汉坦病毒中国疫苗株Z37M片段的克隆及序列分析

汉坦病毒Z37株是从褐家鼠体内分离到的 ,用于生产双价肾综合征出血热疫苗的病毒毒株之一 ,血清分型为SEO型。利用RT PCR方法扩增Z37株M基因片段cDNA ,克隆入质粒载体 ,进行核苷酸序列测定及分析。Z37株M基因片段由 36 5 1个核苷酸组成 ,只有一个开放读码框架 ,共编码 1133个氨基酸。与HTN型病毒 ( 76 118、A9、HV 114)的核苷酸和氨基酸同源性分别为 71.8%～ 72 .1%、76 .2 %～ 76 .7% ,与SEO型 (R2 2、L99、80 39)的核苷酸和氨基酸同源性分别为 95 .3%～ 96 .1%、95 .3 %～ 98.9%。这一结果的获得进一步从分子水平确定了Z37株的型别 。

汉坦病毒Z37株基因组全序列分析

目的 测定Z37株的全基因组序列 ,了解我国汉坦病毒疫苗生产株分子基础 ,分析其遗传学和抗原性差异等。方法 设计出针对各片段的特异性引物 ,用PCR方法从Z37病毒感染的细胞提取细胞总RNA ,逆转录扩增、产物克隆T载体 ,纯化后测序 ,测定的序列应用DNASTAR软件比较分析。结果 Z37株全基因组由L片段 6 5 30nt、M36 5 1nt、S175 4nt组成 ,分别编码 2 15 1、1133、42 9个氨基酸 ,与同型病毒间同源率高达 95 .2 %～ 99.5 % ,绘出了 3个片段的核苷酸和氨基酸的系统发生树。结论 测定得到了Z37株的全基因组序列 ,为研究疫苗毒株的生物学特性。