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Analytical Polarizable Continuum Model for Wavelets on NURBS Patches 被引量:1
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作者 Maharavo Randrianarivony 《Applied Mathematics》 2017年第8期1045-1073,共29页
This article concerns the application of wavelet techniques on molecular surfaces constituted of four-sided patches. The Polarizable Continuum Model, which is governed by the Poisson-Boltzmann equation, is treated by ... This article concerns the application of wavelet techniques on molecular surfaces constituted of four-sided patches. The Polarizable Continuum Model, which is governed by the Poisson-Boltzmann equation, is treated by means of boundary integral equations. The media inside and outside the molecular surface consist respectively of the solute and the solvent. For a given electrically charged molecule, the principal unknown is the electrostatic solvation energy when the permittivity is specified. The wavelet basis functions are constructed on the unit square which are subsequently mapped onto the patches that are assumed to be isotropically shaped and to admit similar surface areas. The initial transmission problem is recast as an integral equation in term of both the single and the double layers. Domain decomposition preconditioner serves as acceleration of the linear solver of the single layer which is badly conditioned. 展开更多
关键词 polarizable continuum model Wavelet POISSON-BOLTZMANN PATCH Electrostatic SOLVATION Energy
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Effects of Electron Donor and Different Solvents on Polarizability and Second Hyperpolarizability of Diradical Complex Involving X(X=B,Al,Ga)
2
作者 LIU Hai-bo QIU Yong-qing +2 位作者 YANG Guo-chun LIU Chun-guang SUN Shi-ling 《Chemical Research in Chinese Universities》 SCIE CAS CSCD 2012年第2期308-312,共5页
The polarizability(α) and second hyperpolarizability(γ) were systemically investigated for singlet diradical complex involving X(X=B,Al,Ga) atom.The results show that both the α and γ can be effectively tune... The polarizability(α) and second hyperpolarizability(γ) were systemically investigated for singlet diradical complex involving X(X=B,Al,Ga) atom.The results show that both the α and γ can be