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PCR技术在快速检测沙门氏菌中的应用 被引量:7
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作者 沈兰 王锐萍 +1 位作者 史海涛 庞贤鹏 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期90-94,共5页
本文总结了PCR检测沙门氏菌过程中被检目标基因的选择、引物的特异性以及国内外检测沙门氏菌的一些实例,分析了PCR检测沙门氏菌在引物选择上存在的问题,简述了在传统PCR技术基础上发展起来的检测沙门氏菌新方法。
关键词 沙门氏菌 被检目标基因 引物特异性 pcr技术
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应用单引物PCR指纹技术分析Vc-獭兔的分子遗传结构 被引量:4
2
作者 徐勇 张嘉保 +2 位作者 任文陟 王玉平 孟玉 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期616-620,共5页
采用 1条小卫星引物 M13( 5′GAGGGTGGCGGTTCT3′)和 2条微卫星引物 ( GTG) 5、( GACA) 4,对 Vc- 系、Vc- 系獭兔、日本大耳白兔 ( JWR)和青紫蓝 ( QZL) 4个品系各 8只 ,总计 32个个体的遗传结构进行了 DNA指纹分析。结果 ,3条引物的... 采用 1条小卫星引物 M13( 5′GAGGGTGGCGGTTCT3′)和 2条微卫星引物 ( GTG) 5、( GACA) 4,对 Vc- 系、Vc- 系獭兔、日本大耳白兔 ( JWR)和青紫蓝 ( QZL) 4个品系各 8只 ,总计 32个个体的遗传结构进行了 DNA指纹分析。结果 ,3条引物的扩增产物都呈现良好的多态性和稳定性 ;对每个品系混合 DNA池进行分析 ,计算出了 4个品系间及 32个个体间的共有带率及遗传距离指数 ,通过聚类分析 ,得出各品系间和个体间欧式遗传距离 ,并绘制出 4个品系间及各品系 32个个体间的亲缘关系树状聚类图 ,从而初步建立了 4个品系兔的 展开更多
关键词 单引物pcr指纹技术 Vc-獭兔 分子遗传结构 遗传距离 亲缘关系
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PCR技术应用的新进展 被引量:6
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作者 张红缨 张今 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1996年第6期509-513,共5页
近年来,随着PCR技术方法学的逐步改进和完善,更加显示出它的实用性这不仅扩大了其用武之地,也促进了分子生物学的快速发展文章着重介绍PCR在基因工程和蛋白质工程应用中的某些新进展,包括不需连接的克隆技术、随机引导/定位... 近年来,随着PCR技术方法学的逐步改进和完善,更加显示出它的实用性这不仅扩大了其用武之地,也促进了分子生物学的快速发展文章着重介绍PCR在基因工程和蛋白质工程应用中的某些新进展,包括不需连接的克隆技术、随机引导/定位PCR、CDNA末端随机快速扩增、重组PCR和大引物PCR. 展开更多
关键词 聚合酶链反应 分子生物学 应用
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基因芯片的PCR引物设计 被引量:3
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作者 张元颖 何农跃 陆祖宏 《化工时刊》 CAS 2002年第7期19-22,共4页
基因芯片(Gene chip),将大量特定的核苷酸探针有序地固定在玻璃或硅等基底上,通过检测探针与荧光标记的核酸靶序列发生杂交显示的信号,获得生命信息。PCR技术可扩增核酸靶序列,极大提高了检测灵敏度。进行PCR扩增的首要条件是设计人工... 基因芯片(Gene chip),将大量特定的核苷酸探针有序地固定在玻璃或硅等基底上,通过检测探针与荧光标记的核酸靶序列发生杂交显示的信号,获得生命信息。PCR技术可扩增核酸靶序列,极大提高了检测灵敏度。进行PCR扩增的首要条件是设计人工合成的寡核苷酸引物。本文介绍了PCR引物设计软件的一般设计原理并设计了相关软件。 展开更多
关键词 基因芯片 pcr技术 核酸靶序列 寡核苷酸引物 扩增
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RNA-primed allele-specific PCR 被引量:1
5
作者 ZHANG LingHui TANG Zhuo 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 2014年第7期961-965,共5页
