期刊文献+
共找到54篇文章
< 1 2 3 >
每页显示 20 50 100
Cholic acid mitigates osteoarthritis by inhibiting the NF-κB/PERK/ SIRT1 signaling pathway
1
作者 JIAOE SHENG ZUMIN YI +5 位作者 SANSHAN HE QINGCHAO WU XIA HUANG GUOQING YAN YUFANG DAI LINCHONG SU 《BIOCELL》 SCIE 2024年第7期1095-1104,共10页
Introduction:Cholic acid(CA)is a natural steroid useful in treating chronic bronchitis and cholecystitis.On the other hand,its potential impact on osteoarthritis(OA)is unknown.Objective:Using an in vitro and in vivo o... Introduction:Cholic acid(CA)is a natural steroid useful in treating chronic bronchitis and cholecystitis.On the other hand,its potential impact on osteoarthritis(OA)is unknown.Objective:Using an in vitro and in vivo osteoarthritis model,we sought to assess the chondroprotective properties of CA.Methods:We employed the Cell Counting Kit-8 to measure the impact of CA on chondrocyte activity to assess the toxicity of the cells.Multiple molecular biology experimental techniques were used to investigate potential signaling pathways that CA may use to prevent inflammation and give chondrocytes protection.Furthermore,how CA affects the OA model in Sprague-Dawley(SD)rats was evaluated.Results:CA significantly suppressed the up-regulation of the interleukin-1β(IL-1β),cyclooxygenase-2(COX-2),and matrix metalloproteinase 13(MMP-13)and the downregulation of aggrecan and type II collagen A1(COL2A)in chondrocytes treated tumor necrosis factor-alpha(TNF-α).Differentially expressed genes(DEG)enrichment revealed IL-17,TNF,chemokine,cytokine-cytokine receptor,toll-like receptor,and nucleotide oligomerization domain-like receptor were the primary signaling pathways.The enriched DEGs included CXCL6,CCL20,MMP3,CXCL3,CXCL11,CCL5,CXCL10,MMP9,MMP13,and CXCL2;these DEGs are involved in inflammatory responses and their expression induced by TNF-αwas reversed by CA treatment.CA inhibits p65 nuclear translocation and inhibitory subunit kappa B alpha(IκBα)phosphorylation induced by TNF-α.Furthermore,CA attenuated protein expression of protein kinase RNA-like endoplasmic reticulum kinase(PERK),inositol-requiring transmembrane kinase/endoribonuclease 1α(IRE1α),glucose regulatory protein 78(GRP78),and sirtuin 1(SIRT1),and down-regulation of phosphorylation of AMP-activated protein kinase-α(p-AMPKα)in TNF-α-treated chondrocytes.Conclusions:CA significantly ameliorated cartilage degradation in the OA rat model.CA alleviated the inflammatory response through the nuclear factor kappa B/PERK/SIRT1 axis and ameliorated cartilage degradation. 展开更多
