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冬末春初圈养梅花鹿健康与腹泻个体粪便菌群的比较分析 被引量:2
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作者 吴家慧 石明慧 +6 位作者 王一晨 韩香雨 吴怡宁 蒋元琳 刘树强 胡德夫 商业 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2023年第2期68-77,共10页
腹泻是制约梅花鹿(Cervus nippon)养殖发展的主要因素之一,通常与肠道菌群失衡有关,而健康与腹泻梅花鹿个体菌群组成变化尚不清楚。为探究健康与腹泻梅花鹿肠道菌群差异,分析梅花鹿腹泻原因,以圈养雄性梅花鹿为实验对象,采集正常及腹泻... 腹泻是制约梅花鹿(Cervus nippon)养殖发展的主要因素之一,通常与肠道菌群失衡有关,而健康与腹泻梅花鹿个体菌群组成变化尚不清楚。为探究健康与腹泻梅花鹿肠道菌群差异,分析梅花鹿腹泻原因,以圈养雄性梅花鹿为实验对象,采集正常及腹泻梅花鹿粪便共18份,通过16S rRNA基因测序进行比较分析。研究结果表明,腹泻组菌群丰度及多样性较健康组均有所下降。在门至属水平,腹泻组理研菌科(Rikenellaceae)、克里斯滕森菌科(Christensenellaceae)等有益菌丰度下降,Treponema_2菌属等促炎菌丰度上升。此外,瘤胃球菌科UCG-014菌属(Ruminococcaceae_UCG-014)和理研菌科RC9菌属(Rikenellaceae_RC9_gut_group)在健康组中显著富集;疣微菌门(Verrucomicrobia)、拟普雷沃氏菌属(Alloprevotella)、阿克曼氏菌属(Akkermansia)在腹泻组显著富集。腹泻梅花鹿与健康梅花鹿粪便菌群组成和多样性存在显著差异,疣微菌门丰度升高可能是导致梅花鹿腹泻的一个原因。 展开更多
关键词 梅花鹿 肠道菌群 腹泻 16S rRNA基因测序 疣微菌门 阿克曼氏菌属
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极端环境下嗜热酸甲烷营养细菌研究进展 被引量:16
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作者 郑勇 郑袁明 +1 位作者 张丽梅 贺纪正 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期3864-3871,共8页
甲烷营养细菌能够将温室气体甲烷(CH4)转化为CO2或生物质,在碳生物地球化学循环及缓解由温室气体导致的全球气候变化方面发挥着重要的作用。甲烷营养细菌生存的条件范围较为广泛,但在中性pH(5~8)和中温(20~35℃)范围内生长最佳。系统... 甲烷营养细菌能够将温室气体甲烷(CH4)转化为CO2或生物质,在碳生物地球化学循环及缓解由温室气体导致的全球气候变化方面发挥着重要的作用。甲烷营养细菌生存的条件范围较为广泛,但在中性pH(5~8)和中温(20~35℃)范围内生长最佳。系统进化分析认为,它们均属于γ-或α-变形菌门(Proteobacteria)。最近3项独立完成的研究从极端热酸(pH接近1,温度高于50℃)环境中分离获得了具有甲烷氧化(营养)功能的微生物,经鉴定均属于疣微菌门(Verrucomicrobia)。这些全新的、不同于以往的研究结果不仅是对现有关于甲烷营养细菌生态学认知的进一步拓展,同时也暗示着可能存在着新型的、由微生物介导的CH4氧化途径与机制。因此,特就极端环境中嗜热嗜酸甲烷营养细菌的最新研究进展作一概述。 展开更多
关键词 甲烷营养细菌 极端环境 基因组分析 代谢途径 疣微菌门
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缬沙坦灌胃糖尿病肾病小鼠肠道菌群多样性观察 被引量:4
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作者 许祯 倪雅丽 +1 位作者 肖曼 杜冠魁 《山东医药》 CAS 2019年第6期42-45,共4页
目的观察缬沙坦灌胃的糖尿病肾病(DN)小鼠肠道菌群的多样性。方法 14只8周雄性DN模型小鼠随机分为A、B两组,每组各7只。A组缬沙坦50 mg/kg灌胃,B组等量生理盐水灌胃,另取7只8周龄正常小鼠为对照组,每天灌胃等量生理盐水。三组均灌胃1次... 目的观察缬沙坦灌胃的糖尿病肾病(DN)小鼠肠道菌群的多样性。方法 14只8周雄性DN模型小鼠随机分为A、B两组,每组各7只。A组缬沙坦50 mg/kg灌胃,B组等量生理盐水灌胃,另取7只8周龄正常小鼠为对照组,每天灌胃等量生理盐水。三组均灌胃1次/d,共灌胃8周。灌胃结束后,收集各组0. 2 g粪便,提取粪便细菌DNA,进行粪便细菌DNA高通量测序。采用分类单元(OTU)指数分析各组小鼠肠道菌群种属,通过Chao1指数、辛普森(Simpson)指数、香农(Shannon)指数,分析肠道菌群多样性,从纲、种属水平分析各组小鼠肠道菌群的相对丰度。结果与对照组比较,B组OTU总数、Chao1指数、Shannon指数升高,Simpson指数降低(P均<0. 05);与B组比较,A组OTU指数、Chao1指数、Simpson指数降低,Shannon指数升高(P均<0. 05)。在门水平上,与对照组小鼠比较,B组小鼠肠道菌群中,拟杆菌、疣微菌门丰度下降,硬壁菌门、无壁[细]菌类、脱铁杆菌门丰度上升上升(P均<0. 05)。与B组比较,A组拟杆菌、疣微菌门丰度上升,壁菌门、无壁[细]菌类、脱铁杆菌门丰度下降(P均<0. 05)。在种属水平上,与对照组比较,B组小鼠肠道菌群大肠杆菌志贺菌、阿克曼菌丰度下降,Mucispirillum菌丰度上升(P均<0. 05)。与B组比较,A组小鼠肠道菌群大肠杆菌志贺菌、阿克曼菌丰度上升,Mucispirillum菌丰度下降(P均<0. 05)。结论缬沙坦可能通过增加DN小鼠肠道菌群多样性、影响肠道菌群的结构,对DN小鼠肾脏起保护作用。 展开更多
