基于StarBase数据库分析lncRNA SNHG6在消化系统肿瘤中的表达及作用机制

目的研究长链非编码RNA SNHG6在消化系统肿瘤中的表达及作用机制。方法通过StarBase数据库不同分析功能,分析SNHG6在不同消化系统肿瘤中的表达水平;筛选出可能的下游靶基因,通过功能富集分析及KEGG通路富集分析,探讨SNHG6可能的作用机制;进一步探讨靶基因Eukaryotic Translation Initiation Factor 4 A3(EIF4A3)和SNHG6的相关性,同时分析EIF4A3在肝癌中的表达及预后分析。结果 SNHG6在除胰腺癌以外的消化系统肿瘤中均高表达,下游作用机制主要与剪切体、RNA转运、核糖体以及mRNA监测相关通路有关,同时与EIF4A3密切相关。EIF4A3和SNHG6在肝癌中明显正相关,并且EIF4A3在肝癌中明显高表达,生存分析提示EIF4A3与肝癌不良预后有关。结论 SNHG6在多数消化系统肿瘤中发挥促癌基因的作用,并且在肝癌中通过与EIF4A3相互作用,促进肝癌发生发展。

基于操作系统的实时数据库移植

介绍了实时数据库的基本概念和主要技术，讨论了实时数据库移植到不同操作系统的方法，结合由美国维吉尼亚大学开发的Starbase实时数据库，实现了实时数据库从操作系统RT-Mach到Unix的移植。