IL-12B和TTC1基因交互作用与中国汉族人银屑病的相关性研究

目的研究IL-12B和TTC1基因交互作用对中国汉族人银屑病发病的影响。方法从前期银屑病GWAS中选取1 139个病例和1 132个对照,经过性别和年龄匹配。使用PLINK软件的SNP×SNP计算两SNPs之间的交互作用,Logistic回归分析每个SNP的最佳关联模型。结果 IL-12B和TTC1在中国汉族人银屑病发病中存在交互作用(P=3.74×10-4)。IL-12B的最佳关联模型为累加模型(OR=1.42,P=6.04×10-3);GG和AG为风险基因型。结论 IL-12B和TTC1在中国汉族人银屑病发病过程中存在交互作用。

lncRNA-TTC39A-AS1通过调控雌激素受体靶基因促进雌激素受体阳性乳腺癌细胞生长增殖

目的:系统筛选受雌激素显著调控且极具临床意义的lncRNA,并探究这些lncRNA如何参与雌激素受体阳性乳腺癌的发生发展。方法:通过全转录组高通量测序(RNA-seq)结合生物信息分析找到受雌激素显著诱导的lncRNA;结合GEPIA数据库找到受雌激素显著调控且在乳腺癌临床样品中特异高表达的lncRNA(TTC39A-AS1);利用PhyloCSF分析方法分析TTC39A-AS1是否具有编码能力;通过MTS、克隆形成实验及流式细胞术检测TTC39A-AS1对乳腺癌细胞的生长增殖及细胞周期的影响;利用LncAtlas数据库及核质分离结合qRT-PCR检测TTC39A-AS1的细胞内定位情况;在雌激素存在与否情况下,利用qRT-PCR检测敲低TTC39A-AS1后对雌激素靶基因表达的影响情况。结果:TTC39A-AS1被雌激素显著上调且在仅乳腺癌中特异性高表达;TTC39A-AS1不具有编码能力,是典型的长链非编码RNA;TTC39A-AS1促进乳腺癌细胞的生长增殖和克隆形成,当敲低TTC39A-AS1时会使乳腺癌细胞周期显著阻滞在G1期;TTC39A-AS1在细胞核和细胞质中都有分布;TTC39A-AS1被敲降后显著下调了雌激素靶基因的表达。结论:lncRNA-TTC39A-AS1受雌激素显著诱导且通过增强雌激素靶基因的表达促进雌激素受体阳性乳腺癌细胞生长增殖,因其仅在乳腺癌中特异性高表达属性,故可作为非常有前景的潜在的乳腺癌临床治疗靶点。

绝经后骨质疏松症差异表达lncRNAs及其靶基因抑瘤素M在外周血的表达研究

目的探讨绝经后骨质疏松症差异表达lncRNAs及其靶基因抑瘤素M(oncostatin M,OSM)在绝经后骨质疏松症外周血的表达及其意义。方法在前期lncRNA-mRNA芯片检测绝经后骨质疏松症差异lncRNAs并进行共表达分析的基础上,利用blat软件分析lncRNA TTC28-AS1、linc-IRF2BP2-1、linc-FAM126B-1靶基因;RNAfold预测其二级结构;随机选择绝经后妇女受试者,检测骨密度,正常骨密度妇女25例为对照组,骨质疏松症患者25例为骨质疏松症组;定量PCR检测两组人群外周血lncRNA TTC28-AS1、linc-IRF2BP2-1、linc-FAM126B-1及抑瘤素M的表达。结果blat软件预测lncRNA TTC28-AS1、linc-IRF2BP2-1、linc-FAM126B-1的靶基因为OSM,相关系数分别为0.8506(P=0.0037)、0.9314(P=0.0003)及0.9222(P=0.0004);RNAfold预测3个lncRNAs均具有多个茎环、多分枝内部环结构;lncRNA TTC28-AS1、linc-IRF2BP2-1、linc-FAM126B-1及其靶基因抑瘤素M在骨质疏松症组中表达水平均显著低于对照组(P值均小于0.05)。结论lncRNA TTC28-AS1、linc-IRF2BP2-1、linc-FAM126B-1及其靶基因抑瘤素M表达下调可能与绝经后骨质疏松症存在相关性。