RNA/DNA primer pairs and two polymerases were used to efficiently amplify DNA sequences using the conventional polymerase chain reaction(PCR).The reaction required the use of both DNA polymerase and reverse transcript... RNA/DNA primer pairs and two polymerases were used to efficiently amplify DNA sequences using the conventional polymerase chain reaction(PCR).The reaction required the use of both DNA polymerase and reverse transcriptase during each thermal cycle and formed a double-stranded DNA in which one terminus was an RNA/DNA hybrid.Because there is a higher sensitivity of the DNA polymerase to the mismatch at the 3?-end in the RNA/DNA hybrid duplex than in the DNA/DNA duplex,the RNA-primed PCR reveals much better specificity in the allele-specific PCR to detect single-nucleotide mutation. 展开更多
关键词 RNA primer Vent(exo-) DNA polymerase TaqM1 DNA polymerase allele-specific pcr single-nucleotide mutation
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KLOTHO的3个SNP位点分布与几种疾病相关性的研究 被引量:15
6
作者 华明娟 马厚勋 +1 位作者 牛永红 谢正祥 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1174-1178,共5页
目的分析汉族人群Klotho基因3个单核苷酸多态性位点(G-395A,F352V,C370S)与几种疾病的相关性。方法选择无亲戚关系的病人161例及正常健康人55例,提取血白细胞基因组DNA,采用等位基因特异性引物PCR技术检测Klotho基因3个SNP位点的基因型... 目的分析汉族人群Klotho基因3个单核苷酸多态性位点(G-395A,F352V,C370S)与几种疾病的相关性。方法选择无亲戚关系的病人161例及正常健康人55例,提取血白细胞基因组DNA,采用等位基因特异性引物PCR技术检测Klotho基因3个SNP位点的基因型,并用SAS统计软件对所得数据进行分析。结果3个位点存在多态性,均出现2种基因型。G-395A与糖尿病有关(P<0.002);F352V与高血压和冠状动脉硬化性心脏病有关(分别为:P=0.0120和P<0.0001);C370S与冠状动脉硬化性心脏病有关(P<0.0001)。G-395A多态性中的AA基因型可能易患高血压,GG基因型可能对患冠状动脉硬化性心脏病,糖尿病有保护性作用。F352V多态性中的VV和FF可能是高血压和冠状动脉硬化性心脏病的易患基因型,而FV基因型具有保护作用,VV基因型可能易患糖尿病。C370S基因型中,CC和SS是冠状动脉硬化性心脏病易患基因型,而CS基因型具有保护作用。结论该研究发现在中国汉族人群中,启动子区G-395A多态性中的AA基因型易患高血压,GG基因型可能对患冠状动脉硬化性心脏病,糖尿病有保护性作用。对于编码区的F-352V和C370S多态性,杂合子对患冠状动脉硬化性心脏病有保护作用。 展开更多
关键词 KLOTHO基因 单核苷酸多态性 等位基因特异性引物pcr技术
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通州区6类食品单增李斯特菌污染状况及分子流行病学特征调查研究 被引量:14
7
作者 张兰荣 唐一清 +1 位作者 甄博珺 张冲 《中国卫生检验杂志》 CAS 2007年第12期2306-2308,共3页
目的:了解通州区6类食品中单增李斯特菌的污染情况,探讨所污染菌株携带的三个毒力基因(hlyA、iap、prfA)的状况和DNA随机扩增多态性PCR分型情况。方法:依据国标方法,采用全自动微生物分析仪和API Listeria试剂条鉴定系统对样本进行单增... 目的:了解通州区6类食品中单增李斯特菌的污染情况,探讨所污染菌株携带的三个毒力基因(hlyA、iap、prfA)的状况和DNA随机扩增多态性PCR分型情况。方法:依据国标方法,采用全自动微生物分析仪和API Listeria试剂条鉴定系统对样本进行单增李斯特菌分离和生化鉴定;采用聚合酶链反应检测实验菌株携带毒力因子的情况,使用随机引物PCR的方法对菌株进行分子分型。结果:从通州区共采集6类食品样品121件,检出单增李斯特菌18株,检出率为14.9%;18株实验菌株均携带单核细胞增多性李斯特菌特异的毒力因子;随机引物PCR方法将实验菌株分成6个随机引物PCR型别。结论:本区食品中单增李斯特菌污染较为严重,且毒力基因prfA、hly、iap同时存在,说明有潜在的致病能力,应引起相关部门关注;通州区在不同时间、不同地点分离的单增李斯特菌其PCR型别差别较大,有多种型别的细菌存在;也可根据PCR分型看出在食品加工过程中存在着内部污染问题。但来源不同的菌株之间PCR分型无关联,无流行趋势。 展开更多
关键词 食品污染 单核细胞增生李斯特菌 随机引物pcr 毒力因子
