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VEGFR3基因启动子中的功能区段预测
1
作者
焦吉祥
张长青
王进
《药物生物技术》
CAS
CSCD
2008年第4期239-243,共5页
VEGFR3基因表达调控元件的研究。通过进化分析软件Footprinter2.0获得了VEGFR3(vascu-lar endothelial growth factorreceptor3)基因启动子在多个物种中进化保守的短序列片段,结合基因芯片数据,筛选出共表达基因启动子中的高频短序列。...
VEGFR3基因表达调控元件的研究。通过进化分析软件Footprinter2.0获得了VEGFR3(vascu-lar endothelial growth factorreceptor3)基因启动子在多个物种中进化保守的短序列片段,结合基因芯片数据,筛选出共表达基因启动子中的高频短序列。结果得到2个在进化上保守、同时在共表达基因启动子中也高频出现的元件TAATCCCAGC和GAGGCTGAGG,它们在基因上游形成TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG的保守序列片段,其中包含转录因子LUN、LyF-1以及Ik-2的结合位点,推测为VEGFR3基因表达调控的区域。
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关键词
淋巴管
vegfr3
基因表达调控
生物信息学
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职称材料
原发性先天性淋巴水肿一家系VEGFR3基因突变分析
被引量:
3
2
作者
盛继群
曾峰
+3 位作者
李畅
刘静宇
王擎
刘木根
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期371-375,共5页
目的 对1个患原发性先天性淋巴水肿(prjmary congenital lymphoedema,PCL)汉族大家系进行遗传学研究,了解先天性淋巴水肿患病的分子遗传学基础.方法 对该家系12名成员(10名直系亲属、2名配偶)采样并提取DNA,选择已知的3个PCL相关...
目的 对1个患原发性先天性淋巴水肿(prjmary congenital lymphoedema,PCL)汉族大家系进行遗传学研究,了解先天性淋巴水肿患病的分子遗传学基础.方法 对该家系12名成员(10名直系亲属、2名配偶)采样并提取DNA,选择已知的3个PCL相关致病基因位点,用荧光微卫星标记进行基因连锁定位.确定VEGFR3为致病基因后,对家系中的患者进行VEGFR3基因的突变检测,并与100名正常人进行对照分析.结果 该家系疾病与5q35.3区的微卫星标记D5S408连锁.对该区域的VEGFR3进行DNA测序,发现患者含有1个c.C3341T转换,该突变导致VEGFR3蛋白发生p.Pro1114Leu;该家系中所检测患者均发现携带该杂合突变.100名正常对照该位点的测序分析未能检测到该突变.结论 VEGFR3基因是最重要的PCL致病基因,该家系成员VEGFR-3的p.Pro1114Leu突变是患者患淋巴水肿的遗传基础.
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关键词
原发性先天性淋巴水肿
vegfr3
基因
错义突变
连锁分析
原文传递
题名
VEGFR3基因启动子中的功能区段预测
1
作者
焦吉祥
张长青
王进
机构
南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室
金陵科技学院园艺系
出处
《药物生物技术》
CAS
CSCD
2008年第4期239-243,共5页
基金
国家自然科学基金项目(No.90208021)资助
文摘
VEGFR3基因表达调控元件的研究。通过进化分析软件Footprinter2.0获得了VEGFR3(vascu-lar endothelial growth factorreceptor3)基因启动子在多个物种中进化保守的短序列片段,结合基因芯片数据,筛选出共表达基因启动子中的高频短序列。结果得到2个在进化上保守、同时在共表达基因启动子中也高频出现的元件TAATCCCAGC和GAGGCTGAGG,它们在基因上游形成TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG的保守序列片段,其中包含转录因子LUN、LyF-1以及Ik-2的结合位点,推测为VEGFR3基因表达调控的区域。
关键词
淋巴管
vegfr3
基因表达调控
生物信息学
Keywords
Lymphatics,
vegfr3
, Regulation of
gene
expression, Bioinformatics
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
原发性先天性淋巴水肿一家系VEGFR3基因突变分析
被引量:
3
2
作者
盛继群
曾峰
李畅
刘静宇
王擎
刘木根
机构
华中科技大学人类基因组中心
安徽省宣城中心医院儿科
出处
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期371-375,共5页
基金
基金项目:国家自然科学基金(30671158,30871386)
文摘
目的 对1个患原发性先天性淋巴水肿(prjmary congenital lymphoedema,PCL)汉族大家系进行遗传学研究,了解先天性淋巴水肿患病的分子遗传学基础.方法 对该家系12名成员(10名直系亲属、2名配偶)采样并提取DNA,选择已知的3个PCL相关致病基因位点,用荧光微卫星标记进行基因连锁定位.确定VEGFR3为致病基因后,对家系中的患者进行VEGFR3基因的突变检测,并与100名正常人进行对照分析.结果 该家系疾病与5q35.3区的微卫星标记D5S408连锁.对该区域的VEGFR3进行DNA测序,发现患者含有1个c.C3341T转换,该突变导致VEGFR3蛋白发生p.Pro1114Leu;该家系中所检测患者均发现携带该杂合突变.100名正常对照该位点的测序分析未能检测到该突变.结论 VEGFR3基因是最重要的PCL致病基因,该家系成员VEGFR-3的p.Pro1114Leu突变是患者患淋巴水肿的遗传基础.
关键词
原发性先天性淋巴水肿
vegfr3
基因
错义突变
连锁分析
Keywords
primary congenital lymphoedema
vegfr3 gene
missense mutation
linkageanalysis
分类号
R725.5 [医药卫生—儿科]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
VEGFR3基因启动子中的功能区段预测
焦吉祥
张长青
王进
《药物生物技术》
CAS
CSCD
2008
0
下载PDF
职称材料
2
原发性先天性淋巴水肿一家系VEGFR3基因突变分析
盛继群
曾峰
李畅
刘静宇
王擎
刘木根
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010
3
原文传递
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