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青贮玉米品质相关性状的全基因组关联分析
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作者 刘鹏飞 王栋 +5 位作者 陈泽辉 郭向阳 吴迅 王安贵 涂亮 祝云芳 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期65-74,共10页
为了初步揭示玉米粗蛋白含量、淀粉含量、中性洗涤纤维(neutral detergent fiber,NDF)含量、酸性洗涤纤维(acid detergent fiber,ADF)含量、可溶性糖含量和体外干物质消化率等性状的遗传规律,按照随机区组设计将183份自交系为材料种植... 为了初步揭示玉米粗蛋白含量、淀粉含量、中性洗涤纤维(neutral detergent fiber,NDF)含量、酸性洗涤纤维(acid detergent fiber,ADF)含量、可溶性糖含量和体外干物质消化率等性状的遗传规律,按照随机区组设计将183份自交系为材料种植于贵阳,测定玉米粗蛋白含量、淀粉含量、NDF含量、ADF含量、可溶性糖含量和体外干物质消化率,利用Maize SNP 50芯片对供试材料进行基因分型,采用混合线性模型进行全基因组关联分析,结果显示,分别鉴定出31、61、11、36、20和42个与粗蛋白、淀粉、NDF、ADF、可溶性糖及体外干物质消化率显著相关的单核苷酸多态性位点(SNP)(P<0.001),对表型变异的解释率分别为5.80%~11.40%、5.78%~11.38%、5.78%~7.85%、5.81%~10.37%、5.78%~7.35%和5.79%~11.33%。同时,发现SYN6712、PHM1190.3、SYN7541和PZE-104072386属于一因多效位点;其中,6号染色体上的SYN6712、PHM1190.3和SYN7541同时与淀粉、体外干物质消化率显著关联,4号染色体上的PZE-104072386同时与ADF、可溶性糖显著关联,经过等位变异鉴定发现T/T基因型是SYN6712和PHM1190.3的优异等位变异,并挖掘到了Zm00001d037272、Zm00001d037386、Zm00001d037532和Zm00001d051166等候选基因。 展开更多
关键词 青贮玉米 品质性状 全基因组关联分析 单核苷酸多态性位点 优异等位变异 候选基因
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牙周炎与哮喘的因果关系:一项两样本孟德尔随机化研究
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作者 陈麒伟 柳汀 蔡扬 《口腔疾病防治》 2024年第8期606-613,共8页
目的通过双样本孟德尔随机化法(Mendelian randomization,MR)探究牙周炎与哮喘的双向因果关系,为牙周炎和哮喘的病因探索和防治措施制定提供基础。方法使用公开发布的欧洲人种的牙周炎(n=34615)与哮喘(n=408422)的全基因组关联研究(geno... 目的通过双样本孟德尔随机化法(Mendelian randomization,MR)探究牙周炎与哮喘的双向因果关系,为牙周炎和哮喘的病因探索和防治措施制定提供基础。方法使用公开发布的欧洲人种的牙周炎(n=34615)与哮喘(n=408422)的全基因组关联研究(genome⁃wide association studies,GWAS)统计数据进行了两样本双向孟德尔随机化分析。以逆方差加权法(inverse variance weighted,IVW)作为主要MR分析方法来估计牙周炎与哮喘之间的双向因果效应,同时采用加权中位数法(weighted median,WM)、MR⁃Egger回归法、最大似然法(maximum likelihood)和孟德尔随机化稳健调整特征评分法(Mendelian randomization robust adjusted profile score,MR⁃RAPS)作为补充分析,并通过Cochran’s Q检验、孟德尔随机化多效性残差与离群值检测(Mendelian randomization pleiotropy residual sum and outlier,MR⁃PRESSO)和留一法进行敏感性分析。结果最终分别有12个和43个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)被纳入作为牙周炎和哮喘的工具变量。IVW、WM、MR⁃Egger回归、最大似然法和MR⁃RAPS的结果表明,在欧洲人群中,牙周炎对哮喘发病无因果关系(IVW:OR=1.003,95%CI=0.973⁃1.035,P=0.828;WM:OR=0.990,95%CI=0.951⁃1.031,P=0.641;MR⁃Egger回归:OR=0.988,95%CI=0.960⁃1.028,P=0.573;最大似然法:OR=1.003,95%CI=0.972⁃1.035,P=0.834;MR⁃RAPS:OR=1.002,95%CI=0.970⁃1.036,P=0.890);哮喘对牙周炎也无因果关系(IVW:OR=1.021,95%CI=0.938⁃1.111,P=0.633;WM:OR=1.011,95%CI=0.894⁃1.142,P=0.866;MR⁃Egger回归:OR=1.042,95%CI=0.824⁃1.319,P=0.731;最大似然法:OR=1.021,95%CI=0.938⁃1.112,P=0.631;MR⁃RAPS:OR=1.017,95%CI=0.931⁃1.110,P=0.713)。Cochran’s Q检验表明纳入的工具变量之间不具有异质性,MR⁃PRESSO检验显示不存在水平多效性,留一法也未发现离群SNP。结论基于欧洲人群遗传数据的MR研究表明,牙周炎与哮喘发病之间不存在双向的因果关系。 展开更多
