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中国维吾尔族人群SLITRK1基因多态性与精神分裂症关联性研究
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作者 史新玉 安治国 +6 位作者 孙乐乐 罗晓 闫萍 杜雯 靳路 高帅帅 伊琦忠 《临床精神医学杂志》 CAS 2024年第3期174-177,共4页
目的:探讨SLITRK1基因多态性与中国维吾尔族人群精神分裂症的关联性。方法:利用多重PCR靶向捕获二代测序技术对1 008例维吾尔族精神分裂症患者(病例组)及1 095例维吾尔族健康对照(对照组)进行SLITRK1基因外显子区域DNA扩增,高通量测序,... 目的:探讨SLITRK1基因多态性与中国维吾尔族人群精神分裂症的关联性。方法:利用多重PCR靶向捕获二代测序技术对1 008例维吾尔族精神分裂症患者(病例组)及1 095例维吾尔族健康对照(对照组)进行SLITRK1基因外显子区域DNA扩增,高通量测序,采用阳性与阴性症状量表(PANSS)对纳入研究患者进行临床精神病性症状的评定。结果:病例组与对照组间SLITRK1基因rs145628951位点等位基因和基因型频率分布差异无统计学意义(P均>0.05);青少年发病病例组与对照组、成年发病病例组与对照组间rs145628951位点等位基因和基因型频率分布差异均无统计学意义(P均>0.05);男性病例组与对照组、女性病例组与对照组间rs145628951位点等位基因和基因型频率分布差异均无统计学意义(P>0.05);病例组中rs145628951位点A/A、A/C、C/C基因型3组间PANSS评分差异无统计学意义(P>0.05)。结论:SLITRK1基因rs145628951位点多态性与中国维吾尔族人群精神分裂症的发病无关联性。 展开更多
关键词 精神分裂症 slitrk1基因 维吾尔族 关联性研究
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大黄鱼slitrk3基因启动子克隆及转录调控分析
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作者 周锐涛 岳珠峰 +4 位作者 纪焦军 温靖 姜丹 王志勇 方铭 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期68-76,共9页
神经突触相关蛋白Slitrk3具有调节抑制性突触发育的作用。研究大黄鱼(Larimichthys crocea)神经突触黏附分子slitrk3基因的转录调控机制,可为解决大黄鱼养殖面临的生长、应激及抗逆等问题提供新思路。通过生物信息学方法对大黄鱼及其他... 神经突触相关蛋白Slitrk3具有调节抑制性突触发育的作用。研究大黄鱼(Larimichthys crocea)神经突触黏附分子slitrk3基因的转录调控机制,可为解决大黄鱼养殖面临的生长、应激及抗逆等问题提供新思路。通过生物信息学方法对大黄鱼及其他物种的Slitrk3氨基酸进行多重序列比对和系统进化树分析,并预测大黄鱼slitrk3基因启动子区域相关的调控元件,采用双荧光素酶报告基因系统检测大黄鱼slitrk3基因启动子区域的转录活性。生物信息学分析结果显示,Slitrk3氨基酸序列在鱼类中具有较高的保守性;大黄鱼slitrk3基因启动子区域预测存在2个潜在的转录起始位点、2个CpG岛以及Sp1、GR、C/EBPα和C/EBPβ等多种转录因子结合位点。双荧光素酶报告基因系统结果显示,大黄鱼slitrk3基因启动子区域的−1970—−1614 bp、−1210—−667 bp存在正调控元件,−1614—−1210 bp、−667—−376 bp、−376—−147 bp存在负调控元件,推测−147—+16 bp为核心启动子。 展开更多
关键词 大黄鱼 slitrk3基因 启动子 转录调控
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Slitrk基因家族的研究进展 被引量:4
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作者 靳雁斌 范文红 范明 《国际病理科学与临床杂志》 CAS 2006年第2期159-161,165,共4页
Slitrk基因家族是一类调节神经突生长的结构相关的跨膜蛋白,有6个成员。Slitrk蛋白有氨基末端的亮氨酸重复序列(LRR s)和羧基末端的酪氨酸残基2个保守结构域,它们分别与轴突导向因子Slit和神经营养因子受体TrkA的相应结构同源,且功能有... Slitrk基因家族是一类调节神经突生长的结构相关的跨膜蛋白,有6个成员。Slitrk蛋白有氨基末端的亮氨酸重复序列(LRR s)和羧基末端的酪氨酸残基2个保守结构域,它们分别与轴突导向因子Slit和神经营养因子受体TrkA的相应结构同源,且功能有相近之处。人与鼠Slitrk家族各成员的氨基酸序列高度同源。除Slitrk6外Slitrk其他成员的表达都局限于神经组织,Slitrk1,Slitrk2的分布具有互补性。Slitrk基因还在多种神经上皮肿瘤中有不同程度的表达。 展开更多
