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肾移植术后腺嘌呤磷酸核糖基转移酶缺乏症1例及文献复习
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作者 董昆 苏瑞玲 +2 位作者 陈军泽 陈冠妙 董淳强 《器官移植》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期263-269,共7页
目的 总结肾移植术后腺嘌呤磷酸核糖基转移酶缺乏症的诊疗经验。方法 回顾性分析1例肾移植术后腺嘌呤磷酸核糖基转移酶缺乏症患者的临床资料,结合文献复习总结该病临床特点、诊断、治疗和预后。结果 患者肾活组织检查显示多数肾小管管... 目的 总结肾移植术后腺嘌呤磷酸核糖基转移酶缺乏症的诊疗经验。方法 回顾性分析1例肾移植术后腺嘌呤磷酸核糖基转移酶缺乏症患者的临床资料,结合文献复习总结该病临床特点、诊断、治疗和预后。结果 患者肾活组织检查显示多数肾小管管腔内可见盐类结晶沉积,偏振光阳性。经过别嘌醇、血液透析和抗结晶等治疗移植物功能逐渐恢复。术后随访1年,患者肾功能恢复良好。结论 肾移植术后腺嘌呤磷酸核糖基转移酶缺乏症可能导致移植物功能恢复延迟或障碍,早发现、早诊断、早治疗可延缓疾病进展,改善功能。 展开更多
关键词 腺嘌呤磷酸核糖基转移酶缺乏症 肾移植 2 8-二羟基腺嘌呤 移植物功能延迟恢复 移植物功能障碍 基因检测 血液透析 别嘌醇
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NDUFS6蛋白生物信息学分析及过表达质粒的构建与鉴定
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作者 张瑜 孙美琪 +4 位作者 徐方晶 王洁 方克宝 王一帆 何军 《宁夏医科大学学报》 2024年第4期353-359,共7页
目的 应用生物信息学方法分析线粒体呼吸链复合体Ⅰ结构亚基烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶(泛素)铁硫蛋白6(NDUFS6)的理化性质,构建pCV702-NDUFS6过表达质粒并进行鉴定,为进一步研究NDUFS6蛋白功能奠定基础。方法 利用Expasy、UniProtKB、... 目的 应用生物信息学方法分析线粒体呼吸链复合体Ⅰ结构亚基烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶(泛素)铁硫蛋白6(NDUFS6)的理化性质,构建pCV702-NDUFS6过表达质粒并进行鉴定,为进一步研究NDUFS6蛋白功能奠定基础。方法 利用Expasy、UniProtKB、NCBI、SOPMA等生物信息学工具分析NDUFS6蛋白的理化性质、二级结构等;根据NDUFS6 cDNA序列构建携带NDUFS6基因的过表达质粒pCV702-NDUFS6,转染大鼠心肌细胞H9C2,并设置阴性对照(NC)组和相应空载体CON520作为阳性对照(PC)组,经嘌呤霉素筛选后,采用RT-qPCR和Western blot检测NDUFS6 mRNA和蛋白表达水平。结果 NDUFS6蛋白由116个氨基酸组成,理论等电点pI为9.37。蛋白二级结构以无规则卷曲(占50%)为主。酶切鉴定和基因测序结果显示,pCV702-NDUFS6表达质粒构建成功。RT-qPCR和Western blot结果显示,相较于NC组和PC组,过表达组NDUFS6表达水平均上调(P均<0.05)。结论 成功构建了能在心肌细胞H9C2中有效过表达NDUFS6基因的过表达质粒。 展开更多
关键词 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶(泛素)铁硫蛋白6 生物信息学分析 心肌细胞 质粒构建
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Adenine phosphoribosyltransferase deficiency: Leave no stone unturned
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作者 Guillaume Bollée Michel Daudon Irène Ceballos-Picot 《World Journal of Clinical Urology》 2014年第3期218-226,共9页
Adenine phosphoribosyltransferase(APRT)deficiency is a rare autosomal recessive disease leading to generation of large amounts of 2,8-dihydroxyadenine(DHA).DHA is excreted in urine,where it precipitates into crystals ... Adenine phosphoribosyltransferase(APRT)deficiency is a rare autosomal recessive disease leading to generation of large amounts of 2,8-dihydroxyadenine(DHA).DHA is excreted in urine,where it precipitates into crystals due to its low solubility.DHA crystals can aggregate into stones or cause injury to the renal parenchyma(DHA nephropathy).Recurrent urolithiasis and DHA nephropathy are the two clinical manifestations of APRT deficiency.Diagnosis of APRT deficiency can be made during childhood as well as adulthood.Diagnosis mainly relies on the recognition of DHA in stones or urine crystals.Measurement of APRT activity and genetic testing are useful for confirmation of diagnosis,for family screening and should be considered in difficult cases of urolithiasis or crystalline nephropathy.Allopurinol