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Compartmentalization of hepatitis B virus: Looking beyond the liver 被引量:2
1
作者 Sibnarayan Datta 《World Journal of Hepatology》 CAS 2015年第20期2241-2244,共4页
Hepatitis B virus(HBV) is classically considered to be hepatotropic, but accumulating evidences strongly support its extra-hepatotropic nature too. HBV nucleicacids and proteins have long been reported in a variety of... Hepatitis B virus(HBV) is classically considered to be hepatotropic, but accumulating evidences strongly support its extra-hepatotropic nature too. HBV nucleicacids and proteins have long been reported in a variety of extra-hepatic tissues. Of these, HBV has been studied in details in the peripheral blood mononuclear cells(PBMCs), due to its accessibility. From these studies, it is now well established that PBMCs are permissive to HBV infection, replication, transcription and production of infective virions. Furthermore, molecular evolutionary studies have provided definite evidences towards evolution of HBV genome in PBMCs, which is independent of evolution occurring in the liver, leading to the emergence and selection of compartment specific escape variants or drug resistant strains. These variants/resistant strains of HBV remain restricted within the PBMCs and are rarely detected in the serum/plasma. In addition, HBV infected PBMCs have been reported to be directly transmitted through intrauterine modes, and this infection does not correlate significantly with serum HBV surface antigen or HBV DNA markers. This editorial briefly reviews the current knowledge on this topic, emphasizes and delineates the gaps that are required to be filled to properly understand the biological and clinical relevance of extrahepatic tropism of HBV. 展开更多
关键词 Lymphotropism COMPARTMENTALIZATION HEPATITIS B vir
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HIV-1 fusion inhibitor VIR576 interferes with T-cell activation by targeting TCR
2
《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第B11期34-35,共2页
