实时荧光定量PCR检测多重耐药大肠杆菌AcrA基因mRNA表达水平

体外单一药物诱导标准大肠杆菌ATCC25922,获得了耐氯霉素(CHL,MIC≥256 mg/L)、耐环丙沙星(CIP,MIC≥256 mg/L)、耐水杨酸钠(SAL,MIC≥275 mg/L)、耐四环素(T,MIC≥512 mg/L)的菌株。选取ATCC25922株,4株中度耐药菌SAL(175)、CHL(64)、T(64)、CIP(128),4株高度耐药菌SAL(275)、CHL(256)、T(512)、CIP(256),和临床分离的3株耐药大肠杆菌H1、H9、H10,通过实时荧光定量RT-PCR方法检测外输泵AcrA基因的mRNA表达水平。系统自动分析软件显示,Ct值与标准质粒浓度的对数之间存在良好的线性关系,回归系数为0.992。检测结果表明:H10、CHL(256)、CIP(256)拷贝数最高,达1015拷贝/μL;T(512)、H9、T(128)、SAL(275)、H1为1014拷贝/μL;CHL(128)、T(64)、CHL(64)为1013拷贝/μL;ATCC25922为1012拷贝/μL。不同程度耐药株AcrA基因的表达量不同,临床分离株和诱导的各高耐药菌株均比ATCC25922株表达量高,且差异极显著(P≤0.01)。这说明不同耐药程度的11株菌cDNA的量存在差异,AcrA基因转录水平与耐药水平成正相关。

大肠杆菌多重耐药基因AcrA、AcrB内标准DNA的构建

在克隆AcrA、AcrB部分基因片段并进行基因及编码蛋白的同源性分析的基础上,设计合成构建AcrA、AcrB的内标准DNA所需引物,经过3次(12个)PCR成功地合成了AcrA、AcrB的内标准DNA。合成法构建定量RT-PCR内标准DNA快捷、成功率高。

中药复方制剂对大肠埃希菌多重耐药基因AcrA的影响

试验分别用精提和粗提的中药复方制剂"连黄"作用多重耐药的大肠埃希菌,提取其基因组DNA,并以大肠埃希菌AcrA的编码序列设计引物,成功扩增出AcrA基因中1 005bp大小的片段,与中药作用前的多重耐药基因AcrA的碱基序列进行对比分析,从分子生物学水平上探讨中药复方制剂对大肠埃希菌多重耐药基因AcrA的影响。结果表明,精提和粗提的中药复方制剂均能改变AcrA基因的编码序列,但精提制剂较粗提制剂对AcrA基因的影响更大。

连翘对大肠埃希菌多重耐药基因AcrA的影响研究

为了研究和开发理想的大肠埃希菌多重耐药抑制剂,用连翘作用于多重耐药大肠埃希菌,提取其基因组DNA,并以大肠埃希菌AcrA基因的编码序列设计引物,成功扩增出AcrA基因中1005bp的片段,与多重耐药菌种中的AcrA基因序列进行对比。结果表明,连翘改变AcrA基因的编码序列,并能有效抑制多重耐药大肠埃希菌的生长,减弱其耐药性。

福氏志贺菌主动外排基因acrA的克隆及原核表达

目的对福氏志贺菌外排基因acrA进行克隆和原核表达,为进一步研究其在志贺菌外排机制中的作用奠定基础。方法参考福氏志贺菌2aacrA基因序列设计一对特异引物,在引物的5′和3′端分别加入含有BamHⅠ和SalⅠ限制性酶切位点序列。以福氏志贺菌2a菌株基因组DNA为模板,通过PCR扩增acrA基因并与pMD18-T载体连接,然后转化DH5α。提取重组质粒pMD18-acrA,经BamHI/SalI双酶切并与载体pET30a连接后转化宿主菌BL21(DE3)pLys,通过IPTG诱导表达目的蛋白。结果克隆的acrA基因长度为1122bp,核苷酸序列与GenBank上公布的序列完全相同。原核表达经SDS-PAGE及WesternBlotting检测和鉴定,结果表明重组载体pET-30a-acrA可成功地在大肠杆菌中表达AcrA蛋白。结论成功构建了福氏志贺菌acrA基因的原核表达质粒,并在大肠杆菌中得到有效表达,该研究为了解AcrA蛋白的特性、功能以及对福氏志贺菌多药耐药机理的深入研究奠定了基础。

