行同源重组,用PCR观察重组现象,将完全重组的菌株作为spvC基因的缺陷变异株,并通过核苷酸序列分析加以确定。结果:PCR及序列分析证实,缺陷变异株的spvC基因缺失711个碱基。结论:成功构建鼠伤寒沙门菌spvC基因缺陷变异株,为进一步研究其在鼠伤寒沙门菌中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 鼠伤寒沙门菌 SPVC 基因缺陷变异 同源重组
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mig-14对伤寒沙门菌在高渗应激早期基因表达的调节 被引量:2
12
作者 夏秋风 邹昕 +2 位作者 杜鸿 高宇琳 黄新祥 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2009年第3期192-196,共5页
目的:探查伤寒沙门菌mig-14在高渗应激下对若干基因表达的调节作用。方法:用自杀质粒介导的同源重组方法制备伤寒沙门菌mig-14基因缺陷变异株,用基因芯片分析高渗应激早期野生株和mig-14缺陷株基因表达差异,并对部分结果采用实时荧光定... 目的:探查伤寒沙门菌mig-14在高渗应激下对若干基因表达的调节作用。方法:用自杀质粒介导的同源重组方法制备伤寒沙门菌mig-14基因缺陷变异株,用基因芯片分析高渗应激早期野生株和mig-14缺陷株基因表达差异,并对部分结果采用实时荧光定量PCR进行验证。结果:成功制备伤寒沙门菌mig-14缺陷株,高渗应激早期mig-14变异株与野生株相比有77个基因表达下调和72个基因表达上调。结论:mig-14可能是一种调节基因,主要参与调节细菌的物质和能量代谢。 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 mig-14 高渗应激 基因芯片分析
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伤寒沙门菌sRNA S2959增强细菌动力和生物膜形成能力 被引量:4
13
作者 陆仁飞 孙嘉瑶 黄新祥 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2018年第10期774-778,共5页
目的研究伤寒沙门菌小RNA(sRNA) S2959对细菌动力以及生物膜形成能力的影响。方法利用Red重组系统制备伤寒沙门菌sRNA S2959缺陷株(△S2959),同时制备sRNA S2959缺陷株的空载体株(△S2959-pBAD)和回补株(△S2959-p S2959)等相关菌株。通... 目的研究伤寒沙门菌小RNA(sRNA) S2959对细菌动力以及生物膜形成能力的影响。方法利用Red重组系统制备伤寒沙门菌sRNA S2959缺陷株(△S2959),同时制备sRNA S2959缺陷株的空载体株(△S2959-pBAD)和回补株(△S2959-p S2959)等相关菌株。通过sRNA S2959缺陷株和野生株的生长曲线实验观察sRNA S2959缺失后对细菌生长的影响;通过细菌sRNA S2959缺陷株、空载体株、回补株的泳动能力实验和生物膜实验观察sRNA S2959对细菌动力以及生物膜形成能力的影响;再用定量PCR(q PCR)方法检测细菌鞭毛相关基因在sRNA S2959相关菌株中的表达水平。结果成功制备sRNA S2959缺陷株和回补株; sRNA S2959缺陷株和野生株在LB和TSB液体培养基中的生长曲线无明显差异;与野生株相比,sRNA S2959缺陷株的泳动能力和生物膜形成能力下调(P<0.05),而回补株的泳动能力和生物膜形成能力较缺陷株显著增加(P<0.05); q PCR结果显示,高表达sRNA S2959后,细菌鞭毛相关基因(flh D、fli A和flj B)的mRNA水平分别上调大约4、3和6倍。结论伤寒沙门菌sRNA S2959促进鞭毛的表达,进一步上调伤寒沙门菌动力以及生物膜的形成能力。 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 SRNA 动力 生物膜
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荧光实时定量RT-PCR观察伤寒杆菌鞭毛z66和d/j抗原基因表达方法的建立 被引量:3
