Sp110基因rs1135791、rs722555多态性与结核病的相关性研究

[目的]研究Sp110基因rs1135791、rs722555多态性与肺结核易感性的关系。[方法]采用病例对照研究,选取重庆地区100例肺结核患者和106例健康对照,运用嵌套式等位基因特异性引物PCR技术检测Sp110基因rs1135791C/T位点和rs722555A/G位点基因型,运用χ2检验分析其基因型频率和等位基因频率与肺结核的相关性。[结果]病例组rs1135791CT基因型、C等位基因频率均高于对照组,差异有统计学意义(P﹤0.05),OR值分别为1.9795和1.6951;病例组rs722555GG基因型、G等位基因频率均高于对照组,差异有统计学意义(P﹤0.05),OR值分别为2.0235和1.5874。[结论]Sp110基因rs1135791、rs722555多态性可能是重庆地区汉族人群肺结核遗传易感性的危险因素。

Sp110基因5’-UTRrs11679983SNP与肺结核易感相关性研究

[目的]探讨Sp110基因5’-UTR rs11679983位点单核苷酸多态性对重庆籍汉族人群肺结核易感性的影响。[方法]采用病例-对照研究,选择100名初治涂阳肺结核患者和106名非结核病对照,运用ASA-PCR技术检测研究对象的基因型,比较Sp110基因5’-UTR rs11679983位点基因型频率及等位基因频率分布。[结果]Sp110基因5’-UTR rs11679983位点A/A、A/G、G/G基因型频率在病例组分别为21.00%、56.00%、23.00%;对照组分别为41.51%、54.72%、3.77%,两组间基因型分布差异有统计学意义(χ2=18.11,P﹤0.001)。Logistic回归分析显示rs11679983A/G与肺结核相关(OR=2.84,95%CI:1.76～4.59,P﹤0.001)。[结论]Sp110基因rs11679983位点基因多态与肺结核易感性相关。

SP110和VDR基因多态性与结核病的关联及其与环境因素的交互作用

目的探讨SP110和维生素D受体(VDR)基因多态性、环境因素与结核病的联系及交互作用。方法采用病例对照研究方法,以198例确诊肺结核病例为病例组,与病例组年龄、性别成组匹配的195例健康人作为对照组,用高分辨率溶解曲线技术(HRM)检测VDR基因(TaqI、FokI)、SP110基因(rs1135791、rs722555)多态性,并收集传统环境因素暴露情况。采用SPSS18.0软件包进行数据管理和分析。结果病例组中VDR基因FokI-ff、SP110基因rs722555 G/G和rs1135791 C/T的分布频率显著高于对照组(P<0.05),且以野生型为参照,OR值及OR95%CI值下限均大于1。吸烟、结核病患者接触史、FokI-ff和rs722555基因型G/G进入多因素logistic回归模型,其中同时具备FokI-ff与吸烟、结核病患者接触史的人群以及同时具备吸烟、FokI-ff与rs722555-G/G人群发生结核病的危险性明显高于各个因素独立时的危险性。结论 FokI-ff、rs722555-G/G与结核病发生相关,且与环境间存在一定正交互作用。

Sp110基因与肺结核易感相关性研究

目的:研究Sp110基因rs1135791r、s722555r、s116799831r、s3948464位点基因多态性与重庆市汉族人群肺结核发病的关系。方法:采用病例对照研究设计,检测rs1135791r、s722555r、s116799831r、s3948464位点SNP多态性,用SAS软件进行显著性检验。结果:(1)Sp110基因rs1135791 CT基因型r、s722555 GG基因型r、s116799831 GG基因型r、s3948464 CC基因型在病例组的频率明显高于对照组;(2)病例组rs1135791 C等位基因r、s722555 G等位基因r、s116799831 G等位基因r、s3948464C等位基因频率都高于对照组,差异有统计学意义。结论:rs1135791 C/Tr、s722555 A/Gr、s116799831 A/Gr、s3948464 C/T可能是重庆市汉族人群肺结核易患的危险因素。

