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利用CRISPR/Cas9编辑系统构建ACTA1基因敲除的PEFs细胞系
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作者 张雪萍 刘嘉仪 +1 位作者 王彦芳 吴添文 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期2273-2284,共12页
【目的】利用CRISPR/Cas9技术获得α-肌动蛋白1(actin alpha 1,ACTA1)基因敲除的猪胎儿成纤维细胞(porcine embryo fibroblasts, PEFs),为后续在细胞水平上探究猪ACTA1基因功能及发掘友好基因座位奠定基础。【方法】通过实时荧光定量PC... 【目的】利用CRISPR/Cas9技术获得α-肌动蛋白1(actin alpha 1,ACTA1)基因敲除的猪胎儿成纤维细胞(porcine embryo fibroblasts, PEFs),为后续在细胞水平上探究猪ACTA1基因功能及发掘友好基因座位奠定基础。【方法】通过实时荧光定量PCR检测ACTA1基因在巴马小型猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背部皮下脂肪和背最长肌7种组织中的表达情况;利用CRISPOR在线网站在猪ACTA1基因第7外显子区域设计3条向导RNA(single guide RNA,sgRNA),并将其连接至pX330载体;通过T7E1酶切检测不同sgRNA活性,选择效率较高且符合目标的载体质粒共转染至PEFs中;利用有限稀释法筛选单克隆细胞,并对获得的单克隆细胞进行基因型鉴定和脱靶分析。【结果】实时荧光定量PCR结果表明,ACTA1基因在背最长肌中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01)。设计的3条sgRNA的基因编辑效率分别为24.87%(sgRNA1)、39.59%(sgRNA2)、36.93%(sgRNA3),综合切割位置和基因编辑效率,选用sgRNA1和sgRNA2共转染细胞。基因型鉴定结果表明,获得的69株单克隆细胞中有20株单克隆细胞发生了编辑,其中单等位基因片段敲除细胞3株,双等位基因片段敲除细胞1株,片段敲除效率为5.8%(4/69)。脱靶分析结果显示,在预测的脱靶位点未检测到脱靶效应。【结论】本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑系统成功构建了ACTA1基因纯合敲除的PEFs,研究结果为进一步探究ACTA1基因对猪骨骼肌发育调控提供了技术支撑和理论基础,同时为挖掘猪组织特异性表达的友好位点提供新思路。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 acta1基因 猪胎儿成纤维细胞(PEFs)
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产单核细胞李斯特菌actA基因在大肠杆菌中的表达及其单克隆抗体的研制 被引量:8
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作者 殷月兰 董慧 +5 位作者 焦新安 焦红梅 顾志强 袁舟 张晨菊 征超峰 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期999-1002,共4页
利用PCR技术从血清型1/2a的产单核细胞李斯特菌Lm-4株中扩增出actA基因,经克隆筛选和测序鉴定后,构建成该基因的原核表达载体pGEX-6P-1-actA及pET-actA,转入E.coli后,IPTG诱导目的蛋白的表达。SDS-PAGE结果表明,actA基因在两种... 利用PCR技术从血清型1/2a的产单核细胞李斯特菌Lm-4株中扩增出actA基因,经克隆筛选和测序鉴定后,构建成该基因的原核表达载体pGEX-6P-1-actA及pET-actA,转入E.coli后,IPTG诱导目的蛋白的表达。SDS-PAGE结果表明,actA基因在两种载体中均获得表达,融合蛋白的大小分别约为120kDa和97kDa。以纯化蛋白为材料进行了AetA单抗的研制,获得4株抗ActA的单克隆抗体杂交瘤细胞株,腹水单抗ELISA效价为1:5×10^4-1:1×10^5。选取单抗1A5进行Western blot分析,结果表明单抗1A5能和表达产物进行特异性反应,且与Lm-4多抗血清的Western blot结果一致。actA基因的原核表达及单抗的研制为研究ActA蛋白的生物学活性及其致病作用奠定了基础。 展开更多
关键词 产单核细胞李斯特菌 acta基因 表达 单克隆抗体
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单核细胞增生李斯特菌毒力基因inlB/actA双缺失突变株的构建 被引量:4
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作者 王莉 冯飞飞 +4 位作者 张强 冯莹颖 邓灵福 张晓莉 罗勤 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期182-185,共4页
