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Genotype-phenotype correlations in Chinese patients with TGFBI gene-linked corneal dystrophy 被引量:3
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作者 Yan LONG Yang-shun GU +3 位作者 Wei HAN Xiu-yi LI Ping YU Ming QI 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2011年第4期287-292,共6页
In this paper,we report the clinical and molecular features of the distinct TGFBI (human transforming growth factor β-induced,OMIM No.601692) gene-linked corneal dystrophy.Altogether,five pedigrees and ten unrelated ... In this paper,we report the clinical and molecular features of the distinct TGFBI (human transforming growth factor β-induced,OMIM No.601692) gene-linked corneal dystrophy.Altogether,five pedigrees and ten unrelated individuals diagnosed as corneal dystrophy were recruited.Peripheral venous DNA was extracted,and then amplified by polymerase chain reaction (PCR) and scanned for mutation by single-stranded conformation polymorphism (SSCP).Direct DNA sequencing was used to analyze the mutations of the TGFBI gene.In our study,thirty patients from five pedigrees and ten sporadic patients were diagnosed as four TGFBI gene-linked corneal dystrophies of granular corneal dystrophy type I (GGCD I),Avellino corneal dystrophy (ACD),lattice corneal dystrophy type I (LCD I),and lattice corneal dystrophy type ⅢA (LCD IIIA),and in total,seven disease-causing mutations,namely R555W,A546D,A546T,and T538P mutations in exon 12,R124H and R124C mutations in exon 4,and P501T mutation in exon 11,were identified,while four polymorphisms of V327V,L472L,F540F,and 1665-1666insC were screened in exons 8,11,and 12.The study ascertained the tight genotype-phenotype relationship and confirmed the clinical and genetic features of four TGFBI gene-linked corneal dystrophies. 展开更多
关键词 tgfbi gene Corneal dystrophy GENOTYPE PHENOTYPE MUTATION
原文传递
TGFBI and CHST6 gene analysis in Chinese stromal corneal dystrophies 被引量:1
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作者 Yin Li Tuo Li +3 位作者 Xiu-Sheng Song Jia-Zhang Li Qing-Song Wu and Hong-Yan Li 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 SCIE CAS 2012年第3期301-306,共6页
AIM:To investigate whether mutations in TGFBI gene or CHST6 gene correlated with stromal corneal dystrophies(CD) in 8 Chinese probands.· METHODS:Eight unrelated patients with stromal corneal dystrophies were recr... AIM:To investigate whether mutations in TGFBI gene or CHST6 gene correlated with stromal corneal dystrophies(CD) in 8 Chinese probands.