关键词 Cholic acid CARTILAGE Inflammation RNA sequencing differentially expressed genes
下载PDF
低叶酸联合甲氨蝶呤诱导神经管畸形胎鼠的神经组织转录组学分析
2
作者 王芳 李建婷 +1 位作者 谢秋 张霆 《医学研究杂志》 2024年第3期50-55,共6页
目的利用低叶酸饲喂联合甲氨蝶呤(methotrexate,MTX)诱导的小鼠神经管畸形(neural tube defects,NTDs)模型,分析孕9.5天胎鼠脑组织和脊髓组织基因转录表达的变化,探讨可能影响神经组织发育的功能基因及转录因子。方法将SPF级、6~8周龄... 目的利用低叶酸饲喂联合甲氨蝶呤(methotrexate,MTX)诱导的小鼠神经管畸形(neural tube defects,NTDs)模型,分析孕9.5天胎鼠脑组织和脊髓组织基因转录表达的变化,探讨可能影响神经组织发育的功能基因及转录因子。方法将SPF级、6~8周龄健康雌性ICR小鼠分为两组,其中对照组采用正常饲喂,低叶酸联合MTX实验组采用低叶酸饲喂,4周后交配,受孕7.5天实验组以1.5mg/kg浓度腹腔注射MTX,受孕9.5天获取两组的胎鼠脑、脊髓组织,分别提取总RNA进行RNA-seq,采用DESeq软件筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),采用生物信息学方法分析实验组与对照组中影响神经组织发育的差异基因功能及转录因子。结果实验组与对照组比较,脑、脊髓组织基因转录组分别有939、879个DEGs。GO(gene ontology)功能分析显示,脑组织DEGs功能按生物学过程(biological process,BP)分类,上、下调的基因均主要集中在细胞过程、生物调节、发育过程;按细胞组分(cellular component,CC)分类,上、下调的基因均主要集中在细胞、细胞器相关组分;按分子功能(molecular function,MF)分类,上、下调的基因均主要集中在蛋白结合、转录调节活性。脊髓组织DEGs功能在各分类中结果与脑组织的相似。脑、脊髓组织的差异表达转录因子主要聚焦在zf-C2H2、bHLH、Homeobox、STAT等家族。结论低叶酸联合MTX能够引起胎鼠神经组织基因组的转录改变,DEGs功能主要与神经细胞发育、转录调节有关。影响神经发育的转录调节因子集中在zf-C2H2、bHLH、Homeobox、STAT家族。 展开更多
关键词 神经管畸形 叶酸 甲氨蝶呤 转录组测序 差异表达基因
下载PDF
转录组测序分析外源水杨酸诱导茶树热激蛋白基因的响应
3
作者 刘悦 曲浩 +3 位作者 田易萍 陈春林 冉隆珣 陈林波 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期607-614,共8页
水杨酸是诱导植物抗性机制中重要的信号分子,外源喷施水杨酸能够调控多种防御相关蛋白质,提升农作物的抗病能力。开展外源水杨酸诱导茶树抗性机制的研究能够挖掘抗病基因,为茶树抗病育种提供分子基础。本研究采集外源喷施水杨酸0 h、6 h... 水杨酸是诱导植物抗性机制中重要的信号分子,外源喷施水杨酸能够调控多种防御相关蛋白质,提升农作物的抗病能力。开展外源水杨酸诱导茶树抗性机制的研究能够挖掘抗病基因,为茶树抗病育种提供分子基础。本研究采集外源喷施水杨酸0 h、6 h、12 h、24 h、48 h的茶树叶片进行转录组测序与分析,结果表明,外源喷施水杨酸6 h、12 h、24 h、48 h时茶树叶片内差异表达基因数量分别为9 360个、3 399个、596个、115个,外源水杨酸处理后各时间点均发生差异表达的基因共604个。KEGG功能富集结果显示,处理后6 h时富集于植物激素信号转导、植物-病原菌互作、核糖体、剪接体和碳代谢通路上的差异表达基因数量分别为95个、73个、121个、94个、154个。差异表达基因中有12个热激因子基因、40个热激蛋白基因和12个WRKY家族转录因子基因上调表达。处理48 h后,无上调表达的热激因子基因,但仍有28个热激蛋白基因上调表达。病程相关蛋白基因在检测阶段均上调表达。外源水杨酸的诱导作用在处理6 h时最为明显,并且引起了大量热激蛋白的响应。本研究结果为开展外源水杨酸诱导茶树抗病机制和茶树抗病分子育种研究提供了参考。 展开更多
关键词 外源水杨酸 茶树 转录组 差异表达基因 热激蛋白
