miRNA-5582在卵巢癌组织中的表达及对卵巢癌细胞增殖和侵袭的影响

目的观察微小RNA(miRNA)-5582对卵巢癌SK-OV-3细胞增殖和侵袭的影响并探讨其可能的机制。方法采用加利福尼亚大学圣克鲁兹分校(UCSC)数据库分析miRNA-5582在卵巢癌组织中的表达及其与卵巢癌患者临床分期的关系。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测卵巢癌细胞株A2780、HO-8910、OC3、SK-OV-3和正常卵巢上皮细胞株IOSE80中miRNA-5582的表达,miRNA-5582表达最低的SK-OV-3细胞株分为对照组和miRNA-5582组,分别转染miR-NC模拟物和miRNA-5582模拟物。MTS法和Transwell实验分别检测SK-OV-3细胞增殖及侵袭。以microRNA.org和miRWalk3.0数据库检索miRNA-5582的靶基因,双荧光素酶报告基因实验验证miRNA-5582的靶基因。qRT-PCR和Western blot法检测靶基因表达。结果miRNA-5582在卵巢癌组织中的表达显著低于正常组织(P<0.01)。miRNA-5582表达水平与卵巢癌患者的临床分期呈负相关(P<0.01)。miRNA-5582在卵巢癌细胞株中表达均显著低于IOSE80细胞(P<0.05),SK-OV-3细胞中miRNA-5582表达最低(P<0.01)。对照组和miRNA-5582组的miRNA-5582相对表达量为1.42±0.73和10.46±0.91,转染体系构建成功(P<0.01)。miRNA-5582组SK-OV-3细胞活性在第3、第4和第5天显著低于对照组(P<0.05)。对照组和miRNA-5582组侵袭细胞数分别为(49.48±3.78)和(15.77±3.40)个,miRNA-5582组细胞侵袭数量显著少于对照组(P<0.01)。miRNA-5582的靶基因是丝氨酸/精氨酸富集剪接因子3(SRSF3)(P<0.01)。miRNA-5582组SK-OV-3细胞SRSF3基因表达显著低于对照组(P<0.01)。结论miRNA-5582在卵巢癌组织和细胞株中低表达,上调miRNA-5582通过抑制SRSF3基因表达降低卵巢癌SK-OV-3细胞的增殖和侵袭能力,miRNA-5582可能为卵巢癌的防治提供新的靶点。

膀胱尿路上皮癌组织中SRSF1及Caspase-3的表达水平及临床意义

目的探讨膀胱浸润性尿路上皮癌组织中丝氨酸/精氨酸富有剪接因子1(SRSF1)、天冬氨酸特异性半胱氨酸蛋白酶-3(Caspase-3)的表达水平及临床意义。方法选取2017年3月至2019年6月郑州大学第五附属医院收集的92例膀胱浸润性尿路上皮癌手术或活检标本为观察组,选取同期20例病理检查结果为正常膀胱尿路上皮组织的活检标本为对照组。采用免疫组化法检测对照组、观察组中SRSF1及Caspase-3的表达情况,分析观察组Caspase-3与SRSF1的相关性。结果观察组SRSF1阳性表达率高于对照组(P<0.05)。复发性浸润性尿路上皮癌组织SRSF1阳性表达率高于原发性癌(P<0.001)。观察组Caspase-3阳性表达率低于对照组(P<0.05)。观察组Caspase-3与SRSF1的表达呈负相关(P<0.05)。结论SRSF1与膀胱浸润性尿路上皮癌的发生、复发关系密切,膀胱浸润性尿路上皮癌组织中Caspase-3与SRSF1表达呈负相关,SRSF1高表达与Caspase-3低表达对膀胱浸润性尿路上皮癌患者病情进展起促进作用。