Aim To determine the effect of VIR576, a dimeric 20-mer peptide potently inhibits HIV-1 entry, on antigen-specific T cell and non-antigen-specific T cell activation. Methods In vitro T-cell proliferation assays were e... Aim To determine the effect of VIR576, a dimeric 20-mer peptide potently inhibits HIV-1 entry, on antigen-specific T cell and non-antigen-specific T cell activation. Methods In vitro T-cell proliferation assays were estalished to investigate the potential effect of FP16, VIR576 on the proliferation of A2b cells in response to MOG35-55. A fluorescence-based binding assay using Rhodamine (Rho)-conjugated VIR576 was estalished to e- valuate the potential interaction between VIR576 and TCR-TMD. Fluorescence confocal microscopy was used to to study whether VIR576 could colocalize with CD4 molecule in the CD4 + T cell membrane to interact with TCR. Re- suits The effects of VIR576 on the proliferation of MOG-specific A2b T cells in response to the stimulation of MOG 35 -55 peptide wasevaluated. VIR576 itself could directly inhibit antigen-specific T-cell activation. Further studies confirmed that VIR576 also inhibited the proliferation of splenocytes and primary CD4 + CD25- T cells iso- lated from the spleens of DOll. 10 OVA Tg mice in response to OVA stimulation in vitro. However, VIR576 had no effect on the proliferation of normal mouse splenocytes and T lymphocytes stimulated with Con A or anti-CD3 anti- body. The FRET assay confirmed that VIR576 effectively binds to the core peptide (CP) , corresponding to the N- terminal 9-residue region of TCR-TMD. Confocal microscopy revealed that VIR576 colocalizes with CD4 on the ac- tivated CD4 + T-cell membrane, particularly within the activation cluster including re-assembled CD4 and TCR mol- ecules. Conclusion These results suggest that VIR576 is effective in suppressing antigen-specific T-cell activa- tion, but it has no effect on non-specific T-cell proliferation, and VIR576 has the ability to down-regulate antigen- specific T-cell activation by interaction with TCR transmembrane domain. 展开更多
关键词 HIV-1 FusION inhibitor GP41 FusION PEPTIDE vir576 T cell receptor T CALL activation
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羊口疮病毒B2L和VIR基因原核表达及抗原性鉴定 被引量:10
3
作者 李杰 李前瑞 +3 位作者 田婷婷 许君艳 姚运亮 陈德坤 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2013年第3期1-6,共6页
