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酰胺Ⅰ与残基分子间不对称耦合作用下孤立子特性的变化
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作者 谢崇伟 陈丽丽 周凌云 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第1期100-106,共7页
文内研究了酰胺Ⅰ振动与其前后胺基酸残基分子间不对称耦合对蛋白质分子链上所激发孤立子的能量、动量等特性的影响。结果表明,无论是亚声速孤立子还是超声速孤立子都能被激发,并且这种非对称耦合致使亚声速孤立子的波形振幅、能量及... 文内研究了酰胺Ⅰ振动与其前后胺基酸残基分子间不对称耦合对蛋白质分子链上所激发孤立子的能量、动量等特性的影响。结果表明,无论是亚声速孤立子还是超声速孤立子都能被激发,并且这种非对称耦合致使亚声速孤立子的波形振幅、能量及动量增大。 展开更多
关键词 Α螺旋 蛋白质分子 酰胺振动 孤立子
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丙氨酸二肽的酰胺-Ⅰ带振动频率图
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作者 郑轩 蔡开聪 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2016年第S1期13-14,共2页
基于分子力学力场构建了丙氨酸二肽(ALAD)在重水溶剂中的酰胺-Ⅰ带振动频率图,将溶剂作用以静电势场的形式投影至ALAD分子骨架中,并且引入骨架二面角对酰胺-Ⅰ带的影响,实现处于不同构象态的ALAD中酰胺-Ⅰ带光谱的快速准确预测。
关键词 丙氨酸二肽 振动频率图 酰胺- 二级结构
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淀粉样蛋白片段结构动力学与酰胺-Ⅰ带振动光谱示踪
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作者 侯彦君 郑轩 蔡开聪 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第S1期109-110,共2页
借助分子对接方法,获取了β淀粉样蛋白(Amyloidβprotein,Aβ)的核心片段Aβ25-35与乙酰胆碱受体相互作用的最优结合构象,并在此基础上开展结合后的复合物的分子动力学模拟,探索其结构动力学特征。将构建的氨基酸多肽通用型振动频率图... 借助分子对接方法,获取了β淀粉样蛋白(Amyloidβprotein,Aβ)的核心片段Aβ25-35与乙酰胆碱受体相互作用的最优结合构象,并在此基础上开展结合后的复合物的分子动力学模拟,探索其结构动力学特征。将构建的氨基酸多肽通用型振动频率图应用于复合物的全原子运动轨迹,预测与受体结合后的Aβ多肽骨架酰胺-Ⅰ带光谱。其特征吸收峰表明该多肽片段与受体结合后主要呈现无规则卷曲构象,与分子对接和分子动力学轨迹聚类分析所呈现的特征构象一致。借助分子模拟与光谱建模相结合的方法能够帮助我们快速解析实验光谱中所蕴含的多肽构象信息,在分子水平上更好地认识蛋白质的空间结构动力学特征。 展开更多
关键词 β淀粉样蛋白 乙酰胆碱受体 酰胺-带频率图 结构动力学 分子对接
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天冬酰胺二肽分子的酰胺-Ⅰ带与二级结构相关性
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作者 严思仪 蔡开聪 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2016年第S1期46-47,共2页
借助对结构敏感的振动探针(酰胺-Ⅰ带)探索天冬酰胺二肽在气相中结构与光谱特征的相关性。研究结果表明,天冬酰胺二肽处于不同构象时振动光谱参数表现出了显著的差异,酰胺-Ⅰ带吸收峰的频率、峰宽对多肽二级结构表现出了明显的特异性,... 借助对结构敏感的振动探针(酰胺-Ⅰ带)探索天冬酰胺二肽在气相中结构与光谱特征的相关性。研究结果表明,天冬酰胺二肽处于不同构象时振动光谱参数表现出了显著的差异,酰胺-Ⅰ带吸收峰的频率、峰宽对多肽二级结构表现出了明显的特异性,为借助振动光谱探针探究多肽二级结构提供了必要的理论依据。 展开更多
关键词 天冬酰胺二肽 酰胺- 振动光谱 二级结构
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使用圆二色性光谱和红外光谱研究冬小麦麸皮抗冻蛋白的二级结构 被引量:8
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作者 张超 张晖 +2 位作者 赵晓燕 马越 姚惠源 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第7期1764-1767,共4页