下载PDF
类风湿关节炎脂肪酸代谢相关基因的生物信息学鉴定与验证
4
作者 陆晓铃 刘斌 徐斌 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第32期5116-5121,共6页
背景:研究表明,脂肪酸代谢基因与类风湿关节炎发展紧密相关,因此基于脂肪酸代谢基因探索类风湿关节炎发病进展具有重要的临床意义。目的:探究脂肪酸代谢基因是否可以作为预测类风湿关节炎进展的可靠生物标志物。方法:从基因表达综合数据... 背景:研究表明,脂肪酸代谢基因与类风湿关节炎发展紧密相关,因此基于脂肪酸代谢基因探索类风湿关节炎发病进展具有重要的临床意义。目的:探究脂肪酸代谢基因是否可以作为预测类风湿关节炎进展的可靠生物标志物。方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载与滑膜组织相关的基因数据,应用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,对其使用Cytoscape进行生物学注释(GO基因本体论)和信号通路富集分析(KEGG京都基因与基因组百科全书)。从分子特征数据库(MSigDB)筛选脂肪酸代谢相关基因,使用套索算法和支持向量机的递归特征消除算法筛选潜在生物标志物。通过CIBERSORT算法评估正常人和类风湿关节炎患者的免疫细胞浸润水平。最后,在GSE77298使用受试者工作特征曲线验证脂肪酸代谢相关基因的表达水平。结果与结论:①确定了361个类风湿关节炎差异表达基因,其中13个与报告的脂肪酸代谢相关基因重叠;②基于机器学习算法筛选出5个基因,受试者工作特征曲线显示有5个基因(PCK1、PDK1、PTGS2、PLA2G2D、DPEP2)可以预测类风湿关节炎的发展;③CIBERSORT算法结果表明上述5个基因和活化肥大细胞、中性粒细胞、静息肥大细胞、记忆性静息CD4^(+)T细胞浸润水平密切相关;④受试者工作特征曲线显示,PLA2G2D和PCK1具有较高的诊断价值;⑤提示脂肪酸代谢相关基因表达特征可作为预测类风湿关节炎临床结果的潜在生物标志物,可进一步提高类风湿关节炎预测的准确性。 展开更多
关键词 类风湿关节炎 脂肪酸代谢相关基因 差异表达基因 生物标志物 生物信息学分析
下载PDF
无患子雄性不育品种‘琦蕊’不同发育时期雄花转录组分析
5
作者 廖杨梅 赵国春 +2 位作者 翁学煌 贾黎明 陈仲 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期197-206,共10页
【目的】探究无患子(Sapindus mukorossi Gaertn.)雄性不育品种‘琦蕊’雄花不同发育时期的细胞学特征及差异表达基因,为深入解析无患子雄性不育发生的分子机制提供理论依据。【方法】在观察雄花花药不同发育过程的细胞学特点基础上,进... 【目的】探究无患子(Sapindus mukorossi Gaertn.)雄性不育品种‘琦蕊’雄花不同发育时期的细胞学特征及差异表达基因,为深入解析无患子雄性不育发生的分子机制提供理论依据。【方法】在观察雄花花药不同发育过程的细胞学特点基础上,进一步利用RNA-Seq技术分别对小孢子母细胞时期(T1)、四分体时期(T2)、单核小孢子时期(T3)的雄花进行转录组比较分析,筛选关键差异表达基因。【结果】‘琦蕊’绒毡层和内层细胞的持续膨大与增殖使得药室结构混乱,药室空间不足,最终导致无可育花粉产生。内源激素测定发现,茉莉酸水平在‘琦蕊’雄花发育过程中呈下降趋势。3个时期的转录组分析共筛选到2990个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中T2_vs_T1中722个(516个上调,206个下调),T3_vs_T2中1741个(765个上调,976个下调)。GO和KEGG分析表明,这些DEGs主要富集在代谢过程、细胞分裂、花粉壁合成、激素信号转导等方面,共鉴定到32个花粉发育相关DEGs、27个激素合成及信号转导DEGs。随机选取9个DEGs进行RT-qPCR分析,结果与RNA-Seq数据趋势一致,证明转录组数据的准确性。【结论】绒毡层细胞持续增殖和内层细胞延迟退化不断挤压小孢子是导致无患子‘琦蕊’雄性不育发生的主要原因,物质代谢、细胞分裂、激素水平、花粉发育等相关基因在雄性不育发生过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 无患子 雄性不育 转录组 差异表达基因 绒毡层 细胞分裂 茉莉酸
下载PDF
全反式维甲酸调控K562细胞红系分化的表观遗传机制
6
作者 刘春亚 贾炳豪 +2 位作者 唐琴 孙元田 任立成 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1441-1452,共12页
