Xeroderma pigmentosum group D 751 polymorphism as a predictive factor in resected gastric cancer treated with chemo-radiotherapy

AIM: To evaluate the potential association of xeroderma pigmentosum group D (XPD) codon 751 variant with outcome after chemo-radiotherapy in patients with resected gastric cancer. METHODS: We used PCR-RFLP to evaluate the genetic XPD Lys751Gln polymorphisms in 44 patients with stage Ⅲ (48%) and Ⅳ (20%) gastric cancer treated with surgery following radiation therapy plus 5-fluorouracil/ leucovorin based chemotherapy. RESULTS: Statistical analysis showed that 75% (12 of 16) of relapse patients showed Lys/Lys genotype more frequently (P = 0.042). The Lys polymorphism was an independent predictor of high-risk relapse-free survival from Cox analysis (HR: 3.07, 95% CI: 1.07-8.78, P = 0.036) and Kaplan-Meir test (P = 0.027, log-rank test). CONCLUSION: XPD Lys751Gln polymorphism may be an important marker in the prediction of clinical outcome to chemo-radiotherapy in resected gastric cancer patients.

Xeroderma pigmentosum group D polymorphisms and esophageal cancer susceptibility: A meta-analysis based on case-control studies

AIM: To clarify the effects of the xeroderma pigmentosum group D (XPD) Asp312Asn and Lys751Gln gene polymorphisms on the risk of esophageal cancer (EC).

DNA修复基因XPD遗传多态性与肺癌易感性关系的meta分析

背景与目的研究表明DNA损伤修复基因-人类着色性干皮病基因D(xeroderma pigmentosum group D,XPD)多态性与肺癌的易感性有关,但各研究结论不一,本研究拟通过meta分析,定量地评价XPD312和751位点基因多态性与肺癌的关系。方法全面检索相关文献,按纳入标准对文献进行筛选后提取相关信息,然后在Stata10软件中按照meta分析流程,选择合适方法计算合并的OR值及95%可信区间,并进行敏感性分析和发表偏倚的估计。结果本研究纳入国内外22篇合格文献,其中XPD312位点15篇,XPD751位点20篇。合并结果显示,携带XPD312Asn/Asn突变基因型患肺癌的危险性是野生型Asp/Asp的1.18倍(95%CI:1.03-1.34,P=0.018);XPD751位点突变基因型也与肺癌危险性升高有关(Lys/GlnOR=1.09,95%CI:1.02-1.18;Gln/GlnOR=1.24,95%CI:1.10-1.41)。亚组分析显示XPD751与肺癌的关联性仅见于欧美人群。漏斗图和Egger’s回归分析均未发现明显的偏倚。结论XPD基因312和751位点的突变与肺癌的易感性升高有关。

XRCC1和XPD单核苷酸多态性与非小细胞肺癌铂类药物化疗敏感性的关系

目的研究X线修复交叉互补基因1(XRCC1)和着色性干皮病基因(XPD)单核苷酸多态性与老年晚期非小细胞肺癌(NSCLC)铂类药物化疗敏感性关系。方法应用聚合酶链反应结合限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法检测81例以铂类药物为主要化疗方案的NSCLC患者XRCC1Arg399Gln和XPDLys751Gln基因型多态性,采用非条件Logistic回归分析不同基因型与化疗疗效的关系。结果81例患者化疗总有效率为35.8%,其中完全缓解(CR)、部分缓解(PR)、稳定(SD)和进展(PD)患者分别为0、29、31、21例。携带至少1个XRCC1399Arg等位基因的患者化疗敏感性是携带Gln/Gln基因型患者的4.52倍(OR=4.52,95%CI=1.11～18.38)。未发现XPDLys751Gln遗传多态与化疗敏感性相关。结论XRCC1Arg399Gln多态可能与晚期NSCLC铂类药物化疗敏感性有关。