使用圆二色性光谱和红外光谱技术对冬小麦麸皮抗冻蛋白的二级结构进行了研究。由于冬小麦麸皮抗冻蛋白在酰胺Ⅰ带和Ⅲ带位置中,各个特征峰相互叠加,因此采用Gausse峰型对圆头峰进行拟合、解析,判断其α-helix,β-sheet,β-turn和Random ... 使用圆二色性光谱和红外光谱技术对冬小麦麸皮抗冻蛋白的二级结构进行了研究。由于冬小麦麸皮抗冻蛋白在酰胺Ⅰ带和Ⅲ带位置中,各个特征峰相互叠加,因此采用Gausse峰型对圆头峰进行拟合、解析,判断其α-helix,β-sheet,β-turn和Random coil的相对含量;同时对圆二色性光谱获得的结构信息,采用按照Chen-Yang原理和最小二乘法编写的程序计算了冬小麦麸皮抗冻蛋白的二级结构。最后,讨论了两种检测方法结果差异的原因,为冬小麦麸皮抗冻蛋白抗冻机理的研究奠定基础。 展开更多
关键词 冬小麦麸皮抗冻蛋白 二级结构 傅里叶变换 红外光谱 圆二色性光谱 酰胺带和Ⅲ带
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FT-IR在蛋白质二级结构研究中的应用进展 被引量:27
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作者 邢本刚 梁宏 《广西师范大学学报(自然科学版)》 CAS 1997年第3期45-49,共5页
对傅里叶变换红外光谱在蛋白质二级结构研究中的应用进行了简介.通过对蛋白质红外光谱的酰胺带的考察,证明傅里叶变换红外光谱法与二阶导数谱、去卷积及曲线拟合等数学处理方法相结合是研究生理状态下蛋白质二级结构的一个有效手段.
关键词 傅里叶变换 红外光谱 蛋白质 二级结构
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蜘蛛牵引丝不同溶剂伸缩特性及丝蛋白构象变化的研究 被引量:2
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作者 李占龙 刘铁成 +2 位作者 周密 陆国会 里佐威 《光散射学报》 2008年第2期168-172,共5页
动物丝纤维的特殊性能与丝蛋白的构象密切相关,本文对蜘蛛牵引丝的不同溶剂下的收缩率和水处理的构象变化进行了研究。水中蜘蛛丝收缩最大,达到50%;通过红外光谱分析,对水处理的丝蛋白的构象进行了研究,结果表明丝蛋白β折叠结构增加,... 动物丝纤维的特殊性能与丝蛋白的构象密切相关,本文对蜘蛛牵引丝的不同溶剂下的收缩率和水处理的构象变化进行了研究。水中蜘蛛丝收缩最大,达到50%;通过红外光谱分析,对水处理的丝蛋白的构象进行了研究,结果表明丝蛋白β折叠结构增加,而β转角变化很小。氢键受到水分子的影响高频组份与低频组份比例发生变化,进而对酰胺I谱带的C=O的振动的频率产生影响,使C=O的电子云密度降低,酰胺I频率向低频方向发生移动,这说明酰胺I的振动频率与氢键是紧密相关的。 展开更多
关键词 蜘蛛牵引丝 构象 红外吸收谱 酰胺 氢键
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酰胺型配体铜、锌、银配合物的合成、结构及荧光性质(英文) 被引量:1
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作者 林龙 李先宏 +3 位作者 张波 张战营 吴伟娜 王元 《无机化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1653-1658,共6页
合成并通过单晶衍射表征了5个配合物[Cu LCl2]·CH3COCH3(1)、[Zn LCl2]·CH3COCH3(2)、[Zn L(NO3)2]·0.5CH3COCH3(3)、[Ag L2]Cl O4(4)和[Ag L2]BF4(5)(L=2-(5-氯-8-喹啉氧基)-1-(吡咯烷-1-基)乙酮)。配合物1和2同构,五... 合成并通过单晶衍射表征了5个配合物[Cu LCl2]·CH3COCH3(1)、[Zn LCl2]·CH3COCH3(2)、[Zn L(NO3)2]·0.5CH3COCH3(3)、[Ag L2]Cl O4(4)和[Ag L2]BF4(5)(L=2-(5-氯-8-喹啉氧基)-1-(吡咯烷-1-基)乙酮)。配合物1和2同构,五配位的中心金属离子采取扭曲的四方锥配位构型,与来自配体L的2个氧原子和1个氮原子及2个氯离子配位。而在配合物3中,锌离子与1个三齿配位的配体L,1个单齿配位的硝酸根和1个双齿配位的硝酸根配位,配位构型为扭曲的八面体。配合物4和5中,中心金属与配体的比例为1∶2。银离子与2个三齿配位的配体L配位,采取扭曲的八面体配位构型。乙腈溶液中,配合物1、2、4和5在410 nm处的最大荧光发射峰与配体L相似。而配合物3由于配体到锌离子之间的能量转移,最大荧光发射峰红移至430 nm。 展开更多
关键词 铜配合物 锌配合物 银配合物 酰胺型配体 荧光
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N-乙基丙酰胺在高浓度盐溶液中的超快二维红外光谱
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作者 于鹏云 赵娟 +2 位作者 吴延州 董田田 王建平 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第S1期121-122,共2页