SRSF6和miR-506-3p在结核性胸膜炎胸腔积液中表达的意义及其诊断价值

目的 探讨富含丝氨酸/精氨酸剪接因子6(SRSF6)、微小RNA-506-3p(miR-506-3p)在结核性胸膜炎胸腔积液中表达的意义及诊断价值。方法 选取2020年1月到2022年1月本院收治的60例结核性胸膜炎胸腔积液患者作为结核组,另选取同期非结核性胸膜炎胸腔积液患者30例作为对照组。两组患者均于无菌条件下进行胸腔穿刺,抽取胸腔积液进行miR-506-3p、SRSF6水平测定。Pearson法分析结核组SRSF6与miR-506-3p水平的相关性。采用多因素Logistic回归分析影响结核性胸膜炎发生的危险因素。采用受试者工作特征(ROC)曲线分析胸腔积液SRSF6和miR-506-3p水平对结核性胸膜炎的诊断价值。结果 结核组胸腔积液SRSF6表达水平明显高于对照组(P<0.05),miR-506-3p表达水平明显低于对照组(P<0.05)。Pearson相关性分析显示,结核组胸腔积液SRSF6与miR-506-3p表达水平呈负相关(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,SRSF6高水平、miR-506-3p低水平是影响结核性胸膜炎发生的危险因素(P<0.05)。SRSF6、miR-506-3p联合诊断结核性胸膜炎的价值高于SRSF6及miR-506-3p单独诊断。结论 SRSF6在结核性胸膜炎胸腔积液中表达水平升高,miR-506-3p在结核性胸膜炎胸腔积液中表达水平降低,两者是影响结核性胸膜炎发生的危险因素,两者联合对于结核性胸膜炎具有较高的诊断价值。

植物生长发育和逆境响应中SR-like蛋白的研究进展

同一基因pre-mRNA经可变剪接(alternative splicing,AS)后能够产生不同的转录本,使得编码的蛋白在细胞中的定位、稳定性和翻译后修饰的功能发生改变,进而增强应答发育及环境胁迫的能力,富含丝氨酸-精氨酸蛋白(serine/arginine-rich proteins,SR proteins/SR)是决定可变剪接效率和准确性的一个重要剪接因子家族。该文在简要介绍SR蛋白概念、分类的基础上,首次系统综述了植物特有的SR蛋白亚家族SR-like(SR45/45a)结构特点、成员构成、亚细胞定位和转录调控功能,尤其是对于非生物胁迫应答过程中相关基因可变剪接的调控机制进行了阐述,并展望了未来植物SR-like可能的前景方向和研究内容。

SRSF1和Survivin在前列腺癌组织中的表达及其与病理分级的相关性

目的检测人丝氨酸/精氨酸富有剪接因子1(SRSF1)和凋亡抑制因子(Survivin)在前列腺癌组织中的表达,并探讨两者的相关性及其与前列腺癌病理分级的关系,从而初步提出前列腺癌治疗中的新靶点。方法采用免疫组织化学SP法检测SRSF1、Survivin蛋白在12例前列腺癌组织和8例良性前列腺增生组织中的表达,分析其与病理分级的关系,并探讨两者的相关性。结果 SRSF1蛋白在前列腺癌组织中的细胞阳性表达率为(76.37±5.06)%,显著高于良性前列腺增生[(11.30±1.09)%,P<0.05],Survivin蛋白在前列腺癌组织中的细胞阳性表达率为(86.93±3.21)%,显著高于良性前列腺增生[(17.67±1.99)%,P<0.05]。SRSF1和Survivin蛋白在前列腺癌组织中的表达与病理Gleason分级呈正相关,并且二者有明显的相关性(P<0.05)。结论SRSF1和Survivin蛋白在前列腺癌组织中均有高表达,比在良性前列腺增生组织中明显增加;并且SRSF1和Survivin蛋白的阳性表达与前列腺癌Gleason评分呈正相关,同时前列腺癌组织中Survivin蛋白表达量的升高与SRSF1蛋白表达量的升高呈正相关,初步证明了SRSF1的作用可能是通过上调Survivin的表达,从而促进了前列腺癌的发生、发展。