关键词 牙周炎 哮喘 孟德尔随机化 全基因组关联分析 单核苷酸多态性 因果关联 双向因果 工具变量 敏感性分析
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白介素-16基因多态性与膝骨性关节炎的易感性研究 被引量:2
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作者 罗世兴 张均锦 +3 位作者 龙光华 董桂甫 苏伟 秦雪 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期951-955,共5页
目的:探讨汉族人群中白介素-16(interleukin-16,IL-16)基因单核苷酸多态性与膝关节骨性关节炎knee osteoarthritis,KOA)的相关性。方法:采用“病例-对照”研究方法,纳入150例汉族KOA患者与147例非KOA受试者,其年龄、性别、体... 目的:探讨汉族人群中白介素-16(interleukin-16,IL-16)基因单核苷酸多态性与膝关节骨性关节炎knee osteoarthritis,KOA)的相关性。方法:采用“病例-对照”研究方法,纳入150例汉族KOA患者与147例非KOA受试者,其年龄、性别、体质指数相匹配。采用苯酚氯仿法提取外周血白细胞基因组DNA,聚合酶链反应限制性片段长度多态性的方法检测IL-16基因rs11556218、rs4072111和rs47788893个位点与KOA的遗传易感相关性,并用基因测序验证结果。结果:病例组和对照组中3个位点基因型分布均符合Hardy—Weinberg平衡。KOA组rsll556218的T/G基因型频率高于非KOA的人群(OR=2.06,95%CI=1.26~3.35,P=0.005),G/G也明显增加发病风险(OR=2.52,95%CI=1.10—5.74,P=0.005),rs4072111的C/T基因型KOA的发病风险较C/C基因型明显增加(OR=2.45,95%CI=1.42~4.22,P=0.000),T/T也明显增加发病风险(OR=4.04,95%CI=1.06—15.37,P=0.000);rsll556218与rs4778889存在连锁不平衡关系(D’=0.63,R。=0.236),单倍型TTT增加KOA的发病风险(OR=3.70,95%CI=1.57—8.72,P=-0.003),GCC也增加了KOA的发病风险(OR=6.22,95%CI=2.37—16.33,P=0.000)。结论:汉族人群中IL—16基因多态性可能与KOA易感性有关。 展开更多
关键词 骨性关节炎 多态性 单核苷酸 白介素-16
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ABCA1启动子区及7外显子基因突变对汉族人群高密度脂蛋白胆固醇水平的影响 被引量:2
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作者 祁莉萍 严晓伟 +2 位作者 叶平 党爱民 方全 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2010年第5期431-433,共3页
目的研究汉族人群ABCA1启动子区-565C/T及7外显子G1051A基因多态性对HDL-C水平的影响。方法应用连接酶检测反应法对519例冠心病患者(冠心病组)及541例同期住院或体检者(对照组)测试-565C/T及G1051A基因型,生化检测HDL-C水平,分析HDL-C... 目的研究汉族人群ABCA1启动子区-565C/T及7外显子G1051A基因多态性对HDL-C水平的影响。方法应用连接酶检测反应法对519例冠心病患者(冠心病组)及541例同期住院或体检者(对照组)测试-565C/T及G1051A基因型,生化检测HDL-C水平,分析HDL-C水平与不同基因型的关系。结果 -565C/T的CC、CT、TT不同基因型的HDL-C水平分别为(1.19±0.81)mmol/L、(1.14±0.28)mmol/L和(1.12±0.28)mmol/L,无显著差异(P=0.44);G1051A的GG+GA、AA不同基因型的HDL-C水平分别为(1.18±0.61)mmol/L和(1.29±0.27)mmol/L,无显著差异(P=0.52);logistic回归模型分析显示,校正年龄、性别、吸烟后,A等位基因系冠心病保护性因素(OR=0.428,95% CI:0.227~0.603,P=0.009)。结论 ABCA1-565C/T及G1051A 2种单核苷酸多态性与HDL-C水平无相关性;G1051A的A等位基因系冠心病保护性因素。 展开更多
关键词 胆固醇 HDL 突变 冠心病 基因型 多态性 单核苷酸 基因频率
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内皮素受体B基因多态性与慢性阻塞性肺疾病及吸烟因素的相关性研究 被引量:3
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作者 尹琦 梁永杰 +4 位作者 任涛 郭忠良 陆晶晶 张路 芮庄华 《临床内科杂志》 CAS 2011年第8期539-541,共3页