effectively tuned by varying the distance R(between compound A and a water molecule) and acceptor atom X.The lone pair of electrons from the O atom of the water molecule entered into the vacant p orbital of atom X,which increased the diradical character and led to the increase of the α and γ values.Furthermore,the polarizable continuum model(PCM) was used to test the effects of H2O and CCl4 solvents on the α and γ values.Both the α and γ values of the studied diradical complex 1a(1b,1c) in H2O and CCl4 were uniformly enhanced.And the solvent effects of H2O on either α or γ were larger than those of CCl4. 展开更多
关键词 polarizABILITY Second hyperpolarizability Diradical character polarizable continuum model(PCM)
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态定(线性响应)-极化连续模型/含时密度泛函方法研究一种有机发光材料的吸收和发射光谱(英文) 被引量:5
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作者 刘小君 林涛 +4 位作者 蔡新晨 高少伟 杨磊 马睿 张晋悦 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第6期1329-1336,共8页
3-(二氰亚甲基)-5,5-二甲基-1-(3-[9-(2-乙基-己基)-咔唑基]-乙烯基)环己烷(DCDHCC)是一种用于光电器件中的有机染料,它具有良好的发光特性.我们使用含时密度泛函方法(TD-PBE0,TD-BMK和TD-M06)以及极化连续模型(PCM)计算了该材料在溶剂... 3-(二氰亚甲基)-5,5-二甲基-1-(3-[9-(2-乙基-己基)-咔唑基]-乙烯基)环己烷(DCDHCC)是一种用于光电器件中的有机染料,它具有良好的发光特性.我们使用含时密度泛函方法(TD-PBE0,TD-BMK和TD-M06)以及极化连续模型(PCM)计算了该材料在溶剂中的吸收和发射特性.计算中使用了线性响应(LR)、态定(SS)两种溶剂模型和6-31G(d)、6-31+G(d,p)两种基组.计算了DCDHCC在苯、四氢呋喃和丙酮溶剂中的吸收和发射光谱,并与实验观测进行了比较.结果表明:对于吸收光谱的计算,杂化函数的影响大于基组和溶剂模型,在三种函数中BMK更适于研究DCDHCC的吸收光谱;而对于发射光谱,基组的影响最大,基组通过影响激发态构型从而影响发射光谱,对于激发态构型的优化需要使用6-31+G(d,p)基组.我们希望这些研究能对今后设计类似的发光分子有帮助. 展开更多
关键词 含时密度泛函理论 态定极化连续模型 紫外-可见光谱 全局杂化 线性响应极化连续模型
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2-(3-巯基-2-吡啶基)苯并咪唑分子内质子转移及溶剂化效应 被引量:8
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作者 彭洪亮 于贤勇 +4 位作者 易平贵 汪朝旭 李筱芳 王涛 周继明 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第1期141-148,共8页
在B3LYP/6-31G(d,p)和TD B3LYP/6-31++G(d,p)//CIS/6-31G(d,p)水平上,研究了2-(3-巯基-2-吡啶基)苯并咪唑(MPyBI)在气相和七种溶剂(环己烷、苯、三氯甲烷、乙醇、乙腈、二甲亚砜和水)中基态和激发态的分子内质子转移(GSIPT和ESIPT)过程... 在B3LYP/6-31G(d,p)和TD B3LYP/6-31++G(d,p)//CIS/6-31G(d,p)水平上,研究了2-(3-巯基-2-吡啶基)苯并咪唑(MPyBI)在气相和七种溶剂(环己烷、苯、三氯甲烷、乙醇、乙腈、二甲亚砜和水)中基态和激发态的分子内质子转移(GSIPT和ESIPT)过程.在基态势能面的研究中发现,该化合物存在分子内双质子转移,其中分步的双质子转移在动力学上具有优势.同时对激发态质子转移势能面及激发态转移过程中的光物理现象进行了研究,结果表明该化合物存在快速的无能垒的激发态分子内质子转移,随着溶剂极性的增强,可以降低基态过渡态的能垒,改变硫醇式与硫酮式互变异构体的比例,从而灵敏地控制荧光的强度. 展开更多