大肠杆菌acrA基因的重组表达及其抗体的制备

以大肠杆菌E. coli ATCC25922株的染色体DNA为模板,PCR扩增AcrA蛋白部分基因,获得约691bp的DNA片段。将PCR产物克隆至pMD18-T载体中测序,并进一步将acrA亚克隆于pET28a原核表达载体中,进行该基因的诱导表达。表达的产物经SDS-聚丙酰胺凝胶电泳分析,可见一条约33ku的特异性蛋白条带。用纯化的acrA基因原核表达产物免疫獭兔,ELISA法检测不同时期獭兔抗体效价。蛋白质印迹结果表明,用表达的AcrA蛋白制备的acrA抗体能够用于检测大肠杆菌AcrA蛋白的表达水平。

不同源性大肠杆菌多药耐药基因AcrA、AcrB部分基因的同源性分析

通过聚合酶链式反应从不同源性大肠杆菌的染色体DNA上扩增出大肠杆菌多药耐药基因AcrA、AcrB的部分片段 ,将该片段分别连接到克隆载体pMD_18T的BamHI、XhoI酶切位点中 ,测定插入片段的核苷酸序列 ,并分别推导出其氨基酸序列。序列分析表明 :不同源性大肠杆菌的AcrA的部分基因的核苷酸序列及所推导的氨基酸序列与GeneBank中该基因序列的同源性较高 ;不同源性大肠杆菌的AcrB的部分基因的核苷酸序列的同源性较低 。

鸡沙门菌环丙沙星耐药株acrA基因突变特征分析

提取体外诱导的3株不同耐药水平鸡源性沙门菌环丙沙星耐药株的染色体DNA(分别为16×MIC、64×MIC、128×MIC)。设计引物acrAF和acrAR,对耐药菌株acrA全基因序列进行克隆及序列分析。与质控菌株C79-13相比,菌株16×MIC的acrA基因第121位碱基发生T→C突变;菌株64×MIC的acrA基因第393位碱基发生C→T突变,第1109位碱基发生A→G突变;菌株128×MIC的acrA基因第1121位碱基发生C→T突变。菌株16×MIC的碱基突变导致acrA基因的第40位氨基酸发生M→T取代,即Met→Thr;菌株64×MIC的碱基突变导致acrA基因的第131位氨基酸发生A→C取代,即Arg→Cys;而菌株128×MIC碱基突变并没有导致相应氨基酸的改变。上述结果提示,acrA基因的突变可能并非鸡源性沙门菌耐药性产生的主要原因。

溶藻弧菌HY9901 AcrA基因克隆与序列分析(英文)

Touchdown PCR扩增溶藻弧菌HY9901 AcrA基因部分序列,得一460 bp片段,再以反向PCR和巢式PCR联合扩增其侧翼序列,拼接得一由1101 nt组成,共编码366 aa的完整基因。该基因演绎的氨基酸序列与几种弧菌的同源性都比较高,与创伤弧菌YJ016、副溶血弧菌RIMD 2210633、灿烂弧菌12B01、霍乱弧菌O1 N16961同源性分别为76%、73%、71%和70%。

大肠杆菌多重耐药基因AcrA的PCR检测

临床分离的大肠杆菌多重耐药菌株越来越多,大肠杆菌形成多重耐药的原因主要与大肠杆菌染色体上存在的AcrAB外排系统有关。本试验首先用环丙沙星、四环素和氯霉素对敏感大肠杆菌进行多重耐药诱导,使敏感大肠杆菌具有了多重耐药性。然后对多重耐药性大肠杆菌的基因组DNA进行了提取,以基因库中AcrA基因的编码序列设计引物,以多重耐药性大肠杆菌基因组为模板,对AcrA基因进行了PCR扩增和测序,得到了1005bp的片断,并与基因库中AcrA基因的序列进行了比较,同源性为99.8%。结果表明:AcrA基因与大肠杆菌的耐药性有关。