目的探讨内皮素受体B(EDNRB)基因的第4外显子-30G/A处单核苷酸多态性与慢性阻塞性肺疾病(COPD)易感性及吸烟因素之间关系。方法采用PCR—RFLP技术,检测并分析EDNRB基因一30G/A(L277L)单核苷酸多态性位点在COPD组和健康对照组... 目的探讨内皮素受体B(EDNRB)基因的第4外显子-30G/A处单核苷酸多态性与慢性阻塞性肺疾病(COPD)易感性及吸烟因素之间关系。方法采用PCR—RFLP技术,检测并分析EDNRB基因一30G/A(L277L)单核苷酸多态性位点在COPD组和健康对照组中的基因型频率、等位基因频率,同时分析该多态性位点与吸烟相关COPD之间是否存在相关性。结果研究发现EDNRB基因一30G/A处基因型频率分布在COPD组和对照组之间差异有统计学意义(P〈0.05),但等位基因频率的分布在两组之间差异无统计学意义(P〉0.05)。在对COPD组和对照组中吸烟者的基因型分布频率和等位基因分布频率比较后,发现两组之间差异无统计学意义(P〉0.05),提示该突变位点与吸烟所致的COPD之间可能无相关性存在。结论EDNRB一30G/A位点多态性可能与COPD易感性相关,与吸烟相关的COPD无关。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 内皮素受体B 单核苷酸多态性 等位基因
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TGF-β1基因多态性与广东地区子痫前期相关性研究 被引量:1
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作者 谢玉珍 何文智 +5 位作者 刘玉冰 陈海霞 何青 李兆生 卢澄钰 李映桃 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2016年第9期683-688,共6页
目的:探讨转化生长因子β1( TGF-β1)基因4个位点-800 G/A、-509 C/T、+869 T/C、+915 G/C的单核苷酸多态性( SNP )及其构成的单体型与子痫前期( PE )的相关性。方法:随机选取2015年1月至12月于广州医科大学附属第三医院住院... 目的:探讨转化生长因子β1( TGF-β1)基因4个位点-800 G/A、-509 C/T、+869 T/C、+915 G/C的单核苷酸多态性( SNP )及其构成的单体型与子痫前期( PE )的相关性。方法:随机选取2015年1月至12月于广州医科大学附属第三医院住院的广东地区汉族孕妇176例,其中PE患者88例( PE组)、正常妊娠88例(对照组)。利用SNaPshot技术对TGF-β1基因4个位点进行基因分型检测,分析PE 组与对照组的TGF-β14个SNP基因型分布及等位基因频率的差异,并对+869 T/C、-509 C/T两个位点构建单体型分析。结果:(1)中国广东地区汉族妇女中存在TGF-β1+869T/C、-509C/T多态性,暂未发现-800G/A、+915G/C多态性。(2)PE组+869T/C位点CC基因型、C等位基因频率明显高于对照组(44.32% vs 27.27%, P=0.028, OR=1.935,95%CI 为1.028~3.639;68.18% vs 56.25%,P=0.014,OR=1.667,95%CI为1.079~2.575),TT基因型和T等位基因则明显下降(5.68% vs 14.77%,P=0.040,OR=0.348,95%CI为0.118~1.021;31.82% vs 43.75%,P=0.014,OR=0.600,95%CI为0.388~0.927);两组CT基因型分布无明显差异(52.27% vs 57.95%,P=0.272)。(3) PE 与对照组比较,-509C/T位点CC、CT、TT基因型分布无明显差异(14.77% vs 23.86%,P=0.090;47.73% vs 50.00%, P=0.440;37.50% vs 26.14%,P=0.072),而C等位基因明显下降(38.64% vs 48.86%, P=0.034, OR=0.659,95%CI 为0.431~1.006), T 等位基因明显升高(61.36% vs 51.14%,P=0.034,OR=1.518,95%CI 为0.994~2.318)。(4)单体型分析发现,由+869T/C、-509C/T两个位点构建的C-T单体型在PE组明显增加(62.79% vs 49.43%,P=0.008, OR=1.727,95%CI 为1.125~2.651),而 T-C 单体型明显下降(31.40% vs 42.33%,P=0.021,OR=0.618,95%CI 为0.398~0.961)。结论:(1) TGF-β1基因+869 T/C、-509 C/T SNPs可能与中国广东地区汉族妇女PE发生有关,而暂未发现-800 G/A、+915 G/C多态性。(2) TGF-β1基因SNP+869 T/CCC 基因型、C 等位基因,-509 C/TT等位基因可能是广东汉族妇女 PE 的危险因素,而+869 T/CTT 基因型、T 等位基因,-509C/TC等位基因可能是保护因素。(3)2个多态位点构成的C-T单体型可能是中国广东地区汉族妇女PE的危险因素,T-C单体型则是保护因素。 展开更多
关键词 转化生长因子-Β1 子痫前期 单核苷酸多态性 单体型分析
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PD-L1基因3’UTR单核苷酸多态性与膀胱尿路上皮癌关系的病例对照研究 被引量:1