宜宾地区汉族人群Sp110基因多态性与肺结核易感性的相关性

目的探讨宜宾地区汉族人群Sp110基因多态性与肺结核易感性的相关性。方法选择2011年1月—2012年12月按病例对照研究设计选取112例肺结核患者和140例健康人作为研究对象,比较两组的一般资料,测定其Sp110基因2个SNP位点(rs11679983、rs3948464)的基因型,探索其与肺结核易感性的相关性。结果 (1)观察组和对照组吸烟史(49.1%vs33.6%)和家族结核病史(23.2%vs 9.3%)差异有统计学意义(P<0.05);(2)观察组rs11679983 G等位基因频率(51.8%vs33.6%)、rs3948464 C等位基因频率(92.9%vs 81.4%)高于对照组(P<0.05),其OR分别为2.13和2.97;(3)两组患者rs11679983和rs3948464的基因型分布不一致(P<0.05)。结论 Sp110基因的rs11679983A/G和rs3948464C/T位点多态性可能是该地区汉族人群肺结核易感性的影响因素。

SP110基因rs1135791多态性与藏族肺结核病易感性研究

目的研究SP110基因rs1135791单核苷酸多态性在世居藏族人群中的分布及其肺结核易感相关性。方法采用病例对照研究方法,以343名藏族肺结核患者为病例组,对照组为与病例组年龄、性别成组匹配的260例藏族健康人群,采用iMLDR分型技术检测SP110基因rs1135791多态性。结果SP110基因rs1135791位点T/T、T/C、C/C基因型频率在病例组分别为61.5%、33.2%、5.3%;对照组分别为63.5%、32.7%、3.8%,两组间基因型分布差异无统计学意义(x^2=0.73;p=0.69)。对rs1135791等位基因频率分析显示,T等位基因在病例组中和对照组中出现的概率分别为78.1%、79.8%,C等位基因在病例组和对照组中的出现的概率分别为21.9%、20.2%,两组间等位基因分布差异无统计学意义(x^2=0.50;p=0.48)。结论 SP110基因rs1135791多态性位点可能不是藏族肺结核人群的危险因素。

双荧光素酶报告技术验证miR-6857-3p对SP110基因的靶向调控作用

目的:通过双荧光素酶报告系统验证miR-6857-3p对SP110基因的靶向调控作用。方法:从人巨噬细胞基因组中获取SP110基因的3′UTR序列,构建SP110基因的3′UTR野生型及SP110的3′UTR突变型双荧光素酶报告基因载体,分别将双荧光素酶报告质粒(psi CHECK-2-SP110-3′UTR和psi CHECK-2-SP110-3′UTR-6857mut)和miRNA质粒(miR-6857-3p mimic、miR-4772-3p mimic、miR-4659b-3p mimic和miRNA mimic nc)共转染到293T细胞,进行荧光活性测定。结果:与对照组相比,携带miR-6857-3p mimic和SP110野生型3'UTR的构建体的相对荧光素酶活性产生明显下降(P<0.001),SP110突变型3'UTR的构建体的相对荧光素酶活性下降没有统计学意义(P>0.05)。结论:miR-6857-3p可以直接靶向SP110的3′UTR序列,SP110是miR-6857-3p的直接靶基因。

siRNA下调Sp110基因沉默对小鼠巨噬细胞的生物学作用

目的:利用siRNA基因沉默技术特异性抑制小鼠巨噬细胞RAW264.7细胞Sp110基因的表达,为了解结核病的发病机制提供理论依据。方法:人工合成针对Sp110基因的siRNA,利用脂质体转染的方法导入RAW264.7细胞中,通过显微镜观察细胞形态,通过RT-qPCR技术及western blot检测Sp110基因表达量。结果:siRNA可抑制Sp110基因的表达,与对照组相比,siRNA组mRNA表达下降明显,组间比较差异有统计学意义(P<0.05);Sp110基因蛋白表达量下降,与对照组相比,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:瞬时转染siRNA可特异有效地下调Sp110基因的表达,为进一步明确结核病的发病机制提供理论依据。

