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羊口疮病毒SYBR Green I qPCR方法建立及VIR基因的遗传演化分析 被引量:1
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作者 冯星 卢昌杨 +6 位作者 邓亚飞 吴佳颖 苑君君 贺绍君 辛洪雷 刘德义 张留君 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期772-779,共8页
目的为快速、高效、准确地检出羊口疮病毒(ORFV),并进一步明确皖北地区羊群ORFV流行毒株的遗传变异情况。方法本研究基于ORFV F1L基因建立SYBR Green I实时荧光定量PCR(qPCR)方法,对皖北地区羊场开展ORFV检测,并从阳性病料中PCR扩增ORF... 目的为快速、高效、准确地检出羊口疮病毒(ORFV),并进一步明确皖北地区羊群ORFV流行毒株的遗传变异情况。方法本研究基于ORFV F1L基因建立SYBR Green I实时荧光定量PCR(qPCR)方法,对皖北地区羊场开展ORFV检测,并从阳性病料中PCR扩增ORFV的完整VIR基因,直接测序后进行遗传演化分析。结果所建立ORFV SYBR Green I qPCR方法的线性关系良好,R 2=0.994;扩增效率高,E%=95.62%;检测速度快,理论反应时间约15 min;灵敏度较高,检测下限为10 copies/μL,是普通PCR法的100倍;重复性良好,组内和组间变异系数分别为0.44%~1.14%和2.82%~3.16%。用该qPCR方法对采集自皖北地区的168份羊临床样本进行检测,其ORFV阳性率为37.5%(63/168)。PCR扩增阳性样本中ORFV的完整VIR基因并直接测序,共获得52条全长VIR基因序列,其中21条来源于山羊,31条来源于绵羊。52条VIR基因间核苷酸序列及氨基酸序列的一致性分别为95.8%~100.0%和93.5%~100.0%,与参考毒株VIR基因核苷酸序列及氨基酸序列的一致性分别为95.1%~100.0%和91.3%~100.0%。基于ORFV VIR基因的遗传进化树分析显示,本次检测的21株山羊源ORFV毒株与8株国内外山羊源参考毒株和1株人源hChi17.2017参考毒株位于同一大分支,而本次检测的31株绵羊源ORFV毒株与7株国内外绵羊源参考毒株、1株人源hMbu15参考毒株及1株OV-V疫苗毒株位于遗传距离较远的另一大分支。结论建立了用于检测ORFV的高效、快捷、特异、灵敏、稳定的SYBR Green I qPCR方法。从临床样本中检测到的不同宿主来源ORFV的VIR基因间存在较大遗传差异。该研究结果可为ORFV的临床监测、检测、诊断及防控提供参考和指导。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 荧光定量PCR F1L基因 vir基因 遗传演化分析
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Identification of rice (Oryza sativa L.) signal factors capable of inducing Agrobacterium vir gene expression 被引量:3
2
作者 许东晖 李宝健 +2 位作者 刘煜 黄志纾 古练权 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 1996年第1期8-16,共9页
Two kinds of signal factors capable of inducing Agrobaorerium vir gene expression were purified and identified from leaf extracts of panicle-differentiating to flowering stage of rice (Oryza saliva L. cv. IR 72) detec... Two kinds of signal factors capable of inducing Agrobaorerium vir gene expression were purified and identified from leaf extracts of panicle-differentiating to flowering stage of rice (Oryza saliva L. cv. IR 72) detected by Agrobacterium vir(?) lacZ. fusion genes. The induction was similar to that observed with 5 μm actosyringone (AS). Based on the comprehensive analysis of the data by UV, IR, NMR, MS, HMQC and HMBC, the structures of these two signal factors are identified as 5, 7, 4'-trihydroxy-3', 5'-dimethoxy-flavone (named tricin) and 5, 4' -dihydroxy-3', 5' -dimethoxy-7- (β-D-glucosyloxy) -flavone, respectively. These results demonstrate that monocotyledonous plants do contain highly efficient vir gene inducing factors of Agrobacterium, and the reason why monocotyledonous plants are difficult to transform by Ayrobacterium is not due to absence of vir gene inducing factors, but due to the signal factors only produced in specific stage and tissue of monocotyledonous plants 展开更多
关键词 RICE SIGNAL FACTORS Agrobocterium TUMEFACIENS vir gene flavones.