14
作者 徐顺高 黄新祥 周丽萍 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2005年第1期21-24,共4页
目的:构建荧光实时定量RT-PCR测定伤寒杆菌鞭毛抗原z66和d/j编码基因mRNA的方法。方法:根据伤寒杆菌鞭毛抗原z66和d/j编码基因序列,设计引物扩增其读码框架内片段,克隆进pGEM-TEasy质粒。质粒经PCR鉴定后,纯化并定量,作为荧光实时定量PC... 目的:构建荧光实时定量RT-PCR测定伤寒杆菌鞭毛抗原z66和d/j编码基因mRNA的方法。方法:根据伤寒杆菌鞭毛抗原z66和d/j编码基因序列,设计引物扩增其读码框架内片段,克隆进pGEM-TEasy质粒。质粒经PCR鉴定后,纯化并定量,作为荧光实时定量PCR的标准品,并制作标准曲线。利用不同渗透压下的鞭毛素基因表达差异,比较三种随机引物(6、8、10核苷酸)与特异性引物的逆转录效果,以确定一种最佳的随机引物用于多基因表达观察。结果:标准曲线有较好的线性(r=0.999),cDNA和标准品的PCR产物溶解曲线峰值一致。用8核苷酸随机引物进行逆转录的敏感度高于6、10核苷酸随机引物,低于特异性引物,但用其观测z66抗原基因和d/j抗原基因在高、低渗时表达变化趋势与用特异性引物测得结果一致。结论:成功构建用8核苷酸随机引物进行逆转录同时测定伤寒杆菌鞭毛抗原z66和d/j基因表达的荧光实时定量RT-PCR方法。 展开更多
关键词 实时荧光定量RT-PCR 伤寒杆菌 随机引物
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鼠伤寒沙门菌spvB基因缺陷变异株的制备及其抗酸能力检测 被引量:1
15
作者 吴春雪 陈强 +5 位作者 李红 余晓君 朱春晖 李岚 何美娟 刘晓艳 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期399-404,共6页
目的为深入研究鼠伤寒沙门菌毒力基因spvB的功能,制备鼠伤寒沙门菌spvB基因完全缺陷变异株,观察spvB基因缺陷株在体外酸性环境中的生存能力。方法根据鼠伤寒沙门菌spvB基因序列,设计PCR特异性引物,制备spvB基因缺陷性同源性核苷酸片段,... 目的为深入研究鼠伤寒沙门菌毒力基因spvB的功能,制备鼠伤寒沙门菌spvB基因完全缺陷变异株,观察spvB基因缺陷株在体外酸性环境中的生存能力。方法根据鼠伤寒沙门菌spvB基因序列,设计PCR特异性引物,制备spvB基因缺陷性同源性核苷酸片段,导入自杀质粒pCVD442后再导入鼠伤寒沙门菌野生株,进行同源重组,用PCR方法观察重组现象,将完全重组的菌株作为spvB基因的缺陷变异株,并通过核苷酸序列分析加以确定。绘制生长曲线,对比spvB基因缺陷变异株与野生株在酸性条件下的生存情况。结果 PCR及序列分析证实,缺陷变异株的spvB基因缺失1 749bp。酸性条件下培养1h及2h后,野生株的活菌数高于spvB基因缺陷株,差异有统计学意义(P<0.05);且野生株在酸性环境中的生存率明显高于缺陷株,野生株在1h及2h后的生存率分别为85.6%、74.9%,缺失株分别为68.0%、42.3%。结论成功构建鼠伤寒沙门菌spvB基因缺陷变异株,并发现在酸性条件下其生存能力明显降低,为进一步研究其在鼠伤寒沙门菌中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 鼠伤寒沙门菌 spvB 基因缺陷变异 同源重组 生长曲线
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伤寒沙门菌fljA样基因表达载体的构建 被引量:1
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作者 周丽萍 邹昕 +3 位作者 张伟利 徐顺高 许化溪 黄新祥 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2006年第6期461-464,468,共5页