关键词 密度泛函理论 2-(3-巯基-2-吡啶基)苯并咪唑 分子内质子转移 极化连续介质模型
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超分子作用对2-(2-氨基苯基)苯并噻唑分子内质子转移的影响 被引量:2
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作者 向俊峰 易平贵 +4 位作者 任志勇 于贤勇 陈建 刘武 李桃梅 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2016年第3期624-630,共7页
采用稳态荧光、瞬态荧光及量子化学计算等手段对2-(2-氨基苯基)苯并噻唑(APBT)在不同溶剂中的质子转移进行了研究。结果表明,溶剂的极性及质子化对APBT的质子转移有较大的影响,通过对超分子作用的考察,发现七元瓜环(CB[7])的加入对APBT... 采用稳态荧光、瞬态荧光及量子化学计算等手段对2-(2-氨基苯基)苯并噻唑(APBT)在不同溶剂中的质子转移进行了研究。结果表明,溶剂的极性及质子化对APBT的质子转移有较大的影响,通过对超分子作用的考察,发现七元瓜环(CB[7])的加入对APBT质子转移起到了一定的抑制作用,APBT与CB[7]能形成化学计量比为1:1的主客体包合物,同时测定了包合物的结合常数等热力学参数。此外,核磁共振氢谱和包合物的理论计算表明APBT分子进入了CB[7]的疏水空腔。 展开更多
关键词 质子转移 七元瓜环 极化连续介质模型 热力学 主客体化学
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亚硝基苯与甲醛的反应机理和溶剂效应的理论研究 被引量:1
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作者 黎安勇 郑天龙 苗树青 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第13期1529-1533,共5页
采用密度泛函理论方法RB3LYP/6-311++G(d,p)研究了亚硝基苯与甲醛在单重态势能面上分别在气相和溶剂中的反应机理.找到两条反应通道:协同机理和分步机理,均生成实验产物N-苯基氧肟酸C6H5NOHCHO.计算结果表明:亚硝基苯与甲醛在气相中分... 采用密度泛函理论方法RB3LYP/6-311++G(d,p)研究了亚硝基苯与甲醛在单重态势能面上分别在气相和溶剂中的反应机理.找到两条反应通道:协同机理和分步机理,均生成实验产物N-苯基氧肟酸C6H5NOHCHO.计算结果表明:亚硝基苯与甲醛在气相中分步机理为主要通道.采用导电极化连续介质模型研究了反应体系在水、乙醇、乙腈、二氯甲烷、四氢呋喃、环己烷溶液中反应的溶剂化效应,这些溶剂可降低反应的活化能,但反应对溶剂的极性不敏感.无论在气相还是溶剂中,亚硝基苯与甲醛的分步机理为优势通道. 展开更多
关键词 亚硝基苯 甲醛 溶剂效应 极化连续模型
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[EPy][BF_4]和[EPy][PF_6]离子对的气相及液相阴阳离子相互作用研究 被引量:2
7
作者 万辉 王小露 管国锋 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第8期1615-1620,共6页
采用从头算HF/6-31G和密度泛函理论B3LYP/6-31+G(d,p)方法,对乙基吡啶四氟硼酸盐([EPy][BF4])和乙基吡啶六氟磷酸盐([EPy][PF6])的离子对进行了结构优化和频率分析,并利用自洽反应场(SCRF)的导体极化连续模型(CPCM)考察了离子对液态下... 采用从头算HF/6-31G和密度泛函理论B3LYP/6-31+G(d,p)方法,对乙基吡啶四氟硼酸盐([EPy][BF4])和乙基吡啶六氟磷酸盐([EPy][PF6])的离子对进行了结构优化和频率分析,并利用自洽反应场(SCRF)的导体极化连续模型(CPCM)考察了离子对液态下的结构及相互作用,得到了两种离子对的红外光谱及气相、液相下最稳定结构.由两种离子对的几何参数可知,阴阳离子通过氢键相互作用,两种离子液体的红外光谱特征值与实验值比较吻合.应用自然键轨道(NBO)理论分析了吡啶阳离子及离子对中的原子电荷分布和电荷转移情况,结果表明两种离子对中阴阳离子间存在静电相互作用和氢键作用.通过几何参数、相互作用能及NBO分析研究发现,液相下由于周围电荷的中和作用,离子对中阴阳离子的相互作用明显降低. 展开更多
关键词 离子液体 密度泛函理论 自然键轨道 导体极化连续模型
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脂肪酰胺水解酶催化三联体膦酰化失活的机理:一个模型体系的理论研究(英文) 被引量:1
8
作者 李强根 薛英 +1 位作者 郭勇 鄢国森 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第7期1965-1975,共11页