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Gene-Eden-VIR Is Antiviral: Results of a Post Marketing Clinical Study 被引量:1
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作者 Hanan Polansky Edan Itzkovitz 《Pharmacology & Pharmacy》 2013年第6期1-8,共8页
Introduction: This paper reports the results of a post marketing clinical study that tested the antiviral properties of Gene-Eden-VIRTM. Specifically, the clinical study tested the effect of Gene-Eden-VIR on the sever... Introduction: This paper reports the results of a post marketing clinical study that tested the antiviral properties of Gene-Eden-VIRTM. Specifically, the clinical study tested the effect of Gene-Eden-VIR on the severity, duration, and frequency of symptoms reported by individuals infected with various viruses. The viruses included the Human Papillomavirus (HPV), Herpes Simplex Virus (HSV), Epstein Barr Virus (EBV), Human Cytomegalovirus (HCMV) and Hepatitis C Virus (HCV). The symptoms included abnormal Pap smear, low and high grade cervical dysplasia, warts, blisters, cold sores, hives, skin tabs, panic attacks, depression, kidney problems, sleeping problems, liver problems, fever, fatigue, sore throat, swollen lymph nodes, diarrhea, and weight loss. Treatment: A capsule of Gene-Eden-VIR includes five natural ingredients: 100 mg of quercetin, 150 mg of green tea extract, 50 mg of a cinnamon extract, 25 mg of a licorice extract, and 100 mcg of selenium. The dosage was 1, 2, 3, or 4 capsules per day. The duration of treatment was 2 to 54 weeks. Population: The study population consisted of 60 infected individuals, ages 20 to 66. Results: The participants reported no side effects after taking Gene-Eden-VIR. Seventy three percent of the individuals treated with Gene-Eden-VIR reported a decrease in their symptoms. Specifically, they reported a decrease in the severity (p = 0.006, n = 45), duration (p = 0.009, n = 34), and frequency of their symptoms (p Conclusions: This post marketing clinical study showed that Gene-Eden-VIR is a safe and effective antiviral treatment. Specifically, the clinical study showed that Gene-Eden-VIR is a safe and effective treatment against the Human Papillomavirus (HPV), Herpes Simplex Virus (HSV), Epstein Barr Virus (EBV), Human Cytomegalovirus (HCMV), and Hepatitis C Virus (HCV). Therefore, health care practitioners should recommend Gene-Eden-VIR as a safe and effective antiviral treatment against these viruses. 展开更多
关键词 HUMAN Papillomavirus (HPV) Herpes Simplex virUS (HSV) Epstein BARR virUS (EBV) HUMAN Cytomegalovirus (HCMV) Hepatitis C virUS (HCV) gene-Eden-vir