· METHODS:Eight unrelated patients with stromal corneal dystrophies were recruited in this study;all affected members were assessed by completely ophthalmologic examinations.Genomic DNA was extracted from peripheral leukocytes,17 exons of TGFBI gene and the exon of CHST6 gene were amplified by polymerase chain reaction(PCR),sequenced directly and compared with the reference database.· RESULTS:Three heterozygous mutations in TGFBI gene were identified in six patients:c.370C>T(p.Arg124Cys) was found in exon 4 of TGFBI gene in three members,c.371G>A(p.Arg124His) was found in one patient;c.1663C>T(p.Arg555Trp) was found in exon 12 in other two members.In addition,four polymorphisms with the nucleotide changes rs1442,rs1054124,rs4669,and rs35151677 were found in TGFBI gene.Mutations were not identified in the rest of 2 affected individuals in TGFBI gene or CHST6 gene.· CONCLUSION:Within these patients,R124C,R124H and R555W mutations were co-segregated with the disease phenotypes and were specific mutations for lattice corneal dystrophy type I(LCD I),Avellino corneal dystrophy(ACD,GCDⅡ),granular corneal dystrophy type I(GCD I),respectively.Our study highlights the prevalence of codon 124 and codon 555 mutations in the TGFBI gene among the Chinese stromal corneal dystrophies patients.· 展开更多
关键词 corneal dystrophies Mutation screening tgfbi gene tgfbi protein CARBOHYDRATE sulfotransferse CHST6
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基于生物信息学分析TGFBI基因在头颈部鳞癌中的表达及其预后意义
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作者 胡婷 卢诗丽 +4 位作者 李钰颖 刘洁兰 侯沅林 莫丽梅 唐玉莲 《右江医学》 2023年第2期102-108,共7页
目的探讨转化生长因子β诱导基因(transforming growth factorβ-induced gene,TGFBI)在头颈部鳞癌(head and neck squamous carcinoma,HNSC)中的表达及其预后意义。方法首先通过TIMER2.0数据库分析TGFBI基因在泛癌中的表达水平;并进一... 目的探讨转化生长因子β诱导基因(transforming growth factorβ-induced gene,TGFBI)在头颈部鳞癌(head and neck squamous carcinoma,HNSC)中的表达及其预后意义。方法首先通过TIMER2.0数据库分析TGFBI基因在泛癌中的表达水平;并进一步利用UALCAN数据库和GEPIA数据库检索TGFBI基因在HNSC与正常组织中的表达水平,以及TGFBI基因与患者种族、年龄、性别、肿瘤分期、淋巴结转移状况等相关临床特征的关系;通过STRING数据库分析TGFBI基因的互作蛋白,借助DAVID数据库对其与互作蛋白基因进行功能富集分析;最后通过GEPIA数据库分析TGFBI基因在HNSC中的生存意义。结果发现TGFBI在HNSC中的表达明显高于正常组织(P<0.05),TGFBI高表达的患者总生存期明显低于低表达的患者(P<0.05)。蛋白互作分析发现,FN1、MMP14、ITGA3、ITGAM、ITGAV、ITGB1、ITGB2、ITGB3、TGIF2和TGIF2LX这10个蛋白基因与TGFBI存在紧密联系,此外,TGFBI及相关基因功能富集分析显示它们主要参与了5个生物学程序、4个细胞组分、3个分子功能、4个信号通路。结论TGFBI在HNSC中的表达水平较正常组织明显升高,且与患者预后不良有关,有望成为HNSC诊断和治疗的生物学靶点。 展开更多
关键词 转化生长因子β诱导基因 头颈部鳞癌 生物信息学 预后
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一角膜营养不良家系的TGFBI基因突变
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作者 宋晓东 吴秋月 +4 位作者 朱培冉 刘雪艳 周宏健 李卫巍 夏欣一 《临床检验杂志》 CAS 2023年第3期176-179,共4页