全反式维甲酸(ATRA)是早幼粒细胞分化的有效诱导剂,其对红系分化过程的作用尚不完全清楚。为研究ATRA在红系分化进程中的作用及其表观遗传调控机制,本文以诱导白血病细胞K562向红系分化为模型,对ATRA干扰红系分化过程的调控机制进行研... 全反式维甲酸(ATRA)是早幼粒细胞分化的有效诱导剂,其对红系分化过程的作用尚不完全清楚。为研究ATRA在红系分化进程中的作用及其表观遗传调控机制,本文以诱导白血病细胞K562向红系分化为模型,对ATRA干扰红系分化过程的调控机制进行研究。首先利用血红素(he-min)诱导K562细胞向红系分化;流式细胞术结果显示,ATRA影响细胞向红系分化过程中的谱系变化,阻滞细胞分化进程;ATRA处理分化中的细胞后,红系分化相关基因表达水平降低;而通过3C、FAIRE和ChIP技术对其中的表观遗传机制进行探究发现,ATRA处理细胞后,β-珠蛋白家族基因座位内的染色质可及性降低,LCR与其靶基因启动子之间的相互作用频率降低;而基因座位染色质可及性降低导致了红系相关转录因子GATA1、LDB1、LMO2和TAL1在LCR及珠蛋白家族基因座位的启动子区的富集频率降低。上述结果表明,ATRA处理分化中的细胞导致红系分化相关基因的染色质可及性降低,更加封闭的染色质结构阻碍了LCR招募转录因子与基因启动子区的结合,进而抑制β-珠蛋白家族基因表达,这种动态的变化过程阐明了ATRA调控红系分化的表观遗传机制。 展开更多
关键词 全反式维甲酸 红系分化 染色质构象捕获 染色质免疫沉淀 基因表达调控
下载PDF
基于RNA-seq的甲氨蝶呤处理sv129胚胎干细胞的转录组学分析
7
作者 王芳 包怡华 +2 位作者 李建婷 谢秋 张霆 《山西医科大学学报》 CAS 2023年第6期808-813,共6页
目的利用转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术探讨抗叶酸代谢药物甲氨蝶呤(methotrexate,MTX)处理的小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cells,mESC)基因转录表达的变化,并探讨其可能影响的生物学过程和关键信号通路。方法将mESC... 目的利用转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术探讨抗叶酸代谢药物甲氨蝶呤(methotrexate,MTX)处理的小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cells,mESC)基因转录表达的变化,并探讨其可能影响的生物学过程和关键信号通路。方法将mESC分为两组,其中对照组采用完全培养基培养,MTX组在此基础上加入0.12μmol/L MTX药物处理。MTX处理24 h分别收集细胞,提取总RNA进行RNA-seq,获得胚胎早期全基因转录组图谱并采用Deseq2软件筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),采用生物信息学R软件包对MTX组与对照组进行差异基因的功能及通路分析。结果MTX组与对照组的转录组相比,共有365个DEGs,其中144个显著上调表达,221个显著下调。GO(Gene Ontology)功能富集分析显示,生物学过程(biological process,BP)分类集中在肌肉系统发育、肌肉收缩、肌纤维发育等肌肉系统发育过程,细胞组分(cellular component,CC)分类集中在细胞膜组分、肌原纤维、收缩纤维、肌丝、肌节等肌肉组分,分子功能(molecular function,MF)分类集中在跨膜转运蛋白结合活性及膜通道活性。KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)生物功能分析显示DEGs显著性富集的通路在钙信号通路、紧密连接。结论抗叶酸代谢药物甲氨蝶呤能够引起mESC基因组的转录改变,DEGs功能主要与肌肉发育以及肌肉纤维发育相关,同时DEGs富集的关键信号通路主要有肌肉发育相关的膜通道的钙离子信号通路和紧密连接。 展开更多
关键词 转录组测序 甲氨蝶呤 差异表达基因 叶酸 胚胎干细胞
下载PDF
RNA N^(6)-甲基腺苷甲基化对老年患者阿司匹林反应性的影响 被引量:2
8
作者 张嘉祺 刘雯雯 +1 位作者 王茜婷 刘梅林 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2023年第2期143-146,共4页
目的探讨RNA N^(6)-甲基腺苷(m^(6)A)甲基化水平及相关基因对老年患者阿司匹林反应性的影响。方法纳入规律服用阿司匹林100 mg/d的老年患者34例,根据光比浊法检测花生四烯酸诱导的血小板聚集率分为低反应组14例(血小板聚集率>12%),... 目的探讨RNA N^(6)-甲基腺苷(m^(6)A)甲基化水平及相关基因对老年患者阿司匹林反应性的影响。方法纳入规律服用阿司匹林100 mg/d的老年患者34例,根据光比浊法检测花生四烯酸诱导的血小板聚集率分为低反应组14例(血小板聚集率>12%),高反应组20例(血小板聚集率<7%)。检测全血RNA m^(6)A甲基化水平及相关基因(YTHDF1、METTL3等)表达,血浆前列腺素H2和血栓素B2水平。结果低反应组全血RNA m^(6)A甲基化水平明显高于高反应组,差异有统计学意义(P<0.05)。低反应组YTHDF1和METTL3 mRNA表达明显高于高反应组[2.77(1.25,4.61)vs 1.32(0.75,1.84),P<0.05;1.64(1.01,2.92)vs 0.80(0.57,1.26),P<0.01]。低反应组血浆前列腺素H2和血栓素B2水平明显高于高反应组[(180.21±15.12)ng/L vs(136.48±9.32)ng/L,(213.44±10.83)ng/L vs(177.27±9.90)ng/L,P<0.05]。结论RNA m^(6)A甲基化水平在阿司匹林低反应性老年患者中升高,检测相关基因可为阿司匹林抗血小板的个体化治疗提供依据。 展开更多
