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决策树特征基因选择方法对SVM有效性的研究 被引量:15
1
作者 李霞 张田文 +1 位作者 李丽 郭政 《中国生物医学工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第1期66-72,共7页
基因芯片新兴生物技术为从分子水平上研究疾病的发病机理和临床疾病诊断提供了强有力的手段。其中特征基因选择是疾病模式识别诊断最重要的一个环节 ,但不同的特征基因选择方法往往影响疾病模式分类方法的效能。本研究针对这一问题 ,结... 基因芯片新兴生物技术为从分子水平上研究疾病的发病机理和临床疾病诊断提供了强有力的手段。其中特征基因选择是疾病模式识别诊断最重要的一个环节 ,但不同的特征基因选择方法往往影响疾病模式分类方法的效能。本研究针对这一问题 ,结合结肠癌基因表达谱数据分析 ,研究了递归决策树特征基因选择集成方法EFST ,对支持向量机 (SVM )模式分类器能力的影响。主要从特征基因选择前后分类器的性能、支持向量的吻合度、错分样本标识的吻合度、对样本均匀翻倍模式分类器的稳定性的影响等四个方面研究EFST特征选择算法对支持向量机模式分类方法的影响 ,同时考察了支持向量机模式分类器的泛化能力。结果表明 :基于决策树特征基因选择算法EFST明显地提高了支持向量机模式分类的效能 ,且支持向量机模式分类器具有很强的泛化能力。 展开更多
关键词 特征基因 支持向量机 模式分类 支持向量
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植物病毒病媒介昆虫的传毒特性和机制研究进展 被引量:23
2
作者 史晓斌 谢文 张友军 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期841-848,共8页
植物病毒病是农作物的"癌症",至今缺少有效的防治方法。目前已知80%的植物病毒病依赖于媒介昆虫传播,而媒介昆虫对植物病毒的传播是一个昆虫、病毒、寄主植物互作的过程,历经获毒、持毒和传毒等多个阶段,昆虫体内一系列病毒... 植物病毒病是农作物的"癌症",至今缺少有效的防治方法。目前已知80%的植物病毒病依赖于媒介昆虫传播,而媒介昆虫对植物病毒的传播是一个昆虫、病毒、寄主植物互作的过程,历经获毒、持毒和传毒等多个阶段,昆虫体内一系列病毒受体或蛋白参与了这个过程。昆虫传播病毒的方式有口针携带式、前肠保留式和体内循环式3类,它们各自对应的持久性为非持久性、半持久性和持久性,不同昆虫获取这3类病毒的获毒时间、在体内存留位置和传毒时间也各不相同。这个过程受到媒介昆虫的性别及龄期、寄主植物、环境条件、昆虫体内共生菌等多种因素的影响。与之相关的蛋白主要有病毒衣壳蛋白(CP)、次要衣壳蛋白(CPm)、GroEL蛋白、辅助因子(HC)和下颚口针蛋白等。近年来对植物病毒基因组的研究也取得了很大的进展,对昆虫传毒机制的研究正受到越来越广泛的关注。本文综述了近年来该领域内的相关研究进展,包括昆虫传播植物病毒的传毒方式、影响传毒效率的因素、传毒机制特别是昆虫体内与病毒传播可能相关的受体等。 展开更多
关键词 植物病毒 媒介昆虫 传毒 病毒受体 分子生物学 共生菌
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Bemisia tabaci Phylogenetic Groups in India and the Relative Transmission Efficacy of Tomato leaf curl Bangalore virus by an Indigenous and an Exotic Population 被引量:8
3
作者 R V Chowda-Reddy M Kirankumar +4 位作者 Susan E Seal V Muniyappa Girish B Valand M R Govindappa John Colvin 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2012年第2期235-248,共14页