目的对一角膜营养不良家系的致病基因进行检测,明确该家系角膜营养不良的致病基因突变位点。方法采集先证者及其家系成员外周血标本,提取基因组DNA,采用全外显子组测序筛查先证者致病基因及突变位点,并通过Sanger测序对先证者及其家系成... 目的对一角膜营养不良家系的致病基因进行检测,明确该家系角膜营养不良的致病基因突变位点。方法采集先证者及其家系成员外周血标本,提取基因组DNA,采用全外显子组测序筛查先证者致病基因及突变位点,并通过Sanger测序对先证者及其家系成员DNA样本进行验证。结果全外显子测序结果显示,先证者5号染色体上的转化生长因子β诱导基因(TGFBI)4号外显子发生c.370 C>T(p.R124C)杂合突变,8号外显子发生c.1007 A>T(p.E336V)杂合突变。Sanger测序验证发现患者父亲及家系其他患者TGFBI基因也发生c.370 C>T(p.R124C)杂合突变,患者母亲及家系其他正常成员未见TGFBI基因发生突变。TGFBI基因c.370 C>T(p.R124C)突变与疾病表型共分离。结论TGFBI基因c.370 C>T(p.R124C)杂合突变是导致该家系角膜营养不良的致病原因。 展开更多
关键词 角膜营养不良 转化生长因子β诱导基因 全外显子组测序 Sanger测序
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卵巢上皮性癌TGFBI基因启动子甲基化与CyclinD1蛋白表达的关系 被引量:2
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作者 忽平 李红雨 +4 位作者 郭小芬 高玉霞 张红岩 贾冬丽 李爱香 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2011年第21期1315-1317,1321,共4页
目的:研究TGFBI基因启动子甲基化与CyclinD1蛋白表达在卵巢上皮性癌组织中关系,探讨TGFBI基因启动子甲基化在卵巢上皮性癌形成过程中的影响及意义。方法:用甲基化PCR的方法对20例正常卵巢上皮性组织(A组),20例良性卵巢上皮性肿瘤组织(B... 目的:研究TGFBI基因启动子甲基化与CyclinD1蛋白表达在卵巢上皮性癌组织中关系,探讨TGFBI基因启动子甲基化在卵巢上皮性癌形成过程中的影响及意义。方法:用甲基化PCR的方法对20例正常卵巢上皮性组织(A组),20例良性卵巢上皮性肿瘤组织(B组),30例卵巢上皮性癌组织(C组)中TGFBI基因启动子甲基化进行检测,用免疫组化SP方法检测上述标本中CyclinD1蛋白的表达的情况。结果:1)C组TCFBI基因启动子甲基化频率高于B组及A组(P<0.05);2)CyclinD1蛋白在卵巢上皮组织中的表达为:C组>B组>A组,各组之间差异均有统计学意义(P<0.0167);3)卵巢上皮性癌组织中CyclinD1蛋白表达增高与TCFBI基因启动子发生甲基化有关(r=0.505,P<0.05)。结论:TGFBI基因DNA启动子发生甲基化可能上调CyclinD1蛋白的表达,刺激细胞异常增殖。该机制可能参与卵巢上皮性癌的发生发展。 展开更多
关键词 卵巢上皮性癌 tgfbi基因 DNA甲基化 免疫组织化学
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格子状角膜营养不良一家系的TGFBI基因突变研究 被引量:1
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作者 邓莹莹 王玲丽 +2 位作者 许玲 邢怡桥 杨国华 《临床眼科杂志》 2014年第5期429-431,共3页
目的对我国鄂西北地区一格子状角膜营养不良家系进行研究,探讨这一格子状角膜营养不良类型与TGFBI基因突变的关系。方法选取该家系共18例,包括第三代患者及配偶13例,第四代患者2例及无临床症状者3例。收集该家系所有研究对象外周血,提... 目的对我国鄂西北地区一格子状角膜营养不良家系进行研究,探讨这一格子状角膜营养不良类型与TGFBI基因突变的关系。方法选取该家系共18例,包括第三代患者及配偶13例,第四代患者2例及无临床症状者3例。收集该家系所有研究对象外周血,提取基因组DNA,PCR扩增TGFBI基因4、11、12、14号外显子片段并进行直接测序,证实其突变位点。以家系内无近亲关系配偶5人和1名健康者为阴性对照。结果该家系基本符合常染色体显性遗传模式的特征,为LCD I/IIIA型。TGFBI基因编码区进行基因直接测序,发现10例患者和2例无症状者携带者共同突变点为H626R。结论该家系为格子状角膜营养不良LCD I/IIIA型家系,该家系角膜混浊的直接原因是TGFBI基因H626R突变。 展开更多
关键词 格子状角膜营养不良 tgfbi基因 突变
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Chinese family with atypical granular corneal dystrophy type I caused by the typical R555W mutation in TGFBI 被引量:4
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作者 Su-Juan Zhao Ya-Nan Zhu +1 位作者 Xing-Chao Shentu Qi Miao 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 SCIE CAS 2013年第4期458-462,共5页
