期刊文献+
共找到30篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
广东省自然保护区DCA排序与UPGMA聚类研究 被引量:10
1
作者 贾小容 苏志尧 +1 位作者 陈北光 周毅 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期75-79,共5页
选取广东省已进行过深入调查的20个自然保护区为样本,以稀有濒危物种分布、维管植物数量、稀有濒危动植物的种数、保护区面积、年平均降雨量等属性数据作为变量,建立数据库,进行DCA排序和UPGMA聚类研究.DCA排序结果显示,各自然保护区在... 选取广东省已进行过深入调查的20个自然保护区为样本,以稀有濒危物种分布、维管植物数量、稀有濒危动植物的种数、保护区面积、年平均降雨量等属性数据作为变量,建立数据库,进行DCA排序和UPGMA聚类研究.DCA排序结果显示,各自然保护区在排序空间中基本上聚集在一起,表明它们的β多样性即样本间的梯度很低,具有很强的同质性.各个保护区的聚类结果基本上反映了省内生境的地带性分异.60种稀有濒危植物的聚类结果则反映出它们在各个保护区分布情况的相似程度,这就间接地表明了它们的分布与相关自然保护区生境条件的密切关系.本项研究的结果提示,在做好行政及管理协调的基础上,从自然保护的角度着眼,可把地理相近、梯度相差较少的保护区合并,组成更大面积的自然保护区.本项研究还表明,采用排序结合聚类的方法对于所选样本的分类是行之有效的. 展开更多
关键词 广东 自然保护区 DCA排序 upgma聚类 生境条件 稀有濒危物种
下载PDF
基于UPGMA的优化初始中心K-means算法研究 被引量:2
2
作者 张锐 王义武 +3 位作者 朱啸龙 殷俊 韩晨 杨余旺 《计算机技术与发展》 2018年第2期50-53,58,共5页
为了弥补传统K-means算法聚类效果严重依赖于初始聚类中心这一不足,提出了OICC K-means算法。将不加权算术平均组对法(UPGMA)进行改进,通过该算法将密集区域的数据合并得到可以反映数据分布的若干数据点,再由最大最小距离算法从中选出... 为了弥补传统K-means算法聚类效果严重依赖于初始聚类中心这一不足,提出了OICC K-means算法。将不加权算术平均组对法(UPGMA)进行改进,通过该算法将密集区域的数据合并得到可以反映数据分布的若干数据点,再由最大最小距离算法从中选出彼此相距较远的点,作为传统K-means算法的初始聚类中心,从而使K-means算法有一个可以反映数据分布特征的输入。在典型数据集上进行的实验发现,相较于传统K-means算法,OICC K-means算法拥有更强的聚类能力,在准确率、召回率和F-测量值方面均有明显提高。在OICC K-means算法的前两个阶段(即UPGMA算法和最大最小距离算法)产生了较理想的初始聚类中心,这些中心点选自于数据密集的区域,因此避免了噪声数据、边缘数据带来的不良影响,使得K-means算法没有陷入局部最优解而达到了整体良好的聚类效果,同时聚类中心的个数在算法中自动确定而不需要手动设置。 展开更多
关键词 聚类 初始中心 不加权算术平均组对法 最大最小距离算法 K-MEANS算法
下载PDF
部分柚类品种数值分类研究 被引量:26
3
作者 刘勇 孙中海 +2 位作者 刘德春 吴波 江东 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期35-40,共6页
利用NTSYS软件对柚类33个品种65个形态学性状进行了品种Q型聚类及其性状R型聚类,采用Mantel相关性检测优化出29个性状为核心性状。结果表明,29个性状对33个柚类品种的聚类,可分成6个组群;29个性状聚类也可分成6组。主成分分析,前9个主... 利用NTSYS软件对柚类33个品种65个形态学性状进行了品种Q型聚类及其性状R型聚类,采用Mantel相关性检测优化出29个性状为核心性状。结果表明,29个性状对33个柚类品种的聚类,可分成6个组群;29个性状聚类也可分成6组。主成分分析,前9个主成分累积贡献率达75%,根据前9个主成分与性状间的相关性,选出影响力较大18个性状,综合了柚类特有的果实因子、花器官因子、枝条因子、叶片因子,说明这些因子是柚类品种重要特征。试验结果将有利于今后更好地利用形态学指标评定柚类品种及根据分类结果更好地利用这些丰富育种材料的遗传背景。 展开更多