富丝氨酸/精氨酸剪接因子7的表达在肝细胞癌中的意义

目的:探讨富丝氨酸/精氨酸剪接因子7(SRSF7)表达肝细胞癌(HCC)中的临床意义及生物学功能。方法:首先通过TCGA数据库中HCC转录组数据和临床数据分析SRSF7的表达水平、临床病理特征、功能和通路富集情况。再利用临床HCC样本、Huh7、Hep3B细胞株进行验证;将细胞分为对照组(control组)、过表达组(SRSF7OE组)和敲低组(SRSF7KD组)。细胞计数试剂盒(CCK-8)实验、TUNEL实验检测其增殖和凋亡能力;伤口愈合实验、Transwell迁移实验和Transwell侵袭实验检测其迁移和侵袭能力;蛋白质免疫印迹法(western blotting)实验检测上皮—间质转化(EMT)相关标志物的蛋白水平;实时荧光定量PCR(RT-qPCR)实验检测SRSF7下游调控基因的mRNA水平。结果:生信分析结果显示,SRSF7在HCC肿瘤组织中呈高表达并且与肿瘤分级、分期和患者预后不良有关(P<0.05)。Western blotting和免疫组化结果显示,SRSF7在肿瘤组织中呈高表达(P<0.05)。与对照组相比,过表达SRSF7能促进HCC细胞增殖、迁移侵袭以及EMT进程;敲低SRSF7能抑制HCC细胞增殖、促进细胞凋亡,抑制HCC细胞迁移侵袭和EMT进程(P<0.05)。结论:SRSF7在HCC中呈高表达,其高表达可能通过调控PAK5、RTL1等下游靶基因的表达来促进HCC细胞增殖,抑制细胞凋亡,并通过促进EMT进程来促进细胞迁移和侵袭,进而促进HCC的进展。

SRSF1通过调控VEGFA mRNA可变剪接促进食管鳞状细胞癌Eca9706细胞增殖、侵袭和迁移

背景与目的:丝氨酸/精氨酸富集剪接因子1(serine/arginine-rich splicing factor 1,SRSF1)与肿瘤的发生、发展密切相关。食管癌是常见的消化系统恶性肿瘤,但SRSF1在食管癌中的作用罕有报道。检测SRSF1在食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)组织中的表达及其对ESCC细胞增殖、迁移和侵袭的影响,并初步探讨其作用机制。方法:收集2020年1月—2021年12月于河北医科大学第四医院行手术切除的40例ESCC患者的癌及癌旁组织标本,采用免疫组织化学染色法检测ESCC组织中SRSF1的水平。采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)检测ESCC细胞系中SRSF1 mRNA表达和蛋白水平。筛选SRSF1高表达的Eca9706细胞进行研究。采用小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)技术降低SRSF1 mRNA表达。采用细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)、transwell和Matrigel基质胶实验分别检测Eca9706细胞增殖、迁移和侵袭能力。采用数据库分析ESCC组织中血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)的表达,并分析SRSF1与VEGFA表达的相关性。采用RTFQ-PCR检测Eca9706细胞VEGFA Iso8a和Iso8b亚型的表达水平,以及敲低SRSF1后VEGFA Iso8a和Iso8b亚型的表达变化。结果:SRSF1在ESCC组织中的表达水平高于癌旁组织(P<0.05)。SRSF1 mRNA表达和蛋白水平在ESCC Eca9706细胞系中最高(P<0.01)。转染siRNA-SRSF1组中SRSF1 mRNA表达和蛋白水平显著低于siRNA-NC组(P<0.01)。与siRNA-NC组相比,siRNA-SRSF1组Eca9706细增殖、迁移和侵袭能力显著降低(P<0.05)。ESCC组织中VEGFA表达明显高于食管正常组织(P<0.05),且与SRSF1表达呈正相关(P<0.01)。Eca9706细胞VEGFA Iso8a亚型表达明显高于VEGFA Iso8b亚型(P<0.01),且敲低SRSF1后VEGFA Iso8a亚型表达降低,VEGFA Iso8b亚型表达升高(P<0.01)。结论:SRSF1可通过作用于VEGFA可变剪接促进ESCC Eca9706细胞增殖、侵袭和迁移。

