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New insights into ATR inhibition in muscle invasive bladder cancer:The role of apolipoprotein B mRNA editing catalytic subunit 3B
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作者 HYUNHO KIM UIJU CHO +5 位作者 SOOK HEE HONG HYUNG SOON PARK IN-HO KIM HO JUNG AN BYOUNG YONG SHIM JIN HYOUNG KANG 《Oncology Research》 SCIE 2024年第6期1021-1030,共10页
Background:Apolipoprotein B mRNA editing catalytic polypeptide(APOBEC),an endogenous mutator,induces DNA damage and activates the ataxia telangiectasia and Rad3-related(ATR)-checkpoint kinase 1(Chk1)pathway.Although c... Background:Apolipoprotein B mRNA editing catalytic polypeptide(APOBEC),an endogenous mutator,induces DNA damage and activates the ataxia telangiectasia and Rad3-related(ATR)-checkpoint kinase 1(Chk1)pathway.Although cisplatin-based therapy is the mainstay for muscle-invasive bladder cancer(MIBC),it has a poor survival rate.Therefore,this study aimed to evaluate the efficacy of an ATR inhibitor combined with cisplatin in the treatment of APOBEC catalytic subunit 3B(APOBEC3B)expressing MIBC.Methods:Immunohistochemical staining was performed to analyze an association between APOBEC3B and ATR in patients with MIBC.The APOBEC3B expression in MIBC cell lines was assessed using real-time polymerase chain reaction and western blot analysis.Western blot analysis was performed to confirm differences in phosphorylated Chk1(pChk1)expression according to the APOBEC3B expression.Cell viability and apoptosis analyses were performed to examine the anti-tumor activity of ATR inhibitors combined with cisplatin.Results:There was a significant association between APOBEC3B and ATR expression in the tumor tissues obtained from patients with MIBC.Cells with higher APOBEC3B expression showed higher pChk1 expression than cells expressing low APOBEC3B levels.Combination treatment of ATR inhibitor and cisplatin inhibited cell growth in MIBC cells with a higher APOBEC3B expression.Compared to cisplatin single treatment,combination treatment induced more apoptotic cell death in the cells with higher APOBEC3B expression.Conclusion:Our study shows that APOBEC3B’s higher expression status can enhance the sensitivity of MIBC to cisplatin upon ATR inhibition.This result provides new insight into appropriate patient selection for the effective application of ATR inhibitors in MIBC. 展开更多
关键词 apolipoprotein b mRNA editing catalytic polypeptide(APObEC) Ataxia telangiectasia and Rad3-related(ATR) bladder cancer DNA damage response DNA replication stress
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APOBEC3G对HIV-1及其Vif缺失株的抑制作用 被引量:1
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作者 李岚 曾毅 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2011年第2期177-181,共5页