β-多肽是由β-氨基酸组成的一类非天然多肽,具有丰富的二级结构。N-乙基丙酰胺(NEPA)是研究β-多肽骨架结构动力学的重要模型分子。解析NEPA在不同溶液环境下的超快结构变化,对研究β-多肽在不同条件下的结构分布及动态结构变化过程有... β-多肽是由β-氨基酸组成的一类非天然多肽,具有丰富的二级结构。N-乙基丙酰胺(NEPA)是研究β-多肽骨架结构动力学的重要模型分子。解析NEPA在不同溶液环境下的超快结构变化,对研究β-多肽在不同条件下的结构分布及动态结构变化过程有着重要意义。我们选取酰胺-Ⅰ带为探针,利用傅里叶变换红外(FTIR)光谱和超快二维红外(2DIR)光谱手段,研究了NEPA分别与高浓度(4.5mol·L^(-1))下的CaCl_2和MgCl_2之间的作用机制。本研究旨在阐明离子与NEPA酰胺单元的相互作用,为解释β-多肽在复杂溶液环境中的结构动力学提供实验依据。 展开更多
关键词 β-多肽 骨架结构动力学 酰胺- CA2+ Mg2+
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金属阳离子与β-肽骨架相互作用的振动光谱特征
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作者 赵娟 王建平 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2016年第S1期99-100,共2页
盐溶液中,金属阳离子(如Na+和Mg2+等)与肽分子骨架的相互作用,在酰胺基团的振动光谱中能得到体现。本工作利用红外光谱实验、分子动力学模拟和量化计算方法,以酰胺-Ⅰ带和酰胺-Ⅱ带为探针,研究了上述金属阳离子与?-肽模型分子-氮乙基丙... 盐溶液中,金属阳离子(如Na+和Mg2+等)与肽分子骨架的相互作用,在酰胺基团的振动光谱中能得到体现。本工作利用红外光谱实验、分子动力学模拟和量化计算方法,以酰胺-Ⅰ带和酰胺-Ⅱ带为探针,研究了上述金属阳离子与?-肽模型分子-氮乙基丙酰胺(N-ethylpropionamide,NEPA)分子骨架的作用。研究表明在盐溶液中,阳离子/阴离子/水分子之间形成复合物。作为阳离子配体的水分子与NEPA中的羰基氧之间存在动态相互作用,从而使得酰胺-Ⅰ带和酰胺-Ⅱ带的光谱发生劈裂。我们也讨论了酰胺NH与水合离子团簇的相互作用。 展开更多
关键词 红外光谱 金属阳离子 β-肽 酰胺- 酰胺-Ⅱ带
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赖氨酸二肽二级结构与振动光谱特性研究 被引量:1
11
作者 庄丹玲 蔡开聪 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2016年第S1期21-22,共2页
利用量子化学方法,在B3LYP/6-31+G(d)水平上系统考察气相中赖氨酸二肽(lysine dipeptide,LYSD)分子骨架上对二级结构敏感的振动探针——酰胺-I带的振动光谱。通过势能分布(potential energy distribution,PED)分析方法对酰胺-I带振动模... 利用量子化学方法,在B3LYP/6-31+G(d)水平上系统考察气相中赖氨酸二肽(lysine dipeptide,LYSD)分子骨架上对二级结构敏感的振动探针——酰胺-I带的振动光谱。通过势能分布(potential energy distribution,PED)分析方法对酰胺-I带振动模式进行指认,探究酰胺-Ⅰ带振动频率与二肽二级结构之间的相关性,为二肽构象态预测提供了有效途径。 展开更多
关键词 赖氨酸二肽 振动光谱 酰胺- 二级结构
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同位素标记和二维红外光谱研究菌紫质的局部构象动力学
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作者 胡溶 于鹏云 +1 位作者 贺雪梅 王建平 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第S1期125-126,共2页
将^(13)C同位素标记的赖氨酸作为红外探针引入细菌视紫红质中,借助傅里叶变换红外光谱和二维红外光谱,我们对该蛋白质的局部结构动力学进行了探究。结果表明一些特定位点的酰胺-Ⅰ带吸收峰发生了明显的红移。在标记的七个赖氨酸残基中,... 将^(13)C同位素标记的赖氨酸作为红外探针引入细菌视紫红质中,借助傅里叶变换红外光谱和二维红外光谱,我们对该蛋白质的局部结构动力学进行了探究。结果表明一些特定位点的酰胺-Ⅰ带吸收峰发生了明显的红移。在标记的七个赖氨酸残基中,位于细胞外侧螺旋-D的环区域中的赖氨酸129残基,在高频1690cm^(-1)处具有独特的酰胺-Ⅰ带吸收,为利用线性和非线性手段研究细胞外表面结构和水合动力学提供了局部探针。 展开更多
关键词 同位素标记 二维红外光谱 红外探针 酰胺-
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Interactive association between processing induced molecular structure changes and nutrient delivery on a molecular basis,revealed by cutting-edge vibrational biomolecular spectroscopy 被引量:3