甲基花生四烯基氟代膦酸酯(MAFP)是脂肪酰胺水解酶(FAAH)的一个抑制剂.FAAH的丝氨酸241(Ser241)-丝氨酸217(Ser217)-赖氨酸142(Lys142)催化三联体被MAFP膦酰化后将导致FAAH失活.本文采用B3LYP/6-311G(d,p)和MP2/6-311G(d,p)方法及一个... 甲基花生四烯基氟代膦酸酯(MAFP)是脂肪酰胺水解酶(FAAH)的一个抑制剂.FAAH的丝氨酸241(Ser241)-丝氨酸217(Ser217)-赖氨酸142(Lys142)催化三联体被MAFP膦酰化后将导致FAAH失活.本文采用B3LYP/6-311G(d,p)和MP2/6-311G(d,p)方法及一个简化的计算模型体系对这个膦酰化抑制反应进行理论研究.考虑了两种反应途径.PathA涉及FAAH的催化三联体的所有残基,是一个分步的加成-消除过程,形成两性离子的三角双锥中间体,其中第一步反应是决速步骤.在这个反应途径中,Ser217和Lys142对亲核试剂Ser241起到碱催化活化的作用,而Ser217充作Lys142和Ser241之间的桥梁.此外,溶剂中的一个水分子作为Lys142和MAFP间的"氢桥"具有关键的作用,通过给出和接收质子促进了长距离的质子转移.PathB是催化三联体中的残基Lys142被突变为丙氨酸以后的膦酰化反应,也是一个分步过程.水的本体溶剂效应通过极化连续介质模型(PCM)估算.计算结果显示膦酰化反应的PathA是优势途径,在水溶液中其决速步骤的活化能垒为64.9kJ·mol-1.FAAH催化三联体中残基Lys142的变异会降低膦酰化反应的速率,这与实验结果相一致. 展开更多
关键词 密度泛函理论 极化连续介质模型 脂肪酰胺水解酶 膦酰化反应 甲基花生四烯基氟代膦酸酯 O-甲基二氧磷基氟
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亚硝基化合物与甲醛的反应机理和溶剂效应的理论研究 被引量:1
9
作者 郑天龙 黎安勇 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第10期2059-2064,共6页
采用密度泛函方法B3LYP/6-311++G(d,p)研究了亚硝基苯C6H5—N O和2-甲基-2-亚硝基丙烷(CH3)3C—N O与甲醛分别在气相和溶剂中的反应机理.在气相中均找到两条反应通道,即协同机理和分步机理,均生成实验产物氧肟酸,而且分步机理均为优势通... 采用密度泛函方法B3LYP/6-311++G(d,p)研究了亚硝基苯C6H5—N O和2-甲基-2-亚硝基丙烷(CH3)3C—N O与甲醛分别在气相和溶剂中的反应机理.在气相中均找到两条反应通道,即协同机理和分步机理,均生成实验产物氧肟酸,而且分步机理均为优势通道;除2-甲基-2-亚硝基丙烷的反应没有协同途径外,在溶剂中反应机理与气相中的类似.采用导电极化连续介质模型分别研究了在乙腈与水溶液中反应的溶剂化效应,发现这些溶剂可降低反应的活化能,但降低的程度比较小,反应速率变化不大. 展开更多
关键词 密度泛函理论方法 亚硝基苯 2-甲基-2-亚硝基丙烷 甲醛 溶剂效应 极化连续介质模型
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NAMI-A型钌配合物(HL)(trans—RuCl4L(dmso—s)](L=1-methyl-1,2,4-triazole)水解机理的理论研究
10
作者 陈兰美 陈锦灿 +3 位作者 廖思燕 刘江琴 罗辉 郑康成 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE CAS CSCD 2011年第4期383-390,I0003,共9页
用量子化学密度泛函方法结合导体极化连续模型研究了具有潜在抗肿瘤活性的NAMI—A型钉配合物(HL)[trans—RuCl4L(dmso.s)1(L=1—methyl-1,2,4-triazole,dmso-S=S—dimethylsul foxide)(1)的水解反应过程.计算得到该配合物... 用量子化学密度泛函方法结合导体极化连续模型研究了具有潜在抗肿瘤活性的NAMI—A型钉配合物(HL)[trans—RuCl4L(dmso.s)1(L=1—methyl-1,2,4-triazole,dmso-S=S—dimethylsul foxide)(1)的水解反应过程.计算得到该配合物水解反应过程中相应的结构特征和详细的反应势能面.对于第一步水解,液相中配合物1的活化能垒比已经报道的抗肿瘤药物(Him)[trans—RuCl4(dmso-S)(im)1(NAMI—A,im=imidazole)的活化能垒稍高,这与实验中显示配合物1的水解反应的半衰期稍大的结果相吻合.对于第二步水解,反应在热力学上优先生成顺式双水解产物.另外,通过对水解反应过程中各平衡构型的电子结构特征的分析,预示了水解产物被生物分子靶标亲核进攻能力的倾向. 展开更多
关键词 NAMI-A型配合物 水解 密度泛函理论 导体极化连续模型
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[EPy]Cl和[EPy]Br离子对的气相和液相结构及阴阳离子间的相互作用 被引量:7