目的研究细胞内在抗病毒因子APOBEC3G对HIV-1及其Vif缺失株的抑制作用。方法 HIV-1野生株病毒(BH10WT)和Vif缺失株病毒(BH10ΔVif)分别由转染293T细胞获得,通过感染MT4和H9细胞,分别检测其反转录酶活性。用分子克隆技术构建APOBEC3G与... 目的研究细胞内在抗病毒因子APOBEC3G对HIV-1及其Vif缺失株的抑制作用。方法 HIV-1野生株病毒(BH10WT)和Vif缺失株病毒(BH10ΔVif)分别由转染293T细胞获得,通过感染MT4和H9细胞,分别检测其反转录酶活性。用分子克隆技术构建APOBEC3G与绿色荧光蛋白融合表达的质粒pEGFP-3G。HIV-1野生株和Vif缺失株质粒与不同剂量的pEGFP-3G共转染293T细胞,APOBEC3G-GFP在细胞内融合表达定位通过荧光显微镜观察。所生成的子代病毒粒子的感染力分别由MAGI检测和反转录酶活性检测方法定量。结果 BH10 WT病毒在H9细胞和MT4细胞中均有所复制,在感染MT4细胞后4 d已经具有较高的反转录酶活性。BH10ΔVif病毒感染H9细胞产生的子代病毒的反转录酶活性接近细胞对照水平,而其在MT4细胞中产生的子代病毒的反转录酶活性在感染后12 d有所显现,即非允许性H9细胞内APOBEC3G对ΔVif病毒株具有很强的抑制作用。与绿色荧光蛋白融合表达的APOBEC3G蛋白定位于细胞质。BH10ΔVif转染293T细胞后生成的病毒滴度为2.75×104 U/mL,随着pEGFP-3G共转染量的升高,所产生的子代病毒滴度从1.48×103 U/mL显著降至0.33×103 U/mL。与0.2μg质粒pEGFP-3G共转染产生的BH10ΔVif病毒的感染力比不表达APOBEC3G的相同病毒的感染力降低近20倍。结论 APOBEC3G具有抗HIV活性,同时HIV Vif在病毒复制过程中发挥关键作用,两者之间相互作用的量效关系为我们构建抗病毒药物筛选平台奠定了可靠的实验基础。 展开更多
关键词 HIV-1 病毒感染因子 载脂蛋白bmRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G
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反转录病毒载体介导的猪APOBEC3F在猪源细胞PK15中的表达
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作者 罗佳 张念 +4 位作者 孙宇 吴健敏 陆芹章 马玉媛 章金刚 《生物技术通讯》 CAS 2012年第5期686-689,共4页
目的:利用反转录病毒载体构建猪载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白(APOBEC)3F重组质粒,并实现其在猪肾细胞PK15中的表达。方法:用RT-PCR方法扩增五指山猪来源的外周血淋巴细胞APOBEC3F基因,将其定点插入反转录病毒载体pMSCV neo中... 目的:利用反转录病毒载体构建猪载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白(APOBEC)3F重组质粒,并实现其在猪肾细胞PK15中的表达。方法:用RT-PCR方法扩增五指山猪来源的外周血淋巴细胞APOBEC3F基因,将其定点插入反转录病毒载体pMSCV neo中,同时于插入位点两侧分别添加FLAG和GFP标签,构建重组质粒pMSCV-FLAG-A3F-GFP,并进行酶切、测序鉴定;将鉴定正确的重组质粒与pVSV-G、pGag-Pol共转染包装细胞HEK293T,分别于转染后48~72 h收集细胞的培养上清以获得假型病毒粒子;用该假型病毒感染猪源细胞PK15,通过PCR、Western印迹检测目的基因的整合及表达。结果:PCR扩增到1254 bp的猪APOBEC3F基因,重组质粒pMSCV-FLAG-A3F-GFP经酶切、测序,结果无误;3质粒共转染HEK293T细胞包装出的假型病毒感染PK15细胞后观察到GFP表达;从感染假型病毒的PK15细胞基因组中扩增到1254 bp的猪APOBEC3F基因,Western印迹检测到78.1×103的猪APOBEC3F蛋白的表达。结论:实现了反转录病毒载体介导的猪APOBEC3F在猪源细胞PK15中的整合与表达,为深入研究该分子对猪内源性反转录病毒(PERV)的抑制作用奠定了基础。 展开更多
关键词 猪载脂蛋白b mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3F 反转录病毒载体 假型病毒 真核表达
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胞嘧啶脱氨基酶APOBEC1研究进展 被引量:1
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作者 周冰涵 严小璇 +2 位作者 蓝文贤 王春喜 曹春阳 《上海师范大学学报(自然科学版)》 2020年第2期234-244,共11页
为全面理解载脂蛋白B mRNA(ApoB mRNA)编辑酶催化多肽-1(APOBEC1)的作用机制,介绍了APOBEC1和ApoB mRNA的蛋白及核酸序列,总结并绘制了APOBEC1与不同的辅助蛋白的结合模型,阐述了APOBEC1催化ApoB mRNA第6666位的胞嘧啶(C6666)脱氨基化... 为全面理解载脂蛋白B mRNA(ApoB mRNA)编辑酶催化多肽-1(APOBEC1)的作用机制,介绍了APOBEC1和ApoB mRNA的蛋白及核酸序列,总结并绘制了APOBEC1与不同的辅助蛋白的结合模型,阐述了APOBEC1催化ApoB mRNA第6666位的胞嘧啶(C6666)脱氨基化分子机制.列举了啮齿动物APOBEC1抑制多种逆转录病毒的研究报道,介绍了兔源APOBEC1结合人类免疫缺陷病毒1(HIV-1)的病毒粒子并编辑病毒基因组的机理.同时介绍了APOBEC1通过编辑胞嘧啶或与AU富集元件(ARE)结合来调控癌症等疾病相关的细胞因子表达. 展开更多
关键词 载脂蛋白b mRNA(Apob mRNA) 载脂蛋白b mRNA编辑酶催化多肽-1(APObEC1) 胞嘧啶脱氨基化
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Apobec-1重组腺病毒治疗肾性高脂血症的实验研究