为检测羊口疮病毒(Orf virus)B2L和VIR蛋白的抗原性,通过PCR方法扩增出羊口疮病毒B2L和VIR基因,与原核表达载体pET-32a连接,将重组质粒转化到BL21(DE3)感受态中,对其进行BamHⅠ和HindⅢ双酶切鉴定和测序验证。对鉴定为阳性的菌液进行诱... 为检测羊口疮病毒(Orf virus)B2L和VIR蛋白的抗原性,通过PCR方法扩增出羊口疮病毒B2L和VIR基因,与原核表达载体pET-32a连接,将重组质粒转化到BL21(DE3)感受态中,对其进行BamHⅠ和HindⅢ双酶切鉴定和测序验证。对鉴定为阳性的菌液进行诱导表达,并进行SDS-PAGE分析。用灭活的羊口疮病毒免疫家兔,制备多克隆抗体,Western blot、ELISA鉴定B2L和VIR蛋白的抗原性。结果显示B2L、VIR蛋白均能与兔抗羊口疮病毒抗血清结合,证明B2L、VIR蛋白具有与羊口疮病毒共同的B细胞表位。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 B2L基因 vir基因 原核表达 抗原性
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单、双子叶植物的代谢物调节农杆菌Vir区基因表达的研究 被引量:9
4
作者 许耀 施骏 李宝健 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1993年第1期59-67,共9页
本文研究了六种植物(三种单子叶植物、三种双子叶植物)愈伤组织的渗出物和抽提物对农杆菌Vir基因表达的调节作用。其调节水平随植物的不同而明显不同,但单、双子叶植物的代谢物对Vir基因表达的调节作用并非截然分开。即使在双子叶植物(... 本文研究了六种植物(三种单子叶植物、三种双子叶植物)愈伤组织的渗出物和抽提物对农杆菌Vir基因表达的调节作用。其调节水平随植物的不同而明显不同,但单、双子叶植物的代谢物对Vir基因表达的调节作用并非截然分开。即使在双子叶植物(如大豆)的抽提物与渗出物中也存在着抑制Vir基因表达的因子,而在单子叶植物(如玉米等)的抽提物与渗出物中也存在着促进Vir基因表达的调节因子。Vir位点的调节反应随渗出物与抽提物的种类不同而明显不同,不同Vir位点对同类渗出物或抽提物的反应也不同。渗出物对Vir基因表达的正调节效应优于抽提物。植物渗出物与AS对Vir区基因表达的调节并不表现简单的累加效应或协同作用。相反,在渗出物中还存在着不同程度阻抑AS对Vir基因表达正调节的因子。 展开更多
关键词 基因表达调节 vir区基因 代谢物 单子叶植物 双子叶植物 农杆菌Ti质粒
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安徽地区羊口疮病毒VIR基因PCR检测及遗传进化分析 被引量:5
5
作者 侯宏艳 惠文巧 +2 位作者 张丹俊 赵瑞宏 胡晓苗 《中国草食动物科学》 CAS 2017年第1期4-6,共3页
采集安徽某地区两个山羊场中疑似感染ORFV的羔羊唇部结痂病料,采用PCR方法对毒力基因VIR进行了扩增,并获得了目的片段VIR-1和VIR-2。同时将PCR产物克隆至p MD18-T载体,鉴定后测序。序列分析结果表明,两个羊场的毒力基因VIR-1和VIR-2基... 采集安徽某地区两个山羊场中疑似感染ORFV的羔羊唇部结痂病料,采用PCR方法对毒力基因VIR进行了扩增,并获得了目的片段VIR-1和VIR-2。同时将PCR产物克隆至p MD18-T载体,鉴定后测序。序列分析结果表明,两个羊场的毒力基因VIR-1和VIR-2基因片段与参考毒株的相关基因核苷酸同源性分别为95.8%~100%和95.4%~99.6%。基因进化树比较显示,两分离株分别与美国AY424975.1株和甘肃KF916586.1株的亲缘关系最近。 展开更多
关键词 安徽 羊口疮病毒 vir基因 遗传进化分析
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VIR576通过与TCR跨膜区结合抑制抗原特异性T细胞活化 被引量:2
6
作者 张瑞涛 李晓娟 +3 位作者 李润明 胡义平 姜世勃 刘叔文 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1960-1964,共5页
目的探讨抗HIV多肽VIR576抑制抗原特异性T细胞活化的作用机制。方法OVA体外刺激分离的DO11.10小鼠抗原特异性T细胞,CCK-8法检测VIR576对其活化的影响。采用溶血试验、溶血抑制实验、荧光结合法等方法检测VIR576与TCR跨膜区序列(TCR-TMD... 目的探讨抗HIV多肽VIR576抑制抗原特异性T细胞活化的作用机制。方法OVA体外刺激分离的DO11.10小鼠抗原特异性T细胞,CCK-8法检测VIR576对其活化的影响。采用溶血试验、溶血抑制实验、荧光结合法等方法检测VIR576与TCR跨膜区序列(TCR-TMD)之间的相互作用。结果体外实验显示,VIR576能逆转HIVgp41融合多肽(FP)介导的抗原特异性T细胞活化,并且其自身也能抑制抗原特异性的T细胞活化(P<0.05)。溶血试验、溶血抑制实验、荧光结合法等方法证实,VIR576能与TCR-TMD特异性结合。结论VIR576对T细胞活化的作用是TCR依赖性的,通过与TCR-TMD结合抑制抗原特异性T细胞活化。VIR576兼具抑制HIV进入和抗原特异性T细胞活化的特性,可望作为预防HIV性传播的杀微生物剂进行研究。 展开更多
关键词 HIV 进入抑制剂 vir576 抗原特异性T细胞活化
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羊传染性脓疱病毒抗干扰素基因(VIR)研究进展 被引量:3
7