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作者 刘静 王永华 +3 位作者 于仑 牛海涛 刘勇 孙立江 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期762-766,共5页
目的:探讨免疫关卡点分子程序性死亡配体1(programmed death ligand 1,PD-L1)基因3’端非翻译区(3’untranslated region,3’UTR)单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,B... 目的:探讨免疫关卡点分子程序性死亡配体1(programmed death ligand 1,PD-L1)基因3’端非翻译区(3’untranslated region,3’UTR)单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BUC)发病风险及临床病理特征之间的关系。方法:采用病例-对照研究方法,PCR-LDR技术分别检测2013年6月至2015年12月在青岛大学附属医院泌尿外科住院手术治疗的213例BUC患者和251例同期健康体检者PD-L1基因3’UTR的rs4143815位点和rs2297136位点基因型分布频率,采用卡方检验和非条件多因素Logistic回归分析不同基因型与BUC发病风险以及临床病理特征之间的关系。结果:BUC组PD-L1基因3’UTR的rs4143815位点基因型分布频率与对照组相比存在明显差异,GG基因型个体发生BUC的风险是CC基因型的2.83倍(95%CI:1.82~4.64,P<0.01),携带G突变基因(CG/GG基因型)个体BUC发病风险是CC型基因个体的1.53倍(95%CI:1.01~2.24,P<0.01),同时BUC组rs4143815位点携带G突变基因频率与BUC病理分级和临床分期具有相关性(P<0.05或P<0.01);而在rs2297136位点,BUC组和对照组基因型分布频率无显著差异,CC、CT及TT基因型个体之间发生BUC的风险亦无显著差异(均P>0.05)。结论:PD-L1基因3’UTR的rs4143815位点SNP与BUC的发病风险和恶性进展可能具有相关性。 展开更多
关键词 膀胱肿瘤 程序性死亡配体1 3’端非翻译区 单核苷酸多态性
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EGFR基因rs1024750多态性显著影响钙加维生素D干预绝经后白人妇女的血钙水平(英文) 被引量:1
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作者 王萍 徐潇静 +3 位作者 卜锋啸 周宇 叶安 周伯庭 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2014年第7期772-779,共8页
目的:考察EGFR基因多态性对钙加维生素D连续4年干预绝经后白人妇女血钙等人体成分的影响。方法:本研究共招募美国中西部农村地区201名绝经后白人妇女,每日三次服用钙剂(乳酸钙1 400mg/d或碳酸钙1 500mg/d)加维生素D(1 100IU/d),170名受... 目的:考察EGFR基因多态性对钙加维生素D连续4年干预绝经后白人妇女血钙等人体成分的影响。方法:本研究共招募美国中西部农村地区201名绝经后白人妇女,每日三次服用钙剂(乳酸钙1 400mg/d或碳酸钙1 500mg/d)加维生素D(1 100IU/d),170名受试者完成了4年的临床试验。用Haploview软件4.2版挑选EGFR基因35个目标SNP并基因分型。每年对受试者的人体成分进行测试,分析目标SNP与人体成分的相关性。结果:在人体成分中,仅有血钙基础水平与EGFR基因rs1024750位点基因多态性显著相关(P<0.05),血钙水平AA型>GA型>GG型。进行钙加维生素D干预后,血钙每年的变化值与该位点多态性显著相关,血钙变化值GG型>GA型>AA型。结论:EGFR基因rs1024750位点多态性与钙加维生素D干预绝经后白人妇女体内的血钙水平变化值显著相关。 展开更多
关键词 EGFR 基因 单核苷酸多态性 维生素D
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SLC10A1基因p.S267F位点单核苷酸多态性对慢性乙型肝炎患者肝功能的影响 被引量:1
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作者 李强 闫静静 +2 位作者 卓其斌 章树业 陈良 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2016年第10期1179-1181,共3页
目的探讨SLC10A1基因p.S267F位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)对慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者肝功能的影响。方法纳入初治CHB患者153例,其中p.S267F位点野生型(C/C)132例,突变型(C/T)21例。T检... 目的探讨SLC10A1基因p.S267F位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)对慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者肝功能的影响。方法纳入初治CHB患者153例,其中p.S267F位点野生型(C/C)132例,突变型(C/T)21例。T检验比较p.S267F位点野生型与突变型CHB患者各项肝功能指标间的差异。结果 SLC10A1基因p.S267F位点突变型CHB患者的ALT、AST、TBIL和DBIL水平均显著低于野生型患者(P<0.05);两组患者ALP、GGT和TBA水平间的差异无统计学意义(P>0.05)。结论 SLC10A1基因p.S267F位点突变型CHB患者的肝功能损伤程度低于野生型CHB患者,SLC10A1基因p.S267F位点突变可能是CHB患者肝损加重的保护因素。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 慢性乙型肝炎 钠离子-牛磺胆酸共转运多肽 单核苷酸多态性 肝功能