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作者 孔海波 胡波 胡鹏 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2015年第8期1049-1053,共5页
目的探讨肝脏获得性表达载脂蛋白B编辑催化多肽-1(Apobec-1)对肾性血脂代谢紊乱的调控效应。方法30只健康普通级雄性新西兰兔随机分为假手术组、肾病组、Apobec-1治疗组,每组10只。肾病组、Apobec-1治疗组适应性喂养1周后行左肾切除术,... 目的探讨肝脏获得性表达载脂蛋白B编辑催化多肽-1(Apobec-1)对肾性血脂代谢紊乱的调控效应。方法30只健康普通级雄性新西兰兔随机分为假手术组、肾病组、Apobec-1治疗组,每组10只。肾病组、Apobec-1治疗组适应性喂养1周后行左肾切除术,术后1周耳缘静脉注射阿霉素(4 mg/kg)构建肾病模型。术后11周Apobec-1治疗组耳缘静脉注射Apobec-1重组腺病毒(1×1013病毒颗粒/kg)。术后12周处死所有兔,并摘除右侧肾脏和肝脏,分别留取血液及24 h尿液,检测24 h尿蛋白(24UPr)、白蛋白(Alb)、尿素氮(BUN)、肌酐(Cr)、血脂等指标,HE染色观察肾脏病理,Western blot检测肝脏Apobec-1、载脂蛋白B48(Apo B48)蛋白表达水平。结果 1与假手术组比较,肾病组24UPr、BUN、Cr、总胆固醇(TC)、总三酰甘油(TG)、极低密度脂蛋白(VLDL-C)、低密度脂蛋白(LDL-C)、载脂蛋白B100(Apo B100)明显升高(P<0.05),而Alb水平明显下降(P<0.05);2与肾病组比较,Apobec-1治疗组TC、TG、VLDL-C、LDL-C、Apo B100、Apo B48水平明显下降(P<0.05);3与假手术组比较,Apobec-1治疗组24UPr、BUN、Cr明显升高(P<0.05),而Alb、Apo B48明显下降(P<0.05);4 Western blot结果显示,与假手术组、肾病组比较,Apobec-1治疗组肝脏Apobec-1、Apo B48表达明显上调(P<0.01)。结论肾性高脂血症中,肝脏获得性表达Apobec-1,重建Apo B mRNA编辑,增加Apo B48-脂蛋白的合成,进而起到一定的降脂效应。 展开更多
关键词 高脂血症 载脂蛋白b编辑催化多肽-1 载脂蛋白 b100 载脂蛋白b48
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稳定表达猪APOBEC3F的PK15细胞单克隆株的建立
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作者 贾俊婷 袁典 +2 位作者 汪琳 马玉媛 章金刚 《生物技术通讯》 CAS 2019年第1期31-35,72,共6页
目的:利用慢病毒载体建立稳定表达猪载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3F(pAPOBEC3F,简称pA3F)的PK15细胞系。方法:以实验室前期构建的pBPLV-flag-pA3F质粒为模板,PCR扩增pA3F基因,克隆到pLenti-Puro-3Flag载体构建成pLenti-Puro-pA3F... 目的:利用慢病毒载体建立稳定表达猪载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3F(pAPOBEC3F,简称pA3F)的PK15细胞系。方法:以实验室前期构建的pBPLV-flag-pA3F质粒为模板,PCR扩增pA3F基因,克隆到pLenti-Puro-3Flag载体构建成pLenti-Puro-pA3F-3Flag质粒,Western印迹鉴定其在HEK293T细胞中的表达;将pLenti-Puro-pA3F-3Flag质粒与包装载体共转染HEK293T细胞,包装成Lenti-pA3F慢病毒并测定病毒滴度;将Lenti-pA3F慢病毒感染PK15细胞,通过嘌呤霉素压力筛选并结合有限稀释法,筛选稳定表达pA3F的细胞单克隆株,最终Western印迹检测细胞单克隆株中pA3F的表达。结果:菌落PCR和序列测定表明pLenti-Puro-pA3F-3Flag质粒构建正确,Western印迹显示该质粒可在HEK293T细胞中表达pA3F蛋白;包装了Lenti-pA3F慢病毒,滴度为1.32×10~8TU/mL,慢病毒感染PK15细胞后可检测到pA3F蛋白的表达;经Western印迹鉴定,筛选得到的单克隆细胞可稳定表达pA3F蛋白。结论:建立了稳定表达pA3F的PK15细胞单克隆株,为进一步深入研究猪内源性反转录病毒在pA3F作用下的免疫逃逸机制奠定了基础。 展开更多
关键词 猪载脂蛋白b mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3F 慢病毒载体 猪内源性反转录病毒
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宫颈癌组织APOBEC3A蛋白的表达与高危型HPV感染的相关性研究 被引量:10
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作者 陈姗 狄娜 +4 位作者 秦君璞 郑婷婷 李丹 周莉 张帝开 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期845-849,共5页
目的:探讨宫颈癌组织中载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3A(APOBEC3A)表达与高危型人乳头瘤病毒(HPV)感染的关系。方法:采用免疫组化法检测26例宫颈癌、27例宫颈上皮内瘤变(CIN)I~III和22例正常宫颈组织APOBEC3A蛋白的表达,同时使... 目的:探讨宫颈癌组织中载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3A(APOBEC3A)表达与高危型人乳头瘤病毒(HPV)感染的关系。方法:采用免疫组化法检测26例宫颈癌、27例宫颈上皮内瘤变(CIN)I~III和22例正常宫颈组织APOBEC3A蛋白的表达,同时使用凯普分型检测试剂盒对3组样品分别进行高危HPV16/HPV18分型检测。以脂质体法转染APOBEC3A质粒进入HeLa细胞,RT-qPCR与Western blotting验证APOBEC3A对高危型HPV18 E6 mRNA以及蛋白表达的影响。结果:宫颈癌组织、CIN组织以及正常宫颈组织中APOBEC3A蛋白表达的阳性率分别为46.2%、92.6%和86.4%,宫颈癌组织中APOBEC3A蛋白表达较正常宫颈组织明显下降(P<0.01)。宫颈癌组织、CIN及正常宫颈组织中HPV16感染阳性率分别为92.3%、77.8%和54.5%;HPV18感染阳性率分别为80.8%、51.8%和68.2%;APOBEC3A蛋白表达与HPV18感染阳性率呈负相关(P<0.05)。增加HeLa细胞中APOBEC3A的表达明显降低了HPV18 E6 mRNA以及蛋白的表达。结论:在宫颈癌组织中APOBEC3A高表达可以对抗HPV18感染,并抑制HPV18 E6的转录和表达。 展开更多