Bemisia tabaci adults from various host-plant species were collected from 31 regions across India.266 B.tabaci samples were first screened by RAPD-PCR to examine molecular variability and to select individuals with di... Bemisia tabaci adults from various host-plant species were collected from 31 regions across India.266 B.tabaci samples were first screened by RAPD-PCR to examine molecular variability and to select individuals with different fingerprints.Host-plant and region of collection were then used to select 25 individuals for PCR amplification and sequencing of their partial mitochondrial cytochrome oxidase subunit one(mtCOI)genes.Pairwise comparisons with mtCOI consensus sequences showed that the majority of these samples had 〈3.5% sequence divergence from groups currently termed Asia I,Asia II-5,Asia II-7,and Asia II-8.The biotype-B B.tabaci from India clustered into the Middle East-Asia Minor 1 group.A new group of B.tabaci from Coimbatore,collected from pumpkin,was related most closely to the Asia I group(6.2% sequence divergence from the consensus Asia I sequence).To increase our understanding of the epidemiology of tomato leaf curl disease(ToLCD)and the key B.tabaci genetic groups involved in virus spread,the indigenous Asia I and the exotic biotype-B population from South India were used to carry out transmission experiments using Tomato leaf curl Bangalore virus(ToLCBV).The acquisition access periods(AAP),inoculation access periods(IAP),latent periods(LP),and ToLCBV transmission efficiencies of the two populations were compared and the biotype-B had the more efficient transmission characteristics.These results are discussed in relation to recent changes in the epidemiology of tomato leaf curl disease in South India. 展开更多
关键词 BEGOMOVIRUSES mitochondrial cytochrome oxidase WHITEFLY Bemisia tabaci virus-vector relationships epidemiology
