牛TRAF6基因编码区的克隆及序列分析

为了探讨牛TRAF6基因的结构与功能,采用基因克隆技术分离了牛TRAF6基因的编码区序列,并采用生物信息学方法分析了该基因及其所编码的蛋白质的序列特征、结构和功能。结果表明:分离了TRAF6基因1803 bp的cDNA序列(GenBank登录号为DQ471669),编码区长度为1 629 bp,编码542个氨基酸(GenBank登录号为ABF06558),位于细胞核、细胞质、线粒体、内质网等多种细胞器上,分子量为61.57176 ku,等电点为6.09,含有RING-finger、zf-TRAF和MATH_TRAF6结构域。该蛋白与人、小鼠和大鼠TRAF6蛋白的同源性分别为89%、84%和82%,其结构域的同源性均达到95%以上。根据各物种间TRAF6蛋白的高同源性,结合人和小鼠TRAF6蛋白在TNF/TLRs/TIR超家族介导的信号转导途径中的重要作用,推测牛TRAF6蛋白也可能参与调节多种信号通路,在免疫反应、炎症反应、细胞分化和凋亡等生物学过程中发挥重要功能。