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LncRNA ZFPM2-AS1靶向miR-519e-5p对脊索瘤U-CH1细胞生物学行为的影响 被引量:1
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作者 李轶 王程阳 +3 位作者 刘顺帆 杨贤 高雨焦 马磊 《广西医科大学学报》 CAS 2023年第2期268-274,共7页
目的:探讨lncRNA ZFPM2-AS1靶向miR-519e-5p对脊索瘤U-CH1细胞生物学行为的影响。方法:体外培养U-CH1细胞,将ZFPM2-AS1的小干扰RNA以及miR-519e-5p的模拟物分别转入U-CH1细胞中,并随机分组:si-NC组、si-ZFPM2-AS1组、miR-NC组、miR-519e... 目的:探讨lncRNA ZFPM2-AS1靶向miR-519e-5p对脊索瘤U-CH1细胞生物学行为的影响。方法:体外培养U-CH1细胞,将ZFPM2-AS1的小干扰RNA以及miR-519e-5p的模拟物分别转入U-CH1细胞中,并随机分组:si-NC组、si-ZFPM2-AS1组、miR-NC组、miR-519e-5p组、si-ZFPM2-AS1+anti-miR-NC组、si-ZFPM2-AS1+anti-miR-519e-5p组;实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测U-CH1细胞中lncRNA ZFPM2-AS1与miR-519e-5p表达量;MTT、流式细胞术、划痕实验、Transwell实验分别检测U-CH1细胞增殖、凋亡、迁移、侵袭;双荧光素酶报告实验检测lncRNA ZFPM2-AS1与miR-519e-5p的靶向调控关系;蛋白印迹(western blotting)法分析蛋白E-cadherin、N-cadherin表达。结果:与si-NC组、miR-NC组比较,si-ZFPM2-AS1组、miR-519e-5p组细胞活力、划痕愈合率、侵袭细胞数及蛋白N-cadherin水平下降,凋亡率、E-cadherin水平增高(P<0.05);lncRNA ZFPM2-AS1可负向调控miR-519e-5p表达;si-ZFPM2-AS1+anti-miR-519e-5p组与si-ZFPM2-AS1+anti-miR-NC组比较,细胞活力、划痕愈合率、侵袭细胞数及蛋白N-cadherin水平增高,凋亡率、E-cadherin水平下降(P<0.05)。结论:下调lncRNA ZFPM2-AS1可促进U-CH1细胞凋亡并阻滞增殖、迁移、侵袭,其机制与上调miR-519e-5p表达有关。 展开更多
关键词 lncRNA zfpm2-AS1 miR-519e-5p 脊索瘤 细胞增殖 迁移 侵袭
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LncRNA ZFPM2-AS1在皮肤鳞状细胞癌中的表达及意义
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作者 翁立强 林滨 +3 位作者 陈俊 龙琴琴 张春萍 陈阳 《福建医药杂志》 CAS 2023年第6期19-22,F0004,共5页
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)ZFPM2-AS1在皮肤鳞状细胞癌(cSCC)中的表达及其对cSCC细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响。方法 采用qRT-PCR法检测lncRNA ZFPM2-AS1在cSCC组织、癌旁正常组织中的表达。Western blot法检测抑制lncRNA ZFPM2... 目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)ZFPM2-AS1在皮肤鳞状细胞癌(cSCC)中的表达及其对cSCC细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响。方法 采用qRT-PCR法检测lncRNA ZFPM2-AS1在cSCC组织、癌旁正常组织中的表达。Western blot法检测抑制lncRNA ZFPM2-AS1表达对A431细胞周期蛋白A1(Cyclin A1)、cyclin D1、cyclin E1、CDK-2、E-cadherin、N-cadherin和vimentin蛋白表达水平的影响。采用MTT法、Transwell试验、EdU标记法和Annexin V/PI双染流式细胞术检测抑制lncRNA ZFPM2-AS1表达时对A431细胞增殖、侵袭和凋亡能力的影响。结果 与癌旁正常组织相比,lncRNA ZFPM2-AS1在cSCC组织中表达明显增高(P<0.001)。