荧光偏振技术分析全血XPD基因单核苷酸多态性的研究

将荧光偏振与非对称基因扩增技术联用,建立了可用于检测全血XPD基因单核苷酸多态性的新方法。用不等量(1∶5)的XPD基因上、下游引物对含单核苷酸多态性位点的目的片段进行非对称扩增,再用两种单核苷酸多态性序列特异的荧光标记探针对扩增产物进行检测。由于扩增得到的单链片段能够与各自不同的荧光标记探针特异结合,使荧光标记分子的分子量增加,偏振值(FP)增高。通过检测增高的FP值,可确定目的片段单核苷酸多态性。采用本方法对98例全血的XPD基因第751位密码子进行了单核苷酸多态性分析,并与传统的荧光偏振检测方法进行了比较,取得满意结果。

XPD基因751位点单核苷酸多态与肺癌遗传易感性关联的Meta分析

目的:人类着色性干皮病基因D(XPD)是核苷酸切除修复途径中的关键基因之一,其单核苷酸多态(SNP)与肺癌的遗传易感性相关联,但研究结论不一,本研究拟采用Meta分析的方法对2000—2014年间发表的相关文献进行综合,评价XPD基因751位点SNP与肺癌遗传易感性的关联。方法:检索PubMed、CNKI(中国知网)、cqVIP(维普资讯网)、万方全文数据库中关于XPD基因Lys751Gln位点多态与肺癌遗传易感性关联的病例对照研究。按照拟定标准筛查并纳入符合标准的文献,采用Rev Man 4.2软件对入选文献进行异质性检验,计算合并相对危险度(OR值)及其95%可信区间(95%CI),同时绘制漏斗图,估计发表偏倚的影响。结果:共纳入28篇国内外文献,累计病例9 012例,对照10 542例,杂合基因型Lys/Gln与野生基因型Lys/Lys相比较,采用随机效应模型计算合并OR值为1.18,95%CI(1.07,1.31),P=0.001;突变基因型Gln/Gln与野生基因型Lys/Lys相比较,采用固定效应模型分析计算合并OR值为1.28,95%CI(1.14,1.44),P<0.01。亚组分析结果显示高加索人群中,XPD基因751位点多态与肺癌遗传易感性相关联。结论:XPD基因751位点Gln/Lys和Gln/Gln基因型的个体,其肺癌发病风险显著增加。

XPD751基因多态性与中国人群肝细胞性肝癌易感性的Meta分析

目的探讨XPD基因多态性与中国人群肝细胞性肝癌患病风险的关系。方法计算机检索CBM、VIP、CNKI、Pubmed、Embase、Ovid等数据库,收集有关XPD Lys751Gln基因多态性与HCC易患性的病例对照研究,提取纳入文献的相关数据进行Meta分析。以病例组与对照组XPD Lys751Gln基因型分布的比值比(OR)为效应指标,检验其是否为肝细胞性肝癌的危险因素。结果共5篇研究符合纳入标准,累计病例1658例,对照1652例。Lys/Lys基因型与Gln/Gln+Lys/Gln基因型比较的OR为0.64(95%CI 0.36～1.14,P=0.13,I2=88%)。而Gln/Gln基因型与Lys/Lys+Lys/Gln基因型比较的OR为2.32(95%CI 1.71～3.15,P<0.01,I2=49%)。结论 XPD 751Gln/Gln是中国人群HCC的易感基因型,而XPD 751Lys/Lys可能是中国人群HCC的保护基因型。

XPD基因多态性与非霍奇金淋巴瘤发病风险

目的探讨核苷酸剪切修复基因(XPD)单核苷酸多态性与非霍奇金淋巴瘤(NHL)发病风险的关系。方法以309例NHL患者和305例健康对照者为研究对象,采用PCR-RFLP技术检测XPDG23591A、A35931C位点的基因多态。结果初步分析XPD G23591A和A35931C基因多态性与总的NHL无显著相关。对NHL亚类分析显示,在滤泡性淋巴瘤(FL)、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、其他B细胞NHL和T细胞NHL中,XPD23591位点GA+AA型频率分别为16.3%、18.0%、10.5%、18.4%,对照组为12.5%,OR值分别为1.43、1.58、0.89和1.50,差异无统计学意义(P>0.05);XPD35931位点AC+CC型频率分别为15.2%、15.8%、18.4%、12.5%,对照组为11.5%,OR值分别为1.41、1.48、1.75和1.12,差异亦无统计学意义(P>0.05)。结论山东地区汉族人群XPD G23591A、G23591A位点多态性与非霍奇金淋巴瘤发病无关。