SRSF7对HepG2细胞增殖、迁移和侵袭的影响及其可能机制

目的:探讨富含丝氨酸/精氨酸剪接因子7(SRSF7)对肝细胞癌(HCC)细胞HepG2增殖、迁移和侵袭的影响及其可能机制。方法:通过癌症基因组图谱(TCGA)和Kaplan-Meier Plotter在线分析SRSF7在HCC和癌旁组织中的差异表达及其与患者预后的关系。常规培养HepG2细胞,用转染试剂将SRSF7 RNA敲减序列(siSRSF7#1和siSRSF7#2)、对照序列(NC)、SRSF7过表达载体(hSRSF7-oe)和对照载体(hSRSF7-nc)转染至HepG2细胞中,实验分为NC组、siSRSF7#1组、siSRSF7#2组、NC+hSRSF7-nc组、siSRSF7+hSRSF7-nc组和siSRSF7+hSRSF7-oe组。通过qPCR和WB法检测各组HepG2细胞中SRSF7 mRNA和蛋白的表达,MTS实验、平板克隆形成实验、划痕愈合实验、Transwell小室实验分别检测各组HepG2细胞的增殖、迁移和侵袭的能力。WB法检测各组HepG2细胞中JAK1/STAT3信号通路的相关蛋白的表达。结果:数据库数据分析显示SRSF7 mRNA在HCC组织中呈高表达(P<0.001),SRSF7 mRNA高表达与HCC患者不良预后有关联(P<0.05)。敲减SRSF7后,HepG2细胞的增殖、迁移和侵袭能力均显著下降(均P<0.01)。敲减SRSF7组细胞中JAK1和STAT3磷酸化水平显著降低(均P<0.05),同时过表达SRSF7后,JAK1和STAT3磷酸化水平又明显升高(均P<0.05)。结论:SRSF7在HCC组织中呈高表达,其可能通过调控JAK1/STAT3信号通路促进HepG2细胞的增殖、迁移和侵袭。

丝氨酸/精氨酸富集剪接因子1在肿瘤发生发展过程中的作用

选择性剪接(alternative splicing)是产生蛋白质组多样性的重要机制,并与肿瘤的发生、发展密切相关。丝氨酸/精氨酸富集剪接因子1(serine/arginine-rich splicing factor 1,SRSF1)是选择性剪接因子家族的代表性成员,参与前体mRNA的选择性剪接与加工、胞内定位与运输等生理过程。研究已证实,SRSF1为原癌蛋白,并在肺癌、乳腺癌和白血病等人类肿瘤细胞中存在过表达现象。SRSF1蛋白通过与肿瘤相关基因的相互作用、调控细胞周期及凋亡等多种途径参与肿瘤的发生、发展过程。此外,SRSF1蛋白通过影响PI3K-Akt-mTOR、Ras-MNK-MAPK及Wnt-β-catenin信号转导通路中相关基因的剪接方式发挥致癌作用。针对剪接异常事件,目前主要采用反义寡核苷酸方法特异性纠正基因的错误性剪接,该方法已在肺癌及乳腺癌等实体肿瘤治疗中开展研究。深入研究选择性剪接的位点选择机制和作用机制必将对探讨肿瘤发病机制、诊断和治疗方法产生深远影响。