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作者 Aya Ismael Victor Hugo Guevara-Oquendo +1 位作者 Basim Refat Peiqiang Yu 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2020年第1期211-226,共16页
Background:This study was conducted to determine protein molecular structure profiles and quantify the relationship between protein structural features and protein metabolism and bioavailability of blend pel eted prod... Background:This study was conducted to determine protein molecular structure profiles and quantify the relationship between protein structural features and protein metabolism and bioavailability of blend pel eted products(BPP)based on co-products(canola or carinata)from processing with different proportions of pulse pea screenings and lignosulfonate chemical compound.Method:The protein molecular structures were determined using the non-invasive advanced vibrational molecular spectroscopy(ATR-FT/IR)in terms of chemical structure and biofunctional groups of amides(ⅠandⅡ),α-helix andβ-sheet.Results:The results showed that increasing the level of the co-products in BPP significantly increased the spectral intensity of the amide area and amide height.The products exhibited similar protein secondaryα-helix toβ-sheet ratio.The protein molecular structure profiles(amidesⅠandⅡ,α-helix toβ-sheet)were highly associated with protein degradation kinetics and intestinal digestion.In conclusion,the non-invasive vibrational molecular spectroscopy(ATR-FT/IR)could be used to detect inherent structural make-up characteristics in BPP.Conclusion:The molecular structural features related to protein biopolymer were highly associated with protein utilization and metabolism. 展开更多
关键词 ALPHA-HELIX and BETA-SHEET Amides(andⅡ) Biofunctional groups Chemical STRUCTURE PROTEIN metabolism and bioavailability PROTEIN molecular STRUCTURE
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酰胺Ⅰ带和酰胺Ⅲ带测定花生磷脂酶D的α-螺旋和β-折叠含量 被引量:12
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作者 曹栋 史苏佳 +2 位作者 张永刚 袁凯 马雪婷 《化学通报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期877-880,共4页
用傅立叶红外光谱的酰胺Ⅰ带和酰胺Ⅲ带测定花生磷脂酶D的α-螺旋和β-折叠含量。结果显示,两个谱带测定的β-折叠含量误差在3%以内,α-螺旋含量的误差在5%左右。
关键词 酰胺 酰胺Ⅲ带 磷脂酶D
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