关键词 缬沙坦 糖尿病肾病 尿白蛋白 尿素氮 拟杆菌 疣微菌门 硬壁菌门 脱铁杆菌门 大肠杆菌志贺菌 阿克曼菌 Mucispirillum菌
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大气颗粒物暴露对肠道细菌丰度调节研究进展
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作者 王耀晗 黄楠楠 +3 位作者 李彬 陈汉清 李晓波 陈瑞 《环境与职业医学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期451-456,共6页
大气颗粒物是我国主要的大气污染物,由于其分布广泛、治理困难一直受到广泛关注。大气颗粒物主要通过呼吸道暴露进入机体,引发多种健康问题。近年来研究表明,大气颗粒物暴露与消化系统疾病的发生发展紧密相关,其可以通过呼吸道间接或者... 大气颗粒物是我国主要的大气污染物,由于其分布广泛、治理困难一直受到广泛关注。大气颗粒物主要通过呼吸道暴露进入机体,引发多种健康问题。近年来研究表明,大气颗粒物暴露与消化系统疾病的发生发展紧密相关,其可以通过呼吸道间接或者通过消化道直接进入人体。肠道菌群是定位于肠道上皮黏膜及肠腔的微生物群,数量庞大,功能丰富,其稳态对个体的肠道健康甚至是机体健康都起着重要的作用。肠道菌群可能介导环境因素诱导的健康效应,因此现有越来越多的研究关注大气颗粒物对肠道菌群的影响。因此,本综述检索并整理了多种大气颗粒物暴露对肠道菌群稳态的影响,以厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门及疣微菌门这五大菌门为主,讨论了它们的主要功能及大气颗粒物对其稳态和丰度的影响。 展开更多
关键词 颗粒物 肠道菌群 厚壁菌门 拟杆菌门 变形菌门 放线菌门 疣微菌门
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基于肠道菌群探讨金藤清痹颗粒抗类风湿关节炎的作用机制 被引量:3
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作者 周政 赵灵灵 +1 位作者 贾文瑞 王娟 《现代药物与临床》 CAS 2023年第2期270-279,共10页
目的以“肠–关节”轴为切入点,探讨金藤清痹颗粒抗类风湿关节炎的作用机制。方法按体质量将大鼠随机分为6组,即对照组、模型组、双氯芬酸钠组以及金藤清痹颗粒高、中、低剂量组,每组6只。采用胶原诱导法进行造模,设计金藤清痹颗粒高、... 目的以“肠–关节”轴为切入点,探讨金藤清痹颗粒抗类风湿关节炎的作用机制。方法按体质量将大鼠随机分为6组,即对照组、模型组、双氯芬酸钠组以及金藤清痹颗粒高、中、低剂量组,每组6只。采用胶原诱导法进行造模,设计金藤清痹颗粒高、中、低剂量组给药剂量分别为6.30、3.15、1.58 g/kg;双氯芬酸钠组给药剂量为3 mg/kg;对照组和模型组ig等量生理盐水,给药4周。苏木精–伊红染色法(HE)观察大鼠踝关节部位病理变化,酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测大鼠血清相关炎症指标,16S rDNA分析盲肠内容物中肠道菌群变化。结果与模型组比较,金藤清痹颗粒可明显降低胶原诱导型关节炎模型大鼠关节肿胀度,减少踝关节炎性细胞浸润,同时可显著降低胶原诱导型关节炎大鼠血清肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素(IL)-1β、C反应蛋白(CRP)水平(P<0.05、0.01);16S rDNA结果显示,金藤清痹颗粒6.30 g/kg可增加Cyanobacteria、软壁菌门、疣微菌门、梭杆菌门、毛螺菌科NK4A136群和Ruminiclostridium 5等菌群的相对丰度,以及降低变形菌门、乳杆菌属和瘤胃球菌属1等菌群的相对丰度。结论金藤清痹颗粒可能通过调控“肠–关节”轴发挥抗类风湿关节炎的作用。 展开更多
关键词 金藤清痹颗粒 类风湿关节炎 肠道菌群 “肠–关节”轴 CYANOBACTERIA 软壁菌门 疣微菌门
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肠道中Akkermansia muciniphila数量影响因素的研究进展 被引量:14
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作者 韩伟 王超 +1 位作者 李晓敏 张晓琳 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2019年第3期356-359,364,共5页
Akkermansia muciniphila (AKK菌)是在人体粪便样品中分离的一种细菌,也是目前唯一可培养的疣微菌门肠道微生物。因它在黏蛋白降解过程中的特殊性能而成为肠腔与宿主细胞间黏膜界面的关键生物,和炎症性肠病、肥胖、酒精肝、孤独症、结... Akkermansia muciniphila (AKK菌)是在人体粪便样品中分离的一种细菌,也是目前唯一可培养的疣微菌门肠道微生物。因它在黏蛋白降解过程中的特殊性能而成为肠腔与宿主细胞间黏膜界面的关键生物,和炎症性肠病、肥胖、酒精肝、孤独症、结肠炎、2型糖尿病、1型糖尿病及其他代谢紊乱等密切相关。作为宿主肠道微生物的一员,AKK菌的数量必然受到体内、体外多种因素的影响,其中,饮食、抗生素及其他药物、益生菌和益生元、天然产物、温度、体内免疫蛋白等均是目前已知的影响因素。这篇文章从AKK菌的生理特性、与宿主的关系及其数量的影响因素等3个方面对现有研究进行综述。 展开更多