作者 王玲玲 刘永杰 +2 位作者 郑海学 张克山 刘湘涛 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1181-1184,共4页
羊传染性脓疱病毒(ORFV)是痘病毒科副痘病毒属的成员之一,引起严重的人兽共患传染病。该病毒基因组全长约134~139kb,编码130多个蛋白,抗干扰素基因是ORFV编码的具有拮抗宿主干扰素功能的蛋白,在ORFV突破宿主免疫屏障过程中有重要作用... 羊传染性脓疱病毒(ORFV)是痘病毒科副痘病毒属的成员之一,引起严重的人兽共患传染病。该病毒基因组全长约134~139kb,编码130多个蛋白,抗干扰素基因是ORFV编码的具有拮抗宿主干扰素功能的蛋白,在ORFV突破宿主免疫屏障过程中有重要作用。本文就抗干扰素基因的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 羊传染性脓疱病毒 vir基因 研究进展
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产气荚膜梭菌VirS/VirR双组分系统调控机制研究进展 被引量:3
8
作者 王艳华 KHAN MUZ +1 位作者 许笑 蔡建平 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期934-938,956,共6页
产气荚膜梭菌是一种重要的人兽共患病病原体,该菌引起各种动物坏死性肠炎、肠毒血症、人畜创伤性气性坏疽及人类食物中毒。该菌产生的毒素和酶协同作用导致病变发生。产气荚膜梭菌毒素和酶的产生受到复杂网络调控。VirS/VirR系统是产气... 产气荚膜梭菌是一种重要的人兽共患病病原体,该菌引起各种动物坏死性肠炎、肠毒血症、人畜创伤性气性坏疽及人类食物中毒。该菌产生的毒素和酶协同作用导致病变发生。产气荚膜梭菌毒素和酶的产生受到复杂网络调控。VirS/VirR系统是产气荚膜梭菌中最重要也是研究最深入的一个双组分调节系统。本文对这一双组分系统的研究进展进行综述,为进一步阐明该菌的致病机制奠定基础。 展开更多
关键词 产气荚膜梭菌 virS/virR系统 调控
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HIV进入抑制多肽VIR576与TCR的相互作用研究 被引量:1
9
作者 张瑞涛 李珉珉 +2 位作者 李润明 张嘉杰 李晓娟 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1731-1734,共4页
目的 VIR576为具有抑制HIV进入靶细胞活性的抗艾滋病多肽,我们发现其能抑制抗原特异性T细胞活化,且可能是通过与T细胞受体(TCR)结合而发挥作用。本研究深入探讨VIR576与T细胞受体(TCR)相互作用,并确定其关键作用位点。方法采用荧光化合... 目的 VIR576为具有抑制HIV进入靶细胞活性的抗艾滋病多肽,我们发现其能抑制抗原特异性T细胞活化,且可能是通过与T细胞受体(TCR)结合而发挥作用。本研究深入探讨VIR576与T细胞受体(TCR)相互作用,并确定其关键作用位点。方法采用荧光化合物标记多肽,用荧光共振能量转移技术(FRET)来检测VIR576与TCR的相互作用,并通过合成TCR跨膜序列(TCR-TMD)的核心多肽(CP),确定相互作用的关键序列。同时用激光共聚焦显微镜,观察VIR576在T细胞膜上是否与TCR存在共定位。结果FRET分析表明VIR576能与CP多肽发生近距离的相互作用。VIR576能插入到细胞膜上,并结合在抗CD3-抗体活化的小鼠脾细胞膜上,与CD4分子分布一致,提示其与TCR分子存在共定位。结论 VIR576可能在激活的T细胞上与TCR跨膜区直接结合,结合的关键位点为TCR跨膜区的核心序列CP。 展开更多
关键词 HIV进入抑制多肽 vir576 蛋白-蛋白相互作用 T细胞受体 荧光共振能量转移技术 T细胞
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诱导根癌土壤杆菌vir区基因表达信号分子的构效研究 被引量:1
10
作者 许东晖 许实波 +2 位作者 李宝健 刘煜 古练权 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1999年第11期1252-1254,共3页
Four rice (Oryza satia L. cv. IR72) signal factors with the functions of inducing Agrobaterium tumefaciens (Smith et Townsend) Conn vir genes were constructed. They were 5, 7, 4’-trihydroxy-3’, 5’-dimethoxy-flavone... Four rice (Oryza satia L. cv. IR72) signal factors with the functions of inducing Agrobaterium tumefaciens (Smith et Townsend) Conn vir genes were constructed. They were 5, 7, 4’-trihydroxy-3’, 