丝氨酸和富含精氨酸剪接因子1基因通过调控翻译过程影响神经胶质瘤U87细胞的增殖

目的:探讨丝氨酸和富含精氨酸剪接因子1(SRSF1)基因对神经胶质瘤U87细胞增殖和细胞周期的影响及其作用机制。方法:采用基因沉默技术抑制SRSF1基因表达,获得2种不同靶点的SRSF1稳定沉默细胞系(shSRSF1-1组和shSRSF1-2组)。用CCK-8法检测SRSF1沉默对神经胶质瘤U87细胞的增殖活性,流式细胞技术检测SRSF1沉默对U87细胞周期的影响,qPCR和WB实验检测SRSF1沉默对细胞分裂相关基因(CEP70和SMC4)m RNA和蛋白表达水平的影响,用WB实验检测SRSF1沉默对翻译起始蛋白4E-BP1磷酸化的影响。结果:shSRSF1-1组和shSRSF1-2组U87细胞中SRSF1蛋白表达均明显低于对照组(P<0.01),shSRSF1-1组和shSRSF1-2组U87细胞增殖能力被显著抑制(P<0.01),并且处在G2期的细胞数量明显高于对照组(P<0.01)。与对照组比较,shSRSF1-1组和shSRSF1-2组细胞中细胞分裂相关基因CEP70和SMC4 mRNA水平无明显差异(P>0.05),但是蛋白表达水平明显降低(P<0.01)。shSRSF1-1组和shSRSF1-2组U87细胞中翻译起始蛋白4E-BP1磷酸化程度要明显低于对照组(P<0.01)。结论:沉默SRSF1基因通过降低翻译起始蛋白4E-BP1磷酸化水平抑制细胞分裂相关基因CEP70和SMC4的翻译过程,最终使细胞阻滞在G2期,进而减弱神经胶质瘤U87细胞的增殖能力。

基于剪接因子SRSF9在头颈部鳞状细胞癌中的表达及临床意义的生物信息学分析

目的:基于生物信息学方法分析富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子9(SRSF9)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达情况、临床意义以及与肿瘤免疫浸润的关系,并探讨其作用机制。方法:利用癌症基因图谱(TCGA)数据库、基因表达综合(GEO)数据库中GSE30784和GSE13601数据集、临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)数据库、基因表达交互分析(GEPIA)数据库和Kaplan-Meier plotter数据库分析SRSF9在HNSCC中的表达及与患者临床病理特征和预后的关系;利用cBioPortal数据库分析SRSF9基因变异情况;应用ESTIMATE算法和肿瘤免疫估计资源(TIMER)数据库评估SRSF9表达与肿瘤微环境和肿瘤免疫细胞浸润的关系;利用LinkedOmics数据库分析SRSF9在HNSCC中的共表达基因及其调控通路;基于TCGA SpliceSeq数据库分析HNSCC中SRSF9调控的可变剪接事件,并对靶基因进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果:TCGA数据库、GEO数据库中GSE30784和GSE13601数据集分析,HNSCC组织中SRSF9 mRNA表达水平较癌旁正常组织明显升高(P<0.01);CPTAC数据库分析,与正常组织比较,HNSCC组织中SRSF9蛋白表达水平明显升高(P<0.001)。TCGA数据库分析,SRSF9 mRNA表达与HNSCC患者病理分级(P=0.004)和HPV感染(P=0.031)有关联。GEPIA和Kaplan-Meier plotter数据库分析,HNSCC组织中SRSF9 mRNA高表达均与患者总生存期(OS)较差相关[风险比(HR)=1.40,P=0.019;HR=1.55,P=0.003]。cBioPortal数据库分析,HNSCC中SRSF9基因拷贝数变异(CNV)占26.85%,其CNV与SRSF9 mRNA表达水平呈正相关关系(r=0.44,P<0.001)。ESTIMATE算法分析,SRSF9 mRNA高表达组基质评分和免疫评分均较SRSF9 mRNA低表达组低(P<0.001),肿瘤纯度则高于SRSF9 mRNA低表达组(P<0.001)。TIMER数据库分析,SRSF9 mRNA表达水平与CD4+T淋巴细胞浸润呈正相关关系(r=0.186,P<0.001),而与B淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞和树突状细胞浸润呈负相关关系(r=-0.269,P<0.001;r=-0.353,P<0.001;r=-0.304,P<0.001)。SRSF9共表达基因富集分析,核糖体、剪接体和代谢通路等相关基因上调,而黏着斑、细胞因子和细胞黏附分子等相关基因下调。SRSF9相关可变剪接靶基因主要涉及脂类代谢、胰高血糖素和紧密连接等通路。结论:SRSF9在HNSCC中呈高表达,且与患者预后不良和肿瘤微环境免疫细胞浸润相关,可成为HNSCC诊断、预后评估和治疗的潜在分子靶标。