DNA修复基因XPD基因型与铂类药物化疗敏感性的关系

目的探讨着色性干皮病基因D(XPD)的单核苷酸多态性(SNPs)与铂类药物化疗敏感性的关系。方法采用基因测序法对50例经病理确诊且CT扫描证实有可测量病灶的恶性肿瘤患者的外周血进行XPD基因SNPs检测,分析各基因型与化疗敏感性的关系。结果 XPD基因型的分布与病种无关(P>0.05)。XPD基因第312位密码子的纯合突变型Asn/Asn基因分型对铂类化疗的敏感性高于纯合野生型Asp/Asp及杂合突变型Asp/Asn基因分型(P<0.05)。结论 XPD基因SNPs可能与铂类药物化疗敏感性有关。

DNA修复基因XPD与肿瘤关系的研究进展

人着色性干皮病D组基因(XPD)是一种重要的DNA修复基因,其基因产物为哺乳动物基本转录因子Ⅱ的核心成分,参与了真核生物转录起始和DNA核苷酸切除修复作用。XPD基因多态性参与了DNA修复过程,与多种肿瘤的发病风险存在相关性,目前涉及的领域主要包括呼吸系统、消化系统、泌尿系统、造血及淋巴系统及皮肤及头颈部肿瘤等。研究XPD基因多态性与肿瘤的相关性,阐明其对肿瘤易感性的影响,将为进一步研究其作用机制提供新的思路。

XPD和P53对HepG2.2.15增殖及乙型肝炎病毒X蛋白表达的影响

目的:探讨人着色性干皮病基因D(XPD)和P53对人肝癌细胞株HepG2.2.15增殖及乙型肝炎病毒X蛋白(HBx)、Bcl-2和Bax基因表达的影响。方法:用脂质体转染法将重组质粒pEGFP-N2/XPD和空载质粒pEGFP-N2转染HepG2.2.15细胞,转染后第2天给予20μmol/L的Pifithrin-α(P53抑制剂)孵育24h。分为空白对照组、pEGFP-N2组、pEGFP-N2/XPD组、pEGFP-N2/XPD+Pifithrin-α组及Pifithrin-α组。用RT-PCR和Westernblotting方法检测XPD、HBx、Bcl-2和Bax表达的变化;用MTT法观察细胞增殖活力;用流式细胞仪检测细胞周期。结果:(1)重组质粒pEGFP-N2/XPD的转染使得XPD表达增高(均P<0.001);XPD表达增高使得HBx和Bcl-2表达降低,同时使得Bax表达增高,而Pifithrin-α能抑制XPD这一作用(均P<0.01)。(2)XPD表达增高抑制了细胞增殖活力,而Pifithrin-α能抑制XPD降低细胞活力的作用(均P<0.001)。(3)XPD表达增高引起了细胞G1期增加、S期减少,而Pifithrin-α能抑制XPD这一作用(均P<0.001)。结论:XPD是通过P53途径抑制肝癌细胞增殖,下调HBx和Bcl-2的表达并上调Bax的表达;XPD、P53和HBx三者之间能相互作用、相互影响,共同调节肝癌的发生与发展。

XPD Asp312Asn位点多态性与头颈部鳞状细胞癌易感性的Meta分析

目的:运用Meta分析研究XPD Asp312Asn位点多态性与头颈部鳞状细胞癌易感性的关联。方法:检索VIP,CNKI和PubMed数据库中有关XPD Asp312Asn位点多态性与头颈部鳞状细胞癌易感性关联研究的文献,以OR值和95%的可信区间为效应指标,应用STATA 11.0软件进行Meta分析,并对发表偏倚进行检测。结果:纳入9个病例对照研究,共计2 670例头颈部鳞状细胞癌患者和4 452例正常对照。Meta分析结果显示,总人群中XPDAsp312Asn多态性与头颈部鳞状细胞癌风险之间没有显著关联[Asn/Asn vs.Asp/Asp:OR=0.95,95%CI=0.80-1.13;Asp/Asn vs.Asp/Asp:OR=1.11,95%CI=0.99-1.24;(Asn/Asn+Asp/Asn)vs.Asp/Asp:OR=1.07,95%CI=0.97-1.19;Asn/Asn vs.(Asp/Asp+Asp/Asn):OR=0.87,95%CI=0.68-1.10]。在针对种族和对照人群来源设计的亚组分析中,仍未发现二者之间有显著的相关性。结论:XPD Asp312Asn位点多态性可能与头颈部鳞状细胞癌的发生无关。

