DNA修复基因XPD遗传多态性与肺癌易感性关系的meta分析

背景与目的研究表明DNA损伤修复基因-人类着色性干皮病基因D(xeroderma pigmentosum group D,XPD)多态性与肺癌的易感性有关,但各研究结论不一,本研究拟通过meta分析,定量地评价XPD312和751位点基因多态性与肺癌的关系。方法全面检索相关文献,按纳入标准对文献进行筛选后提取相关信息,然后在Stata10软件中按照meta分析流程,选择合适方法计算合并的OR值及95%可信区间,并进行敏感性分析和发表偏倚的估计。结果本研究纳入国内外22篇合格文献,其中XPD312位点15篇,XPD751位点20篇。合并结果显示,携带XPD312Asn/Asn突变基因型患肺癌的危险性是野生型Asp/Asp的1.18倍(95%CI:1.03-1.34,P=0.018);XPD751位点突变基因型也与肺癌危险性升高有关(Lys/GlnOR=1.09,95%CI:1.02-1.18;Gln/GlnOR=1.24,95%CI:1.10-1.41)。亚组分析显示XPD751与肺癌的关联性仅见于欧美人群。漏斗图和Egger’s回归分析均未发现明显的偏倚。结论XPD基因312和751位点的突变与肺癌的易感性升高有关。

XPD基因多态性与非霍奇金淋巴瘤发病风险

目的探讨核苷酸剪切修复基因(XPD)单核苷酸多态性与非霍奇金淋巴瘤(NHL)发病风险的关系。方法以309例NHL患者和305例健康对照者为研究对象,采用PCR-RFLP技术检测XPDG23591A、A35931C位点的基因多态。结果初步分析XPD G23591A和A35931C基因多态性与总的NHL无显著相关。对NHL亚类分析显示,在滤泡性淋巴瘤(FL)、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、其他B细胞NHL和T细胞NHL中,XPD23591位点GA+AA型频率分别为16.3%、18.0%、10.5%、18.4%,对照组为12.5%,OR值分别为1.43、1.58、0.89和1.50,差异无统计学意义(P>0.05);XPD35931位点AC+CC型频率分别为15.2%、15.8%、18.4%、12.5%,对照组为11.5%,OR值分别为1.41、1.48、1.75和1.12,差异亦无统计学意义(P>0.05)。结论山东地区汉族人群XPD G23591A、G23591A位点多态性与非霍奇金淋巴瘤发病无关。

XPD基因多态性与非霍奇金淋巴瘤的相关性

目的探讨核苷酸剪切修复基因-着色性干皮病基因D(Xeroderma pigmenting group D,XPD)单核苷酸多态性与非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma,NHL)及其亚型发病风险的关系。方法选取解放军总医院、解放军总医院第一附属医院2011年3月-2013年9月282例NHL患者和231例正常对照者为研究对象,采用SNaPshot方法检测XPD的2个基因rs1799793、rs13181的基因多态性,分析其在NHL组和正常对照组中基因型和等位基因频率分布的差异。采用Logistic回归分析计算各个SNP的等位基因的比值比(odd ratio,OR)和95%置信区间(confidence interval,CI)。结果 XPD rs1799793、rs13181在NHL组和正常对照组中基因型和等位基因频率分布无统计学差异。XPD rs1799793、rs13181组合基因型在对照组和NHL组中无统计学差异。对NHL亚型分析显示,与对照相比较,弥漫大B细胞性淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤、T细胞性淋巴瘤、其他B细胞性淋巴瘤发病风险无差异。结论本组人群XPD rs1799793、rs13181基因多态性与NHL组及其亚型的发病无明显相关性。

人着色性干皮病D组基因的克隆及其真核表达

着色性干皮病D组蛋白(Xeroderma pigmentosum group D,XPD)是基础转录因子ⅡH(Transcript factorⅡH,TFⅡH)复合体的第二大亚基,它在转录和核苷酸剪切修复过程中都发挥着重要作用。我们利用人宫颈鳞癌上皮细胞(HeLa细胞)中提取的总RNA进行逆转录酶-聚合酶链反应(Reverse transcriptase-polymerase chain reac-tion,RT-PCR),克隆出人全长XPD cDNA,把此基因按野生型插入表达绿色荧光蛋白的pEGFP-N2质粒,构建了pEGFP-N2/XPD重组体质粒,并将其转染入整合有乙肝病毒X蛋白(Hepatitis B virus X protein,HBx)的人肝癌细胞Hep3B,分析重组细胞的XPD表达水平、HBx表达水平和细胞增殖力,为进一步研究XPD的各种生物学活性及作用机制奠定了基础。