关键词 载脂蛋白b mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3A 人乳头状瘤病毒 宫颈肿瘤
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猪APOBEC3F基因克隆及真核表达载体的构建与鉴定 被引量:4
8
作者 孙宇 罗佳 +1 位作者 马玉媛 章金刚 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第18期1904-1906,共3页
目的克隆猪载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3F(apolipoprotein B mRNA editing enzyme,catalyticpolypeptide 3F,APOBEC3F)基因,构建真核表达载体实现其在体外表达与鉴定。方法分离4头21周龄,体质量25~30kg的雌性健康五指山猪的外... 目的克隆猪载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3F(apolipoprotein B mRNA editing enzyme,catalyticpolypeptide 3F,APOBEC3F)基因,构建真核表达载体实现其在体外表达与鉴定。方法分离4头21周龄,体质量25~30kg的雌性健康五指山猪的外周血单个核细胞,Trizol法提取细胞总RNA,RT-PCR特异性扩增目的基因,目的基因插入真核表达载体pDsRed1-N1及改造的pCDNA3-Flage载体构建表达质粒并在PK-15细胞中进行表达。激光共聚焦显微镜及Western blot鉴定目的基因的表达。结果克隆的目的基因与公布的基因序列同源性达99%;激光共聚焦显微镜显示目的基因在PK-15细胞表达,且表达产物定位于细胞质内;Western blot检测示表达的目的蛋白大小与预期相符。结论成功构建了猪APOBEC3F真核表达载体。 展开更多
关键词 APObEC3F 克隆 真核表达载体 鉴定
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HIV/AIDS患者APOBEC3G mRNA水平与CD4T淋巴细胞计数相关研究 被引量:3
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作者 王福祥 毕蔓茹 +4 位作者 颜丙柱 周慧 刘卫华 李用国 周晋 《哈尔滨医科大学学报》 CAS 北大核心 2011年第2期138-141,145,共5页
目的探讨人体细胞内的载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G(apolipoprotein B mRNA editing enzyme-catalytic polypeptide-like 3G,APOBEC3G)与HIV疾病进展的关系及其与CD4 T淋巴细胞计数之间的关系。方法用实时荧光相对定量RT-PCR... 目的探讨人体细胞内的载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G(apolipoprotein B mRNA editing enzyme-catalytic polypeptide-like 3G,APOBEC3G)与HIV疾病进展的关系及其与CD4 T淋巴细胞计数之间的关系。方法用实时荧光相对定量RT-PCR的方法检测黑龙江省17例HIV-1感染者及7例健康人外周血单核细胞(PBMC)中APOBEC3G mRNA水平,同时检测黑龙江省17例HIV-1感染者及7例健康人CD4 T淋巴细胞计数。结果与未感染HIV组相比,HIV感染组APOBEC3G mRNA水平略降低,两组无显著性差异(P>0.05),3组APOBEC3G mRNA水平为:HIV未感染组>无症状感染组>AIDS患者组,但各组总体均数差异不显著(P>0.05)。HIV/AIDS患者CD4计数与APOBEC3G mRNA水平正相关(r=0.523,P=0.038)。结论 APOBEC3G在HIV-1疾病进展中可能发挥一定的作用。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒Ⅰ型 载脂蛋白bmRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G CD4T淋巴细胞计数
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激光扫描共聚焦显微镜研究APOBEC3G蛋白的亚细胞定位 被引量:3
10
作者 杨怡姝 李岚 +1 位作者 李泽琳 曾毅 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期16-21,共6页
采用RT-PCR技术,从HIV的非允许性H9细胞中获得载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G(APOBEC3G)的全长cDNA。APOBEC3G cDNA全长1 155nt,编码384个氨基酸。将APOBEC3G克隆到真核表达载体pEGFP-C3上,转染CD4+HeLa细胞,激光扫描共聚焦显微... 采用RT-PCR技术,从HIV的非允许性H9细胞中获得载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G(APOBEC3G)的全长cDNA。APOBEC3G cDNA全长1 155nt,编码384个氨基酸。将APOBEC3G克隆到真核表达载体pEGFP-C3上,转染CD4+HeLa细胞,激光扫描共聚焦显微镜下可观察到表达的GFP-APOBEC3G融合蛋白定位于细胞质。 展开更多