单核细胞增生李斯特菌inlB和actA毒力基因的编码产物InlB和ActA是与其致病性相关的重要毒力因子,与该菌在细胞间扩散、传播有着直接的关系,其中肌动蛋白聚集因子ActA是细菌由细胞浆扩散至相邻细胞所必须的因子,而内化素InlB在对肝细胞... 单核细胞增生李斯特菌inlB和actA毒力基因的编码产物InlB和ActA是与其致病性相关的重要毒力因子,与该菌在细胞间扩散、传播有着直接的关系,其中肌动蛋白聚集因子ActA是细菌由细胞浆扩散至相邻细胞所必须的因子,而内化素InlB在对肝细胞的侵袭过程中起着重要作用。本研究中利用同源重组技术在inlB缺失菌株基础上成功构建了毒力基因inlB和actA双缺失的突变株,获得减毒突变株,为构建预防人类和动物疾病的疫苗载体奠定了基础。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特菌 基因敲除 inlB基因 acta基因 同源重组
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GFP用于单核细胞增生李斯特菌PrfA调控毒力基因actA转录表达的研究 被引量:1
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作者 冯莹颖 张晓莉 +4 位作者 张强 罗勤 蒋苹 钱悦 冯爱平 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期139-143,共5页
PrfA是单核细胞增生李斯特菌(LM)中迄今为止发现的惟一个调控绝大多数毒力基因转录表达的蛋白因子。为了研究PrfA转录调控毒力基因表达的分子机制,将无启动子的绿色荧光蛋白(GFP)基因与毒力基因actA的启动子融合,连接到穿梭载体pLSV16... PrfA是单核细胞增生李斯特菌(LM)中迄今为止发现的惟一个调控绝大多数毒力基因转录表达的蛋白因子。为了研究PrfA转录调控毒力基因表达的分子机制,将无启动子的绿色荧光蛋白(GFP)基因与毒力基因actA的启动子融合,连接到穿梭载体pLSV16质粒上,构建成表达融合载体pLSV16-PactA-gfp,然后将其电转化入LM野生株P14、PrfA高表达突变株P14a和prfA基因等位缺失突变株A42中表达。利用荧光显微镜和荧光酶标仪检测上述3株细菌中绿色荧光蛋白的不同表达强度,从而评价actA基因依赖于PrfA的转录活性强弱。结果显示,绿色荧光蛋白在P14a中发出的荧光强度最高,P14次之,A42最弱,两两比较均有显著差异(P<0.01),表明毒力基因actA的转录水平高低与PrfA的活性成正相关,其转录表达依赖于PrfA的调控;该试验同时也显示GFP能方便、有效地用于研究PrfA调控LM不同毒力基因的转录表达水平。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特菌 PrfA acta毒力基因 绿色荧光蛋白报告基因 转录调控
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单增李斯特氏菌actA基因的克隆及原核表达
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作者 张辉 王兴龙 +5 位作者 王俊霞 李晓艳 卜昭阳 张爱玲 崔丽瑾 闫广谋 《畜牧与兽医》 北大核心 2008年第3期14-17,共4页
利用PCR技术从单增李斯特氏菌中扩增出actA基因,将PCR产物纯化后克隆到pMD 18Tsimple vector中,成功构建出克隆载体pMD-18T/actA。以BamHⅠ和EcoRⅠ分别双酶切pMD-18T/ActA和表达载体pGEX-3X,将纯化的actA基因亚克隆到表达载体pGEX-3X... 利用PCR技术从单增李斯特氏菌中扩增出actA基因,将PCR产物纯化后克隆到pMD 18Tsimple vector中,成功构建出克隆载体pMD-18T/actA。以BamHⅠ和EcoRⅠ分别双酶切pMD-18T/ActA和表达载体pGEX-3X,将纯化的actA基因亚克隆到表达载体pGEX-3X。构建的重组表达载体pGEX-3X/ActA转化到E.coli BL21(DE3)中,IPTG诱导表达,表达产物进行SDS-PAGE分析,可见约120 ku外源蛋白带,Western blot分析表明该蛋白可与单增李斯特氏菌多克隆抗体发生特异性反应。该研究为ActA的生物学特性和功能的研究及诊断试剂的研制奠定了基础。 展开更多
关键词 单增李斯特氏菌 acta基因 克隆 原核表达
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基于ActA基因的单核细胞增多性李斯特菌的序列分型研究 被引量:5
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作者 曾海燕 《青海大学学报(自然科学版)》 2006年第3期29-33,共5页