关键词 数值分类 性状指标筛选 upgma聚类分析
下载PDF
江西柑橘地方品种资源及野生近缘种SSR分子标记 被引量:19
4
作者 刘勇 吴波 +1 位作者 刘德春 孙中海 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期486-490,共5页
利用SSR分子标记方法研究了63个江西柑橘地方品种资源及野生近缘种的遗传多样性,用30对SSR引物,检测到374条等位基因,平均每对引物检测到等位基因3~28个,平均12.47个,平均信息量为0.805.用UPGMA方法可将63个试材划分为8个类群,聚类结... 利用SSR分子标记方法研究了63个江西柑橘地方品种资源及野生近缘种的遗传多样性,用30对SSR引物,检测到374条等位基因,平均每对引物检测到等位基因3~28个,平均12.47个,平均信息量为0.805.用UPGMA方法可将63个试材划分为8个类群,聚类结果可以推断出崇义野生橘可能是江西柑橘的始祖,井冈野生橙可能是橘类和橙类的杂交种. 展开更多
关键词 江西柑橘 种质资源 遗传多样性 SSR分子标记 upgma聚类分析
下载PDF
应用微卫星标记分析不同桔小实蝇种群的遗传多样性 被引量:10
5
作者 吴仲真 李红梅 +5 位作者 宾淑英 申建梅 贺华良 罗梅 马骏 林进添 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期149-156,共8页
为探究不同桔小实蝇Bactrocera dorsalis(Hendel)地理种群的遗传变异、入侵来源和扩散情况,利用13对引物对中国南方10省区、泰国、夏威夷、菲律宾和老挝的30个桔小实蝇种群共180个个体的遗传多样性水平进行了研究。Popgene32和NTSYS-p... 为探究不同桔小实蝇Bactrocera dorsalis(Hendel)地理种群的遗传变异、入侵来源和扩散情况,利用13对引物对中国南方10省区、泰国、夏威夷、菲律宾和老挝的30个桔小实蝇种群共180个个体的遗传多样性水平进行了研究。Popgene32和NTSYS-pc2.10e软件分析结果表明:30个不同桔小实蝇种群的遗传相似度在0.3599~0.9153范围内。种群的Nei氏基因多样性指数平均为0.6464±0.1026,Shannon信息指数I平均为1.2845±0.2632,提示桔小实蝇种群具有较丰富的遗传多样性。UPGMA聚类分析显示,福建地区和海南地区分别独立一支,广东地区和台湾地区种群聚成一支,而广西、泰国、湖南、云南、老挝、四川、重庆和贵州地区聚为一大支系。据此提出泰国种群和老挝种群是最早入侵我国的种群,云南地区是最早的入侵地,广西地区可能为又一较早入侵地。 展开更多
关键词 桔小实蝇 地理种群 遗传多样性 遗传距离 微卫星 upgma聚类分析
下载PDF
沙田柚系列遗传关系的RAPD标记研究 被引量:11
6
作者 张太平 彭少麟 +2 位作者 凌定厚 李丹 甘廉生 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期247-251,共5页
采用 RAPD标记技术分析了沙田柚系列 1 2个样品的遗传关系。利用经筛选具多态性的 1 4个 1 0碱基随机引物对 1 2个样品进行 DNA随机扩增 ,获得清晰可重复的位点 99个 ,其中多态性位点 5 8个 ,占 5 8.89% ;在部分样品中检出了特异性 RAP... 采用 RAPD标记技术分析了沙田柚系列 1 2个样品的遗传关系。利用经筛选具多态性的 1 4个 1 0碱基随机引物对 1 2个样品进行 DNA随机扩增 ,获得清晰可重复的位点 99个 ,其中多态性位点 5 8个 ,占 5 8.89% ;在部分样品中检出了特异性 RAPD标记 1 9个 ,占 1 9.1 9% ;通过样品间遗传相似性系数比较与 UPGMA聚类分析 ,并根据历史事实可知 ,广西沙田柚、梅州金柚为沙田柚的无性繁殖系 ,软枝系沙田柚、沙田柚早熟单株为沙田柚的芽变后代 ,梅花早柚、菊花心沙田柚、冬瓜圈沙田柚、段氏柚、垫江沙田柚、古老钱沙田柚为沙田柚的实生变异品系。 展开更多