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Gene-Eden-VIR Decreased Physical and Mental Fatigue in a Post Marketing Clinical Study That Followed FDA Guidelines;Results Support Microcompetition Theory 被引量:1
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作者 Hanan Polansky Edan Itzkovitz 《Pharmacology & Pharmacy》 2014年第3期280-290,共11页
Objective: The Microcompetition with Foreign DNA theory, proposed by Hanan Polansky in 2003, describes how latent viruses can cause chronic conditions, including fatigue. The Gene-Eden-VIR formula was designed to targ... Objective: The Microcompetition with Foreign DNA theory, proposed by Hanan Polansky in 2003, describes how latent viruses can cause chronic conditions, including fatigue. The Gene-Eden-VIR formula was designed to target latent viruses. Therefore, the theory predicts that treatment with Gene-Eden-VIR will decrease fatigue in individuals infected with a latent virus. The objective of this study was to test this prediction. Framework: A post marketing clinical study that followed FDA guidelines. Treatment: Gene-Eden-VIR, a dietary supplement. A capsule of Gene-Eden-VIR includes 100 mg of quercetin, 150 mg of green tea extract, 50 mg of cinnamon extract, 25 mg of licorice extract, and 100 mcg of selenium. The treatment included 1, 2, 3, or 4 capsules per day, and lasted 2 to 54 weeks. Population: 100 individuals infected with a latent virus, including the Human Papillomavirus (HPV), Epstein Barr Virus (EBV), Herpes Simplex Virus (HSV), Human Cytomegalovirus (HCMV), and Hepatitis C Virus (HCV). Ages ranged from 20 to 66. All participants reported a feeling of fatigue at the start of the study. Specifically, 98, 90, and 79 participants reported a feeling of general, physical, and mental fatigue, respectively. Results: Following treatment with Gene-Eden-VIR, 73.47%, 62.22%, and 47.36% reported a decrease in their feeling of general, physical, and mental fatigue, respectively. The participants also reported a statistically significant decrease in every aspect of fatigue tested in the study. The results also showed a duration effect, that is, those treated for 2 months or more reported a larger decrease in their feeling of fatigue (general, p = 0.03, n = 65;physical and mental, p = 0.05, n = 70). The results showed no interviewer bias, and no selection bias. In addition, the results showed therapeutic consistency under varying manufacturing conditions. The participants reported no side effects after taking Gene-Eden-VIR. Conclusions: This post marketing clinical study showed that treatment with Gene-Eden-VIR safely decreased the feeling of general, physical, and mental fatigue in individuals infected with a latent virus. Since most individuals are infected with a latent virus, health care practitioners should recommend Gene-Eden-VIR as a first line treatment for fatigue. The results of this post marketing clinical study support the Microcompetition with Foreign DNA theory. 展开更多