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FAM13A基因多态性与慢性阻塞性肺疾病易感性关系的Meta分析 被引量:2
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作者 冯晓丽 何杰 +2 位作者 李万成 李小燕 任召强 《齐鲁医学杂志》 2017年第3期315-318,320,共5页
目的采用Meta分析的方法综合评价家族序列相似性13A(FAM13A)基因rs7671167位点多态性与慢性阻塞性肺疾病(COPD)的关系。方法计算机检索PubMed、CNKI、万方、EMbase等数据库有关FAM13A基因rs7671167位点多态性与COPD发病风险的病例-对照... 目的采用Meta分析的方法综合评价家族序列相似性13A(FAM13A)基因rs7671167位点多态性与慢性阻塞性肺疾病(COPD)的关系。方法计算机检索PubMed、CNKI、万方、EMbase等数据库有关FAM13A基因rs7671167位点多态性与COPD发病风险的病例-对照研究,检索时间范围从建库至2016年6月20日。由两位研究者按照已制定的标准纳入文献并进行文献质量评价及资料提取。采用RevMan 5.3软件进行Meta分析。结果共纳入研究文献7篇,包括COPD组3 571例,对照组4 344例。Meta分析结果显示,在总体人群中,FAM13A基因rs7671167位点多态性与COPD易感性相关(CC+CT vs.TT,OR=0.76,95%CI=0.62~0.94,P<0.05);将人群按照种族不同进行分层分析,未发现FAM13A基因rs7671167位点多态性与亚洲人群COPD发病风险相关(CC+CT vs.TT,OR=0.82,95%CI=0.64~1.05,P>0.05);但在高加索人群中,FAM13A基因rs7671167位点多态性与COPD易感性相关(CC+CT vs.TT,OR=0.63,95%CI=0.43~0.93,P<0.05)。结论 FAM13A基因rs7671167位点多态性与高加索人群COPD发病风险具有相关性,可能降低高加索人群COPD发病风险;尚不能确定FAM13A基因rs7671167位点及等位基因基因型与亚洲人群COPD发病风险相关。 展开更多
关键词 家族序列相似性13A基因 肺疾病 慢性阻塞性 多态性 单核苷酸 META分析
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锰暴露工人XRCC1基因C26304T位点多态性与神经行为改变 被引量:2
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作者 姜慧 刘继刚 +3 位作者 缪雪阳 申旭波 周希雷 邹焰 《遵义医学院学报》 2014年第1期89-93,共5页
目的探讨不同锰累积暴露量的工人DNA损伤修复基因XRCC1 C26304T位点多态性与神经行为改变的关系。方法选取200名半年以上工龄的职业性锰暴露冶炼工人和94名劳动强度相似但无锰暴露的工人,按照累积暴露指数将观察对象分为高、低暴露组和... 目的探讨不同锰累积暴露量的工人DNA损伤修复基因XRCC1 C26304T位点多态性与神经行为改变的关系。方法选取200名半年以上工龄的职业性锰暴露冶炼工人和94名劳动强度相似但无锰暴露的工人,按照累积暴露指数将观察对象分为高、低暴露组和对照组。利用垂直沟槽稳定试验和插板试验进行神经行为改变的检测;提取血白细胞DNA,利用PCR-RFLP法检测XRCC1 C26304T位点的单核苷酸多态性(SNPs)。结果高、低暴露组携带XRCC1 C26304T位点变异基因型TT的工人在垂直沟槽稳定试验的划痕长度、插板试验的得分上均低于携带野生基因型CC和杂合基因型CT的工人,碰撞次数高于野生基因型和杂合基因型(P<0.05);对照组内各基因型之间无统计学差异(P>0.05)。结论 XRCC1C26304T位点的多态性可能影响职业锰暴露者的神经行为;XRCC1 C26304T位点的多态性有可能作为锰致神经行为改变以及锰中毒风险评估的检测指标。 展开更多
关键词 XRCC1 单核苷酸多态性 神经行为改变
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中国汉族TGF-β1基因-800G>A多态性与脑梗死的相关性(英文)
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作者 谢逸群 曾凯敏 +1 位作者 王依宁 许宏伟 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1166-1170,共5页
