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脯氨酸的构象及性质 被引量:13
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作者 王朝杰 李永 +1 位作者 杨新宇 林丽 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第3期305-310,共6页
用X3LYP法在6-311++G(d,p)和6-311++G(3df,3pd)基组水平上对脯氨酸15种构象的几何结构、相对能量、电子结构、红外光谱、偶极矩、极化率等性质进行了研究,并与PBE1PBE/6-311++G(d,p)的结果和文献相比较,从而得到:(1)的脯氨酸的15种构象... 用X3LYP法在6-311++G(d,p)和6-311++G(3df,3pd)基组水平上对脯氨酸15种构象的几何结构、相对能量、电子结构、红外光谱、偶极矩、极化率等性质进行了研究,并与PBE1PBE/6-311++G(d,p)的结果和文献相比较,从而得到:(1)的脯氨酸的15种构象中能量最低的有4种,不同构象中存在着强弱不同的5种氢键,其中以N…H—O氢键最强,并存在特殊的C—H…O=C氢键.两种方法计算的几何结构数据相近,均与实验值吻合;(2)在构象相对能差计算方面,X3LYP具有明显的优势,用中等基组就可以得到与高水平从头算法和大基组相同的结果,而PBE1PBE法计算的相对能值则相差较大;(3)脯氨酸不同构象中偶极矩最大和极化率最小的是最稳定的构象1和2,两种方法计算的结果一致. 展开更多
关键词 脯氨酸 x3lyp 构象 偶极矩 转动系数
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脯氨酸与Ag和Ag^+相互作用及性质 被引量:3
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作者 王朝杰 蔡跃飘 +1 位作者 黄旭慧 卫涛 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第2期352-362,共11页
用X3LYP杂化密度泛函方法在LACV3P**++基组水平上对脯氨酸(Pro)的15种构象与Ag原子和Ag离子形成多种配合物的几何结构、电子结构、振转光谱和能量学特征进行了计算研究,结果得到17种Pro-Ag和23种Pro-Ag+稳定结构.数据分析表明:(1)Pro-A... 用X3LYP杂化密度泛函方法在LACV3P**++基组水平上对脯氨酸(Pro)的15种构象与Ag原子和Ag离子形成多种配合物的几何结构、电子结构、振转光谱和能量学特征进行了计算研究,结果得到17种Pro-Ag和23种Pro-Ag+稳定结构.数据分析表明:(1)Pro-Ag配合物中仅有Pro的9种构象出现,而Pro-Ag+配合物中则都涉及,最稳定结构并不是能量最低的Pro构象与Ag或Ag+生成;(2)Pro与4d105s1组态的Ag结合主要是范德华作用力,对Pro结构影响很小,配合物中存在较弱的特殊O―H…Ag氢键.外层5s5p全空的Ag+与配位原子间生成σ配位键.前者以单配位最稳定,后者以双配位最稳定;(3)Ag原子与Pro配位结合能小于-19 kJ·mol-1,而Ag+与Pro的结合能在-117--255 kJ·mol-1范围,形成热力学稳定体系Pro-Ag+;(4)自然键轨道(NBO)布局分析显示Pro-Ag和Pro-Ag+体系中Ag都获得少量负电荷,配合物的前线轨道能量差(Δε)均比两个碎片的低.配合物中O―H和N―H键的红移和蓝移都存在. 展开更多
关键词 x3lyp 脯氨酸 银原子 银离子 配合物
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脯氨酸与Zn^(2+/1+/0)相互作用及性质 被引量:1
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作者 孙晓玲 金芩 +2 位作者 王燕妮 蔡跃飘 王朝杰 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1071-1085,共15页
运用M062X和X3LYP两种密度泛函理论(DFT)方法在TZVP和6-311++G(2d,p)+LANL2DZ基组水平上,对已报道的15种脯氨酸(Pro)构象分别与Zn2+、Zn+及Zn进行不同方式配位体系的几何结构、能量学特征、振动光谱和电子结构性质进行了计算研究.Pro-Z... 运用M062X和X3LYP两种密度泛函理论(DFT)方法在TZVP和6-311++G(2d,p)+LANL2DZ基组水平上,对已报道的15种脯氨酸(Pro)构象分别与Zn2+、Zn+及Zn进行不同方式配位体系的几何结构、能量学特征、振动光谱和电子结构性质进行了计算研究.Pro-Zn2+、Pro-Zn+和Pro-Zn三种体系分别得到19、21和24种稳定结构.Pro-Zn2+体系中Zn2+与Pro两性离子的氧端(OO)配位形成的四元环结构能量最低,其次是与Pro羧羰基氧和亚氨基氮配位形成的五元环结构,而Pro-Zn+体系与之相反.Pro-Zn2+/1+/0体系的相对能差逐渐降低,结合能分别位于-620--936,-139--325和-1.5--22 kJ·mol-1范围,配位Pro的变形能随价态降低而减小.ProZn2+体系受方法和基组影响较大,离子体系中Zn均获得少量负电荷,所有配位化合物的前线轨道能差均比相应两个碎片要低. 展开更多