therapy is the cornerstone of treatment and is highly effective in preventing recurrence of stones and kidney disease.High fluid intake and dietary modifications are also recommended.Early diagnosis and treatment are of paramount importance to prevent renal damage.Unfortunately,diagnosis of APRT deficiency is often overlooked and irreversible renal failure still occurs in a substantial proportion of patients.Clinicians must be alert to the possibility of APRT deficiency and consider the appropriate diagnostic tests in certain cases.This review discusses the genetic and biochemical mechanisms of APRT deficiency,and the issues of diagnosis and management. 展开更多
关键词 adenine PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE Dihydroxyadenine UROLITHIASIS Crystalline NEPHROPATHY 2 8-dihydroxyadenine NEPHROPATHY
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基于生物信息学分析喹啉酸磷酸核糖基转移酶在恶性黑色素瘤中的表达及潜在生物学功能
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作者 曹静 路鹏霏 万学峰 《癌症进展》 2023年第10期1090-1094,1109,共6页
目的通过生物信息学方法分析喹啉酸磷酸核糖基转移酶(QPRT)在恶性黑色素瘤中的表达及潜在生物学功能。方法应用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)检索恶性黑色素瘤患者的临床资料。应用基因表达谱互动分析(GEPIA)数据库对T... 目的通过生物信息学方法分析喹啉酸磷酸核糖基转移酶(QPRT)在恶性黑色素瘤中的表达及潜在生物学功能。方法应用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)检索恶性黑色素瘤患者的临床资料。应用基因表达谱互动分析(GEPIA)数据库对TCGA数据库中恶性黑色素瘤组织和正常皮肤组织中QPRT mRNA表达水平进行分析。应用UALCAN数据库对TCGA数据库中不同临床分期恶性黑色素瘤组织中QPRT mRNA的表达水平进行分析。应用GEPIA数据库分析不同QPRT mRNA表达情况恶性黑色素瘤患者的预后。应用人类蛋白质参考数据库(HPRD)分析正常皮肤组织、原发性黑色素瘤组织及转移性黑色素瘤组织中QPRT蛋白的表达情况。应用GeneMANIA数据库查找与QPRT相互作用的蛋白,将与QPRT相互作用的关键基因利用WebGestalt进行基因本体(GO)分析,了解其参与的细胞组分、生物过程、生物功能。结果恶性黑色素瘤组织中QPRT mRNA表达水平明显高于正常皮肤组织,差异有统计学意义(P﹤0.01)。Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ期恶性黑色素瘤患者的QPRT mRNA表达水平比较,差异无统计学意义(P﹥0.05)。QPRT低表达组患者的总生存情况和无病生存情况均优于QPRT高表达组,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。免疫组化显示,正常皮肤组织中QPRT蛋白阴性表达,恶性黑色素瘤组织中QPRT蛋白呈强阳性表达。GeneMANIA数据库中筛选出20个与QPRT相互作用的蛋白,相关关键基因主要参与蛋白结合、离子结合、核酸结合及转运活性等。结论QPRT基因在恶性黑色素瘤中高表达,其高表达与恶性黑色素瘤患者的预后不良相关,可能成为筛查恶性黑色素瘤的标志物及治疗靶点。 展开更多
关键词 恶性黑色素瘤 喹啉酸磷酸核糖基转移酶 公共数据库 生物信息学
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烟酸及其衍生物:从传统营养素到肿瘤防治的新认识 被引量:1
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作者 李昊 安家兴 王倩 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期108-113,共6页
烟酸属于B族维生素,是人体必需的维生素之一。过去对烟酸功能的认知主要停留在营养素层面,如参与维持神经功能、促进代谢和发育、保护心脑血管等。随着研究的不断深入,近年来已有多项研究表明,烟酸及其衍生物能起到预防和辅助治疗癌症... 烟酸属于B族维生素,是人体必需的维生素之一。过去对烟酸功能的认知主要停留在营养素层面,如参与维持神经功能、促进代谢和发育、保护心脑血管等。随着研究的不断深入,近年来已有多项研究表明,烟酸及其衍生物能起到预防和辅助治疗癌症的作用。烟酸及其衍生物不仅影响肿瘤细胞的生物学功能、参与免疫调节,还能对烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)抑制剂的抗肿瘤疗效起到辅助作用,并以多聚ADP-核糖聚合酶(PARP)依赖方式通过多种分子途径维持基因组的稳定性。本文总结了烟酸及其衍生物在肿瘤中作用的研究脉络和最新进展,并展望其进一步研究和应用方向,对烟酸及其衍生物在肿瘤综合防治中的应用有一定的指导作用。 展开更多
关键词 烟酸 烟酰胺 肿瘤 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 烟酰胺磷酸核糖转移酶 免疫 基因组稳定性
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Identification of a candidate QTG for seed number per silique by integrating QTL mapping and RNA-seq in Brassica napus L.