目的:探讨转化生长因子β1(transforming growth factorβ1,TGF-β1)基因多态性与脑梗死的关系。方法:利用多聚酶链反应-限制性片段长度多态性分析法检测247例脑梗死(cerebral infarction,CI)患者及167例性别、年龄匹配的健康体检者-800... 目的:探讨转化生长因子β1(transforming growth factorβ1,TGF-β1)基因多态性与脑梗死的关系。方法:利用多聚酶链反应-限制性片段长度多态性分析法检测247例脑梗死(cerebral infarction,CI)患者及167例性别、年龄匹配的健康体检者-800G>A多态位点的基因型,并计算出各等位基因频率在组中的频率分布。结果:中国湖南汉族人群中存在-800G>A位点多态性。-800G>A基因型在两个人群中的分布符合Hardy-Weinberg平衡,脑梗死组与对照组相比,基因型及等位基因频率分布无统计学差异(P>0.05),Logistic回归分析未发现某种基因型增加或者降低脑梗死发生的风险。结论:TGF-β1-800G>A基因多态性与中国湖南地区汉族人群脑梗死无明显相关性。 展开更多
关键词 脑梗死 转化生长因子Β1 基因多态性 单核苷酸多态性
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中国家族性乳腺癌患者碱基切除修复基因MUTYH的胚系突变研究
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作者 曹文明 高赟 +1 位作者 潘志文 王晓稼 《实用肿瘤杂志》 CAS 2018年第2期133-138,共6页
目的探讨MUTYH基因在中国BRCA1/2突变阴性家族性乳腺癌患者中的突变特点及其与乳腺癌发病的相关性。方法采用测序方法筛查90例中国BRCA1/2突变阴性家族性乳腺癌患者MUTYH基因胚系突变,结合基因组数据库和In silico分析对突变位点进行分... 目的探讨MUTYH基因在中国BRCA1/2突变阴性家族性乳腺癌患者中的突变特点及其与乳腺癌发病的相关性。方法采用测序方法筛查90例中国BRCA1/2突变阴性家族性乳腺癌患者MUTYH基因胚系突变,结合基因组数据库和In silico分析对突变位点进行分类。同时纳入250例散发乳腺癌患者和250例健康女性为对照。通过病例-对照研究,明确突变与乳腺癌发病的相关性。结果共发现6个变异:c.925-2A>G、c.53C>T(p.P18L)、c.74G>A(p.G25D)、c.1005G>C(p.Q335H)、c.1576C>A(p.L526M)和c.1422G>C(p.T474T)。c.1005G>C是最常见的变异,存在杂合型和纯合型,其中GG、GC和CC基因型分别占33.3%(30/90)、46.7%(42/90)和21.1%(19/90)。其他5个变异都为杂合型。c.925-2A>G和c.74G>A发生率在散发性乳腺癌和健康对照组间比较,差异无统计学意义(P>0.05),c.1576C>A在散发性乳腺癌和健康对照组中均未发现。c.925-2A>G在突变家系中与肿瘤的发生不一致。结论 MUTYH基因剪接位点变异c.925-2A>G不是乳腺癌的致病性变异,c.53C>T、c.1005G>C和c.1576C>A与中国家族性乳腺癌的相关性有待进一步研究。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤/遗传学 DNA修复 基因 BRCA1 基因 BRCA2 多态性 单核苷酸 寡核苷酸序列分析 突变 聚合酶链反应 中国
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IL-17A基因和IL-17F基因多态性在评估扩张型心肌病发病风险和预后的意义 被引量:4
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作者 唐辉 裴芳 +5 位作者 裴华 权云帆 王英 唐乙媚 黄骥 黄婕 《心肺血管病杂志》 2017年第11期951-956,共6页
目的:评估白细胞介素17A(IL-17A)和IL-17F单核苷酸多态性(SNPs)与中国重庆地区汉族人群扩张型心肌病(DCM)发生风险和预后的关系。方法:选取112例DCM患者和125例年龄和性别相匹配的健康人群对照,采用聚和酶链反应-限制性内切酶片断长度... 目的:评估白细胞介素17A(IL-17A)和IL-17F单核苷酸多态性(SNPs)与中国重庆地区汉族人群扩张型心肌病(DCM)发生风险和预后的关系。方法:选取112例DCM患者和125例年龄和性别相匹配的健康人群对照,采用聚和酶链反应-限制性内切酶片断长度多态性和DNA测序的方法对IL-17A基因rs2275913(G-197A)和IL-17F基因rs763780(7488C/T)两个功能性SNP进行基因分型,然后运用等统计学方法分析SNPs与DCM遗传易感性及预后的关系。结果:IL-17A基因SNP rs2275913(G-197A)携带_(AA)基因型的个体患DMC的风险是携带GG基因型个体的2.124倍(95%CI_(AA)=1.213-3.964,P_(AA)=0.007);在DCM患者中,rs2 275 913位点_(AA)基因型携带者在NYHA心功能分级Ⅳ级、左心室射血分数<35%及有病毒性心肌炎病史的患者中所占比例显著增高(P<0.05);未发现IL-17F基因SNP rs763780(7488C/T)与DCM的发病和预后相关。结论:本研究首次发现IL-17A基因rs2275913(G-197A)位点SNP可能与DCM的遗传易感性和预后相关。 展开更多
关键词 扩张型心肌病 白细胞介素17A 白细胞介素17F 多态性 单核苷酸