富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子1、转录因子7类似物2在胃癌组织中的表达及与化疗药物耐药性的关系

目的 探讨富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子1(SRSF1)、转录因子7类似物2(TCF7L2)在胃癌组织中的表达及与化疗药物耐药性的关系。方法 收集120例胃癌患者的胃癌组织及癌旁组织,应用实时荧光定量聚合酶链反应检测胃癌患者胃癌组织和癌旁组织中SRSF1、TCF7L2的表达量,分析这两种蛋白的表达情况与患者临床特征的关系,并检测胃癌患者对不同化疗药物的敏感性与SRSF1、TCF7L2的关系。结果 胃癌组织中SRSF1、TCF7L2相对表达量均明显高于癌旁组织,差异均有统计学意义(P﹤0.01)。不同分化程度、TNM分期及淋巴结转移情况胃癌患者的胃癌组织中SRSF1、TCF7L2表达情况比较,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。不同顺铂、紫杉醇、多西他赛和环磷酰胺耐药情况的胃癌患者胃癌组织中SRSF1、TCF7L2表达情况比较,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。结论 胃癌患者胃癌组织中SRSF1和TCF7L2呈异常高表达,SRSF1和TCF7L2高表达可能是胃癌患者对化疗药物产生耐药性的重要原因。

丝氨酸/精氨酸富有剪接因子1、核因子κB在前列腺癌中的表达及与患者临床特征的关系

目的探讨前列腺癌组织中丝氨酸/精氨酸富有剪接因子1(SRSF1)、核因子κB(NF-κB)的表达情况及与患者临床特征的关系。方法选取前列腺癌患者和前列腺良性增生患者,各70例,取前列腺癌组织和前列腺良性增生组织。免疫组化法检测前列腺癌组织和前列腺良性增生组织SRSF1、NF-κB蛋白的阳性表达率,并分析不同临床特征前列腺癌患者前列腺癌组织中SRSF1、NF-κB蛋白的表达情况。结果前列腺癌组织中SRSF1、NF-κB蛋白的阳性表达率均高于前列腺良性增生组织,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。不同前列腺特异性抗原(PSA)水平前列腺癌患者前列腺癌组织中SRSF1蛋白的阳性表达率比较,差异无统计学意义(P﹥0.05);不同TNM分期、淋巴结转移情况、Gleason评分前列腺癌患者前列腺癌组织中SRSF1蛋白的阳性表达率比较,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。不同PSA水平、Gleason评分前列腺癌患者前列腺癌组织中NF-κB蛋白的阳性表达率比较,差异均无统计学意义(P﹥0.05);不同TNM分期、淋巴结转移情况前列腺癌患者前列腺癌组织中NF-κB蛋白的阳性表达率比较,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。结论前列腺癌组织中的SRSF1、NF-κB蛋白表达水平和阳性表达率均较高,SRSF1蛋白的表达可能与TNM分期、淋巴结转移情况和Gleason评分,NF-κB蛋白的表达可能与TNM分期和淋巴结转移情况有关。

温脾活血汤辅助治疗结核性胸膜炎的疗效及对富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子6和miR-506-3p的影响

目的探讨温脾活血汤辅助治疗结核性胸膜炎的疗效,以及对富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子6(SRSF6)和miR-506-3p的影响。方法选取2021年1月至2023年2月收治的98例结核性胸膜炎患者,随机分为对照组(49例)与研究组(49例),对照组采用胸腔穿刺抽液术+抗结核药物治疗,研究组采用温脾活血汤+胸腔穿刺抽液术+抗结核药物治疗,2组均连续治疗2个月。比较2组的临床疗效和不良事件发生情况;比较2组治疗前后的中医证候评分、胸膜厚度以及胸腔积液中炎症因子、腺苷脱氨酶(ADA)、转化生长因子β_(1)(TGF-β_(1)),SRSF6水平和miR-506-3p表达水平。结果研究组总有效率(93.88%)高于对照组(79.59%),差异有统计学意义(P<0.05)。2组不良事件总发生率比较差异无统计学意义(P>0.05)。治疗后,2组中医证候评分和胸膜厚度均低于治疗前(P<0.05),并且研究组低于对照组(P<0.05);2组胸腔积液中干扰素诱导蛋白10(IP-10)、干扰素-γ(IFN-γ)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-17(IL-17)、ADA、TGF-β_(1)和SRSF6水平均低于治疗前(P<0.05),并且研究组低于对照组(P<0.05);2组胸腔积液中的miR-506-3p表达水平均高于治疗前(P<0.05),并且研究组高于对照组(P<0.05)。结论温脾活血汤可提高结核性胸膜炎患者的临床疗效,改善临床症状,减轻炎症反应,其机制可能与温脾活血汤能够调节SRSF6和miR-506-3p的水平有关。