与对照组相比,抑制lncRNA ZFPM2-AS1表达,A431细胞CDK-2、cyclin A1、cyclin D1、cyclin E1、N-cadherin和vimentin的表达明显减少(P<0.001),而E-cadherin的表达明显增高(P<0.001)。MTT试验、EdU、Transwell试验标记结果显示,与对照组相比,shZFPM2-AS1组A431细胞增殖活性及迁移侵袭能力显著降低(P<0.001)。流式细胞术结果显示,shZFPM2-AS1组凋亡细胞数明显增多(P<0.01)。结论 lncRNA ZFPM2-AS1在皮肤鳞状细胞癌中表达显著增高,抑制其表达可降低皮肤鳞癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并促进癌细胞凋亡;其有望成为潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 lncRNA zfpm2-AS1 皮肤鳞状细胞癌 细胞增殖 迁移侵袭
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法洛四联症患者ZFPM2/FOG2基因编码区突变检测 被引量:2
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作者 赵明 朱鲜阳 +6 位作者 田小利 王琦光 杨帆 吕蓓 王红 董洁 郑谷燕 《中国心血管病研究》 CAS 2012年第6期422-424,479,共4页
目的 探讨心脏正常发育相关基因改变导致法洛四联症(TOF)的发生机制.方法 通过聚合酶链反应,并结合DNA测序分析方法检测散发106例TOF患者ZFPM2/FOG2基因编码区的突变或单核苷酸多态性位点.结果 在16例不同的患者ZFPM2/FOG2基因的外显... 目的 探讨心脏正常发育相关基因改变导致法洛四联症(TOF)的发生机制.方法 通过聚合酶链反应,并结合DNA测序分析方法检测散发106例TOF患者ZFPM2/FOG2基因编码区的突变或单核苷酸多态性位点.结果 在16例不同的患者ZFPM2/FOG2基因的外显子2、6、8上,分别发现多个位点基因改变,并将新发现的基因改变位点在110名健康人中进行验证,证实其改变位点均为突变位点.结论 ZFPM2/FOG2基因新位点的突变可能通过不同的机制进一步导致转录蛋白的改变,推测是法洛四联症发病的重要遗传基础. 展开更多
关键词 心脏病 先天性 法洛四联症 zfpm2/FOG2基因 基因突变
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lncRNA ZFPM2-AS1在膀胱癌组织中的表达及对膀胱癌T24细胞生物学特性的影响 被引量:1
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作者 常俊锴 侯俊清 +5 位作者 朱朝阳 李晓东 李铁强 徐卫波 赵小磊 徐文超 《实用癌症杂志》 2021年第4期540-544,共5页
目的探究lncRNA ZFPM2-AS1在膀胱癌组织中的表达和对膀胱癌T24细胞增殖、克隆形成、迁移和侵袭的影响。方法QPCR检测膀胱癌组织和细胞系中lncRNA ZFPM2-AS1的表达;将阴性对照siRNA和lncRNA ZFPM2-AS1 siRNA转染至膀胱癌T24细胞中,qPCR... 目的探究lncRNA ZFPM2-AS1在膀胱癌组织中的表达和对膀胱癌T24细胞增殖、克隆形成、迁移和侵袭的影响。方法QPCR检测膀胱癌组织和细胞系中lncRNA ZFPM2-AS1的表达;将阴性对照siRNA和lncRNA ZFPM2-AS1 siRNA转染至膀胱癌T24细胞中,qPCR检测转染后细胞中lncRNA ZFPM2-AS1表达,MTT检测细胞增殖,克隆形成检测细胞克隆形成能力,细胞划痕检测细胞迁移,Transwell检测细胞侵袭,Western blot检测细胞中Wnt/β-catenin信号通路蛋白表达。结果膀胱癌组织中lncRNA ZFPM2-AS1的水平高于癌旁组织;与正常膀胱上皮细胞SV-HUC-1相比,T24、J82、56373种膀胱癌细胞株中lncRNA ZFPM2-AS1表达水平均高于正常膀胱上皮细胞,且差异有统计学意义(P<0.01)。与沉默对照组相比,沉默ZFPM2-AS1组T24细胞中lncRNA ZFPM2-AS1表达显著降低(P<0.01),细胞增殖、克隆形成、迁移和侵袭能力显著降低(P<0.01),细胞中Wnt/β-catenin信号通路蛋白β-catenin及其下游蛋白c-Myc和Cyclin D1表达显著降低,p-β-catenin蛋白表达明显增加,差异有统计学意义(P<0.01)。结论LncRNA ZFPM2-AS1在膀胱癌中高表达,沉默LncRNA ZFPM2-AS1能够抑制膀胱癌细胞增殖、克隆形成、迁移和侵袭,其机制可能与抑制Wnt/β-catenin信号通路有关。 展开更多