关键词 沙田柚系列 RAPD标记 遗传相似性 upgma聚类分析
下载PDF
不同地域野生欧李及其近缘植物亲缘关系的RAPD分析 被引量:14
7
作者 王鹏飞 李利锋 +4 位作者 杜俊杰 张建成 纪薇 穆霄鹏 曹琴 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期119-126,共8页
利用RAPD分子标记技术对21个不同地域欧李及其近缘种属植物(桃、杏、李、樱桃)进行了遗传亲缘关系及分类研究。结果表明,用于不同地域野生欧李分析的25条引物中,共扩增出441个清晰可用的DNA片段,其中多态性位点366个,多态性比为82.99%... 利用RAPD分子标记技术对21个不同地域欧李及其近缘种属植物(桃、杏、李、樱桃)进行了遗传亲缘关系及分类研究。结果表明,用于不同地域野生欧李分析的25条引物中,共扩增出441个清晰可用的DNA片段,其中多态性位点366个,多态性比为82.99%。在遗传相似系数为0.71时,可将中国野生欧李资源划分为3个大的区域,分别为东北分布群、华北华东分布群与中西部分布群。用于欧李及其近缘种属植物分析的20条引物中,共扩出多态性带683条,多态性比率为98.99%。聚类分析表明,在遗传相似系数为0.61时,欧李与其近缘种属植物分为3大类;欧李与麦李的亲缘关系最近,与桃亲缘关系最远。 展开更多
关键词 欧李 野生种群 RAPD 遗传多样性 近缘植物 聚类分析
下载PDF
滇杨优树遗传多样性的AFLP分析 被引量:11
8
作者 纵丹 员涛 +4 位作者 周安佩 刘东玉 郑元 段安安 何承忠 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2014年第4期103-108,213,共7页
以收集于云南和四川的52株滇杨优树为试验材料,并以1株大叶杨、1株北京杨和2株黑杨做类外对照,采用AFLP分子标记技术进行基因组DNA水平检测。结果表明,筛选出的8对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合对52株滇杨优树共扩增出264条带,其中多态性条... 以收集于云南和四川的52株滇杨优树为试验材料,并以1株大叶杨、1株北京杨和2株黑杨做类外对照,采用AFLP分子标记技术进行基因组DNA水平检测。结果表明,筛选出的8对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合对52株滇杨优树共扩增出264条带,其中多态性条带174条,多态带百分率为64.52%,检测到有效等位基因数(Ne)为1.184,基因多样度(H)为0.121,Shannon信息指数为0.201,平均遗传相似系数为0.877;对56份杨树样本共扩增出325条带,其中多态性条带共247条,多态带百分率为75.21%,检测出有效等位基因数(Ne)为1.185,基因多样度(H)为0.122,Shannon信息指数为0.209,平均遗传相似系数为0.876。UPGMA聚类分析结果显示,除滇杨优树QXB007与QXJ030外,其余杨树分析样本均能够被鉴别。基于采集地和遗传相似系数的模糊聚类分析表明,52株滇杨优树除开远采集地外,丽江采集地样本与其他采集地样本之间均有交集,说明丽江可能是滇杨的分布中心和起源中心。该研究结果为滇杨人工选择育种、遗传改良、种质资源收集与保存等提供了理论依据。 展开更多
关键词 滇杨优树 AFLP 遗传多态性 遗传相似系数 upgma聚类分析
下载PDF
基于SSR标记的荷花品种遗传多样性及群体结构分析 被引量:7
9
作者 杜凤凤 刘晓静 +3 位作者 常雅军 李乃伟 李丕睿 姚东瑞 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期9-16,共8页