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应用反向斑点杂交技术进行脐血HLA-DRB基因分型方法的建立 被引量:4
8
作者 黄以宁 廖灿 +3 位作者 汤雪薇 李焱 谢杏梅 曾瑞萍 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2002年第2期148-152,共5页
HLA分子的多态性对于移植有十分重要的意义。常用的HLA基因分型方法中SSOP基因分型方法有较高分辨率 ,但操作过程复杂 ,仅适于大样本的HLA分型。PCR SSP基因分型方法分辨率较低 ,但操作过程简单 ,适于临床要求。有必要建立一种简便、快... HLA分子的多态性对于移植有十分重要的意义。常用的HLA基因分型方法中SSOP基因分型方法有较高分辨率 ,但操作过程复杂 ,仅适于大样本的HLA分型。PCR SSP基因分型方法分辨率较低 ,但操作过程简单 ,适于临床要求。有必要建立一种简便、快速、价廉、高分辨率的基因分型方法。本研究取 6 3份已知HLA DRB型的脐血标本 ,经盐酸胍方法提取DNA用于反向斑点杂交 (RDB)基因分型 ,同时采用SSOP和PCR SSP方法进行比较。结果表明 ,所有样本用RDB方法基因分型均获得成功 ,可准确地分辨 6 0个HLA DRB等位基因 ,且结果与用SSOP和PCR SSP方法的结果完全一致。结论提示 ,RDB方法可准确地分辨HLA DRB等位基因 ,分辨率高 ,操作简单 。 展开更多
关键词 反向斑点杂交技术 HLA-DRB基因分型 脐血 特异性序列引物pcr 序列特异性寡核苷酸探针 白细胞抗原
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汉族人群NOS2 C-1173T、G-954C单核苷酸多态性及其等位基因频率与组合分布特征研究 被引量:1
9
作者 马厚勋 谢正祥 +1 位作者 牛永红 李章勇 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 2005年第1期34-38,共5页
目的分析中国汉族人群诱导型一氧化氮合酶(NOS2)基因启动子区C-1173T、G-954C单核苷酸多态性及其等位基因频率与组合分布特征。方法获取选择自然人群个体565人(男314例,女251例)血白细胞基因组DNA,利用嵌套式等位基因特异性引物PCR技术... 目的分析中国汉族人群诱导型一氧化氮合酶(NOS2)基因启动子区C-1173T、G-954C单核苷酸多态性及其等位基因频率与组合分布特征。方法获取选择自然人群个体565人(男314例,女251例)血白细胞基因组DNA,利用嵌套式等位基因特异性引物PCR技术检测NOS2C-1173T、NOS2G-954CSNP。结果NOS2C-1173TSNP基因型分布CC、CT、TT分别为66.73%、26.37%、6.90%,C、T等位基因频率分别为79.88%、20.12%。NOS2G-954CSNP基因型分布GG、GC、CC分别为61.77%、37.88%、0.35%,G、C等位基因频率分别为80.71%、19.29%。研究发现了NOS2基因在2位点的SNP前5种组合基因型分布NOS2C-1173C+G-954G233例(41.24%),NOS2C-1173C+G-954C143例(25.31%),NOS2C-1173T+G-954G89例(15.75%),NOS2C-1173T+G-954C59例(10.44%),NOS2T-1173T+G-954G27例(4.78%)。结论本研究揭示了中国汉族人群NOS2基因的2位点的SNP基因型及其组合分布特征,为研究该基因SNP与其生理功能和疾病的关系提供实验基础。 展开更多
关键词 NOS SNP 基因型分布 单核苷酸多态性 等位基因频率 中国汉族人群 血白细胞 基因组DNA 基因启动子区 位点
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利用侧流核酸试纸条快速检测非洲猪瘟病毒 被引量:13
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作者 王之莹 于文杰 +2 位作者 谢瑞彬 乔璐 陈爱亮 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第4期294-299,共6页
为满足基层普通实验室或养殖场等资源有限的实验室对非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)的检测需求,该研究开发了一种简单、快速、低成本的检测技术,可以用肉眼观察检测结果。研究将传统聚合酶链式反应(polymerase chain rea... 为满足基层普通实验室或养殖场等资源有限的实验室对非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)的检测需求,该研究开发了一种简单、快速、低成本的检测技术,可以用肉眼观察检测结果。研究将传统聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)与胶体金试纸条技术结合,开发一种低成本的侧流核酸测定试纸条(lateral flow nucleic acid assay,LFNAA)。该体系设计了独特的尾引物,避免了传统核酸试纸条的半抗原标记及抗体的使用。