关键词 人免疫缺陷病毒 载脂蛋白b mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G 病毒感染因子 激光扫描共聚焦显微镜
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载脂蛋白BmRNA编辑酶催化多肽3G抗乙肝病毒作用研究进展 被引量:2
11
作者 王建军 赵平 《解放军医学院学报》 CAS 2016年第2期181-183,共3页
载脂蛋白B m RNA编辑酶催化多肽3G(apolipoprotein B m RNA editing enzyme catalytic polypeptide-like 3G,APOBEC3G)是一种天然抗病毒因子,目前研究证明其具有抗乙肝病毒的作用。它可能通过影响HBV DNA逆转录、诱导HBV DNA超突变、包... 载脂蛋白B m RNA编辑酶催化多肽3G(apolipoprotein B m RNA editing enzyme catalytic polypeptide-like 3G,APOBEC3G)是一种天然抗病毒因子,目前研究证明其具有抗乙肝病毒的作用。它可能通过影响HBV DNA逆转录、诱导HBV DNA超突变、包装到HBV病毒粒子中、参与干扰素的抗病毒作用等方式起到抗乙肝病毒的作用。它为新型抗病毒药物的开发和机体天然免疫机制的研究开拓了新的方向,可能对未来的HBV防治提供新的线索并产生重要影响。 展开更多
关键词 载脂蛋白b M RNA编辑酶催化多肽3G 慢性乙型肝炎 治疗
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肝细胞癌组织中APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员的表达观察 被引量:1
12
作者 陈清梅 陈睿 邓阳 《山东医药》 CAS 2018年第47期15-19,共5页
目的观察载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽3(APOBEC3s)类胞苷脱氨酶基因家族成员在肝细胞癌(HCC)组织中的表达变化,并探讨其意义。方法分别采用实时定量PCR和免疫组化法检测155例HCC患者癌组织和癌旁组织中的APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族... 目的观察载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽3(APOBEC3s)类胞苷脱氨酶基因家族成员在肝细胞癌(HCC)组织中的表达变化,并探讨其意义。方法分别采用实时定量PCR和免疫组化法检测155例HCC患者癌组织和癌旁组织中的APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员A3A、A3B、A3C、A3D、A3F、A3G、A3H的mRNA和蛋白。以癌组织中APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员mRNA相对表达量的中位数为界,将155例HCC患者分为高表达组和低表达组,并分析APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族各成员mRNA相对表达量与HCC预后的关系。结果 HCC患者癌组织中APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员A3A、A3B、A3C、A3D、A3F、A3G、A3H mRNA相对表达量分别为4. 08±0. 11、6. 61±0. 17、6. 42±0. 10、5. 29±0. 12、6. 64±0. 12、7. 49±0. 07、4. 32±0. 08,HCC患者癌旁组织中APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员A3A、A3B、A3C、A3D、A3F、A3G、A3H mRNA相对表达量分别为2. 93±0. 11、4. 60±0. 11、5. 48±0. 11、5. 22±0. 08、6. 97±0. 08、5. 91±0. 12、4. 21±0. 10,癌组织与癌旁组织中A3A、A3B、A3C、A3G mRNA相对表达量相比,P均<0. 05。HCC患者癌组织中APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员A3A、A3B、A3C、A3D、A3F、A3G、A3H蛋白阳性表达率分别为92. 3%、96. 8%、89. 0%、58. 1%、69. 7%、85. 9%、52. 9%,HCC患者癌旁组织中APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员A3A、A3B、A3C、A3D、A3F、A3G、A3H蛋白阳性表达率分别为61. 3%、63. 2%、57. 4%、61. 9%、74. 8%、47. 7%、47. 7%,癌组织与癌旁组织中A3A、A3B、A3C、A3G蛋白阳性表达率相比,P均<0. 05。155例HCC患者癌组织中A3A mRNA低表达者、高表达者5年生存率分别为27. 3%、17. 7%,两者相比,P <0. 05; A3B mRNA低表达者、高表达者5年生存率分别为30. 0%、17. 1%,两者相比,P <0. 05; A3G mRNA低表达者、高表达5年生存率分别为33. 6%、13. 7%,两者相比,P <0. 05。结论APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员A3A、A3B、A3C、A3G mRNA和蛋白表达水平在HCC癌组织中显著上调,且A3A、A3B、A3G mRNA高表达的HCC患者术后生存率低。 展开更多
关键词 载脂蛋白bmRNA编辑酶催化多肽3类胞苷脱氨酶 肝肿瘤 原发性肝癌 肝细胞癌
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人免疫缺陷病毒TAT蛋白转导肽与人载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白质3F/3G串联锌结合域的融合表达
