基于联合残基力场的蛋白质结构预测的研究进展

讨论了作为后基因组时代的重大课题的蛋白质结构预测的简单分类和基于能量预测方法的难点,系统论述了在进行蛋白质结构预测中的一种模型即联合残基力场的形式和参数的确定方法以及相关项的作用,讨论了在力场中势能函数全局能量最优化方法即构象空间退火算法的基本原理,分析了利用联合残基力场和构象空间退火算法预测蛋白质结构的例子。

基于联合残基力场的蛋白质能量优化

简述了蛋白质结构预测中存在的问题,主要介绍了蛋白质分子力场的一种模型即联合残基力场,然后利用这种模型对一种多肽和葡萄球菌蛋白的部分段进行试验,使它们的能量不同程度的得到了最小化,其中前者的初始能量为-71.50461kcal/mol,最小化后为-73.32767kcal/mol.