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作者 王小露 万辉 管国锋 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第11期2077-2082,共6页
采用密度泛函理论B3LYP/6-31+G(d,p)方法对氯化乙基吡啶([EPy]Cl)、溴化乙基吡啶([EPy]Br)的离子对进行了结构优化和频率分析,并利用自洽反应场(SCRF)的导体极化连续模型(CPCM)考察了离子液体液相下的结构及相互作用.得到了两种离子液... 采用密度泛函理论B3LYP/6-31+G(d,p)方法对氯化乙基吡啶([EPy]Cl)、溴化乙基吡啶([EPy]Br)的离子对进行了结构优化和频率分析,并利用自洽反应场(SCRF)的导体极化连续模型(CPCM)考察了离子液体液相下的结构及相互作用.得到了两种离子液体的离子对在气相、液相下最稳定结构及气相红外光谱特征值,两种离子液体的离子对结构存在相似性,红外光谱特征值与文献值比较吻合.应用自然键轨道(NBO)理论分析了离子对中原子电荷分布及电荷转移情况,结果证明两种离子液体中阴阳离子间除了静电相互作用外还存在着氢键作用.通过对比气相及液相下的几何参数、相互作用能及NBO分析结果,发现液相下阴阳离子的相互作用明显降低.液相环境抵消了大部分阴阳离子间的静电作用,导致液相下阴阳离子间相互作用的减小. 展开更多
关键词 离子液体 密度泛函理论 自然键轨道 导体极化连续模型
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甲酸苯酯氨解反应的机理和溶剂效应的理论研究 被引量:2
12
作者 金鹿 吴勇 +3 位作者 薛英 郭勇 谢代前 鄢国森 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第9期873-878,共6页
采用密度泛函理论方法B3LYP/6-31G(d,p)研究了甲酸苯酯与氨在气相中的反应机理.考虑了两条可能的反应途径:中性协同的和中性分步的机理.采用自洽反应场极化连续模型(CPCM模型)研究了反应体系在水、乙醇和乙腈溶液中反应的溶剂化效应.计... 采用密度泛函理论方法B3LYP/6-31G(d,p)研究了甲酸苯酯与氨在气相中的反应机理.考虑了两条可能的反应途径:中性协同的和中性分步的机理.采用自洽反应场极化连续模型(CPCM模型)研究了反应体系在水、乙醇和乙腈溶液中反应的溶剂化效应.计算结果表明气相和溶液中协同机理均是最优途径.水、乙醇和乙腈溶剂可降低协同途径的活化能,溶剂化效应的大小对溶剂的极性不敏感. 展开更多
关键词 氨解反应 甲酸苯酯 溶剂效应 极化连续模型
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溶剂化效应对6-亚甲基环戊二烯酮与HCN的反应机理影响的理论研究 被引量:2
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作者 贾秀娟 潘秀梅 +4 位作者 王莉伟 刘颖 孙昊 苏忠民 王荣顺 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第6期1224-1227,共4页
在B3LYP/6-311+G**计算水平上,采用导体极化连续模型研究了溶剂化效应对6-亚甲基环戊二烯酮与HCN反应生成主要产物b类酸的反应机理的影响.计算结果表明,在溶剂中的反应机理与在气相中的反应机理一致.溶剂化效应使反应路径中各驻点的自... 在B3LYP/6-311+G**计算水平上,采用导体极化连续模型研究了溶剂化效应对6-亚甲基环戊二烯酮与HCN反应生成主要产物b类酸的反应机理的影响.计算结果表明,在溶剂中的反应机理与在气相中的反应机理一致.溶剂化效应使反应路径中各驻点的自由能降低,稳定化了各物质.溶液中的活化自由能与气相相比也有所降低,反应更容易发生,其中CC进攻方式的活化自由能降低得更多. 展开更多
关键词 6-亚甲基环戊二烯酮 HCN 导体极化连续模型 溶剂化效应
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N,N-二(对氟苄基)-N′-(2′,3′-二脱氧-3′-硫代胞苷)甲脒水解反应的理论研究 被引量:5
14
作者 张成华 薛英 +1 位作者 郭勇 鄢国森 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第12期2354-2359,共6页
采用密度泛函理论方法B3LYP/6-31++G(d,p)//B3LYP/6-31G(d,p)和导体极化连续模型B3LYP/CPCM/6-31++G(d,p)方法对苯环对位上有F取代的N,N-二(对氟苄基)-N′-(2′,3′-二脱氧-3′-硫代胞苷)甲脒(FBFA-3TC)水解反应机理和溶剂效应进行了研... 采用密度泛函理论方法B3LYP/6-31++G(d,p)//B3LYP/6-31G(d,p)和导体极化连续模型B3LYP/CPCM/6-31++G(d,p)方法对苯环对位上有F取代的N,N-二(对氟苄基)-N′-(2′,3′-二脱氧-3′-硫代胞苷)甲脒(FBFA-3TC)水解反应机理和溶剂效应进行了研究.考虑两条可能反应途径:水分子首先进攻CN双键的途径(PathA)和先进攻C—N单键的途径(PathB).计算结果表明,气相和水中两条途径的第一步都是速率控制步骤,PathA比PathB更有利.对优势途径PathA的第二步反应的进一步研究发现,中间体的羟基H原子转移到双键N比单键N更容易,从而形成2′,3′-二脱氧-3′-硫代胞苷(3TC)的最终水解产物. 展开更多