13
作者 王革非 彭程 +2 位作者 张驰 曾祥兴 李康生 《汕头大学医学院学报》 2010年第2期84-88,共5页
目的:分析载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白质3F和3G(APOBEC3F/3G)的蛋白基序,获得具有细胞转导潜力的抗病毒基序融合蛋白。方法:用MotifScan软件对APOBEC3F/3G进行生物信息学分析,找出APOBEC3F/3G中的锌结合域(ZBRs)。通过PCR及多... 目的:分析载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白质3F和3G(APOBEC3F/3G)的蛋白基序,获得具有细胞转导潜力的抗病毒基序融合蛋白。方法:用MotifScan软件对APOBEC3F/3G进行生物信息学分析,找出APOBEC3F/3G中的锌结合域(ZBRs)。通过PCR及多步酶切克隆得到APOBEC3F/3G的3个串联ZBRs基因片段,并将其与人免疫缺陷病毒(HIV)的TAT蛋白转导域基因克隆至原核表达载体(pET32a),转化大肠杆菌BL21(DE3)并诱导表达。结果:酶切和测序鉴定,得到含有HIV-TAT和3个ZBRs基因的重组质粒;十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳检测分析,融合蛋白在BL21(DE3)中获得表达,占菌体总蛋白的20%。结论:获得含HIV-TAT和3个ZBRs的融合表达重组蛋白,为进一步研究APOBEC3F/3G抗病毒机制,也为其在抗病毒治疗中的应用打下基础。 展开更多
关键词 载脂蛋白b mRNA编辑酶催化多肽样蛋白质3F/3G 锌结合域 蛋白转导
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载脂蛋白B RNA编辑机制概述 被引量:1
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作者 刘树涛 李慧萍 齐庆远 《中国农学通报》 CSCD 2013年第15期135-141,共7页
载脂蛋白B(apoB)是负责脂类转运的脂蛋白中的蛋白组成部分,在人体内主要以apoB-100和apoB-48两种形式存在。apoB-48是apoB-100mRNA转录后经RNA编辑产生的。包含apoB-48的脂蛋白不会变成致动脉粥样硬化的低密度脂蛋白。编辑过程涉及一系... 载脂蛋白B(apoB)是负责脂类转运的脂蛋白中的蛋白组成部分,在人体内主要以apoB-100和apoB-48两种形式存在。apoB-48是apoB-100mRNA转录后经RNA编辑产生的。包含apoB-48的脂蛋白不会变成致动脉粥样硬化的低密度脂蛋白。编辑过程涉及一系列蛋白质对单个碱基进行精确的脱氨基修饰,受多种因素的调节。这些蛋白质的精确组成及各自在编辑过程中的作用尚不清楚。对apoBmRNA编辑机制的理解有助于为脂蛋白相关疾病治疗提供理论依据。 展开更多
关键词 RNA编辑 载脂蛋白b APObEC-1 ACF 机制
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APOBEC3蛋白与HPV及宫颈癌的研究进展 被引量:4
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作者 魏智(综述) 赵洪波 +2 位作者 张涛 冯璇 杜琰(审校) 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期271-276,共6页
宫颈癌是严重威胁女性健康的恶性肿瘤之一,已知人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)感染是宫颈癌的主要病因,但具体机制尚不明确。人载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽(apolipoprotein B mRNA-editing enzyme catalytic polypeptide,AP... 宫颈癌是严重威胁女性健康的恶性肿瘤之一,已知人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)感染是宫颈癌的主要病因,但具体机制尚不明确。人载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽(apolipoprotein B mRNA-editing enzyme catalytic polypeptide,APOBEC)家族是一组能够编辑DNA或RNA序列的胞苷脱氨酶。APOBEC3成员是固有免疫系统的重要成员,在抗病毒感染防御过程中扮演重要角色。APOBEC3与多种肿瘤的发生发展密切相关,可能与HPV感染以及宫颈癌的关系尤为密切。APOBEC3B可能通过“协助”HPV病毒使抑癌蛋白失活及促进HPV病毒癌蛋白的突变,从而促进癌症的发生。本文就APOBEC3与HPV清除、突变和宫颈癌发生方面的研究进行综述。 展开更多
关键词 载脂蛋白b mRNA编辑催化多肽3(APObEC3) 宫颈癌 人乳头瘤病毒(HPV)
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人天然免疫蛋白载脂蛋白B mRNA编辑酶催化亚基3A(APOBEC3A)的克隆表达及活性鉴定
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作者 成珊 曹丽妍 +2 位作者 杜娟 王文勇 郭晏海 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期179-184,共6页