关键词 slitrk SLIT TRKA LRR 酪氨酸残基
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Slitrk家族在精神疾病中作用的研究现状 被引量:1
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作者 王媛 肖泽萍 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1402-1405,共4页
精神疾病的病因学研究一直是精神医学领域研究的重点和热点,但多数精神疾病的病因及发病机制目前仍未能完全阐明,遗传学是研究最为关注的领域之一。近年来,Slitrk家族在精神疾病发病机制中的作用逐渐受到研究者的重视。该文就Slitrk家... 精神疾病的病因学研究一直是精神医学领域研究的重点和热点,但多数精神疾病的病因及发病机制目前仍未能完全阐明,遗传学是研究最为关注的领域之一。近年来,Slitrk家族在精神疾病发病机制中的作用逐渐受到研究者的重视。该文就Slitrk家族在精神疾病中作用的研究现状作一综述。 展开更多
关键词 精神疾病 TOURETTE综合征 强迫症 拔毛癖 精神分裂症 slitrk
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人Slitrk1基因对PC12细胞增殖和分化的影响
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作者 靳雁斌 吴燕 +5 位作者 王晓文 吴海涛 景孝堂 刘毅 范文红 范明 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1043-1046,共4页
目的研究人Slitrk1基因过表达对PC12细胞增殖和分化的影响。方法PCR扩增人Slitrk1CDS,克隆到pcDNA4/myc-HisA载体,构建重组质粒pcDNA4/St1,分别以空载体和重组质粒转染PC12细胞,RT-PCR法鉴定出阳性转染细胞,观察空载体转染的PC12细胞(pc... 目的研究人Slitrk1基因过表达对PC12细胞增殖和分化的影响。方法PCR扩增人Slitrk1CDS,克隆到pcDNA4/myc-HisA载体,构建重组质粒pcDNA4/St1,分别以空载体和重组质粒转染PC12细胞,RT-PCR法鉴定出阳性转染细胞,观察空载体转染的PC12细胞(pcDNA4/PC12)和过表达Slitrk1的PC12细胞(ST1/PC12)的表型并用MTT法检测细胞增殖情况。结果与空载体转染的PC12细胞相比,过表达Slitrk1基因的细胞增殖速度明显减慢。pcDNA4/PC12与野生型PC12细胞表型一致,均为悬浮成团生长,细胞少有突起,而ST1/PC12细胞大部分贴壁生长,突起多见,呈分化状态。结论过表达人Slitrk1基因能够抑制PC12细胞增殖,促进细胞的贴壁及突起长出。人Slitrk1基因可能有促进PC12细胞神经分化的作用。 展开更多
关键词 基因 slitrk1 PC12细胞 细胞分化
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Slitrk1基因和中国汉族抽动秽语综合症患者抑郁关系研究
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作者 季卫东 李宁 《心理学进展》 2019年第6期1027-1032,共6页
目的:探讨Slitrk1基因单核苷酸多态性与中国汉族抽动秽语综合症抑郁症状之间的关联性。方法:釆用病例对照研究,纳入研究的中国汉族抽动秽语综合症患者1000例,对照1000例,收集一般人口学资料及临床数据,应用Excel软件建立数据库。提取研... 目的:探讨Slitrk1基因单核苷酸多态性与中国汉族抽动秽语综合症抑郁症状之间的关联性。方法:釆用病例对照研究,纳入研究的中国汉族抽动秽语综合症患者1000例,对照1000例,收集一般人口学资料及临床数据,应用Excel软件建立数据库。提取研究对象全基因组DNA,利用Taqman探针分型技术对Slitrk1基因中四个单核苷酸多态性位点进行基因型的测定,采用SHEsis软件平台,在两组人群中进行基因型频率的分析。结果:Slitrk1基因4个SNPs位点在人群中的分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(P >0.05)。基因rs144821830位点的基因型分布频率在两组间差异有统计学意义(P = 0.005),其中病例组中CT基因型频率高于对照组,TT基因型频率低于对照组;基因rs3737193、rs144800086、rs145628951位点的基因型频率在两组间均无差异(p 0.05)。结论:Slitrk1基因(rs144821830)位点与中国汉族人群中国汉族抽动秽语综合症相关联,Slitrk1基因可能参与了中国汉族抽动秽语综合症的发病机制。没有发现Slitrk1基因(rs144821830)和中国汉族抽动秽语综合症患者的抑郁症状之间的关系。 展开更多
