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基于CRISPR-Cas9定向编辑TRAC基因的研究
1
作者
徐畅
覃启富
+6 位作者
向静
瞿创
张丹
徐鹏程
张文峰
沈晗
邵红伟
《广东药科大学学报》
CAS
2017年第2期255-261,共7页
目的针对人源TCRαC基因(TRAC)进行CRISPR/Cas9-gRNA的设计,并验证设计的gRNA的有效性及其脱靶率。方法利用CRISPR网站(http://crispr.mit.edu/)提供的靶向编辑位点筛选工具,针对TCRαC区各设计出了3个编辑位点,并据此构建CRISPR-Cas9-...
目的针对人源TCRαC基因(TRAC)进行CRISPR/Cas9-gRNA的设计,并验证设计的gRNA的有效性及其脱靶率。方法利用CRISPR网站(http://crispr.mit.edu/)提供的靶向编辑位点筛选工具,针对TCRαC区各设计出了3个编辑位点,并据此构建CRISPR-Cas9-TCR敲除质粒,将构建好的质粒转染293T细胞系,通过流式细胞术结合PCR产物的T-A克隆测序等方法验证各个gRNA序列的编辑效率。再根据所预测的潜在脱靶位点,设计相应的上下游引物进行PCR扩增后测序,检测其是否出现脱靶。结果在3组针对TCRαC区的gRNA中,site2-gRNA的编辑效率最高,并且无脱靶现象。结论针对人源TCRαC基因设计的site2-gRNA对TCRαC区具有很好的编辑效果,且无脱靶现象,为消除杂合TCR分子的产生和改善TCR修饰的T细胞(TCR-T)过继性免疫治疗奠定了基础。
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关键词
c
RISPR
引导RNA
TRA
c
基因
基因组编辑
脱靶
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职称材料
题名
基于CRISPR-Cas9定向编辑TRAC基因的研究
1
作者
徐畅
覃启富
向静
瞿创
张丹
徐鹏程
张文峰
沈晗
邵红伟
机构
广东药科大学生命科学与生物制药学院/广东省生物技术候选药物研究重点实验室
出处
《广东药科大学学报》
CAS
2017年第2期255-261,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31100664
31300737
+3 种基金
81303292)
广东省自然科学基金项目(10151022401000024
2014A030313586)
广东省科技计划项目(2016A020215157)
文摘
目的针对人源TCRαC基因(TRAC)进行CRISPR/Cas9-gRNA的设计,并验证设计的gRNA的有效性及其脱靶率。方法利用CRISPR网站(http://crispr.mit.edu/)提供的靶向编辑位点筛选工具,针对TCRαC区各设计出了3个编辑位点,并据此构建CRISPR-Cas9-TCR敲除质粒,将构建好的质粒转染293T细胞系,通过流式细胞术结合PCR产物的T-A克隆测序等方法验证各个gRNA序列的编辑效率。再根据所预测的潜在脱靶位点,设计相应的上下游引物进行PCR扩增后测序,检测其是否出现脱靶。结果在3组针对TCRαC区的gRNA中,site2-gRNA的编辑效率最高,并且无脱靶现象。结论针对人源TCRαC基因设计的site2-gRNA对TCRαC区具有很好的编辑效果,且无脱靶现象,为消除杂合TCR分子的产生和改善TCR修饰的T细胞(TCR-T)过继性免疫治疗奠定了基础。
关键词
c
RISPR
引导RNA
TRA
c
基因
基因组编辑
脱靶
Keywords
c
RISPR
guide RNA
tcr alpha c gene
genome editing
off-target
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
R457.2 [医药卫生—治疗学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于CRISPR-Cas9定向编辑TRAC基因的研究
徐畅
覃启富
向静
瞿创
张丹
徐鹏程
张文峰
沈晗
邵红伟
《广东药科大学学报》
CAS
2017
0
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