·AIM: To investigate the clinical features and genetic defects in four generations of a Chinese family affected with atypical granular corneal dystrophy type I (GCD type I). · METHODS: Family history and cli... ·AIM: To investigate the clinical features and genetic defects in four generations of a Chinese family affected with atypical granular corneal dystrophy type I (GCD type I). · METHODS: Family history and clinical data were recorded. Genomic DNA samples were obtained from peripheral blood leukocytes of all participated. Exons of the transforming growth factor-β-induced (TGFBI) gene were directly sequenced after being amplified by polymerase chain reaction (PCR), and multi-point linkage analysis using microsatellite makers flanking the gene was applied to identify the disease-causing mutation. · RESULTS: Clinical features were quite variable in patients, some patients only had opacities in the epithelium, and others revealed multiple bilateral circular, discrete, crumb -like opacities mainly in the epithelium, with several in different depths of corneal stroma, and the performance was different bilaterally, even in the same patient. Directly nucleotide sequencing revealed a heterozygous p.R555W mutation in the coding sequence of the TGFBI gene in all affected individuals of the family, but was not found in all unaffected. The maximum logarithm of odds (LOD) score obtained by multi -point analysis was detected at marker locus D5S393 (LOD = 2.740; α=1.000). ·CONCLUSION: Our case presented with clinical futures and the pathogenic mutations in TGFBI gene, the phenotype of the pedigree was quite different from typical GCD type I, so we suggested that this phenotype was a variant of GCD type I. These findings expand the knowledge about GCD type I, and demonstrate that molecular genetic analysis is important to make an accurate diagnosis of patients with variable corneal dystrophies in clinic. 展开更多
关键词 ATYPICAL granular corneal dystrophy tgfbi gene mutation
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CRISPR/Cas9构建TGFBI稳定敲除HSC-3细胞系
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作者 汪丙杰 郑赛巍 +3 位作者 马聪聪 史聪 李玉婷 何园 《同济大学学报(医学版)》 CAS 2018年第2期26-31,共6页
目的利用CRISPR/Cas9技术稳定敲除人口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)细胞系HSC-3中的TGFBI基因。方法根据CRISPR/Cas9靶点设计原则,设计能特异性针对于TGFBI外显子3上下游的小向导RNA(small guide RNA,sgRNA),并以PX... 目的利用CRISPR/Cas9技术稳定敲除人口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)细胞系HSC-3中的TGFBI基因。方法根据CRISPR/Cas9靶点设计原则,设计能特异性针对于TGFBI外显子3上下游的小向导RNA(small guide RNA,sgRNA),并以PX330质粒为骨架构建能表达此sgRNA的真核重组质粒。将此质粒以及PGK-puro质粒共转染HSC-3细胞,用嘌呤霉素抗性筛选细胞克隆,并用PCR、核酸电泳和测序初步确定基因敲除情况,再通过实时荧光定量PCR及免疫印迹法确认细胞中TGFBI的mRNA和蛋白水平的表达变化情况。结果通过CRISPR/Cas9技术,HSC-3中的TGFBI基因外显子3的核苷酸序列已被完全敲除。免疫印迹法检测显示,相对于HSC-3,TGFBI敲除细胞中无法检测到TGFBI蛋白的表达。同时,通过RT-q PCR对部分基因进行检测,发现一系列与细胞周期和上皮间充质转化相关基因表达发生了改变(P<0.05)。结论通过CRISPR/Cas9技术成功获得了TGFBI基因敲除的HSC-3细胞系,为进一步研究TGFBI在OSCC中的作用及其机制提供了理论基础。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 tgfbi HSC-3细胞 基因敲除
