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不同禾本科作物中ZmWRKY79同源基因的鉴定与分析 被引量:1
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作者 卢源达 陈玲 +10 位作者 杜云龙 刘学思 柯学 赵建屛 吴洪钦 刘鑫 李玉琢 朱文强 邢世军 程在全 钟巧芳 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期522-531,共10页
【目的】玉米ZmWRKY79基因在合成植保素和干旱胁迫响应中发挥重要作用。文章旨在通过生物信息学技术从不同禾本科作物中挖掘更多的ZmWRKY79同源基因,为玉米及其它禾本科作物提供抗逆境胁迫的候选基因。【方法】从NCBI数据库中获取玉米Zm... 【目的】玉米ZmWRKY79基因在合成植保素和干旱胁迫响应中发挥重要作用。文章旨在通过生物信息学技术从不同禾本科作物中挖掘更多的ZmWRKY79同源基因,为玉米及其它禾本科作物提供抗逆境胁迫的候选基因。【方法】从NCBI数据库中获取玉米ZmWRKY79同源基因的基本信息,并对其进行染色体定位、基因结构可视化、功能结构域预测、进化关系分析、亚细胞定位预测、启动子顺式作用元件预测及非生物胁迫表达预测。【结果】在玉米、谷子、高粱、青稞、野生二粒小麦、普通小麦、水稻作物中共鉴定到9个ZmWRKY79同源基因,这些基因结构相似性较高,分布于不同的染色体上,且均属于第III类WRKY转录因子。系统进化分析结果显示ZmWRKY79蛋白同源序列可被分为I和II类,不同成员间进化受纯化选择,其中ZmWRKY79蛋白与高粱SbWRKY54蛋白同源性较高,达到81.58%。亚细胞定位预测显示所有ZmWRKY79同源蛋白均在细胞核,说明ZmWRKY79同源基因均在细胞核中发挥功能。启动子顺式作用元件预测显示ZmWRKY79同源基因的启动中主要包含组织特异性元件、应激响应元件和激素响应元件。非生物胁迫表达预测表明,ZmWRKY53和ZmWRKY74 2个ZmWRKY79的同源基因被确定为受逆境胁迫诱导。【结论】在7种禾本科作物中鉴定到9个ZmWRKY79同源基因,这些同源基因可能具有抗逆功能,为禾本科作物抗逆研究提供了更多的基因选择。 展开更多
关键词 玉米 zmwrky79 同源基因 生物信息学
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玉米ZmWRKY36基因的生物信息学及功能分析
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作者 王文丽 穆春华 +7 位作者 张发军 刘霞 冷冰莹 姚国旗 闫振伟 刘巍 王昀 张恩盈 《山东农业科学》 北大核心 2023年第12期1-8,共8页
作为植物转录因子家族最大的成员之一,WRKY蛋白在植物的生长发育、防御反应以及胁迫响应中都发挥着极为关键的作用.本研究以玉米自交系B73为材料,克隆了一个玉米WRKY转录因子Zm-WRKY36,并对其进行生物信息学与功能分析.结果表明,ZmWRKY3... 作为植物转录因子家族最大的成员之一,WRKY蛋白在植物的生长发育、防御反应以及胁迫响应中都发挥着极为关键的作用.本研究以玉米自交系B73为材料,克隆了一个玉米WRKY转录因子Zm-WRKY36,并对其进行生物信息学与功能分析.结果表明,ZmWRKY36基因的开放阅读框为1002 bp,编码333个氨基酸.ZmWRKY36蛋白分子量为35.8 kDa,理论等电点为5.66,属于酸性蛋白;不稳定系数为67.16,为极不稳定蛋白;亲水指数为-0.526,为亲水性蛋白;具有1个WRKY结构域和1个C2 HC锌指结构基序,属于WRKY转录因子Ⅲ类亚家族成员;与高粱SbWRKY64、稷PmWRKY4和狗尾草SvWRKY4有着较近的亲缘关系.进一步分析发现,ZmWRKY36蛋白定位于细胞核内,并且有着较强的转录激活活性.qRT-PCR结果显示,ZmWRKY36基因在玉米根和叶中表达量较高,具有组织特异性;并且受到干旱胁迫和盐胁迫的显著诱导,表明转录因子ZmWRKY36可能在玉米抵御外界干旱胁迫和盐胁迫的过程中发挥着重要作用. 展开更多
关键词 玉米 zmwrky36 生物信息学分析 功能分析 干旱胁迫 盐胁迫
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ZmWRKY104 positively regulates salt tolerance by modulating ZmSOD4 expression in maize 被引量:8
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作者 Jingwei Yan Jing Li +2 位作者 Heping Zhang Ya Liu Aying Zhang 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2022年第2期555-564,共10页