关键词 gene-Eden-vir Microcompetition FATIGUE Mental FATIGUE PHYSICAL FATIGUE Latent virUS Human Papillomavirus HPV Epstein Barr virUS EBV Herpes Simplex virUS HSV Cytomegalovirus CMV Hepatitis C virUS HCV
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羊口疮病毒B2L和VIR基因原核表达及抗原性鉴定 被引量:10
5
作者 李杰 李前瑞 +3 位作者 田婷婷 许君艳 姚运亮 陈德坤 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2013年第3期1-6,共6页
为检测羊口疮病毒(Orf virus)B2L和VIR蛋白的抗原性,通过PCR方法扩增出羊口疮病毒B2L和VIR基因,与原核表达载体pET-32a连接,将重组质粒转化到BL21(DE3)感受态中,对其进行BamHⅠ和HindⅢ双酶切鉴定和测序验证。对鉴定为阳性的菌液进行诱... 为检测羊口疮病毒(Orf virus)B2L和VIR蛋白的抗原性,通过PCR方法扩增出羊口疮病毒B2L和VIR基因,与原核表达载体pET-32a连接,将重组质粒转化到BL21(DE3)感受态中,对其进行BamHⅠ和HindⅢ双酶切鉴定和测序验证。对鉴定为阳性的菌液进行诱导表达,并进行SDS-PAGE分析。用灭活的羊口疮病毒免疫家兔,制备多克隆抗体,Western blot、ELISA鉴定B2L和VIR蛋白的抗原性。结果显示B2L、VIR蛋白均能与兔抗羊口疮病毒抗血清结合,证明B2L、VIR蛋白具有与羊口疮病毒共同的B细胞表位。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 B2L基因 vir基因 原核表达 抗原性
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诱导根癌农杆菌vir区基因表达水稻代谢物的分离、鉴定和生物活性研究 被引量:4
6
作者 刘煜 黄志纾 +5 位作者 肖剑国 古练权 许东晖 李宝健 吴厚铭 马侃 《有机化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1995年第1期72-75,共4页
从孕穗期至开花期水稻(oryza satire L.cv.India IR 72)的茎叶提取液中,筛选并分离出二种能高效诱导根癌农杆菌(Agrobacterium tumfaciens)vir区基因表达的信号分子,这两种信号分子的化学结构分别是5,7,4′-三羟基-3′-5′-二甲氧基黄酮... 从孕穗期至开花期水稻(oryza satire L.cv.India IR 72)的茎叶提取液中,筛选并分离出二种能高效诱导根癌农杆菌(Agrobacterium tumfaciens)vir区基因表达的信号分子,这两种信号分子的化学结构分别是5,7,4′-三羟基-3′-5′-二甲氧基黄酮和5,4′-二羟基-3′,5′-二甲氧基-7-β-D-葡萄糖氧基黄酮。 展开更多
关键词 水稻 黄酮类 根癌农杆菌
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安徽地区羊口疮病毒VIR基因PCR检测及遗传进化分析 被引量:5
7
作者 侯宏艳 惠文巧 +2 位作者 张丹俊 赵瑞宏 胡晓苗 《中国草食动物科学》 CAS 2017年第1期4-6,共3页
采集安徽某地区两个山羊场中疑似感染ORFV的羔羊唇部结痂病料,采用PCR方法对毒力基因VIR进行了扩增,并获得了目的片段VIR-1和VIR-2。同时将PCR产物克隆至p MD18-T载体,鉴定后测序。序列分析结果表明,两个羊场的毒力基因VIR-1和VIR-2基... 采集安徽某地区两个山羊场中疑似感染ORFV的羔羊唇部结痂病料,采用PCR方法对毒力基因VIR进行了扩增,并获得了目的片段VIR-1和VIR-2。同时将PCR产物克隆至p MD18-T载体,鉴定后测序。序列分析结果表明,两个羊场的毒力基因VIR-1和VIR-2基因片段与参考毒株的相关基因核苷酸同源性分别为95.8%~100%和95.4%~99.6%。基因进化树比较显示,两分离株分别与美国AY424975.1株和甘肃KF916586.1株的亲缘关系最近。 展开更多
关键词 安徽 羊口疮病毒 vir基因 遗传进化分析
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羊传染性脓疱病毒抗干扰素基因(VIR)研究进展 被引量:2
8
作者 王玲玲 刘永杰 +2 位作者 郑海学 张克山 刘湘涛 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1181-1184,共4页
羊传染性脓疱病毒(ORFV)是痘病毒科副痘病毒属的成员之一,引起严重的人兽共患传染病。该病毒基因组全长约134~139kb,编码130多个蛋白,抗干扰素基因是ORFV编码的具有拮抗宿主干扰素功能的蛋白,在ORFV突破宿主免疫屏障过程中有重要作用... 羊传染性脓疱病毒(ORFV)是痘病毒科副痘病毒属的成员之一,引起严重的人兽共患传染病。该病毒基因组全长约134~139kb,编码130多个蛋白,抗干扰素基因是ORFV编码的具有拮抗宿主干扰素功能的蛋白,在ORFV突破宿主免疫屏障过程中有重要作用。本文就抗干扰素基因的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 羊传染性脓疱病毒 vir基因 研究进展