采用SSR标记技术对42个荷花品种(Nelumbo spp.)的基因组DNA进行扩增,在此基础上,对供试品种进行UPGMA聚类分析、群体结构分析和主坐标分析(PCo A)。结果表明:采用17对SSR引物从42个荷花品种的基因组DNA中扩增出77个位点,多态性位... 采用SSR标记技术对42个荷花品种(Nelumbo spp.)的基因组DNA进行扩增,在此基础上,对供试品种进行UPGMA聚类分析、群体结构分析和主坐标分析(PCo A)。结果表明:采用17对SSR引物从42个荷花品种的基因组DNA中扩增出77个位点,多态性位点百分率为88.31%;每对引物可扩增出1~9个多态性位点。根据Nei’s遗传距离,供试的42个荷花品种可被分成Ⅰ和Ⅱ两组,分别包含3和39个品种;在Nei’s遗传距离0.150处,Ⅱ组被进一步分成Ⅱa、Ⅱb和Ⅱc 3个亚组,分别包含3、16和20个品种。群体结构分析结果表明:组分概率高于等于0.80时,供试的42个荷花品种被分成Pop1、Pop2和混合群3个亚群,分别包含17、16和9个品种。PCo A分析结果表明:在F1水平上,供试的42个荷花品种被分成2个部分;其中,Pop1亚群的品种均分布在第二和第三象限,而Pop2亚群的品种则分布在第一和第四象限。总体来看,聚类分析、群体结构分析和PCo A分析的结果基本一致。综合分析结果表明:Ⅰ组包含美洲黄莲(N.lutea Pers.)品种‘艾江南’,且与传统中国莲(N.nucifera Gaertn.)品种的亲缘关系最远,故认为该组为美洲黄莲;Ⅱ组为中国莲,其中,Ⅱc亚组以传统中国莲品种为主,而Ⅱb亚组则偏重于美洲黄莲。总体上看,供试的42个荷花品种主要被分为中国莲和美洲黄莲两组,而中美杂交莲并没有独立成组,其成因有待进一步研究。 展开更多
关键词 荷花品种 SSR标记 遗传多样性 upgma聚类分析 群体结构分析 主坐标分析(PCo A)
下载PDF
17种木犀科植物的AFLP指纹分析 被引量:4
10
作者 王洋 赵书岗 +1 位作者 赵锦 刘孟军 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期31-35,共5页
应用AFLP技术对木犀科17种植物的亲缘关系进行了分析,利用从16对引物中筛选出的多态性好的5对引物,共扩增出条带553条,其中多态性条带451条,多态性比率81.6%;不同属之间,白蜡属的多态性比率最低;采用UPGMA法进行了聚类分析,初步证明丁... 应用AFLP技术对木犀科17种植物的亲缘关系进行了分析,利用从16对引物中筛选出的多态性好的5对引物,共扩增出条带553条,其中多态性条带451条,多态性比率81.6%;不同属之间,白蜡属的多态性比率最低;采用UPGMA法进行了聚类分析,初步证明丁香属和女贞属之间亲缘关系最近,连翘属和素馨属亲缘关系较近;筛选出了15种木犀科植物的特征性AFLP标记,为分子水平开展木犀科植物的分类研究提供了有益参考。 展开更多
关键词 木犀科 AFLP 亲缘关系 upgma 聚类分析
下载PDF
干旱胁迫下老芒麦遗传多样性分析 被引量:8
11
作者 陈云 闫伟红 +1 位作者 吴昊 曲志才 《草原与草坪》 CAS 2014年第2期11-17,22,共8页
对干旱胁迫处理的20份不同居群的老芒麦10对多态性引物进行 SSR 分析,研究干旱胁迫处理对老芒麦遗传多样性的影响。结果显示:10对引物总扩增带数115条,平均每个引物对扩增11.5条,多态性带数为103条,占总条带数的89.57%,每对引物扩增7... 对干旱胁迫处理的20份不同居群的老芒麦10对多态性引物进行 SSR 分析,研究干旱胁迫处理对老芒麦遗传多样性的影响。结果显示:10对引物总扩增带数115条,平均每个引物对扩增11.5条,多态性带数为103条,占总条带数的89.57%,每对引物扩增7~15条,平均为10.3条,多态性信息含量(PIC)为0.255~0.473,平均为0.368,SSR 标记效率(MI)为3.87;通过 POPGENE 软件得出供试材料的 Nei’s 遗传多样性指数(He)为0.3324,Shannon 指数(Ho)为0.4926。NTSYSpc 2.1软件和POPGENE 32软件聚类结果均表明,胁迫处理材料与同批材料胁迫前的聚类结果差异较大。意味着干旱胁迫处理造成非编码区的微卫星序列的遗传变异和分化,致使其重复次数发生相应改变;而胁迫前后UPGMA 聚类都表明产地相同的材料大多聚为一类,但不完全一致,其中,内蒙古的材料胁迫前后差异较大。分析结果表明,供试老芒麦材料间差异明显,遗传多样性丰富,应加快其开发和合理利用。 展开更多