目的构建载脂蛋白B mRNA编辑酶催化亚基3A(APOBEC3A)表达载体,真核细胞表达APOBEC3A并鉴定其胞嘧啶脱氨酶活性。方法构建APOBEC3A真核表达载体pc DNA3.0-APOBEC3A,转染HEK293T细胞和Hep G2细胞。Western blot法鉴定APOBEC3A蛋白表达,免... 目的构建载脂蛋白B mRNA编辑酶催化亚基3A(APOBEC3A)表达载体,真核细胞表达APOBEC3A并鉴定其胞嘧啶脱氨酶活性。方法构建APOBEC3A真核表达载体pc DNA3.0-APOBEC3A,转染HEK293T细胞和Hep G2细胞。Western blot法鉴定APOBEC3A蛋白表达,免疫荧光细胞化学染色确定APOBEC3A在HEK293T细胞和Hep G2细胞的定位,利用组蛋白(His)标签蛋白纯化方法富集纯化APOBEC3A蛋白,荧光偏振技术检测APOBEC3A脱氨酶活性。结果 DNA测序证实pc DNA3.0-APOBEC3A插入长600 bp的APOBEC3A基因序列;该质粒能在HEK293T细胞和Hep G2细胞表达APOBEC3A,APOBEC3A在HEK293T细胞中主要分布于胞质,在Hep G2细胞中胞质和胞核均匀分布;纯化获得的APOBEC3A对单链DNA中TTCA序列具有胞嘧啶脱氨基活性。结论成功构建APOBEC3A真核表达载体,APOBEC3A在HEK293T细胞和Hep G2细胞定位不同,表达的APOBEC3A具有胞嘧啶脱氨基活性。 展开更多
关键词 固有免疫 载脂蛋白b mRNA编辑酶催化亚基3A(APObEC3A) 胞嘧啶脱氨酶 克隆表达
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天然免疫抗病毒分子APOBEC3s在宫颈癌组织中的表达及意义
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作者 隋霜 陈红香 +1 位作者 玛依努尔·尼牙孜 王琳 《现代肿瘤医学》 CAS 2020年第9期1516-1520,共5页
目的:探讨载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3s(apolipoprotein B mRNA-editing enzyme catalytic polypeptide 3 protein,APOBEC3s)各个蛋白在维吾尔族宫颈癌和宫颈炎组织中的表达及意义。方法:选择2015年1月至2017年12月在新疆维吾... 目的:探讨载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3s(apolipoprotein B mRNA-editing enzyme catalytic polypeptide 3 protein,APOBEC3s)各个蛋白在维吾尔族宫颈癌和宫颈炎组织中的表达及意义。方法:选择2015年1月至2017年12月在新疆维吾尔自治区人民医院妇科门诊和病区行宫颈液基薄层细胞学检查和HC-Ⅱ高危型HPV检测联合筛查并同时行阴道镜活检和组织病理学诊断的维吾尔族妇女148例,其中高危型HPV阴性慢性宫颈炎80例,宫颈癌68例,提取宫颈组织中的RNA和蛋白质,并采用Real-Time PCR检测APOBEC3s各个蛋白mRNA转录水平,采用Western blot检测APOBEC3s各个蛋白表达水平。结果:APOBEC3C、APOBEC3F、APOBEC3G mRNA在宫颈癌组和宫颈炎组表达水平进行比较,差异有统计学意义(P=0.006,0.001,0.003);APOBEC3A、APOBEC3B、APOBEC3DE、APOBEC3H mRNA在宫颈癌组和宫颈炎组表达水平比较,差异无统计学意义(P=0.612,0.076,0.247,0.984);采用Western blot检测APOBEC3C、APOBEC3F、APOBEC3G蛋白表达水平在宫颈癌组和宫颈炎组进行比较,差异有统计学意义(P=0.001,0.001,0.001);Western blot检测APOBEC3A、APOBEC3B、APOBEC3DE、APOBEC3H蛋白表达水平在宫颈癌组和宫颈炎组进行比较,差异无统计学意义(P=0.612,0.076,0.247,0.984)。结论:APOBEC3C、APOBEC3F和APOBEC3G与维吾尔族宫颈癌发生具有相关性。 展开更多
关键词 载脂蛋白b mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3s 宫颈癌 维吾尔族 发病机制
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癌症新型的诊疗靶点——APOBEC
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作者 鲁晶晶 门姝含 韩英伦 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期152-158,共7页
APOBEC("载脂蛋白质B mRNA编辑催化多肽")是一类进化保守的胞苷脱氨酶家族。在人体内,已知含有保守的DNA胞嘧啶脱氨酶结构域的基因共有11种,包括AID、APOBEC1、APOBEC2、APOBEC3基因家族APOBEC3A、APOBEC3B、APOBEC3C、APOBEC... APOBEC("载脂蛋白质B mRNA编辑催化多肽")是一类进化保守的胞苷脱氨酶家族。在人体内,已知含有保守的DNA胞嘧啶脱氨酶结构域的基因共有11种,包括AID、APOBEC1、APOBEC2、APOBEC3基因家族APOBEC3A、APOBEC3B、APOBEC3C、APOBEC3DE、APOBEC3F、APOBEC3G、APOBEC3H(分别称为A3A、A3B、A3C、A3D、A3F、A3G和A3H)和APOBEC4。APOBEC利用其脱氨酶活性通过与RNA和/或DNA结合,催化mRNA或使DNA中的胞嘧啶核苷酸转变为尿嘧啶,或者胞嘧啶核苷酸转变为胸腺嘧啶核苷酸,进而完成各自不同的功能。目前研究发现,AID及APOBEC3(A3s)的7种脱氨酶在人类的天然免疫和适应性免疫防御过程中发挥重要的作用,且在口腔癌,肺癌(腺癌和鳞状细胞癌),结直肠癌和乳腺癌等的诊疗过程中具有重要的潜在应用价值。AID可以通过将胞嘧啶脱氨基成尿嘧啶,来启动SHM(体细胞超突变)和CSR(类别转换重组),进而在抗体多样性方面发挥作用。它的异常表达能够使B细胞淋巴瘤等恶性肿瘤的发病频率显著增加。而A3A、A3B通过胞嘧啶到尿嘧啶转换,以及自身表达量上调而在乳腺癌和肺癌诊疗中起作用。A3G通过APOBEC3G/miR-29/MMP2为了解结直肠癌肝转移和开发治疗晚期结肠癌的有效疗法开辟了新的途径。综上所述,本文将以AID,A3A,A3B,A3G为例子,对APOBEC在癌症诊断和治疗方面的应用进行综述,以期为进一步药物研究和临床应用等提供参考。 展开更多
关键词 载脂蛋白b mRNA编辑催化多肽 癌症 诊断 治疗
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病毒感染因子在APOBEC3G抗病毒中的拮抗作用