根据单核细胞增多性李斯特菌ActA基因序列保守区设计一对引物,对21个菌株进行PCR扩增,得到长度为820bp的片段。PCR产物经过纯化后直接测序,并对其中的506bp进行同源性分析。结果表明单核细胞增多性李斯特菌分离株具有5个明显不同的... 根据单核细胞增多性李斯特菌ActA基因序列保守区设计一对引物,对21个菌株进行PCR扩增,得到长度为820bp的片段。PCR产物经过纯化后直接测序,并对其中的506bp进行同源性分析。结果表明单核细胞增多性李斯特菌分离株具有5个明显不同的克隆谱系,每个谱系的同源性均在95%~100%。16个单核细胞增多性李斯特菌奶相关和环境分离株可被分成4个谱系,其中2个谱系(C、D)均为奶相关分离株和成品奶分离株;加工厂地面污水分离株为独立的一个谱系。初步表明,成品奶中污染的单核细胞增多性李斯特菌来自于奶牛场,而非加工环境。 展开更多
关键词 单核细胞增多性李斯特菌 acta基因 序列分型
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基于单核细胞增生李斯特菌actA基因的环介导等温扩增技术快速检测方法的建立 被引量:7
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作者 胡仲皓 单兴根 +2 位作者 何晓花 吴金节 胡青海 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期47-52,共6页
单核细胞增生李斯特菌(Lm)是主要的食源性致病菌之一,也是一种重要的人畜共患病原菌,感染人和动物后主要表现为败血症、脑膜炎和单核细胞增多症等。为建立快速检测Lm的方法,本研究以Lm毒力因子actA作为特异性检测的靶基因,通过条件优化... 单核细胞增生李斯特菌(Lm)是主要的食源性致病菌之一,也是一种重要的人畜共患病原菌,感染人和动物后主要表现为败血症、脑膜炎和单核细胞增多症等。为建立快速检测Lm的方法,本研究以Lm毒力因子actA作为特异性检测的靶基因,通过条件优化初步建立了快速检测食源性Lm的环介导等温扩增(LAMP)方法。并采用该方法进行了特异性、敏感性及临床样品检测试验。结果显示,利用建立的LAMP方法检测Lm、肠出血性大肠杆菌O157:H7、鼠伤寒沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、小肠结肠炎耶尔森菌、产气荚膜梭菌、空肠弯曲菌、胸膜肺炎放线杆菌、副猪嗜血杆菌、多杀性巴氏杆菌、猪链球菌、猪丹毒丝菌或支气管败血波氏杆菌基因组DNA,除Lm为阳性外,其他病原菌均为阴性,表明该方法的特异性较强;将Lm菌液10倍倍比稀释为4.7×10^(9)cfu/mL~4.7×10^(0)cfu/mL,再采用该LAMP方法和常规PCR方法进行检测,结果显示,LAMP对Lm的检测下限为4.7×10^(1)cfu/mL,而常规PCR对Lm的检测下限为4.7×10^(3)cfu/mL,即LAMP比普通PCR的敏感性高100倍,表明本研究建立的LAMP方法敏感性较高;采用建立的LAMP方法对118份猪肉临床样品进行检测,结果显示有3份样品为阳性,与常规PCR和国标的检测结果均一致。本研究基于Lm actA基因建立了Lm LAMP检测方法,且该方法具有特异性强、敏感性高、结果可视等优点,适用于实验室和基层食品安全监管部门的现场快速检测。 展开更多
关键词 食源性致病菌 单增李斯特菌 环介导等温扩增技术(LAMP) acta基因 可视化检测
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ACTA-Ⅰ基因复合杂合突变引起β-酮硫解酶缺乏症临床分析 被引量:1
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作者 高玉凤 单小鸥 《温州医科大学学报》 CAS 2019年第8期606-611,共6页
目的:探讨β-酮硫解酶缺乏症(BKTD)的临床特点,以期早期诊断指导临床实践。方法:回顾性分析温州医科大学附属第二医院育英儿童医院收治的1例经基因测序确诊的BKTD病例,收集其临床症状、辅助检查结果和诊治方案。文献复习BKTD的诊治策略... 目的:探讨β-酮硫解酶缺乏症(BKTD)的临床特点,以期早期诊断指导临床实践。方法:回顾性分析温州医科大学附属第二医院育英儿童医院收治的1例经基因测序确诊的BKTD病例,收集其临床症状、辅助检查结果和诊治方案。文献复习BKTD的诊治策略。结果:患儿,男,4岁,因酮症酸中毒2次入院。第1次发作年龄为1岁10个月,发作时血气分析均提示重度代谢性酸中毒,血氨、血乳酸、血脂、尿酸均正常。第1次发作时尿酮体++++,尿气相质谱检测显示除酮体升高外,2-甲基-3-羟基异丁酸升高。第2次发作伴低血糖,血糖2.6mmol/L,血β-羟丁酸明显升高,血游离脂肪酸正常高限,尿酮体++。血串联质谱示3-羟基丁酸肉碱轻度增高,尿气相质谱示3-羟基丁酸增高,基因测序结果示ACTA-Ic.370A>C、c.473A>G复合杂合突变,确诊BKTD。结论:婴幼儿在禁食或呼吸道感染或胃肠炎后发生无法解释的严重酮症酸中毒时需考虑BKTD的可能,血串联质谱、尿气相质谱分析有时无典型提示,需要ACTA-I基因型的检测做确诊。 展开更多
关键词 β-酮硫解酶缺陷症 acta-I基因 酮病 儿童