6
作者 Shuangshuang Xin Hongli Dong +7 位作者 Yixin Cui Yilin Liu Guifu Tian Nanxi Deng Huafang Wan Zhi Liu Xiaorong Li Wei Qian 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2023年第1期189-197,共9页
Seed number per silique(SNPS)is one of seed yield components in rapeseed,but its genetic mechanism remains elusive.Here a double haploid(DH)population derived from a hybrid between female 6Q006with 35–40 SNPS and mal... Seed number per silique(SNPS)is one of seed yield components in rapeseed,but its genetic mechanism remains elusive.Here a double haploid(DH)population derived from a hybrid between female 6Q006with 35–40 SNPS and male 6W26 with 10–15 SNPS was investigated for SNPS in the year 2017,2018,2019 and 2021,and genotyped with Brassica 60K Illumina Infinium SNP array.An overlapping major QTL(qSNPS.C09)explaining 51.50%of phenotypic variance on average was narrowed to a 0.90 Mb region from 44.87 Mb to 45.77 Mb on chromosome C09 by BSA-seq.Subsequently,two DEGs in this interval were detected between extreme individuals in DH and F_2populations by transcriptome sequencing at7 and 14 days after pollination siliques.Of which,BnaC09g45400D encoded an adenine phosphoribosyltransferase 5(APT5)has a 48-bp InDel variation in the promoter of two parents.Candidate gene association analysis showed that this InDel variation was associated with SNPS in a nature population of rapeseed,where 54 accessions carrying the same haplotype as parent 6Q006 had higher SNPS than103 accessions carrying the same haplotype as parent 6W26.Collectively,the findings are helpful for rapeseed molecular breeding of SNPS,and provide new insight into the genetic and molecular mechanism of SNPS in rapeseed. 展开更多
关键词 adenine phosphoribosyltransferase 5 Brassica napus QTL mapping RNA-SEQ Seed number per silique
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寄生原虫嘌呤磷酸核糖转移酶研究进展
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作者 余志会 方肆云 +5 位作者 孙铭飞 戚南山 刘文俊 李娟 胡俊菁 廖申权 《广东农业科学》 CAS 2023年第8期163-172,共10页
寄生原虫是一类单细胞寄生性原虫,包括利什曼原虫(Leishmania spp.)、锥虫(Trypanosoma spp.)、疟原虫(Plasmodium spp.)、刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)、隐孢子虫(Cryptosporidium spp.)和艾美耳球虫(Eimeria spp.)等,可引起严重危... 寄生原虫是一类单细胞寄生性原虫,包括利什曼原虫(Leishmania spp.)、锥虫(Trypanosoma spp.)、疟原虫(Plasmodium spp.)、刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)、隐孢子虫(Cryptosporidium spp.)和艾美耳球虫(Eimeria spp.)等,可引起严重危害人类与动物健康以及对养殖业造成巨大经济损失的原虫病。寄生虫入侵宿主后的发育和繁殖需要大量的嘌呤核苷酸,相应的嘌呤碱基在嘌呤磷酸核糖转移酶的催化下生成对应的嘌呤核苷酸。嘌呤磷酸核糖转移酶是一类参与嘌呤核苷酸补救合成的重要代谢酶,广泛存在于寄生原虫中。寄生原虫的嘌呤磷酸核糖转移酶主要包括腺嘌呤磷酸核糖转移酶和次黄嘌呤-鸟嘌呤-黄嘌呤磷酸核糖转移酶,两者在寄生原虫中分别催化腺嘌呤核苷酸、次黄嘌呤核苷酸、鸟嘌呤核苷酸和黄嘌呤核苷酸合成,从而参与寄生原虫的多个生化代谢过程,不仅为寄生原虫核酸生物合成等提供前体物质,还为虫体提供通用能量载体。由于寄生原虫的嘌呤补救途径明显区别于宿主的从头合成途径,且嘌呤磷酸核糖转移酶是寄生原虫嘌呤补救途径的关键酶,因而近年来寄生原虫嘌呤磷酸核糖转移酶成为抗原虫药物候选靶标的研究热点,以寄生原虫嘌呤磷酸核糖转移酶为潜在靶标,特异性筛选、设计抑制剂,并开发抗寄生原虫药物取得重要进展。以利什曼原虫、锥虫、疟原虫和弓形虫的嘌呤磷酸核糖转移酶为重点,综述寄生原虫嘌呤磷酸核糖转移酶的基本特征、生物学功能、抑制剂筛选与应用的研究进展,以期为抗寄生原虫药物靶标研究与新型抑制剂筛选提供参考。 展开更多