关键词 老芒麦 干旱胁迫 upgma 聚类 SSR(simple SEQUENCE repeat)
下载PDF
甘肃省苹果蠹蛾不同地理种群遗传多样性分析 被引量:3
12
作者 张大为 罗进仓 +2 位作者 周昭旭 魏玉红 刘月英 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期94-99,共6页
为探明苹果蠹蛾不同地理种群的遗传变异、种群分化及传播扩散情况,利用9对微卫星引物对甘肃9个不同苹果蠹蛾地理种群的遗传多样性进行了研究。应用 POPGENE 1.32和 NTSYSpc 2.1软件分析表明:9对引物共检测到21个多样性位点,多态性百分... 为探明苹果蠹蛾不同地理种群的遗传变异、种群分化及传播扩散情况,利用9对微卫星引物对甘肃9个不同苹果蠹蛾地理种群的遗传多样性进行了研究。应用 POPGENE 1.32和 NTSYSpc 2.1软件分析表明:9对引物共检测到21个多样性位点,多态性百分比为95.45%;9个不同地理种群的观测等位基因为1.9545,有效等位基因为1.7413,Nei 氏指数为0.4113,Shannon 指数为0.5927±0.1472;遗传相似度在0.3258-0.8170范围内。UPG-MA 聚类分析表明甘州、金塔种群聚为一支,与肃州种群合为一支;临泽种群与总寨种群聚为一支;七里河与敦煌种群聚为一支;高台与民勤种群聚为一支,各分支间的遗传分化系数 Fst 分别为0.7950、0.5314、0.8579、0.5980。Mantel 检测表明,种群间的遗传距离与地理距离无显著相关性。研究表明,甘肃苹果蠹蛾种群的遗传多样性较低,遗传变异主要来自种群内部,种群之间的基因交流较少,在甘肃省的传播以人为被动传播扩散为主。 展开更多
关键词 苹果蠹蛾 地理种群 微卫星 遗传多样性 upgma 聚类分析
下载PDF
紫胶虫主要生产种的RAPD分子标记分析 被引量:2
13
作者 陈航 陈晓鸣 +1 位作者 冯颖 叶寿德 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2006年第4期423-430,共8页
用RAPD技术研究了紫胶虫7种主要生产种12个群体之间的亲缘关系,研究中每个群体使用了24个标本,共有288个个体用于研究。在试用的45种随机引物中,筛选出9种引物用于随机引物扩增,共得到121个清晰稳定的位点,其中118个为多态性位点... 用RAPD技术研究了紫胶虫7种主要生产种12个群体之间的亲缘关系,研究中每个群体使用了24个标本,共有288个个体用于研究。在试用的45种随机引物中,筛选出9种引物用于随机引物扩增,共得到121个清晰稳定的位点,其中118个为多态性位点,多态百分率为97.52%,每条引物检测到的位点数为11~16个,长度为150~3000bp。根据扩增结果,用UPGMA法对Nei's遗传距离进行聚类分析,构建分子系统树。7种紫胶虫聚类结果显示:紫胶虫各群体间的遗传距离为0.0443~0.7917,其中,种间的遗传平均距离为0.4430,种内的遗传平均距离为0.1707。根据聚类分析,讨论了紫胶虫主要生产种的亲缘关系。 展开更多
关键词 紫胶虫 RAPD分子标记 upgma聚类分析 遗传距离 亲缘关系
下载PDF
福建省6种早熟良种柚的RAPD分子标记研究 被引量:4
14
作者 罗开梅 潘一山 +3 位作者 伍成厚 张敬虎 王惠云 缪巧林 《漳州师范学院学报(自然科学版)》 2009年第2期102-106,共5页
采用改良的CTAB法成功提取龙柚等6种福建省早熟良种柚叶片的DNA,并对其进行RAPD分析.从初选的100个随机引物中筛选出12个扩增效果较好的引物,对提取的DNA进行PCR扩增,获得清晰可重复的位点107个,平均每条引物产生的位点为8.9个,其中多... 采用改良的CTAB法成功提取龙柚等6种福建省早熟良种柚叶片的DNA,并对其进行RAPD分析.从初选的100个随机引物中筛选出12个扩增效果较好的引物,对提取的DNA进行PCR扩增,获得清晰可重复的位点107个,平均每条引物产生的位点为8.9个,其中多态性位点93个,占86.9%;在部分样品中检出了特异性RAPD标记24个,占23.4%;样品间遗传相似系数比较和UPGMA聚类分析表明坪山柚和文旦柚的亲缘关系最近,度尾蜜柚和四季柚分别与其它5个柚类的亲缘关系较远. 展开更多