关键词 LncRNA zfpm2-AS1 膀胱癌 T24 WNT/Β-CATENIN信号通路
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LncRNA ZFPM2-AS1靶向miR-515-5p调控胆管癌细胞增殖、迁移和侵袭 被引量:2
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作者 陈杰 《河北医药》 CAS 2021年第7期976-980,共5页
目的探讨长链非编码RNA ZFPM2反义RNA1(ZFPM2-AS1)对miR-515-5p的靶向调控作用以及对胆管癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。方法实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测人肝内胆管上皮细胞HIBEpic和3种胆管癌细胞(RBE、HuCCT1、TFK1)中ZFPM2-AS1和m... 目的探讨长链非编码RNA ZFPM2反义RNA1(ZFPM2-AS1)对miR-515-5p的靶向调控作用以及对胆管癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。方法实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测人肝内胆管上皮细胞HIBEpic和3种胆管癌细胞(RBE、HuCCT1、TFK1)中ZFPM2-AS1和miR-515-5p的表达。将ZFPM2-AS小干扰RNA(si-ZFPM2-AS1)、miR-515-5p模拟物(miR-515-5p mimics)分别转染胆管癌细胞RBE,采用四甲基偶氮唑蓝(MTT)实验、Transwell实验检测干扰ZFPM2-AS1或过表达miR-515-5p后RBE细胞增殖、迁移侵袭能力变化。蛋白质印记(Western blot)检测细胞周期素D1(CyclinD1)、基质金属蛋白酶2(MMP2)和MMP9蛋白的表达变化。双荧光素酶报告实验和RT-qPCR验证ZFPM2-AS1对miR-515-5p的调控作用。将si-ZFPM2-AS1与miR-515-5p抑制物(anti-miR-515-5p)共转染RBE细胞,采用上述方法检测RBE细胞增殖、迁移侵袭能力变化。Western blot检测干扰ZFPM2-AS1表达对β-连环蛋白(β-catenin)蛋白表达的影响。结果与HIBEpic细胞比较,3种胆管癌细胞ZFPM2-AS1的表达显著升高,miR-515-5p的表达显著降低(P<0.05)。干扰ZFPM2-AS1或过表达miR-515-5p后RBE细胞CyclinD1、MMP2和MMP9蛋白的表达显著降低,细胞增殖、迁移和侵袭能力显著降低(P<0.05)。ZFPM2-AS1靶向miR-515-5p并负调控其表达。干扰ZFPM2-AS1可抑制β-catenin蛋白表达(P<0.05)。抑制miR-515-5p表达可减弱干扰ZFPM2-AS1对RBE细胞增殖、迁移、侵袭以及β-catenin蛋白的影响(P<0.05)。结论干扰ZFPM2-AS1通过靶向miR-515-5p可抑制胆管癌细胞增殖、迁移和侵袭,其机制可能与抑制Wnt/β-catenin信号通路活化有关。 展开更多
关键词 zfpm2-AS1 miR-515-5p 胆管癌 细胞增殖 迁移侵袭
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鸡miR-17-92基因簇靶基因ZFPM2的鉴定及功能分析 被引量:5
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作者 张潇飞 宋鹤 +4 位作者 刘静 张文建 闫晓红 李辉 王宁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期333-345,共13页
miR-17-92基因簇在哺乳动物的许多生理和病理过程中发挥重要作用。本实验室前期研究发现,miR-17-92基因簇促进鸡前脂肪细胞的增殖,但其作用机制尚不清楚。为了揭示miR-17-92基因簇促进鸡前脂肪细胞增殖的作用机制,本研究采用CCK-8细胞... miR-17-92基因簇在哺乳动物的许多生理和病理过程中发挥重要作用。本实验室前期研究发现,miR-17-92基因簇促进鸡前脂肪细胞的增殖,但其作用机制尚不清楚。为了揭示miR-17-92基因簇促进鸡前脂肪细胞增殖的作用机制,本研究采用CCK-8细胞增殖检测方法分析干扰ZFPM2对前脂肪细胞的影响,结果发现,干扰ZFPM2能显著促进鸡前脂肪细胞的增殖(P<0.01);与CCK-8分析结果相一致,干扰ZFPM2可致使细胞增殖标志基因PCNA、Ki67、Cyclin D1的mRNA表达量明显升高(P<0.01或P<0.05)。