关键词 甲基化 阿司匹林 花生四烯酸 血小板聚集 基因表达
下载PDF
花生四烯酸对三角褐指藻生长、脂质含量及相关基因表达的影响 被引量:6
9
作者 周丽亚 龚一富 +4 位作者 俞凯 陈俊粤 王何瑜 章丽 严小军 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期1291-1297,共7页
为提高三角褐指藻生产生物柴油的能力,本研究利用不同浓度(0、0.5、2.5、12.5、62.5和312.5mg·L^(-1))的花生四烯酸(AA)处理三角褐指藻,探究三角褐指藻生长、总脂、游离脂肪酸的变化,并通过荧光定量PCR研究脂质生物合成途径中相关... 为提高三角褐指藻生产生物柴油的能力,本研究利用不同浓度(0、0.5、2.5、12.5、62.5和312.5mg·L^(-1))的花生四烯酸(AA)处理三角褐指藻,探究三角褐指藻生长、总脂、游离脂肪酸的变化,并通过荧光定量PCR研究脂质生物合成途径中相关基因的转录差异。结果表明,低浓度(0.1~62.5mg·L^(-1))的AA对三角褐指藻的生长有促进作用,高浓度(312.5 mg·L^(-1))则抑制其生长。游离脂肪酸与总脂含量结果表明,游离脂肪酸在AA浓度为12.5 mg·L^(-1)时达到最大值,较对照组提高了4倍;总脂则在AA浓度为62.5 mg·L^(-1)达到最大值,较对照组提高了54%。荧光定量PCR分析结果表明,在AA浓度为312.5 mg·L^(-1)时,油脂合成相关基因LPAAT、GPAT、KAS II、ACCase转录水平与对照组相比极显著提高(P<0.01)。综上,AA促进三角褐指藻油脂的积累可能是通过增加油脂生物合成相关基因表达来实现的。本研究结果为利用基因工程实现微藻油脂的能源化目的奠定了理论基础。 展开更多
关键词 花生四烯酸 三角褐指藻 生长 脂质 基因表达
下载PDF
花生四烯酸对日本沼虾肝胰腺细胞脂质代谢基因表达的影响 被引量:5
10
作者 丁志丽 曹访 +4 位作者 罗娜 孔有琴 张易祥 李景芬 叶金云 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期536-546,共11页
本试验旨在评价细胞培养液中花生四烯酸(arachidonic acid,ARA)浓度对日本沼虾肝胰腺细胞活力及脂质代谢相关基因表达的影响。分离日本沼虾肝胰腺细胞,使用M199完全培养液培养5 d后换成含ARA的培养液,ARA浓度分别为0(ARA1)、50(ARA2)、1... 本试验旨在评价细胞培养液中花生四烯酸(arachidonic acid,ARA)浓度对日本沼虾肝胰腺细胞活力及脂质代谢相关基因表达的影响。分离日本沼虾肝胰腺细胞,使用M199完全培养液培养5 d后换成含ARA的培养液,ARA浓度分别为0(ARA1)、50(ARA2)、100(ARA3)、200(ARA4)和1 000μmol/L(ARA5),测定12和24 h时脂质代谢相关基因的表达水平,以及24h时细胞活力。结果表明:原代肝胰腺细胞使用完全培养液时,生长状况良好,能存活15 d左右;ARA5组24 h时细胞活力显著低于ARA1和ARA2组(P<0.05);高浓度的ARA降低了12和24 h时Δ4脱饱和酶(Δ4 FAD)、Δ6脱饱和酶(Δ6 FAD)、碳链延长酶6(Elovl6)、B类Ⅰ型清道夫受体(SR-BⅠ)、脂肪酸结合蛋白10(FABP10)、乙酰辅酶A结合蛋白(ACBP)基因表达水平;ARA作用12 h时,ARA2组SR-BⅠ基因表达水平显著高于其余各组(P<0.05),ARA2和ARA3组FABP10基因表达水平显著高于ARA1和ARA5组(P<0.05),ARA3组ACBP基因表达水平显著高于其余各组(P<0.05);ARA作用24 h时,ARA2组SR-BⅠ、FABP10和ACBP基因表达水平显著高于其余各组(P<0.05)。由此可见,细胞培养液中ARA浓度会影响日本沼虾肝胰腺细胞活力及脂质代谢相关基因的表达,过高的ARA浓度(1 000μmol/L)会降低细胞的活力,适宜的ARA浓度(50~100μmol/L)可促进脂肪酸脱饱和酶、碳链延长酶及脂肪酸转运相关基因的表达。 展开更多
关键词 日本沼虾 花生四烯酸 细胞培养 基因表达
下载PDF
核桃种子油脂转化期转录组分析 被引量:10
11
作者 杨丽 陈虹 +3 位作者 潘存德 尚刘群 方淼 赵明明 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1084-1094,共11页