SRSF9/SRp30c通过调控GRβ对胶质瘤细胞增殖和迁移的影响

目的:探讨富含丝氨酸-精氨酸剪切因子9/富含丝氨酸-精氨酸蛋白30c(SRSF9/SRp30c)和糖皮质激素受体β(GRβ)在胶质瘤细胞中的表达及两者之间的关系。方法:用小干扰RNA(siRNA)靶向干扰胶质瘤U87细胞中SRSF9的表达,同时用慢病毒将短发卡RNA(shRNA)转染细胞,构建SRSF9敲减的U87稳转细胞株,通过荧光显微镜观察并检测转染情况。通过RT-q PCR和Western blot法检测SRSF9/SRp30c和GRβ的表达水平,CCK-8和细胞集落形成实验检测细胞的增殖能力,划痕实验检测细胞的迁移能力。结果:用2种方法敲减SRSF9后,SRSF9/SRp30c表达均降低,GRβ的表达水平也随之下降,差异有统计学意义(P<0.05)。荧光显微镜观察结果表明,成功构建了稳转细胞株,转染效率超过80%。CCK-8实验和细胞集落形成实验的结果表明U87细胞在敲减SRSF9后,细胞活力和集落形成能力降低,差异有统计学意义(P<0.05);划痕实验结果表明U87细胞在敲减SRSF9后,迁移能力明显减弱,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:SRSF9/SRp30c可通过调控GRβ促进胶质瘤细胞的增殖和迁移。

SRSF2基因突变与髓系肿瘤

近年随着新一代基因组测序技术的开展,发现剪接体相关基因突变在髓系肿瘤中检出率较高,并且可能与疾病的发生发展密切相关。研究这些基因突变前后功能的改变不仅有助于明确疾病的发病机制,而且对于疾病的诊断、治疗及预后判断也具有重要意义。富含丝氨酸/精氨酸剪接因子2（serine/arginine-rich splicing factor 2,SRSF2）基因是常见剪接体基因突变之一,

剪接因子SRSF7新mRNA剪接异构体在顺铂处理细胞中的变化

目的:探讨不同梯度浓度顺铂(CDDP)处理不同肺癌细胞后新发现的剪接因子SRSF7 m RNA异构体在同浓度CDDP处理后不同的细胞中的水平变化。方法:采用梯度浓度的CDDP处理肺癌细胞A549(8、18、24、32、40、48及56μmol/L)和H1299(12、24、36、48、60、72及84μmol/L),处理24 h后提取总RNA,进行RT-PCR检测SRSF7 m RNA剪接异构体,并选取NCBI中未确定的异构体进行TA克隆后测序并分析鉴定异构体类型;用56μmol/L的CDDP处理人胚肾细胞293FT,宫颈癌细胞Ca Ski、Si Ha、C33A细胞24 h,提取总RNA后验证新发现的SRSF7 m RNA剪切异构体是否存在这些细胞中。结果:发现3种新的SRSF7 m RNA剪接异构体(分别标记为New1、New2及New3),在肺癌细胞A549、H1299,人胚肾细胞293FT,宫颈癌细胞Ca Ski、Si Ha、C33A细胞等多种肿瘤细胞中均存在,根据NCBI的预测New1,New2,New3异构体均为非编码蛋白的m RNA异构体,随着处理CDDP浓度的增加,其比例明显上升;而编码蛋白的m RNA异构体a和(或)b所占比例明显下降;同时SRSF7的总m RNA水平逐渐降低。结论:新发现的3种非编码的m RNA异构体的变化揭示细胞可能通过SRSF7自身的m RNA选择性剪接来应对DNA损伤。