进一步对鸡ZFPM2基因进行生物信息学分析,发现该基因mRNA的3′UTR有两个区域存在miR-17-92基因簇4个成员(miR-17-5p、miR-20a、miR-19a及miR-19b)的潜在结合位点。为验证miR-17-92基因簇是否靶作用于鸡ZFPM2基因,构建了鸡ZFPM2基因3′UTR区的荧光素酶报告基因载体(野生型)(psi-CHECK2-ZFPM2-3′UTR-WT)及其突变型的荧光素酶报告基因载体(psi-CHECK2-ZFPM2-3′UTR-MUT)。报告基因活性分析显示,过表达mi-17-92基因簇能极显著地抑制野生型ZFPM2的报告基因活性(P<0.01);转染miR-17-5p、miR-20a及miR-19a的抑制剂均能显著地提高野生型ZFPM2报告基因的活性(P<0.01或P<0.05),但这些抑制剂对突变型ZFPM2报告基因的活性无明显影响。q RT-PCR分析发现,miR-17-5p、miR-19a及miR-20a的抑制剂能显著提高内源性ZFPM2基因mRNA的表达水平(P<0.01或P<0.05)。共转染分析发现,尽管差异不显著,但miR-17-5p和miR-19a的抑制剂均倾向于降低ZFPM2干扰片段的促细胞增殖作用。本研究结果表明:miR-17-92基因簇成员miR-17-5p、miR-20a、miR-19a及miR-19b靶作用于ZFPM2;miR-17-92基因簇至少部分通过抑制ZFPM2基因表达从而促进鸡前脂肪细胞的增殖。 展开更多
关键词 miR-17-92基因簇 zfpm2 鸡前脂肪细胞 细胞增殖
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ZFPM2基因的低频变异通过影响GATA4转录调控参与圆锥动脉干畸形的发生 被引量:1
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作者 郭晓 钱琰琰 +4 位作者 肖德勇 陈洪波 马晓静 黄国英 王慧君 《中国循证儿科杂志》 CSCD 北大核心 2017年第6期457-462,共6页
目的通过Sanger测序,检测圆锥动脉干畸形(CTA)患儿中ZFPM2基因的突变情况,并探讨其致病性及相关分子机制。方法对复旦大学附属儿科医院收治的非综合征型CTA患儿的心肌组织标本c DNA进行Sanger测序,检测ZFPM2基因的突变情况。构建ZFPM2、... 目的通过Sanger测序,检测圆锥动脉干畸形(CTA)患儿中ZFPM2基因的突变情况,并探讨其致病性及相关分子机制。方法对复旦大学附属儿科医院收治的非综合征型CTA患儿的心肌组织标本c DNA进行Sanger测序,检测ZFPM2基因的突变情况。构建ZFPM2、GATA4的表达载体和ANF启动子载体,并将ZFPM2突变型引入表达载体。采用免疫共沉淀(Co-IP)结合Western blotting的方法研究野生型或突变型ZFPM2与GATA4的相互作用。采用荧光素酶报告基因系统研究野生型或突变型ZFPM2对ANF启动子活性的影响。通过mRNA注射研究h ZFPM2突变对斑马鱼心脏表型的影响。结果 (1)对107例非综合征型CTA患儿进行Sanger测序,男64例,年龄1月至14岁(中位年龄8个月);包括单纯型法洛四联症(TOF)39例,TOF合并卵圆孔未闭(PFO)29例,TOF合并房间隔缺损(ASD)6例,TOF合并PFO和动脉导管未闭(PDA)8例,25例为复杂表型[如房室间隔缺损(AVSD)和左位上腔静脉(LSVC)等]。(2)在1例TOF合并PFO的患儿中,发现位于ZFPM2基因外显子4的1个杂合错义变异c.397A>Gp.M133V(rs77117583),它仅出现在东亚人群,突变频率为0.3‰,位于ZFPM2蛋白的N端转录抑制结构域,该结构域对于ZFPM2调控的GATA4依赖性转录是必需的。(3)HEK293T细胞和HL-1细胞中的Co-IP结果均表明ZFPM2发生M133V突变后与GATA4的结合增强。(4)荧光素酶报告基因实验:人胚肾细胞株HEK293T和小鼠心肌细胞株HL-1中的结果均表明,ZFPM2发生M133V突变后,其抑制GATA4对ANF的转录激活的作用增强。(5)mRNA注射斑马鱼胚胎后心脏发育畸形情况:未注射的对照组、WT组和M133V突变体组心脏畸形发生率分别为11.3%、15.0%和27.5%,M133V突变体组高于其他两组(P<0.05)。心脏异常表现为:心脏的环化发生异常,心房和心室与正常心脏呈镜像。结论在1例CTA患儿中检测到1个ZFPM2低频变异c.397A>G,p.M133V,它可能通过影响ZFPM2与GATA4的结合及GATA4转录调控来参与CTA的发生。 展开更多
关键词 圆锥动脉干畸形 zfpm2 斑马鱼 低频变异 功能研究
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黄癸素通过ZFPM2-AS1/miR-519e-5p对神经母细胞瘤细胞增殖和凋亡的影响 被引量:1
