生物信息学方法对影响肺癌发生发展关键基因的初步筛选

背景与目的肺癌是最常见的恶性肿瘤之一。对于肺癌基因芯片的研究已在很多报道里提及,但是鲜有报道汇总所有的基因芯片数据来研究肺癌的共同表达通路从而挖掘出特殊的基因标记来作为治疗肺癌的靶点。本研究从肺癌相关的基因芯片数据库(GEO DataSets)中初步筛选出与肺癌发生发展有关键联系的基因与通路。方法运用基因富集(geneset enrichment analysis,GSEA)等生物信息学方法比较选择出的6套肺癌基因芯片表达谱数据,初步筛选出在转录水平上影响肺癌的通路及基因。结果用GSEA方法分析6组芯片集中所得的通路对比,上调中皆有的通路有3条;下调中皆有的通路有26条。本研究挑选共同存在于6套芯片数据集的下调通路即紧密连接(tightjunction)通路里的基因进行meta分析,可得差异有统计学意义(P<0.05)的基因11个。结论紧密连接通路在肺癌发生发展过程中的共性可能有一定研究意义,可在后续研究中探讨通路里的显著性基因。

内皮细胞屏障与烧伤后血管通透性的关系及机制

正常血管通透性的维持有赖于血管内皮细胞屏障的完整性，内皮细胞与内皮细胞间、细胞与基底膜间的连接以及胞内骨架蛋白收缩这3种力量，经蛋白质相互作用，在功能和调节上互相关联。烧伤休克的主要临床特点是低血容量性休克，其主要原因之一是毛细血管扩张，血管通透性增加，毛细血管静水压增加，促进了血浆样液体的渗出，导致血容量锐减。关于内皮细胞屏障功能在烧伤后血管通透性变化中的作用，我们近年来做了一些研究工作。