【目的】从分子水平上探索核桃(Juglans regia L.)种子油脂转化时期的脂肪酸合成相关基因的表达模式。【方法】基于Illumina Hi SeqTM4000高通量测序平台,以新疆早实核桃‘新新2号’(J.regia‘Xinxin2’)品种种子的种仁为材料,对核桃种... 【目的】从分子水平上探索核桃(Juglans regia L.)种子油脂转化时期的脂肪酸合成相关基因的表达模式。【方法】基于Illumina Hi SeqTM4000高通量测序平台,以新疆早实核桃‘新新2号’(J.regia‘Xinxin2’)品种种子的种仁为材料,对核桃种子油脂转化期3个不同阶段(花后60~70 d,简称G1;花后90~100 d,简称G2;花后120~130 d,简称G3)进行转录组测序比较分析。【结果】组装得到174 545条Unigene,其中G2 vs G1、G3 vs G2和G3 vs G1分别有9 408、8 316、6 398条上调表达的差异基因和11 916、10 485、5 218条下调表达的差异基因。代谢通路富集分析发现,3个阶段之间差异基因富集最显著的是脂肪酸生物合成代谢途径。随机挑选8个基因进行荧光定量验证,结果与测序数据一致,表明核桃种子油脂转化期的转录组测序结果可信度高。不同时期基因差异表达富集度最高的为脂肪酸生物合成代谢通路。在脂肪酸生物合成途径上乙酰辅酶A的羧基转移酶α亚基基因acc A、生物素羧基载体蛋白基因acc B和生物素羧化酶亚基基因acc C的表达量在G1到G3持续上升,β-酮酰ACP合酶Ⅱ基因fab F、β-酮酰-ACP还原酶基因fab G和硬脂酰-ACP去饱和酶基因FAB2的表达量在G1到G3也持续上升,并且G2与G1之间上调表达的差异基因最多。【结论】核桃种子的油脂转化在G2阶段脂肪酸合成最活跃,脂肪酸生物合成途径与油脂合成有关的accA、accB、accC、fabF、fabG、fabI和FAB2基因均呈上调表达。 展开更多
关键词 核桃 RNA-SEQ 转录组 差异基因表达 脂肪酸生物合成
下载PDF
利用基因芯片技术研究甘蓝型油菜油酸合成中差异表达基因 被引量:8
12
作者 官梅 李栒 官春云 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期968-978,共11页
采用基因芯片技术对甘蓝型油菜高油酸(71.71%)和低油酸(55.6%)材料进行分析,探索油酸的差异表达基因。结果检测到差异表达基因562个,其中上调表达基因194个,下调表达基因368个。以基因芯片中油菜上调基因NM_100489和下调基因NM_130183... 采用基因芯片技术对甘蓝型油菜高油酸(71.71%)和低油酸(55.6%)材料进行分析,探索油酸的差异表达基因。结果检测到差异表达基因562个,其中上调表达基因194个,下调表达基因368个。以基因芯片中油菜上调基因NM_100489和下调基因NM_130183为材料,用实时荧光定量方法验证基因芯片的结果,二者完全相符。根据基因芯片的实验结果,采用Go注释系统和数据库查询对562个差异表达基因进行功能注释表明,主要为各种酶类、结合功能、转录调控、代谢等,还有的功能未知或与糖代谢及脂肪酸合成相关,其中丙酮酸激酶、果糖二磷酸、酰基传递/酰基ACP硫脂酶、作用于酯键的水解酶、Δ9硬脂酰-乙酰载体蛋白去饱和酶(ADS1)、Δ9酰基-油脂减饱和酶2(ADS2)、ω-3脂肪酸减饱和酶(fad3)等被鉴定为差异表达基因。 展开更多
关键词 基因芯片 油菜 油酸 差异表达基因
下载PDF
水杨酸诱导下人参培养物差异表达基因片段的克隆 被引量:10
13
作者 张悦 王义 +3 位作者 蒋世翠 张明哲 李凤华 张美萍 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期245-250,共6页
本研究以人参愈伤悬浮细胞为材料,在其生长的第28天添加1×10-3mg/L水杨酸,测定水杨酸添加后,过氧化物酶、多酚氧化酶和苯丙氨酸解氨酶等3种酶在72h内的变化及皂苷含量,结果表明:水杨酸添加后对过氧化物酶和苯丙氨酸解氨酶的活力影... 本研究以人参愈伤悬浮细胞为材料,在其生长的第28天添加1×10-3mg/L水杨酸,测定水杨酸添加后,过氧化物酶、多酚氧化酶和苯丙氨酸解氨酶等3种酶在72h内的变化及皂苷含量,结果表明:水杨酸添加后对过氧化物酶和苯丙氨酸解氨酶的活力影响最大,分别在24h和48h达到最大峰值,在18h开始影响多酚氧化酶的活力,培养物生长的第28天添加水杨酸可以明显提高人参愈伤组织中皂苷的合成。确定添加水杨酸后24h提取总RNA,进行cDNA-RDA分析,筛选差异片段。确定差异基因并在GenBank中注册,注册号为FE900130。为探讨水杨酸作为诱导子对人参次生代谢的影响奠定基础。 展开更多
关键词 人参 水杨酸诱导子 cDNA-RDA 差异表达基因
下载PDF
基于数字基因表达谱筛选黄瓜中水杨酸诱导基因 被引量:7
14
作者 刘双 乔禹 +5 位作者 王芳 韩旭 金晓霞 池春玉 于丽杰 丁国华 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期874-884,共11页