Salinity impairs plant growth, limiting agricultural development. It is desirable to identify genes responding to salt stress and their mechanism of action. We identified a function of the Zea mays WRKY transcription ... Salinity impairs plant growth, limiting agricultural development. It is desirable to identify genes responding to salt stress and their mechanism of action. We identified a function of the Zea mays WRKY transcription factor, Zm WRKY104, in salt stress response. Zm WRKY104 was localized in the nucleus and showed transcriptional activation activity. Phenotypic and physiological analysis showed that overexpression of Zm WRKY104 in maize increased the tolerance of maize to salt stress and alleviated salt-induced increases in O;accumulation, malondialdehyde(MDA) content, and percent of electrolyte leakage. Further investigation showed that Zm WRKY104 increased SOD activity by regulating Zm SOD4 expression. Yeast onehybrid, electrophoretic mobility shift test, and chromatin immunoprecipitation–quantitative PCR assay showed that Zm WRKY104 bound directly to the promoter of Zm SOD4 by recognizing the W-box motif in vivo and in vitro. Phenotypic, physiological, and biochemical analysis showed that Zm SOD4 increased salt tolerance by alleviating salt-induced increases in O;accumulation, MDA content, and percent of electrolyte leakage under salt stress. Taken together, our results indicate that Zm WRKY104 positively regulates Zm SOD4 expression to modulate salt-induced O;accumulation, MDA content, and percent of electrolyte leakage, thus affecting salt stress response in maize. 展开更多
关键词 Zea mays zmwrky104 ZmSOD4 Salt tolerance
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异源表达玉米ZmWRKY114基因增强拟南芥对盐胁迫的敏感性 被引量:5
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作者 蔡荣号 李尉 +4 位作者 陈浩伟 罗国伟 戴浩然 宋文雷 伯晨 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2019年第6期1040-1047,共8页