经过PCR扩增后产生一端带着单链寡核苷酸尾巴的双链DNA产物,能够与胶体金标记的寡核苷酸捕获探针结合,从而在试纸条上形成可以用肉眼观察的目标产物。该LFNAA试纸条能够在猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CFSV)、猪瘟病毒猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)、猪圆环病毒1型(Porcine circovirus 1,PCV1)、猪圆环病毒2型(Porcine circovirus 2,PCV2)、猪伪狂犬病毒(Pseudorabies virus,PRV)、猪细小病毒(Porcine parvovirus virus,PPV)中特异的鉴定出ASFV的存在,其灵敏度与琼脂糖凝胶电泳的分析结果一致,均能达到103 copies/μL。因此,仅需要一台普通PCR仪,即可对ASFV进行快速灵敏的鉴定(<2 h),其低成本、操作简便的特点非常适合资源有限的实验室中非专业人员的操作。此外,该技术可进一步结合等温扩增技术,能够在食品安全和医学诊断中实现更快更简便的现场检测。 展开更多
关键词 动物 养殖 非洲猪瘟(ASFV) 传统pcr技术 侧流核酸测定(LFNAA) 尾引物 低成本
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中国北方汉族人群强直性脊柱炎与白细胞抗原B27亚型关联性研究 被引量:3
11
作者 徐娜 孙华 +9 位作者 单小燕 李伟 王丽君 何小梅 王中梅 刘娜 倪蕾 王琳 崔爽 张志欣 《北京医学》 CAS 2007年第4期241-243,共3页
目的通过对中国北方汉族人正常人群与强直性脊柱炎(AS)患者白细胞抗原B27(HLA-B27)等位基因亚型的分布进行比较分析,试图发现AS的易感基因。方法用聚合酶链反应-序列特异性引物高分辨技术(PCR-SSP)对118例HLA-B27阳性的北方汉族AS患者和... 目的通过对中国北方汉族人正常人群与强直性脊柱炎(AS)患者白细胞抗原B27(HLA-B27)等位基因亚型的分布进行比较分析,试图发现AS的易感基因。方法用聚合酶链反应-序列特异性引物高分辨技术(PCR-SSP)对118例HLA-B27阳性的北方汉族AS患者和150例HLA-B27阳性北方汉族正常人进行HLA-B27等位基因亚型分型。结果正常人与AS患者HLA-B27亚型分布频率不同,正常人B*2705比例最高,占49.33%(74/150);其次分别为B*2704,占40%(60/150);B*2707,占8.67%(13/150);B*2706,占2%(3/150)。AS患者B*2704比例最高,占61.02%(72/118);其次分别为B*2705,占38.98%(46/118);B*2706,占0.85%(1/118)。在AS患者中未检测到2707亚型。B*2704、B*2705、B*2706亚型均与AS有关联,其关联程度以B*2704为最强(RR=84.24,x2=70.77,P<0.01),其次为B*2705(RR=30.39,x2=36.98,P<0.01),再其次为B*2706(RR=10.77,x2=6.59,P<0.05),而B*2707与AS呈负相关(RR=0,X2=24.39,P<0.01)。结论中国北方汉族人群AS患者主要的相关性基因为B*2704和B*2705,但B*2704是中国北方汉族人发生AS的更加危险基因;HLA-B*2707可能是一种保护性基因,尚需进行更大样本和多人种的调查。 展开更多
关键词 强直性脊柱炎 白细胞抗原B27亚型 聚合酶链反应-序列特异性引物高分辨技术
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植物内生菌16S rRNA基因扩增子高通量测序中降低宿主污染的方法 被引量:1
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作者 程丹丹 杨嘉麒 +1 位作者 王牧 赵菁 《安全与环境工程》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期212-220,共9页
植物内生菌能够帮助植物生长,增强其抗逆性与抗病性,研究植物内生菌对了解植物入侵机制、保护生态环境与农业的健康发展具有重要意义。通过阅读相关文献,总结归纳了降低植物内生菌16S rRNA基因扩增子高通量测序(16S-seq)中宿主基因污染... 植物内生菌能够帮助植物生长,增强其抗逆性与抗病性,研究植物内生菌对了解植物入侵机制、保护生态环境与农业的健康发展具有重要意义。通过阅读相关文献,总结归纳了降低植物内生菌16S rRNA基因扩增子高通量测序(16S-seq)中宿主基因污染的4种方法,即:①寻找特异性错配引物用来扩增细菌16S rRNA基因;②添加特异性阻断物用来抑制宿主16S rRNA基因扩增,如PNA-PCR和LNA-RCR钳位技术;③在文库构建过程中剪切宿主细胞器的16S rRNA基因,如Cas-16S-seq方法;④改变PCR扩增流程,如巢式PCR技术。了解上述各种方法的特点,有助于在植物内生菌16S-seq中选择合适的方法,避免或者减少宿主基因的污染,更准确地进行植物内生细菌群落的研究。 展开更多
关键词 植物内生菌 16S rRNA基因扩增子高通量测序 宿主基因污染 Cas-16S-seq 微生物组 pcr钳位技术 特异性引物
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