5’-dimethoxy-flavone (F1) and its structure analogues F2, F3 and F4. These four signal fartors were detected by Agrobacterium vir:: lzcZ fusion gene system as to compare their functions of inducing virA, virB, virC,virD, virE and virG genes. The structure characters and structure-activity relationship of these signal factors with the best inducing effects to Agrobacterium exogenous gene transformation system were defined which may provide some basic information for foreign gene transformation in rice. 展开更多
关键词 水稻 根癌土壤杆菌 vir基因 信号分子 诱导 构效
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根瘤农杆菌二组分体VirA/VirG介导的侵染性 被引量:1
11
作者 姚远 姚瑶 +1 位作者 莫日根 范丽菲 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期76-82,共7页
根瘤农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)是存在于土壤中的革兰氏阴性菌,可以侵染很多种双子叶植物、单子叶植物以及裸子植物的受伤部位,用位于其Ti质粒上vir基因产物来诱导植物产生冠瘿瘤,因此,根瘤农杆菌广泛用于植物基因工程研究,是... 根瘤农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)是存在于土壤中的革兰氏阴性菌,可以侵染很多种双子叶植物、单子叶植物以及裸子植物的受伤部位,用位于其Ti质粒上vir基因产物来诱导植物产生冠瘿瘤,因此,根瘤农杆菌广泛用于植物基因工程研究,是个农业工程菌。研究表明vir基因的表达受VirA/VirG二组分体的介导。回顾和总结了根瘤农杆菌的VirA/VirG二组分体的结构、作用机理、以及所感知的环境因子,和这些环境因子通过VirA/VirG二组分体对vir基因的表达调控分子机制。 展开更多
关键词 根瘤农杆菌 virA virG二组分体 vir基因表达 侵染
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HIV进入抑制多肽VIR576可抑制抗原特异性CD4^+T细胞的体外活化:一种潜在的双功能杀微生物剂(英文)
12
作者 李珉珉 张瑞涛 +4 位作者 胡义平 李建军 姜世勃 李晓娟 刘叔文 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期597-602,共6页
目的观察VIR576对CD4+T细胞活化的作用。方法分离DO11.10小鼠脾细胞并用OVA或ConA分别刺激,观察VIR576对抗原特异性和非特异性T细胞活化的影响;培养A2b CD4+T细胞株和磁珠分离的DO11.10小鼠脾脏CD4+CD25-效应性T细胞,分别用特异性抗原激... 目的观察VIR576对CD4+T细胞活化的作用。方法分离DO11.10小鼠脾细胞并用OVA或ConA分别刺激,观察VIR576对抗原特异性和非特异性T细胞活化的影响;培养A2b CD4+T细胞株和磁珠分离的DO11.10小鼠脾脏CD4+CD25-效应性T细胞,分别用特异性抗原激活,观察VIR576对抗原特性CD4+T细胞活化的影响。结果 VIR576抑制抗原特异性T细胞的活化,但对非抗原特异性T细胞活化的影响不显著,非特异性T细胞活化不需要TCR和CD3的交联。进一步研究发现,VIR576也可以下调抗原特异性CD4+T细胞的活化。结论粘膜活化的CD4+T细胞对HIV-1高度易感,VIR576不仅具有抑制HIV进入的活性还能够抑制CD4+T细胞活化,提示VIR576是一种有开发潜能的预防HIV性传播的杀微生物剂。 展开更多
关键词 HIV进入抑制多肽 GP41 融合多肽 vir576 CD4’T细胞活化
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农杆菌侵染过程中的Vir蛋白
13
作者 张坤 王继刚 李玉花 《生物技术通讯》 CAS 2007年第4期715-718,共4页
农杆菌作为目前广泛应用的遗传转化工具,其分子机理得到广泛深入的研究,尤其是位于Ti质粒上的Vir蛋白,在整个侵染过程中起非常重要的作用。从植物信号的感应到T-DNA的运输及整合,都是在Vir蛋白和植物因子的帮助下共同完成的。简要综述... 农杆菌作为目前广泛应用的遗传转化工具,其分子机理得到广泛深入的研究,尤其是位于Ti质粒上的Vir蛋白,在整个侵染过程中起非常重要的作用。从植物信号的感应到T-DNA的运输及整合,都是在Vir蛋白和植物因子的帮助下共同完成的。简要综述了近年来有关Vir蛋白在农杆菌侵染各阶段中作用的研究进展。 展开更多