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半持久性病毒的介体传播机制研究进展 被引量:2
4
作者 田晓 李玲娣 刘金香 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期48-53,共6页
大多数植物病毒依靠昆虫进行传播,半翅目昆虫是最常见的传播介体。昆虫的传毒特性一般分为非持久性、半持久性和持久性传播。介体与其所传播病毒的相互作用机制复杂,主要为外壳机制和辅助机制。目前发现的半持久性病毒主要属于长线形病... 大多数植物病毒依靠昆虫进行传播,半翅目昆虫是最常见的传播介体。昆虫的传毒特性一般分为非持久性、半持久性和持久性传播。介体与其所传播病毒的相互作用机制复杂,主要为外壳机制和辅助机制。目前发现的半持久性病毒主要属于长线形病毒科(Closteroviridae)、花椰菜花叶病毒科(Caulimoviridae)、曲线病毒科(Flexiviridae)和伴生病毒科(Sequiviridae)等。近年来昆虫传毒机制尤其是半持久性病毒的传播机制的研究受到越来越广泛的关注,就该领域的研究进展作一概述。 展开更多
关键词 半持久性病毒 介体传播 外壳机制 辅助机制
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负链RNA病毒的反向遗传技术 被引量:5
5
作者 曾江勇 郭建宏 刘在新 《动物医学进展》 CSCD 2006年第9期35-39,共5页
反向遗传技术是一种新的分子生物学技术,它在深入研究负链RNA病毒基因组结构和功能,探寻其基因组复制、转录和研发新型基因工程疫苗上发挥着重要的作用。文章介绍了分节与不分节负链RNA病毒的复制机理和特征,论述了反向遗传学在研究这... 反向遗传技术是一种新的分子生物学技术,它在深入研究负链RNA病毒基因组结构和功能,探寻其基因组复制、转录和研发新型基因工程疫苗上发挥着重要的作用。文章介绍了分节与不分节负链RNA病毒的复制机理和特征,论述了反向遗传学在研究这些病毒上的策略、最新研究进展及其主要影响拯救效率的因素,进一步涉及了负链RNA病毒载体及其重组病毒的研究动态。因此,通过反向遗传学,人们将更加了解负链RNA病毒,为科学利用和有效控制该病毒奠定基础。 展开更多
关键词 反向遗传学 负链RNA病毒 病毒载体
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真菌传播植物病毒的证据(综述) 被引量:3
6
作者 陈剑平 阮义理 《浙江农业学报》 CSCD 1991年第4期202-205,共4页
(一)概述已知的传毒真菌都是一些植物根部专性寄生的游动孢子真菌;它们是壶菌目(Chytridiales)的油壶菌属(Olpidium)和集壶菌属(Synchytrium)以及根肿菌目(Plasmodiophorales)的多粘菌属(Pplymyxa)和粉痂菌属(Spongospora)。壶菌目游动... (一)概述已知的传毒真菌都是一些植物根部专性寄生的游动孢子真菌;它们是壶菌目(Chytridiales)的油壶菌属(Olpidium)和集壶菌属(Synchytrium)以及根肿菌目(Plasmodiophorales)的多粘菌属(Pplymyxa)和粉痂菌属(Spongospora)。壶菌目游动孢子仅具1根鞭毛,在寄主植物根中所形成的休眠孢子是单个的,而根肿菌目游动孢子具有2根鞭毛,并形成休眠孢子堆。两类真菌介体生活史的详细情况,特别是所谓的核融合(Karyogamy)尚不能肯定,但其总的发育过程是相似的;即在寄主根部形成单个或成堆的厚壁休眠孢子,当根腐烂后,休眠孢子(堆) 展开更多
关键词 真菌 植物病毒 传播 证据 真菌介体
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基于Win32 API和SVM的未知病毒检测方法 被引量:4
7
作者 王晓燕 金聪 谈华永 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2011年第7期125-127,134,共4页