关键词 优质早熟柚 RAPD分子标记 upgma聚类分析 亲缘关系
下载PDF
石竹科繁缕属与卷耳属的数量分类 被引量:1
15
作者 陈旭波 汪亮亮 +1 位作者 陈睿 叶挺梅 《丽水学院学报》 2014年第5期31-38,共8页
形态解剖学和化学成分分析表明,石竹科繁缕属(Stellaria L.)和卷耳属(Cerastium L.)具有一定的亲缘关系。为了进一步探究它们之间的关系及属下分类等问题,根据欧氏距离,利用聚类分析和主坐标分析方法,首次对这2个属进行数值分类学研究... 形态解剖学和化学成分分析表明,石竹科繁缕属(Stellaria L.)和卷耳属(Cerastium L.)具有一定的亲缘关系。为了进一步探究它们之间的关系及属下分类等问题,根据欧氏距离,利用聚类分析和主坐标分析方法,首次对这2个属进行数值分类学研究。数据采集涉及51个形态特征,42种植物(每属各21种)。结果表明,繁缕属与卷耳属有较近的关系,其中达乌里卷耳(C.dahuricum Fisch.ex Spreng.)、无毛卷耳(C.arvense var.glabellum(Turcz.)Fenzl)均和繁缕属植物聚在了一起。对性状的主坐标排序分析显示,是否具退化雄蕊、是否具有花瓣、花瓣长度、蒴果裂齿数为花柱的2倍、花柱的数目、种皮表面是否具疣状突起、种子表面是否具弹坑状凹陷、根的形态等在繁缕属与卷耳属的分类中具有重要的作用。此外,聚类分析支持将细叶卷耳(C.subpilosum Hayata)作为一个独立类群处理。 展开更多
关键词 繁缕属 卷耳属 数量分类 聚类分析 主坐标分析
下载PDF
Genetic Diversity of Tunisian and Chinese Alfalfa (Medicago sativa L.) Revealed by RAPD and ISSR Markers 被引量:1
16
作者 Leila Touil Aike Bao +1 位作者 Suomin Wang Ali Ferchichi 《American Journal of Plant Sciences》 2016年第6期967-979,共13页
Medicago sativa L.) is one of the most important forage crops in the world. The genetic variability analysis of 19 alfalfa populations collected from three sites in South Tunisia (Gabes, Kebili, Tozeur) and 1 from Nor... Medicago sativa L.) is one of the most important forage crops in the world. The genetic variability analysis of 19 alfalfa populations collected from three sites in South Tunisia (Gabes, Kebili, Tozeur) and 1 from North West China were carried out using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) and Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) markers. Five RAPD primers amplified 44 bands of which 22 were polymorphic;and five ISSR primers amplified 51 bands of which 33 were polymorphic. The percentage of polymorphic bands detected by RAPD and ISSR