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上皮基底膜角膜营养不良家系的TGFBI基因突变1例研究 被引量:1
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作者 杨晓波 陈丽娟 《国际眼科杂志》 CAS 2012年第10期2029-2032,共4页
目的:检测1例中国上皮基底膜角膜营养不良家系TGFBI基因突变类型。方法:经过详细的病史采集及临床检查后,提取先证者及其家系内其他2例患者和4例有血缘关系的正常家系成员的静脉血白细胞DNA,应用PCR直接测序法对TGFBI的17个外显子进行... 目的:检测1例中国上皮基底膜角膜营养不良家系TGFBI基因突变类型。方法:经过详细的病史采集及临床检查后,提取先证者及其家系内其他2例患者和4例有血缘关系的正常家系成员的静脉血白细胞DNA,应用PCR直接测序法对TGFBI的17个外显子进行候选基因的突变检测。结果:在该家系患者的TGFBI基因4号外显子发现了c.417C>T,导致了杂合突变R124C。家系中正常成员及对照组均未检测到该突变。结论:本研究首次报道了TGFBI基因的R124C杂合突变导致了上皮基底膜角膜营养不良,拓宽了角膜营养不良的基因型与表现型关系,为进一步的分子遗传学研究奠定了基础。 展开更多
关键词 tgfbi基因 上皮基底膜角膜营养不良 基因突变
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海南省糖尿病视网膜病变患者TGFBI基因突变情况分析
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作者 唐平 王玲 +2 位作者 陈执 吕博琦 李蒙恩 《海南医学》 CAS 2019年第16期2117-2120,共4页
目的调查分析转化生长因子β诱导基因(TGFBI)基因突变在海南省糖尿病视网膜病变患者中的发生情况。方法选择2013年8月至2018年2月在海南医学院第一附属医院眼科就诊的海南省糖尿病视网膜病变患者78例作为观察组,同期选择本省非糖尿病视... 目的调查分析转化生长因子β诱导基因(TGFBI)基因突变在海南省糖尿病视网膜病变患者中的发生情况。方法选择2013年8月至2018年2月在海南医学院第一附属医院眼科就诊的海南省糖尿病视网膜病变患者78例作为观察组,同期选择本省非糖尿病视网膜病变患者68例作为对照组,两组患者均进行全血组织TGFBI基因突变检测,记录患者的临床特征并进行相关性分析。结果观察组患者的TGFBI基因突变率为10.25%,明显高于对照组的1.47%,差异有统计学意义(P<0.05);8例TGFBI基因突变患者中,-51G>A 3例,-26A>G 3例,310G>A 1例,895G>T 1例;Pearson相关分析结果显示,海南省糖尿病视网膜病变患者的TGFBI基因突变与最佳矫正视力、视网膜厚度、眼压均呈正相关性(P<0.05)。结论TGFBI基因突变在海南省糖尿病视网膜病变患者中比较常见,与患者的临床特征显著相关。 展开更多
关键词 海南省 转化生长因子β诱导基因 基因突变 糖尿病视网膜病变
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TGFBI(βIGH3)基因及其相关的角膜营养不良 被引量:1
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作者 李璇 《系统医学》 2016年第10期159-162,共4页
对于眼部疾病而言,角膜营养不良是引起眼部疾病的重要原因。基于角膜营养不良的特殊性,以及角膜营养不良对眼球造成的不良影响,只有认真研究角膜不良的成因及影响,并重点研究TGFBI(βIGH3)基因,才能从根本上解决角膜营养不良的问题,实... 对于眼部疾病而言,角膜营养不良是引起眼部疾病的重要原因。基于角膜营养不良的特殊性,以及角膜营养不良对眼球造成的不良影响,只有认真研究角膜不良的成因及影响,并重点研究TGFBI(βIGH3)基因,才能从根本上解决角膜营养不良的问题,实现对角膜的优化,改善角膜的弹性及功能。为此,该研究应立足角膜研究实际,重点研究TGFBI(βIGH3)基因及其相关的角膜营养不良问题,通过实验研究的方式总结研究成果,保证角膜营养不良的问题得到缓解和改善。 展开更多
关键词 tgfbi(βIGH3)基因 角膜营养不良 眼病治疗
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转化生长因子β诱导的基因抑制恶性间皮瘤细胞增殖的体外研究 被引量:3
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作者 曹艳梅 张鹤美 +5 位作者 高四海 贺金奖 童建 张增利 Tom K Hei 李冰燕 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1123-1127,共5页
目的研究转化生长因子β诱导的基因(transforming growth factor-βinduced gene,TGFBI)在体外是否能抑制恶性间皮瘤细胞NCI-H28的增殖。方法将外源性TGFBI稳定性转染到恶性间皮瘤细胞NCI-H28中,绘制生长曲线图,测定其细胞增殖、接种效... 目的研究转化生长因子β诱导的基因(transforming growth factor-βinduced gene,TGFBI)在体外是否能抑制恶性间皮瘤细胞NCI-H28的增殖。方法将外源性TGFBI稳定性转染到恶性间皮瘤细胞NCI-H28中,绘制生长曲线图,测定其细胞增殖、接种效率和软琼脂克隆形成,并进行细胞周期的分析。结果外源性TGFBI在恶性间皮瘤细胞NCI-H28中能够稳定地高表达;当外源性的TGFBI转入到肿瘤细胞NCI-H28后,TGFBI高表达的细胞倍增时间增加了4.38倍;与转染空载体的肿瘤细胞相比:NCI-H28的相对接种效率降低了69.68%,外源性TGFBI表达的T28细胞形成了较小的软琼脂克隆;TGFBI可以使肿瘤细胞阻滞在G1期,并延缓肿瘤细胞进入S期的时间。结论 TGFBI可以抑制恶性间皮瘤细胞的体外增殖。 展开更多
