甘蔗花穗ScRS31基因的克隆与初步表达分析

应用RT-PCR法从甘蔗(Saccharum L.)花穗中克隆了1个丝氨酸精氨酸丰富蛋白(Serine/Arginine-rich proteins,SR proteins)家族基因ScRS31,属于RS亚家族成员。该序列全长1 120 bp,包含编码285个氨基酸的完整开放读码框,具有典型的RS亚家族结构特征。生物信息学分析显示,ScRS31编码蛋白是一个不稳定蛋白,表现亲水性;含有41个潜在丝氨酸磷酸化位点,推测通过磷酸化和去磷酸化实现功能调控;与高粱、玉米中的SR蛋白氨基酸序列的同源性最高,分别为97.5%、96.1%。实时荧光定量分析发现,ScRS31在根、花和芽中的表达量远高于其它组织中该基因的表达量。