提出了一种Windows平台下检测未知病毒的新方法,该方法通过分析PE文件调用的Win32 API序列,用SVM来对划分后k长度的API短序列分类,并通过分析API函数及参数危险程度来提高SVM分类的精确度,从而实现对未知病毒的检测。实验结果表明,该方... 提出了一种Windows平台下检测未知病毒的新方法,该方法通过分析PE文件调用的Win32 API序列,用SVM来对划分后k长度的API短序列分类,并通过分析API函数及参数危险程度来提高SVM分类的精确度,从而实现对未知病毒的检测。实验结果表明,该方法实现的病毒检测系统比只用SVM的系统具有更好的检测效果。 展开更多
关键词 未知病毒 WIN32 API序列 支持向量机
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施马伦贝格病毒 被引量:1
8
作者 朱来华 郑小龙 +8 位作者 王群 肖西志 邓明俊 魏乃林 于红光 辛学谦 孙涛 赵玉然 王宫璞 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第1期175-179,共5页
施马伦贝格病毒病(Schmallenberg virus,SBV)是一种新发现的动物传染病,因于2011年底在德国施马伦贝格镇首次发现而临时得名,随后蔓延于西欧(包括比利时、法国、德国、荷兰、意大利、卢森堡、西班牙、英国和丹麦),并分别在奥地利、波兰... 施马伦贝格病毒病(Schmallenberg virus,SBV)是一种新发现的动物传染病,因于2011年底在德国施马伦贝格镇首次发现而临时得名,随后蔓延于西欧(包括比利时、法国、德国、荷兰、意大利、卢森堡、西班牙、英国和丹麦),并分别在奥地利、波兰、瑞典和芬兰等国的牛、山羊、绵羊中检测到抗体。遗传分析显示该病毒与布尼亚病毒科(Bunyaviridae)正布尼亚病毒属(Orthobunyavirus)西姆布血清群病毒(Simbu serogroup viruses)的亲缘关系最密切,西姆布血清群病毒是已知的反刍动物病原,可通过节肢动物媒介(蚊、蠓)传播。施马伦贝格病毒病有2种不同的临床症状:成年牛出现短暂轻微/温和的病症(产奶量减少、发热、腹泻)和新生哺乳动物(牛、羊)死产和先天缺陷。因为同群类似的病毒不是人畜共患病病原,也无该病毒致人发病的证据,但现阶段尚不能完全排除。尽管目前没有特效的药物和疫苗,但因已有类似病毒(赤羽病)的疫苗,疫苗接种应是控制该病的可能选项。因施马伦贝格病毒是一种新发现的病毒,许多方面尚不清楚,还有待于进一步研究。 展开更多
关键词 施马伦贝格病毒 正布尼亚病毒属西姆布血清群病毒 反刍动物 节肢动物媒介
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靶向型辅助腺病毒的构建及其功能研究 被引量:1
9
作者 杨月峰 李泽良 +5 位作者 鲁茁壮 王华 肖凤君 张群伟 孙慧燕 王立生 《中国医药生物技术》 2014年第1期6-12,共7页
目的构建一种新型辅助腺病毒,并用于靶向型第三代腺病毒载体的制备,提高其对造血细胞的感染效率。方法采用重叠PCR的方法合成含有不完全包装信号序列A1-A4和loxP序列的DNA片段SynES,替换穿梭质粒pShuttle中原有的包装信号序列,得到穿梭... 目的构建一种新型辅助腺病毒,并用于靶向型第三代腺病毒载体的制备,提高其对造血细胞的感染效率。方法采用重叠PCR的方法合成含有不完全包装信号序列A1-A4和loxP序列的DNA片段SynES,替换穿梭质粒pShuttle中原有的包装信号序列,得到穿梭质粒pShuttle-SynES;将所得穿梭质粒与骨架质粒Ad5/F11p在大肠杆菌BJ5183中同源重组,获得重组腺病毒质粒载体pAd5/F11p-HV,将其转染293细胞包装重组腺病毒Ad5/F11p-HV。参照第三代腺病毒包装策略,利用Ad5/F11p-HV包装获得携带绿色荧光蛋白(GFP)基因的第三代腺病毒HD-Ad5/F11p-GFP;将其以不同的感染强度感染人白血病细胞系K562、U937、Jurkat和人脐带血CD34+细胞后,采用荧光显微镜和流式细胞术检测GFP的表达。结果采用DAN片段SynES替换穿梭质粒pShuttle上的包装信号,获得新的穿梭质粒pShuttle-SynES;进一步构建获得重组腺病毒质粒pAd5/F11p-HV,并制备了辅助腺病毒Ad5/F11p-HV。采用该辅助腺病毒包装pC4HSU-GFP,获得了第三代腺病毒HD-Ad5/F11p-GFP;CsCl密度梯度离心分离HD-Ad5/F11p-GFP和Ad5/F11p-HV,获得了高质量的HD-Ad5/F11p-GFP。与对照病毒HD-H14-GFP相比,HD-Ad5/F11p-GFP可明显提高对人白血病细胞U937、Jurkat和人脐带来源CD34+细胞的感染效率。结论设计并构建了一种靶向性辅助腺病毒,并以此为基础成功制备了对造血细胞高效感染的第三代重组腺病毒。 展开更多