was 50% and 64.7%, respectively. The resolving power (Rp) varied between 0.6 and 4.1 with an average of 2.02 for RAPD marker and between 0.7 and 6.5 with an average of 2.28 for ISSR marker. However the Average Informativeness band (AvIb) was ranged from 0.2 to 0.9 with an average of 0.5 in RAPD marker and from 0.29 to 0.7 with an average of 0.624 in ISSR marker. The RAPD marker revealed less within population genetic diversity than ISSR marker. Although Cluster (UPGMA) and Correspondence Factorial Analyses (CFA) indicate that populations’ clustering made independently both from the geographical origin. 展开更多
关键词 Medicago sativa L. Genetic Variability RAPD ISSR upgma clustering
下载PDF
卫矛科沟瓣属与卫矛属的数量分类学研究 被引量:1
17
作者 刘慧圆 孟世勇 刘全儒 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期92-102,共11页
卫矛属(Euonymus L.)和沟瓣属(Glyptopetalum Thw.)的系统关系长期以来备受争议,为理清它们之间的关系,该研究选择沟瓣属12种、卫矛属17种和假卫矛属(Microtropis Wall.ex Meisn.)2种,共计31个分类单元(OTUs),测量并统计了56个形态性状... 卫矛属(Euonymus L.)和沟瓣属(Glyptopetalum Thw.)的系统关系长期以来备受争议,为理清它们之间的关系,该研究选择沟瓣属12种、卫矛属17种和假卫矛属(Microtropis Wall.ex Meisn.)2种,共计31个分类单元(OTUs),测量并统计了56个形态性状,同时利用聚类分析(UPGMA)和主坐标分析(PCoA)的方法进行了数量分类学研究。结果表明:沟瓣属与卫矛属具有较高的表征相似性,二者之间存在的过渡类群有缙云卫矛(Euonymus chloranthoides Yang)和淡绿叶卫矛(E.pallidifolium Hayata)以及海南沟瓣[Glyptopetalum fengii(Chun&F.C.How)Ding Hou]、白树沟瓣[G.geloniifolium(Chun&F.C.How)C.Y.Cheng]。该研究认为将沟瓣属作为卫矛属的一个组,即沟瓣组(Sect.Glyptopetalum),放在冬青卫矛组(Sect.Ilicifolia)附近更为合理。对性状的主坐标排序分析显示,叶片长度、叶片宽度、叶侧脉数目、花瓣数目、心室数目、每室胚珠数、花序分枝数、是否具有假种皮、蒴果是否开裂、花期与果序梗长度在卫矛属分类中具有重要的价值。 展开更多
关键词 卫矛属 沟瓣属 形态性状 数量分类学 聚类分析 主坐标分析
下载PDF
非加权组平均法在工商数据资源分析中的应用 被引量:1
18
作者 罗冬梅 《洛阳理工学院学报(自然科学版)》 2011年第4期47-49,54,共4页
结合数据挖掘知识,对个体工商户的部分行业数据进行聚类分析。通过实验结果,可以让地方政府较为充分地了解当地个体工商户的行业结构发展情况,加强数据分析利用。
关键词 工商数据资源 聚类分析 非加权组平均法
下载PDF
西藏披碱草属野生牧草种质资源的遗传多样性分析与分子聚类研究 被引量:10
19