关键词 寄生原虫 腺嘌呤磷酸核糖转移酶 次黄嘌呤-鸟嘌呤-黄嘌呤磷酸核糖转移酶 嘌呤核苷酸 药物靶标 抑制剂
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日本血吸虫腺嘌呤磷酸核糖转移酶的生物信息学鉴定与分析 被引量:4
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作者 杨忠 胡薇 +4 位作者 苏谨 马骊 李亦学 冯正 魏东芝 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期272-275,共4页
目的鉴定日本血吸虫中存在的腺嘌呤磷酸核糖转移酶,分析其蛋白结构特征。方法采用双向同源比对、结构域搜索和系统发育分析等生物信息学手段,在已有转录组和蛋白质组数据基础上鉴定日本血吸虫的腺嘌呤磷酸核糖转移酶,并采用同源建模方... 目的鉴定日本血吸虫中存在的腺嘌呤磷酸核糖转移酶,分析其蛋白结构特征。方法采用双向同源比对、结构域搜索和系统发育分析等生物信息学手段,在已有转录组和蛋白质组数据基础上鉴定日本血吸虫的腺嘌呤磷酸核糖转移酶,并采用同源建模方法获得日本血吸虫腺嘌呤磷酸核糖转移酶的结构特征。结果获得了2条腺嘌呤磷酸核糖转移酶的同源蛋白序列;分析了这2条序列的EST丰度、理化性质及蛋白三维结构等信息。结论日本血吸虫至少存在2个腺嘌呤磷酸核糖转移酶的异构体。 展开更多
关键词 日本血吸虫 腺嘌呤磷酸核糖转移酶 生物信息学
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烟酰胺磷酸核糖转移酶信号通路在心血管疾病中的作用 被引量:5
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作者 窦青瑜 饶莉 《西部医学》 2017年第3期418-422,共5页
有关烟酰胺磷酸核糖转移酶(Nicotinamide phosphoribosyltransferase,NAMPT)的研究是近年的热点之一。NAMPT在体内有两种存在形式,细胞内NAMPT和细胞外NAMPT。细胞内NAMPT主要作为一种合成烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(Nicotinamide adenine di... 有关烟酰胺磷酸核糖转移酶(Nicotinamide phosphoribosyltransferase,NAMPT)的研究是近年的热点之一。NAMPT在体内有两种存在形式,细胞内NAMPT和细胞外NAMPT。细胞内NAMPT主要作为一种合成烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(Nicotinamide adenine dinucleotide,NAD)补救途径的限速酶,而细胞外NAMPT同时具有多种细胞因子的功能。大量研究表明,NAMPT控制了NAD的生物合成及下游分子NAD依赖的组蛋白去乙酰化酶沉默信息调节因子1(Sirtuin-1,SIRT1)的活性,在细胞增殖、分化、凋亡、肿瘤、衰老和代谢中均有重要作用。本文对NAMPT的基因结构、蛋白特征以及在心血管疾病中的作用进行了综述,重点阐述了NAMPT与心肌缺血、动脉粥样硬化、心力衰竭三方面的关系。 展开更多
关键词 烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT) 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD) 沉默信息调节因子1(SIRT1) 心血管疾病
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柞蚕腺苷酸转移酶基因的克隆与序列分析 被引量:2
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作者 李玉萍 王欢 +5 位作者 武松 夏润玺 刘彦群 秦利 李喜升 姜德富 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期398-402,共5页
腺苷酸转移酶(adenine nucleotide translocase,ANT)是线粒体内膜上的转运蛋白家族成员。从柞蚕(An-theraea pernyi)蛹全长cDNA文库中获得了柞蚕腺苷酸转移酶基因(ApANT)的cDNA序列(GenBank登录号FJ788509)。对该基因进行生物信息学分... 腺苷酸转移酶(adenine nucleotide translocase,ANT)是线粒体内膜上的转运蛋白家族成员。从柞蚕(An-theraea pernyi)蛹全长cDNA文库中获得了柞蚕腺苷酸转移酶基因(ApANT)的cDNA序列(GenBank登录号FJ788509)。对该基因进行生物信息学分析表明:ApANTcDNA全长1 282 bp,含有1个903 bp的开放阅读框(ORF)序列,编码300个氨基酸;ApANT与烟草天蛾(Manduca sexta)等鳞翅目昆虫的ANT基因在核苷酸和氨基酸序列水平分别具有80%和90%以上的同源性,说明ANT蛋白在这些昆虫中是高度保守的;与其它已知鳞翅目昆虫的ANT蛋白一样,ApANT蛋白含有3个线粒体穿膜结构域,并且这3个保守结构域之间也显示出较高的相似性。 展开更多