关键词 vir蛋白 T-DNA 农杆菌
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福建省羊传染性脓疱病毒F1L、B2L和VIR基因的遗传变异分析 被引量:6
14
作者 林裕胜 江锦秀 +2 位作者 江斌 游伟 胡奇林 《动物医学进展》 北大核心 2017年第2期1-6,共6页
为探明2014年-2015年在福建省流行的羊传染性脓疱病毒(ORFV)遗传变异情况,对10株ORFV流行毒株的F1L、B2L和VIR基因进行克隆、测序及分析。结果表明,10株ORFV F1L基因之间的核苷酸序列同源性为97.6%~100%,与国内株的核苷酸序列同源性为96... 为探明2014年-2015年在福建省流行的羊传染性脓疱病毒(ORFV)遗传变异情况,对10株ORFV流行毒株的F1L、B2L和VIR基因进行克隆、测序及分析。结果表明,10株ORFV F1L基因之间的核苷酸序列同源性为97.6%~100%,与国内株的核苷酸序列同源性为96.8%~99.7%,与NZ2参考株的核苷酸序列同源性为96.3%~97.1%;同NZ2参考株比较,FJ-YT2014缺失2个氨基酸;10株ORFV B2L基因之间核苷酸序列同源性为97.5%~99.9%,与国内株的核苷酸序列同源性为96.7%~99.5%,与NZ2参考株的核苷酸序列同源性为96.7%~97.7%;10株ORFV VIR基因之间的核苷酸序列同源性为95.8%~99.5%,与国内株的核苷酸序列同源性为94.6%~99.6%,与NZ2参考株的核苷酸序列同源性为94.6%~96.4%。基于基因核苷酸序列的遗传进化分析表明,10株ORFV F1L基因与福建省分离株、山西株和新疆株亲缘关系较近;10株ORFV B2L基因与新疆、山西、德国毒株亲缘关系较近;10株ORFV VIR基因与台湾、新疆株亲缘关系较近。结果提示,当前福建省流行的ORFV F1L、B2L和VIR基因尚未出现明显变异,但是其F1L、B2L和VIR基因核苷酸序列之间普遍存在异质性。 展开更多
关键词 羊传染性脓疱病毒 F1L基因 B2L基因 vir基因 变异分析
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几种禾谷类作物中诱导农杆菌Vir区基因活化的酚类物质分析 被引量:6
15
作者 杨剑波 许智宏 卫志明 《植物生理学报(0257-4829)》 CSCD 1992年第2期179-184,共6页
主要禾谷类作物中所含与农杆菌Vir基因活化诱导有关的酚类物质,在种类和数量上,都较双子叶模式植物烟草和胡萝卜为少,其中水稻、大麦中含量最低(每克鲜重幼苗所含的酚类诱导物均在6μg以下),玉米和小麦中的含量稍高(大约在20μg/gFW左右... 主要禾谷类作物中所含与农杆菌Vir基因活化诱导有关的酚类物质,在种类和数量上,都较双子叶模式植物烟草和胡萝卜为少,其中水稻、大麦中含量最低(每克鲜重幼苗所含的酚类诱导物均在6μg以下),玉米和小麦中的含量稍高(大约在20μg/gFW左右)。被检测的主要禾谷类作物所含酚类诱导物的种类仅有1~2种,而烟草中却含有除香草醛以外的所有被检测的酚类诱导物,其含量为水稻和大麦的十几倍;胡萝卜仅次于烟草。从总体上看,不同作物所含酚类诱导物的种类与数量分布与其被农杆菌感染的难易程度有较好的一致性。此外,同一作物不同品种和组织中所含酚类诱导物的数量也有些差异。 展开更多
关键词 农杆菌 禾谷类 vir酚诱导物
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根癌农杆菌介导VirE2-N-EGFP在2种茄科植物中的表达分析 被引量:1
16
作者 杜利娟 薛杨 +1 位作者 张旺 孙现超 《安徽农业科学》 CAS 2015年第33期254-256,265,共4页
为了明确根癌农杆菌介导的外源蛋白在茄科植物叶片细胞中能否瞬时表达,克隆了土壤根癌农杆菌的Vir E2基因,并融合至绿色荧光蛋白(EGFP)的N端,成功构建p PZP-Vir E2-N-EGFP植物表达载体。以茄科的本氏烟为对照,根癌农杆菌介导在辣椒和番... 为了明确根癌农杆菌介导的外源蛋白在茄科植物叶片细胞中能否瞬时表达,克隆了土壤根癌农杆菌的Vir E2基因,并融合至绿色荧光蛋白(EGFP)的N端,成功构建p PZP-Vir E2-N-EGFP植物表达载体。以茄科的本氏烟为对照,根癌农杆菌介导在辣椒和番茄叶片细胞中进行了表达分析。用共同聚焦显微镜可以在本氏烟和辣椒叶片细胞中观察到绿色荧光,而在番茄叶片细胞中未观察到。表明外源蛋白Vir E2-N-EGFP可以在辣椒叶片细胞瞬时表达。该研究结果为进一步研究辣椒中与植物病原互作基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 根癌农杆菌 vir E2-N-EGFP 茄科植物 表达
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羊口疮病毒SYBR Green I qPCR方法建立及VIR基因的遗传演化分析 被引量:1
17
作者 冯星 卢昌杨 +6 位作者 邓亚飞 吴佳颖 苑君君 贺绍君 辛洪雷 刘德义 张留君 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期772-779,共8页