关键词 tgfbi 恶性间皮瘤细胞 细胞增殖
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Ⅰ型前弹力层角膜营养不良患者角膜与正常角膜蛋白的差异表达 被引量:1
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作者 王琪 张泳 +1 位作者 肖迎 陈家祺 《眼科新进展》 CAS 北大核心 2010年第10期937-940,共4页
目的探讨中国人I型前弹力层角膜营养不良(corneal dystrophy of Bowman layertype1,CDB1)患者角膜与正常角膜的蛋白差异表达。方法取1个CDB1家系3例患者外周血,提取基因组DNA,PCR扩增TGFBI基因第4、11、12、14外显子片段并进行直接测... 目的探讨中国人I型前弹力层角膜营养不良(corneal dystrophy of Bowman layertype1,CDB1)患者角膜与正常角膜的蛋白差异表达。方法取1个CDB1家系3例患者外周血,提取基因组DNA,PCR扩增TGFBI基因第4、11、12、14外显子片段并进行直接测序,证实其突变位点。取板层或穿透性角膜移植术后的病变角膜,部分标本行HE染色、阿辛蓝、PAS、刚果红、Masson三色染色后光学显微镜观察,剩余标本提取组织蛋白后进行双向凝胶电泳。以3例正常角膜组织为对照。结果 3例CDB1患者均发现TGFBI基因R124L突变。HE染色证实病变主要累及前弹力层,PAS、刚果红、Masson三色染色阳性,阿辛蓝染色阴性。在PI4-7,相对分子质量7×103~30×103之间病变与正常角膜蛋白表达存在27个差异点。结论中国人CDB1患者以R124L基因突变为主。CDB1角膜异常沉着性质为细胞外淀粉样纤维蛋白沉着。在PI4-7,相对分子质量7×103~30×103之间的差异蛋白可能在CDB1发病过程中起着重要作用。 展开更多
关键词 角膜营养不良 双向电泳 tgfbi基因
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结肠癌实质细胞长标签基因表达系列分析文库的建立及应用 被引量:2
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作者 樊军卫 唐华美 +3 位作者 严东旺 王兆文 王晓亮 彭志海 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期505-509,共5页
目的:应用长标签基因表达系列分析(long serialan alysis of gene expression,LongSAGE)技术定量分析结肠癌实质细胞转录组,并筛选肿瘤相关基因。方法:应用激光捕获显微切割(laser capture microdissection,LCM)、RNA提取和线性扩增方... 目的:应用长标签基因表达系列分析(long serialan alysis of gene expression,LongSAGE)技术定量分析结肠癌实质细胞转录组,并筛选肿瘤相关基因。方法:应用激光捕获显微切割(laser capture microdissection,LCM)、RNA提取和线性扩增方法得到结肠癌实质细胞及其相应正常结肠上皮细胞的反义RNA(antisense RNA,aRNA)样品,构建LongSAGE文库;然后应用SAGE2000软件对所得序列文本进行分析,筛选肿瘤相关基因;最后采用RT-PCR方法验证该差异表达基因。结果:结肠癌细胞LongSAGE文库标签体总数为50542个,识别出基因总数为16497个。正常结肠细胞LongSAGE文库标签体总数为50124个,识别出基因总数为16417个。LongSAGE文库筛选出结肠癌差异表达基因705个(P<0.05)。转化生长因子β诱导基因(transforming growth factor β-induced gene,TGFBI)为LongSAGE文库筛选出的结肠癌相关基因,RT-PCR检测验证了其在结肠癌组织标本中表达上调。结论:LCM-LongSAGE是对结肠癌实质细胞进行定量转录组研究的可行流程。 展开更多
关键词 结肠肿瘤 基因表达谱 序列分析 RNA 显微切割 基因表达系列分析 基因 tgfbi
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Avellino型角膜营养不良一家系基因研究 被引量:4
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作者 王娟娟 廖荣丰 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2013年第6期678-681,共4页
目的对Avellino角膜营养不良一家系进行分子遗传学分析及分类,了解其转化生长因子β诱导(TGFBI)基因突变的类型。方法收集1个Avellino角膜营养不良家系中的4例患者,2例表型正常成员和100例正常对照者的外周血5 ml,提取DNA后利用TGFBI基... 目的对Avellino角膜营养不良一家系进行分子遗传学分析及分类,了解其转化生长因子β诱导(TGFBI)基因突变的类型。方法收集1个Avellino角膜营养不良家系中的4例患者,2例表型正常成员和100例正常对照者的外周血5 ml,提取DNA后利用TGFBI基因所有17个外显子的特异性引物,进行聚合酶链反应(PCR)扩增,并对PCR产物行DNA测序分析。结果该家系4例患者的TGFBI基因第4号外显子存在CGC>CAC(R124H)杂合突变,而家系表现正常成员无此基因位点突变。同时4例患病家庭成员存在同义单核苷酸多态性(SNP):第11外显子杂合性的CTC>CTT(L472L),第12外显子杂合性的TTT>TTC(F540F)结论 Avellino角膜营养不良家系存在TGFBI基因突变,为R124H杂合突变类型。 展开更多
关键词 角膜营养不良 tgfbi基因 突变 杂合子