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猪锚蛋白重复序列和SOCS盒蛋白基因4与生长因子受体结合蛋白基因10的克隆及印迹状态分析
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作者 周洋 朱江 +3 位作者 焦明霞 王加强 孔庆然 刘忠华 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第8期1-7,共7页
本试验采用单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)直接测序法检测猪锚蛋白重复序列和SOCS盒蛋白基因4(ankyrin repeat and SOCS box containing protein 4,Asb4)与生长因子受体结合蛋白基因10(growth factor recep-tor-bo... 本试验采用单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)直接测序法检测猪锚蛋白重复序列和SOCS盒蛋白基因4(ankyrin repeat and SOCS box containing protein 4,Asb4)与生长因子受体结合蛋白基因10(growth factor recep-tor-bound protein 10,Grb10)在不同组织器官中的印迹状态。首先,克隆得到了1350bp的Asb4基因cDNA序列及1811bp的Grb10基因cDNA序列,然后进行了SNP直接测序法检测。结果发现,Asb4在1月龄仔猪所有检测组织器官中均为双等位基因表达,而Grb10在1月龄仔猪的舌、肾脏、胃、小肠和脑中为父源等位基因表达,在其他组织器官中为双等位基因表达。实时定量PCR结果表明,Grb10在10种组织器官中的表达量存在显著性差异(P<0.05),其中在肺脏组织中的表达量最高,在小肠和脑中表达量最低。上述结果表明,Grb10可能是猪父源表达的印迹基因,而Asb4则属于猪非印迹基因。 展开更多
关键词 锚蛋白重复序列和SOCS盒蛋白基因4 生长因子受体结合蛋白基因10 单核苷酸多态性 印迹基因
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肿瘤坏死因子-α基因多态性与幽门螺杆菌感染的胃溃疡及吸烟的相关性分析 被引量:4
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作者 王红卫 《实用医技杂志》 2012年第3期229-231,共3页
目的探讨肿瘤坏死因子(TNF)-α基因多态性及与幽门螺杆菌感染的胃溃疡发生的相关性,血浆TNF-α含量与吸烟的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术结合琼脂糖凝胶电泳的方法,检测幽门螺杆菌感染的胃溃疡组及幽门螺杆... 目的探讨肿瘤坏死因子(TNF)-α基因多态性及与幽门螺杆菌感染的胃溃疡发生的相关性,血浆TNF-α含量与吸烟的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术结合琼脂糖凝胶电泳的方法,检测幽门螺杆菌感染的胃溃疡组及幽门螺杆菌感染的健康组的TNF-α基因多态性,同时采用酶联免疫吸附试验比较胃溃疡组吸烟者与不吸烟者的血浆TNF-α含量。结果携带A/A基因型为幽门螺杆菌阳性的胃溃疡患者发病的独立危险因素(OR=3.67,P<0.05),同时发现胃溃疡组吸烟者与非吸烟者相比,外周血TNF-α明显增高(P<0.05)。结论 TNF-α启动子区-308位点多态性与幽门螺杆菌感染的胃溃疡可能相关。吸烟能引起血浆TNF-α含量增高。 展开更多
关键词 肿瘤坏死因子Α 螺杆菌 幽门 胃溃疡 多态性 单核苷酸 吸烟
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闽南地区急性淋巴细胞白血病患儿亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性与甲氨蝶呤的相关性 被引量:13
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作者 陈先睿 温红 +4 位作者 郭碧赟 白海涛 吴谨准 黄建琪 王玥 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2019年第14期1068-1071,共4页
目的研究亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T及A1298C位点多态性与闽南地区儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)化疗用药甲氨蝶呤(MTX)不良反应易感性的相关性。方法选取2015年1月至2018年6月厦门大学附属第一医院儿科收治的128例闽南地区AL... 目的研究亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T及A1298C位点多态性与闽南地区儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)化疗用药甲氨蝶呤(MTX)不良反应易感性的相关性。方法选取2015年1月至2018年6月厦门大学附属第一医院儿科收治的128例闽南地区ALL患儿,采集其外周血2 mL,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应(PCR)直接测序方法检测MTHFR基因C677T和A1298C基因型,依据国立癌症研究所毒性判定标准评估ALL患儿MTX不良反应。