人剪切修复基因XPD肝癌对人HepG2细胞中Rb和MAD2表达的影响

目的:探讨人剪切修复基因着色性干皮病D组基因(xeroderma pigmentosum group D,XPD)转染人肝癌HepG2细胞后视网膜母细胞瘤蛋白(retinoblastoma,Rb)和有丝分裂阻滞缺陷蛋白2(mitotic arrest deficient 2,MAD2)表达的变化及对细胞增殖的影响。方法:将人工合成的pEGFP-N2-XPD重组质粒通过LipofectamineTM2000转染HepG2细胞。实验分为4组,分别为无转染HepG2细胞组(空白对照组)、脂质体转染HepG2细胞组(脂质体组)、空载质粒pEGFP-N2转染细胞组(N2组)和重组质粒pEGFP-N2-XPD转染细胞组(XPD组)。分别用RT-PCR和Western blotting法检测各组细胞中XPD、Rb及MAD2 mRNA和蛋白的表达量,用MTT法检测各组细胞的增殖活力,流式细胞术检测各组的细胞凋亡情况及细胞周期。结果:与其它3组相比,XPD组XPD mRNA及蛋白表达量明显升高(P<0.05),Rb mRNA及蛋白表达量明显升高(P<0.05),而MAD2 mRNA及蛋白表达量显著降低(P<0.05)。XPD组细胞增殖活力显著降低,细胞凋亡率明显升高(P<0.05)。XPD组细胞停滞在G1期,难以进入S期。结论:XPD可以抑制MAD2的表达和肝癌细胞的增殖,促进Rb的表达。

人剪切修复基因XPD对肝癌细胞P53和Ets-1基因的作用

目的探讨人剪切修复基因XPD对肝癌细胞P53和Ets-1基因的影响。方法使用脂质体瞬时转染技术,将pEGFP-N2-XPD重组质粒转染至肝癌细胞HepG2,24 h后加入20μmol/L的P53抑制剂Pifithrin-α,孵育24 h,并以未经转染的HepG2细胞作为空白对照。RT-PCR、Western blot检测细胞中XPD、P53、phosphoP53(ser-15)、Ets-1的mRNA和蛋白的表达变化,MTT法观察细胞增殖的活力,流式细胞仪检测细胞周期变化。结果与空白对照比较,转染pEGFP-N2-XPD重组质粒后,HepG2细胞XPD、P53 mRNA和蛋白表达上调(P<0.01),而Ets-1 mRNA和蛋白表达下调(P<0.01),加入Pifithrin-α后,XPD、P53 mRNA和蛋白表达下调,Ets-1mRNA和蛋白表达上调(P<0.01)。转染pEGFP-N2-XPD重组质粒后,HepG2细胞进入S期发生阻滞,停滞在G1期(P<0.01),加入Pifithrin-α后,HepG2细胞G1期细胞减少,S期细胞增多(P<0.01)。转染pEGFP-N2-XPD重组质粒后,HepG2细胞增殖活力下降(P<0.01),加入Pifithrin-α后,HepG2细胞增殖活力上升(P<0.01)。结论野生型XPD基因在转染至肝癌HepG2细胞后,可以上调P53的表达,通过P53途径抑制Ets-1的表达,促使肝癌细胞凋亡。

XPD Lys751Gln polymorphism and esophageal cancer risk: A meta-analysis involving 2288 cases and 4096 controls