关键词 中国汉族抽动秽语综合症 slitrk1基因 抑郁 基因组扫描 单核苷酸多态性 Taqman探针技术
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非小细胞肺癌组织中Slitrk5的表达及意义 被引量:1
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作者 孙金鹏 田涛 +2 位作者 陈玲 刘燕春 孔继昌 《山东医药》 CAS 北大核心 2017年第6期43-45,共3页
目的观察非小细胞肺癌(NSCLC)组织中Slitrk5的表达情况,探讨其与患者临床病理特征的关系。方法收集69例NSCLC患者手术切除的癌组织及癌旁组织,采用qRT-PCR法检测Slitrk5 mRNA表达,免疫组化染色法观察Slitrk5蛋白表达情况,Western blot... 目的观察非小细胞肺癌(NSCLC)组织中Slitrk5的表达情况,探讨其与患者临床病理特征的关系。方法收集69例NSCLC患者手术切除的癌组织及癌旁组织,采用qRT-PCR法检测Slitrk5 mRNA表达,免疫组化染色法观察Slitrk5蛋白表达情况,Western blot法检测Slitrk5蛋白表达量,并分析Slitrk5蛋白高表达与NSCLC患者临床病理特征的关系。结果癌组织中Slitrk5 mRNA及蛋白表达均显著高于癌旁组织(P均<0.05)。Slitrk5蛋白高表达在NSCLC患者不同性别、年龄、肿瘤直径、TNM分期、病理分型及有无淋巴结转移间比较差异均无统计学意义(P均>0.05)。结论 Slitrk5在NSCLC肺癌组织中高表达,可能与NSCLC的发生相关。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 神经跨膜蛋白 slitrk5 肿瘤分化程度
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SLITRK3 expression correlation to gastrointestinal stromal tumor risk rating and prognosis 被引量:2
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作者 Chao-Jie Wang Zi-Zhen Zhang +8 位作者 Jia Xu Ming Wang Wen-Yi Zhao Lin Tu Chun Zhuang Qiang Liu Yan-Yin Shen Hui Cao Zhi-Gang Zhang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2015年第27期8398-8407,共10页
AIM: To assess the influence of SLIT and NTRKlike family member 3(SLITRK3) on the prognosis of gastrointestinal stromal tumor(GIST) and determine whether SLITRK3 can help improve current risk stratification systems.ME... AIM: To assess the influence of SLIT and NTRKlike family member 3(SLITRK3) on the prognosis of gastrointestinal stromal tumor(GIST) and determine whether SLITRK3 can help improve current risk stratification systems.METHODS: We hypothesized that SLITRK3 could be used as a prognostic molecular biomarker for GIST. 35 fresh tumor samples and 417 paraffin-embedded specimens from GIST patients were utilized. SLITRK3m RNA expression in GIST tumor tissue was detected by real-time polymerase chain