急性髓系白血病SRSF2基因突变患者临床病理特征及预后生存分析

目的探讨急性髓系白血病(acute myelogenous leukemia,AML)精氨酸/丝氨酸丰富剪接因子2(serine/arginine-rich splicing factor 2,SRSF2)基因突变患者的临床病理特征及预后生存情况。方法选取2006年12月至2013年4月内蒙古医科大学附属医院收治的286例AML患者作为研究对象,回顾性分析所有患者的临床及随访资料,统计患者的临床资料、SRSF2基因突变情况、临床病理特征及预后生存时间,并比较SRSF2基因不同表达患者间上述资料的差异性,分析影响AML患者预后的相关因素。结果本研究286例AML患者中有12例发生杂合子SRSF2基因突变,突变率为4.20%,其余为野生型SRSF2基因。发生SRSF2基因突变和未发生SRSF2基因突变的AML患者在性别、病程、FAB分型、核型、白细胞(white blood cell,WBC)、血红蛋白(hemoglobin,Hb)、血小板(platelet,PLT)水平以及骨髓原始细胞比例比较均无显著差异(P_均> 0.05),但发生SRSF2基因突变的AML患者年龄较未发生SRSF2基因突变的AML患者大(P <0.05)。发生SRSF2基因突变和未发生SRSF2基因突变的AML患者5年总生存率比较差异具有显著性(χ~2=14.148,P <0.001)。经Log-Rank检验单因素分析,年龄≥60岁、出现异常核型、Hb <90.00 g/L、骨髓原始细胞比例≥50.00%以及SRSF2基因突变的AML患者生存时间均明显缩短(P_均<0.05)。经多因素Cox回归模型分析,年龄≥60岁、出现异常核型、Hb <90.00 g/L、骨髓原始细胞比例≥50.00%均为导致AML患者预后较差的独立危险因素(P_均<0.05)。结论 SRSF2基因突变的AML患者年龄显著较大,且年龄较大、出现异常核型、Hb水平过低、骨髓原始细胞比例较高均可导致AML患者预后不良,但SRSF2基因突变并非影响AML患者预后的独立危险因素。

SRSF2基因的生物信息学分析与蛋白质预测

目的:分析富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子2(SRSF2)基因序列和表达产物的特征。方法:运用生物信息学相关软件分析和预测人类和小鼠SRSF2基因的同源区段、开放读框、启动子区域、转录因子结合位点、CpG岛分布情况,分析预测小鼠SRSF2基因蛋白产物的功能结构域以及与其他蛋白的相互作用。结果:人类和小鼠SRSF2基因共有3个同源区段、19个开放读框、4个相同的转录因子结合位点,2个基因的CpG岛各项参数基本一致;小鼠SRSF2蛋白会与至少10种其他蛋白因子发生相互作用。结论:SRSF2基因及其蛋白产物的生物信息学分析,为相关研究提供了重要的信息基础。

基于TCGA数据库分析富含丝氨酸/精氨酸剪接因子家族在不同癌症中的表达及其预后意义

目的揭示不同类型癌症中富含丝氨酸/精氨酸剪接因子(SRSF)的整体表达及其对预后的作用。方法从癌症基因组图谱数据库(TCGA)中下载患者SRSF表达和临床信息,分析33种癌症类型中SRSF基因家族的表达差异及预后价值。利用R语言分析SRSF基因表达、突变及其相关细胞信号通路。结果SRSF在多种癌症中异常表达,并与G2/M检查点、DNA修复、IL-2/STAT5信号转导、缺氧和KRAS多种信号转导通路以及免疫细胞浸润密切相关。SRSF的异常表达与癌症患者的预后显著相关。结论SRSF基因异常表达可以预测癌症的预后,其可能作为癌症潜在标志物。