AIM: To evaluate the association between xeroderma pigmentosum group D (XPD), genetic polymorphism Lys751Gln and esophageal cancer risk. METHODS: We searched PubMed up to September 1, 2010 to identify eligible studies. A total of 10 casecontrol studies including 2288 cases and 4096 controls were included in the meta-analysis. Statistical analysis was performed with Review Manage version 4.2. Odds ratios (ORs) with 95% confidence intervals (CIs) were used to assess the strength of the association.RESULTS: The results suggested that there is no significant association between XPD Lys751Gln polymorphism and esophageal cancer susceptibility in the overall population. However, in subgroup analysis by histology type, a significant association was found between XPD Lys751Gln polymorphism and esophageal adenocarcinoma (for CC vs AA: OR = 1.25, 95% CI = 1.01-1.55, P = 0.05 for heterogeneity). CONCLUSION: Our meta-analysis suggested that XPD Lys751Gln polymorphism may be associated with increased risk of esophageal adenocarcinoma.

野生型XPD转染对胆管癌QBC939细胞生物学行为的影响

目的:探讨野生型X P D基因对人胆管癌QBC939细胞的生物学影响.方法:用碱裂解法提取空载质粒pEGFP-N2和重组质粒pEGFP-N2-XPD,提取出的质粒以KPNⅠ、BGIⅡ和SPHⅠ酶切鉴定.实验分4组,重组质粒pEGFP-N2-XPD组、空载质粒pEGFP-N2组、脂质体组,并用具有相同遗传背景和代数的QBC939细胞作为空白对照.用脂质体转染法瞬时转染四组细胞.荧光显微镜下观察转染后绿色荧光蛋白报告基因表达情况.提取各组细胞总RNA,合成cDNA,用聚合酶链反应(PCR)检测4组细胞中XPD、p53、cyclin D1、c-myc表达情况.并用四甲基偶氮唑盐(MTT)和流式细胞仪检测细胞增殖及其细胞周期的变化.结果:pEGFP-N2-XPD细胞与pEGFP-N2、脂质体组和空白对照组相比,XPD mRNA表达量明显增加(0.778±0.018vs0.561±0.039,0.544±0.035,0.542±0.034,均P<0.01).pEGFP-N2-XPD细胞中p53mRNA相对表达量与pEGFP-N2、脂质体组和空白对照组比较具有统计学意义(0.421±0.019vs0.256±0.014,0.267±0.015,0.274±0.018,均P<0.01).pEGFP-N2-XPD细胞与其他组相比,cyclin D1mRNA相对表达量明显降低(0.339±0.041vs0.560±0.039,0.558±0.050,0.560±0.041,均P<0.01).pEGFP-N2-XPD细胞与其他组相比,c-myc mRNA相对表达量明显降低(0.355±0.045vs0.570±0.075,0.560±0.041,0.537±0.050,均P<0.01).流式细胞仪检测pEGFP-N2-XPD组细胞周期G1期为81.65%,S期为11.83%,其他组Gl期分别为65.54%、56.61%、63.26%;S期分别为24.10%、29.52%、27.28%,结果具有统计学意义(P<0.05).MTT检测示pEGFP-N2-XPD细胞生长率为0.249±0.02,与其他组相比,细胞增殖力明显减弱(P<0.01).结论:野生型XPD基因可以抑制胆管癌细胞的生长,XPD基因可抑制c-myc、cyclin D1基因的表达,增加p53基因表达.

人剪切修复基因XPD对人肝癌SMMC-7721细胞中Ets-1和Cdk6基因的调控作用

目的:观察野生型人剪切修复基因XPD转染入人肝癌细胞SMMC-7721后,细胞内Ets-1和Cdk6基因的表达变化及对SMMC-7721肝癌细胞增殖的影响。方法:将人工合成的pEGFP-N2-XPD重组质粒通过Lipofectamine 2000TM转染SMMC-7721细胞。设重组质粒转染细胞SMMC-7721-pEGFP-N2-XPD(XPD)组、空载质粒转染细胞SMMC-7721-pEGFP-N2(N2)组、脂质体组、无转染空白对照组。分别用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和蛋白印迹法(Western blot)检测细胞中XPD、Ets-1、Cdk6基因mRNA和蛋白质的表达量,并用流式细胞仪检测细胞周期变化,四甲基偶氮唑盐微量酶反应比色法(MTT)检测各组细胞的增殖活力。结果:XPD组中的XPD的mRNA和蛋白质表达较其他3组明显增高(P<0.001),而Ets-1、Cdk6 mRNA和蛋白质表达较其他3组明显减少(P<0.001)。转染pEGFP-N2-XPD重组质粒后细胞停滞在G1期,难于进入S期。转染了野生型XPD的SMMC-7721细胞增殖能力减弱。结论:XPD基因可能通过抑制Ets-1、Cdk6基因的表达影响肝癌细胞的生长。