目的:进一步明确二相伤寒沙门菌鞭毛抗原表达调节机制,系统分析伤寒沙门菌fljA样基因功能,构建含fljA样基因的表达载体并验证其表达。方法:根据fljA样基因两端序列设计引物,以z66抗原阳性伤寒沙门菌G IFU10007基因组为模板,通过PCR获得... 目的:进一步明确二相伤寒沙门菌鞭毛抗原表达调节机制,系统分析伤寒沙门菌fljA样基因功能,构建含fljA样基因的表达载体并验证其表达。方法:根据fljA样基因两端序列设计引物,以z66抗原阳性伤寒沙门菌G IFU10007基因组为模板,通过PCR获得该基因,与表达载体pET22b连接后,重组体转化至大肠杆菌JM109中诱导培养,并通过RT-PCR观察fljA样基因表达情况。结果:基因克隆和序列分析结果显示伤寒沙门菌fljA样基因被成功导入载体pET22b,RT-PCR结果提示大肠杆菌JM109可利用此重组载体进行fljA样基因表达。结论:成功获得能在大肠埃希菌中表达伤寒沙门菌fljA样基因的载体。 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 fljA样基因 基因表达
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伤寒沙门菌fljB∶∶lacZ变异株的制备 被引量:1
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作者 朱超望 茅凌翔 +1 位作者 徐顺高 黄新祥 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2008年第2期93-96,共4页
目的:为研究伤寒沙门菌z66鞭毛抗原编码基因fljB的表达调节机制,建立该fljB基因的β-半乳糖苷酶基因(lacZ)插入变异株。方法:采用自杀质粒介导的同源重组方法进行制备。设计加接KpnⅠ和SalⅠ的特异性引物,用PCR扩增获得fljB基因的上、... 目的:为研究伤寒沙门菌z66鞭毛抗原编码基因fljB的表达调节机制,建立该fljB基因的β-半乳糖苷酶基因(lacZ)插入变异株。方法:采用自杀质粒介导的同源重组方法进行制备。设计加接KpnⅠ和SalⅠ的特异性引物,用PCR扩增获得fljB基因的上、下游同源性DNA片段,并与用KpnⅠ和SalⅠ酶切pSV-β-半乳糖苷酶载体(pSV-β-galactosidase vector)的片段定向连接,将连接片段克隆至自杀质粒pGMB151,再通过电击法将重组质粒转入伤寒沙门菌,在含X-Gal的蔗糖平板上筛选获得同源重组的变异株。结果:经筛选获得阳性克隆,经PCR及序列分析证实,fljB基因中的763 bp被3550 bp的lacZ片段替代。结论:成功构建伤寒沙门菌flj∶∶lacZ突变株,为进一步研究fljB基因表达调节机制奠定了基础。 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 舻基因 Β-半乳糖苷酶基因 基因融合
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伤寒沙门菌核糖核酸酶G对胞内非编码RNA T3956水平的影响 被引量:1
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作者 王菲 孟彦辰 +5 位作者 詹莉芳 张晓磊 张海方 生秀梅 徐顺高 黄新祥 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2012年第2期114-119,共6页
目的:研究伤寒沙门菌核糖核酸酶G(RNase G)对非编码RNA(ncRNA)T3956胞内水平的影响。方法:利用自杀质粒介导的同源重组方法制备伤寒沙门菌RNase G基因(rng)缺陷变异株;利用重组质粒pBAD将rng导入rng缺陷变异株,构建rng缺陷回补株;通过... 目的:研究伤寒沙门菌核糖核酸酶G(RNase G)对非编码RNA(ncRNA)T3956胞内水平的影响。方法:利用自杀质粒介导的同源重组方法制备伤寒沙门菌RNase G基因(rng)缺陷变异株;利用重组质粒pBAD将rng导入rng缺陷变异株,构建rng缺陷回补株;通过实时定量PCR分别比较伤寒沙门菌野生株、rng缺陷变异株、回补株等在不同生长时期的ncRNA T3956水平。结果:成功制备伤寒沙门菌rng缺陷变异株、rng缺陷回补株和空质粒对照株;实时定量PCR结果表明,rng缺陷株中T3956的胞内水平较野生株有所升高,并且在对数中期和稳态期升高得更加明显,而回补株胞内T3956的水平又得到恢复。结论:伤寒沙门菌RNase G能够参与对胞内ncRNA T3956水平的调控,并且在细菌对数生长中期和稳态期作用更为明显。 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 核糖核酸酶G 非编码RNA