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诱导根癌土壤杆菌vir区基因表达信号分子的构效研究 被引量:1
9
作者 许东晖 许实波 +2 位作者 李宝健 刘煜 古练权 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1999年第11期1252-1254,共3页
Four rice (Oryza satia L. cv. IR72) signal factors with the functions of inducing Agrobaterium tumefaciens (Smith et Townsend) Conn vir genes were constructed. They were 5, 7, 4’-trihydroxy-3’, 5’-dimethoxy-flavone... Four rice (Oryza satia L. cv. IR72) signal factors with the functions of inducing Agrobaterium tumefaciens (Smith et Townsend) Conn vir genes were constructed. They were 5, 7, 4’-trihydroxy-3’, 5’-dimethoxy-flavone (F1) and its structure analogues F2, F3 and F4. These four signal fartors were detected by Agrobacterium vir:: lzcZ fusion gene system as to compare their functions of inducing virA, virB, virC,virD, virE and virG genes. The structure characters and structure-activity relationship of these signal factors with the best inducing effects to Agrobacterium exogenous gene transformation system were defined which may provide some basic information for foreign gene transformation in rice. 展开更多
关键词 水稻 根癌土壤杆菌 vir基因 信号分子 诱导 构效
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根瘤农杆菌二组分体VirA/VirG介导的侵染性 被引量:1
10
作者 姚远 姚瑶 +1 位作者 莫日根 范丽菲 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期76-82,共7页
根瘤农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)是存在于土壤中的革兰氏阴性菌,可以侵染很多种双子叶植物、单子叶植物以及裸子植物的受伤部位,用位于其Ti质粒上vir基因产物来诱导植物产生冠瘿瘤,因此,根瘤农杆菌广泛用于植物基因工程研究,是... 根瘤农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)是存在于土壤中的革兰氏阴性菌,可以侵染很多种双子叶植物、单子叶植物以及裸子植物的受伤部位,用位于其Ti质粒上vir基因产物来诱导植物产生冠瘿瘤,因此,根瘤农杆菌广泛用于植物基因工程研究,是个农业工程菌。研究表明vir基因的表达受VirA/VirG二组分体的介导。回顾和总结了根瘤农杆菌的VirA/VirG二组分体的结构、作用机理、以及所感知的环境因子,和这些环境因子通过VirA/VirG二组分体对vir基因的表达调控分子机制。 展开更多
关键词 根瘤农杆菌 virA virG二组分体 vir基因表达 侵染
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福建省羊传染性脓疱病毒F1L、B2L和VIR基因的遗传变异分析 被引量:6
11
作者 林裕胜 江锦秀 +2 位作者 江斌 游伟 胡奇林 《动物医学进展》 北大核心 2017年第2期1-6,共6页
为探明2014年-2015年在福建省流行的羊传染性脓疱病毒(ORFV)遗传变异情况,对10株ORFV流行毒株的F1L、B2L和VIR基因进行克隆、测序及分析。结果表明,10株ORFV F1L基因之间的核苷酸序列同源性为97.6%~100%,与国内株的核苷酸序列同源性为96... 为探明2014年-2015年在福建省流行的羊传染性脓疱病毒(ORFV)遗传变异情况,对10株ORFV流行毒株的F1L、B2L和VIR基因进行克隆、测序及分析。结果表明,10株ORFV F1L基因之间的核苷酸序列同源性为97.6%~100%,与国内株的核苷酸序列同源性为96.8%~99.7%,与NZ2参考株的核苷酸序列同源性为96.3%~97.1%;同NZ2参考株比较,FJ-YT2014缺失2个氨基酸;10株ORFV B2L基因之间核苷酸序列同源性为97.5%~99.9%,与国内株的核苷酸序列同源性为96.7%~99.5%,与NZ2参考株的核苷酸序列同源性为96.7%~97.7%;10株ORFV VIR基因之间的核苷酸序列同源性为95.8%~99.5%,与国内株的核苷酸序列同源性为94.6%~99.6%,与NZ2参考株的核苷酸序列同源性为94.6%~96.4%。基于基因核苷酸序列的遗传进化分析表明,10株ORFV F1L基因与福建省分离株、山西株和新疆株亲缘关系较近;10株ORFV B2L基因与新疆、山西、德国毒株亲缘关系较近;10株ORFV VIR基因与台湾、新疆株亲缘关系较近。结果提示,当前福建省流行的ORFV F1L、B2L和VIR基因尚未出现明显变异,但是其F1L、B2L和VIR基因核苷酸序列之间普遍存在异质性。 展开更多
