Repetitive Sequences in Plant Nuclear DNA:Types, Distribution, Evolution and Function

Repetitive DNA sequences are a major component of eukaryotic genomes and may account for up to 90% of the genome size. They can be divided into minisatellite, microsatellite and satellite sequences. Satellite DNA sequences are considered to be a liist-evolving component of eukaryotic genomes, comprising tandemly-arrayed, highly-repetitive and highly-conserved monomer sequences. The monomer unit of satellite DNA is 150M00 base pairs （bp） in length. Repetitive sequences may be species- or genus-specific, and may be centromeric or subtelomeric in nature. They exhibit cohesive and concerted evolution caused by molecular drive, leading to high sequence homogeneity. Repetitive sequences accumulate variations in sequence and copy number during evolution, hence they are important tools for taxonomic and phylogenetic studies, and are known as ＂tuning knobs＂ in the evolution. Therefore, knowledge of repetitive sequences assists our understanding of the organization, evolution and behavior of eukaryotic genomes. Repetitive sequences have cytoplasmic, cellular and developmental effects and play a role in chromosomal recombination. In the post-genomics era, with the introduction of next-generation sequencing tech- nology, it is possible to evaluate complex genomes for analyzing repetitive sequences and decipher- ing the yet unknown functional potential of repetitive sequences.

不同温度焚烧对成人股骨16个基因位点的影响

目的：探讨不同温度焚烧后骨骼DNA浓度的变化以及16个基因位点的存留情况。方法：常压下以100-500℃对30例成人股骨进行焚烧，对其存留DNA进行浓度测定，用Identifiler^TMPCR试剂盒进行荧光标记和复合扩增，ABI3100xl Genetic Analyzer软件对DNA16个基因位点进行检测和分析。结果：骨骼样本提取的DNA浓度在50．6～0．0ng／μl之间。未烧和5个温度焚烧后基因位点存留不同，位点检出率分别为98．5％、82．7％、52．9％、35．0％、8．5％、0．4％。结论：温度对骨骼DNA的保存有很大影响，温度越低，保存越完整；片段越小，存留越多。

蒙古冰草Afa家族串联重复序列克隆及染色体定位（英文）

Afa家族串联重复序列因只出现在小麦及小麦族近缘属物种而得名,本研究从蒙古冰草中克隆得到一个Afa家族序列,长度为233 bp,命名为pAmAfa1,该序列在GENBANK中进行同源序列比对,结果表明该序列与大多数小麦族其他物种的Afa家族串联重复序列存在较高的相似性;系统进化分析表明,蒙古冰草pAmAfa1序列与大赖草pLrAfa3,pLrAfa5序列聚在一起,表明蒙古冰草P染色体组与大赖草的N、X染色体亲源关系较近。为了明确Afa家族串联重复序列在蒙古冰草染色体上的位置,双色荧光原位杂交技术被采用,以pAmAfa1为探针检测到杂交信号出现在染色体的末端或近端部的区域,每条染色体上都有杂交信号,表明Afa家族串联重复序列普遍存在于P染色体组中。

重复序列在牛亚科中的研究进展

重复序列是在整个基因组中以多个拷贝出现的核酸序列,是真核生物基因组中的重要组成部分,对染色体重排、基因组及生物进化具有重要意义。它在模式动物、人类、植物等物种中都有报道,但在牛亚科中的研究进展较少,因此本文对重复序列的分类和特点进行综述,重点关注串联重复序列和散在重复序列在牛亚科中的研究进展,并分析了这两大类重复序列在牛亚科物种进化中的作用。

WT-1 mRNA定量分析在急性白血病移植后微小残留病监测中的意义

目的探讨定量检测Wilms瘤基因1(WT-1)m RNA在急性白血病患者造血干细胞移植后的疗效、预后和预测复发中的价值。方法收集84例经异基因造血干细胞移植的急性白血病患者不同治疗时间的骨髓标本,实时荧光定量聚合酶链反应技术(RQ-PCR)分析WT-1 m RNA表达水平;聚合酶链反应-短串联重复序列法(PCR-STR)分析移植后供体基因嵌合率,并进行统计学分析。结果与AML和ALL治疗前组WT-1表达水平[分别为4.13(0.77,9.26)、0.69(0.16,2.35)]比较,AML和ALL治疗后组[分别为0.51(0.06,0.91)(U=164,P<0.01);0.06(0.02,0.10)(U=315,P<0.01]、缓解组[分别为0(0,0.06)(U=0,P<0.01);0(0,0.03)(U=0,P<0.01)]表达水平均明显下降。与缓解组相比,AML复发组[3.35(2.46,5.63)(U=0,P<0.01)]、ALL复发组[2.46(2.17,3.31)(U=0,P<0.01)]WT-1表达水平均明显上升。15例复发患者,在临床确诊复发前的WT-1水平明显升高。移植患者WT-1水平与供体基因嵌合率呈负相关(r=-0.73,P<0.05)。结论 WT-1m RNA定量分析可用于监测经造血干细胞移植急性白血病患者的微小残留病灶,评估疗效、预后及预测疾病复发风险。

18株耐药结核分枝杆菌散在分布重复单位基因型分析

目的:了解宁波市江北区流动人口结核耐药菌株的基因型,为探讨流行病学传播规律,正确制定防控策略提供依据。方法:随机抽取江北区流动人口分离的耐药结核分枝杆菌22株,先用PCR检测耐药基因,再对耐药菌株进行MIRU基因分型,同时对12个MIRU位点的多态性进行比较。结果:随机抽取的22株耐药菌株中耐药基因阳性18株,MIRU分型结果有18种MIRU基因型,12个MIRU位点的h值为0.73～0.88之间,显示了较高的多态性(h>0.6)。结论:江北区流动人口肺结核耐药菌株MIRU基因型呈"唯一性",说明发病以内源性、散发为主。MIRU分型简单快速有效。