结果128例患儿中,54例(42.2%)出现皮疹,48例(37.5%)出现黏膜损害,51例(39.8%)出现肝损害,23例(18.0%)出现肾损害,52例(40.6%)出现胃肠道反应,38例(29.7%)出现白细胞减少,34例(26.6%)出现血小板减少,63例(49.2%)出现血红蛋白下降。MTHFR C677T和A1298C基因不同基因型组的MTX化疗不良反应(皮疹、黏膜损害、肝肾损害、胃肠道反应、白细胞减少、血红蛋白下降和血小板减少)的发生率比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。患儿不同临床危险度(MTX剂量)分组在MTHFR C677T和A1298C的基因型和等位基因频率中分布差异无统计学意义(χ^2=2.573、2.264、1.615、0.267,均P>0.05)。24 h、48 h和72 h MTX血药浓度异常发生率差异无统计学意义(均P>0.05)。结论MTHFR的C677T和A1298C多态性可能不是预测闽南地区儿童ALL MTX化疗的良好指标,其临床应用仍需进一步探讨。 展开更多
关键词 淋巴细胞白血病 急性 亚甲基四氢叶酸还原酶 甲氨蝶呤 单核昔酸多态性
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CYP3A5^*3基因多态性对病人芬太尼镇痛效应的影响 被引量:2
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作者 张卫 袁静静 +4 位作者 阚全程 常琰子 张莉蓉 王中玉 赵二贤 《中华麻醉学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1083-1086,共4页
目的探讨CYP3A5^*3基因多态性对病人芬太尼镇痛效应的影响。方法择期全麻下行腹式子宫全切术或子宫肌瘤剔除术的病人180例,河南籍,汉族,年龄20~50岁,ASAⅠ或Ⅱ级。采用聚合酶链反应一限制性片断长度多态性技术进行CYP3A5^*3多态... 目的探讨CYP3A5^*3基因多态性对病人芬太尼镇痛效应的影响。方法择期全麻下行腹式子宫全切术或子宫肌瘤剔除术的病人180例,河南籍,汉族,年龄20~50岁,ASAⅠ或Ⅱ级。采用聚合酶链反应一限制性片断长度多态性技术进行CYP3A5^*3多态性位点检测,根据基因型将病人分为野生型纯合子组、突变型杂合子组和突变型纯合子组。病人清醒后行视觉模拟评分(VAS),当VAS评分〉3分时,则间断静脉注射芬太尼20μg,直至VAS评分≤3分时开始病人自控静脉镇痛,维持VAS不超过3分。记录病人自控静脉镇痛24h内芬太尼的用量。结果3组病人自控静脉镇痛24h内芬太尼用量比较差异无统计学意义(P〉0.05)。结论CYP3A5^*3基因多态性不是芬太尼静脉镇痛效应个体差异的遗传因素。 展开更多
关键词 细胞色素P450酶系统 多态性 单核苷酸 芬太尼 镇痛 病人控制
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人脑胶质母细胞瘤中核因子-κB抑制因子α多态性的研究 被引量:1
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作者 赵朝辉 李炎炎 +5 位作者 吴庭枫 杨天权 陈桂林 谢学顺 周幽心 杜子威 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1279-1281,共3页
目的探讨人脑胶质母细胞瘤中核因子-κB抑制因子d(NFKBIA)蛋白水平及其与NFKBIA mRNA表达水平、变异、拷贝数变异的关系。方法收集24例胶质母细胞瘤组织标本,应用聚合酶链反应(PCR)扩增及直接测序检测NFKBIA变异,Western blot检测... 目的探讨人脑胶质母细胞瘤中核因子-κB抑制因子d(NFKBIA)蛋白水平及其与NFKBIA mRNA表达水平、变异、拷贝数变异的关系。方法收集24例胶质母细胞瘤组织标本,应用聚合酶链反应(PCR)扩增及直接测序检测NFKBIA变异,Western blot检测NFKBIA蛋白表达,实时定量PCR检测NFKBIA拷贝数变异及mRNA表达。结果胶质母细胞瘤中存在NFKIBA单核苷酸多态性rs1957106(CC/CT/TT);胶质母细胞瘤中NFKBIA蛋白表达量在CT基因型和TT基因型显著低于CC基因型:CT和TT:(10.1±1.2)%、CC:(40.1±2.8)%;胶质母细胞瘤中NFKBIA蛋白表达量和NFKBIA mRNA表达水平均显著低于非瘤组织:肿瘤组织中NFKBIA的相对表达分别为:(28.2±12.5)%、(0.44±0.19),非瘤组织中NFKBIA的相对表达分别为:(64.3±1.7)%、(0.78±0.12);而且含有CT基因型和TT基因型的胶质母细胞瘤NFKBIA mRNA表达水平明显低于含有CC基因型的胶质母细胞瘤:CT和TT:0.31±0.11,CC:0.54±0.18;P〈0.01;含有CT基因型或TT基因型的10个胶质母细胞瘤中有7个的拷贝数显著低于含有CC基因型的肿瘤,而这些胶质母细胞瘤同时有低NFKBIA蛋白及低NFKBIA mRNA表达水平。结论NFKBIA单核苷酸多态性rs1957106与NFKRTA低蛋表达、低拷贝数密切相关。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 核因子-κB抑制因子α 核因子-ΚB 单核苷酸多态性
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