关键词 柞蚕 腺苷酸转移酶基因 生物信息学分析 CDNA序列 氨基酸序列 蛋白结构
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日本血吸虫腺嘌呤磷酸核糖转移酶基因的克隆、表达及虫期表达差异分析 被引量:3
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作者 孔娟 冯正 +3 位作者 徐斌 邓王平 杨忠 胡薇 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期179-182,共4页
目的克隆和表达日本血吸虫腺嘌呤磷酸核糖转移酶基因1(SjAPRT1),并研究该基因在日本血吸虫不同发育阶段的转录和蛋白表达情况。方法根据SjAPRT1基因序列(GenBank登录号为AAW24796)设计引物,RT-PCR扩增目的基因,分析其在日本血吸虫各发... 目的克隆和表达日本血吸虫腺嘌呤磷酸核糖转移酶基因1(SjAPRT1),并研究该基因在日本血吸虫不同发育阶段的转录和蛋白表达情况。方法根据SjAPRT1基因序列(GenBank登录号为AAW24796)设计引物,RT-PCR扩增目的基因,分析其在日本血吸虫各发育阶段转录本差异。将目的基因亚克隆至载体pET28a(+),转化至大肠埃希菌BL21(DE3)菌株,异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达,组氨酸亲和层析法纯化表达产物,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析纯化结果。纯化的蛋白SjAPRT1免疫新西兰白兔制备免疫兔血清,蛋白质印迹(West-ern blotting)分析其免疫反应性及其在日本血吸虫不同发育阶段表达的差异。结果在虫卵、尾蚴、童虫和成虫期均检测到SjAPRT1转录本(561 bp),获得了重组SjAPRT1蛋白。Western blotting分析表明,纯化的重组蛋白SjAPRT1可被日本血吸虫感染兔血清识别,虫卵、童虫和成虫粗抗原可被SjAPRT1免疫兔血清识别,在Mr 25 000处有特异性条带。结论日本血吸虫SjAPRT1蛋白在虫卵、童虫和成虫各期均有表达,并具有一定的免疫反应性。 展开更多
关键词 日本血吸虫 腺嘌呤磷酸核糖转移酶 免疫反应性
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玉米APRT基因的克隆及特征分析
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作者 余展旺 叶春江 《现代农业科技》 2013年第22期22-24,30,共4页
腺嘌呤磷酸核糖基转移酶(APRT,adenine phosphoribosyltransferase)是催化腺嘌呤碱基转化为腺嘌呤核苷一磷酸(AMP)的关键酶。运用生物信息学,RT-PCR和RACE方法,从玉米叶片中克隆了1个1 202 bp的APRT基因cDNA片段,命名为ZmAPT2(GenBank... 腺嘌呤磷酸核糖基转移酶(APRT,adenine phosphoribosyltransferase)是催化腺嘌呤碱基转化为腺嘌呤核苷一磷酸(AMP)的关键酶。运用生物信息学,RT-PCR和RACE方法,从玉米叶片中克隆了1个1 202 bp的APRT基因cDNA片段,命名为ZmAPT2(GenBank登录号为AY485263)。该cDNA包含1个642 bp的开放阅读框,编码214个氨基酸。RPS-BLAST分析表明,玉米ZmAPT2蛋白有腺嘌呤磷酸核糖基转移酶的催化结构域。推导的玉米ZmAPT2氨基酸与水稻2型、小麦2型、拟南芥2型、大麦的APRT具有较高序列相似性,一致率分别为79%、75%、56%、56%。 展开更多
关键词 腺嘌呤磷酸核糖基转移酶渊APRT冤 RT-PCR RACE 玉米
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尼克酰胺磷酸核糖转移酶功能研究进展 被引量:2
13
作者 黄琼 丁鹤林 《国际内科学杂志》 CAS 2009年第11期648-651,共4页
尼克酰胺磷酸核糖转移酶(Nampt),又称为前B细胞克隆增强因子(PBEF)和内脏脂肪素(Visfatin),近年来由于其多方面的功能在尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)生物学、代谢、炎症等领域成为研究热点。作为NAD生物合成限速酶,Nampt调节NAD依赖蛋... 尼克酰胺磷酸核糖转移酶(Nampt),又称为前B细胞克隆增强因子(PBEF)和内脏脂肪素(Visfatin),近年来由于其多方面的功能在尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)生物学、代谢、炎症等领域成为研究热点。作为NAD生物合成限速酶,Nampt调节NAD依赖蛋白如脱乙酰基酶的活性,并在胰岛β细胞分泌胰岛素中起重要作用。Nampt尚可作为具有免疫调节功能的炎症细胞因子,参与多种急慢性炎症性疾病的发病。本综述总结Nampt上述不同功能,并讨论其与2型糖尿病的关系。 展开更多
关键词 尼克酰胺磷酸核糖转移酶 尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸 脱乙酰基酶 Β细胞 2型糖尿病
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木薯NOX基因家族成员的生物信息学及其表达分析 被引量:3
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作者 胡广 梁大成 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期2178-2187,共10页