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ACTA2 mutation is responsible for multisystemic smooth muscle dysfunction syndrome with seizures:A case report and review of literature 被引量:2
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作者 Wen-Xian Yang Hang-Hu Zhang +3 位作者 Jia-Ni Hu Li Zhao Yan-Yun Li Xiao-Li Shao 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2021年第29期8789-8796,共8页
BACKGROUND ACTA2 gene is a specific gene that encodes actinα2.Multisystem smooth muscle dysfunction syndrome(MSMDS)is a multisystem disease characterized by aortic and cerebrovascular lesions caused by ACTA2 gene mut... BACKGROUND ACTA2 gene is a specific gene that encodes actinα2.Multisystem smooth muscle dysfunction syndrome(MSMDS)is a multisystem disease characterized by aortic and cerebrovascular lesions caused by ACTA2 gene mutations.There have been many reports of cardiac,pulmonary and cerebrovascular lesions caused by MSMDS;however,few studies have focused on seizures caused by MSMDS.CASE SUMMARY Our patient was a girl aged 7 years and 8 mo with recurrent cough,asthma and seizures for 7 years.She was diagnosed with severe pneumonia,congenital heart disease,cardiac insufficiency,and malnutrition in the local hospital.Cardiac ultrasonography revealed congenital heart disease,patent ductus arteriosus(with a diameter of 0.68 cm),left coronary arteriectasis,patent oval foramen(0.12 cm),tricuspid and pulmonary regurgitation,and pulmonary hypertension.Cerebral magnetic resonance imaging and magnetic resonance angiography indicated stiffness in the brain vessels,together with multiple aberrant signaling shadows in bilateral paraventricular regions.A heterozygous mutation(c.536G>A)was identified in the ACTA2 gene,resulting in generation of p.R179H.Finally,the girl was diagnosed with MSMDS combined with epilepsy.The patient had 4 episodes of seizures before treatment,and no onset of seizure was reported after oral administration of sodium valproate for 1 year.CONCLUSION MSMDS has a variety of clinical manifestations and unique cranial imaging features.Cerebrovascular injury and white matter injury may lead to seizures.Gene detection can confirm the diagnosis and prevent missed diagnosis or misdiagnosis. 展开更多
关键词 Multi-systemic smooth muscle dysfunction syndrome acta2 gene Seizures gene detection Case report