关键词 脯氨酸 M062X x3lyp Zn原子 Zn离子
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R—ReO_3的构型和电子结构的密度泛函研究 被引量:1
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作者 何旭敏 杨佩勰 +2 位作者 陈浙宁 傅钢 徐昕 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第11期2267-2272,共6页
在X3LYP/6-311+G(2d,p)的水平下系统地研究了一系列高价有机铼氧化物(R—ReO3.Ln)的几何构型和电子结构.研究结果表明,用X3LYP方法预测的几何结构与实验值符合得很好,键长的误差一般小于0.001 nm,而键角的误差小于1°.同时发现不同... 在X3LYP/6-311+G(2d,p)的水平下系统地研究了一系列高价有机铼氧化物(R—ReO3.Ln)的几何构型和电子结构.研究结果表明,用X3LYP方法预测的几何结构与实验值符合得很好,键长的误差一般小于0.001 nm,而键角的误差小于1°.同时发现不同配位类型的R基和L配体显著影响铼氧化合物的酸性以及Re—O键能.应用NBO分析和前线轨道理论可以合理地阐明配体调变的实质. 展开更多
关键词 有机铼氧化合物 CH3ReO3 x3lyp方法
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一些密度泛函方法预测电子亲和势 被引量:3
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作者 丁秀丽 吴剑鸣 徐昕 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第2期396-398,共3页
In this paper,we examined the performance of 12 density functionals(B3LYP,X3LYP,O3LYP,PBE0,B3PW91,BLYP,OLYP,OPBE,PBE,BPW91,VSXC and TPSS),combined with two basis sets[DZP++ and 6-311+G(3df,2p)] in the prediction of th... In this paper,we examined the performance of 12 density functionals(B3LYP,X3LYP,O3LYP,PBE0,B3PW91,BLYP,OLYP,OPBE,PBE,BPW91,VSXC and TPSS),combined with two basis sets[DZP++ and 6-311+G(3df,2p)] in the prediction of the adiabatic electron affinities against a set of 91 well-established experimental values.We have reached a conclusion that all these modern functionals are ge-nerally good,giving a mean absolute deviation(MAD)less than 0.24 eV.B3LYP and X3LYP are among the most reliable methods for this test set.When the DZP++ basis set is adopted,X3LYP is the best with a MAD of 0.14 eV,while B3LYP leads to a MAD of 0.16 eV.When the basis set is extended to 6-311+G(3df,2p),B3LYP improves its MAD to 0.13 eV,while the MAD of X3LYP remains to be 0.14 eV.Most hybrid functionals outperform the corresponding GGA functinals,with the exception of PBE0.The meta-GGA functionals(VSXC and TPSS)are not necessarily better than the GGA functionals.Our calculations also reveal that there are flaws associated with the OPTX exchange functional in the calculations of EA. 展开更多
关键词 密度泛函理论 电子亲和势 B3LYP x3lyp
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