关键词 N N-二(对氟苄基)-N′-(2′ 3′-二脱氧-3′-硫代胞苷)甲脒 水解 密度泛函理论 导体极化连续模型
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溶液相有机化合物pK_a的量子化学计算 被引量:1
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作者 刘元海 王永健 +2 位作者 于奡 张鑫锐 李久虹 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1241-1250,共10页
寻找一种理论计算方法来验证和补充实验数据,得到较为精确的溶剂化自由能和pKa,是众多理论化学家长期以来研究的重要方向。本综述较为详细地总结了近年发展起来的PCM理论模型在溶液相化合物溶剂化自由能、特别是近十年来有机化合物pKa... 寻找一种理论计算方法来验证和补充实验数据,得到较为精确的溶剂化自由能和pKa,是众多理论化学家长期以来研究的重要方向。本综述较为详细地总结了近年发展起来的PCM理论模型在溶液相化合物溶剂化自由能、特别是近十年来有机化合物pKa的量子化学计算中的最新成果,比较了各种不同计算方法的精确性和各自特点。 展开更多
关键词 PKA 溶液相酸性 量化计算 极化连续介质模型(PCM)
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四唑负离子与脒正离子复合物稳定性的理论研究 被引量:1
16
作者 孙元元 张成华 +1 位作者 薛英 鄢国森 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第7期751-756,共6页
采用密度泛函B3LYP/6-31+G(d,p)方法和自洽反应场极化连续模型(PCM)研究四唑负离子与脒类(乙脒或苄脒)正离子形成的两种形式的复合物(末端和侧端)及甲酸根负离子与脒类(乙脒或苄脒)正离子形成的复合物在气相和二甲亚砜(DMSO)溶剂中的稳... 采用密度泛函B3LYP/6-31+G(d,p)方法和自洽反应场极化连续模型(PCM)研究四唑负离子与脒类(乙脒或苄脒)正离子形成的两种形式的复合物(末端和侧端)及甲酸根负离子与脒类(乙脒或苄脒)正离子形成的复合物在气相和二甲亚砜(DMSO)溶剂中的稳定性.在气相中,四唑-乙脒和四唑-苄脒复合物的相互作用能(△E)末端分别比侧端的大3.56和3.72kJ/mol,表明末端复合物稍占优势.甲酸与乙脒和苄脒的复合物的相互作用能(△E)分别比四唑与乙脒和苄脒的复合物的大59.35和58.99kJ/mol,表明脒与甲酸形成复合物时相互作用更强.溶剂DMSO的作用使得所有复合物的相互作用能变小,但脒与四唑的相互作用仍比脒与甲酸的弱.前者的结合常数与后者的相比只有1/315(乙脒)和1/218(苄脒),这与实验结果相一致. 展开更多
关键词 四唑负离子 甲酸根负离子 乙脒正离子 苄脒正离子 密度泛函理论 极化连续模型
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线性响应和两种态特定方法模拟AF350电子跃迁的溶剂效应 被引量:2
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作者 毕婷君 王繁 王治钒 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2020年第12期2781-2787,共7页
在极化连续模型框架下比较了线性响应与两种不同态特定方法计算的溶液中Alexa Fluor 350(AF350)分子激发能和光谱移动值的差异.AF350的第一激发态S0→S1电子跃迁属于π→π*跃迁,主要对应于最高占据分子轨道(HOMO)到最低空轨道(LUMO)的... 在极化连续模型框架下比较了线性响应与两种不同态特定方法计算的溶液中Alexa Fluor 350(AF350)分子激发能和光谱移动值的差异.AF350的第一激发态S0→S1电子跃迁属于π→π*跃迁,主要对应于最高占据分子轨道(HOMO)到最低空轨道(LUMO)的跃迁.该分子激发态偶极矩大于基态偶极矩,激发态时溶质溶剂相互作用比基态时更强,随着溶剂极性增大,会发生光谱红移的现象.与实验值相比,线性响应和两种态特定方法均高估了激发能,其中以IBSF(Improta-Barone-Scalmani-Frisch)方法得到的激发能最小,矫正的基态反应场方法(cGSRF)得到的激发能最大.对于光谱移动值,3种方法与实验值相比都偏小,线性响应方法(LR)计算出的误差最大,而IBSF方法得到的结果与实验值最吻合,是预测溶液中AF350分子激发能和光谱移动值最准确的方法.对比了Marcus传统理论和基于约束平衡的非平衡溶剂化理论的结果,发现后者得到的激发能和光谱移动值更接近于实验值. 展开更多