SP110基因过表达慢病毒载体的构建与包装

目的构建核体蛋白SP110基因过表达慢病毒载体,并进行慢病毒包装,为研究SP110在结核病中的作用机制奠定基础。方法利用PCR技术获得SP110基因序列并将其插入到慢病毒穿梭质粒LV5中,获得重组慢病毒质粒V-SP110,经酶切鉴定及DNA测序鉴定后,用RNAi-Mate将重组质粒和慢病毒包装质粒系统(pGag/Pol、pRev、pVSV-G)包装成重组慢病毒颗粒,共转染293T细胞,包装产生慢病毒。通过荧光显微镜或FACS计数荧光细胞,结合稀释倍数计算病毒滴度。结果酶切鉴定结果显示产生约1650 bp的片段,片段大小与SP110基因cDNA大小一致。DNA测序比对测序结果与预期SP110基因序列完全一致,说明SP110基因正确插入载体中,成功构建了SP110基因过表达载体。经293T细胞包装后,成功获得病毒滴度为1.0×10^8 TU/mL的重组慢病毒LV5-SP110。结论SP110基因过表达慢病毒载体构建与包装成功完成,为进一步探讨SP110基因在结核病发生发展中的作用提供工具。

SP110基因过表达对THP-1细胞体外抗结核杆菌作用的研究

目的:观察SP110基因过表达对人单核巨噬细胞株THP-1生长状态的影响,探讨SP110基因过表达对THP-1体外杀伤结核分枝杆菌H37Ra作用的影响。方法:构建SP110基因过表达模型,体外感染结核分枝杆菌H37Ra,感染24h、96h后细胞裂解物细菌培养菌落计数(CFU)的方法观察实验组细胞、对照组细胞抗结核分枝杆菌H37Ra感染活性。结果:在mRNA水平实验组细胞SP110基因获得高表达;MTT法检测未发现SP110基因的过表达对THP-1巨噬细胞的生长有显著的影响;体外抗分枝杆菌H37Ra显示H37Ra感染24h后实验组巨噬细胞裂解物CFU与对照组无差异,而感染96h后实验组CFU低于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:SP110基因的过表达增强了巨噬细胞杀伤胞内吞噬的结核分枝杆菌H37Ra的能力,对巨噬细胞的增殖无抑制作用。

SP110基因rs722555和rs11679983多态性与结核病易感性的Meta分析

目的:基于Meta分析方法更全面地评价SP110基因多态性与结核病之间的关系。方法:在CBM、CNKI、维普、万方、PubMed、Web of science、EMBASE、Cochrane library等数据库中,检索2022年10月前国内外已发表的关于SP110基因SNPs与结核病易感性相关的文献,由两名研究者共同分析提取SP110基因研究较多的两个SNP位点(rs722555、rs11679983)的基本信息及数据,分别对两个SNP位点的5个模型(等位基因、杂合、纯合、显性与隐性)进行Meta分析。利用RevMan5.3软件进行效应量的合并以及Stata14.0软件进行Egger’s检验评价发表偏倚。结果:最终纳入10篇文献,其中rs722555位点包含病例组831例,对照组923例,rs11679983位点包含病例组3295例,对照组3284例。结果显示SP110基因rs722555多态性病例组与对照组间差异在统计学上无意义,5个模型即等位基因(A vs.G:OR=0.866,95%CI:0.632~1.188,P=0.372),杂合子(AG vs.GG:OR=0.74,95%CI:0.50~1.10,P=0.14),纯合子(AA vs.GG:OR=0.73,95%CI:0.38~1.41,P=0.34),显性(AA+AG vs.GG:OR=0.74,95%CI:0.47~1.17,P=0.19)与隐性(AA vs.AG+GG:OR=0.91,95%CI:0.59~1.40,P=0.66)。SP110基因rs11679983多态性病例组与对照组间差异在统计学上无意义,5个模型即等位基因(A vs.G:OR=0.89,95%CI:0.57~1.39,P=0.61),杂合(AG vs.GG:OR=1.26,95%CI:0.65~2.44,P=0.49),纯合(AA vs.GG:OR=1.12,95%CI:0.39~3.20,P=0.83),显性(AA+AG vs.GG:OR=1.13,95%CI:0.62~2.03,P=0.70)与隐性(AA vs.AG+GG:OR=0.87,95%CI:0.56~1.33,P=0.51)。结论:SP110基因SNP(rs722555与rs11679983)与结核病易感性可能不相关。