关键词 辅助病毒 白血病 第三代腺病毒载体
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携带人β干扰素基因的人乙型肝炎特异性真核表达载体的构建 被引量:9
10
作者 潘欣 柯重伟 +5 位作者 潘卫 武文斌 张斌 贺祥 曹广文 戚中田 《世界华人消化杂志》 CAS 2000年第5期520-523,共4页
目的构建乙型肝炎病毒(HBV)C 区启动子调控的人β干扰素(IFN-β)基因的真核表达载体.方法切除真核表达载体 pcDNA3.1(+)-DT_(390)-VEG_(exon7)内部的 CMV 启动子及 DT_(390)序列使之成为 p3.1V_7;从逆转录病毒载体 pMNSM-IFN-β质粒中... 目的构建乙型肝炎病毒(HBV)C 区启动子调控的人β干扰素(IFN-β)基因的真核表达载体.方法切除真核表达载体 pcDNA3.1(+)-DT_(390)-VEG_(exon7)内部的 CMV 启动子及 DT_(390)序列使之成为 p3.1V_7;从逆转录病毒载体 pMNSM-IFN-β质粒中游离人β干扰素基因;用 PCR 方法从 pGEM.7Z-HBV 质粒中扩增人乙型肝炎病毒(HBV)的 C区启动子序列;通过转换酶切位点,将 HBV C 区启动子和人β干扰素基因共同插入到 p3.1V_7中,构建成受 HBV C 区启动子控制的人β干扰素基因真核表达载体 p3.1 V_7-HBV.CP-IFN-β.结果构建完成携带人β干扰素基因的人乙型肝炎特异性真核表达载体.结论该载体为慢性病毒性肝炎的特异性干扰素基因治疗奠定了基础. 展开更多
关键词 IFN-β基因 乙型肝炎病毒 真核表达载体 治疗
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建立转录丙型肝炎病毒结构区基因细胞模型的研究 被引量:2
11
作者 陈前 窦骏 《东南大学学报(医学版)》 CAS 2004年第1期31-33,共3页
目的 :建立转录丙型肝炎病毒 (HCV)结构区基因的细胞模型 ,为研究中药在体外对HCV结构区基因转录的抑制作用提供实验用细胞模型。方法 :用脂质体将已构建好的含HCV结构区基因 1.73kb的真核细胞表达载体pBK CMV转入人HeLa细胞 ,用G418选... 目的 :建立转录丙型肝炎病毒 (HCV)结构区基因的细胞模型 ,为研究中药在体外对HCV结构区基因转录的抑制作用提供实验用细胞模型。方法 :用脂质体将已构建好的含HCV结构区基因 1.73kb的真核细胞表达载体pBK CMV转入人HeLa细胞 ,用G418选择性培养基筛选出成功转染的HeLa细胞 (HeLaD细胞 ) ,用Trizol提取HeLaD细胞的总RNA ,通过特异性引物进行逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR) ,从mRNA水平来验证HeLaD细胞中HCV结构区基因的有效转录。结果 :对从HeLaD细胞抽提的总RNA作RT PCR ,得到 14 4bp的特异的扩增片段 ,证实HCV结构区基因在HeLaD细胞中有转录水平的表达。结论 :重组质粒pBK CMV能被成功地转染人HeLa细胞 ,且HCV的结构区基因能够有效地表达 ,成功建立了能转录HCV结构区基因的细胞模型 HeLaD。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 基因细胞 细胞模型 HCV 遗传学 HELA细胞
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HCVC基因腺病毒表达载体骨架质粒pAd.HCV-C的构建、鉴定及表达 被引量:15