【目的】搜索鉴定木薯还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶(NOX)基因家族成员,分析其生物学信息及在不同组织和非生物胁迫下的表达模式,为深入研究该家族基因对木薯块根发育的调控机理及提高木薯抗逆性提供理论参考。【方法】从JGI数... 【目的】搜索鉴定木薯还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶(NOX)基因家族成员,分析其生物学信息及在不同组织和非生物胁迫下的表达模式,为深入研究该家族基因对木薯块根发育的调控机理及提高木薯抗逆性提供理论参考。【方法】从JGI数据库下载木薯的基因组序列,由pfam数据库下载4个NOX蛋白结构域相关的HMM文件,通过HMMER程序筛选NOX基因家族成员,利用生物信息学分析软件对该家族蛋白的理化性质、氨基酸序列和结构特征进行分析。基于GEO数据库的转录组测序(RNA-Seq)数据,对木薯NOX基因家族成员在不同组织和干旱胁迫下的表达模式进行分析。【结果】从木薯基因组中共鉴定到15个NOX基因家族成员,包括9个NOX基因和6个FRO基因(NOX祖先基因)。FRO基因的外显子数(6~9个)明显少于NOX基因的外显子数(11~14个),且FRO基因的内含子序列较NOX基因短,NOX基因的第一个外显子相对保守。15个NOX基因家族成员分布在木薯的9条染色体和1个结构支架上,且均被定位在染色体末端,除6号染色体有4个基因、8号和14号染色体有2个基因外,其他染色体均只有1个基因。木薯NOX蛋白的分子量和氨基酸数明显高于FRO蛋白,而理论等电点(pI)差异不明显。FRO蛋白含6~9个保守跨膜结构域,而NOX蛋白均只含4个跨膜螺旋区,且均位于第350~750位氨基酸残基。木薯NOX家族蛋白有10个保守结构域,其中Motif1和Motif8存在于所有的NOX和FRO蛋白中,Motif6为NOX蛋白所特有,Motif3只独立存在于FRO蛋白中。NOX蛋白均具有典型的保守结构域和相似的蛋白质结构,其脱氢酶结构域明显折叠成催化域裂缝结构,且C末端氨基酸极度保守。由RNA-Seq数据的基因表达谱可知,NOX基因家族成员在不同木薯叶片、中静脉、叶柄、茎、侧芽、茎尖分生组织、根尖分生组织、易碎胚性愈伤组织、胚性愈伤组织(OES)和贮藏根中均有表达,但呈不同的表达模式,其中,Manes.14G042600和Manes.S089900在储藏根中高表达,Manes.06G128700和Manes.09G172500在须根和根尖分生组织中高表达。在木薯品种KU50和新选048的叶片中,Manes.14G042600基因在干旱胁迫下呈上调表达,推测NOX基因在特定组织及响应非生物胁迫过程中扮演重要角色。【结论】木薯NOX基因家族成员具有保守基因结构,其编码蛋白具有保守的功能域,尤其是C端氨基酸序列;NOX基因表达具有组织特异性,部分成员的表达受非生物胁迫的影响。FRO蛋白和NOX蛋白具有较明显的共进化关系。 展开更多
关键词 木薯 还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶(NOX) 基因家族成员 生物信息学 干旱胁迫
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腺嘌呤磷酸核糖转移酶基因突变导致2,8-二羟基腺嘌呤结晶性肾病1例
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作者 张然 姜维娜 +3 位作者 陈增生 刘丰海 邵乐平 傅海霞 《中华肾脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期561-564,共4页
该文报道1例由腺嘌呤磷酸核糖转移酶(adenine phosphoribosyltransferase,APRT)基因突变导致的2,8-二羟基腺嘌呤(2,8-dihydroxyadenine,2,8-DHA)结晶性肾病病例。患者,女,60岁,因发现"尿泡沫增多半年"就诊。肾活检光镜下可见... 该文报道1例由腺嘌呤磷酸核糖转移酶(adenine phosphoribosyltransferase,APRT)基因突变导致的2,8-二羟基腺嘌呤(2,8-dihydroxyadenine,2,8-DHA)结晶性肾病病例。患者,女,60岁,因发现"尿泡沫增多半年"就诊。肾活检光镜下可见不规则的棕黄色、偏振光下具有折光性的2,8-DHA结晶,尿沉渣检测发现2,8-DHA结晶,基因检测发现APRT基因5号外显子纯合缺失(c.521523delTCT),最终确诊为2,8-DHA结晶性肾病。经别嘌醇治疗后,患者肾功能好转。该病例报告旨在提高临床医师对2,8-DHA结晶性肾病的认识,早期识别、正确诊断及早期药物干预可延缓肾衰竭进展,改善预后。 展开更多
关键词 肾疾病 腺嘌呤磷酸核糖基转移酶 腺嘌呤 2 8-二羟基腺嘌呤结晶 结晶性肾病
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Obstructive uropathy and severe acute kidney injury from renal calculi due to adenine phosphoribosyltransferase deficiency 被引量:1
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作者 Siew Le Chong Yong Hong Ng 《World Journal of Pediatrics》 SCIE CSCD 2016年第2期243-245,共3页