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两例颗粒角膜营养不良患者临床特征及基因突变分析 被引量:1
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作者 李瑾 旷龙昊 +2 位作者 王婷 黄滔 闫晓河 《罕少疾病杂志》 2022年第3期19-20,25,共3页
目的分析两例颗粒状角膜营养不良(GCD)中年女性患者的临床特征及利用高通量测序结合PCR测序鉴定其基因突变位点。方法结合两名患者典型临床表现及眼前段照相结果对临床特征进行分析,并对其外周血进行目标序列捕获高通量测序技术结合PCR... 目的分析两例颗粒状角膜营养不良(GCD)中年女性患者的临床特征及利用高通量测序结合PCR测序鉴定其基因突变位点。方法结合两名患者典型临床表现及眼前段照相结果对临床特征进行分析,并对其外周血进行目标序列捕获高通量测序技术结合PCR测序鉴定基因突变位点。结果两名患者临床表现为反复发生的角膜刺激症状伴视力下降,眼前段照相显示角膜基质层颗粒状或雪花状混浊,患者外周血基因测序发现TGFBI基因上分别存在c.1663C>T:p.R555W及c.371G>A:p.R124杂合位点突变。结论两名颗粒状角膜营养不良患者均表现为角膜刺激症状,该疾病分别由TGFBI基因的c.1663C>T:p.R555W及c.371G>A:p.R124位点杂合突变导致,基因检测分别诊断为GCD1型及GCD2型。 展开更多
关键词 颗粒状角膜营养不良 基因突变 tgfbi基因
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Pathogenic mutations of TGFBI and CHST6 genes in Chinese patients with Avellino,lattice,and macular corneal dystrophies 被引量:2
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作者 Ya-nan HUO Yu-feng YAO Ping YU 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2011年第9期687-693,共7页
Objective:To investigate gene mutations associated with three different types of corneal dystrophies(CDs),and to establish a phenotype-genotype correlation.Methods:Two patients with Avellino corneal dystrophy(ACD),fou... Objective:To investigate gene mutations associated with three different types of corneal dystrophies(CDs),and to establish a phenotype-genotype correlation.Methods:Two patients with Avellino corneal dystrophy(ACD),four patients with lattice corneal dystrophy type I(LCD I) from one family,and three patients with macular corneal dystrophy type I(MCD I) were subjected to both clinical and genetic examinations.Slit lamp examination was performed for all the subjects to assess their corneal phenotypes.Genomic DNA was extracted from peripheral blood leukocytes.The coding regions of the human transforming growth factor β-induced(TGFBI) gene and carbohydrate sulfotransferase 6(CHST6) gene were amplified by polymerase chain reaction(PCR) and subjected to direct sequencing.DNA samples from 50 healthy volunteers were used as controls.Results:Clinical examination showed three different phenotypes of CDs.Genetic examination identified that two ACD subjects were associated with homozygous R124H mutation of TGFBI,and four LCD I subjects were all associated with R124C heterozygous mutation.One MCD I subject was associated with a novel S51X homozygous mutation in CHST6,while the other two MCD I subjects harbored a previously reported W232X homozygous mutation.Conclusions:Our study highlights the prevalence of codon 124 mutations in the TGFBI gene among the Chinese ACD and LCD I patients.Moreover,we found a novel mutation among MCD I patients. 展开更多