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作者 王运华 张耀洲 《细胞生物学杂志》 CSCD 2008年第3期297-300,共4页
病毒感染因子(virion infectivity factor,Vif)是人免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)的6个辅助蛋白之一,是病毒进行有效复制所必需的。由于Vif功能的复杂性以及对相应复合物体系的不了解,一直以来,对Vif的研究进展缓慢... 病毒感染因子(virion infectivity factor,Vif)是人免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)的6个辅助蛋白之一,是病毒进行有效复制所必需的。由于Vif功能的复杂性以及对相应复合物体系的不了解,一直以来,对Vif的研究进展缓慢。直到2002年发现载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G(apolipoprotein B mRNA-editing enzyme catalytic polypeptide-like3G,APOBEC3G)是存在于细胞内的一种天然抗病毒因子后,Vif的功能才被逐步阐明。APOBEC3G主要通过嘧啶脱氨基活性使HIV-1的负链DNA在逆转录过程中发生致死性超突变,从而起到抗病毒作用。HIV-1基因编码Vif来拮抗APOBEC3G,二者在宿主细胞内达到动态平衡。Vif通过介导APOBEC3G降解、减少在胞内的表达、阻碍其向病毒粒子的包装以及促使其装配成无活性的高分子质量复合体等多种途径起到中和作用。对Vif/APOBEC3G相互作用及其调节机制的进一步研究,将为新型抗HIV-1病毒药物的研制与开发提供理论依据。 展开更多
关键词 人免疫缺陷病毒 病毒感染因子 载脂蛋白b mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G
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APOBEC3B调控葡萄膜黑色素瘤复制应激的研究
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作者 宗春燕 何杰 +2 位作者 张哲 贾仁兵 沈键锋 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1034-1044,共11页
目的·研究载脂蛋白B mRNA编辑酶催化亚基3B(apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B,APOBEC3B)在葡萄膜黑色素瘤(uveal melanoma,UM)中的生物学功能以及对药物治疗敏感性的影响。方法·应用免疫组织化学... 目的·研究载脂蛋白B mRNA编辑酶催化亚基3B(apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B,APOBEC3B)在葡萄膜黑色素瘤(uveal melanoma,UM)中的生物学功能以及对药物治疗敏感性的影响。方法·应用免疫组织化学染色和Western blotting,分别检测眼部黑色素瘤[UM和结膜黑色素瘤(conjunctival melanoma,CM)]组织和细胞中APOBEC3B蛋白的表达水平。通过检索癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库,分析UM中APOBEC3B表达水平与预后的关联。使用CRISPR-Cas9质粒APOBEC3B-sgRNA敲除UM细胞系OMM2.3中APOBEC3B基因,构建APOBEC3B敲除的OMM2.3稳转细胞系sgAPOBEC3B以及对照细胞系Vector;并通过克隆形成实验,探索APOBEC3B敲除对OMM2.3细胞增殖的影响。同时,通过APOBEC3B-shRNA和空载质粒建立APOBEC3B敲低的OMM2.3细胞shAPOBEC3B和对照细胞shCtrl,对其进行转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq),检测差异基因,并通过基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)揭示APOBEC3B调控的下游通路。通过免疫荧光染色鉴定下游通路的关键蛋白。通过应用通路靶向药物处理,检测APOBEC3B对UM药物治疗敏感性的影响。结果·免疫组织化学染色结果表明眼部黑色素瘤(UM和CM)组织相较于良性色素痣组织APOBEC3B表达更高。Western blotting也表明包括OMM2.3细胞在内的大多数眼部黑色素瘤细胞相较于正常对照细胞(视网膜色素上皮细胞)APOBEC3B蛋白表达水平更高。并且TCGA数据库分析表明,APOBEC3B高表达的UM患者总生存期(P=0.032)和无病生存期(P=0.000)更短。然而APOBEC3B敲除并不影响OMM2.3细胞克隆形成的能力,APOBEC3B敲低也没有造成细胞周期的显著改变。shAPOBEC3B和shCtrl细胞系的RNA-seq差异基因富集分析结果显示,APOBEC3B参与调控OMM2.3细胞的复制应激相关通路,并且热图分析也显示APOBEC3B敲低后DNA复制应激相关通路基因表达发生改变。免疫荧光染色结果显示,APOBEC3B敲低后复制应激通路关键靶标磷酸化的复制蛋白A 32 kDa亚基(replication protein A 32 kDa subunit,RPA32)水平降低。在对APOBEC3B敲低的OMM2.3细胞和对照细胞的药物敏感性实验中,发现相较于shAPOBEC3B细胞,shCtrl细胞对细胞周期检测点激酶1(cell cycle checkpoint kinase 1,CHK1)抑制剂的敏感性更高。结论·APOBEC3B参与调控OMM2.3细胞复制应激相关通路,且APOBEC3B表达的OMM2.3细胞对CHK1抑制剂的处理更为敏感。 展开更多
关键词 载脂蛋白b mRNA编辑酶催化亚基3b(APObEC3b) 葡萄膜黑色素瘤 复制应激 细胞周期检测点激酶1(CHK1)抑制剂
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