5-羟色胺2A受体基因多态性与肺癌患者疼痛发生及阿片类药物需求量的相关性研究

目的:探讨5-羟色胺2A受体(5-HT2AR)基因rs6313位点多态性与肺癌患者疼痛发生及阿片类药物需求量的相关性。方法:选取2017年12月-2018年6月徐州医科大学附属医院收治的肺癌患者332例,作为肺癌组;根据其是否发生疼痛分为疼痛组(177例)和无痛组(155例)。选取同期于该院行体检的健康者116例,作为对照组。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测各受试者5-HT2AR基因rs6313位点的基因型。采用χ^2检验比较各组患者基因型分布情况,采用二元Logistic回归分析法、χ^2检验、Kruskal-Wallis检验分别考察基因型与肺癌患者疼痛发生、疼痛程度以及阿片类药物需求量的相关性。结果:共检出5-HT2AR基因rs6313位点CC、CT、TT等3种基因型。对照组、无痛组、疼痛组受试者上述基因型频率分别为20.7%、47.4%、31.9%,20.6%、50.3%、29.0%以及16.4%、50.8%、32.8%,其频率及等位基因频率均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。肺癌组患者各基因型及等位基因频率与对照组比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。TNM分期(Ⅲ~Ⅳ期)与肺癌患者疼痛发生有关[比值比为3.661,95%置信区间(1.972,6.797),P<0.001],而性别、年龄、身高、体质量、病理分型和rs6313位点基因型与患者疼痛发生无关(P>0.05),且该位点基因型与肺癌患者疼痛程度以及阿片类药物需求量均无关(P>0.05)。结论:5-HT2AR基因rs6313多态性与肺癌患者疼痛的发生及阿片类药物的需求量无关,其多态性可能不是导致肺癌患者疼痛个体差异的主要原因。

Susceptibility to ulcerative colitis in Hungarian patients determined by gene-gene interactions

AIM: To study the inflammatory bowel disease-5 locus (IBD5) and interleukin-23 receptor (IL23R) gene variants in UC patients and test for gene-gene interaction.

ALOX5AP基因位点SG13S35、SG13S377多态性与中国北方汉族人缺血性脑血管病的关系

以探讨5-脂氧合酶激活蛋白基因(ALOX5AP)位点SG13S35、SG13S377多态性与中国北方汉族人患缺血性脑血管病(IS)的关系为目的,将研究对象分为IS病例组和对照组,抽取空腹静脉血,对位点SG13S35、SG13S377进行DNA测序,采用病例对照分析法对比其两组间出现频数有无不同。应用SPSS 16.0软件包进行统计分析,计算相对风险度,并进行χ2检验,病例组与对照组基因频数比较采用Fisher确切概率P检验,应用logistic回归分析危险因素。ALOX5AP基因位点SG13S377(T/T)、SG13S377(T/C)基因型频数在两组间比较有显著性差异(P<0.05);SG13S377(T/C)频数在病例组男女之间的比较以及病例组与对照组男性之间的比较有显著性差异(P<0.05)。ALOX5AP基因位点SG13S377多态性可能与中国北方汉族人缺血性脑血管病(IS)的发生有关。

丹参F3′5′H基因克隆及其序列分析

目的:为了验证丹参类黄酮-3′,5′-羟基化酶(Flavonoid 3′,5′-hydroxylase,F3′5′H)基因与丹参花色表型的相关性,本研究克隆并分析了紫花丹参99-3株系和一些白花丹参中的F3′5′H基因。方法:本研究通过提取紫花丹参和白花丹参中的总RNA,再将其反转录得到cDNA,以此cDNA为模板,利用PCR方法扩增获得F3′5′H基因全长序列。再利用生物信息学分析方法,分析了该基因编码蛋白质的理化性状、结构域、系统进化等特点,并预测了该蛋白质的亚细胞定位、跨膜区等;利用实时定量PCR方法检测了该基因的表达特异性;利用毛状根遗传转化方法获得了该基因的过表达阳性毛状根株系。结果:F3′5′H基因全长1551 bp,编码516个氨基酸,相对分子质量为57.4 kDa。该基因在丹参花中高丰度表达。在42份(紫花25份;白花17份)丹参样品中发现一个单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)位点在紫花和白花丹参中呈现与花色相关的稳定变化。系统发育分析表明丹参F3′5′H与美女樱的F3′5′H具有较高序列同源性。获得了过表达F3′5′H的毛状根株系。结论:本研究在丹参中克隆到F3′5′H基因,对其序列进行了分析,为进一步研究丹参F3′5′H基因的功能奠定基础。

Amplified fragment length polymorphism analysis on D5S436 locus and its application to linkage analysis in gene diagnosis of asthma

Objectives To detect the polymorphism of D5S436 locus, and to carry out an amplified fragment length polymorphism (Amp FLP) genotyping linkage analysis in asthma families.Methods Allele and genotype frequencies of the high polymorphic D5S436 locus were determined in 92 unrelated Chinese individuals by using polymerase chain reaction (PCR). The amplified fragments were separated by denaturing polyacrylamide gel electrophoresis and silver staining techniques. Results Eight alleles and 22 genotypes were observed in this population. The heterozygosity was 78.26%. The polymorphism information content (PIC) was 0.76. Amp FLP genotyping linkage analyses were carried out in four asthma families, demonstrating that the locus was inherited according to Mendel's law and had a clear result.Conclusion The PIC of D5S436 is high in Chinese individuals, so it could be used as a genetic marker of asthma in Chinese and might be useful in the gene diagnosis of asthma.

水稻稻瘟病抗性基因座Piz和Pik的探秘之旅

由稻瘟病菌Magnaporthe oryzae引起的稻瘟病是我国乃至世界水稻生产上的重要病害。目前生产上主要有栽培管理、化学药剂和选用抗病品种等防治方法,其中利用抗病基因培育抗病品种已被证实为最经济有效和环境友好的选择。回顾了本课题组在过去10多年利用分子生物学和多组学等研究技术,在抗性基因筛选、鉴定和应用以及抗病机制解析方面的工作。另外,还综述了近年来关于水稻抗性基因和稻瘟病菌无毒基因方面的研究进展,以及与抗病基因Piz-t相关的物质和代谢途径,如五羟色胺和色氨酸途径等。这些信息有望为水稻分子设计抗病育种提供参考。

番茄抗番茄斑萎病毒病育种研究进展

番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)是危害番茄(Lycopersicon esculentum Mill.)最重要的病原菌之一,在中国及世界范围内已成为限制番茄生产的重要因素。利用自然番茄抗病资源及抗病基因是控制TSWV的有效方法。秘鲁番茄(Lycopersicon peruvianum Mill.)和智利番茄(Lycopersicon chilense Mill.)等野生番茄是目前发现的抗TSWV的主要自然资源。其中,秘鲁番茄中的显性抗病质量基因位点Sw-5在TSWV抗病遗传育种中发挥重要作用。后续开发和培育了多种与Sw-5连锁的分子标记及含有Sw-5的抗病品种。除此之外,病毒RNA介导基因沉默技术在番茄TSWV抗病育种中也逐渐受到重视。由于目前陆续出现了打破Sw-5基因位点的TSWV分离种,因此今后的工作亟须发掘TSWV新的抗病资源和基因。