目的为快速、高效、准确地检出羊口疮病毒(ORFV),并进一步明确皖北地区羊群ORFV流行毒株的遗传变异情况。方法本研究基于ORFV F1L基因建立SYBR Green I实时荧光定量PCR(qPCR)方法,对皖北地区羊场开展ORFV检测,并从阳性病料中PCR扩增ORF... 目的为快速、高效、准确地检出羊口疮病毒(ORFV),并进一步明确皖北地区羊群ORFV流行毒株的遗传变异情况。方法本研究基于ORFV F1L基因建立SYBR Green I实时荧光定量PCR(qPCR)方法,对皖北地区羊场开展ORFV检测,并从阳性病料中PCR扩增ORFV的完整VIR基因,直接测序后进行遗传演化分析。结果所建立ORFV SYBR Green I qPCR方法的线性关系良好,R 2=0.994;扩增效率高,E%=95.62%;检测速度快,理论反应时间约15 min;灵敏度较高,检测下限为10 copies/μL,是普通PCR法的100倍;重复性良好,组内和组间变异系数分别为0.44%~1.14%和2.82%~3.16%。用该qPCR方法对采集自皖北地区的168份羊临床样本进行检测,其ORFV阳性率为37.5%(63/168)。PCR扩增阳性样本中ORFV的完整VIR基因并直接测序,共获得52条全长VIR基因序列,其中21条来源于山羊,31条来源于绵羊。52条VIR基因间核苷酸序列及氨基酸序列的一致性分别为95.8%~100.0%和93.5%~100.0%,与参考毒株VIR基因核苷酸序列及氨基酸序列的一致性分别为95.1%~100.0%和91.3%~100.0%。基于ORFV VIR基因的遗传进化树分析显示,本次检测的21株山羊源ORFV毒株与8株国内外山羊源参考毒株和1株人源hChi17.2017参考毒株位于同一大分支,而本次检测的31株绵羊源ORFV毒株与7株国内外绵羊源参考毒株、1株人源hMbu15参考毒株及1株OV-V疫苗毒株位于遗传距离较远的另一大分支。结论建立了用于检测ORFV的高效、快捷、特异、灵敏、稳定的SYBR Green I qPCR方法。从临床样本中检测到的不同宿主来源ORFV的VIR基因间存在较大遗传差异。该研究结果可为ORFV的临床监测、检测、诊断及防控提供参考和指导。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 荧光定量PCR F1L基因 vir基因 遗传演化分析
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羊传染性脓疱病毒内蒙古分离株VIR基因的克隆与序列分析 被引量:1
18
作者 徐华敏 希尼尼根 申之义 《畜牧与饲料科学》 2012年第4期1-3,共3页
根据GenBank中已经发表的羊传染性脓疱病毒毒株StrainNZ2的VIR基因序列,设计合成1对引物。采用PCR技术对内蒙古分离株(OV/nm-05)的VIR基因进行特异性扩增,然后将其克隆到pEASY-T1载体中进行测序,得到该病毒的VIR基因序列。序列分析表明,... 根据GenBank中已经发表的羊传染性脓疱病毒毒株StrainNZ2的VIR基因序列,设计合成1对引物。采用PCR技术对内蒙古分离株(OV/nm-05)的VIR基因进行特异性扩增,然后将其克隆到pEASY-T1载体中进行测序,得到该病毒的VIR基因序列。序列分析表明,OV/nm-05株与1710/03株的同源性最高,达98.0%;与513/04株的同源性最低,为95.4%。说明羊传染性脓疱病毒内蒙古分离株VIR基因与其他参考毒株之间差异不大,这为进一步从分子生物学角度了解VIR基因的结构和功能奠定了基础。 展开更多
关键词 羊传染性脓疱病毒 vir基因 PCR 序列分析
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On properties of mass transfer in an Algol-type binary system:an example of VV Vir 被引量:1
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作者 Jia Zhang Sheng-Bang Qian Lin-Qiao Jiang 《Research in Astronomy and Astrophysics》 SCIE CAS CSCD 2014年第2期179-192,共14页
Some properties of mass transfer within a semi-detached binary system are discussed based on an example of VV Vir. The observations and analysis of VV Vir show that it is a semi-detached binary system with the less ma... Some properties of mass transfer within a semi-detached binary system are discussed based on an example of VV Vir. The observations and analysis of VV Vir