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作者 艾尼娃·克然木 阿地来古丽·艾音丁 +1 位作者 李万富 鹿洪亭 《沈阳药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期818-827,共10页
目的探讨黄癸素(luteolin)是否通过长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA)ZFPM2反义RNA 1(ZFPM2-AS1)/微小RNA(miRNA)-519e-5p轴影响神经母细胞瘤细胞的增殖和凋亡。方法将神经母细胞瘤细胞分为对照组,黄癸素低、中、高剂量组(1、2... 目的探讨黄癸素(luteolin)是否通过长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA)ZFPM2反义RNA 1(ZFPM2-AS1)/微小RNA(miRNA)-519e-5p轴影响神经母细胞瘤细胞的增殖和凋亡。方法将神经母细胞瘤细胞分为对照组,黄癸素低、中、高剂量组(1、2、8 mg·L^(-1)黄癸素),si-NC组(转染si-NC),si-ZFPM2-AS1组(转染si-ZFPM2-AS1),黄癸素高剂量+pcDNA组(8 mg·L^(-1)黄癸素处理前转染pcDNA),黄癸素高剂量+pcDNA-ZFPM2-AS1组(8 mg·L^(-1)黄癸素处理前转染pcDNA-ZFPM2-AS1),miR-NC组(转染miR-NC),miR-519e-5p组(转染miR-519e-5p mimic)。采用细胞计数试剂盒8(CCK-8)法、集落形成实验、流式细胞术、免疫印迹实验(Western blotting)和定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测神经母细胞瘤细胞的活力、集落形成、凋亡率、Bcl-2相关X蛋白(Bax)、B细胞淋巴瘤/白血病-2(Bcl-2)和ZFPM2-AS1、miR-519e-5p表达。生物信息学StarBase软件与双荧光素酶报告实验分析ZFPM2-AS1与miR-519e-5p之间的靶向结合。结果与对照组或黄癸素低剂量组相比,黄癸素中剂量组和黄癸素高剂量组神经母细胞瘤细胞OD值、集落形成数、Bcl-2蛋白、ZFPM2-AS1表达量降低,细胞凋亡率、Bax蛋白、miR-519e-5p表达量升高(P<0.05),对照组与黄癸素低剂量组各指标比较差异不显著。si-ZFPM2-AS1组神经母细胞瘤细胞中miR-519e-5p表达量、凋亡率和Bax蛋白表达量比si-NC组高,OD值、集落形成数、Bcl-2蛋白表达量比si-NC组低(P<0.05)。与黄癸素高剂量+pcDNA组相比,黄癸素高剂量+pcDNA-ZFPM2-AS1组神经母细胞瘤细胞miR-519e-5p表达量、凋亡率、Bax蛋白表达量降低,OD值、集落形成数、Bcl-2蛋白表达量升高(P<0.05)。ZFPM2-AS1可以靶向miR-519e-5p。miR-519e-5p组神经母细胞瘤细胞OD值、集落形成数、Bcl-2蛋白表达量比miR-NC组低,凋亡率、Bax蛋白表达量比miR-NC组高(P<0.05)。结论黄癸素可以通过调控ZFPM2-AS1/miR-519e-5p轴抑制神经母细胞瘤细胞的增殖并诱导其凋亡。 展开更多
关键词 黄癸素 神经母细胞瘤 增殖 凋亡 zfpm2-AS1 miR-519e-5p
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LncRNA ZFPM2-AS1对肝细胞癌的预后影响及机制研究 被引量:1
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作者 张凯楠 温雯 +2 位作者 赵辉 周亚萍 伏建峰 《新疆医科大学学报》 CAS 2022年第7期697-702,共6页
目的分析LncRNA ZFPM2反义RNA1(ZFPM2 antisense RNA1,ZFPM2-AS1)对肝细胞癌预后的影响及其潜在的致病机制。方法采用癌症基因组图谱(The cancer genome atlas,TCGA)数据库相关基因表达谱并结合临床病理学指标综合分析ZFPM2-AS1对肝细... 目的分析LncRNA ZFPM2反义RNA1(ZFPM2 antisense RNA1,ZFPM2-AS1)对肝细胞癌预后的影响及其潜在的致病机制。方法采用癌症基因组图谱(The cancer genome atlas,TCGA)数据库相关基因表达谱并结合临床病理学指标综合分析ZFPM2-AS1对肝细胞癌诊断及预后的效能及其与临床病理学指标的相关性;通过siRNA干扰ZFPM2-AS1的表达,采用5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷染色(EdU)法检测HepG2细胞增殖活力、Transwell实验检测细胞迁移和侵袭能力、免疫印迹法检测下游蛋白质表达水平的变化;通过GO和KEGG分析,初步探究ZFPM2-AS1调控肝细胞癌进程的潜在机制。