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单核细胞增生李斯特菌LAMP检测方法的建立及应用 被引量:2
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作者 陈平亚 何翠华 +3 位作者 张亮亮 吴少荣 王绥家 赵光远 《安徽农业科学》 CAS 2023年第10期74-78,共5页
[目的]建立一种单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法,并对其检测敏感性、特异性进行评价。[方法]针对单增李斯特菌的actA基因序列,设计6条LAMP特异性引... [目的]建立一种单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法,并对其检测敏感性、特异性进行评价。[方法]针对单增李斯特菌的actA基因序列,设计6条LAMP特异性引物,通过对LAMP反应体系中的反应温度、内外引物浓度比、镁离子浓度等各参数进行优化,确定最优反应体系。以单增李斯特菌株CMCC54006株为阳性对照,其他菌株为阴性对照,验证LAMP检测方法的特异性。将纯培养的单增李斯特菌菌液提取DNA后10倍梯度稀释为模板进行LAMP检测,以测定该检测方法灵敏度。[结果]建立了特异性检测单增李斯特菌的LAMP检测方法,优化后确定了检测体系中FIP/BIP与F3/B3的终浓度比为1.6∶0.2,镁离子浓度为6 mmol/L,dNTPs浓度为1.6 mmol/L,反应温度为65℃。特异性检测结果显示,仅单增李斯特菌反应管中的反应液呈绿色,表明建立的检测方法具有较高特异性。以单增李斯特菌DNA为模板进行的LAMP检测结果显示,LAMP检测方法灵敏度为64 copies/mL。[结论]建立单增李斯特菌的LAMP检测方法,高效特异,灵敏度高,可直接观察检测结果,适合现场检测。 展开更多
关键词 单增李斯特菌 环介导等温扩增 acta基因
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应用LAMP检测方法检测肉制品中的单增李斯特菌 被引量:12
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作者 高宏伟 徐彪 +3 位作者 朱来华 肖西志 郑小龙 梁成珠 《食品安全质量检测学报》 CAS 2010年第1期12-17,共6页
本研究使用恒温环介导技术,以单增李斯特菌的肌动蛋白大会诱导蛋白聚集因子A(actA)基因设计引物,建立单增李斯特菌的LAMP快速检测方法。不同来源的13株单增李斯特菌LAMP检测均显示阳性,其他21种细菌LAMP检测显示阴性。使用使用本研究建... 本研究使用恒温环介导技术,以单增李斯特菌的肌动蛋白大会诱导蛋白聚集因子A(actA)基因设计引物,建立单增李斯特菌的LAMP快速检测方法。不同来源的13株单增李斯特菌LAMP检测均显示阳性,其他21种细菌LAMP检测显示阴性。使用使用本研究建立的LAMP方法检测肉类样品中的单增李斯特菌结果与细菌分离方法检测结果一致。 展开更多
关键词 单增李斯特菌 acta基因 环介导等温核酸扩增
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基于actA基因的产单核细胞李斯特菌遗传谱系研究 被引量:5
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作者 周晓辉 焦新安 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期319-323,共5页
目的 探讨产单核细胞李斯特菌(Lm)的actA基因3′末端核苷酸序列作为其遗传谱系分析的可能性,及中国与美国的Lm分离株遗传进化的关系。方法 采用特异性引物扩增40株分离自食品、污水及临床患者的菌株actA基因3′末端597 bp的核苷酸序列... 目的 探讨产单核细胞李斯特菌(Lm)的actA基因3′末端核苷酸序列作为其遗传谱系分析的可能性,及中国与美国的Lm分离株遗传进化的关系。方法 采用特异性引物扩增40株分离自食品、污水及临床患者的菌株actA基因3′末端597 bp的核苷酸序列,所获得的DNA序列用于Lm遗传谱系的建立并将其分为不同的actA基因型;比较中国Lm 分离株与美国分离株actA基因型与遗传谱系的差异。结果 40株Lm中国分离株可分为两个遗传谱系(谱系Ⅰ和谱系Ⅱ),其中谱系Ⅰ包括14株,谱系Ⅱ包括26株。26株谱系Ⅱ的菌株又可被分为两个亚群(ⅡA和ⅡB)。与15株已发表的美国分离株序列比较发现中国分离株与美国分离株的谱系相一致,在40株中国分离株中有14个actA基因型,其中有2个与美国分离株的actA基因型相同。结论 actA基因3′末端核苷酸序列适合于Lm的谱系分析,且中国分离株与美国分离株具有较大的相似性,Lm 的克隆组群可能在全球范围内存在。 展开更多
关键词 产单核细胞李斯特菌 遗传 act aA基因型 中国分离株 核苷酸序列 谱系分析 DNA序列 基因3 AAA 引物扩增 序列比较 美国 可能性 特异性 相似性 菌株
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