关键词 羊传染性脓疱病毒 F1L基因 B2L基因 vir基因 变异分析
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羊传染性脓疱病毒内蒙古分离株VIR基因的克隆与序列分析 被引量:1
12
作者 徐华敏 希尼尼根 申之义 《畜牧与饲料科学》 2012年第4期1-3,共3页
根据GenBank中已经发表的羊传染性脓疱病毒毒株StrainNZ2的VIR基因序列,设计合成1对引物。采用PCR技术对内蒙古分离株(OV/nm-05)的VIR基因进行特异性扩增,然后将其克隆到pEASY-T1载体中进行测序,得到该病毒的VIR基因序列。序列分析表明,... 根据GenBank中已经发表的羊传染性脓疱病毒毒株StrainNZ2的VIR基因序列,设计合成1对引物。采用PCR技术对内蒙古分离株(OV/nm-05)的VIR基因进行特异性扩增,然后将其克隆到pEASY-T1载体中进行测序,得到该病毒的VIR基因序列。序列分析表明,OV/nm-05株与1710/03株的同源性最高,达98.0%;与513/04株的同源性最低,为95.4%。说明羊传染性脓疱病毒内蒙古分离株VIR基因与其他参考毒株之间差异不大,这为进一步从分子生物学角度了解VIR基因的结构和功能奠定了基础。 展开更多
关键词 羊传染性脓疱病毒 vir基因 PCR 序列分析
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利用根癌农杆菌法获得转基因水稻植株及其后代 被引量:16
13
作者 尹中朝 杨凡 +1 位作者 许耀 李宝健 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1998年第6期517-524,共8页
在100μmol/L乙酰丁香酮(AS)等vir基因诱导分子存在的情况下,用含双元载体pBYT2的根癌农杆菌菌株EHA101同水稻(OrizasativaL.)台北309悬浮培养细胞共培养3天。经过2个月的连续筛选,共从364颗同根癌农杆菌共培养的悬浮培养细胞... 在100μmol/L乙酰丁香酮(AS)等vir基因诱导分子存在的情况下,用含双元载体pBYT2的根癌农杆菌菌株EHA101同水稻(OrizasativaL.)台北309悬浮培养细胞共培养3天。经过2个月的连续筛选,共从364颗同根癌农杆菌共培养的悬浮培养细胞团中得到17个具有稳定潮霉素抗性和GUS表达的愈伤组织。对从8个转化组织中得到的10株可能的R0代转基因植株及其后代进行外源基因的整合和表达分析,Southern分析表明外源基因已稳定地整合进水稻基因组中并实现了有性遗传传递。杂交结果显示在其中一个转化系的植株中有5个拷贝的T-DNA整合,而其余的转化系则只整合了1个拷贝。转基因水稻细胞及植株中GUS活性的组织化学染色观察和荧光分析表明玉米ubiquitin基因启动子在水稻细胞中能高效启动gus报告基因的表达。ndPAGE-X-Gluc法检测表明转基因水稻细胞中表达的GUS蛋白比Sigma公司的标准GUS蛋白(SigmaCo.G0786)要小,而与来自大肠杆菌HB101(pBI1121)中的GUS蛋白大小相同。结果表明,根癌农杆菌可有效且可靠地介导外源基因转化水稻。 展开更多
关键词 水稻 根癌农杆菌 转基因植株
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茶多酚对农杆菌介导的植物遗传转化体系的影响 被引量:2
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作者 李晶 林彩容 +3 位作者 黄艳 邓旭铭 王艺清 孙威江 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期477-490,共14页
为研究在农杆菌介导的茶树遗传体系中,茶多酚对农杆菌侵染效率的影响,以LBA4404、EHA105、ATCC15834和K599 4个农杆菌菌株为研究对象,分析其在不同浓度茶多酚处理下的耐酚能力、被膜完整率、吸附性、vir和chv基因表达,以及遗传转化差异... 为研究在农杆菌介导的茶树遗传体系中,茶多酚对农杆菌侵染效率的影响,以LBA4404、EHA105、ATCC15834和K599 4个农杆菌菌株为研究对象,分析其在不同浓度茶多酚处理下的耐酚能力、被膜完整率、吸附性、vir和chv基因表达,以及遗传转化差异。结果显示,4个菌株的耐酚能力依次为LBA4404>K599>EHA105>ATCC15834,其中EHA105和ATCC15834菌株对茶多酚较为敏感;ATCC15834菌株被膜完整率与茶多酚的浓度、静置时间呈负相关,EHA105在600 mg·L^(-1)茶多酚处理48 h后,其被膜完整率最低;ATCC15834和EHA105对烟草叶肉细胞的吸附能力随着茶多酚浓度的升高而降低,在经茶多酚处理24 h后,ATCC15834中chv B和EHA105中chv B2的表达受到显著抑制,vir A表达量与低浓度酚类的敏感性呈正相关性;烟草经农杆菌菌液(含茶多酚)侵染后,瞬时转化效率和稳定转化效率均受到不同程度的抑制,发状根诱导率大大降低。1 000 mg·L^(-1)茶多酚处理后,ATCC15834的发根诱导率最低,仅为13.85%,坏死率高达33.85%。综上所述,茶多酚会降低农杆菌活力和被膜完整率,chv基因通过降低表达量影响其吸附性,最终导致烟草转化体系中瞬时转化效率和稳定转化效率均受到不同程度的抑制。 展开更多
关键词 茶多酚 农杆菌介导 吸附性 chv和vir基因 遗传转化
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新城疫病毒V4株主要基因的克隆与序列分析 被引量:1
15
作者 刘芳宁 闫丽辉 +2 位作者 曹殿军 刘培欣 杨增岐 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期319-321,362,共4页