结果ZFPM2-AS1在肝细胞癌组织中显著高表达(P<0.01),影响患者的生存时间(P<0.001),且与年龄(P=0.004)、T分期(P=0.011)、临床分期(P=0.033)及甲胎蛋白水平(P=0.050)密切相关。ZFPM2-AS1可促进HepG2细胞的增殖、迁移及侵袭能力,抑制B淋巴细胞瘤-2蛋白相关蛋白(BAX)、E-钙黏蛋白(E-cadherin)的表达,增强B淋巴细胞瘤-2蛋白(BCL2)、细胞周期蛋白D1(cy-clin D1)、N-钙黏蛋白(N-cadherin)的表达。GO和KEGG分析显示,ZFPM2-AS1可能与烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP)代谢过程、戊糖代谢过程、NADP结合以及氧化还原酶活性等生物学功能有关,同时与碳代谢、磷酸戊糖途径和谷胱甘肽代谢等通路密切相关。结论ZFPM2-AS1促进肝细胞癌的增殖、迁移和侵袭并参与肝细胞癌的发生、发展。 展开更多
关键词 肝细胞癌 zfpm2-AS1 致病机制
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LncRNA ZFPM2-AS1 promotes phyllodes tumor progression by binding to CDC42 and inhibiting STAT1 activation
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作者 Shishi He Guowei Huang +12 位作者 Rong Lei Rurong Jia Zhanghai He Jiewen Chen Hongyan Huang Zixian Huang Ailifeire Yilihamu Xun Li Zilin Zhuang Mengjia Han Xueman Chen Di Huang Yan Nie 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 SCIE CAS CSCD 2024年第7期2942-2958,共17页
Breast phyllodes tumor(PT)is a rare fibroepithelial neoplasm with potential malignant behavior.Long non-coding RNAs(lncRNAs)play multifaceted roles in various cancers,but their involvement in breast PT remains largely... Breast phyllodes tumor(PT)is a rare fibroepithelial neoplasm with potential malignant behavior.Long non-coding RNAs(lncRNAs)play multifaceted roles in various cancers,but their involvement in breast PT remains largely unexplored.In this study,microarray was leveraged for the first time to investigate the role of lncRNA in PT.We identified lncRNA ZFPM2-AS1 was significantly upregulated in malignant PT,and its overexpression endowed PT with high tumor grade and adverse prognosis.Furthermore,we elucidated that ZFPM2-AS1 promotes the proliferation,migration,and invasion of malignant PT in vitro.Targeting ZFPM2-AS1 through nanomaterial-mediated siRNA delivery in patient-derived xenograft(PDX)model could effectively inhibit tumor progression in vivo.Mechanistically,our findings showed that ZFPM2-AS1 is competitively bound to CDC42,inhibiting ACK1 and STAT1 activation,thereby launching the transcription of TNFRSF19.In conclusion,our study provides evidence that ZFPM2-AS1 plays a pivotal role in the pathogenesis of breast PT,and suggests that ZFPM2-AS1 could serve as a prognostic indicator for patients with PT as well as a promising novel therapeutic target. 展开更多