12
作者 郝春秋 周永兴 +3 位作者 冯志华 李谨革 贾战生 王平忠 《世界华人消化杂志》 CAS 2001年第6期635-639,共5页
目的构建能表达HVC基因的腺病毒表达载体的重组骨架质粒,为进一步包装能高效表达HCVC基因的腺病毒载体做准备。方法用分别含有BgⅡ及HindⅢ酶切位点的HCVC区基因上、下游引物,以含有HCV H株基因序列的质粒pBRTM/HCV1-3011为模板,通过PC... 目的构建能表达HVC基因的腺病毒表达载体的重组骨架质粒,为进一步包装能高效表达HCVC基因的腺病毒载体做准备。方法用分别含有BgⅡ及HindⅢ酶切位点的HCVC区基因上、下游引物,以含有HCV H株基因序列的质粒pBRTM/HCV1-3011为模板,通过PCR扩增获得HCVC区基因片段,基因片段回收后,以BglⅡ及HindⅢ双酶切,定向插入到腺病毒骨架质粒pAd,CMV-Link.1中CMV启动子下游BglⅡ与HindⅢ位点之间,获得重组表达质粒pAd.HCV-C通过BglⅡ/HindⅢ双酶切、PCR及插入片段序列测定对质粒进行了鉴定,以抗HCVC单克隆抗体为一抗,利用间接免疫荧光法检测了pAd.HCV-C在人肝癌细胞7721中的瞬时表达。结果酶切、PCR及测序鉴定证实,pAd,HCV-C插入片段为HCVC区基因片段,免疫荧光法检测表明其可以在7721细胞中瞬时表达。结论构建的质粒pAd.HCV-C可以在7721细胞中瞬时表达HCVC区基因,为包装表达HCVC基因的腺病毒载体奠定了基础。 展开更多
关键词 C型肝炎样病毒属 遗传学 病毒基因 腺病毒科 遗传载体
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腺病毒介导慢病毒载体的细胞转染
13
作者 黄晓武 张明 汤钊猷 《复旦学报(医学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第6期611-614,628,共5页
目的 尝试利用腺病毒介导慢病毒载体的细胞感染以提高转染效率。方法 以多聚赖氨酸粘合腺病毒和慢病毒载体形成复合体后感染Hela细胞 ,测定慢病毒载体目的基因表达的变化并用激光共聚焦扫描显微镜观察慢病毒载体的细胞摄入情况 ,进一... 目的 尝试利用腺病毒介导慢病毒载体的细胞感染以提高转染效率。方法 以多聚赖氨酸粘合腺病毒和慢病毒载体形成复合体后感染Hela细胞 ,测定慢病毒载体目的基因表达的变化并用激光共聚焦扫描显微镜观察慢病毒载体的细胞摄入情况 ,进一步了解抗腺病毒衣壳球部的抗体能否干扰这种变化以证明腺病毒是否参与此介导作用。结果 携带大肠埃希菌半乳糖苷酶 (β galactosidase ,β gal)基因的慢病毒载体Lenti-VSVG对Hela细胞的感染率非常低 ,通过多聚赖氨酸与腺病毒 (AdenoPL)形成复合体后感染率显著上升并呈剂量依赖性。激光共聚焦扫描显微镜显示Lenti-VSVG被细胞摄取的数量在和腺病毒粘合后显著增加。抗腺病毒衣壳球部抗体能抑制直至阻断Lenti-VSVG/AdenoPL复合体两者各自携带基因 (分别是β gal和荧光素酶 /绿色荧光蛋白融合蛋白 )的表达。结论 通过多聚赖氨酸的物理连接 。 展开更多
关键词 慢病毒载体 腺病毒介导 多聚赖氨酸 球部 转染效率 复合体 携带 目的基因 细胞 绿色荧光蛋白
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丙型肝炎病毒 HCV E1区基因的真核表达载体构建及序列分析 被引量:2
14
作者 高建恩 蒋栋 +3 位作者 陶其敏 纪和平 季颖 冯百芳 《北京医科大学学报》 CSCD 1999年第2期113-116,共4页
建立丙型肝炎病毒包膜区基因的真核表达载体,并通过对其序列分析阐明其作为基因接种的可能性。方法:经常规RT-PCR法从HCV RNA阳性病人的血清中扩增出HCV E1区的基因片段,经EcoRⅠ和XbaⅠ双酶发后将其克隆... 建立丙型肝炎病毒包膜区基因的真核表达载体,并通过对其序列分析阐明其作为基因接种的可能性。方法:经常规RT-PCR法从HCV RNA阳性病人的血清中扩增出HCV E1区的基因片段,经EcoRⅠ和XbaⅠ双酶发后将其克隆到真核表达载体PcDNA3中,阳性克隆经SmaⅠ和XbaⅠ双酶切鉴定以脱氧终止法测序,同时利用计算机软件对其推定的氨基酸序列进行分析。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 基因表达 遗传载体 序列分析