作者 张文妤 曹社会 +2 位作者 曹仲华 魏军 周梦华 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2008年第6期39-44,共6页
【目的】了解西藏披碱草属野生牧草的遗传多样性及其数量、分布规律。【方法】以披碱草基因组DNA为模板,利用微卫星(Microsatellite)分子标记对搜集到的9份西藏披碱草属野生牧草及8份对照材料进行遗传多样性研究,统计了不同引物对... 【目的】了解西藏披碱草属野生牧草的遗传多样性及其数量、分布规律。【方法】以披碱草基因组DNA为模板,利用微卫星(Microsatellite)分子标记对搜集到的9份西藏披碱草属野生牧草及8份对照材料进行遗传多样性研究,统计了不同引物对供试材料的扩增结果,分析了西藏的9个披碱草居群间的遗传距离、遗传相似系数,并对所有17个居群进行了UPGMA聚类。【结果】试验共筛选32对引物,其中14对引物有扩增条带,具有多态性且扩增效果较好的引物有8对。用筛选出的8对引物对供试的17份材料进行微卫星分析,共检测出69个等位基因,平均每对引物所产生的等位基因数为8.6个;西藏9个居群间的遗传相似系数为0.273~0.900。UPGMA聚类分析表明,在相似系数阈值为0.58时,9份材料可大致分为3类。【结论】西藏披碱草属野生牧草种质资源具有较高的遗传多样性。 展开更多
关键词 西藏 披碱草属牧草 遗传多样性 SSR分子标记 upgma聚类
下载PDF
基于30个形态性状的中国杏属(Armeniaca Scop.)植物分类学研究 被引量:9
20
作者 王家琼 吴保欢 +3 位作者 崔大方 羊海军 黄峥 齐安民 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期103-111,共9页
基于与叶和果实相关的30个形态性状(包括20个定性性状和10个定量性状)对中国杏属(Armeniaca Scop.)11种3变种进行了UPGMA聚类分析和主成分分析;在主成分分析基础上,构建了中国杏属植物的OTU散点图;并且,结合降水量分布图绘制了中国杏属... 基于与叶和果实相关的30个形态性状(包括20个定性性状和10个定量性状)对中国杏属(Armeniaca Scop.)11种3变种进行了UPGMA聚类分析和主成分分析;在主成分分析基础上,构建了中国杏属植物的OTU散点图;并且,结合降水量分布图绘制了中国杏属植物分布图。聚类分析结果显示:供试杏属植物被分成2支。若包含毛叶梅(A.mume var.goethartiana Koehne),则毛叶梅、梅(A.mume Sieb.)、洪平杏(A.hongpingensis C.L.Li)以及政和杏(A.zhengheensis J.Y.Zhang et M.N.Lu)聚为一支,其余8种2变种聚为另一支;若不包含毛叶梅,梅则被划分在后一个分支中。主成分分析结果显示:前3个主成分的累计贡献率仅60.318 0%,说明中国杏属植物的形态性状具有较大的遗传变异;在前3个主成分中,树高、叶片下表面被毛情况、叶长/叶柄长比值、叶长/叶宽比值、果核形状、叶宽、果核宽、叶柄长、果柄长和叶缘锯齿形状的绝对权重值均在0.7以上,表明这10个性状在中国杏属植物的分类学研究中具有重要作用。OTU散点图显示:中国杏属植物在二维散点图上的分类结果与其聚类结果基本一致,并且,其聚类结果中的各分支在三维散点图上也能够明显区分,说明可以采用前3个主成分中绝对权重值较高的性状对中国杏属植物进行分类。分布图显示:杏属植物遍布中国各省(区),且主要集中分布在400和800 mm等降水量线之间的区域。结合上述研究结果及他人的研究成果,支持"将藏杏〔A.holosericea(Batal.)Kost.〕作为杏(A.vulgaris Lam.)的1个变种"以及"将政和杏作为梅的1个变种"的分类处理,并支持"将洪平杏作为独立种"的分类处理。此外,建议将仙居杏(A.xianjuxing J.Y.Zhang et X.Z.Wu)和华仁杏(A.cathayana D.L.Fu et al)作为杏属的栽培种。 展开更多
关键词 杏属 形态性状 upgma聚类分析 主成分分析 OTU散点图 分类学修订
下载PDF
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部