reaction, and SLITRK3 protein levels were estimated by immunohistochemistry. The correlation of SLITRK3 expression with various tumor clinicopathological characteristics and follow-up data were analyzed.RESULTS: GIST tumors had high expression of SLITRK3 compared with adjacent normal tissues and the expression level gradually increased with risk grade. SLITRK3 protein expression was closely associated with gastrointestinal bleeding, tumor site, tumor size, mitotic index, and National Institutes of Health(NIH) classification. Survival analysis showed that SLITRK3 expression was closely correlated with overall survival and disease-free survival of GIST patients. Multivariate analysis also identified SLITRK3 expression, mitotic index, and NIH stage as significant risk factors of GIST recurrence.CONCLUSION: SLITRK3 expression is a highly significant predictor of GIST recurrence and metastasis. Combinations of SLITRK3 and NIH stage have strong predictive and prognostic value, and are feasible markers for clinical practice in gastrointestinal stromal tumor. 展开更多
关键词 slitrk3 GASTROINTESTINAL STROMAL tumor Biomarkers Non-epithelial TUMORS Risk STRATIFICATION
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SliTrk5在脑胶质瘤组织中的表达及临床意义
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作者 刘浩然 毕艳华 《现代肿瘤医学》 CAS 2018年第11期1688-1691,共4页
目的:检测Sli Trk家族成员Sli Trk5在脑胶质瘤组织中的表达,并探讨其在脑胶质瘤组织与正常脑组织中Sli Trk5的表达差异,分析其与脑胶质瘤临床病理特征的关系。方法:收集96例脑组织标本,包含6例正常脑组织和90例脑胶质瘤组织,采用免疫组... 目的:检测Sli Trk家族成员Sli Trk5在脑胶质瘤组织中的表达,并探讨其在脑胶质瘤组织与正常脑组织中Sli Trk5的表达差异,分析其与脑胶质瘤临床病理特征的关系。方法:收集96例脑组织标本,包含6例正常脑组织和90例脑胶质瘤组织,采用免疫组织化学染色及Western blot检测SliTrk5的蛋白表达水平,分析SliTrk5表达与脑胶质瘤临床病理特征的关系,同时进行RT-PCR检测SliTrk5在脑胶质瘤中的mRNA水平。结果:免疫组化结果显示,脑胶质瘤组织中SliTrk5表达较正常脑组织明显上调,差异具有统计学意义(P<0.05)。Western blot和RT-PCR的检测结果与免疫组化一致。根据不同病理特征比较高表达与低表达例数发现,SliTrk5在脑胶质瘤组织中的高表达与患者病理分级显著相关(P<0.05)。结论:SliTrk5在脑胶质瘤组织中异常表达,并与病理分级相关。 展开更多
关键词 脑胶质瘤 slitrk5 蛋白表达 免疫组化
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山东地区汉族人群SLITRK6基因多态性与抽动秽语综合征遗传易感性关系的研究
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作者 张绪展 李慧 +4 位作者 李桂霞 吕富岩 刘文淼 张铷 刘世国 《精准医学杂志》 2018年第6期520-522,526,共4页