Sp110基因多态性与重庆汉族肺结核遗传易感性关联性研究

目的研究Sp110基因SNP位点多态性与重庆市汉族人群肺结核发病的关系。方法采用病例-对照研究设计,问卷调查收集肺结核相关危险因素;多种方法检测rs1135791C/T、rs722555A/G、5′-UTRrs11679983A/G、rs28930679C/T、rs9061A/G、rs1063154G/T、rs1047254A/G、rs3948464C/T位点SNP多态性,用SAS软件进行显著性检验,用MDR软件分析与肺结核易患性相关的SNP位点的交互作用。结果 (1)Sp110基因rs1135791CT基因型、rs722555GG基因型、rs11679983GG基因型、rs3948464CC基因型在病例组的频率明显高于对照组;(2)Logistic回归分析rs1135791C/T、rs722555A/G、rs11679983A/G、rs3948464C/T基因型,吸烟史、家庭中有结核病人、人均居住面积及BMI与重庆地区汉族肺结核的易患性有关;(3)Sp110基因rs722555A/G与rs1135791C/T、rs11679983A/G、rs3948464C/T3个位点有交互作用。结论 rs1135791C/T、rs722555A/G、rs11679983A/G、rs3948464C/T可能是重庆市汉族人群肺结核易患的危险因素。

SP110基因rs11679983A/G多态性与中国南方汉族肺结核易感性研究

目的探讨SP110基因rs11679983位点单核苷酸多态性与中国南方汉族人群肺结核的关联性,为临床治疗提供参考依据。方法纳入2013年1月-2014年12月医院118例肺结核患者为病例组,同期选取118名健康志愿者为对照组,运用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术检测基因型,数据采用SPSS 22.0软件进行统计分析。结果 SP110基因rs11679983 AA、AG、GG基因型在病例组和对照组的分布频率分别为0、90.7%、9.3%和0.8%、40.7%、58.5%;A、G等位基因在病例组和对照组的分布频率分别为45.3%、54.7%和21.2%、78.8%;肺结核患者中AG基因型和A等位基因频率高于健康对照人群。结论 SP110基因rs11679983位点单核苷酸多态性与中国南方汉族人群肺结核相关,AG基因型和A等位基因可能增加肺结核的易感性。

核体蛋白Sp110及其生物学功能

Sp110是最近发现的可能与结核易感性相关的新基因,是核体蛋白Sp100/Sp140家族中的一员,包含了Sp100区,SAND区,核定位序列(NLS)以及细胞核激素受体结合域(NRB)等多种功能结构区。在基因转录,激素受体信号传递,细胞凋亡,病毒复制等方面都有重要作用。

SP110基因多态性与结核病易感性研究进展

SP110是人核体蛋白SP110/140家族中的一员,包含了SP100区,SAND区,核定位序列(NLS)以及细胞核激素受体结合域(NRB)等多种功能结构区。其与能调节小鼠对结核病的先天免疫力的Ipr1基因的同源性达到了41%,因此被认为是影响人类肺结核发生,发展的新候选基因。受外界环境、不同人种以及种群等多种因素影响,SP110基因多个SNP位点存在变异。在不同的人种和人群中,其多态性与结核病易感性相关与否也存在着不同。本文将对SP110基因3个SNP位点rs3948464C/T、rs1135791、rs11679983A/G的研究进展进行综述。

SP110基因多态性与肺结核易感性的关系

目的探讨SP110基因的单核苷酸多态性(SNP)位点与肺结核易感性的关系。方法选取58例肺结核患者(试验组)和62例健康志愿者(对照组),进行SNP分型分析,比较两组SP110基因SNP位点rs2114592和rs3948464的基因型和等位基因频率。结果 rs2114592位点的基因型有3种,两组的基因型和等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05)。rs3948464位点的基因型在两组中均为CC型,未检测到其他2种基因型。结论 SP110基因rs2114592和rs3948464位点的多态性与肺结核的易感性无关。

抗结核病基因及相关因子的研究进展

结核病以其高传染性和高死亡率受到世界各国的普遍关注。尽管,结核病的治疗还是以药物为主,但抗结核病基因Ipr1、SP110以及相关因子的发现,将结核病的治疗与研究推上了一个新的台阶。文章就抗结核基因和相关因子的研究概况以及今后的发展趋势进行综述,旨在为有效控制结核病的发生、发展提供帮助。