本文通过筛选水杨酸诱导黄瓜叶片差异表达基因(DEGs),旨在揭示水杨酸提高黄瓜抗病性机制和信号转导过程。以抗霜霉病黄瓜东农649为试材,无菌培养幼苗至4叶期,喷施5 mmol·L-1的水杨酸,喷施前和喷施后3、12和24 h分别采取叶片,提取总... 本文通过筛选水杨酸诱导黄瓜叶片差异表达基因(DEGs),旨在揭示水杨酸提高黄瓜抗病性机制和信号转导过程。以抗霜霉病黄瓜东农649为试材,无菌培养幼苗至4叶期,喷施5 mmol·L-1的水杨酸,喷施前和喷施后3、12和24 h分别采取叶片,提取总RNA,制备c DNA文库,应用Illumina高通量测序技术对水杨酸处理前后的4个叶片c DNA文库进行差异基因数字表达谱分析。结果表明,SA诱导了多数与叶绿体和细胞壁相关基因的下调表达和多个与抗病相关基因的上调表达,对受体激酶、细胞色素P450、脂氧合酶和脂转运蛋白等信号转导相关基因的表达均有显著影响。本研究获取了丰富有效的数据,初步筛选的DGEs涉及到植物的PCD(程序性细胞死亡)、信号转导、系统获得性抗性(SAR)形成等过程,证实了SA与上述过程有密切关系,为最终揭示SA提高黄瓜抗病性机制奠定了基础。 展开更多
关键词 黄瓜 水杨酸 数字基因表达谱 高通量测序 差异表达基因 系统获得性抗性
下载PDF
大豆籽粒不同发育时期基因表达谱分析 被引量:3
15
作者 陈欢 杨美英 +7 位作者 王真慧 孙旸 王刚 魏玮 关瑜 王法微 李海燕 陈光 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期129-135,共7页
以花后15d的大豆籽粒作为对照,通过Solexa高通量测序方法对花后35d、55d和65d的大豆籽粒进行转录水平上的检测,并结合GO功能注释和pathway分析,共有差异表达unigene为9 905个,其中调控脂肪酸合成途径的显著差异表达基因12个,蛋氨酸代谢... 以花后15d的大豆籽粒作为对照,通过Solexa高通量测序方法对花后35d、55d和65d的大豆籽粒进行转录水平上的检测,并结合GO功能注释和pathway分析,共有差异表达unigene为9 905个,其中调控脂肪酸合成途径的显著差异表达基因12个,蛋氨酸代谢途径关键基因6个。以花后55d的cDNA为样本,荧光定量PCR检测了12个差异表达基因,其结果可与测序结果互为印证。 展开更多
关键词 大豆 油脂 蛋白质 脂肪酸 蛋氨酸 差异表达基因
下载PDF
橡胶树皮乳管组织茉莉酸诱导相关因子AP2/EREBP基因的克隆与表达分析 被引量:5
16
作者 吴华玲 于波 +4 位作者 程芹芹 曾日中 段翠芳 聂智毅 黎瑜 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2010年第5期287-293,共7页
茉莉酸(jasmonic acid,JA)可诱导橡胶树(Hevea brasiliensis Muell.Arg.)乳管分化,是乳管分化的关键信号分子。目前,对JA诱导橡胶树乳管分化的分子机理仍然不清楚。在前期研究中通过筛选JA刺激乳管分化时期的橡胶树树皮组织cDNA差减文库... 茉莉酸(jasmonic acid,JA)可诱导橡胶树(Hevea brasiliensis Muell.Arg.)乳管分化,是乳管分化的关键信号分子。目前,对JA诱导橡胶树乳管分化的分子机理仍然不清楚。在前期研究中通过筛选JA刺激乳管分化时期的橡胶树树皮组织cDNA差减文库,获得了4条与茉莉酸诱导乳管分化相关的AP2/EREBP家族转录因子基因的EST。该研究在此基础上,采用RACE法完整地克隆了这4个AP2/EREBP转录因子基因的开放阅读框,蛋白氨基酸序列分析表明其中3个属于ERF亚类,1个属于RAV亚类;表达分析发现,这4个基因在乳管分化时期的橡胶树树皮组织的表达受JA诱导,随JA处理时间的延长,其表达量先增强后减弱,推测它们可能在JA诱导橡胶树乳管分化过程中起着重要的调控作用。 展开更多
关键词 巴西橡胶树 AP2/EREBP转录因子 基因克隆 基因表达 茉莉酸 乳管分化
下载PDF
应用cDNA-AFLP技术分离应答BABA诱导的番茄抗病相关基因 被引量:4
17
作者 李大志 陈霄 +3 位作者 邓子牛 杨宇红 熊兴耀 谢丙炎 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期32-36,共5页
应用cDNA-AFLP技术研究番茄根部组织应答BABA(β-Aminobutyric Acid,β-氨基丁酸)诱导后基因转录谱,得到与植物获得性抗性相关的差异表达片段29条,克隆测序后获得10个上调基因片断.经过生物信息学分析和功能预测,其同源基因都是植物体... 应用cDNA-AFLP技术研究番茄根部组织应答BABA(β-Aminobutyric Acid,β-氨基丁酸)诱导后基因转录谱,得到与植物获得性抗性相关的差异表达片段29条,克隆测序后获得10个上调基因片断.经过生物信息学分析和功能预测,其同源基因都是植物体在抗病、抗逆反应中的表达序列标签.根据功能可将其分为5类:第1类是防御反应基因,为病程相关蛋白基因P69家族成员,具有蛋白水解酶功能;第2类是转运蛋白基因,负责细胞内外离子、水和小分子物质的跨膜运输;第3类是信号传导蛋白,是Ca2+信号传导途径上重要的功能蛋白;第4类是分子伴侣蛋白BIF1,协助蛋白质的复性;第5类属功能未知基因.研究表明:BABA诱导植物根部抗病机制涉及植物多方面生理生化反应,由多个功能不同基因共同参与控制.差异表达片段的获得将有助于下一步全长抗病基因的克隆和BABA诱导植物抗性机制的研究. 展开更多