目的探讨山东地区汉族人群SLITRK6基因多态性与抽动秽语综合征(TS)间的关联性。方法共有295例TS核心家庭成员纳入本次研究,采用Taqman探针实时荧光定量PCR技术对TS核心家系成员SLITRK6基因rs3825413和rs7336083位点多态性进行检测,采用... 目的探讨山东地区汉族人群SLITRK6基因多态性与抽动秽语综合征(TS)间的关联性。方法共有295例TS核心家庭成员纳入本次研究,采用Taqman探针实时荧光定量PCR技术对TS核心家系成员SLITRK6基因rs3825413和rs7336083位点多态性进行检测,采用传递不平衡检验(TDT)、单倍型相对风险分析(HRR)和基于单倍型的单倍型相对风险分析(HHRR)评估SLITRK6基因的两个单核苷酸多态性位点(SNP)与TS的关联性。结果 TDT和HRR结果均表明,SLITRK6基因rs3825413和rs7336083位点与TS之间均不存在明显关联。HHRR结果同样表明,SLITRK6基因rs3825413和rs7336083位点与TS之间差异无统计学意义。结论SLITRK6基因rs3825413和rs7336083位点基因多态性与山东地区汉族人群TS的发病无明显关联,但仍需以更大样本量在不同种族中进行验证。 展开更多
关键词 slitrk6基因 多动秽语综合征 多态性 单核苷酸 疾病遗传易感性 山东 汉族
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SLITRK6,RASGRF1基因多态性与高度近视的关联分析
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作者 李宇飞 宫晓婷 +1 位作者 郝岗平 孟超 《中文科技期刊数据库(全文版)医药卫生》 2021年第10期43-45,共3页
探讨RASGRF1和SLITRK6基因上的6个SNP位点与山东某地汉族人群高度近视易感性之间的关联性,为近视有效防治提供理论依据。方法:本研究共选取101例高度近视患者和111例正常受试者的外周血样本。采用MassARRAY技术对所研位点进行基因分型,... 探讨RASGRF1和SLITRK6基因上的6个SNP位点与山东某地汉族人群高度近视易感性之间的关联性,为近视有效防治提供理论依据。方法:本研究共选取101例高度近视患者和111例正常受试者的外周血样本。采用MassARRAY技术对所研位点进行基因分型,并进行统计分析。结果:父母近视状况与近视的发生显着相关(P<0.001)。病例组和对照组基因型和等位基因频率无统计学差异(P>0.05)。结论:RASGRF1和SLITRK6基因所研位点与人群高度近视易感性无明显关联,但近视患者具有更多的家族史。 展开更多
关键词 高度近视 SNPS slitrk6 RASGRF1
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miR-429对抽动障碍靶基因调控的生物信息学分析
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作者 江极龙 陈燕惠 +1 位作者 黄惠芳 黄玉娴 《中国儿童保健杂志》 CAS CSCD 2023年第3期268-273,共6页
目的通过生物信息学分析,并将miR-429靶基因与抽动障碍(TD)相关基因(TRGs)关联,预测TD相关靶基因,以更好地理解miR-429在TD中的作用。方法通过miRbase数据库获取多物种成熟miR-429的序列,进行保守性分析。通过GeneCards和DisGeNET数据... 目的通过生物信息学分析,并将miR-429靶基因与抽动障碍(TD)相关基因(TRGs)关联,预测TD相关靶基因,以更好地理解miR-429在TD中的作用。方法通过miRbase数据库获取多物种成熟miR-429的序列,进行保守性分析。通过GeneCards和DisGeNET数据库获取TRGs,并将miRDB数据库及DIANA数据库的microT工具预测的miR-429的靶基因与TRGs取交集获得TD相关靶基因。运用RNAhybird数据库对杂交的位点序列和最小自由能(MFE)进行预测。通过DAVID数据库对TD相关靶基因进行功能富集分析。结果miR-429的22个核苷酸中仅2个核苷酸在物种间存在差异,总共获得9个基因为TD相关靶基因。仅ASH1L、SLITRK 1与miR-429杂交的序列中未包含物种间存在差异的核苷酸,最小的杂交MFE的基因为CHD2(-25.0 kcal/mol)。功能富集分析各分类的首个功能术语为生物学过程的成人行为,细胞组分的谷氨酸能突触,以及分子功能的染色质结合。未获得有统计学意义的通路富集。结论miR-429可能通过相关基因调控谷氨酸能突触而影响TD行为,尤其是SLITRK1基因。 展开更多
关键词 miR-429 谷氨酸能 slitrk1基因 生物信息学分析 抽动障碍
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