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油田硫酸盐还原菌APS-MPN-PCR快速定量检测方法 被引量:3
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作者 魏利 马放 《西安石油大学学报(自然科学版)》 CAS 2007年第1期91-94,共4页
为了解决现有油田污水中硫酸盐还原菌检测周期长、检测费用较高的问题,应用聚合酶链式反应(PCR)技术与倍比稀释法(MPN)相结合的APS-MPN-PCR法,对硫酸盐还原菌进行快速定量检测.从污水中制备了直接用于PCR扩增的菌液,保证了定量... 为了解决现有油田污水中硫酸盐还原菌检测周期长、检测费用较高的问题,应用聚合酶链式反应(PCR)技术与倍比稀释法(MPN)相结合的APS-MPN-PCR法,对硫酸盐还原菌进行快速定量检测.从污水中制备了直接用于PCR扩增的菌液,保证了定量检测的准确性;建立以腺苷酰硫酸还原酶基因(APS)为靶位点的通用探针APS7F和APS8R的反应体系和扩增条件.研究结果表明,与液体稀释培养法相比,该方法检测灵敏度提高了两个数量级,操作时间缩短(整个检测过程只需要3~4h),检测费用也降低.该方法检测结果非常稳定,真实的表征了污水中实际的SRB菌数量,可以在生产中应用. 展开更多
关键词 硫酸盐还原菌 定量检测 腺苷酰硫酸还原酶 APS-MPN—PCR法
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H2O2-Activated Up-Regulation of Glutathione in Arabidopsis Involves Induction of Genes Encoding Enzymes Involved in Cysteine Synthesis in the Chloroplast 被引量:10
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作者 Guillaume Queval Dorothée Thominet Hélène Vanacker Myroslawa Miginiac-Maslow Bertrand Gakière Graham Noctor 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2009年第2期344-356,共13页
Glutathione is a key player in cellular redox homeostasis and, therefore, in the response to H2O2, but the factors regulating oxidation-activated glutathione synthesis are still unclear. We investigated H2O2-induced g... Glutathione is a key player in cellular redox homeostasis and, therefore, in the response to H2O2, but the factors regulating oxidation-activated glutathione synthesis are still unclear. We investigated H2O2-induced glutathione synthesis in a conditional Arabidopsis catalase-deficient mutant (cat2). Plants were grown from seed at elevated CO2 for 5 weeks, then transferred to air in either short-day or long-day conditions. Compared to cat2 at elevated CO2 or wild-type plants in any condition, transfer of cat2 to air in both photoperiods caused measurable oxidation of the leaf glutathione pool within hours. Oxidation continued on subsequent days and was accompanied by accumulation of glutathione. This effect was stronger in cat2 transferred to air in short days, and was not linked to appreciable increases in the extractable activities of or transcripts encoding enzymes involved in the committed pathway of glutathione synthesis. In contrast, it was accompanied by increases in serine, O-acetylserine, and cysteine. These changes in metabolites were accompanied by induction of genes encoding adenosine phosphosulfate reductase (APR), particularly APR3, as well as a specific serine acetyltransferase gene (SAT2.1) encoding a chloroplastic SAT. Marked induction of these genes was only observed in cat2 transferred to air in short-day conditions, where cysteine and glutathione accumulation was most dramatic. Unlike other SAT genes, which showed negligible induction in cat2, the relative abundance of APR and SAT2.1 transcripts was closely correlated with marker transcripts for H2O2 signaling. Together, the data underline the importance of cysteine synthesis in oxidant-induced up-regulation of glutathione synthesis and suggest that the chloroplast makes an important contribution to cysteine production under these circumstances. 展开更多
关键词 Oxidative stress CATALASE PHOTOPERIOD 3 -glutamylcysteine synthetases (γ-ECS) adenosine phosphosulfate reductase (apr serine acetyltransferase (SAT).
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重度肥胖症患者膳食干预前后肠道内硫酸盐还原菌的定量检测 被引量:9
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作者 殷晓晨 费娜 +3 位作者 肖水明 申剑 赵立平 庞小燕 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2012年第8期691-695,共5页
目的检测重度肥胖症患者膳食干预过程中,肠道内硫酸盐还原菌(SRB)的数量变化,为进一步研究SRB与肥胖的关系提供参考。方法以SRB基因组中的重要功能基因-腺苷酰硫酸(APS)还原酶基因作为指示基因,通过实时定量PCR的方法检测了12名重度肥... 目的检测重度肥胖症患者膳食干预过程中,肠道内硫酸盐还原菌(SRB)的数量变化,为进一步研究SRB与肥胖的关系提供参考。方法以SRB基因组中的重要功能基因-腺苷酰硫酸(APS)还原酶基因作为指示基因,通过实时定量PCR的方法检测了12名重度肥胖症患者在进行膳食干预过程中随着体重的降低,肠道内SRB的数量变化,同时以16S rRNA基因对肠道内总菌进行定量来计算SRB占总菌的相对比例。结果膳食干预过程中,随着患者体重的显著降低,其肠道内SRB占总菌的比例也显著下降。在维持期,患者体重仍和干预前有显著差异,但较干预期有所回升;其体内SRB含量也显著低于干预前,但相比干预期,有所上升。结论研究结果提示肠道菌群中SRB细菌与肥胖的发展有密切关系,为后续研究SRB细菌的功能和作用机理奠定了基础。 展开更多
关键词 硫酸盐还原菌 重度肥胖症 膳食干预 腺苷酰硫酸还原酶基因 定量PCR
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肠道硫酸盐还原菌DGGE分析技术的建立 被引量:2
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作者 刘辰雷 殷晓晨 +3 位作者 龙文敏 费娜 赵立平 庞小燕 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2013年第6期706-711,714,共7页
目的建立分析肠道内硫酸盐还原菌(Sulfate-reducing bacteria,SRB)组成的变性梯度凝胶电泳(Denaturing gra-dient gel electrophoresis,DGGE)技术,并用于分析10例健康人粪便样品中的SRB组成。方法从GenBank中下载13株脱硫弧菌科细菌的... 目的建立分析肠道内硫酸盐还原菌(Sulfate-reducing bacteria,SRB)组成的变性梯度凝胶电泳(Denaturing gra-dient gel electrophoresis,DGGE)技术,并用于分析10例健康人粪便样品中的SRB组成。方法从GenBank中下载13株脱硫弧菌科细菌的腺苷酰硫酸还原酶α亚基基因(aprA)的序列,利用Clustal X、Simulated PCR(SPCR)软件比较、评估了2对针对aprA基因的引物(AprA-3-FW/APS-RV和AprA-1-FW/AprA-5-RV)用于扩增粪便样品中的SRB的特异性。确定PCR引物和条件,进一步摸索并建立DGGE分析体系。结果 Clustal X和SPCR软件分析的结果均表明引物AprA-3-FW/APS-RV优于AprA-1-FW/AprA-5-RV。实际PCR的结果也显示AprA-1-FW/AprA-5-RV扩增效率低并有非特异扩增。建立DGGE体系,对10例健康人肠道中SRB的分析显示,每个个体肠道中SRB的种类有1到5种不等。结论基于aprA序列的DGGE技术是分析肠道SRB组成的有效方法。 展开更多
关键词 硫酸盐还原菌 腺苷酰硫酸还原酶基因 DGGE 肠道菌群
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