关键词 AKK菌 疣微菌门 肠道菌 丰度
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Difficult-to-culture bacteria in the rhizosphere:The underexplored signature microbial groups 被引量:5
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作者 Sadaf KALAM Anirban BASU Appa Rao PODILE 《Pedosphere》 SCIE CAS CSCD 2022年第1期75-89,共15页
Microorganisms represent a substantial portion of the earth’s biodiversity and biomass, and the plant rhizosphere is an innate reservoir teeming with heterogeneous microbes predominated by bacterial communities. Rhiz... Microorganisms represent a substantial portion of the earth’s biodiversity and biomass, and the plant rhizosphere is an innate reservoir teeming with heterogeneous microbes predominated by bacterial communities. Rhizospheric microbial diversity (genetic, phenotypic, and metabolic) has been extensively studied to understand the key ecological roles played by the microbial members, including plant growth promotion. The application of 16S rRNA gene sequencing and next-generation sequencing (NGS) technologies has revolutionized the discovery of novel bacterial groups that have remained undetected by traditional cultivation-based approaches. Such technological advancements have opened new vistas in our current understanding of predominant but concealed and missed bacterial diversity referred to as difficult-to-culture bacterial lineages, especially the predominant phyla Acidobacteria, Verrucomicrobia,Planctomycetes, and Gemmatimonadetes. Regardless of their ubiquity and prevalence, little is known about their ecophysiology because of the non-availability of culturable members. More recently, there has been increased interest in understanding the cosmopolitan distribution and diversity of the difficult-to-culture bacteria, focusing on their role in driving complex plant-microbial interactions and mobilizing nutrients in soil and their potential as sources of novel bioactive metabolites. As an initial step, we review the distribution and significance of such bacterial phyla in soil, their ecophysiological roles, and their hidden plant growth promoting potential. The ability to select and deploy plant probiotic bacteria from the difficult-to-culture fraction of the bacterial community might open new avenues for improving crop health. 展开更多
关键词 ACIDOBACTERIA ecophysiological roles Gemmatimonadetes microbial diversity PLANCTOMYCETES plant growth promotion verrucomicrobia