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伤寒沙门菌不同生长期和不同应激下非编码RNA ArpH的表达 被引量:1
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作者 熊昌艳 李雪娇 黄新祥 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2020年第1期58-62,共5页
目的:探讨伤寒沙门菌(Salmonella enterica serovar Typhi,S.Typhi)在不同生长时期和不同应激条件下非编码RNA ArpH的表达水平,以及双组分调节系统和氧应激调节因子对ArpH的调控作用。方法:利用RNA印迹、qRT-PCR分析伤寒沙门菌在不同生... 目的:探讨伤寒沙门菌(Salmonella enterica serovar Typhi,S.Typhi)在不同生长时期和不同应激条件下非编码RNA ArpH的表达水平,以及双组分调节系统和氧应激调节因子对ArpH的调控作用。方法:利用RNA印迹、qRT-PCR分析伤寒沙门菌在不同生长期ArpH的表达;利用qRT-PCR分析伤寒沙门菌在酸、氧、高渗和热等不同应激环境下ArpH的表达;利用qRT-PCR分析伤寒沙门菌双组分调节系统基因(ompR、rcsB)和氧应激调节因子基因(oxyR)对ArpH表达的影响。结果:ArpH在伤寒沙门菌的对数晚期表达量最高,在从对数早期开始到达稳态期的转变中,其表达量逐渐增加,而进入稳态期后明显回落;ArpH表达水平在酸应激下明显下降,氧应激下明显增高,而高渗应激和42℃热应激下ArpH的表达无显著变化;当ompR、rcsB和oxyR基因缺失时,ArpH表达量均明显下降。结论:ArpH参与伤寒沙门菌对酸、氧应激的调节;伤寒沙门菌双组分调节系统OmpR、RcsB和氧应激调节因子OxyR对ArpH均有正向调控作用。 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 非编码RNA 环境应激 双组分调节系统 氧应激调节因子
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OmpR与PhoP高渗应激下交叉调节伤寒沙门菌基因表达
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作者 生秀梅 徐顺高 +2 位作者 张海方 许化溪 黄新祥 《华中师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期633-638,共6页
为了探寻OmpR和PhoP之间的交叉调节关系,构建了ompR-phoP双缺陷变异株,运用基因芯片分析技术比较了伤寒沙门菌ompR缺陷株、phoP缺陷株及ompR-phoP双缺陷株之间基因表达谱的差异.结果显示OmpR与PhoP共同激活11个基因的转录,主要为外膜孔... 为了探寻OmpR和PhoP之间的交叉调节关系,构建了ompR-phoP双缺陷变异株,运用基因芯片分析技术比较了伤寒沙门菌ompR缺陷株、phoP缺陷株及ompR-phoP双缺陷株之间基因表达谱的差异.结果显示OmpR与PhoP共同激活11个基因的转录,主要为外膜孔蛋白相关基因、脂多糖修饰相关基因等,两者在调节特定的膜蛋白、孔蛋白及表面结构成分的表达水平方面发挥着协同作用,OmpR与PhoP对未知功能蛋白基因t0563、t0564也具有协同激活效应,值得进一步关注.OmpR与PhoP共同抑制nanT的转录,阻止唾液酸的转运.另外,ompR缺陷株和phoP缺陷株中未见变化,而ompR-phoP双缺陷变异株中差异表达基因也可能是OmpR和PhoP的共同调节元,但需要进一步验证. 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 OMPR PHOP 基因表达调节
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