设计4对引物,利用RT—PCR技术分别扩增出新城疫病毒(NDV)V4株长约4.2、4.1、4.1、3.5kb的4个互相重叠的核苷酸片段,并分别进行了克隆和序列测定。将这4个片段的核苷酸序列拼接后,得到长为15 061 bp的核苷酸序列。该序列包含有NDVv... 设计4对引物,利用RT—PCR技术分别扩增出新城疫病毒(NDV)V4株长约4.2、4.1、4.1、3.5kb的4个互相重叠的核苷酸片段,并分别进行了克隆和序列测定。将这4个片段的核苷酸序列拼接后,得到长为15 061 bp的核苷酸序列。该序列包含有NDVv4株结构基因NP的全部编码区和5’端非编码序列,结构基因P、M、F、HN及L基因的全部编码区和非编码区序列,各结构基因之间的间隔序列以及基因组5’端部分尾巴序列(108bp)。序列比较分析表明,NDVv4株F蛋白裂解位点序列为^112GKQGRL^117,HN基因编码616个氨基酸,符合无毒株的特征;NDVv4株同基因组长度为15 192 bp的毒株一样,在基因组的1647~1648bp间比基因组长为15192bp的毒株少了6个碱基。 展开更多
关键词 新城疫病毒 主要基因 克隆 序列分析
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将农杆菌Ti质粒携带的外源基因转入水稻细胞 被引量:1
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作者 李宝健 欧阳学智 许耀 《中山大学学报论丛》 1989年第4期40-47,共8页
未经特殊处理的农杆菌C58C1Rif^r菌株,与籼稻悬浮培养细胞共培养时,很少见有细菌的附着,也观察不到纤维丝的形成。但经复合酚类化合物预处理的菌株,与籼稻培养细胞在普通培养液,特别是在复合诱导培养液(培养过的番茄下胚轴切段、胡萝卜... 未经特殊处理的农杆菌C58C1Rif^r菌株,与籼稻悬浮培养细胞共培养时,很少见有细菌的附着,也观察不到纤维丝的形成。但经复合酚类化合物预处理的菌株,与籼稻培养细胞在普通培养液,特别是在复合诱导培养液(培养过的番茄下胚轴切段、胡萝卜细胞及农杆菌的培养滤液)中共培养时,均可发现有较多的细菌附着于水稻细胞表面,并且菌体周围有纤维丝的形成。在复合处理组中,位于pGV3850:1103neo嵌合质粒T-DNA上的NPTⅡ基因及NOS基因在籼稻培养细胞中获得了转移与表达。 展开更多
关键词 水稻细胞转化 vir基因活性诱导 酚类化合物 农杆菌与宿主细胞相互作用 扫描电镜
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羊口疮病毒安徽株VIR基因克隆与生物信息学分析 被引量:3
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作者 杨侃侃 俞赵荣 +8 位作者 张谦 张高峰 王元红 张学琪 鲁智敏 刘自敏 彭开松 王勇 李永东 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2018年第12期1365-1370,共6页
目的获取并分析ORFV AH-F10株VIR基因序列及预测其编码蛋白的生物信息学特点。方法利用实验室保存的羊口疮AH-F10株,设计VIR基因引物并进行PCR扩增、克隆及序列测定,同时利用生物信息学方法对其编码的蛋白的理化性质、二级结构、三级结... 目的获取并分析ORFV AH-F10株VIR基因序列及预测其编码蛋白的生物信息学特点。方法利用实验室保存的羊口疮AH-F10株,设计VIR基因引物并进行PCR扩增、克隆及序列测定,同时利用生物信息学方法对其编码的蛋白的理化性质、二级结构、三级结构、信号肽、磷酸化位点、跨膜结构域以及线性细胞表位进行预测。结果 AH-F10-VIR基因长552 bp,编码183个氨基酸,与Nantou株的VIR基因同源性最高,核苷酸同源性高达99.6%,氨基酸同源性为100.0%。生物信息学分析结果显示编码的蛋白相对分子量为19.88 kDa,等电点为4.83,为亲水性蛋白;α-螺旋、β-转角、无规则卷曲和延伸链分别占36.07%、3.83%、43.17%和16.94%;三级结构预测显示VIR蛋白存在较多的α-螺旋与无规则卷曲,同二级结构预测结果相符;含有17个磷酸化位点,无信号肽和跨膜结构区域,有15个潜在的B细胞优势表位,4个CTL细胞表位以及5个Th细胞表位。结论成功克隆了羊口疮安徽株VIR基因并预测了VIR蛋白的生物信息学相关信息,为进一步研究VIR蛋白奠定了基础。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 vir基因 克隆 生物信息学分析
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羊传染性脓疱病毒疫苗株和野毒株VIR基因的比较分析 被引量:2
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作者 王玲玲 刘永杰 +2 位作者 郑海学 张克山 刘湘涛 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期1135-1139,共5页
羊传染性脓疱(Orf)是由羊传染性脓疱病毒(orf virus,ORFV)感染引起的一种人兽共患传染病。VIR是ORFV编码的抗干扰素基因。为比较分析ORFV疫苗弱毒株和野毒株编码的VIR基因的特征,本试验扩增并测定了ORFV疫苗株和野毒株的VIR基因序列,比... 羊传染性脓疱(Orf)是由羊传染性脓疱病毒(orf virus,ORFV)感染引起的一种人兽共患传染病。VIR是ORFV编码的抗干扰素基因。为比较分析ORFV疫苗弱毒株和野毒株编码的VIR基因的特征,本试验扩增并测定了ORFV疫苗株和野毒株的VIR基因序列,比较分析了两者核酸水平和氨基酸水平的变异情况以及二、三级蛋白结构。结果表明:本次测定的ORFV疫苗株与野毒VIR基因核苷酸序列相似性为94.6%,氨基酸序列相似性为91.8%,两者在Z-DNA结合结构域和ds-RNA结合结构域均有突变。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 疫苗株 野毒株 vir基因 比较分析