APRT) deficiency is an uncommon genetic cause ofchronic kidney disease due to crystalline nephropathy.Methods: A case of a Chinese boy with APRT defi ciencypresenting with severe acute kidney injury secondaryto obstru... APRT) deficiency is an uncommon genetic cause ofchronic kidney disease due to crystalline nephropathy.Methods: A case of a Chinese boy with APRT defi ciencypresenting with severe acute kidney injury secondaryto obstructive uropathy from multiple renal calculi wasreviewed.Results: The patient underwent staged removal of thecalculi. Infrared spectrometry of the renal calculi showed2,8-dihydroxyadenine. APRT deficiency was confirmedwith abolished APRT enzyme activity in red blood cells.He was started on allopurinol and low purine diet withcomplete resolution of the residual calculi.Conclusion: APRT defi ciency should be considered inpatients with multiple radiolucent renal calculi. 展开更多
关键词 2 8-dihydroxyadenine acute renal failure adenine phosphoribosyltransferase deficiency UROLITHIASIS
原文传递
利用数据库信息分析NAMPT与肝癌的病理特征和免疫浸润的关联性
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作者 常晴 刘佳 +1 位作者 曲爱林 杨咏梅 《山东大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2023年第4期26-36,共11页
目的分析烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)在肝细胞癌(HCC)中的表达,并研究其与肝癌患者病理特征及免疫浸润的关系。方法利用TIMER数据库获得NAMPT在HCC中的表达数据。通过UALCAN数据库分析NAMPT表达与血清甲胎蛋白(AFP)之间的相关性。从TCG... 目的分析烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)在肝细胞癌(HCC)中的表达,并研究其与肝癌患者病理特征及免疫浸润的关系。方法利用TIMER数据库获得NAMPT在HCC中的表达数据。通过UALCAN数据库分析NAMPT表达与血清甲胎蛋白(AFP)之间的相关性。从TCGA-LIHC中下载肝癌转录组RNA-Seq数据,提取NAMPT和免疫相关分子mRNA表达量。利用估计算法和单样本基因集富集分析(ssGSEA),评估NAMPT高低表达组间免疫成分、基质成分的数量和免疫细胞浸润丰度及计算免疫相关分子表达有无差异;分析NAMPT表达与免疫细胞浸润的关联性。结果TIMER数据库显示,NAMPT mRNA在HCC中的表达低于癌旁组织(P<0.05)。UALCAN数据库检测发现,NAMPT表达和血清AFP呈负向低度相关(r=-0.464,P<0.05)。基质细胞占比、免疫细胞占比和肿瘤细胞纯度在NAMPT高低表达组间存在统计学差异(P<0.05)。ssGSEA分析发现,20种免疫细胞在NAMPT高表达组中的浸润程度高于NAMPT低表达组(P<0.05)。免疫相关分子NKG2D、CD40、FAS、ELANE、PDL1、PDL2在两组中的表达差异有统计学意义(P<0.05)。TIMER数据库分析发现,NAMPT的表达与巨噬细胞(r=0.125,P=0.021)、中性粒细胞(r=0.284,P<0.001)和树突状细胞(r=0.131,P=0.016)浸润呈正向低度相关,与肿瘤纯度呈负向低度相关(r=-0.137,P=0.011)。结论NAMPT与临床病理参数具有一定相关性,并能在一定程度反映肝癌患者免疫微环境的状态。本研究为鉴别肝癌免疫治疗获益人群提供了新的线索。 展开更多
关键词 烟酰胺磷酸核糖转移酶 肝细胞癌 生物信息学 免疫浸润 肿瘤免疫微环境
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APRT缺陷型CHO细胞系的建立及其重组蛋白表达能力评价 被引量:2
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作者 冯莹莹 肖梦珂 +4 位作者 路江涛 王小引 柴玉荣 王天云 贾岩龙 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期3453-3465,共13页