关键词 转变生长因素 -- 导致(tgfbi ) 基因 糖类 sulfotransferase 6 (CHST6 ) 基因 角膜的营养障碍 变化
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角膜营养不良家系的TGFBI基因突变研究 被引量:4
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作者 齐艳华 赫红丹 +4 位作者 李颖 林辉 谷静芝 苏虹 黄尚志 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期310-312,共3页
目的确定中国角膜营养不良患者所存在的TGFBI基因突变类型。方法对3个角膜基质营养不良家系和1个Thiel Behnke角膜营养不良家系进行分析,其中1个家系成员是蒙古族人,另3个家系则是汉族人。利用合成的TGFBI基因13个外显子的特异性引物,... 目的确定中国角膜营养不良患者所存在的TGFBI基因突变类型。方法对3个角膜基质营养不良家系和1个Thiel Behnke角膜营养不良家系进行分析,其中1个家系成员是蒙古族人,另3个家系则是汉族人。利用合成的TGFBI基因13个外显子的特异性引物,应用聚合酶链反应进行扩增,并直接测序分析。结果1个颗粒状角膜营养不良家系患者中检测到R555W突变;1个Thiel Behnke角膜营养不良家系患者为R555Q突变;另外2个Avellino角膜营养不良家系患者中发现R124H突变,这3种突变均为杂合子。结论研究表明R555和R124密码子在中国人常染色体显性遗传性角膜营养不良的发病机理中起重要作用。Thiel Behnke角膜营养不良患者为R555Q突变,在我国属首次报告。 展开更多
关键词 角膜营养不良 tgfbi基因 常染色体显性遗传 杂合子 突变
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一个非典型Reis-Bückler角膜营养不良家系的TGFBI基因突变研究 被引量:5
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作者 李丹丹 齐艳华 +3 位作者 韩清 林辉 赵黎明 张春美 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期245-248,共4页
目的通过基因突变分析,确定一个非典型Reis-Biickler角膜营养不良家系突变基因型和表现型之间的关系。方法采集家系中的4例患者及2名健康成员和100名正常对照的外周血10mL,提取白细胞DNA,应用聚合酶链反应分别扩增TGFBI基因的第4、11... 目的通过基因突变分析,确定一个非典型Reis-Biickler角膜营养不良家系突变基因型和表现型之间的关系。方法采集家系中的4例患者及2名健康成员和100名正常对照的外周血10mL,提取白细胞DNA,应用聚合酶链反应分别扩增TGFBI基因的第4、11、12、14外显子,并对扩增产物进行直接测序分析。结果发现TGFBI基因第623密码子第2个碱基呈杂合性点突变G-A,导致甘氨酸突变为天冬氨酸(P.G623D),家系中健康成员和正常对照均未检测到此突变存在。结论这一由TGFBI基因G623D突变引起的角膜营养不良为非典型的ReisBiickler角膜营养不良,这在我国属首次报告。 展开更多
关键词 Reis-Btickler角膜营养不良 tgfbi基因 杂合子 突变
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角膜营养不良患者TGFBI基因突变特点及基因型-表型关系 被引量:4
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作者 许可 孙旭光 +4 位作者 谢玥 梁庆丰 张晓慧 蒋凤 李杨 《中华眼视光学与视觉科学杂志》 CAS CSCD 2016年第3期153-159,共7页
目的分析TGFBI基因相关角膜营养不良患者的基因突变特点及基因型-表型关系。方法系列病例研究。应用聚合酶链式反应(PCR)技术对63例角膜营养不良患者基因组DNA进行TGFBI基因扩增并直接测序,所有患者进行详细的眼科检查,包括最佳矫... 目的分析TGFBI基因相关角膜营养不良患者的基因突变特点及基因型-表型关系。方法系列病例研究。应用聚合酶链式反应(PCR)技术对63例角膜营养不良患者基因组DNA进行TGFBI基因扩增并直接测序,所有患者进行详细的眼科检查,包括最佳矫正视力(BCVA)、眼前节检查,部分患者行角膜激光共聚焦显微镜(HRT)检查。结果63例患者中有48例检测到9种TGFBI基因杂合错义突变,包括8种已报道过的致病突变[c.371G〉A(p.R124H)、c.370C〉T(p.R124C)、c.371G〉T(p.R124L)、c.1663C〉T(p.R555W)、c.1664G〉A(p.R555Q)、C.1514T〉A(p.V505D)、c.1859C〉A(p.A620D)、C.1877A〉G(p.H626R)]和1种新突变[c.1694T〉A(p.L565H)],突变主要分布于第4号外显子,突变频次为37次,其中携带c.371G〉A(p.R124H)突变的Avellino角膜营养不良患者所占比例最大(28/48)。48例阳性患者平均发病年龄为(31.3±16.8)岁,裂隙灯显微镜检查患者双眼可见角膜上皮至基质层均混浊,不同突变导致患者角膜沉积物形态各异。结论本研究新发现的c.1694T〉A(P.L565H)突变,拓展了角膜营养不良TGFBI基因突变谱。并再次证实371G〉A(p.R124H)是亚洲TGFBI基因突变相关角膜营养不良最常见的突变形式。角膜营养不良患者存在表型异质性,角膜沉积物特征与其携带的基因突变明显相关,以分子遗传学为基础的角膜营养不良分类方法可以提高临床诊断的准确性。 展开更多
关键词 角膜营养不良 遗传性 表型 tgfbi基因 基因突变
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