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HCV E2和HBV preS融合蛋白真核表达载体的构建及在哺乳动物细胞中的表达 被引量:1
15
作者 谢尧 陶其敏 《北京医科大学学报》 CSCD 1999年第1期38-40,共3页
目的:构建丙型肝炎病毒(HCV)E2和乙型肝炎病毒(HBV)preS融合蛋白的真核表达载体。方法:用PCR方法扩增HBVpreS和HCVE2蛋白基因,并将二者克隆到真核表达载体pcDNA3中,用脂质体转染试剂将其转入... 目的:构建丙型肝炎病毒(HCV)E2和乙型肝炎病毒(HBV)preS融合蛋白的真核表达载体。方法:用PCR方法扩增HBVpreS和HCVE2蛋白基因,并将二者克隆到真核表达载体pcDNA3中,用脂质体转染试剂将其转入COS7细胞,通过免疫荧光检测细胞瞬时表达的融合蛋白。结果:E2preS融合蛋白基因包括了全长的HBVpreS和HCVE2蛋白基因,嵌合基因长度约1.6kb。表达载体在COS7细胞表达出了E2preS融合蛋白。结论:构建的E2preS融合蛋白表达载体能在哺乳动物细胞中表达融合蛋白。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 乙型肝炎病毒 融合蛋白 载体表达
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腺相关病毒载体优化的研究进展 被引量:3
16
作者 翟贯星(综述) 傅卫辉 +1 位作者 徐建青 张晓燕(审校) 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期827-833,共7页
腺相关病毒(adeno-associated viruses,AAV)是用于基因传递与表达的常用载体,具有安全性好、免疫原性低、表达稳定等优点,在基因治疗中逐步得到应用。但是AAV载体在基因治疗中仍面临着转导效率低、载体容量小、靶向性弱以及宿主的免疫... 腺相关病毒(adeno-associated viruses,AAV)是用于基因传递与表达的常用载体,具有安全性好、免疫原性低、表达稳定等优点,在基因治疗中逐步得到应用。但是AAV载体在基因治疗中仍面临着转导效率低、载体容量小、靶向性弱以及宿主的免疫反应等限制,影响了AAV载体的广泛应用。因此,AAV载体技术的优化研究在持续推进,优化策略能够提高AAV转导效率,降低机体免疫反应,调高靶向性,扩展载体容量,优化调控。本文对相关研究进展进行综述,为AAV载体在临床应用提供一定的参考。 展开更多
关键词 腺相关病毒(AAV) 载体优化 改造技术 安全隐患
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基于慢病毒载体系统构建重组JSRV-NM假病毒 被引量:1
17
作者 龚淑敏 李光明 +4 位作者 吴志敏 董莉真 程彬 张斌 朱泽 《天津医药》 CAS 北大核心 2014年第8期749-751,共3页
目的采用慢病毒质粒结构重组JSRV-NM假病毒,克服JSRV-NM病毒只能通过绵羊支气管穿刺接种扩增,不能通过体外细胞培养扩增的问题。方法采用慢病毒高效包装系统pMD.G、pCMV-HIV△8.2和pHIV-eGFP,以JSRV-NM病毒的env包膜质粒pCMVJSRV-NM替代... 目的采用慢病毒质粒结构重组JSRV-NM假病毒,克服JSRV-NM病毒只能通过绵羊支气管穿刺接种扩增,不能通过体外细胞培养扩增的问题。方法采用慢病毒高效包装系统pMD.G、pCMV-HIV△8.2和pHIV-eGFP,以JSRV-NM病毒的env包膜质粒pCMVJSRV-NM替代VSV-G病毒的包膜质粒pMD.G,转染293T细胞,复制、包装并产出重组的JSRV-NM假病毒。用real-time PCR检测WPRE表达来测定假病毒的滴度,用接种24孔板的293T细胞检测假病毒感染力。结果成功重组了基于慢病毒质粒结构的JSRV-NM假病毒,可超速离心浓缩成高滴度(1×108TU/mL)的病毒,Lv-JSRV-NM包膜与Lv-VSV-G包膜按感染复数(MOI)=3的比例感染Hela细胞具有相同的感染能力。结论基于慢病毒质粒构建的JSRV-NM假病毒,能够在293T细胞中复制和扩增,产出的假病毒具有稳定性、感染力和安全性,符合二级生物实验室安全的要求。 展开更多