中国仓鼠卵巢(Chinese hamster ovary,CHO)细胞是生产复杂重组药物蛋白的首选宿主细胞,腺嘌呤磷酸核糖转移酶(adenine phosphoribosyltransferase,APRT)催化腺嘌呤与磷酸核糖缩合形成腺苷一磷酸,是嘌呤生物合成步骤中的关键酶。采用基... 中国仓鼠卵巢(Chinese hamster ovary,CHO)细胞是生产复杂重组药物蛋白的首选宿主细胞,腺嘌呤磷酸核糖转移酶(adenine phosphoribosyltransferase,APRT)催化腺嘌呤与磷酸核糖缩合形成腺苷一磷酸,是嘌呤生物合成步骤中的关键酶。采用基因编辑技术敲除CHO细胞中aprt基因,验证获得的APRT缺陷型CHO细胞系的生物学特性;构建两种真核表达载体:对照载体(含有目的基因增强型绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)和弱化载体(含有启动子和起始密码子突变的aprt弱化表达盒及EGFP),分别转染APRT缺陷型和野生型CHO细胞并筛选获得稳定转染的细胞池;重组CHO细胞传代培养60代并用流式细胞术检测EGFP表达的平均荧光强度,并比较不同实验组重组蛋白EGFP的表达稳定性。PCR扩增和测序结果表明,CHO细胞aprt基因成功敲除;获得的APRT缺陷型CHO细胞系在细胞形态、生长增殖、倍增时间等生物学特性方面与野生CHO细胞无显著差异。目的蛋白瞬时表达结果表明,与野生型CHO细胞相比,转染对照载体和弱化载体的APRT缺陷型CHO细胞系中EGFP的表达分别提高了42%±6%和56%±9%;特别是长期传代培养时,转染弱化载体的APRT缺陷型细胞中EGFP表达量显著高于野生型CHO细胞(P<0.05);构建的基于APRT缺陷型CHO细胞系能够明显提高重组蛋白的长期表达稳定性。研究结果为建立高效稳定的CHO细胞表达系统提供了一种有效的细胞工程策略。 展开更多
关键词 中国仓鼠卵巢细胞 腺嘌呤磷酸核糖转移酶 基因敲除 重组蛋白表达
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尼克酰胺磷酸核糖转移酶抑制剂的抗肿瘤作用研究进展 被引量:1
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作者 韩雪 张纬萍 《中国现代应用药学》 CAS CSCD 2015年第2期238-242,共5页
尼克酰胺磷酸核糖转移酶(nicotinamide phosphoribosyltransferase,NAMPT)是哺乳动物细胞烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide,NAD)补救合成通路的限速酶。NAMPT通过合成NAD,参与调节细胞内重要的生理病理过程。近... 尼克酰胺磷酸核糖转移酶(nicotinamide phosphoribosyltransferase,NAMPT)是哺乳动物细胞烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide,NAD)补救合成通路的限速酶。NAMPT通过合成NAD,参与调节细胞内重要的生理病理过程。近年研究发现,NAMPT与肿瘤发生、发展有着密切关系,抑制NAMPT可以起到有效的抗肿瘤作用。NAMPT已成为抗肿瘤药物研究新靶点,其抑制剂FK866、GMX1778作为抗肿瘤药,已经进入临床试验。NAMPT抑制剂作用机制的研究主要包括诱导细胞凋亡、细胞自吞噬、抑制细胞增殖、血管生成等。本文综述了NAMPT抑制剂的抗肿瘤作用及机制研究。 展开更多
关键词 尼克酰胺磷酸核糖转移酶 尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸 肿瘤 NAMPT抑制剂
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异源表达德氏乳杆菌保加利亚亚种TCS1调控酸适应基因提高乳酸乳球菌NZ9000耐酸性
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作者 王超 崔艳华 曲晓军 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期2521-2537,共17页
【目的】在乳酸乳球菌NZ9000中异源表达德氏乳杆菌保加利亚亚种中由双组分系统TCS1(JN675228/JN675229)调控的与酸适应相关基因,进而探究德氏乳杆菌保加利亚亚种应对酸胁迫的机制。【方法】通过逆转录聚合酶链式反应和十二烷基硫酸钠-... 【目的】在乳酸乳球菌NZ9000中异源表达德氏乳杆菌保加利亚亚种中由双组分系统TCS1(JN675228/JN675229)调控的与酸适应相关基因,进而探究德氏乳杆菌保加利亚亚种应对酸胁迫的机制。【方法】通过逆转录聚合酶链式反应和十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳验证由德氏乳杆菌保加利亚亚种TCS1调控的与酸适应相关基因中腺嘌呤磷酸核糖转移酶(aprt)、D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶(ddl)、寡肽ABC转运蛋白(oppDII)和延伸因子Ts(tsf)在乳酸乳球菌NZ9000中的表达情况。酸处理实验验证基因表达对宿主菌酸胁迫耐受能力的影响。并采用酵母双杂交验证双组分系统TCS1与表达的酸适应相关基因之间的互作关系及具体的互作部位。【结果】结果表明,乳酸乳球菌NZ9000中成功表达了aprt、ddl、oppDII和tsf。aprt、ddl基因使重组菌对酸胁迫的抗性分别提高了75倍和114倍。oppDII和tsf基因的表达对重组菌株的耐酸能力没有明显影响。酵母双杂交实验表明TCS1中的组氨酸蛋白激酶HPK1与Ddl之间存在相互作用,且HPK1-C结构域是二者相互作用的关键区域。【结论】aprt和ddl过表达菌株酸刺激的适应能力显著高于对照菌株,该研究结果可为德氏乳杆菌保加利亚亚种及类似菌株耐酸性特性的获得策略提供参考。 展开更多
关键词 德氏乳杆菌保加利亚亚种 腺嘌呤磷酸核糖转移酶 D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶 耐酸性 母双杂交
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