WRKY转录因子参与调控植物对各种非生物胁迫的应答反应。从玉米中分离得到一个响应高盐胁迫的WRKY基因,将其命名为ZmWRKY114。亚细胞定位实验表明ZmWRKY114定位于细胞核内且和ZmCaM2可以发生相互作用。为进一步研究ZmWRKY114基因的生物... WRKY转录因子参与调控植物对各种非生物胁迫的应答反应。从玉米中分离得到一个响应高盐胁迫的WRKY基因,将其命名为ZmWRKY114。亚细胞定位实验表明ZmWRKY114定位于细胞核内且和ZmCaM2可以发生相互作用。为进一步研究ZmWRKY114基因的生物学功能,将ZmWRKY114基因构建到植物表达载体p CAMBIA1301上,并采用农杆菌转化法转化拟南芥,扩繁后对T3代转基因拟南芥进行了耐盐性试验。结果表明,转基因株系的绿苗率在高盐胁迫条件下显著低于野生型拟南芥,并且高盐胁迫对转基因拟南芥的主根抑制程度更大。同时,ZmWRKY114在拟南芥中的异源过表达还可以导致丙二醛的积累和相对电解质渗透率的增加,从而使转基因植物对盐胁迫的耐受性显著降低。上述结果表明ZmWRKY 114基因可能是盐胁迫反应的负调控因子。 展开更多
关键词 玉米 zmwrky114基因 亚细胞定位 蛋白互作 盐胁迫
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玉米ZmWRKY45基因克隆及盐碱逆境胁迫下的表达分析 被引量:1
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作者 吕庆雪 高嵩 +8 位作者 何欢 孙蕾 李毅丹 才卓 徐国良 张建新 林志 宋广树 刘文国 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期28-32,共5页
通过水稻中OsWRKY45基因在NCBI中进行同源序列比对,电子克隆ZmWRKY45基因并与其他物种中的同源基因进行进化树分析。利用该基因的CDS区设计特异引物,在3叶期对吉单441进行不同浓度NaHCO_3处理,对玉米杂交种吉单441及其双亲自交系进行验... 通过水稻中OsWRKY45基因在NCBI中进行同源序列比对,电子克隆ZmWRKY45基因并与其他物种中的同源基因进行进化树分析。利用该基因的CDS区设计特异引物,在3叶期对吉单441进行不同浓度NaHCO_3处理,对玉米杂交种吉单441及其双亲自交系进行验证。结果表明,在吉单441及其父本中含有ZmWRKY45,在盐碱胁迫下吉单441中该基因随着盐碱浓度的升高而表达量升高,初步判断该基因可能在吉单441的耐盐碱过程中起到正向调控作用。 展开更多
关键词 玉米 zmwrky45基因 电子克隆 盐碱胁迫
原文传递
异源表达玉米ZmWRKY11基因增强拟南芥对盐胁迫的耐受性 被引量:1
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作者 蔡荣号 伯晨 马庆 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期34-38,共5页
从玉米中分离得到响应高盐胁迫的WRKY基因,将其命名为ZmWRKY11。构建过量表达载体pCAMBIA1301-ZmWRKY11,采用花序侵染法转化拟南芥,研究ZmWRKY11基因的生物学功能,扩繁后对T3代转基因植株进行耐盐鉴定试验。结果表明,转基因株系的绿苗... 从玉米中分离得到响应高盐胁迫的WRKY基因,将其命名为ZmWRKY11。构建过量表达载体pCAMBIA1301-ZmWRKY11,采用花序侵染法转化拟南芥,研究ZmWRKY11基因的生物学功能,扩繁后对T3代转基因植株进行耐盐鉴定试验。结果表明,转基因株系的绿苗率在盐胁迫处理后显著高于野生型拟南芥,同时,野生型株系中丙二醛含量和相对电解质渗透率相较于转基因植株发生了更为显著的上升,但脯氨酸含量的上升幅度则小于转基因株系。结果表明,ZmWRKY11在拟南芥中的异源过表达增强了转基因植物对盐胁迫的耐受性。 展开更多
关键词 玉米 zmwrky11基因 亚细胞定位 蛋白互作 盐胁迫
原文传递
一个新的玉米WRKY基因识别及其生物信息学分析 被引量:4
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作者 胡守景 张治礼 《江西农业学报》 CAS 2008年第6期23-26,共4页
利用电子克隆技术从玉米EST库中发现了一个新的玉米WRKY基因ZmWRKY。生物信息学分析表明,该基因编码一个由302个氨基酸组成的、相对分子质量为32.5 kD的蛋白,具有一个由60个氨基酸组成的WRKY结构域(155~214),定位于细胞核,具有转录... 利用电子克隆技术从玉米EST库中发现了一个新的玉米WRKY基因ZmWRKY。生物信息学分析表明,该基因编码一个由302个氨基酸组成的、相对分子质量为32.5 kD的蛋白,具有一个由60个氨基酸组成的WRKY结构域(155~214),定位于细胞核,具有转录调控功能。序列分析表明,该蛋白与同科植物水稻OsWRKY76基因具有较高的同源性,推测其可能参与植物病害防御信号的传导过程,在植物生物胁迫防御中发挥作用。 展开更多
关键词 电子克隆 zmwrky 生物信息学 玉米
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