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不同油脂对小鼠肠道菌群的影响 被引量:5
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作者 朱航榉 王锋 +4 位作者 杨贤 王兆丹 夏慧 成晨 孙桂菊 《环境与职业医学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期995-998,共4页
[目的]研究不同油脂对肠道菌群的影响。[方法]采用C57BL/6雄性小鼠(6周龄,体重16~18 g),每组12只,分为7组,对照组采用脂肪能量占总能量10%的普通饲料饲养,其余6组用D12451高脂饲料进行饲养,各组高脂饲料中的油脂分别为猪油、大豆油、24... [目的]研究不同油脂对肠道菌群的影响。[方法]采用C57BL/6雄性小鼠(6周龄,体重16~18 g),每组12只,分为7组,对照组采用脂肪能量占总能量10%的普通饲料饲养,其余6组用D12451高脂饲料进行饲养,各组高脂饲料中的油脂分别为猪油、大豆油、24度棕榈油、33度棕榈油、混合油(含大豆油与棕榈油,质量比=0.9∶1)、橄榄油,连续干预12周后眼框采血,检测总胆固醇和三酰甘油等血脂指标,处死后采集结肠内的残留排泄物,采用16S rRNA扩增子测序技术进行测序,进行操作分类单元聚类和物种分类分析。采用Meta Stat方法分析物种丰度数据,得到P值,校正后得到q值,筛选具有差异的物种。[结果]实验组总胆固醇和三酰甘油高于对照组。混合油组放线菌门物种相对丰度高于对照组(q<0.05)。猪油组、33度棕榈油组疣微菌门物种相对丰度高于对照组(q<0.05)。[结论]长期的高脂膳食会对小鼠肠道菌群产生影响。大豆油、橄榄油、24度棕榈油不会引起肠道菌群的异常。 展开更多
关键词 油脂 C57BL/6 肠道菌群 血脂 放线菌 疣微菌 16S RRNA
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特殊环境中甲烷氧化菌的研究进展 被引量:4
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作者 艾佳 吕杨 +2 位作者 李彦澄 钟雄 李江 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期1509-1517,共9页
甲烷氧化菌在自然界中广泛分布,是一类独特的原核生物,同时也是环境中甲烷气体的重要生物过滤器。其生存环境不仅仅局限于普通的中性中温条件,现已从酸性泥炭藓沼泽湿地、酸性森林土壤、温泉及火山口附近的高温地热区域、苏打盐碱型湖... 甲烷氧化菌在自然界中广泛分布,是一类独特的原核生物,同时也是环境中甲烷气体的重要生物过滤器。其生存环境不仅仅局限于普通的中性中温条件,现已从酸性泥炭藓沼泽湿地、酸性森林土壤、温泉及火山口附近的高温地热区域、苏打盐碱型湖泊及海洋沉积物等pH、温度范围较宽的多种特殊环境中被分离出来。本文详细阐述了特殊环境中甲烷氧化菌的分类、性质和影响因素,并总结了甲烷氧化菌的工程应用和研究技术,旨在为环境生物多样性和全球碳、氢循环的深入研究提供参考。 展开更多
关键词 特殊环境 极端条件 甲烷氧化菌 疣微菌 变形菌
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湿度盐度pH协同驱动锡林河景观疣微菌群空间异质性 被引量:8
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作者 王泽铭 李传虹 +5 位作者 马巧丽 李千雪 魏亚茹 赵吉 于景丽 希尼尼根 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1728-1742,共15页
【目的】为了阐明锡林河不同景观要素间疣微菌群的空间分布异质性及环境驱动力。【方法】本文基于生境及微地形差异选择水生的河床中心、河床边缘与牛轭湖床,湿生的低河漫滩与高河漫滩,旱生的低阶地与高阶地等景观要素,基于16S rRNA基... 【目的】为了阐明锡林河不同景观要素间疣微菌群的空间分布异质性及环境驱动力。【方法】本文基于生境及微地形差异选择水生的河床中心、河床边缘与牛轭湖床,湿生的低河漫滩与高河漫滩,旱生的低阶地与高阶地等景观要素,基于16S rRNA基因高通量测序技术研究不同景观要素土壤疣微菌群的景观异质性,结合土壤湿度等环境变量研究其驱动力。【结果】景观要素内疣微菌群呈协同的分布特征,景观要素间呈趋异的分布特征。斯巴达杆菌纲的Chthoniobacter成员及疣微菌纲的突柄杆菌属等成员主要分布在水生河床中心,与砂粒含量存在显著正相关关系(P<0.05);丰祐菌纲成员主要分布在湿生河漫滩,与pH存在正相关关系(P<0.05或P>0.05);斯巴达杆菌纲的DA101soilgroup成员主要分布在旱生河流阶地,与盐度及养分含量等存在极显著正相关关系(P<0.01)。双组与三组环境变量的变异权重分析表明,湿度、盐度、pH对疣微菌群景观异质性的解释度分别高达24.7%与21.4%、24.3%与22.7%、23.1%与20.8%。【结论】锡林河流域疣微菌群存在景观异质性。Chthoniobacter和突柄杆菌属等成员是河床中心景观要素的指示生物,DA101soilgroup是阶地景观要素的指示生物。湿度、盐度、pH协同驱动疣微菌群的景观异质性。 展开更多
关键词 锡林河 景观要素 疣微菌 空间异质性 复合环境变量
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