show that it is a semi-detached binary system with the less massive cooler component filling its Roche lobe, which is also called an Algol-type binary system. Based on the parameters of this semi-detached binary, a theoretical study on the mass flow is carded out, including the trajectory of the mass flow, the position, radius and temperature of the impact spot caused by the mass flow, the inconsistent form of the mass flow and the possibly huge rate of energy transfer carried by the mass flow. Humps and distortions in light curves of VV Vir are deemed to be weak evidence for the theoretical results. 展开更多
关键词 BINARIES eclipsing -- stars individual (VV vir -- techniques photo-metric
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PS Vir:a short-period solar-like contact binary 被引量:1
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作者 Hui-Yu Yuan Hai-Feng Dai Yuan-Gui Yang 《Research in Astronomy and Astrophysics》 SCIE CAS CSCD 2018年第7期45-52,共8页
We present multi-color photometric observations and a one-dimensional spectrum, acquired from March 2016 to May 2017, for the short-period eclipsing binary PS Vir, by using the 2.16-m, 85-cm and 60-cm telescopes at Xi... We present multi-color photometric observations and a one-dimensional spectrum, acquired from March 2016 to May 2017, for the short-period eclipsing binary PS Vir, by using the 2.16-m, 85-cm and 60-cm telescopes at Xinglong station, which is administered by National Astronomical Observatories, Chinese Academy of Sciences. The spectral type was determined as G2V from the one-dimensional spectrum. The photometric solution was reduced from BVRc light curves. The results imply that PS Vir is a W-subtype contact binary with a mass ratio of q - 0.305(zk0.008) and a fill-out factor of f = 14.4(+1.8)%. The orbital period may be undergoing a cyclic oscillation with an ampli-tude of A = 0.0027(~0.0001)d and a modulated period of 11.7(4-0.2) yr, which may result from the light-time effect due to a third body. The lower limit on mass for the assumed component is 0.12 Me. Moreover, the more massive component of PS Vir may be a bit more evolved star as determined from the mass-luminosity diagram. 展开更多
关键词 BINARIES close-binaries eclipsing-stars individual(PS vir)-stars
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