关键词 cDNA—AFLP技术 Β-氨基丁酸 抗病基因 获得性抗性 差异表达片段
下载PDF
油酸对延边黄牛前脂肪细胞分化过程的影响 被引量:5
18
作者 金鑫 张军芳 +3 位作者 李香子 严昌国 王英 崔岩 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2020年第2期184-190,共7页
为研究油酸对延边黄牛前脂肪细胞的分化过程的影响,无菌条件下从延边黄牛皮下脂肪组织中分离获得原代脂肪细胞,并进行传代,在培养基中加入100μmol/L的油酸诱导其分化,并分别在0、48h、96h、144h时观察其细胞形态,油红O染色效果,并检测... 为研究油酸对延边黄牛前脂肪细胞的分化过程的影响,无菌条件下从延边黄牛皮下脂肪组织中分离获得原代脂肪细胞,并进行传代,在培养基中加入100μmol/L的油酸诱导其分化,并分别在0、48h、96h、144h时观察其细胞形态,油红O染色效果,并检测其甘油三酯含量及与分化相关的主要转录因子PPARγ、SREBP1、LPL及C/EBPβ基因表达量的变化等。结果表明,加入油酸后48h便可观察到前脂肪细胞中有脂滴出现,随着处理时间的延长,脂滴数量明显增多,形状变大,且甘油三酯含量也随着处理天数的增加而升高,PPARγ和LPL基因的相对表达量在处理后均高于处理前,SREBP1的表达量在处理后随着处理时间增加先升后降,而C/EBPβ基因的表达量则在添加油酸后不断下降,在处理144h时达到最低。说明油酸在延边黄牛脂肪细胞的分化过程中对脂滴形成、甘油三酯含量及主要转录因子表达有着重要的调节作用。 展开更多
关键词 延边黄牛 油酸 脂肪细胞 分化 基因表达量
下载PDF
全反式维甲酸和二甲亚砜诱导人食管癌细胞wtp53基因的表达 被引量:3
19
作者 金戈 赵继敏 +6 位作者 杨洪艳 黄幼田 郑智敏 赵国强 赵勤 吴景兰 董子明 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期14-16,共3页
目的探讨野生型p53(wtp53)基因表达与食管癌细胞分化相关性。方法采用全反式维甲酸(ATRA)和二甲亚砜(DMSO)诱导人食管癌Eca109细胞分化,应用甲基绿-派洛宁染色、软琼脂集落形成、原位杂交方法分别检测细胞分化和wtp53的基因表达变化。结... 目的探讨野生型p53(wtp53)基因表达与食管癌细胞分化相关性。方法采用全反式维甲酸(ATRA)和二甲亚砜(DMSO)诱导人食管癌Eca109细胞分化,应用甲基绿-派洛宁染色、软琼脂集落形成、原位杂交方法分别检测细胞分化和wtp53的基因表达变化。结果ATRA和DMSO作用5d后可以抑制Eca109细胞增殖,诱导细胞分化及降低集落形成率。wtp53基因表达随着Eca109细胞分化而增高。结论ATRA和DMSO可上调Eca109细胞wtp53的表达使其趋向正常细胞分化。 展开更多
关键词 食管肿瘤 基因 p53 全反式维甲酸 二甲亚砜 基因表达 细胞分化
下载PDF
全反式维甲酸诱导人急性早幼粒白血病HL-60细胞分化的机制(英文) 被引量:4
20
作者 汪进 曾志雄 +4 位作者 黄明辉 方宏勋 肖培根 韩锐 杨梦甦 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期22-28,共7页
目的 研究全反式维甲酸诱导人急性早幼粒白血病HL 6 0细胞分化机制。方法 用流式细胞仪分析维甲酸对HL 6 0细胞周期变化的影响 ,用自制的含 9984个已知基因和EST的高密度基因芯片检测HL 6 0细胞在维甲酸诱导作用下不同时期的基因表达... 目的 研究全反式维甲酸诱导人急性早幼粒白血病HL 6 0细胞分化机制。方法 用流式细胞仪分析维甲酸对HL 6 0细胞周期变化的影响 ,用自制的含 9984个已知基因和EST的高密度基因芯片检测HL 6 0细胞在维甲酸诱导作用下不同时期的基因表达变化。结果 HL 6 0细胞在 1μmol·L- 1 维甲酸持续作用 2 ,4和 6d时 ,流式细胞仪结果显示 4 8%~ 73%细胞阻断在G0 G1 期 ;基因表达谱分析发现 ,黏附分子、组织重建蛋白、转运蛋白、核蛋白体蛋白和涉及氧化酶激活途径的基因表达明显升高。结论 基因表达谱的研究结果表明 ,维甲酸作用HL 6 0细胞与氧化酶激活途径及组织重建蛋白的表达相关联 ,并揭示了一些已知和未知功能的基因在HL 6 0细胞分化与细胞凋亡过程中的作用。 展开更多
关键词 全反式维甲酸 急性早幼粒白血病 HL-60细胞 细胞分化 基因芯片
下载PDF
上一页 1 2 3 下一页 到第
使用帮助 返回顶部