小鼠睾丸特异表达基因TSEG-1的克隆及序列分析

从表达序列标签（expressed sequence tags,ESTs）数据库ZooDDD中获得小鼠正常睾丸表达的EST,通过dbEST数据库检索出与其高度同源的EST序列,构建EST叠加群（contigs）,Biolign软件拼接,GeneScan软件预测contigs对应的基因组序列中的外显子、内含子 针对开放阅读框设计引物序列,采用RT-PCR从小鼠睾丸组织中克隆新基因的cDNA,分析该基因在小鼠各脏器中的mRNA表达,并对测序结果进行生物信息学分析。结果表明：在小鼠X染色体的1668～2011kb间克隆出一新基因TSEG-1,全长为510bp,开放阅读框为336bp,编码111氨基酸,分子量12.84258kDa,等电点11.4000。RT-PCR证实该基因开放阅读框正确,在小鼠睾丸组织中特异性表达,且与小鼠其他cDNA无同源性,获得GenBank登录号EU079024。功能区分析发现TSEG-1蛋白可能为一种跨膜蛋白,跨膜区位于第41～61氨基酸残基。TSEG-1基因与人类睾丸特异性组蛋白2α变异体基因有较高同源性,在TSEG-1基因5′-端非编码侧翼预测发现存在1个启动子区域,范围为680bp。TSEG-1蛋白可能有4个抗原性位点,2个特异性蛋白激酶的磷酸化位点,其亚细胞定位可能位于线粒体。小鼠睾丸特异性基因TSEG-1的克隆为进一步研究其生物学功能和表达调控奠定了基础。