关键词 LncRNA Phyllodes tumor zfpm2-AS1 Cell division cycle 42 Activated cdc42 kinase 1 Signal transducer and activator of transcription 1 TNF receptor superfamily member 19 Nano particles
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室间隔缺损患者循环miRNA表达差异研究 被引量:1
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作者 许美玲 吴雪嵩 +3 位作者 朱凯 李金栋 王倩 纪龙 《泰山医学院学报》 CAS 2016年第9期961-967,共7页
目的先天性心脏病(CHD)是环境因素和遗传因素共同作用的结果。室间隔缺损(VSD)是CHD中最常见的一种。研究表明,microRNAs(miRNAs)与CHD的发生发展关系密切,但目前缺乏有关miRNAs与VSD的研究报道。本研究旨在通过血清差异miRNA的表达研... 目的先天性心脏病(CHD)是环境因素和遗传因素共同作用的结果。室间隔缺损(VSD)是CHD中最常见的一种。研究表明,microRNAs(miRNAs)与CHD的发生发展关系密切,但目前缺乏有关miRNAs与VSD的研究报道。本研究旨在通过血清差异miRNA的表达研究阐明miRNA与VSD发生发展的关系。方法采用miRNA表达谱芯片技术进行VSD患者血清miRNA表达差异分析,并对结果进行实时定量PCR(Real-time PCR)验证,进而对miRNA调控的靶基因进行生物信息学分析。结果通过miRNA芯片在VSD患者和对照血清样本中检测miRNA差异表达,筛选出36个表达差异的miRNA(P<0.05),其中21个miRNA在VSD患者表达显著下调,15个表达显著上调。经过Real-time PCR验证,证实8个miRNAs差异表达有意义。通过生物信息学预测出447个靶基因,经GO分析富集度分值(enrichment score value)最大的生物过程(biological process)为心脏右心室形态发生(cardiac right ventricle morphogenesis),对应的差异表达基因为NOTCH1、HAND1、ZFPM2和GATA3,调控这些基因的miRNA可能包括hsa-let-7e-5p、hsa-miR-222-3p和hsa-miR-433。结论通过微阵列技术分析和RT-PCR验证,筛选出8个差异表达miRNA,为后续实验提供了可供分析的miRNA。利用3个数据库及GO分析,发现hsa-let-7e-5p、hsa-miR-222-3p和hsa-miR-433的靶基因分别为NOTCH1、HAND1、ZFPM2和GATA3,为进一步在基因水平研究VSD的发病机制提供了新的突破口,为将来可能实现的基因诊断、基因干预治疗以及疾病的预防奠定了一定的实验基础。 展开更多
关键词 室间隔缺损 微小 RNA NOTCH1 HAND1 zfpm2 GATA3
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锌指蛋白作为关键蛋白在白血病患者的间充质干细胞中的表达改变
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作者 李浩江 赵小飞 王桂琴 《药物生物技术》 CAS 2023年第5期470-477,共8页