副猪嗜血杆菌15个血清型参考菌株acrA基因序列分析

acrA基因在细菌多重耐药中起重要作用。利用PCR扩增副猪嗜血杆菌15个血清型标准菌株acrA基因，应用ClustalW进行氨基酸进化距离分析和同源性分析，绘制进化树。序列测定与分析表明，aC—rA基因在副猪嗜血杆菌15个标准菌株中都存在，其中，血清5型、8型、14型有2个拷贝（acrA1和acrA2）。进化距离分析表明不同血清型之间AcrA1氨基酸序列有较大的差异，同源性为89．8％～100％。同一血清型副猪嗜血杆菌aerA1和acrA2氨基酸同源性低于30％，但都位于比较保守的基因座上，这是首次发现副猪嗜血杆菌会存在2个acrA基因。本研究为副猪嗜血杆菌多重耐药机制的研究提供了理论基础，同时对新型抗菌药物的研发也具有重要的参考价值。

苦丁茶和小飞扬草对多重耐药性大肠杆菌外排泵acrA基因表达的影响

目的探讨苦丁茶、小飞扬草水提物对多重耐药性大肠杆菌外排泵acrA基因表达的影响。方法用纸片扩散法筛选多重耐药性大肠杆菌,试管二倍稀释法检测苦丁茶、小飞扬草水提物和阿莫西林对多重耐药菌株的最低抑菌浓度(MIC),用1/2 MIC浓度的苦丁茶、小飞扬草水提物干预多重耐药菌株,72 h后检测阿莫西林的MIC;选取苦丁茶和小飞扬草干预前后的耐药菌株进行荧光实时定量PCR检测外排泵基因acrA mRNA的表达。结果筛选出3株多重耐药性大肠杆菌,苦丁茶或小飞扬草干预后阿莫西林对多重耐药株的MIC明显低于干预前(P<0.05);苦丁茶或小飞扬草干预后acrA mRNA的表达量均较干预前明显降低(P<0.05)。结论苦丁茶和小飞扬草对多重耐药性大肠杆菌有明显抑制作用,其机制可能是与通过降低多重耐药性大肠杆菌外排泵acrA基因mRNA的表达量有关。

中药提取物对耐药大肠杆菌MIC及acrA基因表达量的影响

通过亚抑菌浓度中药提取物处理大肠杆菌耐药菌,利用荧光定量PCR技术检测其外排泵基因acrA表达量的变化及试管二倍稀释法测定乳酸环丙沙星对处理前后细菌MIC的变化。结果显示,经亚抑菌浓度中药提取物处理后的耐药大肠杆菌其acrA基因表达量存在显著变化。其中经中药A,I,S,X处理过的大肠杆菌外排泵基因表达量分别降低到原来的0.20,0.16,0.05和0.24倍,表明亚抑菌浓度中药提取物对大肠杆菌耐药菌的外排泵基因表达量有明显的抑制作用,提示在中药提取物中寻找大肠杆菌耐药外排泵抑制剂有一定前景。

大肠杆菌多药耐药基因AcrA的克隆及其原核表达

从大肠杆菌 Acr A的编码序列中设计引物 ,以大肠杆菌基因组为模板 ,扩增出 Acr A基因中约 6 91 bp的 c DNA片段 ,将所得片段与 p MD- 1 8T载体连接 ,转化到 DH5α大肠杆菌中 ,成功地筛选到阳性克隆 ,其质粒测序结果与文献报道一致。从阳性克隆中提取质粒 ,经 Hind 和 Bam H 酶解 ,回收 6 91 bp的目的片段 ,定向克隆到 p ET- 2 8a表达载体中 ,提取质粒 ,再次转化到 BL2 1 (DE3)中 ,成功地筛选出阳性克隆。经 IPTG诱导阳性菌 ,通过 SDS- PAGE检测出Acr