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题名甘蔗细胞色素P450还原酶基因的电子克隆与分析
被引量:1
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作者
苏炜华
张玉叶
黄宁
肖新换
黄珑
罗俊
阙友雄
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机构
福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗产业技术研发中心
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出处
《生物信息学》
2014年第2期99-105,共7页
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基金
国家自然科学基金(31340060)
农业部948项目(2014-S18)
+1 种基金
教育部博士点基金(20103515120006)
福建农林大学杰出青年基金(xjq201202)资助
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文摘
旨在为甘蔗细胞色素P450还原酶基因的实验克隆、功能鉴定及其应用提供参考。本研究以甘蔗类似细胞色素P450还原酶基因的EST序列CF576130.1为探针,在甘蔗EST数据库中进行检索,并基于电子克隆技术获得了甘蔗细胞色素P450还原酶基因(Cytochrome P450 reductase)的一条cDNA全长序列,命名为ScCYP450。采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、亚细胞定位、跨膜结构域、疏水性/亲水性、高级结构及功能域等方面进行预测和分析。结果表明该基因全长1 821 bp,包含一个744 bp的开放阅读框,编码247个氨基酸,该基因编码蛋白定位于细胞内质网(膜),为可溶性碱性蛋白,不存在信号肽,二级结构原件多为无规卷曲,含有多个保守功能域,主要功能为辅酶因子生物合成和翻译功能。
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关键词
甘蔗
sccyp450基因
电子克隆
生物信息学
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Keywords
Sugarcane
sccyp450 gene
In silico cloning
Bioinformatics
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分类号
TS242.1
[轻工技术与工程—制糖工程]
Q753
[生物学—分子生物学]
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