探究白血病患者中间充质干细胞(MSC)关键基因并分析其与白血病之间的关联,在数据库(GEO)搜索关键词“间充质干细胞、白血病”得到数据,R语言软件对GSE101425阵列数据处理得到MSC的基因表达情况。通过limma包筛选出组间差异基因(包括对... 探究白血病患者中间充质干细胞(MSC)关键基因并分析其与白血病之间的关联,在数据库(GEO)搜索关键词“间充质干细胞、白血病”得到数据,R语言软件对GSE101425阵列数据处理得到MSC的基因表达情况。通过limma包筛选出组间差异基因(包括对照组和诊断组之间差异基因、诊断组和复发组之间的差异基因),随后两组间差异基因通过String在线数据库分析得到蛋白质互作网络(PPI)。在此基础上通过PPI对已有的差异基因进行扩充,将扩充后的差异基因上传至DAVID在线数据库进行在线生物学分析(包括生物学过程、细胞成分、分子功能、KEGG)。在随后的分析中,取两组之间的差异基因的集合,并定义其为关键差异基因,利用UniGene搜索库对锌指蛋白进行细胞亚结构的定位。在最后的动物实验中,通过细胞学染色和蛋白质印迹技术(WB)对关键差异基因进行验证。最后将锌指蛋白上传至String数据库并分析相关蛋白在白血病发生过程中的改变。GSE101425数据集包括4组,对照组比较诊断组间共有差异基因35个,其中表达升高17个,表达降低18个;诊断组比较复发组共有差异基因15个,其中表达升高有9个,表达降低有6个。String数据库对差异基因进行扩充后,对照组比较诊断组共有差异基因60个,诊断组比较复发组共有差异基因35个。DAVID对前者差异基因分析后其集中于免疫应答(生物功能)、细胞质膜(细胞成分)、蛋白结合(分子功能)、细胞粘附(KEGG)。DAVID对后者差异基因分析后其集中于mRNA剪切(生物功能)、核质(细胞成分)、蛋白结合(分子功能)、剪切(KEGG)。两组差异基因取交集得到4个关键差异基因,并对差异基因中关键基因锌指蛋白(ZFPM2)进行体外细胞学实验验证,发现白血病患者中间充质干细胞的改变和白血病的发生呈负相关,ZFPM2主要存在于细胞核中。并同时String数据库搜索ZFPM2相关蛋白,验证了锌指蛋白转录因子(GATA4和GATA6)的改变。通过生物信息学和实验的验证发现白血病患者中间充质干细胞中锌指蛋白表达的改变和疾病的发生呈负相关,为研究白血病微环境中间充质干细胞对肿瘤发展的影响提供了参考。 展开更多
关键词 白血病 R语言 生物信息学分析 间充质干细胞 差异基因 关键差异基因 锌指蛋白
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去氧鬼臼毒素对结肠癌细胞增殖、迁移及侵袭的影响 被引量:1
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作者 申慧彬 申浩 李元平 《中华生物医学工程杂志》 CAS 2020年第6期520-525,共6页
目的探讨去氧鬼臼毒素(DPPT)是否通过调控长链非编码RNA ZFPM2-AS1(LncRNA ZFPM2-AS1)/微小RNA-515-5p(miR-515-5p)分子轴而抑制结肠癌细胞增殖、迁移及侵袭。方法体外培养人结肠癌LoVo细胞,随机分为Control组、DPPT-L组、DPPT-M组、DPP... 目的探讨去氧鬼臼毒素(DPPT)是否通过调控长链非编码RNA ZFPM2-AS1(LncRNA ZFPM2-AS1)/微小RNA-515-5p(miR-515-5p)分子轴而抑制结肠癌细胞增殖、迁移及侵袭。方法体外培养人结肠癌LoVo细胞,随机分为Control组、DPPT-L组、DPPT-M组、DPPT-H组。甲基噻唑基四唑(MTT)检测细胞增殖;Transwell小室实验检测迁移及侵袭;实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测ZFPM2-AS1、miR-515-5p的表达水平;LoVo细胞中转染pcDNA-ZFPM2-AS1,采用上述方法检测细胞增殖、迁移及侵袭;双荧光素酶报告实验验证ZFPM2-AS1、miR-515-5p的靶向关系;蛋白免疫印迹法(Western blot)检测细胞周期蛋白1(CyclinD1)、基质金属蛋白酶-2(MMP-2)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、P21的表达量。结果与Control组比较,DPPT-L组、DPPT-M组、DPPT-H组细胞存活率降低(P<0.05),迁移细胞数、侵袭细胞数减少(P<0.05),CyclinD1、MMP-2、MMP-9蛋白水平降低(P<0.05),P21蛋白水平升高(P<0.05),ZFPM2-AS1表达水平降低(P<0.05),miR-515-5p表达水平升高(P<0.05),且DPPT-L组、DPPT-M组、DPPT-H组上述指标比较,差异均有统计学意义(P<0.05);ZFPM2-AS1可靶向结合miR-515-5p;与DPPT-H+pcDNA组比较,DPPT-H+pcDNA-ZFPM2-AS1组细胞存活率升高(P<0.05),迁移细胞数、侵袭细胞数增多(P<0.05),CyclinD1、MMP-2、MMP-9蛋白水平升高(P<0.05),P21蛋白水平降低(P<0.05)。结论DPPT可能通过下调ZFPM2-AS1的表达及上调miR-515-5p的表达从而抑制结肠癌细胞增殖、迁移及侵袭。 展开更多
关键词 去氧鬼臼毒素 LncRNA zfpm2-AS1 miR-515-5p 结肠肿瘤 增殖 迁移 侵袭
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