关键词 线性响应 态特定方法 极化连续模型 激发能 光谱移动值
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密度泛函理论研究Gd(H2O)n^3+(n=8,9)化合物的结构及相对稳定性
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作者 肖伟 夏琼琼 +2 位作者 章永凡 宁利新 崔执凤 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE CAS CSCD 2009年第4期395-400,448,共7页
用密度泛函理论方法研究了气相和水溶液中Gd(H2O)n^3+(n=8,9)化合物的结构和相对稳定性,其中水溶剂效应利用极化连续介质方法结合多种溶质空腔模型进行模拟.气相计算得到的化合物结构与实验观察结果一致.计算结果表明,在气相... 用密度泛函理论方法研究了气相和水溶液中Gd(H2O)n^3+(n=8,9)化合物的结构和相对稳定性,其中水溶剂效应利用极化连续介质方法结合多种溶质空腔模型进行模拟.气相计算得到的化合物结构与实验观察结果一致.计算结果表明,在气相中9配位Gd(H2O)9^3+比8配位Gd(H2O)8^3+稳定,而在水溶液中稳定顺序刚好相反,这一结果不依赖于计算中采用的空腔模型种类,而且也与实验结果吻合.最后,通过采用各种空腔模型计算Gd^3+的水合自由能,并与实验值比较,发现当化合物只包含第一层配位水分子时,UA0、UAHF及UAKS空腔模型最适合研究Gd^3+在水溶液中的性质. 展开更多
关键词 密度泛函理论 钆基水化物 相对稳定性 极化连续模型 溶质空腔
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用相对Gibbs自由能方法计算羧酸的pK_a值
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作者 何建军 陈香兰 曾跃 《湖南师范大学自然科学学报》 CAS 北大核心 2011年第2期48-53,共6页
运用密度泛函方法以及连续极化溶剂模型(PCM),在B3LYP/6-31+G(d,p)水平上计算了86种羧酸在水溶液中的97个pKa值.在本文pKa值的计算中,用羧酸在水溶液中的电离反应直接计算羧酸电离Gibbs自由能,并用相对Gibbs自由能来计算羧酸的pKa值.结... 运用密度泛函方法以及连续极化溶剂模型(PCM),在B3LYP/6-31+G(d,p)水平上计算了86种羧酸在水溶液中的97个pKa值.在本文pKa值的计算中,用羧酸在水溶液中的电离反应直接计算羧酸电离Gibbs自由能,并用相对Gibbs自由能来计算羧酸的pKa值.结果表明,计算值能很好地与实验值吻合,其标准偏差为±0.36pKa单位. 展开更多
关键词 密度泛函理论 羧酸 连续极化模型
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铝-甲基丙二酸静态结构和NMR的密度泛函理论研究
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作者 董绍楠 刘丽 +2 位作者 张婧 章福平 毕树平 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第S1期307-308,共2页
自然界中广泛存在的低分子量有机酸对环境中铝离子的生物化学和地球化学均有重要影响:一方面,有机酸小分子与土壤溶液中的Al^(3+)络合会降低游离态Al^(3+)毒性;另一方面,溶液中有机酸与Al^(3+)的配位会改变铝形态的溶解、转化和迁移过... 自然界中广泛存在的低分子量有机酸对环境中铝离子的生物化学和地球化学均有重要影响:一方面,有机酸小分子与土壤溶液中的Al^(3+)络合会降低游离态Al^(3+)毒性;另一方面,溶液中有机酸与Al^(3+)的配位会改变铝形态的溶解、转化和迁移过程。在Gaussian 03程序包中,采用密度泛函理论(DFT)和超分子-极化连续模型(GP-SM-PCM)模拟了溶液中铝-甲基丙二酸(Al-mMal)的静态结构,并计算了NMR化学位移。在B3LYP/6-311+G(d,p)水平下优化构型的NMR化学位移值与实验值基本一致,表明采用的方法适用于被研究体系。研究结果表明:(1)对于Al(mMal)(H_2O)_4^+配合物,螯合环对邻位水分子有活化作用,但却惰化对位水分子;(2)对于Al(mMal)_2(H_2O)_2^-配合物,trans异构体由于溶剂分子更对称而能量更低,但无法从NMR数据判断哪种异构体为实验测定的主要构型;(3)对于Al(mMal)_3^(2-)配合物,左右旋的静态结构和NMR数据基本相同。 展开更多
关键词 铝-甲基丙二酸 静态结构 NMR 超分子-极化连续模型 密度泛函理论
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