关键词 JSRV-NM病毒 假病毒 慢病毒载体 ENV基因 病毒包装
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第三代腺病毒载体的改良与应用 被引量:4
18
作者 陈琳 薛绪潮 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期722-725,共4页
腺病毒载体是一种非常有效的转基因载体,具有高效率、低致病性、高滴度及不整合入宿主细胞染色体等优点,广泛应用于基因治疗。第一、二代腺病毒载体仍有许多不足之处,在其基础上发展了第三代腺病毒载体。第三代腺病毒载体与前者相比,具... 腺病毒载体是一种非常有效的转基因载体,具有高效率、低致病性、高滴度及不整合入宿主细胞染色体等优点,广泛应用于基因治疗。第一、二代腺病毒载体仍有许多不足之处,在其基础上发展了第三代腺病毒载体。第三代腺病毒载体与前者相比,具有低免疫原性及高容量等优点,在基因治疗中表现出独特优势。然而,由于辅助病毒污染的存在及病毒产量有待提高,第三代腺病毒载体的临床应用仍面临一定困难。 展开更多
关键词 第三代腺病毒 遗传载体 辅助病毒
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丙型肝炎病毒结构蛋白真核表达载体的构建及其在哺乳动物细胞中的表达 被引量:2
19
作者 马文彬 冯百芳 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期73-75,共3页
目的 :构建丙型肝炎病毒 (HCV)结构蛋白的真核表达载体。方法 :用RT PCR方法扩增HCV结构基因 ,并将其克隆入真核表达载体pcDNA3中 ,用磷酸钙转染法将其转入Sp2 / 0细胞 ,用免疫组化法检测细胞中瞬时表达的目的蛋白。结果 :克隆的基因片... 目的 :构建丙型肝炎病毒 (HCV)结构蛋白的真核表达载体。方法 :用RT PCR方法扩增HCV结构基因 ,并将其克隆入真核表达载体pcDNA3中 ,用磷酸钙转染法将其转入Sp2 / 0细胞 ,用免疫组化法检测细胞中瞬时表达的目的蛋白。结果 :克隆的基因片段全长约 1.9kb ,包括C及E2的全长和E1的部分。免疫组化显示表达蛋白位于细胞浆中。结论 :构建的丙型肝炎病毒结构蛋白的真核表达载体能够在哺乳动物细胞中得到表达 。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 结构蛋白 真核表达载体 构建 哺乳动物 表达
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基于主动学习的计算机病毒检测方法研究 被引量:6
20
作者 张勇 张卫民 欧庆于 《计算机与数字工程》 2011年第11期89-93,105,共6页
针对传统病毒检测方法存在的更新速度慢、对未知病毒检测能力不足等问题,该文对主动学习理论在计算机病毒检测方面的应用进行了研究,提出了一种基于支持向量机主动学习的计算机病毒检测模型结构。此外,为了改进病毒检测的精度问题及主... 针对传统病毒检测方法存在的更新速度慢、对未知病毒检测能力不足等问题,该文对主动学习理论在计算机病毒检测方面的应用进行了研究,提出了一种基于支持向量机主动学习的计算机病毒检测模型结构。此外,为了改进病毒检测的精度问题及主动学习过程的效率,利用相关n-gram方法实现了对样本文件的特征提取,并结合信任度测量理论实现了基于非确定抽样的询问功能。实验表明,该模型针对未知病毒具有较高的检测精度,并且能够极大地缩减训练时间及对训练数据的数量要求,提高系统的学习效率。 展开更多
关键词 病毒检测 主动学习 支持向量机 非确定性抽样
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