Bacillus sp.B110胞内麦芽糖淀粉酶基因克隆与酶学特性

目的:对菌株Bacillus sp.B110的胞内麦芽糖淀粉酶BMAL进行基因克隆、异源表达、纯化及酶学性质研究,为后期开发新的淀粉加工用酶打下基础。方法:使用PCR技术对Bacillus sp.B110的胞内麦芽糖淀粉酶bmal基因序列进行全长克隆,异源表达,使用Ni2+-NTA进行纯化,再对其酶学特性进行测定,使用序列分析工具BioEdit、MEGA等对其氨基酸序列进行分析,使用AlphaFold2对其三级结构进行预测分析。结果:BMAL基因全长1770 bp,编码一个589氨基酸残基的蛋白。重组酶rBMAL经Ni2+-NTA亲和层析纯化后,SDS-PAGE电泳结果显示其分子量大小为63 kDa。氨基酸序列分析和三维建模表明BMAL与来源于B.subtilis 168和B.subtilis SUH4-2的麦芽糖淀粉酶有较高的一致性,且BMAL具有一个麦芽糖淀粉酶所独有的N端结构域以及由Asp328-Glu357-Asp424三个氨基酸残基所构成的催化中心。重组酶rBMAL最适反应温度为45℃,最适反应pH为6.0。重组酶rBMAL在30℃条件下保藏7 h残留酶活为60%,但在60℃条件下保藏2 h残留酶活力下降98%,说明BMAL对热敏感。重组酶rBMAL在4℃,pH7.0~9.5保藏12 h活性稳定。当存在1 mmol/L的金属离子Mg2+时,重组酶rBMAL活力提高36%,而Ni2+、Fe3+、Co2+、Cu2+、Zn2+、Al3+、Ca2+对重组酶rBMAL有抑制作用,酶活力减少85%~48%。有机溶剂和化学试剂甲醇、乙醇、丙酮、异腈、EDTA和SDS对重组酶rBMAL有较强的抑制作用,酶活力减少至32.3%~64.8%。底物特异性实验结果证实BMAL最适底物为环精糊。结论:Bacillus sp.B110的胞内麦芽糖淀粉酶BMAL具有良好的催化特性和pH稳定性,在面包烘焙工业上具有潜在的应用价值。

细菌Lelliottia sp.X-110对铀的吸附及减量化研究

本文以分离自铀污染土壤的细菌Lelliottia sp.X-110(X-110)冻干粉作为生物吸附剂,考察其在不同条件下对铀酰离子(UO_(2)^(2+))的吸附行为、机理及减量化效果。结果表明:pH 5时,X-110对UO_(2)^(2+)的吸附效果最为显著;当初始铀浓度为100 mg·L^(-1)时,吸附量可达170.76 mg·g^(-1);X-110对UO_(2)^(2+)的吸附过程分为前期的快速(前5 min内)和后期的慢速两个阶段,其行为符合准二级动力学和Langmuir吸附等温模型;FT-IR分析显示,X-110表面的羧基、氨基及磷酸基团参与了UO_(2)^(2+)的吸附作用;X-110具有较好的减量化效果,减重比为18.25。XRD进一步分析表明,灰分中的铀主要以U(UO_(2))(PO_(4))_(2)晶体形式存在,表明UO_(2)^(2+)主要与X-110上的磷酸基团结合。上述结果提示,Lelliottia sp.X-110有望作为吸附剂用于放射性废水中铀的去除与减量化处理。

364例蒙古族结核病患者易患基因多态性研究

目的探讨NRAMP1、Sp110基因多态性与蒙古族人群结核病易患性的关系。方法采用病例-对照研究,选取蒙古族结核病患者180例,正常体检者184例,应用聚合酶链式反应–限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测NRAMP1、Sp110的基因型,计算各基因型在病例组和对照组的频率,采用χ^2检验、logistic回归分析基因多态性与结核病易患性的关系。结果单因素χ^2检验发现除体质指数(BMI)外其他因素在两组中分布均衡;NRAMP1rs17235409、NRAMP1rs17235416和Sp110rs3948464位点基因多态性均与结核易患性相关,3个位点突变基因型GA+AA、TGTG/(-)+(-)/(-)、CC结核病易患的危险度分别是未突变基因型GG、TGTG/TGTG、TT的1.784、4.745和3.061倍;BMI<18.5是结核病易患的危险因素,其结核病易患的危险度是BMI≥18.5个体的4.350倍。结论NRAMP1rs17235409、NRAMP1rs17235416和Sp110rs3948464位点基因多态性与结核病易患有关。