DNA修复酶基因XPD和XRCC1单核苷酸多态性与宫颈鳞癌易感性的研究

目的:研究DNA修复酶基因人类着色性干皮病基因组D(XPD)、X射线交错互补基因1(XRCC1)单核苷酸多态性与宫颈鳞癌易感性的关系。方法:采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测200例宫颈鳞癌患者和同期匹配的200例正常人群的DNA修复酶基因XPD-751、XRCC1-399位点多态性与宫颈鳞癌易感性的关系。结果:XRCC1-399基因型(χ2=6.52,P<0.05)与等位基因(χ2=6.30,P<0.05)的分布频率在病例组与对照组的差异均有统计学意义,携带至少一个等位基因A(GA or AA)的个体罹患宫颈鳞癌的风险增加1.73倍(OR=1.73,95%CI:1.15～2.56,P=0.008);XPD-751基因型(χ2=0.48,P>0.05)和等位基因分布频率(χ2=0.84,P>0.05)在病例组与对照组中均无统计学差异。结论:DNA修复酶基因XRCC1-399多态性可能与宫颈鳞癌的遗传易感性相关。

人着色性干皮病D组基因的克隆及其真核表达

着色性干皮病D组蛋白(Xeroderma pigmentosum group D,XPD)是基础转录因子ⅡH(Transcript factorⅡH,TFⅡH)复合体的第二大亚基,它在转录和核苷酸剪切修复过程中都发挥着重要作用。我们利用人宫颈鳞癌上皮细胞(HeLa细胞)中提取的总RNA进行逆转录酶-聚合酶链反应(Reverse transcriptase-polymerase chain reac-tion,RT-PCR),克隆出人全长XPD cDNA,把此基因按野生型插入表达绿色荧光蛋白的pEGFP-N2质粒,构建了pEGFP-N2/XPD重组体质粒,并将其转染入整合有乙肝病毒X蛋白(Hepatitis B virus X protein,HBx)的人肝癌细胞Hep3B,分析重组细胞的XPD表达水平、HBx表达水平和细胞增殖力,为进一步研究XPD的各种生物学活性及作用机制奠定了基础。

着色性干皮病基因组D和胞苷脱氨酶基因单核苷酸多态性与肺癌易感性的关系

目的探讨着色性干皮病基因组D(XPD)和胞苷脱氨酶(CDA)基因单核苷酸多态性与肺癌易感性及其病理类型的关系,并探讨吸烟与基因多态性的交互作用对肺癌发病风险的影响。方法采用病例-对照研究方法纳入肺癌患者和健康对照者各103人,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法分析两组人群XPD基因外显子10G→A(Asp312Asn)、23A→C(Lys751Gln)以及CDA基因外显子1上79A→C(Lys27Gln)、208G→A(Ala70 Thr)的基因型。结果两组XPD312和XPD751位点的基因分布频率比较差异均无统计学意义(P>0.05);但吸烟合并XPD第751位点突变个体发生肺癌的风险显著增加(P=0.044);同时发生XPD第312和751两个位点突变的肺癌风险增加6.13倍(P=0.047)。两组CDA Lys27Gln和CDAAla70 Thr基因分布频率差异无统计学意义(P>0.05)。XPD和CDA在不同病理类型中的基因分布频率差异无统计学意义(P>0.05)。结论吸烟可使XPD第751位点发生突变的个体发生肺癌的风险增加,XPD基因第312和751两个位点同时突变使肺癌发生的风险增加。