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STUDIES ON INTRODUCTION OF FOREIGN GENES INTO CULTURED CELLS OF Oryza sativa INDICA USINC Agrobacterium Ti PLASMID SYSTEM
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作者 李宝健 欧阳学智 许耀 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 1991年第1期54-63,共10页
Either bacterial attachment or cellulose fibrillar elaboration was hardly observedduring the cocultivation of the cultured suspension cells of Oryza sativa Indica with thestrain C58C1 Rif^r of Agrobacterium tumefacien... Either bacterial attachment or cellulose fibrillar elaboration was hardly observedduring the cocultivation of the cultured suspension cells of Oryza sativa Indica with thestrain C58C1 Rif^r of Agrobacterium tumefaciens that was not specially pretreated. Onthe other hand, quite a lot of Agrobacterium cells were found to adhere to the surface ofcultured rice cells and a number of cellulose fibrils were produced around the specifiedbacteria when phenolics-pretreated bacteria were cocultivated with rice suspension cellsin common culture media, especially in complex culture solutions. The complex culturesolution was the bacterium-free filtrate of hormone-containing MS medium which hadbeen utilized to incubate carrot cells and the newly wounded hypocotyl segments fromtomato and Agrobacterium cells. Detecting experiments demonstrated that both NPT Ⅱ andNOS genes, located on the T-DNA segment of chimaeric plasmid pGV3850 :: 1103neo, weretransferred and expressed in the cultured cells of O. sativa Indica in the optimum trans-formation condition of the present experiment. Integration of the foreign genes into riceDNA was confirmed by Southern blot hybridization. 展开更多
关键词 rice cell transformation vir gene activation PHENOLIC compounds interaction of AGROBACTERIUM CELLS with host CELLS scanning electron MICROSCOPE
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农杆菌T-DNA传递相关基因研究进展 被引量:5
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作者 王根平 张婷 +1 位作者 师志刚 程汝宏 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期1752-1761,共10页
农杆菌已广泛应用于单、双子叶植物的遗传转化。T-DNA的传递是农杆菌介导转化的分子基础。T-DNA的传递是一个复杂的过程,与Ti质粒毒性区基因(Vir)、农杆菌染色体上毒性相关基因(chv)有关,另外植物体内部分基因也参与T-DNA的传递。T-DNA... 农杆菌已广泛应用于单、双子叶植物的遗传转化。T-DNA的传递是农杆菌介导转化的分子基础。T-DNA的传递是一个复杂的过程,与Ti质粒毒性区基因(Vir)、农杆菌染色体上毒性相关基因(chv)有关,另外植物体内部分基因也参与T-DNA的传递。T-DNA传递时在VirD1-VirD2蛋白的作用下形成T链,进一步形成T复合物,经农杆菌四型分泌系统(Type IV secretion system,T4SS)穿过细菌和植物细胞膜,运输到植物细胞胞质。进入植物细胞的T复合物在植物相关蛋白的作用下经核运输和T链的整合,最终整合到植物基因组。本研究从农杆菌对植物细胞的识别和附着、农杆菌对植物信号的感知和Vir基因的活化、T链的形成、T-复合物的运输、T链进入植物细胞后的核运输和T链的整合机制及相关基因作了详细综述,探讨了农杆菌转化机制研究中的问题,对今后农杆菌转化机制研究做了展望。 展开更多
关键词 遗传转化 农杆菌 T-DNA vir基因
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